Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
3CC2_M
|
3CC2_0
|
6AZ3_M
|
6AZ3_1,7
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
M:149 [TRP] | 0:432 [G] | M:150 [TRP] | 1:358 [G] | ✔ |
M:149 [TRP] | 0:433 [C] | M:150 [TRP] | 1:359 [U] | ✔ |
M:50 [ARG] | 0:241 [A] | M:49 [ARG] | 1:114 [G] | ✔ |
M:50 [ARG] | 0:242 [A] | M:49 [ARG] | 1:115 [U] | ✔ |
M:50 [ARG] | 0:264 [G] | M:49 [ARG] | 1:147 [G] | ✔ |
M:50 [ARG] | 0:265 [U] | M:49 [ARG] | 1:148 [U] | ✔ |
M:140 [ALA] | 0:250 [C] | M:141 [THR] | 1:124 [C] | ✔ |
M:140 [ALA] | 0:251 [C] | M:141 [THR] | 1:125 [G] | ✔ |
M:94 [ARG] | 0:157 [G] | M:95 [ASN] | 1:29 [C] | ✔ |
M:94 [ARG] | 0:158 [A] | M:95 [ASN] | 1:30 [C] | ✔ |
M:94 [ARG] | 0:390 [G] | M:95 [ASN] | 1:315 [U] | ✔ |
M:94 [ARG] | 0:400 [C] | M:95 [ASN] | 1:325 [C] | ✔ |
M:94 [ARG] | 0:401 [C] | M:95 [ASN] | 1:326 [A] | ✔ |
M:71 [SER] | 0:402 [U] | M:70 [GLY] | 1:327 [G] | ✔ |
M:137 [ASN] | 0:144 [A] | M:138 [MET] | 1:16 [G] | ✔ |
M:137 [ASN] | 0:145 [A] | M:138 [MET] | 1:17 [C] | ✔ |
M:5 [TYR] | 0:242 [A] | M:4 [PHE] | 1:115 [U] | ✔ |
M:5 [TYR] | 0:243 [A] | M:4 [PHE] | 1:116 [U] | ✔ |
M:180 [SER] | 0:398 [U] | M:181 [ALA] | 1:323 [U] | ✔ |
M:163 [LEU] | 0:155 [C] | M:164 [LEU] | 1:27 [C] | ✔ |
M:163 [LEU] | 0:188 [C] | M:164 [LEU] | 1:60 [A] | ✔ |
M:163 [LEU] | 0:189 [A] | M:164 [LEU] | 1:61 [A] | ✔ |
M:163 [LEU] | 0:433 [C] | M:164 [LEU] | 1:359 [U] | ✔ |
M:165 [GLY] | 0:432 [G] | M:166 [SER] | 1:358 [G] | ✔ |
M:104 [ARG] | 0:1469 [C] | M:105 [ARG] | 1:1653 [U] | ✔ |
M:104 [ARG] | 0:1470 [A] | M:105 [ARG] | 1:1654 [A] | ✔ |
M:104 [ARG] | 0:1471 [A] | M:105 [ARG] | 1:1655 [U] | ✔ |
M:53 [GLY] | 0:431 [G] | M:52 [GLY] | 1:357 [A] | ✔ |
M:160 [PHE] | 0:155 [C] | M:161 [GLN] | 1:27 [C] | ✔ |
M:160 [PHE] | 0:156 [C] | M:161 [GLN] | 1:28 [G] | ✔ |
M:160 [PHE] | 0:181 [G] | M:161 [GLN] | 1:53 [G] | ✔ |
M:160 [PHE] | 0:182 [G] | M:161 [GLN] | 1:54 [G] | ✔ |
M:81 [ARG] | 0:161 [A] | M:82 [GLY] | 1:33 [A] | ✔ |
M:93 [ARG] | 0:158 [A] | M:94 [LEU] | 1:30 [C] | ✔ |
M:93 [ARG] | 0:401 [C] | M:94 [LEU] | 1:326 [A] | ✔ |
M:93 [ARG] | 0:1470 [A] | M:94 [LEU] | 1:1654 [A] | ✔ |
M:171 [ARG] | 0:155 [C] | M:172 [ARG] | 1:27 [C] | ✔ |
M:171 [ARG] | 0:156 [C] | M:172 [ARG] | 1:28 [G] | ✔ |
M:171 [ARG] | 0:157 [G] | M:172 [ARG] | 1:29 [C] | ✔ |
M:171 [ARG] | 0:188 [C] | M:172 [ARG] | 1:60 [A] | ✔ |
M:171 [ARG] | 0:189 [A] | M:172 [ARG] | 1:61 [A] | ✔ |
M:171 [ARG] | 0:399 [C] | M:172 [ARG] | 1:324 [G] | ✔ |
M:176 [LYS] | 0:190 [G] | M:177 [LYS] | 1:62 [G] | ✔ |
M:176 [LYS] | 0:191 [A] | M:177 [LYS] | 1:63 [A] | ✔ |
M:176 [LYS] | 0:192 [A] | M:177 [LYS] | 1:64 [A] | ✔ |
M:176 [LYS] | 0:193 [A] | M:177 [LYS] | 1:65 [A] | ✔ |
M:176 [LYS] | 0:194 [A] | M:177 [LYS] | 1:66 [A] | ✔ |
M:97 [ILE] | 0:401 [C] | M:98 [ASN] | 1:326 [A] | ✔ |
M:97 [ILE] | 0:402 [U] | M:98 [ASN] | 1:327 [G] | ✔ |
M:97 [ILE] | 0:403 [C] | M:98 [ASN] | 1:328 [U] | ✔ |
M:187 [LEU] | 0:156 [C] | M:188 [TYR] | 1:28 [G] | ✔ |
M:179 [GLY] | 0:394 [G] | M:180 [LYS] | 1:319 [G] | ✔ |
M:179 [GLY] | 0:398 [U] | M:180 [LYS] | 1:323 [U] | ✔ |
M:179 [GLY] | 0:399 [C] | M:180 [LYS] | 1:324 [G] | ✔ |
M:184 [ARG] | 0:189 [A] | M:185 [ARG] | 1:61 [A] | ✔ |
M:184 [ARG] | 0:190 [G] | M:185 [ARG] | 1:62 [G] | ✔ |
M:184 [ARG] | 0:206 [G] | M:185 [ARG] | 1:77 [U] | ✔ |
M:143 [ASN] | 0:251 [C] | M:144 [ARG] | 1:125 [G] | ✔ |
M:48 [LYS] | 0:379 [G] | M:47 [LYS] | 1:304 [G] | ✔ |
M:48 [LYS] | 0:380 [A] | M:47 [LYS] | 1:305 [A] | ✔ |
M:48 [LYS] | 0:381 [G] | M:47 [LYS] | 1:306 [G] | ✔ |
M:48 [LYS] | 0:431 [G] | M:47 [LYS] | 1:357 [A] | ✔ |
M:158 [ARG] | 0:432 [G] | M:159 [ARG] | 1:358 [G] | ✔ |
M:158 [ARG] | 0:433 [C] | M:159 [ARG] | 1:359 [U] | ✔ |
M:103 [GLU] | 0:156 [C] | M:104 [GLN] | 1:28 [G] | ✔ |
M:103 [GLU] | 0:1470 [A] | M:104 [GLN] | 1:1654 [A] | ✔ |
M:127 [LYS] | 0:403 [C] | M:128 [LYS] | 1:328 [U] | ✔ |
M:92 [THR] | 0:158 [A] | M:93 [LYS] | 1:30 [C] | ✔ |
M:92 [THR] | 0:388 [G] | M:93 [LYS] | 1:313 [U] | ✔ |
M:92 [THR] | 0:389 [G] | M:93 [LYS] | 1:314 [G] | ✔ |
M:92 [THR] | 0:401 [C] | M:93 [LYS] | 1:326 [A] | ✔ |
M:92 [THR] | 0:402 [U] | M:93 [LYS] | 1:327 [G] | ✔ |
M:111 [ASN] | 0:144 [A] | M:112 [ASN] | 1:16 [G] | ✔ |
M:111 [ASN] | 0:145 [A] | M:112 [ASN] | 1:17 [C] | ✔ |
M:111 [ASN] | 0:146 [U] | M:112 [ASN] | 1:18 [A] | ✔ |
M:154 [ASP] | 0:183 [A] | M:155 [VAL] | 1:55 [A] | ✔ |
M:154 [ASP] | 0:184 [G] | M:155 [VAL] | 1:56 [G] | ✔ |
M:154 [ASP] | 0:187 [A] | M:155 [VAL] | 1:59 [A] | ✔ |
M:154 [ASP] | 0:188 [C] | M:155 [VAL] | 1:60 [A] | ✔ |
M:154 [ASP] | 0:434 [U] | M:155 [VAL] | 1:360 [U] | ✔ |
M:153 [ASP] | 0:183 [A] | M:154 [SER] | 1:55 [A] | ✔ |
M:153 [ASP] | 0:184 [G] | M:154 [SER] | 1:56 [G] | ✔ |
M:110 [PRO] | 0:146 [U] | M:111 [GLY] | 1:18 [A] | ✔ |
M:162 [GLY] | 0:155 [C] | M:163 [GLY] | 1:27 [C] | ✔ |
M:162 [GLY] | 0:156 [C] | M:163 [GLY] | 1:28 [G] | ✔ |
M:162 [GLY] | 0:189 [A] | M:163 [GLY] | 1:61 [A] | ✔ |
M:178 [LYS] | 0:194 [A] | M:179 [HIS] | 1:66 [A] | ✔ |
M:178 [LYS] | 0:195 [C] | M:179 [HIS] | 1:67 [C] | ✔ |
M:178 [LYS] | 0:394 [G] | M:179 [HIS] | 1:319 [G] | ✔ |
M:178 [LYS] | 0:398 [U] | M:179 [HIS] | 1:323 [U] | ✔ |
M:178 [LYS] | 0:415 [A] | M:179 [HIS] | 1:340 [A] | ✔ |
M:178 [LYS] | 0:416 [G] | M:179 [HIS] | 1:341 [G] | ✔ |
M:178 [LYS] | 0:417 [G] | M:179 [HIS] | 1:342 [G] | ✔ |
M:168 [ARG] | 0:189 [A] | M:169 [ARG] | 1:61 [A] | ✔ |
M:168 [ARG] | 0:190 [G] | M:169 [ARG] | 1:62 [G] | ✔ |
M:168 [ARG] | 0:432 [G] | M:169 [ARG] | 1:358 [G] | ✔ |
M:186 [SER] | 0:155 [C] | M:187 [SER] | 1:27 [C] | ✔ |
M:186 [SER] | 0:156 [C] | M:187 [SER] | 1:28 [G] | ✔ |
M:186 [SER] | 0:188 [C] | M:187 [SER] | 1:60 [A] | ✔ |
M:173 [LEU] | 0:189 [A] | M:174 [LEU] | 1:61 [A] | ✔ |
M:173 [LEU] | 0:190 [G] | M:174 [LEU] | 1:62 [G] | ✔ |
M:35 [GLY] | 0:1467 [C] | M:34 [HIS] | 1:1651 [G] | ✔ |
M:170 [ASN] | 0:157 [G] | M:171 [HIS] | 1:29 [C] | ✔ |
M:170 [ASN] | 0:400 [C] | M:171 [HIS] | 1:325 [C] | ✔ |
M:170 [ASN] | 0:401 [C] | M:171 [HIS] | 1:326 [A] | ✔ |
M:191 [GLY] | 0:175 [G] | M:192 [TRP] | 1:47 [C] | ✔ |
M:191 [GLY] | 0:176 [U] | M:192 [TRP] | 1:48 [OMU] | ✔ |
M:6 [SER] | 0:378 [A] | M:5 [MET] | 1:303 [C] | ✔ |
M:66 [SER] | 0:1468 [G] | M:65 [ARG] | 1:1652 [U] | ✔ |
M:3 [SER] | 0:243 [A] | M:3 [ALA] | 1:116 [U] | ✔ |
M:74 [LYS] | 0:159 [G] | M:73 [ARG] | 1:31 [G] | ✔ |
M:84 [LYS] | 0:170 [U] | M:85 [LYS] | 1:42 [U] | ✔ |
M:84 [LYS] | 0:171 [C] | M:85 [LYS] | 1:43 [A] | ✔ |
M:84 [LYS] | 0:390 [G] | M:85 [LYS] | 1:315 [U] | ✔ |
M:84 [LYS] | 0:391 [U] | M:85 [LYS] | 1:316 [U] | ✔ |
M:188 [ARG] | 0:154 [C] | M:189 [ARG] | 1:26 [C] | ✔ |
M:188 [ARG] | 0:155 [C] | M:189 [ARG] | 1:27 [C] | ✔ |
M:188 [ARG] | 0:156 [C] | M:189 [ARG] | 1:28 [G] | ✔ |
M:46 [LEU] | 0:263 [U] | M:45 [PRO] | 1:146 [U] | ✔ |
M:46 [LEU] | 0:264 [G] | M:45 [PRO] | 1:147 [G] | ✔ |
M:78 [LYS] | 0:869 [G] | M:79 [ILE] | 1:959 [OMG] | ✔ |
M:78 [LYS] | 0:870 [G] | M:79 [ILE] | 1:960 [A] | ✔ |
M:181 [GLU] | 0:226 [A] | M:182 [SER] | 1:98 [A] | ✔ |
M:181 [GLU] | 0:227 [A] | M:182 [SER] | 1:99 [A] | ✔ |
M:181 [GLU] | 0:393 [G] | M:182 [SER] | 1:318 [G] | ✔ |
M:181 [GLU] | 0:394 [G] | M:182 [SER] | 1:319 [G] | ✔ |
M:185 [PRO] | 0:188 [C] | M:186 [PRO] | 1:60 [A] | ✔ |
M:185 [PRO] | 0:189 [A] | M:186 [PRO] | 1:61 [A] | ✔ |
M:185 [PRO] | 0:206 [G] | M:186 [PRO] | 1:77 [U] | ✔ |
M:185 [PRO] | 0:207 [U] | M:186 [PRO] | 1:78 [C] | ✔ |
M:119 [SER] | 0:381 [G] | M:120 [TRP] | 1:306 [G] | ✔ |
M:90 [ARG] | 0:388 [G] | M:91 [GLY] | 1:313 [U] | ✔ |
M:90 [ARG] | 0:389 [G] | M:91 [GLY] | 1:314 [G] | ✔ |
M:83 [SER] | 0:169 [A] | M:84 [PRO] | 1:41 [A] | ✔ |
M:83 [SER] | 0:170 [U] | M:84 [PRO] | 1:42 [U] | ✔ |
M:68 [ARG] | 0:1469 [C] | M:67 [ARG] | 1:1653 [U] | ✔ |
M:42 [ARG] | 0:262 [A] | M:41 [ARG] | 1:145 [U] | ✔ |
M:42 [ARG] | 0:263 [U] | M:41 [ARG] | 1:146 [U] | ✔ |
M:156 [ALA] | 0:183 [A] | M:157 [LYS] | 1:55 [A] | ✔ |
M:45 [ARG] | 0:380 [A] | M:44 [ARG] | 1:305 [A] | ✔ |
M:45 [ARG] | 0:381 [G] | M:44 [ARG] | 1:306 [G] | ✔ |
M:56 [ALA] | 0:261 [A] | M:55 [THR] | 1:144 [G] | ✔ |
M:56 [ALA] | 0:262 [A] | M:55 [THR] | 1:145 [U] | ✔ |
M:56 [ALA] | 0:264 [G] | M:55 [THR] | 1:147 [G] | ✔ |
M:56 [ALA] | 0:265 [U] | M:55 [THR] | 1:148 [U] | ✔ |
M:183 [THR] | 0:399 [C] | M:184 [LEU] | 1:324 [G] | ✔ |
M:100 [VAL] | 0:1470 [A] | M:101 [VAL] | 1:1654 [A] | ✔ |
M:100 [VAL] | 0:1471 [A] | M:101 [VAL] | 1:1655 [U] | ✔ |
M:107 [ARG] | 0:1471 [A] | M:108 [LYS] | 1:1655 [U] | ✔ |
M:107 [ARG] | 0:1472 [C] | M:108 [LYS] | 1:1656 [A] | ✔ |
M:80 [GLY] | 0:161 [A] | M:81 [TYR] | 1:33 [A] | ✔ |
M:80 [GLY] | 0:770 [C] | M:81 [TYR] | 1:861 [G] | ✔ |
M:15 [PRO] | 0:381 [G] | M:14 [LYS] | 1:306 [G] | ✔ |
M:95 [LYS] | 0:156 [C] | M:96 [LYS] | 1:28 [G] | ✔ |
M:95 [LYS] | 0:157 [G] | M:96 [LYS] | 1:29 [C] | ✔ |
M:95 [LYS] | 0:401 [C] | M:96 [LYS] | 1:326 [A] | ✔ |
M:95 [LYS] | 0:402 [U] | M:96 [LYS] | 1:327 [G] | ✔ |
M:95 [LYS] | 0:1470 [A] | M:96 [LYS] | 1:1654 [A] | ✔ |
M:70 [GLY] | 0:402 [U] | M:69 [GLY] | 1:327 [G] | ✔ |
M:70 [GLY] | 0:403 [C] | M:69 [GLY] | 1:328 [U] | ✔ |
M:172 [GLY] | 0:399 [C] | M:173 [GLY] | 1:324 [G] | ✔ |
M:172 [GLY] | 0:400 [C] | M:173 [GLY] | 1:325 [C] | ✔ |
M:174 [SER] | 0:400 [C] | M:175 [ARG] | 1:325 [C] | ✔ |
M:47 [ASP] | 0:241 [A] | M:46 [GLU] | 1:114 [G] | ✔ |
M:9 [ARG] | 0:379 [G] | M:8 [ASN] | 1:304 [G] | ✔ |
M:9 [ARG] | 0:380 [A] | M:8 [ASN] | 1:305 [A] | ✔ |
M:139 [PRO] | 0:251 [C] | M:140 [LYS] | 1:125 [G] | ✔ |
M:139 [PRO] | 0:252 [C] | M:140 [LYS] | 1:126 [G] | ✔ |
M:55 [LYS] | 0:241 [A] | M:54 [LYS] | 1:114 [G] | ✔ |
M:55 [LYS] | 0:265 [U] | M:54 [LYS] | 1:148 [U] | ✔ |
M:55 [LYS] | 0:266 [G] | M:54 [LYS] | 1:149 [G] | ✔ |
M:177 [GLY] | 0:194 [A] | M:178 [GLY] | 1:66 [A] | ✔ |
M:177 [GLY] | 0:195 [C] | M:178 [GLY] | 1:67 [C] | ✔ |
M:85 [ARG] | 0:160 [A] | M:86 [THR] | 1:32 [A] | ✔ |
M:85 [ARG] | 0:161 [A] | M:86 [THR] | 1:33 [A] | ✔ |
M:13 [LYS] | 0:380 [A] | M:12 [LYS] | 1:305 [A] | ✔ |
M:13 [LYS] | 0:409 [U] | M:12 [LYS] | 1:334 [G] | ✔ |
M:144 [ASP] | 0:266 [G] | M:145 [ASP] | 1:149 [G] | ✔ |
M:146 [ASP] | 0:239 [C] | M:147 [ARG] | 1:112 [U] | ✔ |
M:146 [ASP] | 0:240 [C] | M:147 [ARG] | 1:113 [C] | ✔ |
M:36 [ALA] | 0:1467 [C] | M:35 [THR] | 1:1651 [G] | ✔ |
M:36 [ALA] | 0:1468 [G] | M:35 [THR] | 1:1652 [U] | ✔ |
M:182 [LYS] | 0:226 [A] | M:183 [LYS] | 1:98 [A] | ✔ |
M:182 [LYS] | 0:392 [U] | M:183 [LYS] | 1:317 [U] | ✔ |
M:182 [LYS] | 0:393 [G] | M:183 [LYS] | 1:318 [G] | ✔ |
M:182 [LYS] | 0:394 [G] | M:183 [LYS] | 1:319 [G] | ✔ |
M:58 [GLN] | 0:250 [C] | M:57 [GLN] | 1:124 [C] | ✔ |
M:58 [GLN] | 0:251 [C] | M:57 [GLN] | 1:125 [G] | ✔ |
M:161 [ARG] | 0:155 [C] | M:162 [ARG] | 1:27 [C] | ✔ |
M:161 [ARG] | 0:156 [C] | M:162 [ARG] | 1:28 [G] | ✔ |
M:161 [ARG] | 0:181 [G] | M:162 [ARG] | 1:53 [G] | ✔ |
M:161 [ARG] | 0:182 [G] | M:162 [ARG] | 1:54 [G] | ✔ |
M:161 [ARG] | 0:183 [A] | M:162 [ARG] | 1:55 [A] | ✔ |
M:161 [ARG] | 0:187 [A] | M:162 [ARG] | 1:59 [A] | ✔ |
M:161 [ARG] | 0:188 [C] | M:162 [ARG] | 1:60 [A] | ✔ |
M:169 [ARG] | 0:400 [C] | M:170 [LYS] | 1:325 [C] | ✔ |
M:51 [SER] | 0:240 [C] | M:50 [MET] | 1:113 [C] | ✔ |
M:51 [SER] | 0:241 [A] | M:50 [MET] | 1:114 [G] | ✔ |
M:51 [SER] | 0:379 [G] | M:50 [MET] | 1:304 [G] | ✔ |
M:51 [SER] | 0:431 [G] | M:50 [MET] | 1:357 [A] | ✔ |
M:164 [THR] | 0:432 [G] | M:165 [THR] | 1:358 [G] | ✔ |
M:57 [LYS] | 0:250 [C] | M:56 [LYS] | 1:124 [C] | ✔ |
M:57 [LYS] | 0:265 [U] | M:56 [LYS] | 1:148 [U] | ✔ |
M:57 [LYS] | 0:266 [G] | M:56 [LYS] | 1:149 [G] | ✔ |
M:155 [GLN] | 0:433 [C] | M:156 [HIS] | 1:359 [U] | ✔ |
M:155 [GLN] | 0:434 [U] | M:156 [HIS] | 1:360 [U] | ✔ |
M:69 [LYS] | 0:402 [U] | M:68 [ARG] | 1:327 [G] | ✔ |
M:69 [LYS] | 0:403 [C] | M:68 [ARG] | 1:328 [U] | ✔ |
M:69 [LYS] | 0:404 [G] | M:68 [ARG] | 1:329 [G] | ✔ |
M:12 [TRP] | 0:380 [A] | M:11 [TRP] | 1:305 [A] | ✔ |
M:52 [GLN] | 0:431 [G] | M:51 [LEU] | 1:357 [A] | ✔ |
M:16 [GLY] | 0:381 [G] | M:15 [SER] | 1:306 [G] | ✔ |
M:91 [ILE] | 0:389 [G] | M:92 [MET] | 1:314 [G] | ✔ |
M:157 [ASP] | 0:182 [G] | M:158 [HIS] | 1:54 [G] | ✔ |
M:157 [ASP] | 0:183 [A] | M:158 [HIS] | 1:55 [A] | ✔ |
M:96 [ASP] | 0:401 [C] | M:97 [ASN] | 1:326 [A] | ✔ |
M:96 [ASP] | 0:402 [U] | M:97 [ASN] | 1:327 [G] | ✔ |
M:189 [SER] | 0:155 [C] | M:190 [ALA] | 1:27 [C] | ✔ |
M:189 [SER] | 0:207 [U] | M:190 [ALA] | 1:78 [C] | ✔ |
M:82 [ARG] | 0:161 [A] | M:83 [LYS] | 1:33 [A] | ✔ |
M:82 [ARG] | 0:169 [A] | M:83 [LYS] | 1:41 [A] | ✔ |
M:82 [ARG] | 0:170 [U] | M:83 [LYS] | 1:42 [U] | ✔ |
M:82 [ARG] | 0:171 [C] | M:83 [LYS] | 1:43 [A] | ✔ |
M:82 [ARG] | 0:172 [U] | M:83 [LYS] | 1:44 [U] | ✔ |
M:122 [GLN] | 0:404 [G] | M:123 [MET] | 1:329 [G] | ✔ |
M:72 [ALA] | 0:1470 [A] | M:71 [ARG] | 1:1654 [A] | ✔ |
M:116 [ASN] | 0:431 [G] | M:117 [ASN] | 1:357 [A] | ✔ |
M:116 [ASN] | 0:432 [G] | M:117 [ASN] | 1:358 [G] | ✔ |
M:94 [ARG] | 0:159 [G] | M:95 [ASN] | 1:31 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:94 [ARG] | 0:175 [G] | M:95 [ASN] | 1:47 [C] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:94 [ARG] | 0:391 [U] | M:95 [ASN] | 1:316 [U] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:71 [SER] | 0:1470 [A] | M:70 [GLY] | 1:1654 [A] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:61 [ILE] | 0:136 [C] | M:60 [CYS] | 1:8 [U] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:5 [TYR] | 0:264 [G] | M:4 [PHE] | 1:147 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:180 [SER] | 0:399 [C] | M:181 [ALA] | 1:324 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:104 [ARG] | 0:1468 [G] | M:105 [ARG] | 1:1652 [U] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:81 [ARG] | 0:160 [A] | M:82 [GLY] | 1:32 [A] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:81 [ARG] | 0:770 [C] | M:82 [GLY] | 1:861 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:81 [ARG] | 0:771 [G] | M:82 [GLY] | 1:862 [U] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:93 [ARG] | 0:159 [G] | M:94 [LEU] | 1:31 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:93 [ARG] | 0:1469 [C] | M:94 [LEU] | 1:1653 [U] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:171 [ARG] | 0:400 [C] | M:172 [ARG] | 1:325 [C] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:187 [LEU] | 0:155 [C] | M:188 [TYR] | 1:27 [C] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:187 [LEU] | 0:157 [G] | M:188 [TYR] | 1:29 [C] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:143 [ASN] | 0:250 [C] | M:144 [ARG] | 1:124 [C] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:48 [LYS] | 0:430 [A] | M:47 [LYS] | 1:356 [A] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:103 [GLU] | 0:1471 [A] | M:104 [GLN] | 1:1655 [U] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:127 [LYS] | 0:402 [U] | M:128 [LYS] | 1:327 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:110 [PRO] | 0:145 [A] | M:111 [GLY] | 1:17 [C] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:178 [LYS] | 0:399 [C] | M:179 [HIS] | 1:324 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:168 [ARG] | 0:433 [C] | M:169 [ARG] | 1:359 [U] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:186 [SER] | 0:154 [C] | M:187 [SER] | 1:26 [C] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:3 [SER] | 0:242 [A] | M:3 [ALA] | 1:115 [U] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:74 [LYS] | 0:158 [A] | M:73 [ARG] | 1:30 [C] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:54 [TYR] | 0:264 [G] | M:53 [TYR] | 1:147 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:188 [ARG] | 0:153 [C] | M:189 [ARG] | 1:25 [C] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:181 [GLU] | 0:398 [U] | M:182 [SER] | 1:323 [U] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:181 [GLU] | 0:417 [G] | M:182 [SER] | 1:342 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:68 [ARG] | 0:1470 [A] | M:67 [ARG] | 1:1654 [A] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:42 [ARG] | 0:261 [A] | M:41 [ARG] | 1:144 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:156 [ALA] | 0:182 [G] | M:157 [LYS] | 1:54 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:107 [ARG] | 0:181 [G] | M:108 [LYS] | 1:53 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:80 [GLY] | 0:160 [A] | M:81 [TYR] | 1:32 [A] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:95 [LYS] | 0:158 [A] | M:96 [LYS] | 1:30 [C] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:174 [SER] | 0:193 [A] | M:175 [ARG] | 1:65 [A] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:9 [ARG] | 0:377 [C] | M:8 [ASN] | 1:302 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:9 [ARG] | 0:378 [A] | M:8 [ASN] | 1:303 [C] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:85 [ARG] | 0:174 [A] | M:86 [THR] | 1:46 [A] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:85 [ARG] | 0:175 [G] | M:86 [THR] | 1:47 [C] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:85 [ARG] | 0:390 [G] | M:86 [THR] | 1:315 [U] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:85 [ARG] | 0:391 [U] | M:86 [THR] | 1:316 [U] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:13 [LYS] | 0:381 [G] | M:12 [LYS] | 1:306 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:146 [ASP] | 0:241 [A] | M:147 [ARG] | 1:114 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:58 [GLN] | 0:136 [C] | M:57 [GLN] | 1:8 [U] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:58 [GLN] | 0:137 [U] | M:57 [GLN] | 1:9 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:169 [ARG] | 0:430 [A] | M:170 [LYS] | 1:356 [A] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:169 [ARG] | 0:431 [G] | M:170 [LYS] | 1:357 [A] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:2 [ARG] | 0:377 [C] | M:2 [GLY] | 1:302 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:57 [LYS] | 0:261 [A] | M:56 [LYS] | 1:144 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:192 [GLY] | 0:175 [G] | M:193 [ARG] | 1:47 [C] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:91 [ILE] | 0:159 [G] | M:92 [MET] | 1:31 [G] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:135 [ASP] | 0:136 [C] | M:136 [ASP] | 1:8 [U] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:39 [ARG] | 0:136 [C] | M:38 [ARG] | 1:8 [U] | ❌ 6AZ3_M_1,7 |
M:107 [ARG] | 0:1469 [C] | M:108 [LYS] | 1:1653 [U] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:108 [THR] | 0:1467 [C] | M:109 [ARG] | 1:1651 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:13 [LYS] | 0:407 [A] | M:12 [LYS] | 1:332 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:122 [GLN] | 0:381 [G] | M:123 [MET] | 1:306 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:135 [ASP] | 0:144 [A] | M:136 [ASP] | 1:16 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:15 [PRO] | 0:380 [A] | M:14 [LYS] | 1:305 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:146 [ASP] | 0:266 [G] | M:147 [ARG] | 1:149 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:16 [GLY] | 0:407 [A] | M:15 [SER] | 1:332 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:155 [GLN] | 0:183 [A] | M:156 [HIS] | 1:55 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:156 [ALA] | 0:184 [G] | M:157 [LYS] | 1:56 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:163 [LEU] | 0:432 [G] | M:164 [LEU] | 1:358 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:165 [GLY] | 0:430 [A] | M:166 [SER] | 1:356 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:165 [GLY] | 0:431 [G] | M:166 [SER] | 1:357 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:169 [ARG] | 0:401 [C] | M:170 [LYS] | 1:326 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:170 [ASN] | 0:156 [C] | M:171 [HIS] | 1:28 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:174 [SER] | 0:430 [A] | M:175 [ARG] | 1:356 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:174 [SER] | 0:431 [G] | M:175 [ARG] | 1:357 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:179 [GLY] | 0:416 [G] | M:180 [LYS] | 1:341 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:179 [GLY] | 0:415 [A] | M:180 [LYS] | 1:340 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:182 [LYS] | 0:225 [G] | M:183 [LYS] | 1:97 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:187 [LEU] | 0:399 [C] | M:188 [TYR] | 1:324 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:187 [LEU] | 0:175 [G] | M:188 [TYR] | 1:47 [C] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:187 [LEU] | 0:391 [U] | M:188 [TYR] | 1:316 [U] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:188 [ARG] | 0:176 [U] | M:189 [ARG] | 1:48 [OMU] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:191 [GLY] | 0:174 [A] | M:192 [TRP] | 1:46 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:192 [GLY] | 0:154 [C] | M:193 [ARG] | 1:26 [C] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:192 [GLY] | 0:153 [C] | M:193 [ARG] | 1:25 [C] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:2 [ARG] | 0:243 [A] | M:2 [GLY] | 1:116 [U] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:39 [ARG] | 0:137 [U] | M:38 [ARG] | 1:9 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:5 [TYR] | 0:241 [A] | M:4 [PHE] | 1:114 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:42 [ARG] | 0:136 [C] | M:41 [ARG] | 1:8 [U] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:47 [ASP] | 0:380 [A] | M:46 [GLU] | 1:305 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:50 [ARG] | 0:240 [C] | M:49 [ARG] | 1:113 [C] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:50 [ARG] | 0:263 [U] | M:49 [ARG] | 1:146 [U] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:6 [SER] | 0:242 [A] | M:5 [MET] | 1:115 [U] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:6 [SER] | 0:377 [C] | M:5 [MET] | 1:302 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:6 [SER] | 0:243 [A] | M:5 [MET] | 1:116 [U] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:51 [SER] | 0:380 [A] | M:50 [MET] | 1:305 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:54 [TYR] | 0:265 [U] | M:53 [TYR] | 1:148 [U] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:55 [LYS] | 0:240 [C] | M:54 [LYS] | 1:113 [C] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:66 [SER] | 0:1467 [C] | M:65 [ARG] | 1:1651 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:68 [ARG] | 0:1468 [G] | M:67 [ARG] | 1:1652 [U] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:68 [ARG] | 0:1467 [C] | M:67 [ARG] | 1:1651 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:72 [ALA] | 0:158 [A] | M:71 [ARG] | 1:30 [C] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:72 [ALA] | 0:159 [G] | M:71 [ARG] | 1:31 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:74 [LYS] | 0:160 [A] | M:73 [ARG] | 1:32 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:75 [ARG] | 0:1471 [A] | M:74 [PRO] | 1:1655 [U] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:77 [HIS] | 0:870 [G] | M:76 [HIS] | 1:960 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:80 [GLY] | 0:771 [G] | M:81 [TYR] | 1:862 [U] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:80 [GLY] | 0:869 [G] | M:81 [TYR] | 1:959 [OMG] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:80 [GLY] | 0:870 [G] | M:81 [TYR] | 1:960 [A] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:91 [ILE] | 0:390 [G] | M:92 [MET] | 1:315 [U] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:93 [ARG] | 0:157 [G] | M:94 [LEU] | 1:29 [C] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:94 [ARG] | 0:389 [G] | M:95 [ASN] | 1:314 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:94 [ARG] | 0:399 [C] | M:95 [ASN] | 1:324 [G] | ❌ 3CC2_M_0 |
M:176 [LYS] | 0:204 [A] | M:177 [LYS] | 1:75 [A] | ❌ 6AZ3_1:75 no longer at interface |
M:176 [LYS] | 0:205 [U] | M:177 [LYS] | 1:76 [U] | ❌ 6AZ3_1:76 no longer at interface |
M:184 [ARG] | 0:205 [U] | M:185 [ARG] | 1:76 [U] | ❌ 6AZ3_1:76 no longer at interface |
M:153 [ASP] | 0:185 [G] | M:154 [SER] | 1:57 [G] | ❌ 6AZ3_1:57 no longer at interface |
M:178 [LYS] | 0:397 [A] | M:179 [HIS] | 1:322 [A] | ❌ 6AZ3_1:322 no longer at interface |
M:56 [ALA] | 0:260 [C] | M:55 [THR] | 1:143 [A] | ❌ 6AZ3_1:143 no longer at interface |
M:80 [GLY] | 0:769 [C] | M:81 [TYR] | 1:860 [G] | ❌ 6AZ3_1:860 no longer at interface |
M:58 [GLN] | 0:259 [G] | M:57 [GLN] | 1:142 [G] | ❌ 6AZ3_1:142 no longer at interface |
M:58 [GLN] | 0:260 [C] | M:57 [GLN] | 1:143 [A] | ❌ 6AZ3_1:143 no longer at interface |
M:2 [ARG] | 0:376 [C] | M:2 [GLY] | 1:301 [A] | ❌ 6AZ3_1:301 no longer at interface |
M:57 [LYS] | 0:260 [C] | M:56 [LYS] | 1:143 [A] | ❌ 6AZ3_1:143 no longer at interface |
M:145 [ASP] | 0:288 [A] | M:146 [PRO] | 1:171 [U] | ❌ 6AZ3_M:146, 6AZ3_1:171 no longer at interface |
M:82 [ARG] | 0:173 [C] | M:83 [LYS] | 1:45 [U] | ❌ 6AZ3_1:45 no longer at interface |
M:108 [THR] | 0:1466 [C] | M:109 [ARG] | 1:1650 [C] | ❌ 3CC2_0:1466 no longer at interface |
M:122 [GLN] | 0:406 [G] | M:123 [MET] | 1:331 [C] | ❌ 3CC2_0:406 no longer at interface |
M:146 [ASP] | 0:267 [G] | M:147 [ARG] | 1:150 [G] | ❌ 3CC2_0:267 no longer at interface |
M:156 [ALA] | 0:147 [G] | M:157 [LYS] | 1:19 [G] | ❌ 3CC2_0:147 no longer at interface |
M:169 [ARG] | 0:384 [G] | M:170 [LYS] | 1:309 [G] | ❌ 3CC2_0:384 no longer at interface |
M:169 [ARG] | 0:383 [A] | M:170 [LYS] | 1:308 [A] | ❌ 3CC2_0:383 no longer at interface |
M:174 [SER] | 0:429 [A] | M:175 [ARG] | 1:355 [A] | ❌ 3CC2_0:429 no longer at interface |
M:175 [GLY] | 0:384 [G] | M:176 [HIS] | 1:309 [G] | ❌ 3CC2_M:175, 3CC2_0:384 no longer at interface |
M:188 [ARG] | 0:177 [A] | M:189 [ARG] | 1:49 [C] | ❌ 3CC2_0:177 no longer at interface |
M:35 [GLY] | 0:1466 [C] | M:34 [HIS] | 1:1650 [C] | ❌ 3CC2_0:1466 no longer at interface |
M:57 [LYS] | 0:249 [G] | M:56 [LYS] | 1:123 [U] | ❌ 3CC2_0:249 no longer at interface |
M:82 [ARG] | 0:164 [G] | M:83 [LYS] | 1:36 [U] | ❌ 3CC2_0:164 no longer at interface |
M:82 [ARG] | 0:162 [C] | M:83 [LYS] | 1:34 [C] | ❌ 3CC2_0:162 no longer at interface |
M:82 [ARG] | 0:163 [U] | M:83 [LYS] | 1:35 [U] | ❌ 3CC2_0:163 no longer at interface |
M:79 [ALA] | 0:770 [C] | M:80 [THR] | 1:861 [G] | ❌ 6AZ3_M:80 no longer at interface |
M:79 [ALA] | 0:771 [G] | M:80 [THR] | 1:862 [U] | ❌ 6AZ3_M:80 no longer at interface |
M:37 [VAL] | 0:1467 [C] | M:36 [VAL] | 1:1651 [G] | ❌ 6AZ3_M:36 no longer at interface |
M:73 [ARG] | 0:1469 [C] | M:72 [LYS] | 1:1653 [U] | ❌ 6AZ3_M:72 no longer at interface |
M:73 [ARG] | 0:1470 [A] | M:72 [LYS] | 1:1654 [A] | ❌ 6AZ3_M:72 no longer at interface |
M:115 [LEU] | 0:432 [G] | M:116 [LEU] | 1:358 [G] | ❌ 6AZ3_M:116 no longer at interface |
M:138 [HIS] | 0:136 [C] | M:139 [CYS] | 1:8 [U] | ❌ 6AZ3_M:139 no longer at interface |
M:138 [HIS] | 0:251 [C] | M:139 [CYS] | 1:125 [G] | ❌ 6AZ3_M:139 no longer at interface |
M:14 [ASN] | 0:381 [G] | M:13 [LYS] | 1:306 [G] | ❌ 6AZ3_M:13 no longer at interface |
M:14 [ASN] | 0:407 [A] | M:13 [LYS] | 1:332 [A] | ❌ 6AZ3_M:13 no longer at interface |
M:118 [TYR] | 0:381 [G] | M:119 [TYR] | 1:306 [G] | ❌ 6AZ3_M:119 no longer at interface |
M:59 [GLY] | 0:136 [C] | M:58 [GLY] | 1:8 [U] | ❌ 6AZ3_M:58 no longer at interface |
M:99 [ARG] | 0:156 [C] | M:100 [ALA] | 1:28 [G] | ❌ 6AZ3_M:100 no longer at interface |
M:99 [ARG] | 0:157 [G] | M:100 [ALA] | 1:29 [C] | ❌ 6AZ3_M:100 no longer at interface |
M:145 [ASP] | 0:239 [C] | M:146 [PRO] | 1:112 [U] | ❌ 6AZ3_M:146 no longer at interface |
M:126 [GLN] | 0:1468 [G] | M:127 [PHE] | 1:1652 [U] | ❌ 3CC2_M:126 no longer at interface |
M:175 [GLY] | 0:399 [C] | M:176 [HIS] | 1:324 [G] | ❌ 3CC2_M:175 no longer at interface |
M:175 [GLY] | 0:400 [C] | M:176 [HIS] | 1:325 [C] | ❌ 3CC2_M:175 no longer at interface |
M:34 [GLU] | 0:1467 [C] | M:33 [GLN] | 1:1651 [G] | ❌ 3CC2_M:34 no longer at interface |
M:40 [ILE] | 0:137 [U] | M:39 [LEU] | 1:9 [G] | ❌ 3CC2_M:40 no longer at interface |
M:41 [GLU] | 0:136 [C] | M:40 [ARG] | 1:8 [U] | ❌ 3CC2_M:41 no longer at interface |
M:41 [GLU] | 0:261 [A] | M:40 [ARG] | 1:144 [G] | ❌ 3CC2_M:41 no longer at interface |
M:10 [ASP] | 0:409 [U] | M:9 [GLU] | 1:334 [G] | ❌ 3CC2_M:10 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal proteins S24e, L23 and L15e | 0.72 | 1.84 | 0.34 | 0.92 | 0.7 | 0.84 | 0.71 | 0.72 | 0.64 | 0.27 | 0.31 |
Other pairs involving 3CC2_M_0 or 6AZ3_M_1,7
Total number of entries: 10