Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[ALA]p:2	[C]a:135	4.76				80.6
[ALA]p:2	[C]a:136	3.82	[G]a:235			80.6
[ALA]p:2	[G]a:386	4.69	[C]a:393			80.6
[VAL]p:3	[A]a:236	3.75				82.86
[VAL]p:3	[U]a:237	4.35	[U]a:133			82.86
[LYS]p:4	[G]a:384	4.78	[U]a:395			65.09
[LYS]p:4	[G]a:385	2.44	[C]a:394			65.09
[LYS]p:4	[G]a:386	4.54	[C]a:393			65.09
[ILE]p:5	[G]a:384	4.99	[U]a:395			91.0
[ARG]p:6	[G]a:384	3.05	[U]a:395			93.34
[ARG]p:6	[G]a:385	3.24	[C]a:394			93.34
[LEU]p:7	[U]a:383	3.28	[A]a:397	sugar:BB		90.74
[LEU]p:7	[G]a:384	3.31	[U]a:395			90.74
[ARG]p:9	[A]a:382	4.9	[C]a:380			88.37
[ARG]p:9	[G]a:399	3.98	[C]a:378			88.37
[ARG]p:9	[G]a:400	4.67	[C]a:377			88.37
[LEU]p:10	[C]a:632	3.88	[G]a:624			33.32
[LEU]p:10	[G]a:633	3.32	[C]a:623			33.32
[GLY]p:11	[C]a:632	3.41	[G]a:624	sugar:BB		98.97
[SER]p:12	[C]a:44	4.07	[G]a:407			56.09
[SER]p:12	[G]a:45	4.44	[C]a:406			56.09
[SER]p:12	[A]a:630	4.44	[C]a:626			56.09
[SER]p:12	[C]a:631	3.48	[G]a:625	sugar:SC		56.09
[SER]p:12	[C]a:632	4.75	[G]a:624			56.09
[LYS]p:13	[C]a:44	3.38	[G]a:407			73.61
[LYS]p:13	[G]a:45	3.39	[C]a:406			73.61
[LYS]p:13	[G]a:400	4.19	[C]a:377			73.61
[LYS]p:13	[A]a:401	3.36	[U]a:375			73.61
[ARG]p:14	[C]a:44	4.68	[G]a:407			61.31
[ARG]p:14	[G]a:400	2.56	[C]a:377			61.31
[ARG]p:14	[A]a:401	3.06	[U]a:375			61.31
[ARG]p:14	[A]a:457	4.83	[G]a:492			61.31
[ARG]p:14	[G]a:458	4.75	[C]a:491			61.31
[ARG]p:14	[C]a:491	2.57	[G]a:458	sugar:SC,  sugar:SC		61.31
[ARG]p:14	[G]a:492	3.74	[A]a:457	base:SC		61.31
[ARG]p:14	[U]a:494	4.69	[G]a:493			61.31
[ASN]p:15	[G]a:400	4.77	[C]a:377			56.07
[ASN]p:15	[G]a:625	4.96	[C]a:631			56.07
[PRO]p:16	[G]a:458	4.92	[C]a:491			83.64
[PHE]p:17	[C]a:632	4.74	[G]a:624			34.91
[PHE]p:17	[G]a:633	3.48	[C]a:623			34.91
[TYR]p:18	[A]a:382	3.75	[C]a:380			76.43
[TYR]p:18	[U]a:383	4.6	[A]a:397			76.43
[ARG]p:19	[G]a:633	2.55	[C]a:623			88.78
[ARG]p:19	[U]a:634	3.05	[A]a:622			88.78
[ASP]p:24	[U]a:237	2.88	[U]a:133	sugar:SC		80.6
[ASP]p:24	[G]a:238	4.87	[C]a:132			80.6
[ALA]p:25	[C]a:109	4.62	[G]a:339			69.0
[ALA]p:25	[G]a:385	3.75	[C]a:394			69.0
[ALA]p:25	[G]a:386	3.87	[C]a:393			69.0
[ARG]p:26	[C]a:109	3.57	[G]a:339			77.42
[ARG]p:26	[G]a:110	4.29	[C]a:338			77.42
[ARG]p:26	[A]a:134	3.62				77.42
[ARG]p:26	[U]a:237	2.61	[U]a:133	sugar:SC,  sugar:SC		77.42
[ARG]p:26	[G]a:238	4.26	[C]a:132			77.42
[SER]p:27	[G]a:110	4.95	[C]a:338			64.7
[SER]p:27	[G]a:238	4.81	[C]a:132			64.7
[PRO]p:28	[G]a:110	4.16	[C]a:338			45.61
[PRO]p:28	[G]a:111	4.62	[A]a:323			45.61
[ARG]p:29	[A]a:382	3.92	[C]a:380			83.9
[ARG]p:29	[U]a:383	2.37	[A]a:397	base:SC		83.9
[ARG]p:29	[G]a:384	3.86	[U]a:395			83.9
[ARG]p:29	[A]a:397	4.25	[U]a:383			83.9
[ARG]p:29	[C]a:398	2.43	[G]a:379	sugar:SC		83.9
[ARG]p:29	[G]a:399	2.99	[C]a:378			83.9
[ASP]p:30	[G]a:317	4.57	[C]a:299			66.73
[ASP]p:30	[G]a:318	4.23	[C]a:298			66.73
[GLY]p:31	[G]a:318	3.31	[C]a:298			87.42
[ARG]p:32	[U]a:237	4.85	[U]a:133			68.56
[ARG]p:32	[G]a:238	2.54	[C]a:132			68.56
[ARG]p:32	[G]a:318	3.26	[C]a:298			68.56
[ARG]p:32	[C]a:319	3.61	[G]a:297			68.56
[ILE]p:34	[A]a:236	4.75				73.95
[ILE]p:34	[U]a:237	3.64	[U]a:133			73.95
[ILE]p:34	[G]a:238	4.91	[C]a:132			73.95
[TYR]p:40	[A]a:460	4.92	[G]a:489			87.36
[TYR]p:40	[C]a:461	2.32	[U]a:488			87.36
[PRO]p:42	[G]a:458	4.42	[C]a:491			89.59
[PRO]p:42	[A]a:459	4.17	[A]a:490			89.59
[PRO]p:42	[A]a:460	3.54	[G]a:489			89.59
[PRO]p:42	[C]a:461	3.6	[U]a:488			89.59
[THR]p:43	[A]a:457	4.94	[G]a:492			10.4
[THR]p:43	[G]a:458	3.33	[C]a:491			10.4
[THR]p:43	[A]a:459	3.83	[A]a:490			10.4
[SER]p:44	[A]a:457	4.38	[G]a:492			41.66
[SER]p:44	[G]a:458	3.21	[C]a:491			41.66
[ALA]p:45	[A]a:457	4.51	[G]a:492			19.18
[ALA]p:45	[G]a:458	3.87	[C]a:491			19.18
[PRO]p:48	[C]a:461	3.96	[U]a:488			32.45
[LYS]p:59	[G]a:235	3.8	[C]a:136			8.55
[LYS]p:59	[A]a:236	4.57				8.55
[TRP]p:60	[A]a:236	3.53				72.81
[TRP]p:60	[U]a:237	4.64	[U]a:133			72.81
[LEU]p:61	[U]a:137	4.19	[A]a:234			64.66
[ASN]p:62	[U]a:137	2.52	[A]a:234			36.17
[ASN]p:62	[A]a:138	3.81	[U]a:233			36.17
[ASP]p:63	[C]a:136	4.17	[G]a:235			43.98
[ASP]p:63	[U]a:137	3.63	[A]a:234			43.98
[ASP]p:63	[G]a:235	2.29	[C]a:136	base:BB, sugar:SC		43.98
[ASP]p:63	[A]a:236	4.74				43.98
[GLY]p:64	[C]a:136	2.74	[G]a:235	sugar:BB		97.82
[GLY]p:64	[U]a:137	3.31	[A]a:234			97.82
[GLY]p:64	[G]a:235	3.39	[C]a:136			97.82
[ALA]p:65	[C]a:136	4.58	[G]a:235			98.19
[ALA]p:65	[U]a:137	4.98	[A]a:234			98.19
[LYS]p:66	[C]a:136	3.16	[G]a:235			71.67
[LYS]p:66	[U]a:137	2.53	[A]a:234			71.67
[THR]p:68	[G]a:384	4.59	[U]a:395			88.55
[THR]p:68	[G]a:385	4.0	[C]a:394			88.55
[ASP]p:69	[C]a:461	4.85	[U]a:488			53.8
[ASP]p:69	[A]a:462	3.33				53.8
[THR]p:70	[U]a:383	3.24	[A]a:397			74.71
[THR]p:70	[G]a:384	4.33	[U]a:395			74.71
[THR]p:70	[C]a:461	3.33	[U]a:488	sugar:BB		74.71
[VAL]p:71	[G]a:384	3.98	[U]a:395			82.83
[HIS]p:72	[A]a:462	4.88				37.87
[HIS]p:72	[U]a:463	4.57	[U]a:487			37.87
[HIS]p:72	[G]a:480	3.64	[U]a:469			37.87
[HIS]p:72	[C]a:481	2.59	[G]a:468			37.87
[ASN]p:73	[C]a:461	2.97	[U]a:488			53.12
[ASN]p:73	[A]a:462	2.49		sugar:SC		53.12
[ASN]p:73	[U]a:463	3.47	[U]a:487			53.12
[ILE]p:74	[C]a:461	4.0	[U]a:488			79.98
[ILE]p:74	[A]a:462	4.91				79.98
[LEU]p:75	[C]a:481	4.16	[G]a:468			69.37
[LEU]p:75	[A]a:482	3.69	[U]a:467			69.37
[SER]p:76	[A]a:462	3.45				41.58
[SER]p:76	[C]a:481	3.35	[G]a:468			41.58
[SER]p:76	[A]a:482	2.86	[U]a:467			41.58
[SER]p:76	[C]a:483	4.43	[G]a:466			41.58
[LYS]p:77	[A]a:460	3.8	[G]a:489			43.21
[LYS]p:77	[C]a:461	2.87	[U]a:488			43.21
[LYS]p:77	[A]a:462	3.62				43.21
[LYS]p:77	[A]a:482	4.32	[U]a:467			43.21
[LYS]p:77	[C]a:483	4.81	[G]a:466			43.21
[GLY]p:79	[A]a:482	3.78	[U]a:467			44.34
[MET]p:81	[G]a:480	3.14	[U]a:469			8.26
[MET]p:81	[C]a:481	3.27	[G]a:468			8.26
[LYS]p:82	[C]a:481	3.29	[G]a:468			0.58
[LYS]p:82	[A]a:482	3.22	[U]a:467			0.58
[PHE]p:84	[G]a:480	4.73	[U]a:469			0.03
[ASP]p:85	[U]a:469	4.85	[G]a:480			16.23
[ASP]p:85	[G]a:480	2.46	[U]a:469	base:SC,  base:SC		16.23
[ASP]p:85	[C]a:481	2.89	[G]a:468	sugar:SC		16.23
[LYS]p:89	[A]a:470	3.36	[U]a:479			18.14
[LYS]p:89	[A]a:471	4.92				18.14