RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group118 > 2VQE_L_A vs 7O7Y_Aw_A2

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

2VQE_L
2VQE_A
7O7Y_Aw
7O7Y_A2
Conserved?
L:19 [ARG] A:241 [C] Aw:27 [TYR] A2:359 [C] ✔
L:30 [ALA] A:363 [A] Aw:44 [ALA] A2:484 [C] ✔
L:30 [ALA] A:553 [A] Aw:44 [ALA] A2:650 [PSU] ✔
L:5 [PRO] A:567 [G] Aw:3 [LYS] A2:664 [C] ✔
L:88 [GLY] A:552 [U] Aw:104 [GLY] A2:649 [A] ✔
L:88 [GLY] A:553 [A] Aw:104 [GLY] A2:650 [PSU] ✔
L:74 [GLY] A:521 [G] Aw:88 [ASP] A2:618 [G] ✔
L:118 [SER] A:35 [G] Aw:131 [LEU] A2:29 [G] ✔
L:118 [SER] A:502 [G] Aw:131 [LEU] A2:598 [G] ✔
L:8 [ASN] A:585 [G] Aw:9 [THR] A2:682 [PSU] ✔
L:8 [ASN] A:879 [C] Aw:9 [THR] A2:1161 [U] ✔
L:91 [LYS] A:525 [C] Aw:112 [VAL] A2:622 [C] ✔
L:53 [ARG] A:521 [G] Aw:66 [ILE] A2:618 [G] ✔
L:72 [GLY] A:522 [C] Aw:86 [PRO] A2:619 [C] ✔
L:33 [ARG] A:363 [A] Aw:47 [ALA] A2:484 [C] ✔
L:9 [GLN] A:880 [C] Aw:12 [LYS] A2:1162 [U] ✔
L:9 [GLN] A:881 [G] Aw:12 [LYS] A2:1163 [C] ✔
L:17 [LYS] A:302 [G] Aw:21 [LYS] A2:423 [U] ✔
L:17 [LYS] A:303 [A] Aw:21 [LYS] A2:424 [U] ✔
L:17 [LYS] A:562 [C] Aw:21 [LYS] A2:659 [U] ✔
L:34 [ARG] A:363 [A] Aw:48 [LYS] A2:484 [C] ✔
L:6 [THR] A:879 [C] Aw:4 [CYS] A2:1161 [U] ✔
L:6 [THR] A:880 [C] Aw:4 [CYS] A2:1162 [U] ✔
L:10 [LEU] A:564 [C] Aw:13 [LEU] A2:661 [C] ✔
L:50 [SER] A:518 [C] Aw:63 [ASN] A2:615 [C] ✔
L:50 [SER] A:529 [G] Aw:63 [ASN] A2:626 [G] ✔
L:29 [GLY] A:553 [A] Aw:43 [GLY] A2:650 [PSU] ✔
L:104 [VAL] A:34 [C] Aw:124 [LYS] A2:28 [U] ✔
L:104 [VAL] A:35 [G] Aw:124 [LYS] A2:29 [G] ✔
L:54 [LYS] A:521 [G] Aw:67 [ARG] A2:618 [G] ✔
L:87 [GLY] A:552 [U] Aw:103 [ALA] A2:649 [A] ✔
L:51 [ALA] A:519 [C] Aw:64 [SER] A2:616 [C] ✔
L:51 [ALA] A:520 [A] Aw:64 [SER] A2:617 [A] ✔
L:51 [ALA] A:529 [G] Aw:64 [SER] A2:626 [G] ✔
L:47 [LYS] A:1492 [A] Aw:61 [GLN] A2:1825 [A] ✔
L:32 [PHE] A:33 [A] Aw:46 [HIS] A2:27 [A2M] ✔
L:32 [PHE] A:34 [C] Aw:46 [HIS] A2:28 [U] ✔
L:32 [PHE] A:363 [A] Aw:46 [HIS] A2:484 [C] ✔
L:32 [PHE] A:551 [U] Aw:46 [HIS] A2:648 [U] ✔
L:32 [PHE] A:552 [U] Aw:46 [HIS] A2:649 [A] ✔
L:49 [ASN] A:518 [C] Aw:62 [HY3] A2:615 [C] ✔
L:49 [ASN] A:529 [G] Aw:62 [HY3] A2:626 [G] ✔
L:73 [GLU] A:521 [G] Aw:87 [ASN] A2:618 [G] ✔
L:73 [GLU] A:537 [G] Aw:87 [ASN] A2:634 [C] ✔
L:16 [GLU] A:562 [C] Aw:20 [GLN] A2:659 [U] ✔
L:7 [ILE] A:564 [C] Aw:5 [ARG] A2:661 [C] ✔
L:52 [LEU] A:519 [C] Aw:65 [ALA] A2:616 [C] ✔
L:52 [LEU] A:520 [A] Aw:65 [ALA] A2:617 [A] ✔
L:52 [LEU] A:521 [G] Aw:65 [ALA] A2:618 [G] ✔
L:46 [LYS] A:912 [C] Aw:60 [LYS] A2:1194 [U] ✔
L:46 [LYS] A:913 [A] Aw:60 [LYS] A2:1195 [A] ✔
L:31 [PRO] A:32 [A] Aw:45 [SER] A2:26 [U] ✔
L:31 [PRO] A:33 [A] Aw:45 [SER] A2:27 [A2M] ✔
L:31 [PRO] A:363 [A] Aw:45 [SER] A2:484 [C] ✔
L:31 [PRO] A:552 [U] Aw:45 [SER] A2:649 [A] ✔
L:31 [PRO] A:553 [A] Aw:45 [SER] A2:650 [PSU] ✔
L:13 [LYS] A:882 [C] Aw:16 [HIS] A2:1164 [C] ✔
L:92 [ASP] A:523 [A] Aw:113 [GLY] A2:620 [A] ✔
L:89 [ARG] A:912 [C] Aw:110 [HIS] A2:1194 [U] ✔
L:89 [ARG] A:913 [A] Aw:110 [HIS] A2:1195 [A] ✔
L:18 [VAL] A:562 [C] Aw:24 [ASP] A2:659 [U] ✔
L:14 [GLY] A:562 [C] Aw:17 [ARG] A2:659 [U] ✔
L:23 [LYS] A:23 [C] Aw:36 [LEU] A2:18 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:23 [LYS] A:24 [U] Aw:36 [LEU] A2:19 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:23 [LYS] A:554 [C] Aw:36 [LEU] A2:651 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:5 [PRO] A:882 [C] Aw:3 [LYS] A2:1164 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:5 [PRO] A:883 [C] Aw:3 [LYS] A2:1165 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:118 [SER] A:36 [C] Aw:131 [LEU] A2:30 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:118 [SER] A:501 [C] Aw:131 [LEU] A2:597 [U] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:8 [ASN] A:880 [C] Aw:9 [THR] A2:1162 [U] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:21 [LYS] A:908 [A] Aw:30 [ALA] A2:1190 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:21 [LYS] A:909 [A] Aw:30 [ALA] A2:1191 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:91 [LYS] A:523 [A] Aw:112 [VAL] A2:620 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:91 [LYS] A:912 [C] Aw:112 [VAL] A2:1194 [U] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:91 [LYS] A:913 [A] Aw:112 [VAL] A2:1195 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:53 [ARG] A:522 [C] Aw:66 [ILE] A2:619 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:53 [ARG] A:523 [A] Aw:66 [ILE] A2:620 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:53 [ARG] A:528 [C] Aw:66 [ILE] A2:625 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:53 [ARG] A:529 [G] Aw:66 [ILE] A2:626 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:22 [SER] A:554 [C] Aw:35 [ALA] A2:651 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:72 [GLY] A:521 [G] Aw:86 [PRO] A2:618 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:33 [ARG] A:362 [G] Aw:47 [ALA] A2:483 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:9 [GLN] A:882 [C] Aw:12 [LYS] A2:1164 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:94 [PRO] A:911 [U] Aw:115 [ILE] A2:1193 [U] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:94 [PRO] A:912 [C] Aw:115 [ILE] A2:1194 [U] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:34 [ARG] A:362 [G] Aw:48 [LYS] A2:483 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:50 [SER] A:519 [C] Aw:63 [ASN] A2:616 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:50 [SER] A:1492 [A] Aw:63 [ASN] A2:1825 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:122 [THR] A:35 [G] Aw:134 [TYR] A2:29 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:122 [THR] A:36 [C] Aw:134 [TYR] A2:30 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:54 [LYS] A:520 [A] Aw:67 [ARG] A2:617 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:103 [GLY] A:35 [G] Aw:123 [VAL] A2:29 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:87 [GLY] A:553 [A] Aw:103 [ALA] A2:650 [PSU] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:51 [ALA] A:521 [G] Aw:64 [SER] A2:618 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:20 [LYS] A:555 [C] Aw:29 [LYS] A2:652 [PSU] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:49 [ASN] A:521 [G] Aw:62 [HY3] A2:618 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:49 [ASN] A:522 [C] Aw:62 [HY3] A2:619 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:49 [ASN] A:523 [A] Aw:62 [HY3] A2:620 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:49 [ASN] A:527 [G] Aw:62 [HY3] A2:624 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:49 [ASN] A:528 [C] Aw:62 [HY3] A2:625 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:123 [LYS] A:36 [C] Aw:135 [LYS] A2:30 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:123 [LYS] A:37 [U] Aw:135 [LYS] A2:31 [U] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:73 [GLU] A:520 [A] Aw:87 [ASN] A2:617 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:16 [GLU] A:242 [C] Aw:20 [GLN] A2:360 [U] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:46 [LYS] A:1492 [A] Aw:60 [LYS] A2:1825 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:13 [LYS] A:881 [G] Aw:16 [HIS] A2:1163 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:92 [ASP] A:522 [C] Aw:113 [GLY] A2:619 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:92 [ASP] A:527 [G] Aw:113 [GLY] A2:624 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:92 [ASP] A:528 [C] Aw:113 [GLY] A2:625 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:15 [ARG] A:562 [C] Aw:18 [ARG] A2:659 [U] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:15 [ARG] A:563 [A] Aw:18 [ARG] A2:660 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:15 [ARG] A:564 [C] Aw:18 [ARG] A2:661 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:15 [ARG] A:567 [G] Aw:18 [ARG] A2:664 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:15 [ARG] A:883 [C] Aw:18 [ARG] A2:1165 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:15 [ARG] A:884 [U] Aw:18 [ARG] A2:1166 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:90 [VAL] A:523 [A] Aw:111 [ALA] A2:620 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:89 [ARG] A:524 [G] Aw:110 [HIS] A2:621 [G] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:89 [ARG] A:525 [C] Aw:110 [HIS] A2:622 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:120 [TYR] A:522 [C] Aw:132 [ALA] A2:619 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:120 [TYR] A:523 [A] Aw:132 [ALA] A2:620 [A] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:120 [TYR] A:537 [G] Aw:132 [ALA] A2:634 [C] ❌ 7O7Y_Aw_A2
L:90 [VAL] A:525 [C] Aw:111 [ALA] A2:622 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:90 [VAL] A:912 [C] Aw:111 [ALA] A2:1194 [U] ❌ 2VQE_L_A
L:91 [LYS] A:524 [G] Aw:112 [VAL] A2:621 [G] ❌ 2VQE_L_A
L:92 [ASP] A:525 [C] Aw:113 [GLY] A2:622 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:92 [ASP] A:524 [G] Aw:113 [GLY] A2:621 [G] ❌ 2VQE_L_A
L:94 [PRO] A:523 [A] Aw:115 [ILE] A2:620 [A] ❌ 2VQE_L_A
L:103 [GLY] A:34 [C] Aw:123 [VAL] A2:28 [U] ❌ 2VQE_L_A
L:120 [TYR] A:36 [C] Aw:132 [ALA] A2:30 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:120 [TYR] A:35 [G] Aw:132 [ALA] A2:29 [G] ❌ 2VQE_L_A
L:122 [THR] A:537 [G] Aw:134 [TYR] A2:634 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:122 [THR] A:538 [G] Aw:134 [TYR] A2:635 [A] ❌ 2VQE_L_A
L:123 [LYS] A:502 [G] Aw:135 [LYS] A2:598 [G] ❌ 2VQE_L_A
L:14 [GLY] A:567 [G] Aw:17 [ARG] A2:664 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:14 [GLY] A:884 [U] Aw:17 [ARG] A2:1166 [G] ❌ 2VQE_L_A
L:14 [GLY] A:564 [C] Aw:17 [ARG] A2:661 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:14 [GLY] A:563 [A] Aw:17 [ARG] A2:660 [G] ❌ 2VQE_L_A
L:15 [ARG] A:241 [C] Aw:18 [ARG] A2:359 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:15 [ARG] A:242 [C] Aw:18 [ARG] A2:360 [U] ❌ 2VQE_L_A
L:16 [GLU] A:883 [C] Aw:20 [GLN] A2:1165 [G] ❌ 2VQE_L_A
L:16 [GLU] A:884 [U] Aw:20 [GLN] A2:1166 [G] ❌ 2VQE_L_A
L:18 [VAL] A:884 [U] Aw:24 [ASP] A2:1166 [G] ❌ 2VQE_L_A
L:19 [ARG] A:303 [A] Aw:27 [TYR] A2:424 [U] ❌ 2VQE_L_A
L:20 [LYS] A:554 [C] Aw:29 [LYS] A2:651 [A] ❌ 2VQE_L_A
L:5 [PRO] A:564 [C] Aw:3 [LYS] A2:661 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:5 [PRO] A:563 [A] Aw:3 [LYS] A2:660 [G] ❌ 2VQE_L_A
L:5 [PRO] A:879 [C] Aw:3 [LYS] A2:1161 [U] ❌ 2VQE_L_A
L:21 [LYS] A:555 [C] Aw:30 [ALA] A2:652 [PSU] ❌ 2VQE_L_A
L:22 [SER] A:908 [A] Aw:35 [ALA] A2:1190 [A] ❌ 2VQE_L_A
L:22 [SER] A:909 [A] Aw:35 [ALA] A2:1191 [A] ❌ 2VQE_L_A
L:6 [THR] A:585 [G] Aw:4 [CYS] A2:682 [PSU] ❌ 2VQE_L_A
L:34 [ARG] A:364 [A] Aw:48 [LYS] A2:485 [A2M] ❌ 2VQE_L_A
L:7 [ILE] A:879 [C] Aw:5 [ARG] A2:1161 [U] ❌ 2VQE_L_A
L:46 [LYS] A:911 [U] Aw:60 [LYS] A2:1193 [U] ❌ 2VQE_L_A
L:50 [SER] A:522 [C] Aw:63 [ASN] A2:619 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:50 [SER] A:528 [C] Aw:63 [ASN] A2:625 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:50 [SER] A:523 [A] Aw:63 [ASN] A2:620 [A] ❌ 2VQE_L_A
L:50 [SER] A:527 [G] Aw:63 [ASN] A2:624 [G] ❌ 2VQE_L_A
L:51 [ALA] A:518 [C] Aw:64 [SER] A2:615 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:52 [LEU] A:529 [G] Aw:65 [ALA] A2:626 [G] ❌ 2VQE_L_A
L:53 [ARG] A:520 [A] Aw:66 [ILE] A2:617 [A] ❌ 2VQE_L_A
L:54 [LYS] A:528 [C] Aw:67 [ARG] A2:625 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:54 [LYS] A:522 [C] Aw:67 [ARG] A2:619 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:54 [LYS] A:523 [A] Aw:67 [ARG] A2:620 [A] ❌ 2VQE_L_A
L:73 [GLU] A:522 [C] Aw:87 [ASN] A2:619 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:74 [GLY] A:520 [A] Aw:88 [ASP] A2:617 [A] ❌ 2VQE_L_A
L:74 [GLY] A:537 [G] Aw:88 [ASP] A2:634 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:74 [GLY] A:522 [C] Aw:88 [ASP] A2:619 [C] ❌ 2VQE_L_A
L:41 [ARG] A:1411 [C] Aw:55 [VAL] A2:1713 [A] ❌ 7O7Y_Aw:55, 7O7Y_A2:1713 no longer at interface
L:5 [PRO] A:568 [G] Aw:3 [LYS] A2:665 [A] ❌ 7O7Y_A2:665 no longer at interface
L:118 [SER] A:550 [G] Aw:131 [LEU] A2:647 [G] ❌ 7O7Y_A2:647 no longer at interface
L:57 [LYS] A:1411 [C] Aw:70 [VAL] A2:1713 [A] ❌ 7O7Y_Aw:70, 7O7Y_A2:1713 no longer at interface
L:57 [LYS] A:1412 [C] Aw:70 [VAL] A2:1714 [C] ❌ 7O7Y_Aw:70, 7O7Y_A2:1714 no longer at interface
L:91 [LYS] A:526 [C] Aw:112 [VAL] A2:623 [C] ❌ 7O7Y_A2:623 no longer at interface
L:44 [THR] A:1491 [G] Aw:58 [GLU] A2:1824 [A] ❌ 7O7Y_Aw:58, 7O7Y_A2:1824 no longer at interface
L:117 [ARG] A:500 [G] Aw:130 [LEU] A2:596 [U] ❌ 7O7Y_Aw:130, 7O7Y_A2:596 no longer at interface
L:45 [PRO] A:1491 [G] Aw:59 [ALA] A2:1824 [A] ❌ 7O7Y_Aw:59, 7O7Y_A2:1824 no longer at interface
L:94 [PRO] A:1490 [C] Aw:115 [ILE] A2:1823 [A] ❌ 7O7Y_A2:1823 no longer at interface
L:94 [PRO] A:1491 [G] Aw:115 [ILE] A2:1824 [A] ❌ 7O7Y_A2:1824 no longer at interface
L:124 [LYS] A:500 [G] Aw:136 [GLY] A2:596 [U] ❌ 7O7Y_Aw:136, 7O7Y_A2:596 no longer at interface
L:47 [LYS] A:1491 [G] Aw:61 [GLN] A2:1824 [A] ❌ 7O7Y_A2:1824 no longer at interface
L:20 [LYS] A:556 [C] Aw:29 [LYS] A2:653 [U] ❌ 7O7Y_A2:653 no longer at interface
L:65 [GLU] A:1413 [A] Aw:79 [LYS] A2:1715 [U] ❌ 7O7Y_Aw:79, 7O7Y_A2:1715 no longer at interface
L:46 [LYS] A:1490 [C] Aw:60 [LYS] A2:1823 [A] ❌ 7O7Y_A2:1823 no longer at interface
L:46 [LYS] A:1491 [G] Aw:60 [LYS] A2:1824 [A] ❌ 7O7Y_A2:1824 no longer at interface
L:11 [VAL] A:240 [C] Aw:14 [ARG] A2:358 [C] ❌ 2VQE_L:11, 2VQE_A:240 no longer at interface
L:18 [VAL] A:561 [U] Aw:24 [ASP] A2:658 [U] ❌ 2VQE_A:561 no longer at interface
L:5 [PRO] A:566 [G] Aw:3 [LYS] A2:663 [G] ❌ 2VQE_A:566 no longer at interface
L:5 [PRO] A:565 [U] Aw:3 [LYS] A2:662 [U] ❌ 2VQE_A:565 no longer at interface
L:7 [ILE] A:565 [U] Aw:5 [ARG] A2:662 [U] ❌ 2VQE_A:565 no longer at interface
L:7 [ILE] A:877 [C] Aw:5 [ARG] A2:1159 [G] ❌ 2VQE_A:877 no longer at interface
L:7 [ILE] A:878 [G] Aw:5 [ARG] A2:1160 [G] ❌ 2VQE_A:878 no longer at interface
L:7 [ILE] A:876 [G] Aw:5 [ARG] A2:1158 [G] ❌ 2VQE_A:876 no longer at interface
L:51 [ALA] A:530 [G] Aw:64 [SER] A2:627 [G] ❌ 2VQE_A:530 no longer at interface
L:8 [ASN] A:586 [C] Aw:9 [THR] A2:683 [U] ❌ 2VQE_A:586 no longer at interface
L:24 [VAL] A:553 [A] Aw:39 [ASN] A2:650 [PSU] ❌ 7O7Y_Aw:39 no longer at interface
L:24 [VAL] A:554 [C] Aw:39 [ASN] A2:651 [A] ❌ 7O7Y_Aw:39 no longer at interface
L:69 [TYR] A:521 [G] Aw:83 [ALA] A2:618 [G] ❌ 7O7Y_Aw:83 no longer at interface
L:69 [TYR] A:522 [C] Aw:83 [ALA] A2:619 [C] ❌ 7O7Y_Aw:83 no longer at interface
L:99 [HIS] A:523 [A] Aw:120 [PHE] A2:620 [A] ❌ 7O7Y_Aw:120 no longer at interface
L:25 [PRO] A:910 [C] Aw:40 [PRO] A2:1192 [C] ❌ 7O7Y_Aw:40 no longer at interface
L:84 [LEU] A:34 [C] Aw:100 [VAL] A2:28 [U] ❌ 7O7Y_Aw:100 no longer at interface
L:84 [LEU] A:363 [A] Aw:100 [VAL] A2:484 [C] ❌ 7O7Y_Aw:100 no longer at interface
L:117 [ARG] A:35 [G] Aw:130 [LEU] A2:29 [G] ❌ 7O7Y_Aw:130 no longer at interface
L:117 [ARG] A:36 [C] Aw:130 [LEU] A2:30 [C] ❌ 7O7Y_Aw:130 no longer at interface
L:117 [ARG] A:37 [U] Aw:130 [LEU] A2:31 [U] ❌ 7O7Y_Aw:130 no longer at interface
L:117 [ARG] A:501 [C] Aw:130 [LEU] A2:597 [U] ❌ 7O7Y_Aw:130 no longer at interface
L:117 [ARG] A:502 [G] Aw:130 [LEU] A2:598 [G] ❌ 7O7Y_Aw:130 no longer at interface
L:101 [VAL] A:34 [C] Aw:122 [VAL] A2:28 [U] ❌ 7O7Y_Aw:122 no longer at interface
L:101 [VAL] A:35 [G] Aw:122 [VAL] A2:29 [G] ❌ 7O7Y_Aw:122 no longer at interface
L:97 [ARG] A:910 [C] Aw:118 [VAL] A2:1192 [C] ❌ 7O7Y_Aw:118 no longer at interface
L:97 [ARG] A:911 [U] Aw:118 [VAL] A2:1193 [U] ❌ 7O7Y_Aw:118 no longer at interface
L:45 [PRO] A:1492 [A] Aw:59 [ALA] A2:1825 [A] ❌ 7O7Y_Aw:59 no longer at interface
L:124 [LYS] A:36 [C] Aw:136 [GLY] A2:30 [C] ❌ 7O7Y_Aw:136 no longer at interface
L:124 [LYS] A:37 [U] Aw:136 [GLY] A2:31 [U] ❌ 7O7Y_Aw:136 no longer at interface
L:124 [LYS] A:501 [C] Aw:136 [GLY] A2:597 [U] ❌ 7O7Y_Aw:136 no longer at interface
L:71 [PRO] A:522 [C] Aw:85 [VAL] A2:619 [C] ❌ 7O7Y_Aw:85 no longer at interface
L:121 [GLY] A:35 [G] Aw:133 [LEU] A2:29 [G] ❌ 7O7Y_Aw:133 no longer at interface
L:121 [GLY] A:36 [C] Aw:133 [LEU] A2:30 [C] ❌ 7O7Y_Aw:133 no longer at interface
L:95 [GLY] A:911 [U] Aw:116 [PRO] A2:1193 [U] ❌ 7O7Y_Aw:116 no longer at interface
L:86 [ARG] A:551 [U] Aw:102 [VAL] A2:648 [U] ❌ 7O7Y_Aw:102 no longer at interface
L:86 [ARG] A:552 [U] Aw:102 [VAL] A2:649 [A] ❌ 7O7Y_Aw:102 no longer at interface
L:61 [THR] A:362 [G] Aw:74 [LEU] A2:483 [G] ❌ 7O7Y_Aw:74 no longer at interface
L:61 [THR] A:363 [A] Aw:74 [LEU] A2:484 [C] ❌ 7O7Y_Aw:74 no longer at interface
L:12 [ARG] A:880 [C] Aw:15 [SER] A2:1162 [U] ❌ 7O7Y_Aw:15 no longer at interface
L:12 [ARG] A:881 [G] Aw:15 [SER] A2:1163 [C] ❌ 7O7Y_Aw:15 no longer at interface
L:105 [TYR] A:363 [A] Aw:125 [VAL] A2:484 [C] ❌ 7O7Y_Aw:125 no longer at interface
L:105 [TYR] A:364 [A] Aw:125 [VAL] A2:485 [A2M] ❌ 7O7Y_Aw:125 no longer at interface
L:85 [ILE] A:363 [A] Aw:101 [LEU] A2:484 [C] ❌ 2VQE_L:85 no longer at interface
L:85 [ILE] A:34 [C] Aw:101 [LEU] A2:28 [U] ❌ 2VQE_L:85 no longer at interface
L:93 [LEU] A:528 [C] Aw:114 [ASP] A2:625 [C] ❌ 2VQE_L:93 no longer at interface
L:93 [LEU] A:527 [G] Aw:114 [ASP] A2:624 [G] ❌ 2VQE_L:93 no longer at interface
L:93 [LEU] A:522 [C] Aw:114 [ASP] A2:619 [C] ❌ 2VQE_L:93 no longer at interface
L:93 [LEU] A:523 [A] Aw:114 [ASP] A2:620 [A] ❌ 2VQE_L:93 no longer at interface
L:96 [VAL] A:911 [U] Aw:117 [GLY] A2:1193 [U] ❌ 2VQE_L:96 no longer at interface
L:96 [VAL] A:912 [C] Aw:117 [GLY] A2:1194 [U] ❌ 2VQE_L:96 no longer at interface
L:98 [TYR] A:911 [U] Aw:119 [ARG] A2:1193 [U] ❌ 2VQE_L:98 no longer at interface
L:98 [TYR] A:912 [C] Aw:119 [ARG] A2:1194 [U] ❌ 2VQE_L:98 no longer at interface
L:98 [TYR] A:910 [C] Aw:119 [ARG] A2:1192 [C] ❌ 2VQE_L:98 no longer at interface
L:100 [ILE] A:551 [U] Aw:121 [LYS] A2:648 [U] ❌ 2VQE_L:100 no longer at interface
L:100 [ILE] A:552 [U] Aw:121 [LYS] A2:649 [A] ❌ 2VQE_L:100 no longer at interface
L:109 [GLY] A:36 [C] Aw:129 [SER] A2:30 [C] ❌ 2VQE_L:109 no longer at interface
L:109 [GLY] A:35 [G] Aw:129 [SER] A2:29 [G] ❌ 2VQE_L:109 no longer at interface
L:125 [PRO] A:36 [C] Aw:137 [LYS] A2:30 [C] ❌ 2VQE_L:125 no longer at interface
L:125 [PRO] A:37 [U] Aw:137 [LYS] A2:31 [U] ❌ 2VQE_L:125 no longer at interface
L:125 [PRO] A:501 [C] Aw:137 [LYS] A2:597 [U] ❌ 2VQE_L:125 no longer at interface
L:55 [VAL] A:521 [G] Aw:68 [LYS] A2:618 [G] ❌ 2VQE_L:55 no longer at interface
L:55 [VAL] A:519 [C] Aw:68 [LYS] A2:616 [C] ❌ 2VQE_L:55 no longer at interface
L:55 [VAL] A:520 [A] Aw:68 [LYS] A2:617 [A] ❌ 2VQE_L:55 no longer at interface
L:62 [SER] A:362 [G] Aw:75 [ILE] A2:483 [G] ❌ 2VQE_L:62 no longer at interface
L:63 [GLY] A:363 [A] Aw:76 [LYS] A2:484 [C] ❌ 2VQE_L:63 no longer at interface
L:63 [GLY] A:362 [G] Aw:76 [LYS] A2:483 [G] ❌ 2VQE_L:63 no longer at interface
L:70 [ILE] A:522 [C] Aw:84 [PHE] A2:619 [C] ❌ 2VQE_L:70 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Nucleic acid-binding proteins 0.92 4.13 0.12 0.69 0.92 0.62 0.76 0.33 0.23 0.07 0.45


Other pairs involving 2VQE_L_A or 7O7Y_Aw_A2

Total number of entries: 11

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
2VQE_L_A 6S0X_l_a 0.80 0.96 2.89 0.62 Nucleic acid-binding proteins Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
2VQE_L_A 7RYG_l_a 0.78 0.93 3.16 0.66 Nucleic acid-binding proteins Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
2VQE_L_A 4W2F_AL_AA 0.95 0.99 0.86 0.97 Nucleic acid-binding proteins Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
2VQE_L_A 7PJS_l_a 0.90 0.97 1.1 0.73 Nucleic acid-binding proteins Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
2VQE_L_A 7K00_L_A 0.91 0.97 0.91 0.72 Nucleic acid-binding proteins Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
2VQE_L_A 7O7Y_Aw_A2 0.33 0.92 4.13 0.12 Nucleic acid-binding proteins compare
2VQE_L_A 4Y4O_1l_1a 0.93 0.99 0.99 0.95 Nucleic acid-binding proteins Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
4W2F_AL_AA 7O7Y_Aw_A2 0.34 0.93 4.24 0.12 Nucleic acid-binding proteins compare
4Y4O_1l_1a 7O7Y_Aw_A2 0.34 0.93 4.24 0.12 Nucleic acid-binding proteins compare
6S0X_l_a 7O7Y_Aw_A2 0.41 0.89 4.85 0.08 Nucleic acid-binding proteins compare
7K00_L_A 7O7Y_Aw_A2 0.31 0.91 4.35 0.08 Nucleic acid-binding proteins compare