RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group107 > 3HJW_A_D,E vs 3LWR_A_D,E

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

3HJW_A
3HJW_D,E
3LWR_A
3LWR_D,E
Conserved?
A:82 [GLY] E:67 [G] A:82 [GLY] E:67 [G] ✔
A:66 [VAL] D:41 [C] A:66 [VAL] D:41 [C] ✔
A:80 [HIS] D:41 [C] A:80 [HIS] D:41 [C] ✔
A:80 [HIS] D:42 [G] A:80 [HIS] D:42 [G] ✔
A:80 [HIS] E:67 [G] A:80 [HIS] E:67 [G] ✔
A:81 [GLY] E:67 [G] A:81 [GLY] E:67 [G] ✔
A:107 [LEU] D:43 [C] A:107 [LEU] D:43 [C] ✔
A:107 [LEU] E:67 [G] A:107 [LEU] E:67 [G] ✔
A:274 [VAL] D:57 [A] A:274 [VAL] D:57 [A] ✔
A:323 [VAL] D:3 [G] A:323 [VAL] D:3 [G] ✔
A:323 [VAL] D:4 [C] A:323 [VAL] D:4 [C] ✔
A:270 [ALA] D:3 [G] A:270 [ALA] D:3 [G] ✔
A:270 [ALA] D:55 [A] A:270 [ALA] D:55 [A] ✔
A:270 [ALA] D:57 [A] A:270 [ALA] D:57 [A] ✔
A:59 [GLY] D:17 [G] A:59 [GLY] D:17 [G] ✔
A:59 [GLY] D:18 [C] A:59 [GLY] D:18 [C] ✔
A:83 [THR] E:67 [G] A:83 [THR] E:67 [G] ✔
A:83 [THR] E:69 [G] A:83 [THR] E:69 [G] ✔
A:330 [ARG] D:3 [G] A:330 [ARG] D:3 [G] ✔
A:330 [ARG] D:4 [C] A:330 [ARG] D:4 [C] ✔
A:330 [ARG] D:5 [C] A:330 [ARG] D:5 [C] ✔
A:330 [ARG] D:51 [G] A:330 [ARG] D:51 [G] ✔
A:330 [ARG] D:52 [C] A:330 [ARG] D:52 [C] ✔
A:330 [ARG] D:53 [C] A:330 [ARG] D:53 [C] ✔
A:324 [GLU] D:4 [C] A:324 [GLU] D:4 [C] ✔
A:324 [GLU] D:5 [C] A:324 [GLU] D:5 [C] ✔
A:76 [GLU] D:42 [G] A:76 [GLU] D:42 [G] ✔
A:60 [PRO] D:18 [C] A:60 [PRO] D:18 [C] ✔
A:276 [GLY] D:57 [A] A:276 [GLY] D:57 [A] ✔
A:101 [ARG] D:5 [C] A:101 [ARG] D:5 [C] ✔
A:101 [ARG] D:6 [A] A:101 [ARG] D:6 [A] ✔
A:101 [ARG] D:43 [C] A:101 [ARG] D:43 [C] ✔
A:101 [ARG] D:44 [U] A:101 [ARG] D:44 [U] ✔
A:64 [GLU] D:17 [G] A:64 [GLU] D:17 [G] ✔
A:64 [GLU] D:18 [C] A:64 [GLU] D:18 [C] ✔
A:64 [GLU] D:39 [U] A:64 [GLU] D:39 [U] ✔
A:64 [GLU] D:40 [U] A:64 [GLU] D:40 [U] ✔
A:265 [ALA] D:55 [A] A:265 [ALA] D:55 [A] ✔
A:265 [ALA] D:57 [A] A:265 [ALA] D:57 [A] ✔
A:180 [GLY] E:67 [G] A:180 [GLY] E:67 [G] ✔
A:275 [PRO] D:56 [C] A:275 [PRO] D:56 [C] ✔
A:275 [PRO] D:57 [A] A:275 [PRO] D:57 [A] ✔
A:275 [PRO] D:58 [A] A:275 [PRO] D:58 [A] ✔
A:319 [ILE] D:56 [C] A:319 [ILE] D:56 [C] ✔
A:262 [ALA] D:57 [A] A:262 [ALA] D:57 [A] ✔
A:261 [SER] D:57 [A] A:261 [SER] D:57 [A] ✔
A:261 [SER] D:58 [A] A:261 [SER] D:58 [A] ✔
A:154 [ARG] E:66 [C] A:154 [ARG] E:66 [C] ✔
A:154 [ARG] E:67 [G] A:154 [ARG] E:67 [G] ✔
A:336 [LEU] D:58 [A] A:336 [LEU] D:58 [A] ✔
A:317 [LYS] D:56 [C] A:317 [LYS] D:56 [C] ✔
A:63 [HIS] D:40 [U] A:63 [HIS] D:40 [U] ✔
A:63 [HIS] D:41 [C] A:63 [HIS] D:41 [C] ✔
A:63 [HIS] E:67 [G] A:63 [HIS] E:67 [G] ✔
A:63 [HIS] E:69 [G] A:63 [HIS] E:69 [G] ✔
A:63 [HIS] E:70 [C] A:63 [HIS] E:70 [C] ✔
A:269 [GLY] D:3 [G] A:269 [GLY] D:3 [G] ✔
A:269 [GLY] D:4 [C] A:269 [GLY] D:4 [C] ✔
A:269 [GLY] D:55 [A] A:269 [GLY] D:55 [A] ✔
A:271 [ASP] D:3 [G] A:271 [ASP] D:3 [G] ✔
A:271 [ASP] D:57 [A] A:271 [ASP] D:57 [A] ✔
A:67 [ALA] D:40 [U] A:67 [ALA] D:40 [U] ✔
A:67 [ALA] D:41 [C] A:67 [ALA] D:41 [C] ✔
A:100 [THR] D:42 [G] A:100 [THR] D:42 [G] ✔
A:100 [THR] D:43 [C] A:100 [THR] D:43 [C] ✔
A:104 [GLN] D:43 [C] A:104 [GLN] D:43 [C] ✔
A:104 [GLN] D:44 [U] A:104 [GLN] D:44 [U] ✔
A:86 [PRO] D:17 [G] A:86 [PRO] D:17 [G] ✔
A:86 [PRO] E:69 [G] A:86 [PRO] E:69 [G] ✔
A:326 [VAL] D:4 [C] A:326 [VAL] D:4 [C] ✔
A:326 [VAL] D:5 [C] A:326 [VAL] D:5 [C] ✔
A:268 [HIS] D:3 [G] A:268 [HIS] D:3 [G] ✔
A:268 [HIS] D:4 [C] A:268 [HIS] D:4 [C] ✔
A:268 [HIS] D:52 [C] A:268 [HIS] D:52 [C] ✔
A:268 [HIS] D:53 [C] A:268 [HIS] D:53 [C] ✔
A:268 [HIS] D:55 [A] A:268 [HIS] D:55 [A] ✔
A:325 [LYS] D:4 [C] A:325 [LYS] D:4 [C] ✔
A:325 [LYS] D:5 [C] A:325 [LYS] D:5 [C] ✔
A:325 [LYS] D:44 [U] A:325 [LYS] D:44 [U] ✔
A:325 [LYS] D:45 [C] A:325 [LYS] D:45 [C] ✔
A:273 [ALA] D:56 [C] A:273 [ALA] D:56 [C] ✔
A:273 [ALA] D:57 [A] A:273 [ALA] D:57 [A] ✔
A:266 [VAL] D:57 [A] A:266 [VAL] D:57 [A] ✔
A:267 [THR] D:4 [C] A:267 [THR] D:4 [C] ✔
A:79 [GLY] D:41 [C] A:79 [GLY] D:41 [C] ✔
A:79 [GLY] D:42 [G] A:79 [GLY] D:42 [G] ✔
A:77 [LYS] D:42 [G] A:77 [LYS] D:42 [G] ✔
A:77 [LYS] D:43 [C] A:77 [LYS] D:43 [C] ✔
A:335 [LYS] D:53 [C] A:335 [LYS] D:53 [C] ✔
A:103 [VAL] D:42 [G] A:103 [VAL] D:42 [G] ✔
A:103 [VAL] D:43 [C] A:103 [VAL] D:43 [C] ✔
A:70 [LYS] D:41 [C] A:70 [LYS] D:41 [C] ✔
A:70 [LYS] D:42 [G] A:70 [LYS] D:42 [G] ✔
A:61 [THR] D:17 [G] A:61 [THR] D:17 [G] ✔
A:61 [THR] D:40 [U] A:61 [THR] D:40 [U] ✔
A:61 [THR] E:69 [G] A:61 [THR] E:69 [G] ✔
A:259 [LYS] D:57 [A] A:259 [LYS] D:57 [A] ✔
A:259 [LYS] D:58 [A] A:259 [LYS] D:58 [A] ✔
A:85 [ASP] E:69 [G] A:85 [ASP] E:69 [G] ✔
A:337 [TRP] D:53 [C] A:337 [TRP] D:53 [C] ✔
A:337 [TRP] D:54 [C] A:337 [TRP] D:54 [C] ✔
A:337 [TRP] D:55 [A] A:337 [TRP] D:55 [A] ✔
A:337 [TRP] D:58 [A] A:337 [TRP] D:58 [A] ✔
A:272 [LEU] D:57 [A] A:272 [LEU] D:57 [A] ✔
A:78 [ALA] D:41 [C] A:78 [ALA] D:41 [C] ✔
A:78 [ALA] D:42 [G] A:78 [ALA] D:42 [G] ✔
A:318 [GLY] D:56 [C] A:318 [GLY] D:56 [C] ✔
A:107 [LEU] D:42 [G] A:107 [LEU] D:42 [G] ❌ 3LWR_A_D,E
A:107 [LEU] E:66 [C] A:107 [LEU] E:66 [C] ❌ 3LWR_A_D,E
A:83 [THR] E:70 [C] A:83 [THR] E:70 [C] ❌ 3LWR_A_D,E
A:182 [TYR] E:69 [G] A:182 [TYR] E:69 [G] ❌ 3LWR_A_D,E
A:335 [LYS] D:52 [C] A:335 [LYS] D:52 [C] ❌ 3LWR_A_D,E
A:337 [TRP] D:57 [A] A:337 [TRP] D:57 [A] ❌ 3LWR_A_D,E
A:182 [TYR] E:67 [G] A:182 [TYR] E:67 [G] ❌ 3HJW_A_D,E
A:324 [GLU] D:45 [C] A:324 [GLU] D:45 [C] ❌ 3HJW_A_D,E
A:77 [LYS] D:6 [A] A:77 [LYS] D:6 [A] ❌ 3HJW_A_D,E
A:64 [GLU] D:38 [G] A:64 [GLU] D:38 [G] ❌ 3HJW_D:38 no longer at interface
A:77 [LYS] D:7 [C] A:77 [LYS] D:7 [C] ❌ 3HJW_D:7 no longer at interface
A:205 [ARG] E:67 [G] A:205 [ARG] E:67 [G] ❌ 3LWR_A:205 no longer at interface
A:179 [ALA] E:67 [G] A:179 [ALA] E:67 [G] ❌ 3LWR_A:179 no longer at interface
A:84 [LEU] E:69 [G] A:84 [LEU] E:69 [G] ❌ 3LWR_A:84 no longer at interface
A:111 [LYS] E:67 [G] A:111 [LYS] E:67 [G] ❌ 3LWR_A:111 no longer at interface
A:25 [ASP] D:58 [A] A:25 [ASP] D:58 [A] ❌ 3LWR_A:25 no longer at interface
A:316 [THR] D:56 [C] A:316 [THR] D:56 [C] ❌ 3LWR_A:316 no longer at interface
A:156 [ARG] E:66 [C] A:156 [ARG] E:66 [C] ❌ 3LWR_A:156 no longer at interface
A:156 [ARG] E:67 [G] A:156 [ARG] E:67 [G] ❌ 3LWR_A:156 no longer at interface
A:322 [ASP] D:4 [C] A:322 [ASP] D:4 [C] ❌ 3HJW_A:322 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
PUA domain & Pseudouridine synthase Pab160 RNA 0.99 0.47 0.93 0.99 0.92 0.98 0.93 0.97 0.95 0.85 0.55


Other pairs involving 3HJW_A_D,E or 3LWR_A_D,E

Total number of entries: 7

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
3HAX_A_E,F 3LWR_A_D,E 0.92 0.99 0.43 0.44 PUA domain & Pseudouridine synthase compare
3HAX_A_E,F 3HJW_A_D,E 0.94 0.99 0.57 0.42 PUA domain & Pseudouridine synthase compare
2AB4_A_B 3HJW_A_D,E 0.81 0.78 1.4 0.15 PUA domain & Pseudouridine synthase compare
2HVY_A_E 3LWR_A_D,E 0.78 0.94 0.97 0.5 PUA domain & Pseudouridine synthase compare
2HVY_A_E 3HJW_A_D,E 0.77 0.93 1.3 0.5 PUA domain & Pseudouridine synthase compare
1K8W_A_B 3HJW_A_D,E 0.82 0.76 1.31 0.15 PUA domain & Pseudouridine synthase compare
3HJW_A_D,E 3LWR_A_D,E 0.97 0.99 0.47 0.93 PUA domain & Pseudouridine synthase Pab160 RNA compare