Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[THR]A:11	[U]B:24	3.8	[DA]C:19			0.0
[ARG]A:12	[U]B:24	3.32	[DA]C:19			0.0
[LYS]A:13	[U]B:24	3.6	[DA]C:19			0.0
[ALA]A:14	[U]B:24	2.96	[DA]C:19	sugar:BB		0.0
[ALA]A:14	[A]B:25	3.42	[DT]C:18			0.0
[THR]A:16	[G]B:7	3.04	[C]B:23	sugar:SC		0.0
[THR]A:16	[U]B:8	4.21	[A]B:22			0.0
[THR]A:16	[A]B:25	3.84	[DT]C:18			0.0
[THR]A:17	[G]B:7	3.88	[C]B:23			0.0
[LYS]A:18	[U]B:6	3.42				0.0
[LYS]A:18	[G]B:7	3.65	[C]B:23			0.0
[ILE]A:20	[U]B:3	3.56				0.0
[ILE]A:20	[U]B:6	3.79				0.0
[ARG]A:22	[A]B:1	3.41				0.0
[ARG]A:22	[U]B:2	3.74				0.0
[HIS]A:126	[G]B:30	4.55	[DC]C:13			0.0
[MET]A:315	[A]B:29	4.89	[DT]C:14			0.0
[LYS]A:318	[A]B:29	3.67	[DT]C:14	base:SC		0.0
[LYS]A:318	[G]B:30	4.17	[DC]C:13			0.0
[GLU]A:354	[A]B:40	4.9	[DT]C:3			0.0
[GLU]A:354	[U]B:41	3.87	[DA]C:2			0.0
[GLU]A:354	[A]B:42	4.53	[DT]C:1			0.0
[SER]A:355	[A]B:40	4.6	[DT]C:3			0.0
[ASP]A:356	[A]B:40	3.02	[DT]C:3	sugar:SC		0.0
[ASN]A:415	[G]B:43	4.4				0.0
[GLN]A:431	[A]B:42	3.05	[DT]C:1			0.0
[GLN]A:431	[G]B:43	4.97				0.0
[LYS]A:460	[G]B:31	4.01	[DC]C:12			0.0
[LYS]A:460	[A]B:32	3.02	[DT]C:11			0.0
[LYS]A:463	[G]B:31	3.99	[DC]C:12			0.0
[LYS]A:463	[A]B:32	3.38	[DT]C:11			0.0
[GLN]A:464	[G]B:31	3.21	[DC]C:12			0.0
[GLN]A:464	[A]B:32	3.17	[DT]C:11			0.0
[LYS]A:465	[G]B:30	3.81	[DC]C:13			0.0
[LYS]A:465	[G]B:31	3.09	[DC]C:12			0.0
[ILE]A:466	[G]B:30	3.86	[DC]C:13			0.0
[ASN]A:467	[A]B:29	3.09	[DT]C:14	sugar:SC		0.0
[ASN]A:467	[G]B:30	3.3	[DC]C:13	sugar:SC		0.0
[PRO]A:468	[A]B:29	3.37	[DT]C:14			0.0
[PRO]A:468	[G]B:30	4.09	[DC]C:13			0.0
[ILE]A:470	[A]B:28	3.38	[DT]C:15			0.0
[ILE]A:470	[A]B:29	3.84	[DT]C:14			0.0
[GLN]A:471	[U]B:27	4.68	[DA]C:16			0.0
[GLN]A:471	[A]B:28	3.81	[DT]C:15			0.0
[LYS]A:472	[U]B:27	3.35	[DA]C:16			0.0
[LYS]A:472	[A]B:28	4.82	[DT]C:15			0.0
[TYR]A:473	[U]B:27	3.4	[DA]C:16	sugar:BB		0.0
[TYR]A:473	[A]B:28	4.08	[DT]C:15			0.0
[SER]A:475	[U]B:26	4.01	[DA]C:17			0.0
[ILE]A:489	[A]B:1	3.56				0.0
[ASP]A:493	[A]B:1	4.22				0.0
[LYS]A:494	[U]B:2	3.01		base:SC		0.0
[LYS]A:494	[U]B:3	4.49				0.0
[HIS]A:497	[A]B:1	2.94		sugar:SC	base/AA stacks	0.0
[HIS]A:497	[U]B:2	3.68				0.0
[ASN]A:498	[U]B:2	3.29				0.0
[ARG]A:503	[A]B:1	4.22				0.0
[ARG]A:503	[U]B:2	2.93		sugar:SC	base/AA stacks	0.0
[ARG]A:503	[U]B:4	3.56				0.0
[ASP]A:507	[U]B:2	2.81		base:SC		0.0
[ASP]A:507	[U]B:3	3.57				0.0
[ASP]A:507	[U]B:4	3.92				0.0
[ASN]A:508	[U]B:4	4.85				0.0
[TYR]A:509	[U]B:3	2.89			base/AA stacks	0.0
[TYR]A:509	[U]B:4	3.65				0.0
[TYR]A:509	[U]B:5	3.77				0.0
[TYR]A:509	[U]B:6	2.44				0.0
[TRP]A:511	[A]B:1	3.31				0.0
[TRP]A:511	[U]B:2	3.25			base/AA stacks	0.0
[TRP]A:511	[U]B:3	2.89		base:SC		0.0
[HIS]A:528	[A]B:1	3.31			base/AA stacks	0.0
[ALA]A:530	[U]B:3	3.63				0.0
[SER]A:532	[U]B:6	3.37				0.0
[SER]A:532	[G]B:7	2.55	[C]B:23			0.0
[SER]A:533	[G]B:7	3.26	[C]B:23			0.0
[THR]A:534	[U]B:6	4.28				0.0
[THR]A:534	[G]B:7	2.62	[C]B:23			0.0
[ARG]A:535	[G]B:7	3.32	[C]B:23			0.0
[ARG]A:535	[C]B:23	3.63	[G]B:7		base/AA stacks	0.0
[ARG]A:535	[U]B:24	2.86	[DA]C:19			0.0
[ARG]A:535	[A]B:25	4.39	[DT]C:18			0.0
[GLU]A:539	[C]B:23	4.71	[G]B:7			0.0
[LYS]A:560	[C]B:21	4.95	[G]B:9			0.0
[LYS]A:560	[A]B:22	3.24	[U]B:8			0.0
[THR]A:561	[C]B:23	3.81	[G]B:7			0.0
[LYS]A:567	[C]B:21	3.22	[G]B:9			0.0
[PRO]A:568	[U]B:18	4.06				0.0
[ALA]A:569	[U]B:18	3.69				0.0
[LEU]A:570	[U]B:18	2.93		base:BB		0.0
[ILE]A:575	[U]B:18	3.64				0.0
[ILE]A:578	[U]B:18	3.49				0.0
[ILE]A:578	[G]B:19	4.62	[C]B:11			0.0
[ARG]A:579	[U]B:18	3.01				0.0
[PRO]A:582	[U]B:5	3.83				0.0
[VAL]A:583	[G]B:16	4.04	[C]B:12			0.0
[GLY]A:584	[U]B:6	2.91		base:BB		0.0
[LEU]A:585	[U]B:5	3.23				0.0
[LEU]A:585	[U]B:6	3.66				0.0
[ARG]A:586	[G]B:16	4.03	[C]B:12			0.0
[ARG]A:586	[G]B:19	4.47	[C]B:11			0.0
[LYS]A:587	[G]B:9	4.44	[C]B:21			0.0
[LYS]A:587	[C]B:10	4.02	[G]B:20			0.0
[LYS]A:587	[C]B:11	4.45	[G]B:19			0.0
[LYS]A:587	[G]B:19	3.16	[C]B:11	base:SC		0.0
[LYS]A:587	[G]B:20	3.36	[C]B:10	base:SC		0.0
[LYS]A:587	[C]B:21	4.04	[G]B:9			0.0
[VAL]A:588	[U]B:6	3.24				0.0
[VAL]A:588	[G]B:7	4.05	[C]B:23			0.0
[LYS]A:589	[U]B:5	3.06				0.0
[LYS]A:590	[U]B:18	3.52				0.0
[LYS]A:590	[G]B:19	3.65	[C]B:11			0.0
[LYS]A:590	[G]B:20	2.35	[C]B:10			0.0
[ARG]A:591	[G]B:7	2.97	[C]B:23	base:SC,  base:SC		0.0
[ARG]A:591	[U]B:8	3.42	[A]B:22			0.0
[ARG]A:591	[G]B:9	4.98	[C]B:21			0.0
[ARG]A:591	[A]B:22	3.77	[U]B:8			0.0
[ARG]A:591	[C]B:23	4.43	[G]B:7			0.0
[GLN]A:592	[U]B:5	4.97				0.0
[ARG]A:594	[U]B:18	2.92		base:SC,  base:SC, sugar:SC		0.0
[ARG]A:594	[G]B:19	4.92	[C]B:11			0.0
[ARG]A:594	[G]B:20	3.22	[C]B:10			0.0
[ARG]A:620	[U]B:26	4.32	[DA]C:17			0.0
[ARG]A:620	[U]B:27	2.55	[DA]C:16			0.0
[ARG]A:620	[A]B:28	4.96	[DT]C:15			0.0
[GLU]A:625	[U]B:26	4.55	[DA]C:17			0.0
[THR]A:627	[A]B:25	3.36	[DT]C:18	sugar:SC		0.0
[ALA]A:629	[U]B:24	4.98	[DA]C:19			0.0
[VAL]A:686	[C]B:21	4.52	[G]B:9			0.0
[GLU]A:687	[G]B:20	4.35	[C]B:10			0.0
[GLU]A:687	[C]B:21	4.95	[G]B:9			0.0
[SER]A:688	[C]B:11	3.51	[G]B:19			0.0
[SER]A:688	[G]B:19	4.86	[C]B:11			0.0
[SER]A:688	[G]B:20	2.64	[C]B:10	base:SC,  base:SC		0.0
[SER]A:688	[C]B:21	4.78	[G]B:9			0.0
[GLN]A:689	[G]B:19	3.02	[C]B:11	base:BB		0.0
[GLN]A:689	[G]B:20	2.86	[C]B:10	sugar:BB		0.0
[VAL]A:690	[C]B:11	4.93	[G]B:19			0.0
[VAL]A:690	[C]B:12	3.48	[G]B:16			0.0
[VAL]A:690	[G]B:16	4.31	[C]B:12			0.0
[VAL]A:690	[U]B:17	4.77				0.0
[VAL]A:690	[G]B:19	4.17	[C]B:11			0.0
[ARG]A:691	[U]B:14	4.4				0.0
[ARG]A:691	[G]B:16	4.7	[C]B:12			0.0
[ARG]A:691	[U]B:17	3.32			base/AA stacks	0.0
[LYS]A:693	[A]B:13	4.96				0.0
[LYS]A:693	[U]B:14	3.7				0.0
[TYR]A:695	[C]B:11	4.56	[G]B:19			0.0
[TYR]A:695	[C]B:12	4.13	[G]B:16			0.0
[TYR]A:695	[A]B:13	2.8				0.0
[GLN]A:697	[C]B:10	2.39	[G]B:20	sugar:SC		0.0
[GLN]A:697	[C]B:11	3.1	[G]B:19			0.0
[GLN]A:697	[G]B:20	3.5	[C]B:10	base:SC		0.0
[TYR]A:700	[C]B:12	3.96	[G]B:16			0.0
[TYR]A:700	[A]B:13	2.73				0.0
[GLY]A:702	[A]B:13	4.94				0.0
[VAL]A:703	[A]B:13	3.51				0.0
[TYR]A:707	[A]B:13	3.24			base/AA stacks	0.0
[TYR]A:754	[C]B:11	4.69	[G]B:19			0.0
[TYR]A:754	[C]B:12	2.25	[G]B:16			0.0
[TYR]A:754	[A]B:13	4.82				0.0
[GLN]A:765	[G]B:35	4.66	[DC]C:8			0.0
[GLN]A:765	[G]B:36	2.98	[DC]C:7			0.0
[ARG]A:769	[G]B:36	3.61	[DC]C:7			0.0
[ARG]A:769	[A]B:37	2.93	[DT]C:6			0.0
[LYS]A:790	[A]B:13	3.09		sugar:SC		0.0
[LEU]A:791	[A]B:13	4.19				0.0
[LYS]A:795	[C]B:12	4.46	[G]B:16			0.0
[LYS]A:795	[C]B:15	4.64				0.0
[LEU]A:796	[C]B:12	3.57	[G]B:16			0.0
[LEU]A:796	[A]B:13	3.92				0.0
[LEU]A:796	[C]B:15	4.31				0.0
[SER]A:797	[C]B:11	3.16	[G]B:19			0.0
[SER]A:797	[C]B:12	3.02	[G]B:16			0.0
[SER]A:798	[C]B:11	3.91	[G]B:19			0.0
[SER]A:798	[C]B:12	3.45	[G]B:16			0.0
[LEU]A:799	[C]B:10	3.61	[G]B:20			0.0
[LEU]A:799	[C]B:11	4.54	[G]B:19			0.0
[LYS]A:808	[U]B:34	4.88	[DA]C:9			0.0
[LYS]A:811	[U]B:34	4.74	[DA]C:9			0.0
[LYS]A:811	[G]B:35	3.75	[DC]C:8			0.0
[SER]A:812	[G]B:35	3.27	[DC]C:8	sugar:SC		0.0
[SER]A:812	[G]B:36	3.74	[DC]C:7			0.0
[GLY]A:815	[G]B:36	3.26	[DC]C:7			0.0
[THR]A:816	[G]B:36	3.37	[DC]C:7			0.0
[THR]A:816	[A]B:37	3.58	[DT]C:6			0.0
[GLY]A:819	[G]B:36	4.1	[DC]C:7			0.0
[GLY]A:819	[A]B:37	4.16	[DT]C:6			0.0
[HIS]A:820	[G]B:36	4.74	[DC]C:7			0.0
[HIS]A:820	[A]B:37	2.84	[DT]C:6			0.0
[HIS]A:820	[A]B:38	4.28	[DT]C:5			0.0
[LYS]A:823	[A]B:37	3.98	[DT]C:6			0.0
[LYS]A:823	[A]B:38	2.72	[DT]C:5			0.0
[LYS]A:859	[C]B:10	2.98	[G]B:20			0.0
[LYS]A:859	[C]B:11	2.28	[G]B:19			0.0
[ASN]A:862	[G]B:9	3.32	[C]B:21			0.0
[ASN]A:862	[C]B:10	3.7	[G]B:20			0.0
[LYS]A:863	[C]B:10	3.8	[G]B:20			0.0
[LYS]A:863	[C]B:11	2.56	[G]B:19			0.0
[LYS]A:865	[U]B:8	4.77	[A]B:22			0.0
[LYS]A:865	[C]B:23	4.7	[G]B:7			0.0
[LYS]A:865	[A]B:25	3.98	[DT]C:18			0.0
[SER]A:866	[G]B:9	4.35	[C]B:21			0.0
[SER]A:866	[C]B:10	3.01	[G]B:20	sugar:SC		0.0
[GLU]A:869	[A]B:22	3.62	[U]B:8			0.0
[GLU]A:869	[C]B:23	3.42	[G]B:7			0.0
[GLU]A:869	[A]B:25	4.88	[DT]C:18			0.0
[VAL]A:870	[A]B:22	3.83	[U]B:8			0.0
[ASN]A:873	[A]B:22	3.28	[U]B:8			0.0
[ASN]A:873	[C]B:23	3.05	[G]B:7			0.0
[THR]A:900	[A]B:32	3.01	[DT]C:11	sugar:BB		0.0
[THR]A:900	[A]B:33	3.56	[DT]C:10			0.0
[LYS]A:901	[A]B:32	4.79	[DT]C:11			0.0
[LYS]A:901	[A]B:33	3.53	[DT]C:10			0.0
[LYS]A:901	[U]B:34	4.82	[DA]C:9			0.0
[LYS]A:902	[A]B:32	4.99	[DT]C:11			0.0
[LYS]A:902	[A]B:33	2.74	[DT]C:10			0.0
[LYS]A:904	[U]B:34	4.7	[DA]C:9			0.0
[LYS]A:905	[U]B:34	4.44	[DA]C:9			0.0
[SER]A:906	[U]B:34	3.2	[DA]C:9			0.0
[SER]A:906	[G]B:35	3.66	[DC]C:8			0.0
[ASN]A:909	[A]B:33	3.33	[DT]C:10			0.0
[ASN]A:909	[U]B:34	2.96	[DA]C:9			0.0
[SER]A:910	[U]B:34	3.76	[DA]C:9			0.0
[SER]A:910	[G]B:35	4.67	[DC]C:8			0.0
[MET]A:913	[A]B:33	3.84	[DT]C:10			0.0
[MET]A:913	[U]B:34	3.56	[DA]C:9			0.0
[LYS]A:923	[C]B:23	3.04	[G]B:7	sugar:SC		0.0
[LYS]A:923	[U]B:24	3.73	[DA]C:19			0.0
[LYS]A:923	[A]B:25	4.91	[DT]C:18			0.0
[GLU]A:926	[U]B:24	3.98	[DA]C:19			0.0
[MET]A:927	[C]B:23	3.49	[G]B:7			0.0
[MET]A:927	[U]B:24	3.72	[DA]C:19			0.0