Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[ALA]N:2	[G]A:1048	4.68	[C]A:1209			83.61
[ALA]N:2	[U]A:1049	4.16				83.61
[ALA]N:2	[U]A:1202	4.02				83.61
[ALA]N:2	[C]A:1203	3.03	[G]A:1057			83.61
[LYS]N:3	[A]A:983	4.7	[G]A:1222			73.65
[LYS]N:3	[G]A:1048	3.42	[C]A:1209			73.65
[LYS]N:3	[U]A:1049	3.43				73.65
[LYS]N:3	[G]A:1050	4.99	[C]A:1208			73.65
[LYS]N:3	[G]A:1215	4.74	[C]A:990			73.65
[LYS]N:3	[A]A:1216	3.2	[U]A:989			73.65
[GLN]N:4	[A]A:994	3.98				52.66
[GLN]N:4	[C]A:995	3.49				52.66
[GLN]N:4	[G]A:1047	3.73	[C]A:1210			52.66
[GLN]N:4	[G]A:1048	2.88	[C]A:1209			52.66
[SER]N:5	[A]A:994	3.63				76.45
[SER]N:5	[A]A:1216	2.78	[U]A:989			76.45
[SER]N:5	[C]A:1217	3.46	[G]A:988			76.45
[MET]N:6	[U]A:981	3.51				34.86
[MET]N:6	[U]A:982	3.72				34.86
[MET]N:6	[A]A:983	3.7	[G]A:1222			34.86
[ALA]N:8	[A]A:994	3.14				11.29
[ALA]N:8	[C]A:995	3.7				11.29
[ARG]N:9	[C]A:980	4.88				73.31
[ARG]N:9	[U]A:981	2.7				73.31
[ARG]N:9	[U]A:982	4.38				73.31
[ARG]N:9	[A]A:983	2.74	[G]A:1222			73.31
[ARG]N:9	[A]A:994	4.85				73.31
[ARG]N:9	[C]A:1217	2.75	[G]A:988			73.31
[ARG]N:9	[C]A:1218	4.3	[G]A:987			73.31
[GLU]N:10	[U]A:981	4.21				74.87
[LYS]N:12	[U]A:1017	4.68	[A]A:1012			63.86
[ARG]N:13	[C]A:980	2.87				78.23
[ARG]N:13	[U]A:981	3.16				78.23
[ARG]N:13	[C]A:1218	4.31	[G]A:987			78.23
[LYS]N:19	[U]A:1007	3.62	[A]A:1022			59.15
[LYS]N:19	[U]A:1008	5.0	[A]A:1021			59.15
[PHE]N:21	[A]A:1257	3.45			base/AA stacks	72.39
[LYS]N:23	[U]A:1009	4.45	[G]A:1020			52.43
[ARG]N:24	[C]A:1317	2.9	[C]A:979	sugar:SC		88.02
[LYS]N:28	[G]A:1316	3.81				68.84
[LYS]N:28	[C]A:1317	2.97	[C]A:979			68.84
[VAL]N:34	[G]A:1272	3.63	[C]A:1263			0.94
[VAL]N:45	[C]A:1317	4.72	[C]A:979			20.49
[LYS]N:47	[U]A:1009	4.18	[G]A:1020			35.56
[LYS]N:47	[U]A:1010	4.93	[A]A:1019			35.56
[LEU]N:48	[C]A:1317	3.75	[C]A:979			82.48
[GLN]N:49	[C]A:1317	3.71	[C]A:979			54.03
[ARG]N:53	[C]A:979	3.42	[C]A:1317	sugar:SC		69.18
[ARG]N:53	[A]A:1219	3.76	[U]A:986			69.18
[ARG]N:53	[G]A:1220	2.75	[C]A:985			69.18
[ARG]N:53	[C]A:1317	3.52	[C]A:979		base/AA stacks	69.18
[ASP]N:54	[C]A:1218	4.37	[G]A:987			63.63
[SER]N:56	[G]A:1316	3.69				80.97
[SER]N:56	[C]A:1317	3.03	[C]A:979			80.97
[PRO]N:57	[A]A:1257	4.31				31.96
[PRO]N:57	[C]A:1317	3.95	[C]A:979			31.96
[SER]N:58	[C]A:979	3.2	[C]A:1317	base:BB		69.52
[SER]N:58	[C]A:980	3.6				69.52
[SER]N:58	[G]A:1316	3.57				69.52
[SER]N:58	[C]A:1317	4.56	[C]A:979			69.52
[SER]N:58	[A]A:1360	3.6	[A]A:978			69.52
[ARG]N:59	[C]A:979	2.69	[C]A:1317	base:SC		86.25
[ARG]N:59	[C]A:980	2.64		sugar:BB		86.25
[ARG]N:59	[A]A:1219	3.92	[U]A:986			86.25
[ARG]N:59	[C]A:1317	3.83	[C]A:979			86.25
[GLN]N:60	[C]A:980	4.72				55.75
[ARG]N:61	[G]A:976	4.47	[C]A:1359			60.5
[ARG]N:61	[A]A:977	2.68				60.5
[ARG]N:61	[C]A:980	4.93				60.5
[ARG]N:61	[U]A:981	3.14				60.5
[ASN]N:62	[C]A:1359	3.11	[G]A:976			90.87
[ARG]N:63	[U]A:981	3.02				97.88
[ARG]N:63	[U]A:982	3.06				97.88
[THR]N:67	[U]A:1202	2.93		sugar:SC		92.23
[THR]N:67	[C]A:1203	3.93	[G]A:1057			92.23
[ARG]N:69	[G]A:973	2.99	[C]A:962	sugar:SC		96.41
[ARG]N:69	[A]A:974	3.03				96.41
[ARG]N:69	[U]A:1202	3.12		sugar:SC		96.41
[PRO]N:70	[G]A:976	4.85	[C]A:1359			69.42
[PRO]N:70	[U]A:981	3.91				69.42
[PRO]N:70	[U]A:982	3.58				69.42
[PRO]N:70	[U]A:1049	4.13				69.42
[HIS]N:71	[A]A:974	3.07			base/AA stacks	82.44
[HIS]N:71	[G]A:976	2.72	[C]A:1359			82.44
[HIS]N:71	[A]A:977	3.03				82.44
[GLY]N:72	[A]A:974	3.95				79.62
[GLY]N:72	[A]A:975	3.29				79.62
[GLY]N:72	[G]A:976	2.78	[C]A:1359			79.62
[PHE]N:73	[A]A:975	4.69				65.55
[PHE]N:73	[G]A:976	4.72	[C]A:1359			65.55
[PHE]N:73	[A]A:1357	4.93	[G]A:1365			65.55
[PHE]N:73	[U]A:1358	3.25	[A]A:1363			65.55
[PHE]N:73	[C]A:1359	3.98	[G]A:976			65.55
[LEU]N:74	[A]A:1357	3.52	[G]A:1365			59.2
[LEU]N:74	[U]A:1358	3.72	[A]A:1363			59.2
[ARG]N:75	[A]A:1357	4.96	[G]A:1365			76.41
[ARG]N:75	[U]A:1358	2.76	[A]A:1363			76.41
[ARG]N:75	[C]A:1359	2.6	[G]A:976			76.41
[ARG]N:75	[A]A:1360	2.73	[A]A:978			76.41
[LYS]N:76	[U]A:1358	4.54	[A]A:1363			8.73
[ARG]N:81	[G]A:973	3.09	[C]A:962			99.0
[ARG]N:81	[A]A:974	2.79				99.0
[ILE]N:82	[U]A:1202	3.37				71.59
[LYS]N:83	[U]A:1202	3.98				38.08
[LYS]N:83	[C]A:1203	4.23	[G]A:1057			38.08
[ARG]N:85	[C]A:1059	2.87	[G]A:1198			98.4
[ARG]N:85	[U]A:1060	2.62	[A]A:1197			98.4
[GLU]N:86	[U]A:1202	4.3				54.53
[LYS]N:97	[C]A:1113	4.96	[G]A:1187			45.32
[LYS]N:97	[C]A:1114	4.88	[G]A:1186			45.32
[LYS]N:98	[A]A:1188	3.29				90.53
[LYS]N:98	[U]A:1189	2.24				90.53
[ALA]N:99	[G]A:1187	4.75	[C]A:1113			78.63
[SER]N:100	[C]A:1113	4.83	[G]A:1187			92.94
[SER]N:100	[C]A:1114	2.8	[G]A:1186	sugar:BB		92.94
[SER]N:100	[U]A:1115	4.19	[G]A:1185			92.94
[SER]N:100	[G]A:1186	4.64	[C]A:1114			92.94
[SER]N:100	[G]A:1187	2.8	[C]A:1113	base:SC		92.94
[SER]N:100	[A]A:1188	3.75				92.94
[TRP]N:101	[C]A:1114	4.19	[G]A:1186			88.7
[TRP]N:101	[U]A:1115	3.26	[G]A:1185	sugar:BB		88.7
[TRP]N:101	[G]A:1186	3.14	[C]A:1114	base:SC		88.7
[TRP]N:101	[G]A:1187	3.8	[C]A:1113			88.7
[TRP]N:101	[A]A:1368	3.69	[U]A:1354			88.7
[TRP]N:101	[C]A:1369	3.0	[G]A:1353			88.7