RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group109 > 1ZBI_A_C vs 4H8K_A_C

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

1ZBI_A
1ZBI_C
4H8K_A
4H8K_C
Conserved?
A:77 [ASN] C:9 [A] A:15 [ASN] C:5 [A]
A:77 [ASN] C:10 [U] A:15 [ASN] C:6 [C]
A:77 [ASN] C:11 [U] A:15 [ASN] C:7 [C]
A:192 [ASP] C:10 [U] A:128 [ASP] C:6 [C]
A:71 [ASP] C:10 [U] A:9 [ASP] C:6 [C]
A:183 [THR] C:9 [A] A:121 [ARG] C:5 [A]
A:73 [GLY] C:10 [U] A:11 [GLY] C:6 [C]
A:73 [GLY] C:11 [U] A:11 [GLY] C:7 [C]
A:134 [GLN] C:7 [U] A:79 [GLU] C:3 [A]
A:134 [GLN] C:8 [G] A:79 [GLU] C:4 [C]
A:135 [THR] C:8 [G] A:80 [LEU] C:4 [C]
A:133 [SER] C:8 [G] A:78 [SER] C:4 [C]
A:133 [SER] C:9 [A] A:78 [SER] C:5 [A]
A:181 [TRP] C:9 [A] A:119 [ILE] C:5 [A]
A:105 [ASN] C:9 [A] A:45 [ASN] C:5 [A]
A:105 [ASN] C:10 [U] A:45 [ASN] C:6 [C]
A:132 [ASN] C:8 [G] A:77 [ASN] C:4 [C]
A:132 [ASN] C:9 [A] A:77 [ASN] C:5 [A]
A:132 [ASN] C:10 [U] A:77 [ASN] C:6 [C]
A:180 [LYS] C:8 [G] A:118 [HIS] C:4 [C]
A:180 [LYS] C:9 [A] A:118 [HIS] C:5 [A]
A:75 [GLN] C:11 [U] A:13 [ARG] C:7 [C]
A:75 [GLN] C:12 [C] A:13 [ARG] C:8 [U]
A:74 [SER] C:10 [U] A:12 [ALA] C:6 [C]
A:74 [SER] C:11 [U] A:12 [ALA] C:7 [C]
A:106 [ASN] C:9 [A] A:46 [ASN] C:5 [A]
A:72 [VAL] C:10 [U] A:10 [GLY] C:6 [C]
A:72 [VAL] C:11 [U] A:10 [GLY] C:7 [C]
A:76 [GLY] C:11 [U] A:14 [GLY] C:7 [C]
A:76 [GLY] C:12 [C] A:14 [GLY] C:8 [U]
A:109 [GLU] C:9 [A] A:49 [GLU] C:5 [A]
A:109 [GLU] C:10 [U] A:49 [GLU] C:6 [C]
A:71 [ASP] C:9 [A] A:9 [ASP] C:5 [A] ❌ 4H8K_A_C
A:105 [ASN] C:8 [G] A:45 [ASN] C:4 [C] ❌ 4H8K_A_C
A:74 [SER] C:12 [C] A:12 [ALA] C:8 [U] ❌ 4H8K_A_C
A:106 [ASN] C:8 [G] A:46 [ASN] C:4 [C] ❌ 4H8K_A_C
A:76 [GLY] C:10 [U] A:14 [GLY] C:6 [C] ❌ 4H8K_A_C
A:183 [THR] C:10 [U] A:121 [ARG] C:6 [C] ❌ 1ZBI_A_C
A:75 [GLN] C:10 [U] A:13 [ARG] C:6 [C] ❌ 1ZBI_A_C
A:193 [TYR] C:11 [U] A:129 [GLU] C:7 [C] ❌ 4H8K_A:129 no longer at interface
A:188 [GLU] C:10 [U] A:123 [LYS] C:6 [C] ❌ 4H8K_A:123 no longer at interface
A:196 [LYS] C:12 [C] A:136 [ASP] C:8 [U] ❌ 4H8K_A:136 no longer at interface
A:182 [GLN] C:9 [A] A:120 [PRO] C:5 [A] ❌ 1ZBI_A:182 no longer at interface
A:194 [GLY] C:11 [U] A:132 [ASN] C:7 [C] ❌ 1ZBI_A:194 no longer at interface
A:138 [LYS] C:7 [U] A:83 [ARG] C:3 [A] ❌ 1ZBI_A:138 no longer at interface
A:143 [LYS] C:7 [U] A:89 [TYR] C:3 [A] ❌ 1ZBI_A:143 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
Common RFAM label(s)
Interface TM-score
Interface RMSD
Percentage identity
Protein TM-score
RNA TM-score
Protein coverage
RNA coverage
Percentage conservation
Apolar conservation
H-bond conservation
Percentage switching out
Ribonuclease H-like 0.63 1.41 0.17 0.63 0.32 0.82 1.0 0.90 0.88 0.44 0.50


Other pairs involving 1ZBI_A_C or 4H8K_A_C

Total number of entries: 11