Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[TYR]L:3	[A]A:2717	3.04			base/AA stacks	3.34
[TYR]L:3	[G]A:2892	3.57	[G]A:2746	base:SC		3.34
[TYR]L:3	[A]A:2893	3.69	[U]A:2747		base/AA stacks	3.34
[ARG]L:4	[G]A:1695	4.88	[C]A:2033			50.72
[ARG]L:4	[C]A:1696	2.64	[A]A:2032			50.72
[ARG]L:4	[A]A:2717	2.98		base:BB		50.72
[ARG]L:4	[C]A:2838	4.75	[G]A:2848			50.72
[LYS]L:5	[G]A:1697	3.22		sugar:SC		79.78
[LYS]L:5	[A]A:2028	2.98	[U]A:1703			79.78
[LYS]L:5	[G]A:2029	3.35	[C]A:1702			79.78
[LEU]L:6	[G]A:1695	4.48	[C]A:2033			73.93
[LEU]L:6	[C]A:1696	4.8	[A]A:2032			73.93
[LEU]L:6	[G]A:1697	3.44				73.93
[GLY]L:7	[G]A:1697	2.72		base:BB		62.02
[GLY]L:7	[A]A:2030	3.73	[U]A:1701			62.02
[ARG]L:8	[A]A:1312	4.68				81.84
[ARG]L:8	[G]A:1313	2.84	[C]A:1331	sugar:SC		81.84
[ARG]L:8	[A]A:1314	3.5	[U]A:1330			81.84
[ARG]L:8	[A]A:1694	4.46	[U]A:2034			81.84
[ARG]L:8	[G]A:1697	4.83				81.84
[ARG]L:8	[G]A:2029	3.74	[C]A:1702			81.84
[THR]L:9	[A]A:2028	4.88	[U]A:1703			34.12
[THR]L:9	[G]A:2029	4.52	[C]A:1702			34.12
[SER]L:10	[G]A:2029	4.78	[C]A:1702			49.67
[SER]L:10	[U]A:2716	3.46				49.67
[SER]L:10	[A]A:2717	2.44				49.67
[ASP]L:11	[A]A:1312	4.5				48.02
[ASP]L:11	[C]A:2737	3.53	[G]A:2724			48.02
[GLN]L:12	[A]A:1312	3.65				62.37
[ARG]L:13	[G]A:2029	3.75	[C]A:1702			89.21
[ARG]L:13	[U]A:2716	4.69				89.21
[ARG]L:13	[A]A:2717	2.88		base:SC		89.21
[LYS]L:14	[G]A:2735	4.5	[C]A:2726			46.64
[LYS]L:14	[G]A:2736	3.0	[U]A:2725			46.64
[ALA]L:15	[A]A:1312	3.98				83.74
[ALA]L:15	[C]A:1332	4.38	[G]A:1689			83.74
[MET]L:16	[G]A:1313	4.15	[C]A:1331			79.57
[MET]L:16	[A]A:1314	3.58	[U]A:1330			79.57
[LEU]L:17	[A]A:2717	3.93				45.35
[ARG]L:18	[G]A:2735	3.47	[C]A:2726	sugar:SC		81.04
[ARG]L:18	[G]A:2736	4.21	[U]A:2725			81.04
[ASP]L:19	[A]A:1314	4.69	[U]A:1330			82.63
[LEU]L:20	[A]A:1314	2.92	[U]A:1330			83.98
[LEU]L:20	[C]A:1315	3.98	[G]A:1329			83.98
[SER]L:23	[A]A:1314	4.83	[U]A:1330			80.44
[SER]L:23	[C]A:1315	3.43	[G]A:1329			80.44
[SER]L:27	[G]A:1316	4.44	[C]A:1328			70.41
[ARG]L:29	[G]A:1316	4.48	[C]A:1328			42.34
[ILE]L:30	[C]A:1315	3.62	[G]A:1329			88.36
[ILE]L:30	[G]A:1316	3.41	[C]A:1328			88.36
[GLU]L:31	[C]A:1315	3.75	[G]A:1329			40.75
[GLU]L:31	[G]A:1316	2.75	[C]A:1328			40.75
[THR]L:32	[A]A:1314	4.74	[U]A:1330			99.0
[THR]L:32	[C]A:1315	3.22	[G]A:1329			99.0
[THR]L:33	[A]A:1694	3.93	[U]A:2034			97.87
[THR]L:33	[G]A:1695	2.88	[C]A:2033			97.87
[GLU]L:34	[U]A:2837	3.36	[A]A:2849			6.06
[ALA]L:35	[G]A:1695	4.32	[C]A:2033			74.48
[ALA]L:35	[C]A:1696	4.37	[A]A:2032			74.48
[ARG]L:36	[A]A:1314	3.54	[U]A:1330			82.9
[ARG]L:36	[C]A:1315	4.0	[G]A:1329			82.9
[ARG]L:36	[A]A:1694	3.66	[U]A:2034			82.9
[ARG]L:36	[G]A:1695	3.86	[C]A:2033			82.9
[LYS]L:38	[U]A:2837	3.2	[A]A:2849			87.76
[LYS]L:38	[C]A:2838	3.1	[G]A:2848			87.76
[GLU]L:39	[A]A:2717	2.79		base:SC		58.19
[ARG]L:41	[C]A:2838	3.99	[G]A:2848			59.68
[ARG]L:41	[A]A:2857	4.86	[U]A:2901			59.68
[ARG]L:41	[G]A:2858	3.42	[C]A:2900			59.68
[ARG]L:41	[U]A:2901	4.78	[A]A:2857			59.68
[SER]L:42	[G]A:2858	4.33	[C]A:2900			51.08
[SER]L:42	[G]A:2859	3.61	[U]A:2898			51.08
[VAL]L:43	[A]A:2717	4.99				0.46
[GLU]L:45	[G]A:2858	3.98	[C]A:2900	sugar:SC		85.21
[GLU]L:45	[G]A:2859	3.28	[U]A:2898			85.21
[GLU]L:45	[U]A:2860	3.91	[A]A:2897			85.21
[LYS]L:46	[G]A:2859	4.32	[U]A:2898			70.33
[LYS]L:46	[U]A:2860	3.82	[A]A:2897			70.33
[LYS]L:46	[G]A:2892	3.4	[G]A:2746			70.33
[THR]L:49	[G]A:2859	4.68	[U]A:2898			80.07
[THR]L:49	[U]A:2860	2.86	[A]A:2897			80.07
[THR]L:49	[U]A:2861	4.25	[A]A:2896			80.07
[LYS]L:53	[U]A:2861	4.36	[A]A:2896			42.45
[LEU]L:56	[U]A:1498	3.5				59.71
[LEU]L:56	[U]A:1499	4.21	[C]A:2731			59.71
[LEU]L:56	[A]A:2871	4.38	[G]A:2886			59.71
[LEU]L:56	[G]A:2872	4.72	[U]A:2885			59.71
[ALA]L:57	[A]A:2870	4.67				49.77
[ARG]L:59	[U]A:1498	3.08				68.97
[ARG]L:60	[U]A:1498	3.0		base:SC,  base:SC		92.09
[ARG]L:60	[U]A:1499	4.06	[C]A:2731			92.09
[ARG]L:60	[A]A:2732	4.55				92.09
[ARG]L:60	[A]A:2733	4.4	[U]A:2728			92.09
[ARG]L:60	[A]A:2871	3.6	[G]A:2886			92.09
[ARG]L:60	[G]A:2872	3.9	[U]A:2885			92.09
[ASN]L:61	[C]A:2890	4.86	[G]A:2866			0.14
[ALA]L:63	[U]A:1498	3.8				4.5
[ALA]L:63	[C]A:2734	4.49	[G]A:2727			4.5
[LYS]L:64	[C]A:2734	3.49	[G]A:2727			52.56
[LYS]L:64	[G]A:2735	3.9	[C]A:2726			52.56
[ARG]L:67	[C]A:1331	3.68	[G]A:1313			18.31
[ARG]L:67	[C]A:1332	3.9	[G]A:1689			18.31
[ARG]L:67	[G]A:2735	4.59	[C]A:2726			18.31
[ASN]L:68	[C]A:1331	4.1	[G]A:1313			45.85
[ASN]L:68	[U]A:2728	3.96	[A]A:2733			45.85
[VAL]L:69	[U]A:1330	4.01	[A]A:1314			49.83
[VAL]L:69	[C]A:1331	4.08	[G]A:1313			49.83
[LEU]L:82	[U]A:1498	3.92				64.61
[GLN]L:83	[A]A:1497	4.67				33.38
[GLN]L:83	[U]A:1498	3.45				33.38
[ARG]L:96	[C]A:2900	2.62	[G]A:2858	sugar:SC		84.08
[ARG]L:96	[U]A:2901	3.83	[A]A:2857			84.08
[GLN]L:97	[G]A:2859	3.29	[U]A:2898	base:BB		35.7
[GLN]L:97	[U]A:2860	4.39	[A]A:2897			35.7
[GLN]L:97	[C]A:2900	3.38	[G]A:2858			35.7
[GLY]L:98	[G]A:2858	4.75	[C]A:2900			86.32
[GLY]L:98	[G]A:2859	3.34	[U]A:2898			86.32
[GLY]L:98	[U]A:2860	3.84	[A]A:2897			86.32
[GLY]L:98	[C]A:2900	2.99	[G]A:2858	sugar:BB		86.32
[GLY]L:99	[G]A:2858	3.78	[C]A:2900			93.9
[GLY]L:99	[G]A:2859	3.45	[U]A:2898	sugar:BB		93.9
[GLY]L:99	[C]A:2900	3.15	[G]A:2858			93.9
[GLY]L:99	[U]A:2901	3.8	[A]A:2857			93.9
[TYR]L:100	[G]A:2859	4.32	[U]A:2898			65.96
[TYR]L:100	[U]A:2860	4.8	[A]A:2897			65.96
[TYR]L:100	[C]A:2900	4.53	[G]A:2858			65.96
[TYR]L:100	[U]A:2901	4.88	[A]A:2857			65.96
[THR]L:101	[U]A:2901	2.94	[A]A:2857	sugar:BB		82.53
[ARG]L:102	[U]A:2901	3.64	[A]A:2857			80.41
[ARG]L:102	[A]A:2902	3.41	[U]A:2856			80.41
[ILE]L:103	[U]A:2901	4.78	[A]A:2857			71.75
[ILE]L:103	[A]A:2902	4.45	[U]A:2856			71.75
[LYS]L:105	[C]A:2836	3.08	[G]A:2850			71.12
[LYS]L:105	[U]A:2837	3.24	[A]A:2849			71.12
[ARG]L:109	[A]A:1324	3.37				93.83
[ARG]L:109	[G]A:1693	4.5	[C]A:2035			93.83
[ARG]L:109	[A]A:1694	4.48	[U]A:2034			93.83
[ARG]L:110	[G]A:1322	3.94				41.59
[ARG]L:110	[A]A:1323	4.23	[U]A:1319			41.59
[ARG]L:110	[A]A:1324	3.44				41.59
[ARG]L:110	[C]A:1364	2.8		sugar:SC		41.59
[ARG]L:110	[G]A:1365	3.23				41.59
[ARG]L:110	[G]A:2036	4.26	[C]A:1692			41.59
[GLY]L:111	[A]A:1324	3.01		base:BB		86.49
[GLY]L:111	[U]A:1325	3.08				86.49
[GLY]L:111	[G]A:2036	3.64	[C]A:1692	base:BB		86.49
[ASP]L:112	[A]A:1324	2.9		base:SC		98.47
[ASP]L:112	[G]A:1693	2.61	[C]A:2035	sugar:SC,  sugar:SC		98.47
[ASP]L:112	[A]A:1694	3.86	[U]A:2034			98.47
[ASP]L:112	[G]A:2036	3.86	[C]A:1692			98.47
[GLY]L:113	[G]A:1693	4.48	[C]A:2035			51.89
[GLY]L:113	[G]A:2036	3.83	[C]A:1692			51.89
[ALA]L:114	[A]A:1694	3.44	[U]A:2034			87.93
[GLU]L:115	[A]A:1694	4.86	[U]A:2034			42.05
[VAL]L:122	[U]A:2901	4.91	[A]A:2857			62.28