Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[PRO]S:2	[G]A:1312	3.54	[C]A:1325			49.86
[PRO]S:2	[U]A:1313	3.05	[A]A:1324	base:BB		49.86
[PRO]S:2	[C]A:1314	2.79	[G]A:1323	base:BB		49.86
[PRO]S:2	[A]A:1319	4.96	[U]A:1315			49.86
[PRO]S:2	[C]A:1320	4.95				49.86
[PRO]S:2	[G]A:1323	3.8	[C]A:1314	base:BB		49.86
[PRO]S:2	[A]A:1324	4.31	[U]A:1313			49.86
[ARG]S:3	[U]A:1313	4.38	[A]A:1324			92.55
[ARG]S:3	[C]A:1314	4.48	[G]A:1323			92.55
[ARG]S:3	[G]A:1316	3.63				92.55
[ARG]S:3	[C]A:1317	4.79	[C]A:979			92.55
[ARG]S:3	[A]A:1318	2.61				92.55
[ARG]S:3	[A]A:1319	3.07	[U]A:1315			92.55
[SER]S:4	[U]A:1313	3.61	[A]A:1324			78.36
[SER]S:4	[C]A:1314	2.22	[G]A:1323			78.36
[SER]S:4	[G]A:1316	4.96				78.36
[LEU]S:5	[G]A:1312	3.65	[C]A:1325			37.19
[LEU]S:5	[U]A:1313	2.84	[A]A:1324			37.19
[LYS]S:6	[A]A:1271	4.19	[U]A:1264			37.38
[LYS]S:6	[U]A:1313	4.63	[A]A:1324			37.38
[LYS]S:6	[C]A:1314	2.43	[G]A:1323			37.38
[LYS]S:6	[U]A:1315	4.97	[A]A:1319			37.38
[LYS]S:7	[U]A:1315	4.94	[A]A:1319			91.07
[LYS]S:7	[G]A:1316	2.9		base:SC,  base:SC		91.07
[LYS]S:7	[A]A:1318	3.15				91.07
[PHE]S:10	[C]A:1317	4.44	[C]A:979			46.81
[PHE]S:10	[A]A:1318	3.37				46.81
[PHE]S:10	[A]A:1319	3.8	[U]A:1315			46.81
[HIS]S:14	[A]A:1014	3.51				38.04
[HIS]S:14	[G]A:1015	3.6				38.04
[LYS]S:17	[A]A:1012	3.27	[U]A:1017			53.89
[LYS]S:17	[G]A:1013	4.84	[A]A:1016			53.89
[LYS]S:18	[G]A:1013	4.42	[A]A:1016			46.82
[LYS]S:18	[A]A:1014	3.18				46.82
[LYS]S:21	[A]A:1012	4.63	[U]A:1017			29.13
[ARG]S:32	[G]A:987	4.47	[C]A:1218			66.74
[ARG]S:32	[A]A:1014	4.57				66.74
[TRP]S:34	[A]A:1014	3.4			base/AA stacks	47.13
[TRP]S:34	[A]A:1219	3.53	[U]A:986			47.13
[TRP]S:34	[G]A:1220	3.2	[C]A:985			47.13
[ARG]S:36	[G]A:1220	3.14	[C]A:985			98.57
[ARG]S:36	[G]A:1221	3.13	[C]A:984			98.57
[ARG]S:36	[C]A:1320	2.46		base:SC,  base:SC		98.57
[ARG]S:36	[U]A:1321	3.33				98.57
[ARG]S:37	[G]A:1220	4.42	[C]A:985			62.65
[ARG]S:37	[C]A:1317	2.66	[C]A:979	base:SC,  base:SC		62.65
[ARG]S:37	[A]A:1318	3.42				62.65
[ARG]S:37	[A]A:1319	4.98	[U]A:1315			62.65
[ARG]S:37	[C]A:1320	3.81				62.65
[HIS]S:52	[U]A:986	4.13	[A]A:1219			76.49
[HIS]S:52	[G]A:1220	2.87	[C]A:985			76.49
[ASN]S:53	[A]A:958	2.98		base:BB		91.84
[ASN]S:53	[G]A:1220	4.31	[C]A:985			91.84
[ASN]S:53	[G]A:1221	3.64	[C]A:984	sugar:BB		91.84
[GLY]S:54	[A]A:958	3.05				99.0
[GLY]S:54	[C]A:985	4.58	[G]A:1220			99.0
[GLY]S:54	[U]A:986	3.4	[A]A:1219			99.0
[GLY]S:54	[G]A:1220	2.84	[C]A:985	base:BB		99.0
[GLY]S:54	[G]A:1221	3.26	[C]A:984			99.0
[ARG]S:55	[U]A:957	4.27	[A]A:959			72.4
[ARG]S:55	[A]A:958	2.94			base/AA stacks	72.4
[ARG]S:55	[U]A:986	3.32	[A]A:1219	sugar:BB		72.4
[ARG]S:55	[G]A:1220	4.99	[C]A:985			72.4
[LYS]S:70	[A]A:1318	4.14				80.26
[LYS]S:70	[A]A:1319	3.03	[U]A:1315			80.26
[LYS]S:70	[C]A:1320	3.07				80.26
[GLY]S:72	[C]A:1320	3.25				90.27
[GLU]S:73	[C]A:1320	3.5				92.44
[THR]S:77	[A]A:958	3.02		base:BB		97.97
[THR]S:77	[A]A:959	2.73	[U]A:957	base:BB		97.97
[THR]S:77	[G]A:1221	3.1	[C]A:984			97.97
[THR]S:77	[G]A:1222	2.61	[A]A:983			97.97
[THR]S:77	[U]A:1321	3.22		sugar:SC		97.97
[ARG]S:78	[A]A:959	3.95	[U]A:957			85.53
[ARG]S:78	[U]A:960	4.13	[U]A:956			85.53
[ARG]S:78	[G]A:1222	3.47	[A]A:983			85.53
[ARG]S:78	[C]A:1223	2.91				85.53
[ARG]S:78	[U]A:1224	3.15				85.53
[ARG]S:78	[A]A:1225	3.17	[U]A:955			85.53
[ARG]S:78	[U]A:1321	2.91		sugar:SC		85.53
[ARG]S:78	[C]A:1322	2.75				85.53
[THR]S:79	[U]A:956	3.97	[U]A:960	sugar:BB		70.24
[THR]S:79	[U]A:957	3.29	[A]A:959			70.24
[THR]S:79	[A]A:958	4.21				70.24
[THR]S:79	[A]A:959	4.87	[U]A:957			70.24
[THR]S:79	[U]A:960	4.25	[U]A:956			70.24
[TYR]S:80	[U]A:956	3.71	[U]A:960			26.37
[TYR]S:80	[A]A:1225	4.69	[U]A:955			26.37
[TYR]S:80	[C]A:1226	3.42	[G]A:954			26.37
[TYR]S:80	[A]A:1227	2.93				26.37
[ARG]S:81	[U]A:957	3.56	[A]A:959			32.77
[ARG]S:81	[A]A:958	4.77				32.77
[GLY]S:82	[U]A:956	4.41	[U]A:960			3.28
[HIS]S:83	[G]A:954	4.26	[C]A:1226			82.02
[HIS]S:83	[U]A:955	2.91	[A]A:1225	base:SC		82.02
[HIS]S:83	[U]A:956	3.58	[U]A:960			82.02
[HIS]S:83	[A]A:1225	4.75	[U]A:955			82.02
[HIS]S:83	[C]A:1226	2.96	[G]A:954			82.02
[HIS]S:83	[A]A:1227	3.46			base/AA stacks	82.02
[ALA]S:84	[U]A:955	4.83	[A]A:1225			47.41
[ALA]S:84	[A]A:1227	3.58				47.41