Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[ALA]n:2	[G]a:1045	4.84	[C]a:1206			84.81
[ALA]n:2	[U]a:1046	4.19				84.81
[ALA]n:2	[U]a:1199	3.81				84.81
[ALA]n:2	[C]a:1200	2.95	[G]a:1054			84.81
[LYS]n:3	[A]a:980	4.84				77.02
[LYS]n:3	[G]a:1045	3.96	[C]a:1206			77.02
[LYS]n:3	[U]a:1046	3.64		sugar:SC		77.02
[LYS]n:3	[G]a:1047	3.94	[C]a:1205			77.02
[LYS]n:3	[G]a:1213	3.77	[C]a:986			77.02
[LYS]n:4	[A]a:991	4.15				47.66
[LYS]n:4	[G]a:1044	3.24	[C]a:1207			47.66
[LYS]n:4	[G]a:1045	3.55	[C]a:1206			47.66
[GLY]n:5	[A]a:991	4.01				72.3
[GLY]n:5	[G]a:1213	4.83	[C]a:986			72.3
[GLY]n:5	[C]a:1214	3.82	[G]a:985			72.3
[MET]n:6	[U]a:978	3.27				36.58
[MET]n:6	[U]a:979	3.48				36.58
[MET]n:6	[A]a:980	3.92				36.58
[ASN]n:8	[A]a:991	2.66		base:SC		3.5
[ASN]n:8	[C]a:992	4.44	[A]a:1043			3.5
[ARG]n:9	[C]a:977	4.67				77.95
[ARG]n:9	[U]a:978	2.81				77.95
[ARG]n:9	[U]a:979	4.69				77.95
[ARG]n:9	[A]a:980	3.96				77.95
[ARG]n:9	[C]a:1214	3.07	[G]a:985			77.95
[ARG]n:9	[C]a:1215	4.05	[G]a:984			77.95
[LYS]n:12	[C]a:1214	3.63	[G]a:985			57.85
[LYS]n:12	[C]a:1215	3.34	[G]a:984			57.85
[ARG]n:13	[C]a:977	3.18				81.0
[ARG]n:13	[U]a:978	3.94				81.0
[ARG]n:13	[C]a:1215	4.69	[G]a:984			81.0
[ARG]n:24	[G]a:1313	4.96	[A]a:975			91.44
[ARG]n:24	[C]a:1314	3.42	[C]a:976			91.44
[LYS]n:28	[G]a:1313	3.86	[A]a:975			73.96
[LYS]n:28	[C]a:1314	3.37	[C]a:976			73.96
[LEU]n:48	[C]a:1314	4.31	[C]a:976			78.28
[GLN]n:49	[C]a:1314	3.33	[C]a:976			52.85
[GLN]n:49	[A]a:1315	4.49				52.85
[ARG]n:53	[C]a:976	4.35	[C]a:1314			72.5
[ARG]n:53	[A]a:1216	3.32	[U]a:983			72.5
[ARG]n:53	[G]a:1217	3.08	[C]a:982			72.5
[ARG]n:53	[C]a:1314	4.0	[C]a:976			72.5
[SER]n:56	[G]a:1313	3.74	[A]a:975			82.16
[SER]n:56	[C]a:1314	2.79	[C]a:976			82.16
[PRO]n:57	[C]a:1314	4.37	[C]a:976			26.03
[VAL]n:58	[C]a:976	3.14	[C]a:1314	base:BB		57.75
[VAL]n:58	[C]a:977	4.18				57.75
[VAL]n:58	[G]a:1313	3.89	[A]a:975			57.75
[VAL]n:58	[A]a:1315	3.97				57.75
[VAL]n:58	[A]a:1357	3.72				57.75
[ARG]n:59	[C]a:976	2.35	[C]a:1314	base:SC		88.02
[ARG]n:59	[C]a:977	3.15		sugar:BB		88.02
[ARG]n:59	[A]a:1216	4.39	[U]a:983			88.02
[ARG]n:59	[C]a:1314	3.87	[C]a:976			88.02
[LEU]n:60	[C]a:977	4.56				52.91
[ARG]n:61	[G]a:973	4.36	[C]a:1356			63.1
[ARG]n:61	[A]a:974	3.5				63.1
[ARG]n:61	[C]a:977	4.73				63.1
[ARG]n:61	[U]a:978	3.6				63.1
[ASN]n:62	[C]a:1356	3.11	[G]a:973			87.48
[ARG]n:63	[U]a:978	3.34				97.76
[ARG]n:63	[U]a:979	3.26				97.76
[THR]n:67	[U]a:1199	3.09		sugar:SC		90.52
[THR]n:67	[C]a:1200	4.32	[G]a:1054			90.52
[ARG]n:69	[G]a:970	3.56	[C]a:959	sugar:SC		96.9
[ARG]n:69	[A]a:971	3.56				96.9
[ARG]n:69	[U]a:1199	3.33		sugar:SC		96.9
[PRO]n:70	[G]a:973	4.84	[C]a:1356			73.34
[PRO]n:70	[U]a:978	3.9				73.34
[PRO]n:70	[U]a:979	4.1				73.34
[HIS]n:71	[A]a:971	3.33			base/AA stacks	87.61
[HIS]n:71	[G]a:973	2.55	[C]a:1356			87.61
[HIS]n:71	[A]a:974	3.87				87.61
[GLY]n:72	[A]a:971	4.56				77.4
[GLY]n:72	[A]a:972	3.59				77.4
[GLY]n:72	[G]a:973	3.43	[C]a:1356			77.4
[TYR]n:73	[U]a:1355	4.8	[A]a:1360			78.77
[TYR]n:73	[C]a:1356	3.79	[G]a:973			78.77
[PHE]n:74	[A]a:972	4.55				49.59
[PHE]n:74	[A]a:1354	4.26	[G]a:1362			49.59
[PHE]n:74	[U]a:1355	3.92	[A]a:1360			49.59
[ARG]n:75	[A]a:1354	4.92	[G]a:1362			87.72
[ARG]n:75	[U]a:1355	2.95	[A]a:1360			87.72
[ARG]n:75	[C]a:1356	2.96	[G]a:973		base/AA stacks	87.72
[ARG]n:75	[A]a:1357	2.6				87.72
[LYS]n:76	[U]a:1355	4.68	[A]a:1360			14.13
[ARG]n:81	[G]a:970	2.89	[C]a:959	sugar:SC		99.0
[ARG]n:81	[A]a:971	3.2				99.0
[ASN]n:82	[U]a:1199	3.6			base/AA stacks	71.98
[LYS]n:83	[U]a:1199	4.0		base:SC		33.81
[LYS]n:83	[C]a:1200	3.76	[G]a:1054			33.81
[ARG]n:85	[C]a:1056	3.19	[G]a:1195			98.11
[ARG]n:85	[U]a:1057	2.73	[A]a:1194			98.11
[LYS]n:98	[A]a:1185	3.97				90.66
[LYS]n:98	[C]a:1186	3.78				90.66
[ALA]n:99	[G]a:1184	4.71	[C]a:1110			83.0
[SER]n:100	[C]a:1111	2.93	[G]a:1183	sugar:BB		93.62
[SER]n:100	[U]a:1112	4.61	[G]a:1182			93.62
[SER]n:100	[G]a:1183	4.94	[C]a:1111			93.62
[SER]n:100	[G]a:1184	3.22	[C]a:1110	base:SC		93.62
[SER]n:100	[A]a:1185	4.22				93.62
[TRP]n:101	[C]a:1111	4.36	[G]a:1183			94.96
[TRP]n:101	[U]a:1112	3.73	[G]a:1182			94.96
[TRP]n:101	[G]a:1183	3.57	[C]a:1111	base:BB		94.96
[TRP]n:101	[G]a:1184	3.83	[C]a:1110			94.96
[TRP]n:101	[G]a:1365	3.95	[C]a:1351			94.96
[TRP]n:101	[C]a:1366	3.32	[G]a:1350			94.96