Residue	Ribonucleotide	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stack Type	Residue conservation
[MET]M:1	[A]A:1652	3.25				95.62
[MET]M:1	[C]A:1996	4.37	[G]A:1658			95.62
[MET]M:1	[C]A:2719	3.68	[G]A:2682			95.62
[MET]M:1	[U]A:2720	4.15	[G]A:2681			95.62
[ARG]M:2	[G]A:1651	3.66				78.05
[ARG]M:2	[A]A:1652	3.95				78.05
[ARG]M:2	[G]A:2718	4.65	[U]A:2683			78.05
[ARG]M:2	[C]A:2815	4.88	[G]A:2823			78.05
[ARG]M:2	[G]A:2816	2.98				78.05
[ARG]M:2	[A]A:2817	4.07	[A]A:2822			78.05
[ARG]M:2	[G]A:2818	2.98		base:SC		78.05
[HIS]M:3	[G]A:2718	2.84	[U]A:2683	sugar:BB		83.52
[HIS]M:3	[C]A:2719	3.11	[G]A:2682			83.52
[HIS]M:3	[G]A:2816	3.82				83.52
[HIS]M:3	[A]A:2817	3.85	[A]A:2822			83.52
[HIS]M:3	[G]A:2818	4.58				83.52
[ARG]M:4	[A]A:2717	4.72	[G]A:2684			66.31
[ARG]M:4	[G]A:2718	4.2	[U]A:2683			66.31
[ARG]M:4	[G]A:2816	2.9			base/AA stacks	66.31
[ARG]M:4	[A]A:2869	3.71	[U]A:2716			66.31
[ARG]M:4	[C]A:2870	3.58	[G]A:2839			66.31
[ARG]M:4	[C]A:2871	3.34	[G]A:2838			66.31
[ASN]M:5	[A]A:2717	4.08	[G]A:2684			43.97
[ASN]M:5	[G]A:2718	4.0	[U]A:2683			43.97
[ASN]M:5	[G]A:2816	4.41				43.97
[ASN]M:5	[A]A:2869	3.77	[U]A:2716			43.97
[SER]M:6	[A]A:2686	3.85				40.73
[SER]M:6	[G]A:2868	4.0	[G]A:2715			40.73
[SER]M:6	[A]A:2869	3.44	[U]A:2716	base:BB		40.73
[GLY]M:7	[A]A:2686	3.7				4.16
[VAL]M:8	[A]A:2686	3.52				42.15
[LYS]M:9	[G]A:1651	3.4				69.62
[LYS]M:9	[A]A:1997	3.48	[U]A:1657			69.62
[LYS]M:9	[G]A:1998	2.6	[C]A:1656			69.62
[LEU]M:10	[G]A:1649	4.03	[C]A:2002			63.8
[LEU]M:10	[A]A:1650	3.84				63.8
[LEU]M:10	[G]A:1651	3.3				63.8
[GLY]M:11	[G]A:1651	3.37		base:BB		66.75
[GLY]M:11	[A]A:1999	3.77	[U]A:1655			66.75
[ARG]M:12	[A]A:1271	3.4	[U]A:1289	sugar:SC		80.4
[ARG]M:12	[A]A:1272	3.95	[U]A:1288			80.4
[ARG]M:12	[A]A:1648	4.63	[U]A:2003			80.4
[ARG]M:12	[G]A:1998	3.79	[C]A:1656			80.4
[ARG]M:12	[A]A:1999	4.8	[U]A:1655			80.4
[THR]M:13	[A]A:1270	4.98				34.77
[THR]M:13	[G]A:1998	4.69	[C]A:1656			34.77
[SER]M:14	[U]A:2685	3.95				56.39
[SER]M:14	[A]A:2686	3.2				56.39
[SER]M:15	[A]A:1270	4.59				56.09
[SER]M:15	[C]A:2706	3.57	[G]A:2693			56.09
[HIS]M:16	[A]A:1270	3.25		sugar:SC	base/AA stacks	65.16
[HIS]M:16	[A]A:1271	3.24	[U]A:1289			65.16
[ARG]M:17	[G]A:1998	4.42	[C]A:1656			85.47
[ARG]M:17	[A]A:2686	3.46				85.47
[LYS]M:18	[C]A:2704	4.17	[G]A:2695			53.59
[LYS]M:18	[G]A:2705	2.9	[U]A:2694			53.59
[ALA]M:19	[A]A:1270	4.34				81.55
[ALA]M:19	[C]A:1290	3.98	[G]A:1643			81.55
[MET]M:20	[A]A:1271	4.23	[U]A:1289			75.27
[MET]M:20	[A]A:1272	3.91	[U]A:1288			75.27
[ASN]M:23	[A]A:1271	4.56	[U]A:1289			80.78
[ASN]M:23	[A]A:1272	4.8	[U]A:1288			80.78
[ASN]M:23	[U]A:1289	2.59	[A]A:1271	sugar:SC		80.78
[ASN]M:23	[C]A:1290	3.4	[G]A:1643	sugar:SC		80.78
[LEU]M:24	[A]A:1272	3.43	[U]A:1288			86.22
[LEU]M:24	[C]A:1273	4.08	[G]A:1287			86.22
[ASN]M:26	[U]A:1289	4.94	[A]A:1271			61.52
[SER]M:27	[C]A:1273	3.66	[G]A:1287			77.89
[HIS]M:31	[C]A:1273	3.72	[G]A:1287			67.54
[HIS]M:31	[G]A:1274	3.56	[C]A:1286			67.54
[LEU]M:33	[G]A:1274	4.33	[C]A:1286			47.5
[ILE]M:34	[C]A:1273	3.74	[G]A:1287			85.17
[ILE]M:34	[G]A:1274	3.42	[C]A:1286			85.17
[LYS]M:35	[C]A:1273	3.73	[G]A:1287			44.14
[LYS]M:35	[G]A:1274	3.04	[C]A:1286			44.14
[THR]M:36	[A]A:1272	4.18	[U]A:1288			99.0
[THR]M:36	[C]A:1273	2.63	[G]A:1287			99.0
[THR]M:37	[C]A:1273	4.59	[G]A:1287			99.0
[THR]M:37	[A]A:1648	4.14	[U]A:2003			99.0
[THR]M:37	[G]A:1649	3.51	[C]A:2002			99.0
[PRO]M:39	[G]A:1649	3.51	[C]A:2002			75.23
[PRO]M:39	[A]A:1650	4.5				75.23
[LYS]M:40	[A]A:1272	4.75	[U]A:1288			87.21
[LYS]M:40	[A]A:1648	4.19	[U]A:2003			87.21
[LYS]M:40	[G]A:1649	3.06	[C]A:2002			87.21
[LYS]M:42	[U]A:2813	2.96	[A]A:2825			88.23
[LYS]M:42	[U]A:2814	2.75	[G]A:2824			88.23
[ARG]M:45	[U]A:2814	3.8	[G]A:2824			64.29
[ARG]M:45	[A]A:2833	4.95	[U]A:2877			64.29
[ARG]M:45	[G]A:2834	3.75	[C]A:2876			64.29
[ARG]M:45	[U]A:2877	4.98	[A]A:2833			64.29
[ARG]M:46	[G]A:2834	3.68	[C]A:2876			54.08
[ARG]M:46	[G]A:2835	2.98	[U]A:2874			54.08
[ARG]M:46	[G]A:2868	3.74	[G]A:2715			54.08
[ARG]M:46	[A]A:2869	4.63	[U]A:2716			54.08
[GLU]M:49	[G]A:2834	4.5	[C]A:2876			82.43
[GLU]M:49	[G]A:2835	3.12	[U]A:2874			82.43
[GLU]M:49	[U]A:2836	4.44	[A]A:2873			82.43
[PRO]M:50	[G]A:2835	4.72	[U]A:2874			73.06
[PRO]M:50	[U]A:2836	3.72	[A]A:2873			73.06
[THR]M:53	[G]A:2835	4.86	[U]A:2874			84.19
[THR]M:53	[U]A:2836	3.17	[A]A:2873			84.19
[THR]M:53	[U]A:2837	3.85	[A]A:2872			84.19
[VAL]M:60	[U]A:1449	3.98				58.24
[VAL]M:60	[G]A:1450	4.48	[C]A:2700			58.24
[VAL]M:60	[A]A:2847	4.26	[G]A:2862			58.24
[ALA]M:61	[A]A:2846	3.97				49.22
[ALA]M:61	[A]A:2847	4.85	[G]A:2862			49.22
[ARG]M:63	[U]A:1448	3.34		sugar:SC		67.28
[ARG]M:63	[U]A:1449	3.48				67.28
[ARG]M:64	[U]A:1449	3.16		base:SC		91.71
[ARG]M:64	[G]A:1450	3.38	[C]A:2700			91.71
[ARG]M:64	[A]A:2701	3.71				91.71
[ARG]M:64	[G]A:2702	3.39	[C]A:2697			91.71
[ARG]M:64	[A]A:2847	3.4	[G]A:2862			91.71
[ARG]M:64	[G]A:2848	3.6	[U]A:2861			91.71
[LEU]M:65	[C]A:2866	4.55	[G]A:2842			36.16
[PHE]M:67	[U]A:1449	3.62				0.18
[PHE]M:67	[C]A:2697	3.76	[G]A:2702			0.18
[PHE]M:67	[G]A:2702	4.1	[C]A:2697			0.18
[PHE]M:67	[U]A:2703	4.58	[A]A:2696			0.18
[ALA]M:68	[U]A:2703	3.58	[A]A:2696			46.82
[ALA]M:68	[C]A:2704	3.78	[G]A:2695			46.82
[ARG]M:69	[C]A:2866	3.71	[G]A:2842			0.0
[ARG]M:69	[U]A:2867	3.46	[U]A:2841			0.0
[ARG]M:71	[A]A:2696	3.69	[U]A:2703			19.43
[ARG]M:71	[C]A:2697	4.13	[G]A:2702			19.43
[ARG]M:71	[G]A:2702	4.64	[C]A:2697			19.43
[ARG]M:71	[U]A:2703	2.86	[A]A:2696	base:SC, sugar:SC		19.43
[ARG]M:71	[C]A:2704	3.25	[G]A:2695		base/AA stacks	19.43
[ALA]M:73	[U]A:1448	3.66				51.61
[ALA]M:74	[U]A:1448	3.62				39.22
[VAL]M:76	[U]A:1449	4.62				68.62
[GLY]M:77	[U]A:1448	3.5				42.96
[ARG]M:90	[C]A:2876	3.44	[G]A:2834			85.95
[ARG]M:90	[U]A:2877	4.27	[A]A:2833			85.95
[ASN]M:91	[G]A:2835	3.08	[U]A:2874	base:BB		50.27
[ASN]M:91	[U]A:2836	3.99	[A]A:2873			50.27
[ASN]M:91	[C]A:2876	3.36	[G]A:2834			50.27
[GLY]M:92	[G]A:2834	4.77	[C]A:2876			83.6
[GLY]M:92	[G]A:2835	3.38	[U]A:2874			83.6
[GLY]M:92	[U]A:2836	3.81	[A]A:2873			83.6
[GLY]M:92	[C]A:2876	2.88	[G]A:2834	sugar:BB		83.6
[GLY]M:93	[G]A:2834	3.76	[C]A:2876			93.58
[GLY]M:93	[G]A:2835	3.55	[U]A:2874	sugar:BB		93.58
[GLY]M:93	[C]A:2876	3.09	[G]A:2834	sugar:BB		93.58
[GLY]M:93	[U]A:2877	3.53	[A]A:2833			93.58
[TYR]M:94	[G]A:2835	4.72	[U]A:2874			72.29
[TYR]M:94	[U]A:2836	4.39	[A]A:2873			72.29
[TYR]M:94	[C]A:2876	4.8	[G]A:2834			72.29
[LEU]M:95	[U]A:2877	3.05	[A]A:2833	sugar:BB		84.64
[ARG]M:96	[U]A:2877	3.93	[A]A:2833			87.5
[ARG]M:96	[A]A:2878	2.98	[U]A:2832			87.5
[VAL]M:97	[U]A:2877	4.88	[A]A:2833			75.04
[VAL]M:97	[A]A:2878	4.52	[U]A:2832			75.04
[LEU]M:98	[A]A:2878	4.72	[U]A:2832			44.81
[LYS]M:99	[G]A:2812	3.38	[C]A:2826			69.51
[LYS]M:99	[U]A:2813	2.89	[A]A:2825			69.51
[LYS]M:99	[A]A:2878	4.62	[U]A:2832			69.51
[ARG]M:103	[A]A:1282	3.28				96.12
[ARG]M:103	[G]A:1647	4.24	[C]A:2004			96.12
[ARG]M:103	[A]A:1648	4.1	[U]A:2003			96.12
[ALA]M:104	[A]A:1280	4.65				36.82
[ALA]M:104	[A]A:1281	4.57	[U]A:1277			36.82
[ALA]M:104	[A]A:1282	3.77				36.82
[GLY]M:105	[A]A:1282	2.76				84.4
[GLY]M:105	[A]A:1283	3.89		base:BB		84.4
[ASP]M:106	[A]A:1282	3.35			base/AA stacks	98.45
[ASP]M:106	[G]A:1647	2.42	[C]A:2004	base:BB, sugar:SC		98.45
[ASP]M:106	[A]A:1648	3.42	[U]A:2003			98.45
[ASP]M:106	[C]A:2004	4.85	[G]A:1647			98.45
[ASP]M:106	[A]A:2005	4.17	[U]A:1646			98.45
[ALA]M:107	[A]A:2005	3.61	[U]A:1646			63.48
[ALA]M:108	[A]A:1648	3.26	[U]A:2003			89.29
[PRO]M:109	[A]A:1648	4.19	[U]A:2003			36.73
[VAL]M:116	[U]A:2877	4.27	[A]A:2833			65.01