RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group106 > 1YHQ_M_0 vs 3CC2_M_0

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

1YHQ_M
1YHQ_0
3CC2_M
3CC2_0
Conserved?
M:149 [TRP] 0:432 [G] M:149 [TRP] 0:432 [G] ✔
M:149 [TRP] 0:433 [C] M:149 [TRP] 0:433 [C] ✔
M:108 [THR] 0:133 [U] M:108 [THR] 0:133 [U] ✔
M:108 [THR] 0:134 [U] M:108 [THR] 0:134 [U] ✔
M:50 [ARG] 0:241 [A] M:50 [ARG] 0:241 [A] ✔
M:50 [ARG] 0:242 [A] M:50 [ARG] 0:242 [A] ✔
M:50 [ARG] 0:264 [G] M:50 [ARG] 0:264 [G] ✔
M:50 [ARG] 0:265 [U] M:50 [ARG] 0:265 [U] ✔
M:140 [ALA] 0:250 [C] M:140 [ALA] 0:250 [C] ✔
M:140 [ALA] 0:251 [C] M:140 [ALA] 0:251 [C] ✔
M:94 [ARG] 0:157 [G] M:94 [ARG] 0:157 [G] ✔
M:94 [ARG] 0:158 [A] M:94 [ARG] 0:158 [A] ✔
M:94 [ARG] 0:175 [G] M:94 [ARG] 0:175 [G] ✔
M:94 [ARG] 0:390 [G] M:94 [ARG] 0:390 [G] ✔
M:94 [ARG] 0:391 [U] M:94 [ARG] 0:391 [U] ✔
M:94 [ARG] 0:400 [C] M:94 [ARG] 0:400 [C] ✔
M:94 [ARG] 0:401 [C] M:94 [ARG] 0:401 [C] ✔
M:32 [ARG] 0:2132 [C] M:32 [ARG] 0:2132 [C] ✔
M:32 [ARG] 0:2133 [U] M:32 [ARG] 0:2133 [U] ✔
M:32 [ARG] 0:2244 [A] M:32 [ARG] 0:2244 [A] ✔
M:32 [ARG] 0:2245 [C] M:32 [ARG] 0:2245 [C] ✔
M:71 [SER] 0:402 [U] M:71 [SER] 0:402 [U] ✔
M:71 [SER] 0:2263 [G] M:71 [SER] 0:2263 [G] ✔
M:71 [SER] 0:2264 [A] M:71 [SER] 0:2264 [A] ✔
M:137 [ASN] 0:144 [A] M:137 [ASN] 0:144 [A] ✔
M:137 [ASN] 0:145 [A] M:137 [ASN] 0:145 [A] ✔
M:61 [ILE] 0:135 [G] M:61 [ILE] 0:135 [G] ✔
M:61 [ILE] 0:136 [C] M:61 [ILE] 0:136 [C] ✔
M:5 [TYR] 0:242 [A] M:5 [TYR] 0:242 [A] ✔
M:5 [TYR] 0:243 [A] M:5 [TYR] 0:243 [A] ✔
M:5 [TYR] 0:264 [G] M:5 [TYR] 0:264 [G] ✔
M:180 [SER] 0:398 [U] M:180 [SER] 0:398 [U] ✔
M:180 [SER] 0:399 [C] M:180 [SER] 0:399 [C] ✔
M:79 [ALA] 0:770 [C] M:79 [ALA] 0:770 [C] ✔
M:79 [ALA] 0:771 [G] M:79 [ALA] 0:771 [G] ✔
M:79 [ALA] 0:2274 [A] M:79 [ALA] 0:2274 [A] ✔
M:163 [LEU] 0:155 [C] M:163 [LEU] 0:155 [C] ✔
M:163 [LEU] 0:188 [C] M:163 [LEU] 0:188 [C] ✔
M:163 [LEU] 0:189 [A] M:163 [LEU] 0:189 [A] ✔
M:163 [LEU] 0:433 [C] M:163 [LEU] 0:433 [C] ✔
M:165 [GLY] 0:432 [G] M:165 [GLY] 0:432 [G] ✔
M:104 [ARG] 0:1468 [G] M:104 [ARG] 0:1468 [G] ✔
M:104 [ARG] 0:1469 [C] M:104 [ARG] 0:1469 [C] ✔
M:104 [ARG] 0:1470 [A] M:104 [ARG] 0:1470 [A] ✔
M:104 [ARG] 0:1471 [A] M:104 [ARG] 0:1471 [A] ✔
M:53 [GLY] 0:431 [G] M:53 [GLY] 0:431 [G] ✔
M:160 [PHE] 0:155 [C] M:160 [PHE] 0:155 [C] ✔
M:160 [PHE] 0:156 [C] M:160 [PHE] 0:156 [C] ✔
M:160 [PHE] 0:181 [G] M:160 [PHE] 0:181 [G] ✔
M:160 [PHE] 0:182 [G] M:160 [PHE] 0:182 [G] ✔
M:81 [ARG] 0:160 [A] M:81 [ARG] 0:160 [A] ✔
M:81 [ARG] 0:161 [A] M:81 [ARG] 0:161 [A] ✔
M:81 [ARG] 0:770 [C] M:81 [ARG] 0:770 [C] ✔
M:81 [ARG] 0:771 [G] M:81 [ARG] 0:771 [G] ✔
M:81 [ARG] 0:2274 [A] M:81 [ARG] 0:2274 [A] ✔
M:81 [ARG] 0:2275 [G] M:81 [ARG] 0:2275 [G] ✔
M:93 [ARG] 0:158 [A] M:93 [ARG] 0:158 [A] ✔
M:93 [ARG] 0:159 [G] M:93 [ARG] 0:159 [G] ✔
M:93 [ARG] 0:401 [C] M:93 [ARG] 0:401 [C] ✔
M:93 [ARG] 0:1469 [C] M:93 [ARG] 0:1469 [C] ✔
M:93 [ARG] 0:1470 [A] M:93 [ARG] 0:1470 [A] ✔
M:171 [ARG] 0:155 [C] M:171 [ARG] 0:155 [C] ✔
M:171 [ARG] 0:156 [C] M:171 [ARG] 0:156 [C] ✔
M:171 [ARG] 0:157 [G] M:171 [ARG] 0:157 [G] ✔
M:171 [ARG] 0:188 [C] M:171 [ARG] 0:188 [C] ✔
M:171 [ARG] 0:189 [A] M:171 [ARG] 0:189 [A] ✔
M:171 [ARG] 0:399 [C] M:171 [ARG] 0:399 [C] ✔
M:171 [ARG] 0:400 [C] M:171 [ARG] 0:400 [C] ✔
M:176 [LYS] 0:190 [G] M:176 [LYS] 0:190 [G] ✔
M:176 [LYS] 0:191 [A] M:176 [LYS] 0:191 [A] ✔
M:176 [LYS] 0:192 [A] M:176 [LYS] 0:192 [A] ✔
M:176 [LYS] 0:193 [A] M:176 [LYS] 0:193 [A] ✔
M:176 [LYS] 0:194 [A] M:176 [LYS] 0:194 [A] ✔
M:176 [LYS] 0:204 [A] M:176 [LYS] 0:204 [A] ✔
M:176 [LYS] 0:205 [U] M:176 [LYS] 0:205 [U] ✔
M:97 [ILE] 0:401 [C] M:97 [ILE] 0:401 [C] ✔
M:97 [ILE] 0:402 [U] M:97 [ILE] 0:402 [U] ✔
M:97 [ILE] 0:403 [C] M:97 [ILE] 0:403 [C] ✔
M:1 [ALA] 0:243 [A] M:1 [ALA] 0:243 [A] ✔
M:1 [ALA] 0:244 [C] M:1 [ALA] 0:244 [C] ✔
M:1 [ALA] 0:376 [C] M:1 [ALA] 0:376 [C] ✔
M:1 [ALA] 0:377 [C] M:1 [ALA] 0:377 [C] ✔
M:37 [VAL] 0:1467 [C] M:37 [VAL] 0:1467 [C] ✔
M:25 [TRP] 0:2133 [U] M:25 [TRP] 0:2133 [U] ✔
M:25 [TRP] 0:2243 [C] M:25 [TRP] 0:2243 [C] ✔
M:25 [TRP] 0:2244 [A] M:25 [TRP] 0:2244 [A] ✔
M:187 [LEU] 0:155 [C] M:187 [LEU] 0:155 [C] ✔
M:187 [LEU] 0:156 [C] M:187 [LEU] 0:156 [C] ✔
M:187 [LEU] 0:157 [G] M:187 [LEU] 0:157 [G] ✔
M:179 [GLY] 0:394 [G] M:179 [GLY] 0:394 [G] ✔
M:179 [GLY] 0:398 [U] M:179 [GLY] 0:398 [U] ✔
M:179 [GLY] 0:399 [C] M:179 [GLY] 0:399 [C] ✔
M:184 [ARG] 0:189 [A] M:184 [ARG] 0:189 [A] ✔
M:184 [ARG] 0:190 [G] M:184 [ARG] 0:190 [G] ✔
M:184 [ARG] 0:205 [U] M:184 [ARG] 0:205 [U] ✔
M:184 [ARG] 0:206 [G] M:184 [ARG] 0:206 [G] ✔
M:143 [ASN] 0:250 [C] M:143 [ASN] 0:250 [C] ✔
M:143 [ASN] 0:251 [C] M:143 [ASN] 0:251 [C] ✔
M:48 [LYS] 0:379 [G] M:48 [LYS] 0:379 [G] ✔
M:48 [LYS] 0:380 [A] M:48 [LYS] 0:380 [A] ✔
M:48 [LYS] 0:381 [G] M:48 [LYS] 0:381 [G] ✔
M:48 [LYS] 0:430 [A] M:48 [LYS] 0:430 [A] ✔
M:48 [LYS] 0:431 [G] M:48 [LYS] 0:431 [G] ✔
M:158 [ARG] 0:432 [G] M:158 [ARG] 0:432 [G] ✔
M:158 [ARG] 0:433 [C] M:158 [ARG] 0:433 [C] ✔
M:103 [GLU] 0:156 [C] M:103 [GLU] 0:156 [C] ✔
M:103 [GLU] 0:1470 [A] M:103 [GLU] 0:1470 [A] ✔
M:103 [GLU] 0:1471 [A] M:103 [GLU] 0:1471 [A] ✔
M:127 [LYS] 0:402 [U] M:127 [LYS] 0:402 [U] ✔
M:127 [LYS] 0:403 [C] M:127 [LYS] 0:403 [C] ✔
M:92 [THR] 0:158 [A] M:92 [THR] 0:158 [A] ✔
M:92 [THR] 0:388 [G] M:92 [THR] 0:388 [G] ✔
M:92 [THR] 0:389 [G] M:92 [THR] 0:389 [G] ✔
M:92 [THR] 0:401 [C] M:92 [THR] 0:401 [C] ✔
M:92 [THR] 0:402 [U] M:92 [THR] 0:402 [U] ✔
M:28 [GLN] 0:2245 [C] M:28 [GLN] 0:2245 [C] ✔
M:111 [ASN] 0:134 [U] M:111 [ASN] 0:134 [U] ✔
M:111 [ASN] 0:135 [G] M:111 [ASN] 0:135 [G] ✔
M:111 [ASN] 0:144 [A] M:111 [ASN] 0:144 [A] ✔
M:111 [ASN] 0:145 [A] M:111 [ASN] 0:145 [A] ✔
M:111 [ASN] 0:146 [U] M:111 [ASN] 0:146 [U] ✔
M:73 [ARG] 0:1469 [C] M:73 [ARG] 0:1469 [C] ✔
M:73 [ARG] 0:1470 [A] M:73 [ARG] 0:1470 [A] ✔
M:73 [ARG] 0:1864 [C] M:73 [ARG] 0:1864 [C] ✔
M:73 [ARG] 0:1865 [A] M:73 [ARG] 0:1865 [A] ✔
M:73 [ARG] 0:2263 [G] M:73 [ARG] 0:2263 [G] ✔
M:154 [ASP] 0:183 [A] M:154 [ASP] 0:183 [A] ✔
M:154 [ASP] 0:184 [G] M:154 [ASP] 0:184 [G] ✔
M:154 [ASP] 0:187 [A] M:154 [ASP] 0:187 [A] ✔
M:154 [ASP] 0:188 [C] M:154 [ASP] 0:188 [C] ✔
M:154 [ASP] 0:434 [U] M:154 [ASP] 0:434 [U] ✔
M:88 [VAL] 0:2122 [C] M:88 [VAL] 0:2122 [C] ✔
M:88 [VAL] 0:2123 [A] M:88 [VAL] 0:2123 [A] ✔
M:75 [ARG] 0:1863 [G] M:75 [ARG] 0:1863 [G] ✔
M:75 [ARG] 0:1864 [C] M:75 [ARG] 0:1864 [C] ✔
M:153 [ASP] 0:183 [A] M:153 [ASP] 0:183 [A] ✔
M:153 [ASP] 0:184 [G] M:153 [ASP] 0:184 [G] ✔
M:153 [ASP] 0:185 [G] M:153 [ASP] 0:185 [G] ✔
M:110 [PRO] 0:133 [U] M:110 [PRO] 0:133 [U] ✔
M:110 [PRO] 0:134 [U] M:110 [PRO] 0:134 [U] ✔
M:110 [PRO] 0:145 [A] M:110 [PRO] 0:145 [A] ✔
M:110 [PRO] 0:146 [U] M:110 [PRO] 0:146 [U] ✔
M:162 [GLY] 0:155 [C] M:162 [GLY] 0:155 [C] ✔
M:162 [GLY] 0:156 [C] M:162 [GLY] 0:156 [C] ✔
M:162 [GLY] 0:189 [A] M:162 [GLY] 0:189 [A] ✔
M:178 [LYS] 0:194 [A] M:178 [LYS] 0:194 [A] ✔
M:178 [LYS] 0:195 [C] M:178 [LYS] 0:195 [C] ✔
M:178 [LYS] 0:394 [G] M:178 [LYS] 0:394 [G] ✔
M:178 [LYS] 0:397 [A] M:178 [LYS] 0:397 [A] ✔
M:178 [LYS] 0:398 [U] M:178 [LYS] 0:398 [U] ✔
M:178 [LYS] 0:399 [C] M:178 [LYS] 0:399 [C] ✔
M:178 [LYS] 0:415 [A] M:178 [LYS] 0:415 [A] ✔
M:178 [LYS] 0:416 [G] M:178 [LYS] 0:416 [G] ✔
M:178 [LYS] 0:417 [G] M:178 [LYS] 0:417 [G] ✔
M:168 [ARG] 0:189 [A] M:168 [ARG] 0:189 [A] ✔
M:168 [ARG] 0:190 [G] M:168 [ARG] 0:190 [G] ✔
M:168 [ARG] 0:432 [G] M:168 [ARG] 0:432 [G] ✔
M:168 [ARG] 0:433 [C] M:168 [ARG] 0:433 [C] ✔
M:186 [SER] 0:154 [C] M:186 [SER] 0:154 [C] ✔
M:186 [SER] 0:155 [C] M:186 [SER] 0:155 [C] ✔
M:186 [SER] 0:156 [C] M:186 [SER] 0:156 [C] ✔
M:186 [SER] 0:188 [C] M:186 [SER] 0:188 [C] ✔
M:173 [LEU] 0:189 [A] M:173 [LEU] 0:189 [A] ✔
M:173 [LEU] 0:190 [G] M:173 [LEU] 0:190 [G] ✔
M:35 [GLY] 0:1467 [C] M:35 [GLY] 0:1467 [C] ✔
M:170 [ASN] 0:157 [G] M:170 [ASN] 0:157 [G] ✔
M:170 [ASN] 0:400 [C] M:170 [ASN] 0:400 [C] ✔
M:170 [ASN] 0:401 [C] M:170 [ASN] 0:401 [C] ✔
M:191 [GLY] 0:175 [G] M:191 [GLY] 0:175 [G] ✔
M:191 [GLY] 0:176 [U] M:191 [GLY] 0:176 [U] ✔
M:6 [SER] 0:378 [A] M:6 [SER] 0:378 [A] ✔
M:66 [SER] 0:1468 [G] M:66 [SER] 0:1468 [G] ✔
M:13 [GLU] 0:380 [A] M:13 [LYS] 0:380 [A] ✔
M:13 [GLU] 0:381 [G] M:13 [LYS] 0:381 [G] ✔
M:13 [GLU] 0:409 [U] M:13 [LYS] 0:409 [U] ✔
M:3 [SER] 0:242 [A] M:3 [SER] 0:242 [A] ✔
M:3 [SER] 0:243 [A] M:3 [SER] 0:243 [A] ✔
M:115 [LEU] 0:432 [G] M:115 [LEU] 0:432 [G] ✔
M:74 [LYS] 0:158 [A] M:74 [LYS] 0:158 [A] ✔
M:74 [LYS] 0:159 [G] M:74 [LYS] 0:159 [G] ✔
M:74 [LYS] 0:1864 [C] M:74 [LYS] 0:1864 [C] ✔
M:54 [TYR] 0:264 [G] M:54 [TYR] 0:264 [G] ✔
M:109 [PHE] 0:133 [U] M:109 [PHE] 0:133 [U] ✔
M:109 [PHE] 0:134 [U] M:109 [PHE] 0:134 [U] ✔
M:109 [PHE] 0:135 [G] M:109 [PHE] 0:135 [G] ✔
M:84 [LYS] 0:170 [U] M:84 [LYS] 0:170 [U] ✔
M:84 [LYS] 0:171 [C] M:84 [LYS] 0:171 [C] ✔
M:84 [LYS] 0:390 [G] M:84 [LYS] 0:390 [G] ✔
M:84 [LYS] 0:391 [U] M:84 [LYS] 0:391 [U] ✔
M:188 [ARG] 0:153 [C] M:188 [ARG] 0:153 [C] ✔
M:188 [ARG] 0:154 [C] M:188 [ARG] 0:154 [C] ✔
M:188 [ARG] 0:155 [C] M:188 [ARG] 0:155 [C] ✔
M:188 [ARG] 0:156 [C] M:188 [ARG] 0:156 [C] ✔
M:46 [LEU] 0:263 [U] M:46 [LEU] 0:263 [U] ✔
M:46 [LEU] 0:264 [G] M:46 [LEU] 0:264 [G] ✔
M:78 [LYS] 0:869 [G] M:78 [LYS] 0:869 [G] ✔
M:78 [LYS] 0:870 [G] M:78 [LYS] 0:870 [G] ✔
M:181 [GLU] 0:226 [A] M:181 [GLU] 0:226 [A] ✔
M:181 [GLU] 0:227 [A] M:181 [GLU] 0:227 [A] ✔
M:181 [GLU] 0:393 [G] M:181 [GLU] 0:393 [G] ✔
M:181 [GLU] 0:394 [G] M:181 [GLU] 0:394 [G] ✔
M:181 [GLU] 0:398 [U] M:181 [GLU] 0:398 [U] ✔
M:181 [GLU] 0:417 [G] M:181 [GLU] 0:417 [G] ✔
M:185 [PRO] 0:188 [C] M:185 [PRO] 0:188 [C] ✔
M:185 [PRO] 0:189 [A] M:185 [PRO] 0:189 [A] ✔
M:185 [PRO] 0:206 [G] M:185 [PRO] 0:206 [G] ✔
M:185 [PRO] 0:207 [U] M:185 [PRO] 0:207 [U] ✔
M:119 [SER] 0:381 [G] M:119 [SER] 0:381 [G] ✔
M:90 [ARG] 0:388 [G] M:90 [ARG] 0:388 [G] ✔
M:90 [ARG] 0:389 [G] M:90 [ARG] 0:389 [G] ✔
M:90 [ARG] 0:2123 [A] M:90 [ARG] 0:2123 [A] ✔
M:90 [ARG] 0:2265 [U] M:90 [ARG] 0:2265 [U] ✔
M:90 [ARG] 0:2266 [A] M:90 [ARG] 0:2266 [A] ✔
M:83 [SER] 0:169 [A] M:83 [SER] 0:169 [A] ✔
M:83 [SER] 0:170 [U] M:83 [SER] 0:170 [U] ✔
M:83 [SER] 0:2121 [G] M:83 [SER] 0:2121 [G] ✔
M:83 [SER] 0:2122 [C] M:83 [SER] 0:2122 [C] ✔
M:68 [ARG] 0:1469 [C] M:68 [ARG] 0:1469 [C] ✔
M:68 [ARG] 0:1470 [A] M:68 [ARG] 0:1470 [A] ✔
M:42 [ARG] 0:261 [A] M:42 [ARG] 0:261 [A] ✔
M:42 [ARG] 0:262 [A] M:42 [ARG] 0:262 [A] ✔
M:42 [ARG] 0:263 [U] M:42 [ARG] 0:263 [U] ✔
M:156 [ALA] 0:182 [G] M:156 [ALA] 0:182 [G] ✔
M:156 [ALA] 0:183 [A] M:156 [ALA] 0:183 [A] ✔
M:45 [ARG] 0:380 [A] M:45 [ARG] 0:380 [A] ✔
M:45 [ARG] 0:381 [G] M:45 [ARG] 0:381 [G] ✔
M:56 [ALA] 0:260 [C] M:56 [ALA] 0:260 [C] ✔
M:56 [ALA] 0:261 [A] M:56 [ALA] 0:261 [A] ✔
M:56 [ALA] 0:262 [A] M:56 [ALA] 0:262 [A] ✔
M:56 [ALA] 0:264 [G] M:56 [ALA] 0:264 [G] ✔
M:56 [ALA] 0:265 [U] M:56 [ALA] 0:265 [U] ✔
M:183 [THR] 0:399 [C] M:183 [THR] 0:399 [C] ✔
M:100 [VAL] 0:1470 [A] M:100 [VAL] 0:1470 [A] ✔
M:100 [VAL] 0:1471 [A] M:100 [VAL] 0:1471 [A] ✔
M:138 [HIS] 0:135 [G] M:138 [HIS] 0:135 [G] ✔
M:138 [HIS] 0:136 [C] M:138 [HIS] 0:136 [C] ✔
M:138 [HIS] 0:251 [C] M:138 [HIS] 0:251 [C] ✔
M:107 [ARG] 0:133 [U] M:107 [ARG] 0:133 [U] ✔
M:107 [ARG] 0:181 [G] M:107 [ARG] 0:181 [G] ✔
M:107 [ARG] 0:1471 [A] M:107 [ARG] 0:1471 [A] ✔
M:107 [ARG] 0:1472 [C] M:107 [ARG] 0:1472 [C] ✔
M:80 [GLY] 0:160 [A] M:80 [GLY] 0:160 [A] ✔
M:80 [GLY] 0:161 [A] M:80 [GLY] 0:161 [A] ✔
M:80 [GLY] 0:769 [C] M:80 [GLY] 0:769 [C] ✔
M:80 [GLY] 0:770 [C] M:80 [GLY] 0:770 [C] ✔
M:80 [GLY] 0:2274 [A] M:80 [GLY] 0:2274 [A] ✔
M:80 [GLY] 0:2275 [G] M:80 [GLY] 0:2275 [G] ✔
M:15 [PRO] 0:381 [G] M:15 [PRO] 0:381 [G] ✔
M:95 [LYS] 0:156 [C] M:95 [LYS] 0:156 [C] ✔
M:95 [LYS] 0:157 [G] M:95 [LYS] 0:157 [G] ✔
M:95 [LYS] 0:158 [A] M:95 [LYS] 0:158 [A] ✔
M:95 [LYS] 0:401 [C] M:95 [LYS] 0:401 [C] ✔
M:95 [LYS] 0:402 [U] M:95 [LYS] 0:402 [U] ✔
M:95 [LYS] 0:1470 [A] M:95 [LYS] 0:1470 [A] ✔
M:70 [GLY] 0:402 [U] M:70 [GLY] 0:402 [U] ✔
M:70 [GLY] 0:403 [C] M:70 [GLY] 0:403 [C] ✔
M:70 [GLY] 0:2263 [G] M:70 [GLY] 0:2263 [G] ✔
M:70 [GLY] 0:2264 [A] M:70 [GLY] 0:2264 [A] ✔
M:172 [GLY] 0:399 [C] M:172 [GLY] 0:399 [C] ✔
M:172 [GLY] 0:400 [C] M:172 [GLY] 0:400 [C] ✔
M:174 [SER] 0:193 [A] M:174 [SER] 0:193 [A] ✔
M:174 [SER] 0:400 [C] M:174 [SER] 0:400 [C] ✔
M:47 [ASP] 0:241 [A] M:47 [ASP] 0:241 [A] ✔
M:9 [ARG] 0:377 [C] M:9 [ARG] 0:377 [C] ✔
M:9 [ARG] 0:378 [A] M:9 [ARG] 0:378 [A] ✔
M:9 [ARG] 0:379 [G] M:9 [ARG] 0:379 [G] ✔
M:9 [ARG] 0:380 [A] M:9 [ARG] 0:380 [A] ✔
M:139 [PRO] 0:251 [C] M:139 [PRO] 0:251 [C] ✔
M:139 [PRO] 0:252 [C] M:139 [PRO] 0:252 [C] ✔
M:55 [LYS] 0:241 [A] M:55 [LYS] 0:241 [A] ✔
M:55 [LYS] 0:265 [U] M:55 [LYS] 0:265 [U] ✔
M:55 [LYS] 0:266 [G] M:55 [LYS] 0:266 [G] ✔
M:177 [GLY] 0:194 [A] M:177 [GLY] 0:194 [A] ✔
M:177 [GLY] 0:195 [C] M:177 [GLY] 0:195 [C] ✔
M:85 [ARG] 0:160 [A] M:85 [ARG] 0:160 [A] ✔
M:85 [ARG] 0:161 [A] M:85 [ARG] 0:161 [A] ✔
M:85 [ARG] 0:174 [A] M:85 [ARG] 0:174 [A] ✔
M:85 [ARG] 0:175 [G] M:85 [ARG] 0:175 [G] ✔
M:85 [ARG] 0:390 [G] M:85 [ARG] 0:390 [G] ✔
M:85 [ARG] 0:391 [U] M:85 [ARG] 0:391 [U] ✔
M:87 [GLY] 0:2122 [C] M:87 [GLY] 0:2122 [C] ✔
M:87 [GLY] 0:2123 [A] M:87 [GLY] 0:2123 [A] ✔
M:144 [ASP] 0:266 [G] M:144 [ASP] 0:266 [G] ✔
M:89 [THR] 0:2123 [A] M:89 [THR] 0:2123 [A] ✔
M:89 [THR] 0:2124 [G] M:89 [THR] 0:2124 [G] ✔
M:89 [THR] 0:2264 [A] M:89 [THR] 0:2264 [A] ✔
M:89 [THR] 0:2265 [U] M:89 [THR] 0:2265 [U] ✔
M:14 [ASN] 0:381 [G] M:14 [ASN] 0:381 [G] ✔
M:14 [ASN] 0:407 [A] M:14 [ASN] 0:407 [A] ✔
M:146 [ASP] 0:239 [C] M:146 [ASP] 0:239 [C] ✔
M:146 [ASP] 0:240 [C] M:146 [ASP] 0:240 [C] ✔
M:146 [ASP] 0:241 [A] M:146 [ASP] 0:241 [A] ✔
M:76 [ARG] 0:1864 [C] M:76 [ARG] 0:1864 [C] ✔
M:76 [ARG] 0:2121 [G] M:76 [ARG] 0:2121 [G] ✔
M:76 [ARG] 0:2122 [C] M:76 [ARG] 0:2122 [C] ✔
M:76 [ARG] 0:2123 [A] M:76 [ARG] 0:2123 [A] ✔
M:76 [ARG] 0:2272 [G] M:76 [ARG] 0:2272 [G] ✔
M:76 [ARG] 0:2273 [C] M:76 [ARG] 0:2273 [C] ✔
M:76 [ARG] 0:2274 [A] M:76 [ARG] 0:2274 [A] ✔
M:36 [ALA] 0:1467 [C] M:36 [ALA] 0:1467 [C] ✔
M:36 [ALA] 0:1468 [G] M:36 [ALA] 0:1468 [G] ✔
M:182 [LYS] 0:226 [A] M:182 [LYS] 0:226 [A] ✔
M:182 [LYS] 0:392 [U] M:182 [LYS] 0:392 [U] ✔
M:182 [LYS] 0:393 [G] M:182 [LYS] 0:393 [G] ✔
M:182 [LYS] 0:394 [G] M:182 [LYS] 0:394 [G] ✔
M:58 [GLN] 0:136 [C] M:58 [GLN] 0:136 [C] ✔
M:58 [GLN] 0:137 [U] M:58 [GLN] 0:137 [U] ✔
M:58 [GLN] 0:250 [C] M:58 [GLN] 0:250 [C] ✔
M:58 [GLN] 0:251 [C] M:58 [GLN] 0:251 [C] ✔
M:58 [GLN] 0:259 [G] M:58 [GLN] 0:259 [G] ✔
M:58 [GLN] 0:260 [C] M:58 [GLN] 0:260 [C] ✔
M:161 [ARG] 0:155 [C] M:161 [ARG] 0:155 [C] ✔
M:161 [ARG] 0:156 [C] M:161 [ARG] 0:156 [C] ✔
M:161 [ARG] 0:181 [G] M:161 [ARG] 0:181 [G] ✔
M:161 [ARG] 0:182 [G] M:161 [ARG] 0:182 [G] ✔
M:161 [ARG] 0:183 [A] M:161 [ARG] 0:183 [A] ✔
M:161 [ARG] 0:187 [A] M:161 [ARG] 0:187 [A] ✔
M:161 [ARG] 0:188 [C] M:161 [ARG] 0:188 [C] ✔
M:169 [ARG] 0:400 [C] M:169 [ARG] 0:400 [C] ✔
M:169 [ARG] 0:430 [A] M:169 [ARG] 0:430 [A] ✔
M:169 [ARG] 0:431 [G] M:169 [ARG] 0:431 [G] ✔
M:51 [SER] 0:240 [C] M:51 [SER] 0:240 [C] ✔
M:51 [SER] 0:241 [A] M:51 [SER] 0:241 [A] ✔
M:51 [SER] 0:379 [G] M:51 [SER] 0:379 [G] ✔
M:51 [SER] 0:431 [G] M:51 [SER] 0:431 [G] ✔
M:2 [ARG] 0:376 [C] M:2 [ARG] 0:376 [C] ✔
M:2 [ARG] 0:377 [C] M:2 [ARG] 0:377 [C] ✔
M:164 [THR] 0:432 [G] M:164 [THR] 0:432 [G] ✔
M:57 [LYS] 0:250 [C] M:57 [LYS] 0:250 [C] ✔
M:57 [LYS] 0:260 [C] M:57 [LYS] 0:260 [C] ✔
M:57 [LYS] 0:261 [A] M:57 [LYS] 0:261 [A] ✔
M:57 [LYS] 0:265 [U] M:57 [LYS] 0:265 [U] ✔
M:57 [LYS] 0:266 [G] M:57 [LYS] 0:266 [G] ✔
M:59 [GLY] 0:135 [G] M:59 [GLY] 0:135 [G] ✔
M:59 [GLY] 0:136 [C] M:59 [GLY] 0:136 [C] ✔
M:155 [GLN] 0:433 [C] M:155 [GLN] 0:433 [C] ✔
M:155 [GLN] 0:434 [U] M:155 [GLN] 0:434 [U] ✔
M:69 [LYS] 0:402 [U] M:69 [LYS] 0:402 [U] ✔
M:69 [LYS] 0:403 [C] M:69 [LYS] 0:403 [C] ✔
M:69 [LYS] 0:404 [G] M:69 [LYS] 0:404 [G] ✔
M:69 [LYS] 0:2131 [G] M:69 [LYS] 0:2131 [G] ✔
M:69 [LYS] 0:2263 [G] M:69 [LYS] 0:2263 [G] ✔
M:124 [GLY] 0:2131 [G] M:124 [GLY] 0:2131 [G] ✔
M:124 [GLY] 0:2132 [C] M:124 [GLY] 0:2132 [C] ✔
M:124 [GLY] 0:2262 [C] M:124 [GLY] 0:2262 [C] ✔
M:124 [GLY] 0:2263 [G] M:124 [GLY] 0:2263 [G] ✔
M:99 [ARG] 0:156 [C] M:99 [ARG] 0:156 [C] ✔
M:99 [ARG] 0:157 [G] M:99 [ARG] 0:157 [G] ✔
M:12 [TRP] 0:380 [A] M:12 [TRP] 0:380 [A] ✔
M:86 [GLN] 0:2121 [G] M:86 [GLN] 0:2121 [G] ✔
M:86 [GLN] 0:2122 [C] M:86 [GLN] 0:2122 [C] ✔
M:86 [GLN] 0:2123 [A] M:86 [GLN] 0:2123 [A] ✔
M:86 [GLN] 0:2273 [C] M:86 [GLN] 0:2273 [C] ✔
M:86 [GLN] 0:2274 [A] M:86 [GLN] 0:2274 [A] ✔
M:86 [GLN] 0:2275 [G] M:86 [GLN] 0:2275 [G] ✔
M:52 [GLN] 0:431 [G] M:52 [GLN] 0:431 [G] ✔
M:145 [ASP] 0:239 [C] M:145 [ASP] 0:239 [C] ✔
M:145 [ASP] 0:288 [A] M:145 [ASP] 0:288 [A] ✔
M:192 [GLY] 0:175 [G] M:192 [GLY] 0:175 [G] ✔
M:16 [GLY] 0:381 [G] M:16 [GLY] 0:381 [G] ✔
M:123 [ASP] 0:2132 [C] M:123 [ASP] 0:2132 [C] ✔
M:77 [HIS] 0:2122 [C] M:77 [HIS] 0:2122 [C] ✔
M:77 [HIS] 0:2273 [C] M:77 [HIS] 0:2273 [C] ✔
M:77 [HIS] 0:2274 [A] M:77 [HIS] 0:2274 [A] ✔
M:112 [LEU] 0:134 [U] M:112 [LEU] 0:134 [U] ✔
M:112 [LEU] 0:135 [G] M:112 [LEU] 0:135 [G] ✔
M:91 [ILE] 0:159 [G] M:91 [ILE] 0:159 [G] ✔
M:91 [ILE] 0:389 [G] M:91 [ILE] 0:389 [G] ✔
M:29 [GLN] 0:2244 [A] M:29 [GLN] 0:2244 [A] ✔
M:29 [GLN] 0:2245 [C] M:29 [GLN] 0:2245 [C] ✔
M:157 [ASP] 0:182 [G] M:157 [ASP] 0:182 [G] ✔
M:157 [ASP] 0:183 [A] M:157 [ASP] 0:183 [A] ✔
M:193 [LYS] 0:175 [G] M:193 [LYS] 0:175 [G] ✔
M:193 [LYS] 0:225 [G] M:193 [LYS] 0:225 [G] ✔
M:193 [LYS] 0:391 [U] M:193 [LYS] 0:391 [U] ✔
M:193 [LYS] 0:392 [U] M:193 [LYS] 0:392 [U] ✔
M:193 [LYS] 0:393 [G] M:193 [LYS] 0:393 [G] ✔
M:96 [ASP] 0:401 [C] M:96 [ASP] 0:401 [C] ✔
M:96 [ASP] 0:402 [U] M:96 [ASP] 0:402 [U] ✔
M:194 [GLY] 0:390 [G] M:194 [GLY] 0:390 [G] ✔
M:194 [GLY] 0:391 [U] M:194 [GLY] 0:391 [U] ✔
M:194 [GLY] 0:399 [C] M:194 [GLY] 0:399 [C] ✔
M:135 [ASP] 0:135 [G] M:135 [ASP] 0:135 [G] ✔
M:135 [ASP] 0:136 [C] M:135 [ASP] 0:136 [C] ✔
M:189 [SER] 0:155 [C] M:189 [SER] 0:155 [C] ✔
M:189 [SER] 0:207 [U] M:189 [SER] 0:207 [U] ✔
M:82 [ARG] 0:161 [A] M:82 [ARG] 0:161 [A] ✔
M:82 [ARG] 0:169 [A] M:82 [ARG] 0:169 [A] ✔
M:82 [ARG] 0:170 [U] M:82 [ARG] 0:170 [U] ✔
M:82 [ARG] 0:171 [C] M:82 [ARG] 0:171 [C] ✔
M:82 [ARG] 0:172 [U] M:82 [ARG] 0:172 [U] ✔
M:82 [ARG] 0:173 [C] M:82 [ARG] 0:173 [C] ✔
M:82 [ARG] 0:2274 [A] M:82 [ARG] 0:2274 [A] ✔
M:82 [ARG] 0:2275 [G] M:82 [ARG] 0:2275 [G] ✔
M:39 [ARG] 0:134 [U] M:39 [ARG] 0:134 [U] ✔
M:39 [ARG] 0:135 [G] M:39 [ARG] 0:135 [G] ✔
M:39 [ARG] 0:136 [C] M:39 [ARG] 0:136 [C] ✔
M:122 [GLN] 0:404 [G] M:122 [GLN] 0:404 [G] ✔
M:72 [ALA] 0:1470 [A] M:72 [ALA] 0:1470 [A] ✔
M:116 [ASN] 0:431 [G] M:116 [ASN] 0:431 [G] ✔
M:116 [ASN] 0:432 [G] M:116 [ASN] 0:432 [G] ✔
M:125 [ARG] 0:2131 [G] M:125 [ARG] 0:2131 [G] ✔
M:125 [ARG] 0:2246 [U] M:125 [ARG] 0:2246 [U] ✔
M:125 [ARG] 0:2262 [C] M:125 [ARG] 0:2262 [C] ✔
M:125 [ARG] 0:2263 [G] M:125 [ARG] 0:2263 [G] ✔
M:47 [ASP] 0:380 [A] M:47 [ASP] 0:380 [A] ❌ 3CC2_M_0
M:192 [GLY] 0:176 [U] M:192 [GLY] 0:176 [U] ❌ 3CC2_M_0
M:122 [GLN] 0:2131 [G] M:122 [GLN] 0:2131 [G] ❌ 1YHQ_M_0
M:71 [SER] 0:1470 [A] M:71 [SER] 0:1470 [A] ❌ 1YHQ_M_0
M:94 [ARG] 0:159 [G] M:94 [ARG] 0:159 [G] ❌ 1YHQ_M_0
M:118 [TYR] 0:381 [G] M:118 [TYR] 0:381 [G] ❌ 1YHQ_M:118 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e Archaeal large subunit ribosomal RNA 1.0 0.12 0.99 1.0 1.0 1.0 1.0 1.00 0.99 0.90 0.17


Other pairs involving 1YHQ_M_0 or 3CC2_M_0

Total number of entries: 11

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1JJ2_L_0 3CC2_M_0 0.97 1.0 0.17 0.72 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1JJ2_L_0 1YHQ_M_0 0.97 1.0 0.2 0.71 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1VQ8_M_0 1YHQ_M_0 0.99 1.0 0.22 0.98 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1VQ8_M_0 3CC2_M_0 0.99 1.0 0.27 0.98 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1YHQ_M_0 6AZ3_M_2 0.63 0.83 2.28 0.19 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e compare
1YHQ_M_0 6AZ3_M_1,7 0.72 0.72 1.71 0.32 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e compare
1YHQ_M_0 7O7Y_BN_B5,B8 0.71 0.94 2.03 0.36 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e compare
1YHQ_M_0 3CC2_M_0 1.00 1.0 0.12 0.99 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
3CC2_M_0 7O7Y_BN_B5,B8 0.70 0.94 2.07 0.36 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e compare
3CC2_M_0 6AZ3_M_1,7 0.72 0.72 1.84 0.34 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e compare
3CC2_M_0 6AZ3_M_2 0.63 0.83 2.3 0.19 Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e compare