RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group115 > 1JJ2_O_0 vs 7O7Y_BR_B5

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

1JJ2_O
1JJ2_0
7O7Y_BR
7O7Y_B5
Conserved?
O:69 [ARG] 0:1706 [G] BR:70 [ARG] B5:2653 [U] ✔
O:69 [ARG] 0:1707 [G] BR:70 [ARG] B5:2654 [G] ✔
O:41 [ARG] 0:1499 [U] BR:42 [ARG] B5:2367 [U] ✔
O:41 [ARG] 0:1500 [U] BR:42 [ARG] B5:2368 [U] ✔
O:123 [TYR] 0:1595 [G] BR:124 [TYR] B5:2508 [U] ✔
O:123 [TYR] 0:1596 [U] BR:124 [TYR] B5:2509 [U] ✔
O:35 [ILE] 0:1501 [A] BR:36 [ASN] B5:2369 [C] ✔
O:133 [SER] 0:1793 [C] BR:134 [ASN] B5:2739 [G] ✔
O:133 [SER] 0:1794 [G] BR:134 [ASN] B5:2740 [G] ✔
O:3 [LEU] 0:1396 [C] BR:4 [LEU] B5:2228 [U] ✔
O:3 [LEU] 0:1397 [C] BR:4 [LEU] B5:2229 [U] ✔
O:87 [ARG] 0:1707 [G] BR:88 [ARG] B5:2654 [G] ✔
O:87 [ARG] 0:1708 [C] BR:88 [ARG] B5:2655 [A] ✔
O:87 [ARG] 0:1800 [G] BR:88 [ARG] B5:3338 [U] ✔
O:87 [ARG] 0:1801 [A] BR:88 [ARG] B5:3339 [U] ✔
O:23 [PHE] 0:1397 [C] BR:24 [LEU] B5:2229 [U] ✔
O:23 [PHE] 0:1398 [G] BR:24 [LEU] B5:2230 [G] ✔
O:102 [ARG] 0:1596 [U] BR:103 [ARG] B5:2509 [U] ✔
O:102 [ARG] 0:1597 [A] BR:103 [ARG] B5:2510 [C] ✔
O:102 [ARG] 0:1598 [A] BR:103 [ARG] B5:2511 [G] ✔
O:71 [LYS] 0:1789 [G] BR:72 [LYS] B5:2735 [C] ✔
O:38 [GLU] 0:1500 [U] BR:39 [GLN] B5:2368 [U] ✔
O:38 [GLU] 0:1501 [A] BR:39 [GLN] B5:2369 [C] ✔
O:78 [GLY] 0:1760 [G] BR:79 [GLY] B5:2706 [G] ✔
O:78 [GLY] 0:1784 [U] BR:79 [GLY] B5:2730 [U] ✔
O:78 [GLY] 0:1785 [G] BR:79 [GLY] B5:2731 [G] ✔
O:78 [GLY] 0:1813 [U] BR:79 [GLY] B5:3351 [G] ✔
O:78 [GLY] 0:1814 [G] BR:79 [GLY] B5:3352 [G] ✔
O:1 [THR] 0:1387 [G] BR:2 [SER] B5:2219 [A] ✔
O:1 [THR] 0:1388 [U] BR:2 [SER] B5:2220 [C] ✔
O:1 [THR] 0:1395 [C] BR:2 [SER] B5:2227 [U] ✔
O:1 [THR] 0:1396 [C] BR:2 [SER] B5:2228 [U] ✔
O:28 [GLN] 0:1387 [G] BR:29 [THR] B5:2219 [A] ✔
O:28 [GLN] 0:1397 [C] BR:29 [THR] B5:2229 [U] ✔
O:63 [ARG] 0:1549 [C] BR:64 [ARG] B5:2459 [C] ✔
O:63 [ARG] 0:1550 [A] BR:64 [ARG] B5:2460 [G] ✔
O:63 [ARG] 0:1565 [C] BR:64 [ARG] B5:2476 [U] ✔
O:21 [VAL] 0:1398 [G] BR:22 [VAL] B5:2230 [G] ✔
O:22 [TRP] 0:1398 [G] BR:23 [TRP] B5:2230 [G] ✔
O:22 [TRP] 0:1399 [A] BR:23 [TRP] B5:2231 [A] ✔
O:94 [TRP] 0:814 [G] BR:95 [TRP] B5:1526 [G] ✔
O:94 [TRP] 0:815 [U] BR:95 [TRP] B5:1527 [U] ✔
O:94 [TRP] 0:816 [G] BR:95 [TRP] B5:1528 [G] ✔
O:94 [TRP] 0:1597 [A] BR:95 [TRP] B5:2510 [C] ✔
O:94 [TRP] 0:1598 [A] BR:95 [TRP] B5:2511 [G] ✔
O:36 [THR] 0:1501 [A] BR:37 [SER] B5:2369 [C] ✔
O:82 [GLY] 0:1707 [G] BR:83 [GLY] B5:2654 [G] ✔
O:82 [GLY] 0:1708 [C] BR:83 [GLY] B5:2655 [A] ✔
O:82 [GLY] 0:1760 [G] BR:83 [GLY] B5:2706 [G] ✔
O:82 [GLY] 0:1761 [U] BR:83 [GLY] B5:2707 [A] ✔
O:129 [GLY] 0:813 [C] BR:130 [ASN] B5:1525 [G] ✔
O:129 [GLY] 0:814 [G] BR:130 [ASN] B5:1526 [G] ✔
O:73 [HIS] 0:1788 [U] BR:74 [ARG] B5:2734 [U] ✔
O:73 [HIS] 0:1789 [G] BR:74 [ARG] B5:2735 [C] ✔
O:130 [GLU] 0:801 [U] BR:131 [VAL] B5:1513 [A] ✔
O:85 [GLY] 0:792 [G] BR:86 [ASN] B5:1504 [G] ✔
O:85 [GLY] 0:793 [A] BR:86 [ASN] B5:1505 [G] ✔
O:98 [ILE] 0:1597 [A] BR:99 [MET] B5:2510 [C] ✔
O:98 [ILE] 0:1598 [A] BR:99 [MET] B5:2511 [G] ✔
O:127 [GLY] 0:800 [G] BR:128 [LYS] B5:1512 [C] ✔
O:127 [GLY] 0:1598 [A] BR:128 [LYS] B5:2511 [G] ✔
O:24 [ASN] 0:1397 [C] BR:25 [ASP] B5:2229 [U] ✔
O:19 [ASN] 0:1718 [G] BR:20 [LYS] B5:2665 [G] ✔
O:19 [ASN] 0:1719 [G] BR:20 [LYS] B5:2666 [G] ✔
O:59 [ARG] 0:1548 [U] BR:60 [ARG] B5:2458 [C] ✔
O:59 [ARG] 0:1549 [C] BR:60 [ARG] B5:2459 [C] ✔
O:59 [ARG] 0:1565 [C] BR:60 [ARG] B5:2476 [U] ✔
O:59 [ARG] 0:1566 [C] BR:60 [ARG] B5:2477 [C] ✔
O:59 [ARG] 0:1704 [G] BR:60 [ARG] B5:2651 [G] ✔
O:59 [ARG] 0:1705 [C] BR:60 [ARG] B5:2652 [G] ✔
O:88 [GLN] 0:1800 [G] BR:89 [MET] B5:3338 [U] ✔
O:54 [LYS] 0:1566 [C] BR:55 [VAL] B5:2477 [C] ✔
O:54 [LYS] 0:1567 [A] BR:55 [VAL] B5:2478 [U] ✔
O:54 [LYS] 0:1716 [A] BR:55 [VAL] B5:2663 [C] ✔
O:54 [LYS] 0:1717 [A] BR:55 [VAL] B5:2664 [U] ✔
O:79 [SER] 0:1707 [G] BR:80 [LYS] B5:2654 [G] ✔
O:79 [SER] 0:1760 [G] BR:80 [LYS] B5:2706 [G] ✔
O:79 [SER] 0:1784 [U] BR:80 [LYS] B5:2730 [U] ✔
O:79 [SER] 0:1785 [G] BR:80 [LYS] B5:2731 [G] ✔
O:79 [SER] 0:1786 [C] BR:80 [LYS] B5:2732 [G] ✔
O:20 [ARG] 0:1717 [A] BR:21 [LYS] B5:2664 [U] ✔
O:20 [ARG] 0:1718 [G] BR:21 [LYS] B5:2665 [G] ✔
O:61 [ARG] 0:2736 [U] BR:62 [ARG] B5:4391 [C] ✔
O:61 [ARG] 0:2737 [C] BR:62 [ARG] B5:4392 [U] ✔
O:61 [ARG] 0:2738 [G] BR:62 [ARG] B5:4393 [G] ✔
O:61 [ARG] 0:2739 [A] BR:62 [ARG] B5:4394 [A] ✔
O:17 [GLY] 0:1718 [G] BR:18 [GLY] B5:2665 [G] ✔
O:17 [GLY] 0:1719 [G] BR:18 [GLY] B5:2666 [G] ✔
O:16 [VAL] 0:1718 [G] BR:17 [CYS] B5:2665 [G] ✔
O:134 [VAL] 0:1793 [C] BR:135 [LYS] B5:2739 [G] ✔
O:134 [VAL] 0:1794 [G] BR:135 [LYS] B5:2740 [G] ✔
O:134 [VAL] 0:1795 [G] BR:135 [LYS] B5:2741 [G] ✔
O:56 [GLY] 0:1566 [C] BR:57 [VAL] B5:2477 [C] ✔
O:56 [GLY] 0:1716 [A] BR:57 [VAL] B5:2663 [C] ✔
O:56 [GLY] 0:2737 [C] BR:57 [VAL] B5:4392 [U] ✔
O:125 [LYS] 0:801 [U] BR:126 [LYS] B5:1513 [A] ✔
O:125 [LYS] 0:802 [G] BR:126 [LYS] B5:1514 [G] ✔
O:25 [PRO] 0:1397 [C] BR:26 [PRO] B5:2229 [U] ✔
O:25 [PRO] 0:1398 [G] BR:26 [PRO] B5:2230 [G] ✔
O:53 [ASP] 0:1556 [G] BR:54 [PRO] B5:2466 [A] ✔
O:81 [LYS] 0:1707 [G] BR:82 [LYS] B5:2654 [G] ✔
O:81 [LYS] 0:1708 [C] BR:82 [LYS] B5:2655 [A] ✔
O:81 [LYS] 0:1760 [G] BR:82 [LYS] B5:2706 [G] ✔
O:81 [LYS] 0:1761 [U] BR:82 [LYS] B5:2707 [A] ✔
O:81 [LYS] 0:1813 [U] BR:82 [LYS] B5:3351 [G] ✔
O:81 [LYS] 0:1817 [U] BR:82 [LYS] B5:3355 [C] ✔
O:95 [GLU] 0:1540 [G] BR:96 [MET] B5:2450 [C] ✔
O:95 [GLU] 0:1597 [A] BR:96 [MET] B5:2510 [C] ✔
O:5 [ALA] 0:1422 [U] BR:6 [LEU] B5:2255 [A] ✔
O:4 [SER] 0:1396 [C] BR:5 [ARG] B5:2228 [U] ✔
O:4 [SER] 0:1397 [C] BR:5 [ARG] B5:2229 [U] ✔
O:80 [ARG] 0:1707 [G] BR:81 [ARG] B5:2654 [G] ✔
O:80 [ARG] 0:1708 [C] BR:81 [ARG] B5:2655 [A] ✔
O:80 [ARG] 0:1760 [G] BR:81 [ARG] B5:2706 [G] ✔
O:80 [ARG] 0:1761 [U] BR:81 [ARG] B5:2707 [A] ✔
O:80 [ARG] 0:1762 [C] BR:81 [ARG] B5:2708 [U] ✔
O:80 [ARG] 0:1801 [A] BR:81 [ARG] B5:3339 [U] ✔
O:80 [ARG] 0:1802 [G] BR:81 [ARG] B5:3340 [A] ✔
O:55 [LYS] 0:1716 [A] BR:56 [THR] B5:2663 [C] ✔
O:55 [LYS] 0:1717 [A] BR:56 [THR] B5:2664 [U] ✔
O:58 [SER] 0:1565 [C] BR:59 [SER] B5:2476 [U] ✔
O:58 [SER] 0:1566 [C] BR:59 [SER] B5:2477 [C] ✔
O:58 [SER] 0:2736 [U] BR:59 [SER] B5:4391 [C] ✔
O:58 [SER] 0:2737 [C] BR:59 [SER] B5:4392 [U] ✔
O:58 [SER] 0:2738 [G] BR:59 [SER] B5:4393 [G] ✔
O:8 [ARG] 0:1421 [C] BR:9 [ARG] B5:2254 [C] ✔
O:8 [ARG] 0:1422 [U] BR:9 [ARG] B5:2255 [A] ✔
O:8 [ARG] 0:1501 [A] BR:9 [ARG] B5:2369 [C] ✔
O:8 [ARG] 0:1502 [A] BR:9 [ARG] B5:2370 [A] ✔
O:117 [SER] 0:1593 [C] BR:118 [HIS] B5:2506 [G] ✔
O:60 [GLY] 0:1565 [C] BR:61 [ALA] B5:2476 [U] ✔
O:60 [GLY] 0:1566 [C] BR:61 [ALA] B5:2477 [C] ✔
O:60 [GLY] 0:2738 [G] BR:61 [ALA] B5:4393 [G] ✔
O:120 [ARG] 0:1593 [C] BR:121 [HIS] B5:2506 [G] ✔
O:120 [ARG] 0:1594 [C] BR:121 [HIS] B5:2507 [G] ✔
O:120 [ARG] 0:1595 [G] BR:121 [HIS] B5:2508 [U] ✔
O:116 [SER] 0:1593 [C] BR:117 [ARG] B5:2506 [G] ✔
O:116 [SER] 0:1594 [C] BR:117 [ARG] B5:2507 [G] ✔
O:90 [SER] 0:815 [U] BR:91 [GLU] B5:1527 [U] ✔
O:83 [LYS] 0:792 [G] BR:84 [THR] B5:1504 [G] ✔
O:83 [LYS] 0:793 [A] BR:84 [THR] B5:1505 [G] ✔
O:83 [LYS] 0:1708 [C] BR:84 [THR] B5:2655 [A] ✔
O:83 [LYS] 0:1761 [U] BR:84 [THR] B5:2707 [A] ✔
O:83 [LYS] 0:1762 [C] BR:84 [THR] B5:2708 [U] ✔
O:62 [ALA] 0:1705 [C] BR:63 [CYS] B5:2652 [G] ✔
O:2 [ASP] 0:1395 [C] BR:3 [MET] B5:2227 [U] ✔
O:2 [ASP] 0:1396 [C] BR:3 [MET] B5:2228 [U] ✔
O:2 [ASP] 0:1436 [C] BR:3 [MET] B5:2269 [U] ✔
O:2 [ASP] 0:1437 [A] BR:3 [MET] B5:2270 [G] ✔
O:124 [ASP] 0:800 [G] BR:125 [LEU] B5:1512 [C] ✔
O:124 [ASP] 0:801 [U] BR:125 [LEU] B5:1513 [A] ✔
O:124 [ASP] 0:1595 [G] BR:125 [LEU] B5:2508 [U] ✔
O:106 [ARG] 0:1596 [U] BR:107 [ARG] B5:2509 [U] ✔
O:74 [GLN] 0:1786 [C] BR:75 [HIS] B5:2732 [G] ✔
O:74 [GLN] 0:1787 [C] BR:75 [HIS] B5:2733 [C] ✔
O:75 [LYS] 0:1785 [G] BR:76 [MET] B5:2731 [G] ✔
O:75 [LYS] 0:1786 [C] BR:76 [MET] B5:2732 [G] ✔
O:75 [LYS] 0:1800 [G] BR:76 [MET] B5:3338 [U] ✔
O:75 [LYS] 0:1801 [A] BR:76 [MET] B5:3339 [U] ✔
O:57 [ASN] 0:1566 [C] BR:58 [HIS] B5:2477 [C] ✔
O:57 [ASN] 0:1704 [G] BR:58 [HIS] B5:2651 [G] ✔
O:57 [ASN] 0:1715 [C] BR:58 [HIS] B5:2662 [U] ✔
O:57 [ASN] 0:1716 [A] BR:58 [HIS] B5:2663 [C] ✔
O:57 [ASN] 0:2736 [U] BR:58 [HIS] B5:4391 [C] ✔
O:57 [ASN] 0:2737 [C] BR:58 [HIS] B5:4392 [U] ✔
O:91 [LYS] 0:815 [U] BR:92 [LYS] B5:1527 [U] ✔
O:91 [LYS] 0:816 [G] BR:92 [LYS] B5:1528 [G] ✔
O:91 [LYS] 0:817 [G] BR:92 [LYS] B5:1529 [G] ✔
O:91 [LYS] 0:1539 [U] BR:92 [LYS] B5:2449 [G] ✔
O:91 [LYS] 0:1597 [A] BR:92 [LYS] B5:2510 [C] ✔
O:99 [ARG] 0:1540 [G] BR:100 [ARG] B5:2450 [C] ✔
O:99 [ARG] 0:1541 [G] BR:100 [ARG] B5:2451 [G] ✔
O:99 [ARG] 0:1597 [A] BR:100 [ARG] B5:2510 [C] ✔
O:7 [LYS] 0:1397 [C] BR:8 [LYS] B5:2229 [U] ✔
O:7 [LYS] 0:1398 [G] BR:8 [LYS] B5:2230 [G] ✔
O:109 [ARG] 0:1594 [C] BR:110 [ARG] B5:2507 [G] ✔
O:109 [ARG] 0:1595 [G] BR:110 [ARG] B5:2508 [U] ✔
O:65 [ARG] 0:2735 [U] BR:66 [ASN] B5:4390 [G] ✔
O:135 [ALA] 0:1793 [C] BR:136 [ARG] B5:2739 [G] ✔
O:128 [GLY] 0:800 [G] BR:129 [GLY] B5:1512 [C] ✔
O:128 [GLY] 0:801 [U] BR:129 [GLY] B5:1513 [A] ✔
O:128 [GLY] 0:813 [C] BR:129 [GLY] B5:1525 [G] ✔
O:119 [TYR] 0:1594 [C] BR:120 [TYR] B5:2507 [G] ✔
O:119 [TYR] 0:1595 [G] BR:120 [TYR] B5:2508 [U] ✔
O:18 [LYS] 0:1718 [G] BR:19 [LYS] B5:2665 [G] ✔
O:18 [LYS] 0:1719 [G] BR:19 [LYS] B5:2666 [G] ✔
O:37 [ARG] 0:1500 [U] BR:38 [ARG] B5:2368 [U] ✔
O:37 [ARG] 0:1501 [A] BR:38 [ARG] B5:2369 [C] ✔
O:37 [ARG] 0:1502 [A] BR:38 [ARG] B5:2370 [A] ✔
O:86 [ALA] 0:792 [G] BR:87 [ALA] B5:1504 [G] ✔
O:86 [ALA] 0:793 [A] BR:87 [ALA] B5:1505 [G] ✔
O:86 [ALA] 0:1708 [C] BR:87 [ALA] B5:2655 [A] ✔
O:77 [ALA] 0:1760 [G] BR:78 [ILE] B5:2706 [G] ✔
O:77 [ALA] 0:1761 [U] BR:78 [ILE] B5:2707 [A] ✔
O:77 [ALA] 0:1783 [A] BR:78 [ILE] B5:2729 [U] ✔
O:77 [ALA] 0:1784 [U] BR:78 [ILE] B5:2730 [U] ✔
O:77 [ALA] 0:1785 [G] BR:78 [ILE] B5:2731 [G] ✔
O:9 [LEU] 0:1501 [A] BR:10 [LEU] B5:2369 [C] ✔
O:9 [LEU] 0:1502 [A] BR:10 [LEU] B5:2370 [A] ✔
O:70 [ALA] 0:1798 [C] BR:71 [ARG] B5:3336 [A] ✔
O:84 [ALA] 0:1761 [U] BR:85 [ALA] B5:2707 [A] ✔
O:84 [ALA] 0:1762 [C] BR:85 [ALA] B5:2708 [U] ✔
O:76 [GLY] 0:1784 [U] BR:77 [GLY] B5:2730 [U] ✔
O:76 [GLY] 0:1785 [G] BR:77 [GLY] B5:2731 [G] ✔
O:100 [ALA] 0:1794 [G] BR:101 [ILE] B5:2740 [G] ✔
O:100 [ALA] 0:1795 [G] BR:101 [ILE] B5:2741 [G] ✔
O:52 [LYS] 0:1399 [A] BR:53 [LYS] B5:2231 [A] ✔
O:66 [GLN] 0:1548 [U] BR:67 [THR] B5:2458 [C] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:66 [GLN] 0:1549 [C] BR:67 [THR] B5:2459 [C] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:66 [GLN] 0:1705 [C] BR:67 [THR] B5:2652 [G] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:66 [GLN] 0:1798 [C] BR:67 [THR] B5:3336 [A] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:96 [SER] 0:1794 [G] BR:97 [ARG] B5:2740 [G] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:96 [SER] 0:1795 [G] BR:97 [ARG] B5:2741 [G] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:35 [ILE] 0:1423 [C] BR:36 [ASN] B5:2256 [U] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:87 [ARG] 0:1799 [G] BR:88 [ARG] B5:3337 [C] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:28 [GLN] 0:1396 [C] BR:29 [THR] B5:2228 [U] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:63 [ARG] 0:1566 [C] BR:64 [ARG] B5:2477 [C] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:130 [GLU] 0:802 [G] BR:131 [VAL] B5:1514 [G] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:19 [ASN] 0:1720 [C] BR:20 [LYS] B5:2667 [OMC] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:88 [GLN] 0:1793 [C] BR:89 [MET] B5:2739 [G] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:88 [GLN] 0:1799 [G] BR:89 [MET] B5:3337 [C] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:54 [LYS] 0:1718 [G] BR:55 [VAL] B5:2665 [G] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:56 [GLY] 0:1567 [A] BR:57 [VAL] B5:2478 [U] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:53 [ASP] 0:1717 [A] BR:54 [PRO] B5:2664 [U] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:95 [GLU] 0:1539 [U] BR:96 [MET] B5:2449 [G] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:55 [LYS] 0:1566 [C] BR:56 [THR] B5:2477 [C] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:55 [LYS] 0:1715 [C] BR:56 [THR] B5:2662 [U] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:55 [LYS] 0:2736 [U] BR:56 [THR] B5:4391 [C] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:55 [LYS] 0:2737 [C] BR:56 [THR] B5:4392 [U] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:57 [ASN] 0:1565 [C] BR:58 [HIS] B5:2476 [U] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:65 [ARG] 0:1705 [C] BR:66 [ASN] B5:2652 [G] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:65 [ARG] 0:1706 [G] BR:66 [ASN] B5:2653 [U] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:128 [GLY] 0:814 [G] BR:129 [GLY] B5:1526 [G] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:119 [TYR] 0:1593 [C] BR:120 [TYR] B5:2506 [G] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:84 [ALA] 0:793 [A] BR:85 [ALA] B5:1505 [G] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:52 [LYS] 0:1398 [G] BR:53 [LYS] B5:2230 [G] ❌ 7O7Y_BR_B5
O:99 [ARG] 0:1596 [U] BR:100 [ARG] B5:2509 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:106 [ARG] 0:1595 [G] BR:107 [ARG] B5:2508 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:109 [ARG] 0:1593 [C] BR:110 [ARG] B5:2506 [G] ❌ 1JJ2_O_0
O:127 [GLY] 0:815 [U] BR:128 [LYS] B5:1527 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:127 [GLY] 0:1597 [A] BR:128 [LYS] B5:2510 [C] ❌ 1JJ2_O_0
O:127 [GLY] 0:1596 [U] BR:128 [LYS] B5:2509 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:135 [ALA] 0:1794 [G] BR:136 [ARG] B5:2740 [G] ❌ 1JJ2_O_0
O:18 [LYS] 0:1720 [C] BR:19 [LYS] B5:2667 [OMC] ❌ 1JJ2_O_0
O:19 [ASN] 0:1717 [A] BR:20 [LYS] B5:2664 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:38 [GLU] 0:1499 [U] BR:39 [GLN] B5:2367 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:4 [SER] 0:1436 [C] BR:5 [ARG] B5:2269 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:4 [SER] 0:1395 [C] BR:5 [ARG] B5:2227 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:4 [SER] 0:1437 [A] BR:5 [ARG] B5:2270 [G] ❌ 1JJ2_O_0
O:56 [GLY] 0:2738 [G] BR:57 [VAL] B5:4393 [G] ❌ 1JJ2_O_0
O:56 [GLY] 0:1565 [C] BR:57 [VAL] B5:2476 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:56 [GLY] 0:2736 [U] BR:57 [VAL] B5:4391 [C] ❌ 1JJ2_O_0
O:57 [ASN] 0:1567 [A] BR:58 [HIS] B5:2478 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:5 [ALA] 0:1501 [A] BR:6 [LEU] B5:2369 [C] ❌ 1JJ2_O_0
O:5 [ALA] 0:1423 [C] BR:6 [LEU] B5:2256 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:62 [ALA] 0:1704 [G] BR:63 [CYS] B5:2651 [G] ❌ 1JJ2_O_0
O:66 [GLN] 0:1706 [G] BR:67 [THR] B5:2653 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:69 [ARG] 0:2735 [U] BR:70 [ARG] B5:4390 [G] ❌ 1JJ2_O_0
O:70 [ALA] 0:1799 [G] BR:71 [ARG] B5:3337 [C] ❌ 1JJ2_O_0
O:71 [LYS] 0:1788 [U] BR:72 [LYS] B5:2734 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:73 [HIS] 0:1787 [C] BR:74 [ARG] B5:2733 [C] ❌ 1JJ2_O_0
O:74 [GLN] 0:1707 [G] BR:75 [HIS] B5:2654 [G] ❌ 1JJ2_O_0
O:77 [ALA] 0:1762 [C] BR:78 [ILE] B5:2708 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:77 [ALA] 0:1802 [G] BR:78 [ILE] B5:3340 [A] ❌ 1JJ2_O_0
O:79 [SER] 0:1814 [G] BR:80 [LYS] B5:3352 [G] ❌ 1JJ2_O_0
O:79 [SER] 0:1708 [C] BR:80 [LYS] B5:2655 [A] ❌ 1JJ2_O_0
O:82 [GLY] 0:1762 [C] BR:83 [GLY] B5:2708 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:85 [GLY] 0:1762 [C] BR:86 [ASN] B5:2708 [U] ❌ 1JJ2_O_0
O:91 [LYS] 0:1540 [G] BR:92 [LYS] B5:2450 [C] ❌ 1JJ2_O_0
O:95 [GLU] 0:1541 [G] BR:96 [MET] B5:2451 [G] ❌ 1JJ2_O_0
O:96 [SER] 0:1796 [A] BR:97 [ARG] B5:3334 [C] ❌ 7O7Y_B5:3334 no longer at interface
O:71 [LYS] 0:1790 [C] BR:72 [LYS] B5:2736 [U] ❌ 7O7Y_B5:2736 no longer at interface
O:71 [LYS] 0:1791 [U] BR:72 [LYS] B5:2737 [A] ❌ 7O7Y_B5:2737 no longer at interface
O:78 [GLY] 0:1812 [G] BR:79 [GLY] B5:3350 [C] ❌ 7O7Y_B5:3350 no longer at interface
O:28 [GLN] 0:1386 [G] BR:29 [THR] B5:2218 [A] ❌ 7O7Y_B5:2218 no longer at interface
O:63 [ARG] 0:1564 [C] BR:64 [ARG] B5:2475 [PSU] ❌ 7O7Y_B5:2475 no longer at interface
O:73 [HIS] 0:1790 [C] BR:74 [ARG] B5:2736 [U] ❌ 7O7Y_B5:2736 no longer at interface
O:73 [HIS] 0:1803 [C] BR:74 [ARG] B5:3341 [G] ❌ 7O7Y_B5:3341 no longer at interface
O:73 [HIS] 0:1804 [A] BR:74 [ARG] B5:3342 [A] ❌ 7O7Y_B5:3342 no longer at interface
O:92 [GLU] 0:1640 [C] BR:93 [VAL] B5:2569 [G] ❌ 7O7Y_B5:2569 no longer at interface
O:72 [GLY] 0:1790 [C] BR:73 [GLY] B5:2736 [U] ❌ 7O7Y_BR:73, 7O7Y_B5:2736 no longer at interface
O:54 [LYS] 0:1568 [G] BR:55 [VAL] B5:2479 [U] ❌ 7O7Y_B5:2479 no longer at interface
O:81 [LYS] 0:1709 [G] BR:82 [LYS] B5:2656 [A] ❌ 7O7Y_B5:2656 no longer at interface
O:81 [LYS] 0:1816 [C] BR:82 [LYS] B5:3354 [C] ❌ 7O7Y_B5:3354 no longer at interface
O:57 [ASN] 0:1703 [G] BR:58 [HIS] B5:2650 [A] ❌ 7O7Y_B5:2650 no longer at interface
O:116 [SER] 0:1590 [A] BR:117 [ARG] B5:2502 [A] ❌ 1JJ2_0:1590 no longer at interface
O:116 [SER] 0:1592 [G] BR:117 [ARG] B5:2505 [G] ❌ 1JJ2_0:1592 no longer at interface
O:116 [SER] 0:1591 [A] BR:117 [ARG] B5:2503 [A] ❌ 1JJ2_0:1591 no longer at interface
O:117 [SER] 0:1592 [G] BR:118 [HIS] B5:2505 [G] ❌ 1JJ2_0:1592 no longer at interface
O:127 [GLY] 0:799 [C] BR:128 [LYS] B5:1511 [C] ❌ 1JJ2_0:799 no longer at interface
O:127 [GLY] 0:1599 [U] BR:128 [LYS] B5:2512 [C] ❌ 1JJ2_0:1599 no longer at interface
O:133 [SER] 0:1792 [C] BR:134 [ASN] B5:2738 [A] ❌ 1JJ2_0:1792 no longer at interface
O:135 [ALA] 0:1792 [C] BR:136 [ARG] B5:2738 [A] ❌ 1JJ2_0:1792 no longer at interface
O:15 [ASP] 0:1628 [G] BR:16 [ARG] B5:2541 [G] ❌ 1JJ2_O:15, 1JJ2_0:1628 no longer at interface
O:15 [ASP] 0:1629 [G] BR:16 [ARG] B5:2542 [C] ❌ 1JJ2_O:15, 1JJ2_0:1629 no longer at interface
O:15 [ASP] 0:1498 [G] BR:16 [ARG] B5:2366 [G] ❌ 1JJ2_O:15, 1JJ2_0:1498 no longer at interface
O:79 [SER] 0:2734 [G] BR:80 [LYS] B5:4389 [G] ❌ 1JJ2_0:2734 no longer at interface
O:79 [SER] 0:2733 [U] BR:80 [LYS] B5:4388 [U] ❌ 1JJ2_0:2733 no longer at interface
O:132 [ASP] 0:1793 [C] BR:133 [LYS] B5:2739 [G] ❌ 7O7Y_BR:133 no longer at interface
O:132 [ASP] 0:1794 [G] BR:133 [LYS] B5:2740 [G] ❌ 7O7Y_BR:133 no longer at interface
O:97 [ARG] 0:815 [U] BR:98 [ARG] B5:1527 [U] ❌ 7O7Y_BR:98 no longer at interface
O:97 [ARG] 0:1793 [C] BR:98 [ARG] B5:2739 [G] ❌ 7O7Y_BR:98 no longer at interface
O:97 [ARG] 0:1794 [G] BR:98 [ARG] B5:2740 [G] ❌ 7O7Y_BR:98 no longer at interface
O:72 [GLY] 0:1801 [A] BR:73 [GLY] B5:3339 [U] ❌ 7O7Y_BR:73 no longer at interface
O:72 [GLY] 0:1802 [G] BR:73 [GLY] B5:3340 [A] ❌ 7O7Y_BR:73 no longer at interface
O:93 [ASP] 0:1793 [C] BR:94 [THR] B5:2739 [G] ❌ 7O7Y_BR:94 no longer at interface
O:68 [LYS] 0:1787 [C] BR:69 [ALA] B5:2733 [C] ❌ 7O7Y_BR:69 no longer at interface
O:68 [LYS] 0:1788 [U] BR:69 [ALA] B5:2734 [U] ❌ 7O7Y_BR:69 no longer at interface
O:103 [THR] 0:1795 [G] BR:104 [ARG] B5:2741 [G] ❌ 1JJ2_O:103 no longer at interface
O:103 [THR] 0:1794 [G] BR:104 [ARG] B5:2740 [G] ❌ 1JJ2_O:103 no longer at interface
O:107 [GLU] 0:1795 [G] BR:108 [ARG] B5:2741 [G] ❌ 1JJ2_O:107 no longer at interface
O:11 [ALA] 0:1719 [G] BR:12 [SER] B5:2666 [G] ❌ 1JJ2_O:11 no longer at interface
O:15 [ASP] 0:1499 [U] BR:16 [ARG] B5:2367 [U] ❌ 1JJ2_O:15 no longer at interface
O:29 [GLY] 0:1387 [G] BR:30 [ASN] B5:2219 [A] ❌ 1JJ2_O:29 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal protein L19 (L19e) C-terminal domain & Ribosomal protein L19 (L19e) N-terminal domain 0.94 1.43 0.33 0.95 0.94 0.94 0.86 0.84 0.72 0.51 0.41


Other pairs involving 1JJ2_O_0 or 7O7Y_BR_B5

Total number of entries: 13

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1JJ2_O_0 1VQ8_P_0 0.99 1.0 0.24 0.98 Ribosomal protein L19 (L19e) C-terminal domain & Ribosomal protein L19 (L19e) N-terminal domain Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1JJ2_O_0 1YHQ_P_0 1.00 1.0 0.13 0.98 Ribosomal protein L19 (L19e) C-terminal domain & Ribosomal protein L19 (L19e) N-terminal domain Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1JJ2_O_0 6AZ3_Q_1 0.79 0.76 1.54 0.35 Ribosomal protein L19 (L19e) C-terminal domain & Ribosomal protein L19 (L19e) N-terminal domain compare
1JJ2_O_0 6AZ3_Q_2 0.74 0.8 1.53 0.26 Ribosomal protein L19 (L19e) C-terminal domain & Ribosomal protein L19 (L19e) N-terminal domain compare
1JJ2_O_0 6AZ3_Q_3 0.89 0.72 1.3 0.3 Ribosomal protein L19 (L19e) C-terminal domain & Ribosomal protein L19 (L19e) N-terminal domain compare
1JJ2_O_0 6AZ3_Q_4 0.75 0.78 1.97 0.29 Ribosomal protein L19 (L19e) C-terminal domain compare
1JJ2_O_0 7O7Y_BR_B5 0.84 0.94 1.43 0.33 Ribosomal protein L19 (L19e) C-terminal domain & Ribosomal protein L19 (L19e) N-terminal domain compare
1YHQ_P_0 7O7Y_BR_B5 0.83 0.94 1.43 0.34 Ribosomal protein L19 (L19e) C-terminal domain & Ribosomal protein L19 (L19e) N-terminal domain compare
1VQ8_P_0 7O7Y_BR_B5 0.83 0.94 1.45 0.35 Ribosomal protein L19 (L19e) C-terminal domain & Ribosomal protein L19 (L19e) N-terminal domain compare
6AZ3_Q_3 7O7Y_BR_B5 0.82 0.92 0.82 0.52 Ribosomal protein L19 (L19e) C-terminal domain & Ribosomal protein L19 (L19e) N-terminal domain compare
6AZ3_Q_1 7O7Y_BR_B5 0.85 0.92 0.84 0.61 Ribosomal protein L19 (L19e) C-terminal domain & Ribosomal protein L19 (L19e) N-terminal domain Eukaryotic large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_Q_4 7O7Y_BR_B5 0.96 0.89 0.58 0.57 Ribosomal protein L19 (L19e) C-terminal domain Eukaryotic large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_Q_2 7O7Y_BR_B5 0.86 0.91 0.73 0.58 Ribosomal protein L19 (L19e) C-terminal domain & Ribosomal protein L19 (L19e) N-terminal domain Eukaryotic large subunit ribosomal RNA compare