Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[GLY]q:8	[G]a:1160	4.25	[C]a:994			60.51
[GLY]q:8	[C]a:1161	3.03	[G]a:993			60.51
[GLY]q:9	[A]a:996	3.28	[U]a:1159			91.33
[GLY]q:9	[G]a:1160	3.51	[C]a:994			91.33
[GLY]q:9	[C]a:1161	3.23	[G]a:993			91.33
[LYS]q:10	[G]a:993	3.99	[C]a:1161			73.51
[LYS]q:10	[C]a:994	2.86	[G]a:1160	base:SC		73.51
[LYS]q:10	[A]a:996	3.31	[U]a:1159			73.51
[LYS]q:10	[G]a:1160	3.55	[C]a:994			73.51
[LYS]q:10	[C]a:1161	3.56	[G]a:993	base:SC		73.51
[GLN]q:11	[A]a:996	4.84	[U]a:1159			99.0
[GLU]q:23	[G]a:993	3.08	[C]a:1161	base:SC		69.98
[GLU]q:23	[C]a:994	4.32	[G]a:1160			69.98
[GLU]q:23	[C]a:1161	3.43	[G]a:993			69.98
[GLU]q:23	[G]a:1162	3.29	[C]a:992			69.98
[LYS]q:24	[G]a:1162	3.29	[C]a:992			63.65
[LYS]q:24	[G]a:1163	2.52	[C]a:991			63.65
[ARG]q:68	[G]a:1223	2.94	[A]a:1226			74.29
[ARG]q:68	[U]a:1224	2.88				74.29
[LYS]q:71	[G]a:1223	2.96	[A]a:1226			98.95
[LYS]q:71	[U]a:1224	4.11				98.95
[LYS]q:71	[G]a:1225	2.48				98.95
[VAL]q:72	[G]a:993	4.19	[C]a:1161			76.17
[LYS]q:73	[G]a:1225	4.94				48.23
[ILE]q:74	[C]a:992	3.27	[G]a:1162			71.34
[ILE]q:74	[G]a:993	3.83	[C]a:1161			71.34
[LYS]q:76	[A]a:990	4.36	[G]a:974			79.45
[LYS]q:76	[C]a:991	3.29	[G]a:1163			79.45
[LYS]q:76	[C]a:992	2.79	[G]a:1162			79.45
[PHE]q:77	[C]a:564	3.38	[G]a:577			49.66
[PHE]q:77	[C]a:565	3.02	[U]a:576			49.66
[ARG]q:78	[C]a:565	4.55	[U]a:576			74.76
[ARG]q:78	[G]a:974	3.56	[A]a:990			74.76
[ARG]q:78	[A]a:975	3.15	[G]a:989	sugar:SC		74.76
[ARG]q:78	[A]a:990	2.89	[G]a:974	base:SC		74.76
[ARG]q:78	[G]a:1186	3.88		sugar:SC		74.76
[ARG]q:79	[A]a:563	2.69	[G]a:578			77.82
[ARG]q:79	[C]a:564	2.99	[G]a:577			77.82
[ARG]q:79	[C]a:565	3.52	[U]a:576			77.82
[ARG]q:79	[A]a:572	3.24	[G]a:2029			77.82
[ARG]q:80	[C]a:564	4.92	[G]a:577			90.2
[ARG]q:80	[C]a:565	2.95	[U]a:576			90.2
[ARG]q:80	[U]a:566	3.09	[A]a:575			90.2
[ARG]q:80	[U]a:567	3.87				90.2
[ARG]q:80	[U]a:568	4.96	[6MZ]a:2030			90.2
[ARG]q:80	[U]a:571	3.11				90.2
[ARG]q:80	[A]a:572	2.79	[G]a:2029			90.2
[ARG]q:80	[U]a:573	3.94				90.2
[LYS]q:81	[U]a:566	4.7	[A]a:575			72.63
[LYS]q:81	[U]a:568	2.67	[6MZ]a:2030	base:SC		72.63
[LYS]q:81	[G]a:570	4.52				72.63
[LYS]q:81	[U]a:571	4.39				72.63
[LYS]q:81	[A]a:972	3.55	[A]a:821			72.63
[LYS]q:81	[A]a:973	2.51	[A]a:820			72.63
[LYS]q:81	[G]a:974	4.05	[A]a:990			72.63
[LYS]q:81	[U]a:1188	3.24	[A]a:819			72.63
[HIS]q:82	[U]a:566	4.6	[A]a:575			52.34
[HIS]q:82	[U]a:811	4.88				52.34
[HIS]q:82	[U]a:1188	4.34	[A]a:819			52.34
[HIS]q:82	[A]a:1189	2.98	[G]a:818			52.34
[TYR]q:83	[G]a:1186	4.28				55.71
[TYR]q:83	[G]a:1187	2.81				55.71
[TYR]q:83	[U]a:1188	3.54	[A]a:819			55.71
[ARG]q:84	[U]a:813	3.57	[A]a:1194			60.35
[ARG]q:84	[C]a:814	3.94	[G]a:1193			60.35
[LYS]q:85	[C]a:814	3.38	[G]a:1193			73.39
[LYS]q:85	[C]a:815	2.81	[G]a:1192			73.39
[LYS]q:85	[C]a:816	4.8	[G]a:1191			73.39
[LYS]q:85	[G]a:1187	3.16				73.39
[GLN]q:86	[U]a:813	4.96	[A]a:1194			58.59
[GLN]q:86	[C]a:814	2.62	[G]a:1193			58.59
[GLN]q:86	[U]a:1224	4.47				58.59
[GLN]q:86	[G]a:1225	4.2				58.59
[GLN]q:87	[C]a:815	4.87	[G]a:1192			5.66
[GLN]q:87	[C]a:991	3.94	[G]a:1163	sugar:SC		5.66
[GLN]q:87	[C]a:992	3.23	[G]a:1162	sugar:SC		5.66
[GLN]q:87	[U]a:1224	3.41				5.66
[GLN]q:87	[G]a:1225	4.26				5.66
[GLY]q:88	[U]a:1224	3.09		sugar:BB		98.05
[GLY]q:88	[G]a:1225	3.63				98.05
[HIS]q:89	[C]a:992	2.99	[G]a:1162			89.37
[HIS]q:89	[G]a:993	3.12	[C]a:1161			89.37
[HIS]q:89	[G]a:1162	3.52	[C]a:992			89.37
[HIS]q:89	[U]a:1224	4.78				89.37
[ARG]q:90	[U]a:1222	3.51	[G]a:1227			98.92
[ARG]q:90	[G]a:1223	2.77	[A]a:1226			98.92
[GLN]q:91	[G]a:993	3.57	[C]a:1161		base/AA stacks	83.23
[GLN]q:91	[G]a:1162	3.07	[C]a:992	base:SC,  base:SC		83.23
[TRP]q:92	[G]a:1162	4.02	[C]a:992			4.79
[TRP]q:92	[G]a:1163	4.09	[C]a:991			4.79