Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[GLY]V:8	[G]A:2251	3.27	[C]A:2271	base:BB		75.75
[GLY]V:8	[C]A:2271	4.94	[G]A:2251			75.75
[SER]V:9	[G]A:2251	3.6	[C]A:2271			85.23
[SER]V:9	[G]A:2252	2.84	[C]A:2244	sugar:SC		85.23
[THR]V:10	[G]A:2252	4.35	[C]A:2244			75.54
[THR]V:10	[C]A:2271	4.19	[G]A:2251			75.54
[THR]V:10	[G]A:2273	2.85	[C]A:2259			75.54
[LYS]V:11	[G]A:2275	3.91	[C]A:2257			61.25
[ASN]V:12	[G]A:2273	3.11	[C]A:2259			84.41
[ASN]V:12	[A]A:2274	2.82	[U]A:2258			84.41
[ASN]V:12	[G]A:2275	4.56	[C]A:2257			84.41
[ARG]V:14	[C]A:2256	4.12	[G]A:2276			65.2
[ARG]V:14	[C]A:2257	3.98	[G]A:2275			65.2
[ARG]V:14	[U]A:2258	4.08	[A]A:2274			65.2
[ARG]V:14	[C]A:2259	3.89	[G]A:2273	base:BB		65.2
[ARG]V:14	[G]A:2273	3.86	[C]A:2259			65.2
[ARG]V:14	[A]A:2274	3.47	[U]A:2258			65.2
[ARG]V:14	[G]A:2275	2.81	[C]A:2257	base:SC,  base:SC		65.2
[ARG]V:14	[G]A:2276	3.5	[C]A:2256			65.2
[ASP]V:15	[C]A:2257	4.53	[G]A:2275			68.75
[ASP]V:15	[U]A:2258	4.06	[A]A:2274			68.75
[ASP]V:15	[C]A:2259	3.88	[G]A:2273			68.75
[ASP]V:15	[C]A:2260	3.22	[G]A:2272	base:SC		68.75
[ASP]V:15	[U]A:2261	3.85	[A]A:2270			68.75
[ASP]V:15	[G]A:2272	4.39	[C]A:2260			68.75
[SER]V:16	[C]A:2257	3.68	[G]A:2275			79.67
[SER]V:16	[U]A:2258	2.72	[A]A:2274			79.67
[SER]V:16	[C]A:2259	4.74	[G]A:2273			79.67
[ASN]V:17	[C]A:2256	3.5	[G]A:2276			25.02
[ASN]V:17	[C]A:2257	3.03	[G]A:2275			25.02
[ASN]V:17	[U]A:2258	3.87	[A]A:2274			25.02
[PRO]V:18	[G]A:2267	3.43				65.47
[PRO]V:18	[U]A:2268	3.49	[A]A:2263			65.47
[LYS]V:19	[C]A:2257	3.03	[G]A:2275			84.55
[LYS]V:19	[U]A:2258	3.77	[A]A:2274			84.55
[LYS]V:19	[G]A:2267	3.76				84.55
[LYS]V:19	[U]A:2383	3.88	[A]A:2324			84.55
[MET]V:20	[A]A:2266	3.52				66.1
[MET]V:20	[G]A:2267	3.08				66.1
[MET]V:20	[C]A:2351	4.94	[G]A:2358			66.1
[MET]V:20	[C]A:2352	4.0	[A]A:2357			66.1
[MET]V:20	[C]A:2353	4.69				66.1
[LEU]V:21	[G]A:2265	4.96				72.69
[LEU]V:21	[A]A:2266	3.24				72.69
[LEU]V:21	[G]A:2267	4.61				72.69
[VAL]V:23	[G]A:855	4.45	[A]A:918			56.96
[VAL]V:23	[G]A:2265	4.66				56.96
[LYS]V:24	[C]A:2351	3.39	[G]A:2358			89.99
[LYS]V:24	[C]A:2352	3.07	[A]A:2357			89.99
[TYR]V:26	[G]A:853	4.43	[C]A:920			35.48
[TYR]V:26	[G]A:854	3.55	[C]A:919			35.48
[TYR]V:26	[G]A:855	3.75	[A]A:918			35.48
[TYR]V:26	[C]A:919	4.97	[G]A:854			35.48
[TYR]V:26	[C]A:920	3.89	[G]A:853			35.48
[TYR]V:26	[G]A:2265	3.93		sugar:SC		35.48
[GLY]V:27	[G]A:853	3.48	[C]A:920	base:BB		62.9
[GLY]V:27	[G]A:854	3.58	[C]A:919	sugar:BB		62.9
[GLY]V:28	[G]A:853	4.21	[C]A:920			80.57
[GLY]V:28	[U]A:921	4.39	[A]A:852			80.57
[GLN]V:29	[C]A:920	2.91	[G]A:853	sugar:SC		58.18
[GLN]V:29	[U]A:921	3.32	[A]A:852			58.18
[THR]V:32	[G]A:2349	3.55	[C]A:2360	sugar:SC		37.92
[THR]V:32	[A]A:2350	4.99	[U]A:2359			37.92
[ALA]V:33	[A]A:2348	3.29	[G]A:2361			60.34
[ALA]V:33	[G]A:2349	3.01	[C]A:2360	sugar:BB		60.34
[GLY]V:34	[A]A:2348	3.62	[G]A:2361			93.34
[GLY]V:34	[G]A:2349	3.16	[C]A:2360	base:BB		93.34
[GLY]V:34	[A]A:2350	3.9	[U]A:2359			93.34
[ASN]V:35	[G]A:2349	2.95	[C]A:2360	sugar:SC		55.56
[ASN]V:35	[A]A:2350	3.13	[U]A:2359			55.56
[ILE]V:36	[G]A:2349	4.58	[C]A:2360			89.56
[ILE]V:36	[A]A:2350	3.01	[U]A:2359	sugar:BB		89.56
[ILE]V:36	[C]A:2351	4.03	[G]A:2358			89.56
[ILE]V:36	[C]A:2360	3.92	[G]A:2349			89.56
[ARG]V:39	[A]A:2350	4.98	[U]A:2359			85.15
[ARG]V:39	[C]A:2351	3.63	[G]A:2358	sugar:SC		85.15
[ARG]V:39	[G]A:2358	4.79	[C]A:2351			85.15
[ARG]V:39	[U]A:2359	3.28	[A]A:2350	base:SC, sugar:SC		85.15
[ARG]V:39	[C]A:2360	3.53	[G]A:2349	sugar:SC		85.15
[ARG]V:41	[U]A:2258	4.4	[A]A:2274			77.52
[ARG]V:41	[A]A:2325	3.68	[U]A:2382			77.52
[ARG]V:41	[G]A:2326	3.39	[C]A:2381	base:BB		77.52
[ARG]V:41	[U]A:2382	3.04	[A]A:2325			77.52
[ARG]V:41	[U]A:2383	3.39	[A]A:2324		base/AA stacks	77.52
[GLY]V:42	[G]A:2326	3.16	[C]A:2381	sugar:BB		76.15
[GLY]V:42	[G]A:2327	4.14	[U]A:2320			76.15
[THR]V:43	[G]A:2327	2.91	[U]A:2320	sugar:SC		72.56
[THR]V:43	[C]A:2328	3.88	[G]A:2319			72.56
[THR]V:43	[A]A:2332	3.21		base:SC		72.56
[GLU]V:44	[G]A:2326	2.73	[C]A:2381			53.52
[GLU]V:44	[G]A:2327	2.99	[U]A:2320			53.52
[PHE]V:45	[G]A:855	4.05	[A]A:918			40.15
[PHE]V:45	[G]A:856	4.95	[U]A:917			40.15
[HIS]V:46	[C]A:2328	3.52	[G]A:2319			53.4
[HIS]V:46	[A]A:2332	4.83				53.4
[MET]V:53	[A]A:2332	4.76				19.92
[MET]V:53	[G]A:2361	4.61	[A]A:2348			19.92
[GLY]V:54	[C]A:2360	3.61	[G]A:2349			72.35
[GLY]V:54	[G]A:2361	3.04	[A]A:2348			72.35
[ARG]V:55	[U]A:2359	4.95	[A]A:2350			54.87
[ARG]V:55	[C]A:2360	2.79	[G]A:2349			54.87
[ARG]V:55	[G]A:2361	2.7	[A]A:2348			54.87
[ARG]V:55	[G]A:2379	4.82	[C]A:2281			54.87
[ARG]V:55	[U]A:2380	4.38	[A]A:2280			54.87
[ARG]V:55	[C]A:2381	4.61	[G]A:2326			54.87
[ARG]V:55	[U]A:2382	3.99	[A]A:2325			54.87
[ARG]V:55	[U]A:2383	3.62	[A]A:2324			54.87
[ASP]V:56	[U]A:2359	4.36	[A]A:2350			82.55
[ASP]V:56	[C]A:2360	3.39	[G]A:2349			82.55
[ASP]V:56	[U]A:2382	4.4	[A]A:2325			82.55
[HIS]V:57	[G]A:2326	3.86	[C]A:2381			38.84
[HIS]V:57	[A]A:2332	3.85				38.84
[HIS]V:57	[C]A:2381	3.44	[G]A:2326	base:SC		38.84
[HIS]V:57	[U]A:2382	3.87	[A]A:2325			38.84
[THR]V:58	[C]A:2360	4.13	[G]A:2349			88.34
[PHE]V:60	[C]A:2360	4.4	[G]A:2349			40.4
[PHE]V:60	[G]A:2361	3.81	[A]A:2348			40.4
[PHE]V:60	[A]A:2362	4.13	[G]A:2347			40.4
[THR]V:62	[A]A:2362	4.39	[G]A:2347			35.59
[PHE]V:69	[G]A:854	4.31	[C]A:919			64.94
[PHE]V:69	[G]A:855	4.27	[A]A:918			64.94
[PHE]V:75	[A]A:2329	3.87				26.64
[PHE]V:75	[A]A:2330	4.01				26.64
[ARG]V:77	[C]A:2328	3.95	[G]A:2319			44.24
[ARG]V:77	[A]A:2329	2.7				44.24
[ARG]V:77	[A]A:2330	4.27				44.24
[ARG]V:78	[G]A:855	4.21	[A]A:918			1.28
[ARG]V:78	[G]A:856	2.74	[U]A:917			1.28
[ARG]V:78	[G]A:2327	4.56	[U]A:2320			1.28