Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 6S0Z_W
|
6S0Z_A
|
7RYG_X
|
7RYG_A
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| W:39 [GLU] | A:95 [A] | X:39 [LYS] | A:103 [U] | ✔ |
| W:39 [GLU] | A:96 [G] | X:39 [LYS] | A:104 [C] | ✔ |
| W:3 [ALA] | A:77 [U] | X:3 [THR] | A:84 [U] | ✔ |
| W:3 [ALA] | A:78 [U] | X:3 [THR] | A:85 [C] | ✔ |
| W:40 [THR] | A:95 [A] | X:40 [SER] | A:103 [U] | ✔ |
| W:54 [LYS] | A:72 [U] | X:54 [LYS] | A:79 [A] | ✔ |
| W:32 [LEU] | A:61 [A] | X:32 [LYS] | A:68 [A] | ✔ |
| W:51 [ALA] | A:72 [U] | X:51 [ALA] | A:79 [A] | ✔ |
| W:51 [ALA] | A:73 [A] | X:51 [ALA] | A:80 [A] | ✔ |
| W:51 [ALA] | A:76 [C] | X:51 [ALA] | A:83 [C] | ✔ |
| W:48 [LYS] | A:73 [A] | X:48 [LYS] | A:80 [A] | ✔ |
| W:48 [LYS] | A:75 [G] | X:48 [LYS] | A:82 [G] | ✔ |
| W:48 [LYS] | A:76 [C] | X:48 [LYS] | A:83 [C] | ✔ |
| W:50 [ILE] | A:72 [U] | X:50 [ILE] | A:79 [A] | ✔ |
| W:38 [GLU] | A:95 [A] | X:38 [GLY] | A:103 [U] | ✔ |
| W:41 [ALA] | A:96 [G] | X:41 [HIS] | A:104 [C] | ✔ |
| W:55 [THR] | A:72 [U] | X:55 [THR] | A:79 [A] | ✔ |
| W:55 [THR] | A:76 [C] | X:55 [THR] | A:83 [C] | ✔ |
| W:55 [THR] | A:77 [U] | X:55 [THR] | A:84 [U] | ✔ |
| W:52 [ARG] | A:76 [C] | X:52 [ARG] | A:83 [C] | ✔ |
| W:52 [ARG] | A:77 [U] | X:52 [ARG] | A:84 [U] | ✔ |
| W:58 [ARG] | A:72 [U] | X:58 [THR] | A:79 [A] | ✔ |
| W:58 [ARG] | A:110 [A] | X:58 [THR] | A:118 [A] | ✔ |
| W:58 [ARG] | A:111 [U] | X:58 [THR] | A:119 [U] | ✔ |
| W:7 [ARG] | A:77 [U] | X:7 [ARG] | A:84 [U] | ✔ |
| W:7 [ARG] | A:78 [U] | X:7 [ARG] | A:85 [C] | ✔ |
| W:47 [ARG] | A:59 [U] | X:47 [ARG] | A:66 [U] | ✔ |
| W:47 [ARG] | A:60 [U] | X:47 [ARG] | A:67 [G] | ✔ |
| W:47 [ARG] | A:73 [A] | X:47 [ARG] | A:80 [A] | ✔ |
| W:47 [ARG] | A:74 [U] | X:47 [ARG] | A:81 [A] | ✔ |
| W:44 [ARG] | A:61 [A] | X:44 [GLN] | A:68 [A] | ✔ |
| W:59 [GLU] | A:77 [U] | X:59 [GLU] | A:84 [U] | ✔ |
| W:40 [THR] | A:61 [A] | X:40 [SER] | A:68 [A] | ❌ 7RYG_X_A |
| W:48 [LYS] | A:74 [U] | X:48 [LYS] | A:81 [A] | ❌ 7RYG_X_A |
| W:41 [ALA] | A:95 [A] | X:41 [HIS] | A:103 [U] | ❌ 7RYG_X_A |
| W:55 [THR] | A:110 [A] | X:55 [THR] | A:118 [A] | ❌ 7RYG_X_A |
| W:47 [ARG] | A:61 [A] | X:47 [ARG] | A:68 [A] | ❌ 7RYG_X_A |
| W:47 [ARG] | A:72 [U] | X:47 [ARG] | A:79 [A] | ❌ 7RYG_X_A |
| W:44 [ARG] | A:74 [U] | X:44 [GLN] | A:81 [A] | ❌ 7RYG_X_A |
| W:44 [ARG] | A:75 [G] | X:44 [GLN] | A:82 [G] | ❌ 7RYG_X_A |
| W:44 [ARG] | A:76 [C] | X:44 [GLN] | A:83 [C] | ❌ 7RYG_X_A |
| W:40 [THR] | A:94 [A] | X:40 [SER] | A:102 [A] | ❌ 7RYG_A:102 no longer at interface |
| W:38 [GLU] | A:94 [A] | X:38 [GLY] | A:102 [A] | ❌ 7RYG_A:102 no longer at interface |
| W:41 [ALA] | A:97 [C] | X:41 [HIS] | A:105 [C] | ❌ 6S0Z_A:97 no longer at interface |
| W:55 [THR] | A:109 [G] | X:55 [THR] | A:117 [G] | ❌ 6S0Z_A:109 no longer at interface |
| W:43 [ILE] | A:61 [A] | X:43 [VAL] | A:68 [A] | ❌ 7RYG_X:43 no longer at interface |
| W:29 [ARG] | A:60 [U] | X:29 [ARG] | A:67 [G] | ❌ 7RYG_X:29 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ribosomal protein L29 (L29p) | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.98 | 2.21 | 0.53 | 0.92 | 0.98 | 1.0 | 0.93 | 0.86 | 0.77 | 0.47 | 0.40 |
Other pairs involving 6S0Z_W_A or 7RYG_X_A
Total number of entries: 12