Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[ALA]1n:2	[A]1a:983	3.64				78.42
[ALA]1n:2	[G]1a:1048	3.58	[C]1a:1209			78.42
[ALA]1n:2	[U]1a:1049	3.62		sugar:BB		78.42
[ALA]1n:2	[G]1a:1050	4.34	[C]1a:1208			78.42
[ALA]1n:2	[G]1a:1215	4.7	[C]1a:990			78.42
[ALA]1n:2	[G]1a:1216	3.02	[C]1a:989			78.42
[ARG]1n:3	[G]1a:1048	3.47	[C]1a:1209			43.35
[ARG]1n:3	[U]1a:1049	3.26		base:SC		43.35
[ARG]1n:3	[G]1a:1202	2.93				43.35
[ARG]1n:3	[C]1a:1203	3.28	[G]1a:1057			43.35
[ARG]1n:3	[G]1a:1216	4.14	[C]1a:989			43.35
[LYS]1n:4	[A]1a:994	4.15				10.49
[LYS]1n:4	[C]1a:995	3.6	[A]1a:1046	base:SC		10.49
[LYS]1n:4	[A]1a:996	4.54				10.49
[LYS]1n:4	[A]1a:1046	4.81	[C]1a:995			10.49
[LYS]1n:4	[G]1a:1047	3.22	[C]1a:1210			10.49
[LYS]1n:4	[G]1a:1048	2.94	[C]1a:1209			10.49
[ALA]1n:5	[A]1a:994	3.5				36.24
[ALA]1n:5	[G]1a:1047	4.91	[C]1a:1210			36.24
[ALA]1n:5	[G]1a:1048	4.97	[C]1a:1209			36.24
[ALA]1n:5	[G]1a:1216	3.39	[C]1a:989			36.24
[ALA]1n:5	[C]1a:1217	3.79	[G]1a:988			36.24
[LEU]1n:6	[U]1a:981	4.44				6.68
[LEU]1n:6	[U]1a:982	3.69	[G]1a:1222			6.68
[LEU]1n:6	[A]1a:983	3.71				6.68
[LEU]1n:6	[C]1a:1217	4.04	[G]1a:988			6.68
[GLU]1n:8	[A]1a:994	3.44				35.72
[GLU]1n:8	[C]1a:995	3.26	[A]1a:1046			35.72
[LYS]1n:9	[C]1a:980	4.74				67.93
[LYS]1n:9	[U]1a:981	3.06				67.93
[LYS]1n:9	[A]1a:994	4.84				67.93
[LYS]1n:9	[C]1a:1217	3.01	[G]1a:988			67.93
[LYS]1n:9	[C]1a:1218	2.96	[G]1a:987			67.93
[ARG]1n:12	[C]1a:1217	3.34	[G]1a:988			38.78
[ARG]1n:12	[C]1a:1218	3.26	[G]1a:987			38.78
[LYS]1n:15	[A]1a:1015	2.8				71.02
[LYS]1n:15	[A]1a:1016	2.93	[G]1a:1013			71.02
[LYS]1n:15	[C]1a:1218	4.39	[G]1a:987			71.02
[LYS]1n:15	[U]1a:1219	4.22	[A]1a:986			71.02
[PHE]1n:16	[U]1a:1219	4.54	[A]1a:986			56.78
[PHE]1n:16	[C]1a:1317	3.78			base/AA stacks	56.78
[LYS]1n:17	[U]1a:1257	3.34				12.16
[LYS]1n:17	[G]1a:1316	3.22				12.16
[LYS]1n:17	[C]1a:1317	3.28				12.16
[VAL]1n:18	[C]1a:979	3.53				66.77
[VAL]1n:18	[C]1a:980	3.96				66.77
[VAL]1n:18	[G]1a:1316	3.31				66.77
[VAL]1n:18	[C]1a:1317	3.6				66.77
[VAL]1n:18	[A]1a:1318	4.39				66.77
[VAL]1n:18	[A]1a:1360	3.65	[A]1a:978			66.77
[ARG]1n:19	[C]1a:979	2.73		base:SC		74.43
[ARG]1n:19	[C]1a:980	2.88		sugar:BB		74.43
[ARG]1n:19	[C]1a:1218	4.39	[G]1a:987			74.43
[ARG]1n:19	[U]1a:1219	2.77	[A]1a:986			74.43
[ARG]1n:19	[G]1a:1220	4.62	[C]1a:985			74.43
[ARG]1n:19	[C]1a:1317	3.37		base:SC		74.43
[ALA]1n:20	[C]1a:980	4.41				45.97
[ALA]1n:20	[A]1a:1360	4.79	[A]1a:978			45.97
[TYR]1n:21	[C]1a:980	3.77				45.51
[TYR]1n:21	[U]1a:981	3.51				45.51
[THR]1n:22	[U]1a:1358	4.67	[A]1a:1363			81.46
[THR]1n:22	[C]1a:1359	3.08				81.46
[ARG]1n:23	[U]1a:981	3.53				88.96
[ARG]1n:23	[U]1a:982	2.81	[G]1a:1222			88.96
[ARG]1n:26	[G]1a:1202	4.25				18.41
[CYS]1n:27	[G]1a:1202	3.05				88.28
[CYS]1n:27	[C]1a:1203	3.57	[G]1a:1057			88.28
[GLY]1n:28	[G]1a:1202	5.0				84.5
[ARG]1n:29	[G]1a:973	3.71	[C]1a:962	sugar:SC		90.83
[ARG]1n:29	[A]1a:974	2.26				90.83
[ARG]1n:29	[G]1a:1202	2.81		sugar:SC		90.83
[ALA]1n:30	[U]1a:981	3.86				60.84
[ALA]1n:30	[U]1a:982	4.03	[G]1a:1222			60.84
[ARG]1n:31	[A]1a:974	3.24			base/AA stacks	85.05
[ARG]1n:31	[G]1a:976	3.53				85.05
[ARG]1n:31	[A]1a:977	3.65				85.05
[ARG]1n:31	[U]1a:982	4.58	[G]1a:1222			85.05
[SER]1n:32	[A]1a:974	3.24				66.05
[SER]1n:32	[A]1a:975	2.58		sugar:SC		66.05
[SER]1n:32	[G]1a:976	2.48				66.05
[VAL]1n:33	[G]1a:976	4.43				82.06
[VAL]1n:33	[U]1a:1358	3.49	[A]1a:1363			82.06
[VAL]1n:33	[C]1a:1359	3.92				82.06
[TYR]1n:34	[A]1a:975	3.76				33.71
[TYR]1n:34	[A]1a:1357	3.27	[G]1a:1365			33.71
[TYR]1n:34	[U]1a:1358	3.47	[A]1a:1363			33.71
[ARG]1n:35	[U]1a:1358	2.73	[A]1a:1363			70.8
[ARG]1n:35	[C]1a:1359	3.37			base/AA stacks	70.8
[ARG]1n:35	[A]1a:1360	2.29	[A]1a:978			70.8
[PHE]1n:36	[U]1a:1358	4.42	[A]1a:1363			1.02
[ARG]1n:41	[G]1a:973	3.41	[C]1a:962			99.0
[ARG]1n:41	[A]1a:974	2.65				99.0
[ILE]1n:42	[G]1a:1202	3.36				71.2
[CYS]1n:43	[G]1a:1202	3.72				44.53
[ARG]1n:45	[C]1a:1059	3.03	[G]1a:1198	sugar:SC		94.96
[ARG]1n:45	[C]1a:1060	2.78	[G]1a:1197			94.96
[GLU]1n:46	[G]1a:1058	4.88	[U]1a:1199			51.28
[GLU]1n:46	[G]1a:1202	2.8		base:SC,  base:SC,  base:SC		51.28
[LYS]1n:58	[A]1a:1188	3.29				85.11
[LYS]1n:58	[C]1a:1189	2.87				85.11
[ALA]1n:59	[A]1a:1188	4.82				81.21
[SER]1n:60	[C]1a:1114	2.37	[G]1a:1186	sugar:BB		90.83
[SER]1n:60	[C]1a:1115	4.0	[G]1a:1185			90.83
[SER]1n:60	[G]1a:1186	4.97	[C]1a:1114			90.83
[SER]1n:60	[G]1a:1187	2.61	[C]1a:1113	base:SC,  base:SC		90.83
[SER]1n:60	[A]1a:1188	3.18				90.83
[TRP]1n:61	[C]1a:1114	3.65	[G]1a:1186			77.01
[TRP]1n:61	[C]1a:1115	3.43	[G]1a:1185			77.01
[TRP]1n:61	[G]1a:1186	2.51	[C]1a:1114	base:BB		77.01
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[TRP]1n:61	[G]1a:1368	3.67	[C]1a:1354			77.01
[TRP]1n:61	[C]1a:1369	2.85	[G]1a:1353			77.01