RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group106 > 1JJ2_L_0 vs 1YHQ_M_0

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

1JJ2_L
1JJ2_0
1YHQ_M
1YHQ_0
Conserved?
L:149 [TRP] 0:432 [G] M:149 [TRP] 0:432 [G] ✔
L:149 [TRP] 0:433 [C] M:149 [TRP] 0:433 [C] ✔
L:76 [ARG] 0:1864 [C] M:76 [ARG] 0:1864 [C] ✔
L:76 [ARG] 0:2121 [G] M:76 [ARG] 0:2121 [G] ✔
L:76 [ARG] 0:2122 [C] M:76 [ARG] 0:2122 [C] ✔
L:76 [ARG] 0:2123 [A] M:76 [ARG] 0:2123 [A] ✔
L:76 [ARG] 0:2272 [G] M:76 [ARG] 0:2272 [G] ✔
L:76 [ARG] 0:2273 [C] M:76 [ARG] 0:2273 [C] ✔
L:76 [ARG] 0:2274 [A] M:76 [ARG] 0:2274 [A] ✔
L:50 [ARG] 0:241 [A] M:50 [ARG] 0:241 [A] ✔
L:50 [ARG] 0:242 [A] M:50 [ARG] 0:242 [A] ✔
L:50 [ARG] 0:264 [G] M:50 [ARG] 0:264 [G] ✔
L:50 [ARG] 0:265 [U] M:50 [ARG] 0:265 [U] ✔
L:140 [ALA] 0:250 [C] M:140 [ALA] 0:250 [C] ✔
L:140 [ALA] 0:251 [C] M:140 [ALA] 0:251 [C] ✔
L:32 [ARG] 0:2132 [C] M:32 [ARG] 0:2132 [C] ✔
L:32 [ARG] 0:2133 [U] M:32 [ARG] 0:2133 [U] ✔
L:32 [ARG] 0:2244 [A] M:32 [ARG] 0:2244 [A] ✔
L:32 [ARG] 0:2245 [C] M:32 [ARG] 0:2245 [C] ✔
L:71 [SER] 0:402 [U] M:71 [SER] 0:402 [U] ✔
L:71 [SER] 0:2263 [G] M:71 [SER] 0:2263 [G] ✔
L:71 [SER] 0:2264 [A] M:71 [SER] 0:2264 [A] ✔
L:194 [ALA] 0:390 [G] M:194 [GLY] 0:390 [G] ✔
L:194 [ALA] 0:391 [U] M:194 [GLY] 0:391 [U] ✔
L:194 [ALA] 0:399 [C] M:194 [GLY] 0:399 [C] ✔
L:61 [ILE] 0:135 [G] M:61 [ILE] 0:135 [G] ✔
L:61 [ILE] 0:136 [C] M:61 [ILE] 0:136 [C] ✔
L:174 [ARG] 0:193 [A] M:174 [SER] 0:193 [A] ✔
L:174 [ARG] 0:400 [C] M:174 [SER] 0:400 [C] ✔
L:5 [TYR] 0:242 [A] M:5 [TYR] 0:242 [A] ✔
L:5 [TYR] 0:243 [A] M:5 [TYR] 0:243 [A] ✔
L:5 [TYR] 0:264 [G] M:5 [TYR] 0:264 [G] ✔
L:180 [SER] 0:398 [U] M:180 [SER] 0:398 [U] ✔
L:180 [SER] 0:399 [C] M:180 [SER] 0:399 [C] ✔
L:163 [LEU] 0:155 [C] M:163 [LEU] 0:155 [C] ✔
L:163 [LEU] 0:188 [C] M:163 [LEU] 0:188 [C] ✔
L:163 [LEU] 0:189 [A] M:163 [LEU] 0:189 [A] ✔
L:163 [LEU] 0:433 [C] M:163 [LEU] 0:433 [C] ✔
L:78 [ASN] 0:869 [G] M:78 [LYS] 0:869 [G] ✔
L:78 [ASN] 0:870 [G] M:78 [LYS] 0:870 [G] ✔
L:153 [THR] 0:183 [A] M:153 [ASP] 0:183 [A] ✔
L:153 [THR] 0:184 [G] M:153 [ASP] 0:184 [G] ✔
L:104 [ARG] 0:1468 [G] M:104 [ARG] 0:1468 [G] ✔
L:104 [ARG] 0:1469 [C] M:104 [ARG] 0:1469 [C] ✔
L:104 [ARG] 0:1470 [A] M:104 [ARG] 0:1470 [A] ✔
L:104 [ARG] 0:1471 [A] M:104 [ARG] 0:1471 [A] ✔
L:66 [ALA] 0:1468 [G] M:66 [SER] 0:1468 [G] ✔
L:53 [GLY] 0:431 [G] M:53 [GLY] 0:431 [G] ✔
L:160 [PHE] 0:155 [C] M:160 [PHE] 0:155 [C] ✔
L:160 [PHE] 0:156 [C] M:160 [PHE] 0:156 [C] ✔
L:160 [PHE] 0:181 [G] M:160 [PHE] 0:181 [G] ✔
L:160 [PHE] 0:182 [G] M:160 [PHE] 0:182 [G] ✔
L:165 [SER] 0:432 [G] M:165 [GLY] 0:432 [G] ✔
L:81 [ARG] 0:160 [A] M:81 [ARG] 0:160 [A] ✔
L:81 [ARG] 0:161 [A] M:81 [ARG] 0:161 [A] ✔
L:81 [ARG] 0:770 [C] M:81 [ARG] 0:770 [C] ✔
L:81 [ARG] 0:771 [G] M:81 [ARG] 0:771 [G] ✔
L:81 [ARG] 0:2274 [A] M:81 [ARG] 0:2274 [A] ✔
L:81 [ARG] 0:2275 [G] M:81 [ARG] 0:2275 [G] ✔
L:170 [CYS] 0:157 [G] M:170 [ASN] 0:157 [G] ✔
L:170 [CYS] 0:400 [C] M:170 [ASN] 0:400 [C] ✔
L:170 [CYS] 0:401 [C] M:170 [ASN] 0:401 [C] ✔
L:93 [ARG] 0:158 [A] M:93 [ARG] 0:158 [A] ✔
L:93 [ARG] 0:159 [G] M:93 [ARG] 0:159 [G] ✔
L:93 [ARG] 0:401 [C] M:93 [ARG] 0:401 [C] ✔
L:93 [ARG] 0:1469 [C] M:93 [ARG] 0:1469 [C] ✔
L:93 [ARG] 0:1470 [A] M:93 [ARG] 0:1470 [A] ✔
L:171 [ARG] 0:155 [C] M:171 [ARG] 0:155 [C] ✔
L:171 [ARG] 0:156 [C] M:171 [ARG] 0:156 [C] ✔
L:171 [ARG] 0:157 [G] M:171 [ARG] 0:157 [G] ✔
L:171 [ARG] 0:188 [C] M:171 [ARG] 0:188 [C] ✔
L:171 [ARG] 0:189 [A] M:171 [ARG] 0:189 [A] ✔
L:171 [ARG] 0:399 [C] M:171 [ARG] 0:399 [C] ✔
L:171 [ARG] 0:400 [C] M:171 [ARG] 0:400 [C] ✔
L:154 [ARG] 0:183 [A] M:154 [ASP] 0:183 [A] ✔
L:154 [ARG] 0:184 [G] M:154 [ASP] 0:184 [G] ✔
L:154 [ARG] 0:187 [A] M:154 [ASP] 0:187 [A] ✔
L:154 [ARG] 0:188 [C] M:154 [ASP] 0:188 [C] ✔
L:154 [ARG] 0:434 [U] M:154 [ASP] 0:434 [U] ✔
L:97 [ILE] 0:401 [C] M:97 [ILE] 0:401 [C] ✔
L:97 [ILE] 0:402 [U] M:97 [ILE] 0:402 [U] ✔
L:97 [ILE] 0:403 [C] M:97 [ILE] 0:403 [C] ✔
L:1 [ALA] 0:243 [A] M:1 [ALA] 0:243 [A] ✔
L:1 [ALA] 0:244 [C] M:1 [ALA] 0:244 [C] ✔
L:1 [ALA] 0:376 [C] M:1 [ALA] 0:376 [C] ✔
L:1 [ALA] 0:377 [C] M:1 [ALA] 0:377 [C] ✔
L:37 [VAL] 0:1467 [C] M:37 [VAL] 0:1467 [C] ✔
L:25 [TRP] 0:2133 [U] M:25 [TRP] 0:2133 [U] ✔
L:25 [TRP] 0:2243 [C] M:25 [TRP] 0:2243 [C] ✔
L:25 [TRP] 0:2244 [A] M:25 [TRP] 0:2244 [A] ✔
L:187 [LEU] 0:155 [C] M:187 [LEU] 0:155 [C] ✔
L:187 [LEU] 0:156 [C] M:187 [LEU] 0:156 [C] ✔
L:187 [LEU] 0:157 [G] M:187 [LEU] 0:157 [G] ✔
L:179 [GLY] 0:394 [G] M:179 [GLY] 0:394 [G] ✔
L:179 [GLY] 0:398 [U] M:179 [GLY] 0:398 [U] ✔
L:179 [GLY] 0:399 [C] M:179 [GLY] 0:399 [C] ✔
L:184 [ARG] 0:189 [A] M:184 [ARG] 0:189 [A] ✔
L:184 [ARG] 0:190 [G] M:184 [ARG] 0:190 [G] ✔
L:184 [ARG] 0:205 [U] M:184 [ARG] 0:205 [U] ✔
L:184 [ARG] 0:206 [G] M:184 [ARG] 0:206 [G] ✔
L:122 [GLU] 0:404 [G] M:122 [GLN] 0:404 [G] ✔
L:158 [ARG] 0:432 [G] M:158 [ARG] 0:432 [G] ✔
L:158 [ARG] 0:433 [C] M:158 [ARG] 0:433 [C] ✔
L:103 [GLU] 0:156 [C] M:103 [GLU] 0:156 [C] ✔
L:103 [GLU] 0:1470 [A] M:103 [GLU] 0:1470 [A] ✔
L:103 [GLU] 0:1471 [A] M:103 [GLU] 0:1471 [A] ✔
L:127 [LYS] 0:402 [U] M:127 [LYS] 0:402 [U] ✔
L:127 [LYS] 0:403 [C] M:127 [LYS] 0:403 [C] ✔
L:74 [ARG] 0:158 [A] M:74 [LYS] 0:158 [A] ✔
L:74 [ARG] 0:159 [G] M:74 [LYS] 0:159 [G] ✔
L:74 [ARG] 0:1864 [C] M:74 [LYS] 0:1864 [C] ✔
L:92 [THR] 0:158 [A] M:92 [THR] 0:158 [A] ✔
L:92 [THR] 0:388 [G] M:92 [THR] 0:388 [G] ✔
L:92 [THR] 0:389 [G] M:92 [THR] 0:389 [G] ✔
L:92 [THR] 0:401 [C] M:92 [THR] 0:401 [C] ✔
L:92 [THR] 0:402 [U] M:92 [THR] 0:402 [U] ✔
L:111 [ASN] 0:134 [U] M:111 [ASN] 0:134 [U] ✔
L:111 [ASN] 0:135 [G] M:111 [ASN] 0:135 [G] ✔
L:111 [ASN] 0:144 [A] M:111 [ASN] 0:144 [A] ✔
L:111 [ASN] 0:145 [A] M:111 [ASN] 0:145 [A] ✔
L:111 [ASN] 0:146 [U] M:111 [ASN] 0:146 [U] ✔
L:73 [ARG] 0:1469 [C] M:73 [ARG] 0:1469 [C] ✔
L:73 [ARG] 0:1470 [A] M:73 [ARG] 0:1470 [A] ✔
L:73 [ARG] 0:1864 [C] M:73 [ARG] 0:1864 [C] ✔
L:73 [ARG] 0:1865 [A] M:73 [ARG] 0:1865 [A] ✔
L:73 [ARG] 0:2263 [G] M:73 [ARG] 0:2263 [G] ✔
L:88 [VAL] 0:2122 [C] M:88 [VAL] 0:2122 [C] ✔
L:88 [VAL] 0:2123 [A] M:88 [VAL] 0:2123 [A] ✔
L:192 [ALA] 0:175 [G] M:192 [GLY] 0:175 [G] ✔
L:192 [ALA] 0:176 [U] M:192 [GLY] 0:176 [U] ✔
L:110 [PRO] 0:133 [U] M:110 [PRO] 0:133 [U] ✔
L:110 [PRO] 0:134 [U] M:110 [PRO] 0:134 [U] ✔
L:110 [PRO] 0:145 [A] M:110 [PRO] 0:145 [A] ✔
L:110 [PRO] 0:146 [U] M:110 [PRO] 0:146 [U] ✔
L:162 [GLY] 0:155 [C] M:162 [GLY] 0:155 [C] ✔
L:162 [GLY] 0:156 [C] M:162 [GLY] 0:156 [C] ✔
L:162 [GLY] 0:189 [A] M:162 [GLY] 0:189 [A] ✔
L:178 [LYS] 0:194 [A] M:178 [LYS] 0:194 [A] ✔
L:178 [LYS] 0:195 [C] M:178 [LYS] 0:195 [C] ✔
L:178 [LYS] 0:394 [G] M:178 [LYS] 0:394 [G] ✔
L:178 [LYS] 0:397 [A] M:178 [LYS] 0:397 [A] ✔
L:178 [LYS] 0:398 [U] M:178 [LYS] 0:398 [U] ✔
L:178 [LYS] 0:399 [C] M:178 [LYS] 0:399 [C] ✔
L:178 [LYS] 0:415 [A] M:178 [LYS] 0:415 [A] ✔
L:178 [LYS] 0:416 [G] M:178 [LYS] 0:416 [G] ✔
L:178 [LYS] 0:417 [G] M:178 [LYS] 0:417 [G] ✔
L:168 [ARG] 0:189 [A] M:168 [ARG] 0:189 [A] ✔
L:168 [ARG] 0:190 [G] M:168 [ARG] 0:190 [G] ✔
L:168 [ARG] 0:432 [G] M:168 [ARG] 0:432 [G] ✔
L:168 [ARG] 0:433 [C] M:168 [ARG] 0:433 [C] ✔
L:186 [SER] 0:154 [C] M:186 [SER] 0:154 [C] ✔
L:186 [SER] 0:155 [C] M:186 [SER] 0:155 [C] ✔
L:186 [SER] 0:156 [C] M:186 [SER] 0:156 [C] ✔
L:186 [SER] 0:188 [C] M:186 [SER] 0:188 [C] ✔
L:173 [LEU] 0:189 [A] M:173 [LEU] 0:189 [A] ✔
L:173 [LEU] 0:190 [G] M:173 [LEU] 0:190 [G] ✔
L:191 [GLY] 0:175 [G] M:191 [GLY] 0:175 [G] ✔
L:191 [GLY] 0:176 [U] M:191 [GLY] 0:176 [U] ✔
L:6 [SER] 0:378 [A] M:6 [SER] 0:378 [A] ✔
L:157 [LEU] 0:182 [G] M:157 [ASP] 0:182 [G] ✔
L:157 [LEU] 0:183 [A] M:157 [ASP] 0:183 [A] ✔
L:3 [SER] 0:242 [A] M:3 [SER] 0:242 [A] ✔
L:3 [SER] 0:243 [A] M:3 [SER] 0:243 [A] ✔
L:115 [LEU] 0:432 [G] M:115 [LEU] 0:432 [G] ✔
L:54 [TYR] 0:264 [G] M:54 [TYR] 0:264 [G] ✔
L:109 [PHE] 0:133 [U] M:109 [PHE] 0:133 [U] ✔
L:109 [PHE] 0:134 [U] M:109 [PHE] 0:134 [U] ✔
L:109 [PHE] 0:135 [G] M:109 [PHE] 0:135 [G] ✔
L:84 [LYS] 0:170 [U] M:84 [LYS] 0:170 [U] ✔
L:84 [LYS] 0:171 [C] M:84 [LYS] 0:171 [C] ✔
L:84 [LYS] 0:390 [G] M:84 [LYS] 0:390 [G] ✔
L:84 [LYS] 0:391 [U] M:84 [LYS] 0:391 [U] ✔
L:188 [ARG] 0:153 [C] M:188 [ARG] 0:153 [C] ✔
L:188 [ARG] 0:154 [C] M:188 [ARG] 0:154 [C] ✔
L:188 [ARG] 0:155 [C] M:188 [ARG] 0:155 [C] ✔
L:188 [ARG] 0:156 [C] M:188 [ARG] 0:156 [C] ✔
L:46 [LEU] 0:263 [U] M:46 [LEU] 0:263 [U] ✔
L:46 [LEU] 0:264 [G] M:46 [LEU] 0:264 [G] ✔
L:181 [GLU] 0:226 [A] M:181 [GLU] 0:226 [A] ✔
L:181 [GLU] 0:227 [A] M:181 [GLU] 0:227 [A] ✔
L:181 [GLU] 0:393 [G] M:181 [GLU] 0:393 [G] ✔
L:181 [GLU] 0:394 [G] M:181 [GLU] 0:394 [G] ✔
L:181 [GLU] 0:398 [U] M:181 [GLU] 0:398 [U] ✔
L:181 [GLU] 0:417 [G] M:181 [GLU] 0:417 [G] ✔
L:185 [PRO] 0:188 [C] M:185 [PRO] 0:188 [C] ✔
L:185 [PRO] 0:189 [A] M:185 [PRO] 0:189 [A] ✔
L:185 [PRO] 0:206 [G] M:185 [PRO] 0:206 [G] ✔
L:185 [PRO] 0:207 [U] M:185 [PRO] 0:207 [U] ✔
L:119 [SER] 0:381 [G] M:119 [SER] 0:381 [G] ✔
L:90 [ARG] 0:388 [G] M:90 [ARG] 0:388 [G] ✔
L:90 [ARG] 0:389 [G] M:90 [ARG] 0:389 [G] ✔
L:90 [ARG] 0:2123 [A] M:90 [ARG] 0:2123 [A] ✔
L:90 [ARG] 0:2265 [U] M:90 [ARG] 0:2265 [U] ✔
L:90 [ARG] 0:2266 [A] M:90 [ARG] 0:2266 [A] ✔
L:83 [SER] 0:169 [A] M:83 [SER] 0:169 [A] ✔
L:83 [SER] 0:170 [U] M:83 [SER] 0:170 [U] ✔
L:83 [SER] 0:2121 [G] M:83 [SER] 0:2121 [G] ✔
L:83 [SER] 0:2122 [C] M:83 [SER] 0:2122 [C] ✔
L:68 [ARG] 0:1469 [C] M:68 [ARG] 0:1469 [C] ✔
L:68 [ARG] 0:1470 [A] M:68 [ARG] 0:1470 [A] ✔
L:156 [ARG] 0:182 [G] M:156 [ALA] 0:182 [G] ✔
L:156 [ARG] 0:183 [A] M:156 [ALA] 0:183 [A] ✔
L:42 [ARG] 0:261 [A] M:42 [ARG] 0:261 [A] ✔
L:42 [ARG] 0:262 [A] M:42 [ARG] 0:262 [A] ✔
L:42 [ARG] 0:263 [U] M:42 [ARG] 0:263 [U] ✔
L:45 [ARG] 0:380 [A] M:45 [ARG] 0:380 [A] ✔
L:45 [ARG] 0:381 [G] M:45 [ARG] 0:381 [G] ✔
L:56 [ALA] 0:260 [C] M:56 [ALA] 0:260 [C] ✔
L:56 [ALA] 0:261 [A] M:56 [ALA] 0:261 [A] ✔
L:56 [ALA] 0:262 [A] M:56 [ALA] 0:262 [A] ✔
L:56 [ALA] 0:264 [G] M:56 [ALA] 0:264 [G] ✔
L:56 [ALA] 0:265 [U] M:56 [ALA] 0:265 [U] ✔
L:138 [HIS] 0:135 [G] M:138 [HIS] 0:135 [G] ✔
L:138 [HIS] 0:136 [C] M:138 [HIS] 0:136 [C] ✔
L:138 [HIS] 0:251 [C] M:138 [HIS] 0:251 [C] ✔
L:107 [ARG] 0:133 [U] M:107 [ARG] 0:133 [U] ✔
L:107 [ARG] 0:181 [G] M:107 [ARG] 0:181 [G] ✔
L:107 [ARG] 0:1471 [A] M:107 [ARG] 0:1471 [A] ✔
L:107 [ARG] 0:1472 [C] M:107 [ARG] 0:1472 [C] ✔
L:16 [LYS] 0:381 [G] M:16 [GLY] 0:381 [G] ✔
L:80 [GLY] 0:160 [A] M:80 [GLY] 0:160 [A] ✔
L:80 [GLY] 0:161 [A] M:80 [GLY] 0:161 [A] ✔
L:80 [GLY] 0:769 [C] M:80 [GLY] 0:769 [C] ✔
L:80 [GLY] 0:770 [C] M:80 [GLY] 0:770 [C] ✔
L:80 [GLY] 0:2274 [A] M:80 [GLY] 0:2274 [A] ✔
L:80 [GLY] 0:2275 [G] M:80 [GLY] 0:2275 [G] ✔
L:183 [VAL] 0:399 [C] M:183 [THR] 0:399 [C] ✔
L:15 [PRO] 0:381 [G] M:15 [PRO] 0:381 [G] ✔
L:95 [LYS] 0:156 [C] M:95 [LYS] 0:156 [C] ✔
L:95 [LYS] 0:157 [G] M:95 [LYS] 0:157 [G] ✔
L:95 [LYS] 0:158 [A] M:95 [LYS] 0:158 [A] ✔
L:95 [LYS] 0:401 [C] M:95 [LYS] 0:401 [C] ✔
L:95 [LYS] 0:402 [U] M:95 [LYS] 0:402 [U] ✔
L:95 [LYS] 0:1470 [A] M:95 [LYS] 0:1470 [A] ✔
L:70 [GLY] 0:402 [U] M:70 [GLY] 0:402 [U] ✔
L:70 [GLY] 0:403 [C] M:70 [GLY] 0:403 [C] ✔
L:70 [GLY] 0:2263 [G] M:70 [GLY] 0:2263 [G] ✔
L:70 [GLY] 0:2264 [A] M:70 [GLY] 0:2264 [A] ✔
L:79 [LYS] 0:770 [C] M:79 [ALA] 0:770 [C] ✔
L:79 [LYS] 0:771 [G] M:79 [ALA] 0:771 [G] ✔
L:79 [LYS] 0:2274 [A] M:79 [ALA] 0:2274 [A] ✔
L:77 [PHE] 0:2122 [C] M:77 [HIS] 0:2122 [C] ✔
L:77 [PHE] 0:2273 [C] M:77 [HIS] 0:2273 [C] ✔
L:77 [PHE] 0:2274 [A] M:77 [HIS] 0:2274 [A] ✔
L:172 [GLY] 0:399 [C] M:172 [GLY] 0:399 [C] ✔
L:172 [GLY] 0:400 [C] M:172 [GLY] 0:400 [C] ✔
L:47 [ASP] 0:241 [A] M:47 [ASP] 0:241 [A] ✔
L:47 [ASP] 0:380 [A] M:47 [ASP] 0:380 [A] ✔
L:9 [ARG] 0:377 [C] M:9 [ARG] 0:377 [C] ✔
L:9 [ARG] 0:378 [A] M:9 [ARG] 0:378 [A] ✔
L:9 [ARG] 0:379 [G] M:9 [ARG] 0:379 [G] ✔
L:9 [ARG] 0:380 [A] M:9 [ARG] 0:380 [A] ✔
L:139 [PRO] 0:251 [C] M:139 [PRO] 0:251 [C] ✔
L:139 [PRO] 0:252 [C] M:139 [PRO] 0:252 [C] ✔
L:55 [LYS] 0:241 [A] M:55 [LYS] 0:241 [A] ✔
L:55 [LYS] 0:265 [U] M:55 [LYS] 0:265 [U] ✔
L:55 [LYS] 0:266 [G] M:55 [LYS] 0:266 [G] ✔
L:87 [MET] 0:2122 [C] M:87 [GLY] 0:2122 [C] ✔
L:87 [MET] 0:2123 [A] M:87 [GLY] 0:2123 [A] ✔
L:177 [GLY] 0:194 [A] M:177 [GLY] 0:194 [A] ✔
L:177 [GLY] 0:195 [C] M:177 [GLY] 0:195 [C] ✔
L:85 [ARG] 0:160 [A] M:85 [ARG] 0:160 [A] ✔
L:85 [ARG] 0:161 [A] M:85 [ARG] 0:161 [A] ✔
L:85 [ARG] 0:174 [A] M:85 [ARG] 0:174 [A] ✔
L:85 [ARG] 0:175 [G] M:85 [ARG] 0:175 [G] ✔
L:85 [ARG] 0:390 [G] M:85 [ARG] 0:390 [G] ✔
L:85 [ARG] 0:391 [U] M:85 [ARG] 0:391 [U] ✔
L:137 [ASP] 0:144 [A] M:137 [ASN] 0:144 [A] ✔
L:137 [ASP] 0:145 [A] M:137 [ASN] 0:145 [A] ✔
L:89 [ASN] 0:2123 [A] M:89 [THR] 0:2123 [A] ✔
L:89 [ASN] 0:2124 [G] M:89 [THR] 0:2124 [G] ✔
L:89 [ASN] 0:2264 [A] M:89 [THR] 0:2264 [A] ✔
L:89 [ASN] 0:2265 [U] M:89 [THR] 0:2265 [U] ✔
L:52 [LEU] 0:431 [G] M:52 [GLN] 0:431 [G] ✔
L:13 [LYS] 0:380 [A] M:13 [GLU] 0:380 [A] ✔
L:13 [LYS] 0:381 [G] M:13 [GLU] 0:381 [G] ✔
L:13 [LYS] 0:409 [U] M:13 [GLU] 0:409 [U] ✔
L:146 [GLN] 0:239 [C] M:146 [ASP] 0:239 [C] ✔
L:146 [GLN] 0:240 [C] M:146 [ASP] 0:240 [C] ✔
L:146 [GLN] 0:241 [A] M:146 [ASP] 0:241 [A] ✔
L:155 [HIS] 0:433 [C] M:155 [GLN] 0:433 [C] ✔
L:155 [HIS] 0:434 [U] M:155 [GLN] 0:434 [U] ✔
L:144 [ASP] 0:266 [G] M:144 [ASP] 0:266 [G] ✔
L:96 [ASN] 0:401 [C] M:96 [ASP] 0:401 [C] ✔
L:96 [ASN] 0:402 [U] M:96 [ASP] 0:402 [U] ✔
L:36 [ALA] 0:1467 [C] M:36 [ALA] 0:1467 [C] ✔
L:36 [ALA] 0:1468 [G] M:36 [ALA] 0:1468 [G] ✔
L:182 [LYS] 0:226 [A] M:182 [LYS] 0:226 [A] ✔
L:182 [LYS] 0:392 [U] M:182 [LYS] 0:392 [U] ✔
L:182 [LYS] 0:393 [G] M:182 [LYS] 0:393 [G] ✔
L:182 [LYS] 0:394 [G] M:182 [LYS] 0:394 [G] ✔
L:48 [ARG] 0:379 [G] M:48 [LYS] 0:379 [G] ✔
L:48 [ARG] 0:380 [A] M:48 [LYS] 0:380 [A] ✔
L:48 [ARG] 0:381 [G] M:48 [LYS] 0:381 [G] ✔
L:48 [ARG] 0:430 [A] M:48 [LYS] 0:430 [A] ✔
L:48 [ARG] 0:431 [G] M:48 [LYS] 0:431 [G] ✔
L:58 [GLN] 0:136 [C] M:58 [GLN] 0:136 [C] ✔
L:58 [GLN] 0:137 [U] M:58 [GLN] 0:137 [U] ✔
L:58 [GLN] 0:250 [C] M:58 [GLN] 0:250 [C] ✔
L:58 [GLN] 0:251 [C] M:58 [GLN] 0:251 [C] ✔
L:58 [GLN] 0:259 [G] M:58 [GLN] 0:259 [G] ✔
L:58 [GLN] 0:260 [C] M:58 [GLN] 0:260 [C] ✔
L:161 [ARG] 0:155 [C] M:161 [ARG] 0:155 [C] ✔
L:161 [ARG] 0:156 [C] M:161 [ARG] 0:156 [C] ✔
L:161 [ARG] 0:181 [G] M:161 [ARG] 0:181 [G] ✔
L:161 [ARG] 0:182 [G] M:161 [ARG] 0:182 [G] ✔
L:161 [ARG] 0:183 [A] M:161 [ARG] 0:183 [A] ✔
L:161 [ARG] 0:187 [A] M:161 [ARG] 0:187 [A] ✔
L:161 [ARG] 0:188 [C] M:161 [ARG] 0:188 [C] ✔
L:169 [ARG] 0:400 [C] M:169 [ARG] 0:400 [C] ✔
L:169 [ARG] 0:430 [A] M:169 [ARG] 0:430 [A] ✔
L:169 [ARG] 0:431 [G] M:169 [ARG] 0:431 [G] ✔
L:51 [SER] 0:240 [C] M:51 [SER] 0:240 [C] ✔
L:51 [SER] 0:241 [A] M:51 [SER] 0:241 [A] ✔
L:51 [SER] 0:379 [G] M:51 [SER] 0:379 [G] ✔
L:51 [SER] 0:431 [G] M:51 [SER] 0:431 [G] ✔
L:2 [ARG] 0:376 [C] M:2 [ARG] 0:376 [C] ✔
L:2 [ARG] 0:377 [C] M:2 [ARG] 0:377 [C] ✔
L:164 [THR] 0:432 [G] M:164 [THR] 0:432 [G] ✔
L:57 [LYS] 0:250 [C] M:57 [LYS] 0:250 [C] ✔
L:57 [LYS] 0:260 [C] M:57 [LYS] 0:260 [C] ✔
L:57 [LYS] 0:261 [A] M:57 [LYS] 0:261 [A] ✔
L:57 [LYS] 0:265 [U] M:57 [LYS] 0:265 [U] ✔
L:57 [LYS] 0:266 [G] M:57 [LYS] 0:266 [G] ✔
L:35 [PRO] 0:1467 [C] M:35 [GLY] 0:1467 [C] ✔
L:59 [GLY] 0:135 [G] M:59 [GLY] 0:135 [G] ✔
L:59 [GLY] 0:136 [C] M:59 [GLY] 0:136 [C] ✔
L:14 [ARG] 0:381 [G] M:14 [ASN] 0:381 [G] ✔
L:14 [ARG] 0:407 [A] M:14 [ASN] 0:407 [A] ✔
L:189 [VAL] 0:155 [C] M:189 [SER] 0:155 [C] ✔
L:189 [VAL] 0:207 [U] M:189 [SER] 0:207 [U] ✔
L:124 [GLY] 0:2131 [G] M:124 [GLY] 0:2131 [G] ✔
L:124 [GLY] 0:2132 [C] M:124 [GLY] 0:2132 [C] ✔
L:124 [GLY] 0:2262 [C] M:124 [GLY] 0:2262 [C] ✔
L:124 [GLY] 0:2263 [G] M:124 [GLY] 0:2263 [G] ✔
L:69 [LYS] 0:402 [U] M:69 [LYS] 0:402 [U] ✔
L:69 [LYS] 0:403 [C] M:69 [LYS] 0:403 [C] ✔
L:69 [LYS] 0:404 [G] M:69 [LYS] 0:404 [G] ✔
L:69 [LYS] 0:2131 [G] M:69 [LYS] 0:2131 [G] ✔
L:69 [LYS] 0:2263 [G] M:69 [LYS] 0:2263 [G] ✔
L:100 [ILE] 0:1470 [A] M:100 [VAL] 0:1470 [A] ✔
L:100 [ILE] 0:1471 [A] M:100 [VAL] 0:1471 [A] ✔
L:99 [ARG] 0:156 [C] M:99 [ARG] 0:156 [C] ✔
L:99 [ARG] 0:157 [G] M:99 [ARG] 0:157 [G] ✔
L:12 [TRP] 0:380 [A] M:12 [TRP] 0:380 [A] ✔
L:145 [ASP] 0:239 [C] M:145 [ASP] 0:239 [C] ✔
L:145 [ASP] 0:288 [A] M:145 [ASP] 0:288 [A] ✔
L:72 [SER] 0:1470 [A] M:72 [ALA] 0:1470 [A] ✔
L:123 [ASP] 0:2132 [C] M:123 [ASP] 0:2132 [C] ✔
L:112 [LEU] 0:134 [U] M:112 [LEU] 0:134 [U] ✔
L:112 [LEU] 0:135 [G] M:112 [LEU] 0:135 [G] ✔
L:91 [ILE] 0:159 [G] M:91 [ILE] 0:159 [G] ✔
L:91 [ILE] 0:389 [G] M:91 [ILE] 0:389 [G] ✔
L:143 [SER] 0:250 [C] M:143 [ASN] 0:250 [C] ✔
L:143 [SER] 0:251 [C] M:143 [ASN] 0:251 [C] ✔
L:108 [LYS] 0:133 [U] M:108 [THR] 0:133 [U] ✔
L:108 [LYS] 0:134 [U] M:108 [THR] 0:134 [U] ✔
L:29 [GLN] 0:2244 [A] M:29 [GLN] 0:2244 [A] ✔
L:29 [GLN] 0:2245 [C] M:29 [GLN] 0:2245 [C] ✔
L:193 [LYS] 0:175 [G] M:193 [LYS] 0:175 [G] ✔
L:193 [LYS] 0:225 [G] M:193 [LYS] 0:225 [G] ✔
L:193 [LYS] 0:391 [U] M:193 [LYS] 0:391 [U] ✔
L:193 [LYS] 0:392 [U] M:193 [LYS] 0:392 [U] ✔
L:193 [LYS] 0:393 [G] M:193 [LYS] 0:393 [G] ✔
L:135 [ASP] 0:135 [G] M:135 [ASP] 0:135 [G] ✔
L:135 [ASP] 0:136 [C] M:135 [ASP] 0:136 [C] ✔
L:28 [MET] 0:2245 [C] M:28 [GLN] 0:2245 [C] ✔
L:82 [ARG] 0:161 [A] M:82 [ARG] 0:161 [A] ✔
L:82 [ARG] 0:170 [U] M:82 [ARG] 0:170 [U] ✔
L:82 [ARG] 0:171 [C] M:82 [ARG] 0:171 [C] ✔
L:82 [ARG] 0:172 [U] M:82 [ARG] 0:172 [U] ✔
L:82 [ARG] 0:173 [C] M:82 [ARG] 0:173 [C] ✔
L:82 [ARG] 0:2274 [A] M:82 [ARG] 0:2274 [A] ✔
L:82 [ARG] 0:2275 [G] M:82 [ARG] 0:2275 [G] ✔
L:39 [ARG] 0:134 [U] M:39 [ARG] 0:134 [U] ✔
L:39 [ARG] 0:135 [G] M:39 [ARG] 0:135 [G] ✔
L:39 [ARG] 0:136 [C] M:39 [ARG] 0:136 [C] ✔
L:94 [LYS] 0:157 [G] M:94 [ARG] 0:157 [G] ✔
L:94 [LYS] 0:158 [A] M:94 [ARG] 0:158 [A] ✔
L:94 [LYS] 0:175 [G] M:94 [ARG] 0:175 [G] ✔
L:94 [LYS] 0:390 [G] M:94 [ARG] 0:390 [G] ✔
L:94 [LYS] 0:391 [U] M:94 [ARG] 0:391 [U] ✔
L:94 [LYS] 0:400 [C] M:94 [ARG] 0:400 [C] ✔
L:94 [LYS] 0:401 [C] M:94 [ARG] 0:401 [C] ✔
L:176 [GLN] 0:190 [G] M:176 [LYS] 0:190 [G] ✔
L:176 [GLN] 0:191 [A] M:176 [LYS] 0:191 [A] ✔
L:176 [GLN] 0:192 [A] M:176 [LYS] 0:192 [A] ✔
L:176 [GLN] 0:193 [A] M:176 [LYS] 0:193 [A] ✔
L:176 [GLN] 0:194 [A] M:176 [LYS] 0:194 [A] ✔
L:176 [GLN] 0:204 [A] M:176 [LYS] 0:204 [A] ✔
L:176 [GLN] 0:205 [U] M:176 [LYS] 0:205 [U] ✔
L:116 [ASN] 0:431 [G] M:116 [ASN] 0:431 [G] ✔
L:116 [ASN] 0:432 [G] M:116 [ASN] 0:432 [G] ✔
L:75 [THR] 0:1864 [C] M:75 [ARG] 0:1864 [C] ✔
L:125 [ARG] 0:2131 [G] M:125 [ARG] 0:2131 [G] ✔
L:125 [ARG] 0:2246 [U] M:125 [ARG] 0:2246 [U] ✔
L:125 [ARG] 0:2262 [C] M:125 [ARG] 0:2262 [C] ✔
L:125 [ARG] 0:2263 [G] M:125 [ARG] 0:2263 [G] ✔
L:86 [MET] 0:2121 [G] M:86 [GLN] 0:2121 [G] ✔
L:86 [MET] 0:2122 [C] M:86 [GLN] 0:2122 [C] ✔
L:86 [MET] 0:2123 [A] M:86 [GLN] 0:2123 [A] ✔
L:86 [MET] 0:2274 [A] M:86 [GLN] 0:2274 [A] ✔
L:86 [MET] 0:2275 [G] M:86 [GLN] 0:2275 [G] ✔
L:194 [ALA] 0:400 [C] M:194 [GLY] 0:400 [C] ❌ 1YHQ_M_0
L:165 [SER] 0:431 [G] M:165 [GLY] 0:431 [G] ❌ 1YHQ_M_0
L:192 [ALA] 0:159 [G] M:192 [GLY] 0:159 [G] ❌ 1YHQ_M_0
L:156 [ARG] 0:146 [U] M:156 [ALA] 0:146 [U] ❌ 1YHQ_M_0
L:156 [ARG] 0:184 [G] M:156 [ALA] 0:184 [G] ❌ 1YHQ_M_0
L:16 [LYS] 0:2131 [G] M:16 [GLY] 0:2131 [G] ❌ 1YHQ_M_0
L:16 [LYS] 0:2132 [C] M:16 [GLY] 0:2132 [C] ❌ 1YHQ_M_0
L:79 [LYS] 0:869 [G] M:79 [ALA] 0:869 [G] ❌ 1YHQ_M_0
L:77 [PHE] 0:2121 [G] M:77 [HIS] 0:2121 [G] ❌ 1YHQ_M_0
L:87 [MET] 0:160 [A] M:87 [GLY] 0:160 [A] ❌ 1YHQ_M_0
L:87 [MET] 0:390 [G] M:87 [GLY] 0:390 [G] ❌ 1YHQ_M_0
L:89 [ASN] 0:2122 [C] M:89 [THR] 0:2122 [C] ❌ 1YHQ_M_0
L:52 [LEU] 0:379 [G] M:52 [GLN] 0:379 [G] ❌ 1YHQ_M_0
L:52 [LEU] 0:432 [G] M:52 [GLN] 0:432 [G] ❌ 1YHQ_M_0
L:146 [GLN] 0:266 [G] M:146 [ASP] 0:266 [G] ❌ 1YHQ_M_0
L:189 [VAL] 0:156 [C] M:189 [SER] 0:156 [C] ❌ 1YHQ_M_0
L:125 [ARG] 0:2245 [C] M:125 [ARG] 0:2245 [C] ❌ 1YHQ_M_0
L:82 [ARG] 0:169 [A] M:82 [ARG] 0:169 [A] ❌ 1JJ2_L_0
L:86 [MET] 0:2273 [C] M:86 [GLN] 0:2273 [C] ❌ 1JJ2_L_0
L:174 [ARG] 0:382 [U] M:174 [SER] 0:382 [U] ❌ 1YHQ_0:382 no longer at interface
L:174 [ARG] 0:383 [A] M:174 [SER] 0:383 [A] ❌ 1YHQ_0:383 no longer at interface
L:154 [ARG] 0:186 [A] M:154 [ASP] 0:186 [A] ❌ 1YHQ_0:186 no longer at interface
L:154 [ARG] 0:435 [A] M:154 [ASP] 0:435 [A] ❌ 1YHQ_0:435 no longer at interface
L:154 [ARG] 0:436 [A] M:154 [ASP] 0:436 [A] ❌ 1YHQ_0:436 no longer at interface
L:156 [ARG] 0:44 [G] M:156 [ALA] 0:44 [G] ❌ 1YHQ_0:44 no longer at interface
L:16 [LYS] 0:405 [C] M:16 [GLY] 0:405 [C] ❌ 1YHQ_0:405 no longer at interface
L:79 [LYS] 0:868 [G] M:79 [ALA] 0:868 [G] ❌ 1YHQ_0:868 no longer at interface
L:146 [GLN] 0:269 [G] M:146 [ASP] 0:269 [G] ❌ 1YHQ_0:269 no longer at interface
L:35 [PRO] 0:1466 [C] M:35 [GLY] 0:1466 [C] ❌ 1YHQ_0:1466 no longer at interface
L:14 [ARG] 0:408 [A] M:14 [ASN] 0:408 [A] ❌ 1YHQ_0:408 no longer at interface
L:145 [ASP] 0:289 [G] M:145 [ASP] 0:289 [G] ❌ 1YHQ_0:289 no longer at interface
L:125 [ARG] 0:2261 [C] M:125 [ARG] 0:2261 [C] ❌ 1YHQ_0:2261 no longer at interface
L:153 [THR] 0:185 [G] M:153 [ASP] 0:185 [G] ❌ 1JJ2_0:185 no longer at interface
L:75 [THR] 0:1863 [G] M:75 [ARG] 0:1863 [G] ❌ 1JJ2_0:1863 no longer at interface
L:159 [THR] 0:156 [C] M:159 [VAL] 0:156 [C] ❌ 1YHQ_M:159 no longer at interface
L:118 [TYR] 0:381 [G] M:118 [TYR] 0:381 [G] ❌ 1YHQ_M:118 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e Archaeal large subunit ribosomal RNA 1.0 0.2 0.71 1.0 1.0 1.0 0.98 0.97 0.96 0.76 0.47


Other pairs involving 1JJ2_L_0 or 1YHQ_M_0

Total number of entries: 11

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1JJ2_L_0 3CC2_M_0 0.97 1.0 0.17 0.72 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1JJ2_L_0 1YHQ_M_0 0.97 1.0 0.2 0.71 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1JJ2_L_0 7O7Y_BN_B5,B8 0.70 0.94 2.07 0.36 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e compare
1JJ2_L_0 1VQ8_M_0 0.97 1.0 0.3 0.71 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1JJ2_L_0 6AZ3_M_1,7 0.72 0.72 1.83 0.35 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e compare
1JJ2_L_0 6AZ3_M_2 0.60 0.83 2.3 0.19 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e compare
1VQ8_M_0 1YHQ_M_0 0.99 1.0 0.22 0.98 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1YHQ_M_0 6AZ3_M_2 0.63 0.83 2.28 0.19 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e compare
1YHQ_M_0 6AZ3_M_1,7 0.72 0.72 1.71 0.32 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e compare
1YHQ_M_0 7O7Y_BN_B5,B8 0.71 0.94 2.03 0.36 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e compare
1YHQ_M_0 3CC2_M_0 1.00 1.0 0.12 0.99 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e Archaeal large subunit ribosomal RNA compare