Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[ALA]n:1	[G]a:1048	4.44	[C]a:1209			85.31
[ALA]n:1	[U]a:1049	3.91				85.31
[ALA]n:1	[U]a:1202	3.84				85.31
[ALA]n:1	[C]a:1203	2.71	[G]a:1057			85.31
[LYS]n:2	[A]a:983	4.86	[G]a:1222			72.52
[LYS]n:2	[G]a:1048	3.26	[C]a:1209			72.52
[LYS]n:2	[U]a:1049	3.39				72.52
[LYS]n:2	[G]a:1050	4.49	[C]a:1208			72.52
[LYS]n:2	[G]a:1215	4.57	[C]a:990			72.52
[LYS]n:2	[A]a:1216	2.97	[U]a:989			72.52
[GLN]n:3	[A]a:994	4.05				54.49
[GLN]n:3	[C]a:995	3.44	[A]a:1046	sugar:SC		54.49
[GLN]n:3	[G]a:1047	3.79	[C]a:1210			54.49
[GLN]n:3	[G]a:1048	2.69	[C]a:1209			54.49
[SER]n:4	[A]a:994	3.48				76.06
[SER]n:4	[G]a:1048	4.9	[C]a:1209			76.06
[SER]n:4	[G]a:1215	4.99	[C]a:990			76.06
[SER]n:4	[A]a:1216	2.71	[U]a:989			76.06
[SER]n:4	[C]a:1217	3.4	[G]a:988			76.06
[MET]n:5	[U]a:981	3.3				20.81
[MET]n:5	[U]a:982	3.45				20.81
[MET]n:5	[A]a:983	3.93	[G]a:1222			20.81
[MET]n:5	[C]a:1217	4.87	[G]a:988			20.81
[ALA]n:7	[A]a:994	4.43				5.68
[ALA]n:7	[C]a:995	3.7	[A]a:1046			5.68
[ARG]n:8	[C]a:980	4.94				79.01
[ARG]n:8	[U]a:981	2.66				79.01
[ARG]n:8	[U]a:982	4.31				79.01
[ARG]n:8	[A]a:983	3.49	[G]a:1222			79.01
[ARG]n:8	[A]a:1216	4.92	[U]a:989			79.01
[ARG]n:8	[C]a:1217	2.65	[G]a:988			79.01
[ARG]n:8	[C]a:1218	3.87	[G]a:987			79.01
[GLU]n:9	[C]a:980	4.92				76.34
[GLU]n:9	[U]a:981	4.64				76.34
[LYS]n:11	[C]a:1217	4.59	[G]a:988			62.43
[LYS]n:11	[C]a:1218	4.28	[G]a:987			62.43
[ARG]n:12	[C]a:980	2.54				81.98
[ARG]n:12	[U]a:981	2.95				81.98
[ARG]n:12	[C]a:1218	4.81	[G]a:987			81.98
[LYS]n:18	[U]a:1007	3.82	[A]a:1022			60.08
[LYS]n:18	[U]a:1008	3.54	[A]a:1021			60.08
[PHE]n:20	[A]a:1257	3.42			base/AA stacks	69.45
[LYS]n:22	[U]a:1008	4.88	[A]a:1021			52.04
[LYS]n:22	[U]a:1009	3.53	[G]a:1020			52.04
[ARG]n:23	[G]a:1316	4.55				91.16
[ARG]n:23	[C]a:1317	2.63		sugar:SC		91.16
[LYS]n:27	[G]a:1316	3.54				66.84
[LYS]n:27	[C]a:1317	3.12				66.84
[SER]n:31	[G]a:1272	3.75	[C]a:1263			46.1
[VAL]n:45	[C]a:1317	4.65				7.26
[LEU]n:48	[C]a:1317	3.68				79.38
[GLN]n:49	[C]a:1317	3.2				59.61
[ARG]n:53	[C]a:979	3.78				71.11
[ARG]n:53	[A]a:1219	3.11	[U]a:986			71.11
[ARG]n:53	[G]a:1220	2.9	[C]a:985			71.11
[ARG]n:53	[C]a:1317	3.22			base/AA stacks	71.11
[ASP]n:54	[C]a:1218	4.14	[G]a:987			68.55
[SER]n:56	[G]a:1316	3.09				81.15
[SER]n:56	[C]a:1317	2.73				81.15
[PRO]n:57	[C]a:1317	3.65				28.07
[SER]n:58	[C]a:979	3.14		base:BB		65.96
[SER]n:58	[C]a:980	4.06				65.96
[SER]n:58	[G]a:1316	3.48				65.96
[SER]n:58	[A]a:1360	3.01	[A]a:978			65.96
[ARG]n:59	[C]a:979	3.23		sugar:SC		86.03
[ARG]n:59	[C]a:980	2.67		sugar:BB		86.03
[ARG]n:59	[A]a:1219	4.02	[U]a:986			86.03
[ARG]n:59	[C]a:1317	4.42				86.03
[GLN]n:60	[C]a:980	4.78				59.79
[GLN]n:60	[A]a:1360	4.91	[A]a:978			59.79
[ARG]n:61	[G]a:976	3.87	[C]a:1359			57.95
[ARG]n:61	[A]a:977	2.93				57.95
[ARG]n:61	[C]a:980	4.31				57.95
[ARG]n:61	[U]a:981	3.34				57.95
[ASN]n:62	[U]a:1358	4.81	[A]a:1363			90.6
[ASN]n:62	[C]a:1359	2.64	[G]a:976			90.6
[ARG]n:63	[U]a:981	3.54				98.37
[ARG]n:63	[U]a:982	2.9				98.37
[THR]n:67	[U]a:1202	3.21		sugar:SC		93.03
[THR]n:67	[C]a:1203	3.89	[G]a:1057			93.03
[ARG]n:69	[G]a:973	3.0	[C]a:962	sugar:SC		96.78
[ARG]n:69	[A]a:974	2.94				96.78
[ARG]n:69	[U]a:1202	3.11		sugar:SC		96.78
[PRO]n:70	[G]a:976	4.67	[C]a:1359			66.79
[PRO]n:70	[U]a:981	3.68				66.79
[PRO]n:70	[U]a:982	3.59				66.79
[PRO]n:70	[U]a:1049	4.27				66.79
[HIS]n:71	[A]a:974	3.0			base/AA stacks	82.89
[HIS]n:71	[G]a:976	2.59	[C]a:1359			82.89
[HIS]n:71	[A]a:977	3.06				82.89
[GLY]n:72	[A]a:974	3.67				77.56
[GLY]n:72	[A]a:975	3.23				77.56
[GLY]n:72	[G]a:976	3.15	[C]a:1359			77.56
[PHE]n:73	[A]a:975	4.59				64.59
[PHE]n:73	[G]a:976	4.62	[C]a:1359			64.59
[PHE]n:73	[A]a:1357	4.64	[G]a:1365			64.59
[PHE]n:73	[U]a:1358	3.11	[A]a:1363			64.59
[PHE]n:73	[C]a:1359	3.85	[G]a:976			64.59
[LEU]n:74	[A]a:1357	3.87	[G]a:1365			58.52
[LEU]n:74	[U]a:1358	3.64	[A]a:1363			58.52
[ARG]n:75	[A]a:1357	4.74	[G]a:1365			76.33
[ARG]n:75	[U]a:1358	2.62	[A]a:1363			76.33
[ARG]n:75	[C]a:1359	2.36	[G]a:976			76.33
[ARG]n:75	[A]a:1360	2.67	[A]a:978			76.33
[LYS]n:76	[U]a:1358	4.5	[A]a:1363			12.75
[ARG]n:81	[G]a:973	3.1	[C]a:962			99.0
[ARG]n:81	[A]a:974	2.89				99.0
[ILE]n:82	[U]a:1202	3.37				70.58
[LYS]n:83	[U]a:1202	3.92				30.61
[LYS]n:83	[C]a:1203	4.24	[G]a:1057			30.61
[ARG]n:85	[C]a:1059	3.03	[G]a:1198			98.23
[ARG]n:85	[U]a:1060	2.27	[A]a:1197			98.23
[LYS]n:98	[A]a:1188	2.97				89.97
[LYS]n:98	[U]a:1189	2.74				89.97
[ALA]n:99	[G]a:1187	4.74	[C]a:1113			78.12
[ALA]n:99	[A]a:1188	4.64				78.12
[SER]n:100	[C]a:1114	2.61	[G]a:1186	sugar:BB		93.51
[SER]n:100	[U]a:1115	3.82	[G]a:1185			93.51
[SER]n:100	[G]a:1186	3.48	[C]a:1114			93.51
[SER]n:100	[G]a:1187	2.59	[C]a:1113	base:SC,  base:SC, sugar:SC		93.51
[SER]n:100	[A]a:1188	4.02				93.51
[TRP]n:101	[C]a:1114	4.31	[G]a:1186			87.14
[TRP]n:101	[U]a:1115	3.13	[G]a:1185	sugar:BB		87.14
[TRP]n:101	[G]a:1185	4.8	[U]a:1115			87.14
[TRP]n:101	[G]a:1186	3.44	[C]a:1114	base:SC		87.14
[TRP]n:101	[G]a:1187	4.08	[C]a:1113			87.14
[TRP]n:101	[A]a:1368	3.61	[U]a:1354			87.14
[TRP]n:101	[C]a:1369	2.98	[G]a:1353			87.14