Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[MET]s:1	[U]a:138	4.49	[G]a:141			49.07
[MET]s:1	[U]a:139	3.87				49.07
[MET]s:1	[G]a:141	3.28	[U]a:138			49.07
[MET]s:1	[A]a:142	2.97	[U]a:137	sugar:BB		49.07
[MET]s:1	[C]a:143	2.72	[G]a:136	sugar:BB		49.07
[ILE]s:2	[A]a:142	4.5	[U]a:137			60.25
[ILE]s:2	[C]a:143	4.3	[G]a:136			60.25
[ARG]s:3	[C]a:143	3.91	[G]a:136			34.47
[ARG]s:3	[A]a:144	3.61	[U]a:135	sugar:SC		34.47
[HIS]s:15	[G]a:1338	4.09	[C]a:1314			63.48
[HIS]s:15	[G]a:1339	2.66				63.48
[VAL]s:16	[G]a:1338	4.17	[C]a:1314			64.75
[SER]s:17	[G]a:1338	3.31	[C]a:1314			92.36
[SER]s:17	[G]a:1339	2.54				92.36
[GLU]s:18	[A]a:1392	3.1				99.0
[LYS]s:19	[G]a:1339	3.43				98.88
[LYS]s:19	[U]a:1340	2.69	[U]a:1312			98.88
[LYS]s:19	[G]a:1341	3.19		base:SC		98.88
[LYS]s:19	[A]a:1393	4.01				98.88
[LYS]s:19	[U]a:1394	2.8		base:SC		98.88
[LYS]s:19	[A]a:1395	4.99	[U]a:1390			98.88
[ALA]s:20	[G]a:1339	4.48				83.68
[LYS]s:26	[U]a:1390	3.33	[A]a:1395	sugar:SC		32.33
[LYS]s:26	[U]a:1391	4.55				32.33
[SER]s:27	[C]a:1398	4.96	[G]a:1389			5.57
[SER]s:27	[C]a:1399	4.86	[G]a:1388			5.57
[THR]s:29	[G]a:1341	4.25				47.59
[LYS]s:36	[C]a:1600	4.08	[G]a:1346			3.6
[ALA]s:38	[U]a:1599	4.5	[A]a:1347			90.59
[THR]s:39	[A]a:1598	4.15	[C]a:1348			80.7
[THR]s:39	[U]a:1599	3.24	[A]a:1347			80.7
[LYS]s:40	[A]a:1342	2.56	[U]a:1602			97.61
[LYS]s:40	[G]a:1343	4.79	[C]a:1404			97.61
[LYS]s:40	[A]a:1598	4.38	[C]a:1348			97.61
[LYS]s:40	[U]a:1599	2.83	[A]a:1347			97.61
[ALA]s:41	[A]a:1597	4.98	[U]a:1405			27.41
[LYS]s:44	[A]a:1596	4.52	[U]a:1406			71.52
[VAL]s:58	[A]a:1342	4.55	[U]a:1602			90.12
[ASN]s:59	[G]a:1341	3.06		sugar:SC		78.63
[ASN]s:59	[A]a:1342	3.39	[U]a:1602			78.63
[ASN]s:59	[U]a:1397	4.24				78.63
[ASN]s:59	[C]a:1398	3.02	[G]a:1389			78.63
[THR]s:60	[G]a:1341	3.49				79.23
[THR]s:60	[A]a:1342	3.2	[U]a:1602			79.23
[THR]s:60	[U]a:1599	4.62	[A]a:1347			79.23
[THR]s:60	[C]a:1600	4.35	[G]a:1346			79.23
[LEU]s:61	[U]a:1340	3.82	[U]a:1312			52.76
[LEU]s:61	[G]a:1341	3.48				52.76
[VAL]s:62	[U]a:1340	4.64	[U]a:1312			64.7
[VAL]s:62	[C]a:1600	4.16	[G]a:1346			64.7
[VAL]s:62	[G]a:1601	3.33	[C]a:1345			64.7
[VAL]s:62	[U]a:1602	4.53	[A]a:1342			64.7
[LYS]s:64	[U]a:1312	4.69	[U]a:1340			52.31
[LYS]s:64	[G]a:1601	2.75	[C]a:1345			52.31
[LYS]s:64	[U]a:1602	2.48	[A]a:1342			52.31
[LYS]s:66	[U]a:1312	3.95	[U]a:1340			93.14
[LYS]s:66	[C]a:1314	4.7	[G]a:1338			93.14
[LYS]s:66	[G]a:1337	3.66	[C]a:1315			93.14
[LYS]s:66	[G]a:1338	2.75	[C]a:1314	base:SC,  base:SC		93.14
[LYS]s:66	[G]a:1339	3.71				93.14
[VAL]s:67	[U]a:1312	3.44	[U]a:1340			17.64
[LYS]s:68	[A]a:1336	3.17	[U]a:1316			71.68
[LYS]s:68	[G]a:1337	4.35	[C]a:1315			71.68
[ARG]s:69	[C]a:1335	3.79	[G]a:1317			75.37
[HIS]s:70	[A]a:63	3.49	[A]a:91			0.0
[HIS]s:70	[A]a:64	3.58	[U]a:90		base/AA stacks	0.0
[HIS]s:70	[A]a:91	3.55	[A]a:63			0.0
[ARG]s:73	[A]a:64	4.33	[U]a:90			22.1
[ARG]s:73	[U]a:65	3.48	[A]a:89			22.1
[ARG]s:73	[C]a:456	3.78			base/AA stacks	22.1
[ILE]s:74	[A]a:64	4.36	[U]a:90			1.94
[ILE]s:74	[U]a:65	3.86	[A]a:89			1.94
[GLY]s:75	[A]a:64	3.12	[U]a:90			70.86
[GLY]s:75	[U]a:65	3.57	[A]a:89			70.86
[ARG]s:76	[A]a:64	3.38	[U]a:90			32.68
[ARG]s:76	[U]a:65	3.21	[A]a:89			32.68
[ARG]s:77	[A]a:63	3.16	[A]a:91	sugar:SC		63.74
[ARG]s:77	[A]a:64	3.53	[U]a:90			63.74
[ARG]s:77	[A]a:1336	4.53	[U]a:1316			63.74
[ARG]s:77	[G]a:1337	3.14	[C]a:1315			63.74
[SER]s:78	[G]a:58	3.22	[C]a:69			59.43
[SER]s:78	[U]a:59	4.75	[G]a:68			59.43
[SER]s:78	[A]a:64	4.2	[U]a:90			59.43
[ASP]s:79	[G]a:58	4.16	[C]a:69			40.43
[TRP]s:80	[G]a:1339	4.95				1.39
[LYS]s:81	[U]a:1599	4.1	[A]a:1347			97.03
[LYS]s:81	[C]a:1600	2.35	[G]a:1346			97.03
[LYS]s:82	[G]a:1339	3.66				91.86
[LYS]s:82	[U]a:1340	2.57	[U]a:1312			91.86
[TYR]s:84	[G]a:1339	4.29				69.31
[TYR]s:84	[U]a:1340	2.68	[U]a:1312			69.31
[TYR]s:84	[G]a:1341	3.37			base/AA stacks	69.31
[THR]s:86	[G]a:1341	4.79				81.81
[THR]s:86	[C]a:1399	4.61	[G]a:1388			81.81