Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[GLU]A:5	[C]P:10	3.63				0.0
[THR]A:11	[A]P:11	4.43				0.0
[TYR]A:13	[G]P:9	3.53				0.0
[TYR]A:13	[C]P:10	3.47			base/AA stacks	0.0
[ASN]A:15	[U]P:8	3.61				0.0
[ASN]A:15	[G]P:9	2.99		base:SC		0.0
[ASN]A:16	[U]P:8	2.81		base:SC		0.0
[ASN]A:16	[G]P:9	3.04		base:BB		0.0
[LEU]A:17	[G]P:9	4.33				0.0
[GLU]A:19	[A]P:6	4.2				0.0
[GLU]A:19	[U]P:7	2.78		base:SC		0.0
[GLU]A:19	[U]P:8	4.71				0.0
[GLU]A:19	[G]P:9	2.61		base:SC,  base:SC		0.0
[LYS]A:22	[A]P:1	3.88				0.0
[LYS]A:22	[A]P:2	2.96	[U]P:19			0.0
[LEU]A:44	[A]P:11	3.58				0.0
[LEU]A:44	[C]P:12	3.97				0.0
[ARG]A:47	[G]P:16	4.99	[C]P:5			0.0
[SER]A:48	[C]P:15	4.15				0.0
[SER]A:48	[G]P:16	3.65	[C]P:5			0.0
[LEU]A:49	[A]P:6	3.42				0.0
[LEU]A:49	[U]P:7	4.13				0.0
[LEU]A:49	[G]P:9	4.58				0.0
[LEU]A:49	[C]P:15	4.88				0.0
[LEU]A:49	[G]P:16	3.07	[C]P:5			0.0
[LYS]A:50	[G]P:9	2.5		sugar:BB		0.0
[LYS]A:50	[C]P:10	4.36				0.0
[LYS]A:50	[A]P:11	3.1				0.0
[LYS]A:50	[G]P:16	4.86	[C]P:5			0.0
[MET]A:51	[G]P:9	4.61				0.0
[MET]A:51	[C]P:10	3.9				0.0
[MET]A:51	[A]P:11	3.2				0.0
[ARG]A:52	[A]P:6	2.76		base:SC		0.0
[ARG]A:52	[U]P:7	3.16				0.0
[ARG]A:52	[G]P:9	3.02				0.0
[ARG]A:52	[G]P:16	3.01	[C]P:5	base:SC,  base:SC		0.0
[GLY]A:53	[G]P:9	3.35				0.0
[GLN]A:54	[G]P:9	3.12			base/AA stacks	0.0
[GLN]A:54	[C]P:10	3.33				0.0
[PHE]A:56	[C]P:10	3.45				0.0
[PHE]A:56	[A]P:11	3.42			base/AA stacks	0.0
[LYS]A:80	[U]P:8	3.07		base:SC		0.0
[ARG]A:83	[U]P:8	4.83				0.0
[GLN]A:85	[C]P:10	2.97		base:SC		0.0
[TYR]A:86	[C]P:10	2.96		base:BB		0.0
[ALA]A:87	[C]P:10	3.51				0.0
[ALA]A:87	[A]P:11	3.93				0.0
[LYS]A:88	[C]P:10	3.03		base:BB, sugar:SC		0.0
[THR]A:89	[C]P:10	4.63				0.0
[THR]A:89	[A]P:11	2.86		base:BB		0.0
[THR]A:89	[C]P:12	3.33		base:SC		0.0
[ASP]A:90	[A]P:11	3.52				0.0
[ASP]A:90	[C]P:12	2.86		base:BB		0.0
[SER]A:91	[A]P:11	2.76		base:SC		0.0
[SER]A:91	[C]P:12	3.4				0.0
[ASP]A:92	[C]P:12	3.03		base:BB	base/AA stacks	0.0
[ASP]A:92	[U]P:13	4.51				0.0
[ILE]A:93	[C]P:12	4.8				0.0