Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[SER]s:4	[A]a:987	3.71				84.59
[SER]s:4	[G]a:1326	3.01				84.59
[SER]s:4	[C]a:1327	3.25				84.59
[SER]s:4	[A]a:1328	3.23				84.59
[SER]s:4	[A]a:1329	2.25	[G]a:1371			84.59
[ILE]s:5	[U]a:1325	3.32				33.28
[ILE]s:5	[G]a:1326	3.35				33.28
[ILE]s:5	[A]a:1328	4.62				33.28
[LYS]s:6	[G]a:1322	3.36				16.05
[LYS]s:6	[U]a:1323	3.26	[A]a:1334			16.05
[LYS]s:6	[C]a:1324	4.62	[G]a:1333			16.05
[LYS]s:6	[G]a:1326	4.47				16.05
[LYS]s:7	[U]a:1325	3.99				91.15
[PHE]s:10	[A]a:1328	3.52				58.94
[PHE]s:10	[A]a:1329	3.27	[G]a:1371			58.94
[ASP]s:12	[A]a:1328	4.68				52.52
[HIS]s:14	[G]a:1022	4.02	[A]a:1025			45.03
[HIS]s:14	[G]a:1024	3.42				45.03
[LYS]s:17	[A]a:1021	4.5	[U]a:1026			54.9
[LYS]s:18	[G]a:1022	4.35	[A]a:1025			57.69
[LYS]s:18	[A]a:1023	3.12				57.69
[ALA]s:21	[A]a:1021	4.65	[U]a:1026			35.44
[ALA]s:21	[G]a:1022	4.93	[A]a:1025			35.44
[GLN]s:22	[G]a:1022	4.38	[A]a:1025			0.0
[ILE]s:31	[A]a:1023	3.36				68.73
[LYS]s:32	[A]a:996	3.09	[U]a:1228	sugar:SC,  sugar:SC		64.12
[LYS]s:32	[G]a:1022	4.32	[A]a:1025			64.12
[LYS]s:32	[A]a:1023	2.86				64.12
[THR]s:33	[A]a:1023	3.84				82.79
[TRP]s:34	[A]a:1023	3.16				47.94
[TRP]s:34	[G]a:1024	3.62				47.94
[TRP]s:34	[U]a:1229	4.64	[A]a:995			47.94
[TRP]s:34	[G]a:1230	3.05	[C]a:994			47.94
[ARG]s:36	[G]a:1230	3.26	[C]a:994			98.31
[ARG]s:36	[G]a:1231	3.4	[C]a:993			98.31
[ARG]s:36	[C]a:1330	3.04		base:SC		98.31
[ARG]s:36	[U]a:1331	3.68		base:SC		98.31
[ARG]s:37	[G]a:1230	3.08	[C]a:994			71.05
[ARG]s:37	[C]a:1327	4.09				71.05
[ARG]s:37	[A]a:1328	2.72		base:SC		71.05
[ARG]s:37	[C]a:1330	4.05				71.05
[TYR]s:52	[A]a:995	2.38	[U]a:1229	base:SC, sugar:SC		82.03
[TYR]s:52	[A]a:996	4.37	[U]a:1228			82.03
[TYR]s:52	[A]a:1023	3.74				82.03
[TYR]s:52	[G]a:1230	2.41	[C]a:994	sugar:BB		82.03
[TYR]s:52	[G]a:1231	4.52	[C]a:993			82.03
[ASP]s:53	[A]a:967	3.12				91.98
[ASP]s:53	[A]a:968	4.85				91.98
[ASP]s:53	[G]a:1230	3.82	[C]a:994			91.98
[ASP]s:53	[G]a:1231	3.21	[C]a:993			91.98
[GLY]s:54	[A]a:967	3.08				99.0
[GLY]s:54	[C]a:994	4.57	[G]a:1230			99.0
[GLY]s:54	[A]a:995	3.27	[U]a:1229			99.0
[GLY]s:54	[G]a:1230	2.93	[C]a:994	base:BB		99.0
[GLY]s:54	[G]a:1231	4.27	[C]a:993			99.0
[ARG]s:55	[U]a:966	3.71				81.49
[ARG]s:55	[A]a:967	2.87		base:SC	base/AA stacks	81.49
[ARG]s:55	[A]a:995	2.34	[U]a:1229	sugar:BB		81.49
[ARG]s:55	[G]a:1230	4.66	[C]a:994			81.49
[LYS]s:56	[A]a:995	4.16	[U]a:1229			9.86
[LYS]s:56	[A]a:996	3.14	[U]a:1228			9.86
[HIS]s:69	[C]a:1330	3.37		sugar:SC		76.4
[LYS]s:70	[A]a:1329	4.03	[G]a:1371			85.64
[LYS]s:70	[C]a:1330	2.52				85.64
[GLY]s:72	[C]a:1330	2.97				93.14
[GLY]s:72	[U]a:1331	5.0				93.14
[GLU]s:73	[C]a:1330	3.44				90.57
[THR]s:77	[A]a:967	2.34		base:BB		95.1
[THR]s:77	[A]a:968	3.37		base:SC		95.1
[THR]s:77	[G]a:1231	3.27	[C]a:993			95.1
[THR]s:77	[G]a:1232	3.91				95.1
[ARG]s:78	[U]a:965	5.0	[U]a:969			87.48
[ARG]s:78	[U]a:966	3.17		sugar:BB		87.48
[ARG]s:78	[A]a:967	4.38				87.48
[ARG]s:78	[A]a:968	3.44				87.48
[ARG]s:78	[U]a:969	3.25	[U]a:965			87.48
[THR]s:79	[U]a:965	3.37	[U]a:969	sugar:BB		71.92
[THR]s:79	[U]a:966	3.36				71.92
[PHE]s:80	[U]a:965	2.79	[U]a:969	sugar:BB		16.27
[PHE]s:80	[U]a:969	4.22	[U]a:965			16.27
[PHE]s:80	[A]a:1235	4.64	[U]a:964			16.27
[PHE]s:80	[C]a:1236	4.26	[G]a:963			16.27
[LYS]s:81	[U]a:965	4.26	[U]a:969			39.23
[GLY]s:82	[U]a:964	3.61	[A]a:1235			3.37
[GLY]s:82	[U]a:965	3.72	[U]a:969			3.37
[HIS]s:83	[U]a:964	2.75	[A]a:1235	sugar:SC		78.25
[HIS]s:83	[U]a:965	4.91	[U]a:969			78.25
[HIS]s:83	[C]a:1236	4.02	[G]a:963			78.25
[HIS]s:83	[A]a:1237	3.47				78.25