Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[PRO]s:2	[G]a:1309	3.75	[C]a:1322			49.7
[PRO]s:2	[U]a:1310	3.04	[A]a:1321	base:BB		49.7
[PRO]s:2	[C]a:1311	2.61	[G]a:1320	base:BB		49.7
[PRO]s:2	[U]a:1312	4.96	[A]a:1316			49.7
[PRO]s:2	[G]a:1320	4.02	[C]a:1311			49.7
[PRO]s:2	[A]a:1321	4.23	[U]a:1310			49.7
[ARG]s:3	[U]a:1310	4.42	[A]a:1321			93.0
[ARG]s:3	[C]a:1311	4.64	[G]a:1320			93.0
[ARG]s:3	[G]a:1313	3.44	[A]a:975			93.0
[ARG]s:3	[C]a:1314	4.98	[C]a:976			93.0
[ARG]s:3	[A]a:1315	2.81				93.0
[ARG]s:3	[A]a:1316	3.06	[U]a:1312			93.0
[SER]s:4	[U]a:1310	3.64	[A]a:1321			81.73
[SER]s:4	[C]a:1311	2.75	[G]a:1320			81.73
[LEU]s:5	[G]a:1309	3.77	[C]a:1322			13.56
[LEU]s:5	[U]a:1310	3.2	[A]a:1321			13.56
[LYS]s:6	[G]a:1268	4.7	[C]a:1261			21.07
[LYS]s:6	[U]a:1310	4.99	[A]a:1321			21.07
[LYS]s:6	[C]a:1311	2.71	[G]a:1320			21.07
[LYS]s:7	[G]a:1313	3.22	[A]a:975	base:SC,  base:SC		89.87
[LYS]s:7	[A]a:1315	3.42				89.87
[PHE]s:10	[C]a:1314	4.06	[C]a:976			40.78
[PHE]s:10	[A]a:1315	3.84				40.78
[PHE]s:10	[A]a:1316	4.22	[U]a:1312			40.78
[HIS]s:14	[A]a:1011	3.79				36.27
[HIS]s:14	[G]a:1012	4.5				36.27
[LYS]s:18	[G]a:1010	4.69	[A]a:1013			49.64
[LYS]s:18	[A]a:1011	2.34				49.64
[TRP]s:34	[A]a:1011	3.25			base/AA stacks	53.34
[TRP]s:34	[A]a:1216	3.98	[U]a:983			53.34
[TRP]s:34	[G]a:1217	3.61	[C]a:982			53.34
[ARG]s:36	[G]a:1217	3.37	[C]a:982			98.14
[ARG]s:36	[G]a:1218	3.21	[C]a:981			98.14
[ARG]s:36	[C]a:1317	2.57		base:SC,  base:SC		98.14
[ARG]s:36	[U]a:1318	3.43				98.14
[ARG]s:37	[G]a:1217	4.54	[C]a:982			60.66
[ARG]s:37	[C]a:1314	3.35	[C]a:976	base:SC		60.66
[ARG]s:37	[A]a:1315	3.27				60.66
[ARG]s:37	[C]a:1317	3.87				60.66
[HIS]s:52	[U]a:983	4.94	[A]a:1216			83.59
[HIS]s:52	[G]a:1217	2.74	[C]a:982	sugar:SC		83.59
[ASN]s:53	[A]a:955	3.57		base:BB		88.77
[ASN]s:53	[G]a:1217	4.35	[C]a:982			88.77
[ASN]s:53	[G]a:1218	3.83	[C]a:981			88.77
[GLY]s:54	[A]a:955	3.21				99.0
[GLY]s:54	[C]a:982	4.73	[G]a:1217			99.0
[GLY]s:54	[U]a:983	3.63	[A]a:1216			99.0
[GLY]s:54	[G]a:1217	3.05	[C]a:982	base:BB		99.0
[GLY]s:54	[G]a:1218	3.6	[C]a:981			99.0
[ARG]s:55	[U]a:954	4.69	[A]a:956			72.34
[ARG]s:55	[A]a:955	2.66			base/AA stacks	72.34
[ARG]s:55	[U]a:983	3.5	[A]a:1216	sugar:BB		72.34
[LYS]s:70	[A]a:1315	4.49				88.36
[LYS]s:70	[A]a:1316	3.27	[U]a:1312			88.36
[LYS]s:70	[C]a:1317	3.27				88.36
[GLY]s:72	[C]a:1317	3.31				94.77
[GLU]s:73	[C]a:1317	3.53				89.4
[THR]s:77	[A]a:955	3.51		base:BB		96.37
[THR]s:77	[A]a:956	3.21	[U]a:954	base:BB		96.37
[THR]s:77	[G]a:1218	3.29	[C]a:981			96.37
[THR]s:77	[G]a:1219	2.85				96.37
[THR]s:77	[U]a:1318	3.5				96.37
[ARG]s:78	[A]a:956	4.42	[U]a:954			89.28
[ARG]s:78	[U]a:957	4.28	[U]a:953			89.28
[ARG]s:78	[G]a:1219	3.59				89.28
[ARG]s:78	[C]a:1220	2.78				89.28
[ARG]s:78	[U]a:1221	3.6				89.28
[ARG]s:78	[A]a:1222	3.51	[U]a:952			89.28
[ARG]s:78	[U]a:1318	3.31				89.28
[ARG]s:78	[C]a:1319	3.12				89.28
[THR]s:79	[U]a:953	4.27	[U]a:957			74.97
[THR]s:79	[U]a:954	3.57	[A]a:956			74.97
[THR]s:79	[A]a:955	4.53				74.97
[THR]s:79	[U]a:957	4.62	[U]a:953			74.97
[TYR]s:80	[U]a:953	4.06	[U]a:957			40.61
[TYR]s:80	[A]a:1222	4.97	[U]a:952			40.61
[TYR]s:80	[C]a:1223	3.66	[G]a:951			40.61
[TYR]s:80	[A]a:1224	2.96				40.61
[ARG]s:81	[U]a:954	4.26	[A]a:956			11.44
[ARG]s:81	[A]a:955	4.62				11.44
[GLY]s:82	[U]a:953	4.39	[U]a:957			1.63
[HIS]s:83	[G]a:951	3.86	[C]a:1223			78.99
[HIS]s:83	[U]a:952	2.76	[A]a:1222	sugar:SC		78.99
[HIS]s:83	[U]a:953	4.33	[U]a:957			78.99
[HIS]s:83	[C]a:1223	3.08	[G]a:951	base:SC, sugar:SC		78.99
[HIS]s:83	[A]a:1224	3.45			base/AA stacks	78.99