Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[MET]g:1	[G]a:942	3.26	[C]a:1394			94.08
[MET]g:1	[C]a:943	2.84	[A]a:947			94.08
[MET]g:1	[U]a:1355	4.45	[A]a:946			94.08
[MET]g:1	[A]a:1387	3.19				94.08
[PRO]g:2	[C]a:943	3.28	[A]a:947			55.34
[PRO]g:2	[A]a:944	3.32	[U]a:1390			55.34
[PRO]g:2	[C]a:945	3.31	[C]a:1392			55.34
[PRO]g:2	[A]a:946	3.86	[U]a:1355			55.34
[PRO]g:2	[U]a:1355	4.41	[A]a:946			55.34
[PRO]g:2	[A]a:1387	3.26				55.34
[PRO]g:2	[G]a:1389	4.03				55.34
[PRO]g:2	[U]a:1390	3.13	[A]a:944			55.34
[ARG]g:3	[C]a:941	3.35	[G]a:1395		base/AA stacks	79.28
[ARG]g:3	[G]a:942	2.64	[C]a:1394	base:SC		79.28
[ARG]g:3	[A]a:944	3.46	[U]a:1390			79.28
[ARG]g:3	[U]a:1390	3.23	[A]a:944		base/AA stacks	79.28
[ARG]g:3	[C]a:1393	3.05				79.28
[ARG]g:3	[C]a:1394	3.07	[G]a:942	base:SC		79.28
[ARG]g:3	[G]a:1395	3.85	[C]a:941			79.28
[LYS]g:4	[C]a:941	4.07	[G]a:1395			57.11
[LYS]g:4	[G]a:942	3.57	[C]a:1394			57.11
[LYS]g:4	[U]a:1390	4.08	[A]a:944			57.11
[GLY]g:5	[A]a:1387	3.7		sugar:BB		25.05
[GLY]g:5	[C]a:1388	4.3				25.05
[GLY]g:5	[G]a:1389	3.5				25.05
[GLY]g:5	[U]a:1390	3.23	[A]a:944			25.05
[SER]g:6	[C]a:1388	3.8				9.04
[SER]g:6	[G]a:1389	2.56				9.04
[SER]g:6	[U]a:1390	4.73	[A]a:944			9.04
[VAL]g:7	[A]a:1387	3.38				23.11
[VAL]g:7	[C]a:1388	2.76				23.11
[VAL]g:7	[G]a:1389	4.3				23.11
[PRO]g:8	[A]a:1387	4.89				12.15
[PRO]g:8	[C]a:1388	4.82				12.15
[LYS]g:9	[U]a:1386	3.9				40.1
[LYS]g:9	[A]a:1387	4.68				40.1
[LYS]g:9	[C]a:1388	4.6				40.1
[ARG]g:10	[A]a:1356	3.02	[A]a:1385			62.4
[ARG]g:10	[A]a:1384	4.7				62.4
[ARG]g:10	[A]a:1385	2.39	[A]a:1356	base:SC		62.4
[ARG]g:10	[U]a:1386	3.25			base/AA stacks	62.4
[ARG]g:10	[A]a:1387	4.65				62.4
[LYS]g:25	[A]a:1385	3.75	[A]a:1356			83.92
[LYS]g:25	[U]a:1386	3.15				83.92
[ASN]g:28	[A]a:1384	2.31		sugar:BB		88.31
[ASN]g:28	[A]a:1385	3.18	[A]a:1356			88.31
[LYS]g:29	[G]a:948	4.05	[C]a:1354			8.78
[LYS]g:29	[C]a:949	2.68	[G]a:1353			8.78
[LYS]g:29	[A]a:1384	4.51				8.78
[LYS]g:29	[A]a:1385	3.02	[A]a:1356	sugar:SC		8.78
[MET]g:31	[G]a:1383	3.32				92.11
[MET]g:31	[A]a:1384	4.06				92.11
[LEU]g:32	[G]a:950	4.03	[C]a:1352			60.61
[LEU]g:32	[U]a:1250	4.51				60.61
[ASP]g:33	[A]a:1359	3.67				54.45
[ASP]g:33	[A]a:1360	2.64	[U]a:1382	sugar:SC		54.45
[ASP]g:33	[U]a:1361	3.29	[G]a:1381	sugar:SC		54.45
[ASP]g:33	[G]a:1383	4.78				54.45
[GLY]g:34	[A]a:1359	4.28				99.0
[GLY]g:34	[U]a:1382	4.57	[A]a:1360			99.0
[GLY]g:34	[G]a:1383	2.61		sugar:BB		99.0
[GLY]g:34	[A]a:1384	4.26				99.0
[LYS]g:35	[U]a:1250	4.82				86.25
[LYS]g:35	[G]a:1251	2.46	[C]a:1306			86.25
[LYS]g:35	[A]a:1299	4.79				86.25
[LYS]g:35	[G]a:1300	3.86	[U]a:1257			86.25
[LYS]g:35	[U]a:1382	4.85	[A]a:1360			86.25
[LYS]g:35	[G]a:1383	4.62				86.25
[ARG]g:36	[U]a:1382	3.96	[A]a:1360			88.7
[ARG]g:36	[G]a:1383	2.75				88.7
[ARG]g:36	[A]a:1384	2.66				88.7
[GLY]g:37	[G]a:1300	3.96	[U]a:1257			63.39
[GLY]g:37	[U]a:1301	3.53	[A]a:1256			63.39
[GLY]g:37	[U]a:1382	4.91	[A]a:1360			63.39
[THR]g:38	[U]a:1250	2.38		sugar:BB		47.45
[THR]g:38	[G]a:1251	3.28	[C]a:1306			47.45
[THR]g:38	[G]a:1300	3.33	[U]a:1257			47.45
[THR]g:38	[U]a:1301	3.28	[A]a:1256			47.45
[ALA]g:39	[U]a:1250	3.85				95.19
[ARG]g:41	[G]a:1300	4.64	[U]a:1257			59.11
[ARG]g:41	[U]a:1301	2.49	[A]a:1256			59.11
[ARG]g:41	[U]a:1302	3.13	[A]a:1255			59.11
[ILE]g:42	[U]a:1250	3.34				83.1
[ALA]g:77	[U]a:1391	4.18				69.23
[ARG]g:78	[U]a:1391	3.4				56.23
[ARG]g:79	[U]a:1391	3.34		base:BB		80.3
[ARG]g:79	[C]a:1392	4.2	[C]a:945			80.3
[ARG]g:95	[A]a:947	4.22	[C]a:943			84.69
[ARG]g:95	[C]a:1388	3.4				84.69
[THR]g:98	[A]a:1385	4.87	[A]a:1356			55.51
[THR]g:98	[U]a:1386	3.27				55.51
[ARG]g:102	[A]a:947	4.75	[C]a:943			81.7
[ARG]g:102	[G]a:948	2.4	[C]a:1354			81.7
[ARG]g:102	[C]a:949	2.7	[G]a:1353			81.7
[ARG]g:102	[A]a:1385	3.59	[A]a:1356			81.7
[ASN]g:106	[C]a:949	3.91	[G]a:1353			43.19
[ARG]g:109	[G]a:950	3.55	[C]a:1352			72.92
[GLY]g:112	[C]a:1308	4.31				45.47
[GLU]g:113	[C]a:1308	3.4				46.73
[LYS]g:114	[A]a:1248	4.65				51.55
[LYS]g:114	[A]a:1249	2.82				51.55
[LYS]g:114	[C]a:1308	2.65		base:BB		51.55
[THR]g:115	[A]a:1249	3.79				54.97
[THR]g:115	[U]a:1250	3.12				54.97
[THR]g:115	[C]a:1308	3.47				54.97
[MET]g:116	[U]a:1250	3.04				70.64
[GLU]g:117	[A]a:1249	4.8				6.26
[GLU]g:117	[U]a:1250	2.97				6.26
[ARG]g:119	[A]a:1249	4.32				54.12
[ARG]g:119	[U]a:1250	3.26				54.12