Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
2VQE_L
|
2VQE_A
|
7PJS_l
|
7PJS_a
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
L:24 [VAL] | A:553 [A] | l:20 [VAL] | a:553 [A] | ✔ |
L:24 [VAL] | A:554 [C] | l:20 [VAL] | a:554 [A] | ✔ |
L:112 [ASP] | A:538 [G] | l:108 [ASP] | a:538 [G] | ✔ |
L:30 [ALA] | A:363 [A] | l:26 [CYS] | a:363 [A] | ✔ |
L:30 [ALA] | A:553 [A] | l:26 [CYS] | a:553 [A] | ✔ |
L:115 [LYS] | A:503 [C] | l:111 [GLN] | a:503 [C] | ✔ |
L:115 [LYS] | A:538 [G] | l:111 [GLN] | a:538 [G] | ✔ |
L:115 [LYS] | A:539 [A] | l:111 [GLN] | a:539 [A] | ✔ |
L:5 [PRO] | A:567 [G] | l:1 [ALA] | a:567 [G] | ✔ |
L:5 [PRO] | A:568 [G] | l:1 [ALA] | a:568 [G] | ✔ |
L:5 [PRO] | A:882 [C] | l:1 [ALA] | a:882 [C] | ✔ |
L:5 [PRO] | A:883 [C] | l:1 [ALA] | a:883 [C] | ✔ |
L:88 [GLY] | A:552 [U] | l:84 [GLY] | a:552 [U] | ✔ |
L:88 [GLY] | A:553 [A] | l:84 [GLY] | a:553 [A] | ✔ |
L:74 [GLY] | A:521 [G] | l:70 [GLY] | a:521 [G] | ✔ |
L:69 [TYR] | A:521 [G] | l:65 [TYR] | a:521 [G] | ✔ |
L:69 [TYR] | A:522 [C] | l:65 [TYR] | a:522 [C] | ✔ |
L:118 [SER] | A:35 [G] | l:114 [SER] | a:35 [G] | ✔ |
L:118 [SER] | A:36 [C] | l:114 [SER] | a:36 [C] | ✔ |
L:118 [SER] | A:501 [C] | l:114 [SER] | a:501 [C] | ✔ |
L:118 [SER] | A:502 [G] | l:114 [SER] | a:502 [A] | ✔ |
L:118 [SER] | A:550 [G] | l:114 [SER] | a:550 [G] | ✔ |
L:57 [LYS] | A:1412 [C] | l:53 [ARG] | a:1412 [C] | ✔ |
L:8 [ASN] | A:585 [G] | l:4 [ASN] | a:585 [G] | ✔ |
L:8 [ASN] | A:879 [C] | l:4 [ASN] | a:879 [C] | ✔ |
L:8 [ASN] | A:880 [C] | l:4 [ASN] | a:880 [C] | ✔ |
L:113 [ARG] | A:536 [C] | l:109 [ARG] | a:536 [C] | ✔ |
L:113 [ARG] | A:537 [G] | l:109 [ARG] | a:537 [G] | ✔ |
L:113 [ARG] | A:538 [G] | l:109 [ARG] | a:538 [G] | ✔ |
L:99 [HIS] | A:523 [A] | l:95 [HIS] | a:523 [A] | ✔ |
L:25 [PRO] | A:910 [C] | l:21 [PRO] | a:910 [C] | ✔ |
L:21 [LYS] | A:909 [A] | l:17 [LYS] | a:909 [A] | ✔ |
L:91 [LYS] | A:523 [A] | l:87 [LYS] | a:523 [A] | ✔ |
L:91 [LYS] | A:525 [C] | l:87 [LYS] | a:525 [C] | ✔ |
L:91 [LYS] | A:526 [C] | l:87 [LYS] | a:526 [C] | ✔ |
L:91 [LYS] | A:912 [C] | l:87 [LYS] | a:912 [C] | ✔ |
L:91 [LYS] | A:913 [A] | l:87 [LYS] | a:913 [A] | ✔ |
L:53 [ARG] | A:521 [G] | l:49 [ARG] | a:521 [G] | ✔ |
L:53 [ARG] | A:522 [C] | l:49 [ARG] | a:522 [C] | ✔ |
L:53 [ARG] | A:523 [A] | l:49 [ARG] | a:523 [A] | ✔ |
L:53 [ARG] | A:528 [C] | l:49 [ARG] | a:528 [C] | ✔ |
L:53 [ARG] | A:529 [G] | l:49 [ARG] | a:529 [G] | ✔ |
L:22 [SER] | A:554 [C] | l:18 [SER] | a:554 [A] | ✔ |
L:84 [LEU] | A:34 [C] | l:80 [LEU] | a:34 [C] | ✔ |
L:84 [LEU] | A:363 [A] | l:80 [LEU] | a:363 [A] | ✔ |
L:44 [THR] | A:1491 [G] | l:40 [THR] | a:1491 [G] | ✔ |
L:117 [ARG] | A:35 [G] | l:113 [ARG] | a:35 [G] | ✔ |
L:117 [ARG] | A:36 [C] | l:113 [ARG] | a:36 [C] | ✔ |
L:117 [ARG] | A:37 [U] | l:113 [ARG] | a:37 [U] | ✔ |
L:117 [ARG] | A:500 [G] | l:113 [ARG] | a:500 [G] | ✔ |
L:117 [ARG] | A:501 [C] | l:113 [ARG] | a:501 [C] | ✔ |
L:117 [ARG] | A:502 [G] | l:113 [ARG] | a:502 [A] | ✔ |
L:101 [VAL] | A:34 [C] | l:97 [VAL] | a:34 [C] | ✔ |
L:101 [VAL] | A:35 [G] | l:97 [VAL] | a:35 [G] | ✔ |
L:97 [ARG] | A:910 [C] | l:93 [ARG] | a:910 [C] | ✔ |
L:97 [ARG] | A:911 [U] | l:93 [ARG] | a:911 [U] | ✔ |
L:45 [PRO] | A:1491 [G] | l:41 [PRO] | a:1491 [G] | ✔ |
L:45 [PRO] | A:1492 [A] | l:41 [PRO] | a:1492 [A] | ✔ |
L:72 [GLY] | A:521 [G] | l:68 [GLY] | a:521 [G] | ✔ |
L:72 [GLY] | A:522 [C] | l:68 [GLY] | a:522 [C] | ✔ |
L:33 [ARG] | A:362 [G] | l:29 [LYS] | a:362 [G] | ✔ |
L:33 [ARG] | A:363 [A] | l:29 [LYS] | a:363 [A] | ✔ |
L:9 [GLN] | A:880 [C] | l:5 [GLN] | a:880 [C] | ✔ |
L:9 [GLN] | A:881 [G] | l:5 [GLN] | a:881 [G] | ✔ |
L:9 [GLN] | A:882 [C] | l:5 [GLN] | a:882 [C] | ✔ |
L:94 [PRO] | A:911 [U] | l:90 [PRO] | a:911 [U] | ✔ |
L:94 [PRO] | A:912 [C] | l:90 [PRO] | a:912 [C] | ✔ |
L:94 [PRO] | A:1490 [C] | l:90 [PRO] | a:1490 [U] | ✔ |
L:94 [PRO] | A:1491 [G] | l:90 [PRO] | a:1491 [G] | ✔ |
L:17 [LYS] | A:302 [G] | l:13 [ARG] | a:302 [G] | ✔ |
L:17 [LYS] | A:303 [A] | l:13 [ARG] | a:303 [A] | ✔ |
L:17 [LYS] | A:562 [C] | l:13 [ARG] | a:562 [U] | ✔ |
L:48 [PRO] | A:518 [C] | l:44 [PRO] | a:518 [C] | ✔ |
L:48 [PRO] | A:529 [G] | l:44 [PRO] | a:529 [G] | ✔ |
L:34 [ARG] | A:362 [G] | l:30 [ARG] | a:362 [G] | ✔ |
L:34 [ARG] | A:363 [A] | l:30 [ARG] | a:363 [A] | ✔ |
L:6 [THR] | A:879 [C] | l:2 [THR] | a:879 [C] | ✔ |
L:6 [THR] | A:880 [C] | l:2 [THR] | a:880 [C] | ✔ |
L:124 [LYS] | A:36 [C] | l:120 [ARG] | a:36 [C] | ✔ |
L:124 [LYS] | A:37 [U] | l:120 [ARG] | a:37 [U] | ✔ |
L:124 [LYS] | A:500 [G] | l:120 [ARG] | a:500 [G] | ✔ |
L:124 [LYS] | A:501 [C] | l:120 [ARG] | a:501 [C] | ✔ |
L:10 [LEU] | A:564 [C] | l:6 [LEU] | a:564 [C] | ✔ |
L:50 [SER] | A:518 [C] | l:46 [SER] | a:518 [C] | ✔ |
L:50 [SER] | A:519 [C] | l:46 [SER] | a:519 [C] | ✔ |
L:50 [SER] | A:529 [G] | l:46 [SER] | a:529 [G] | ✔ |
L:50 [SER] | A:1492 [A] | l:46 [SER] | a:1492 [A] | ✔ |
L:29 [GLY] | A:553 [A] | l:25 [ALA] | a:553 [A] | ✔ |
L:104 [VAL] | A:34 [C] | l:100 [ALA] | a:34 [C] | ✔ |
L:104 [VAL] | A:35 [G] | l:100 [ALA] | a:35 [G] | ✔ |
L:122 [THR] | A:35 [G] | l:118 [VAL] | a:35 [G] | ✔ |
L:122 [THR] | A:36 [C] | l:118 [VAL] | a:36 [C] | ✔ |
L:71 [PRO] | A:522 [C] | l:67 [GLY] | a:522 [C] | ✔ |
L:54 [LYS] | A:520 [A] | l:50 [LYS] | a:520 [A] | ✔ |
L:54 [LYS] | A:521 [G] | l:50 [LYS] | a:521 [G] | ✔ |
L:103 [GLY] | A:35 [G] | l:99 [GLY] | a:35 [G] | ✔ |
L:114 [LYS] | A:537 [G] | l:110 [LYS] | a:537 [G] | ✔ |
L:114 [LYS] | A:538 [G] | l:110 [LYS] | a:538 [G] | ✔ |
L:114 [LYS] | A:539 [A] | l:110 [LYS] | a:539 [A] | ✔ |
L:87 [GLY] | A:552 [U] | l:83 [GLY] | a:552 [U] | ✔ |
L:87 [GLY] | A:553 [A] | l:83 [GLY] | a:553 [A] | ✔ |
L:51 [ALA] | A:519 [C] | l:47 [ALA] | a:519 [C] | ✔ |
L:51 [ALA] | A:520 [A] | l:47 [ALA] | a:520 [A] | ✔ |
L:51 [ALA] | A:521 [G] | l:47 [ALA] | a:521 [G] | ✔ |
L:51 [ALA] | A:529 [G] | l:47 [ALA] | a:529 [G] | ✔ |
L:47 [LYS] | A:1491 [G] | l:43 [LYS] | a:1491 [G] | ✔ |
L:47 [LYS] | A:1492 [A] | l:43 [LYS] | a:1492 [A] | ✔ |
L:32 [PHE] | A:33 [A] | l:28 [GLN] | a:33 [A] | ✔ |
L:32 [PHE] | A:34 [C] | l:28 [GLN] | a:34 [C] | ✔ |
L:32 [PHE] | A:363 [A] | l:28 [GLN] | a:363 [A] | ✔ |
L:32 [PHE] | A:551 [U] | l:28 [GLN] | a:551 [U] | ✔ |
L:32 [PHE] | A:552 [U] | l:28 [GLN] | a:552 [U] | ✔ |
L:121 [GLY] | A:35 [G] | l:117 [GLY] | a:35 [G] | ✔ |
L:121 [GLY] | A:36 [C] | l:117 [GLY] | a:36 [C] | ✔ |
L:116 [SER] | A:502 [G] | l:112 [ALA] | a:502 [A] | ✔ |
L:116 [SER] | A:503 [C] | l:112 [ALA] | a:503 [C] | ✔ |
L:49 [ASN] | A:518 [C] | l:45 [ASN] | a:518 [C] | ✔ |
L:49 [ASN] | A:521 [G] | l:45 [ASN] | a:521 [G] | ✔ |
L:49 [ASN] | A:522 [C] | l:45 [ASN] | a:522 [C] | ✔ |
L:49 [ASN] | A:523 [A] | l:45 [ASN] | a:523 [A] | ✔ |
L:49 [ASN] | A:527 [G] | l:45 [ASN] | a:527 [G7M] | ✔ |
L:49 [ASN] | A:528 [C] | l:45 [ASN] | a:528 [C] | ✔ |
L:49 [ASN] | A:529 [G] | l:45 [ASN] | a:529 [G] | ✔ |
L:95 [GLY] | A:911 [U] | l:91 [GLY] | a:911 [U] | ✔ |
L:123 [LYS] | A:36 [C] | l:119 [LYS] | a:36 [C] | ✔ |
L:123 [LYS] | A:37 [U] | l:119 [LYS] | a:37 [U] | ✔ |
L:73 [GLU] | A:520 [A] | l:69 [GLU] | a:520 [A] | ✔ |
L:73 [GLU] | A:521 [G] | l:69 [GLU] | a:521 [G] | ✔ |
L:73 [GLU] | A:537 [G] | l:69 [GLU] | a:537 [G] | ✔ |
L:119 [LYS] | A:35 [G] | l:115 [LYS] | a:35 [G] | ✔ |
L:119 [LYS] | A:502 [G] | l:115 [LYS] | a:502 [A] | ✔ |
L:119 [LYS] | A:503 [C] | l:115 [LYS] | a:503 [C] | ✔ |
L:119 [LYS] | A:550 [G] | l:115 [LYS] | a:550 [G] | ✔ |
L:119 [LYS] | A:551 [U] | l:115 [LYS] | a:551 [U] | ✔ |
L:65 [GLU] | A:1413 [A] | l:61 [GLU] | a:1413 [A] | ✔ |
L:16 [GLU] | A:562 [C] | l:12 [ALA] | a:562 [U] | ✔ |
L:52 [LEU] | A:519 [C] | l:48 [LEU] | a:519 [C] | ✔ |
L:52 [LEU] | A:520 [A] | l:48 [LEU] | a:520 [A] | ✔ |
L:52 [LEU] | A:521 [G] | l:48 [LEU] | a:521 [G] | ✔ |
L:46 [LYS] | A:912 [C] | l:42 [LYS] | a:912 [C] | ✔ |
L:46 [LYS] | A:913 [A] | l:42 [LYS] | a:913 [A] | ✔ |
L:46 [LYS] | A:1491 [G] | l:42 [LYS] | a:1491 [G] | ✔ |
L:46 [LYS] | A:1492 [A] | l:42 [LYS] | a:1492 [A] | ✔ |
L:31 [PRO] | A:32 [A] | l:27 [PRO] | a:32 [A] | ✔ |
L:31 [PRO] | A:33 [A] | l:27 [PRO] | a:33 [A] | ✔ |
L:31 [PRO] | A:363 [A] | l:27 [PRO] | a:363 [A] | ✔ |
L:31 [PRO] | A:552 [U] | l:27 [PRO] | a:552 [U] | ✔ |
L:31 [PRO] | A:553 [A] | l:27 [PRO] | a:553 [A] | ✔ |
L:92 [ASP] | A:522 [C] | l:88 [ASP] | a:522 [C] | ✔ |
L:92 [ASP] | A:523 [A] | l:88 [ASP] | a:523 [A] | ✔ |
L:15 [ARG] | A:562 [C] | l:11 [ARG] | a:562 [U] | ✔ |
L:15 [ARG] | A:563 [A] | l:11 [ARG] | a:563 [A] | ✔ |
L:15 [ARG] | A:564 [C] | l:11 [ARG] | a:564 [C] | ✔ |
L:15 [ARG] | A:567 [G] | l:11 [ARG] | a:567 [G] | ✔ |
L:15 [ARG] | A:883 [C] | l:11 [ARG] | a:883 [C] | ✔ |
L:15 [ARG] | A:884 [U] | l:11 [ARG] | a:884 [U] | ✔ |
L:90 [VAL] | A:523 [A] | l:86 [VAL] | a:523 [A] | ✔ |
L:89 [ARG] | A:524 [G] | l:85 [ARG] | a:524 [G] | ✔ |
L:89 [ARG] | A:525 [C] | l:85 [ARG] | a:525 [C] | ✔ |
L:89 [ARG] | A:912 [C] | l:85 [ARG] | a:912 [C] | ✔ |
L:89 [ARG] | A:913 [A] | l:85 [ARG] | a:913 [A] | ✔ |
L:86 [ARG] | A:551 [U] | l:82 [ARG] | a:551 [U] | ✔ |
L:86 [ARG] | A:552 [U] | l:82 [ARG] | a:552 [U] | ✔ |
L:61 [THR] | A:362 [G] | l:57 [THR] | a:362 [G] | ✔ |
L:61 [THR] | A:363 [A] | l:57 [THR] | a:363 [A] | ✔ |
L:12 [ARG] | A:880 [C] | l:8 [ARG] | a:880 [C] | ✔ |
L:12 [ARG] | A:881 [G] | l:8 [ARG] | a:881 [G] | ✔ |
L:18 [VAL] | A:562 [C] | l:14 [LYS] | a:562 [U] | ✔ |
L:120 [TYR] | A:522 [C] | l:116 [TYR] | a:522 [C] | ✔ |
L:120 [TYR] | A:523 [A] | l:116 [TYR] | a:523 [A] | ✔ |
L:120 [TYR] | A:537 [G] | l:116 [TYR] | a:537 [G] | ✔ |
L:115 [LYS] | A:502 [G] | l:111 [GLN] | a:502 [A] | ❌ 7PJS_l_a |
L:115 [LYS] | A:537 [G] | l:111 [GLN] | a:537 [G] | ❌ 7PJS_l_a |
L:57 [LYS] | A:1411 [C] | l:53 [ARG] | a:1411 [C] | ❌ 7PJS_l_a |
L:46 [LYS] | A:1490 [C] | l:42 [LYS] | a:1490 [U] | ❌ 7PJS_l_a |
L:92 [ASP] | A:527 [G] | l:88 [ASP] | a:527 [G7M] | ❌ 7PJS_l_a |
L:92 [ASP] | A:528 [C] | l:88 [ASP] | a:528 [C] | ❌ 7PJS_l_a |
L:5 [PRO] | A:564 [C] | l:1 [ALA] | a:564 [C] | ❌ 2VQE_L_A |
L:112 [ASP] | A:537 [G] | l:108 [ASP] | a:537 [G] | ❌ 2VQE_L_A |
L:119 [LYS] | A:523 [A] | l:115 [LYS] | a:523 [A] | ❌ 2VQE_L_A |
L:120 [TYR] | A:35 [G] | l:116 [TYR] | a:35 [G] | ❌ 2VQE_L_A |
L:17 [LYS] | A:563 [A] | l:13 [ARG] | a:563 [A] | ❌ 2VQE_L_A |
L:18 [VAL] | A:884 [U] | l:14 [LYS] | a:884 [U] | ❌ 2VQE_L_A |
L:18 [VAL] | A:23 [C] | l:14 [LYS] | a:23 [C] | ❌ 2VQE_L_A |
L:21 [LYS] | A:911 [U] | l:17 [LYS] | a:911 [U] | ❌ 2VQE_L_A |
L:21 [LYS] | A:910 [C] | l:17 [LYS] | a:910 [C] | ❌ 2VQE_L_A |
L:29 [GLY] | A:554 [C] | l:25 [ALA] | a:554 [A] | ❌ 2VQE_L_A |
L:29 [GLY] | A:363 [A] | l:25 [ALA] | a:363 [A] | ❌ 2VQE_L_A |
L:30 [ALA] | A:552 [U] | l:26 [CYS] | a:552 [U] | ❌ 2VQE_L_A |
L:48 [PRO] | A:527 [G] | l:44 [PRO] | a:527 [G7M] | ❌ 2VQE_L_A |
L:51 [ALA] | A:518 [C] | l:47 [ALA] | a:518 [C] | ❌ 2VQE_L_A |
L:57 [LYS] | A:1413 [A] | l:53 [ARG] | a:1413 [A] | ❌ 2VQE_L_A |
L:73 [GLU] | A:536 [C] | l:69 [GLU] | a:536 [C] | ❌ 2VQE_L_A |
L:12 [ARG] | A:879 [C] | l:8 [ARG] | a:879 [C] | ❌ 2VQE_L_A |
L:91 [LYS] | A:527 [G] | l:87 [LYS] | a:527 [G7M] | ❌ 2VQE_L_A |
L:95 [GLY] | A:912 [C] | l:91 [GLY] | a:912 [C] | ❌ 2VQE_L_A |
L:97 [ARG] | A:909 [A] | l:93 [ARG] | a:909 [A] | ❌ 2VQE_L_A |
L:103 [GLY] | A:36 [C] | l:99 [GLY] | a:36 [C] | ❌ 2VQE_L_A |
L:19 [ARG] | A:241 [C] | l:15 [VAL] | a:241 [G] | ❌ 7PJS_l:15, 7PJS_a:241 no longer at interface |
L:23 [LYS] | A:24 [U] | l:19 [ASN] | a:24 [U] | ❌ 7PJS_l:19, 7PJS_a:24 no longer at interface |
L:115 [LYS] | A:540 [G] | l:111 [GLN] | a:540 [G] | ❌ 7PJS_a:540 no longer at interface |
L:115 [LYS] | A:541 [G] | l:111 [GLN] | a:541 [G] | ❌ 7PJS_a:541 no longer at interface |
L:21 [LYS] | A:908 [A] | l:17 [LYS] | a:908 [A] | ❌ 7PJS_a:908 no longer at interface |
L:20 [LYS] | A:555 [C] | l:16 [ALA] | a:555 [U] | ❌ 7PJS_l:16, 7PJS_a:555 no longer at interface |
L:20 [LYS] | A:556 [C] | l:16 [ALA] | a:556 [C] | ❌ 7PJS_l:16, 7PJS_a:556 no longer at interface |
L:16 [GLU] | A:242 [C] | l:12 [ALA] | a:242 [G] | ❌ 7PJS_a:242 no longer at interface |
L:28 [LYS] | A:48 [C] | l:24 [GLU] | a:48 [C] | ❌ 7PJS_l:24, 7PJS_a:48 no longer at interface |
L:28 [LYS] | A:49 [U] | l:24 [GLU] | a:49 [U] | ❌ 7PJS_l:24, 7PJS_a:49 no longer at interface |
L:28 [LYS] | A:364 [A] | l:24 [GLU] | a:364 [A] | ❌ 7PJS_l:24, 7PJS_a:364 no longer at interface |
L:105 [TYR] | A:364 [A] | l:101 [LEU] | a:364 [A] | ❌ 7PJS_l:101, 7PJS_a:364 no longer at interface |
L:17 [LYS] | A:301 [G] | l:13 [ARG] | a:301 [G] | ❌ 2VQE_A:301 no longer at interface |
L:18 [VAL] | A:22 [G] | l:14 [LYS] | a:22 [G] | ❌ 2VQE_A:22 no longer at interface |
L:18 [VAL] | A:885 [G] | l:14 [LYS] | a:885 [G] | ❌ 2VQE_A:885 no longer at interface |
L:18 [VAL] | A:561 [U] | l:14 [LYS] | a:561 [U] | ❌ 2VQE_A:561 no longer at interface |
L:34 [ARG] | A:361 [G] | l:30 [ARG] | a:361 [G] | ❌ 2VQE_A:361 no longer at interface |
L:8 [ASN] | A:584 [G] | l:4 [ASN] | a:584 [G] | ❌ 2VQE_A:584 no longer at interface |
L:47 [LYS] | A:1493 [A] | l:43 [LYS] | a:1493 [A] | ❌ 2VQE_A:1493 no longer at interface |
L:12 [ARG] | A:759 [A] | l:8 [ARG] | a:759 [A] | ❌ 2VQE_A:759 no longer at interface |
L:23 [LYS] | A:23 [C] | l:19 [ASN] | a:23 [C] | ❌ 7PJS_l:19 no longer at interface |
L:23 [LYS] | A:554 [C] | l:19 [ASN] | a:554 [A] | ❌ 7PJS_l:19 no longer at interface |
L:41 [ARG] | A:1411 [C] | l:37 [TYR] | a:1411 [C] | ❌ 7PJS_l:37 no longer at interface |
L:7 [ILE] | A:564 [C] | l:3 [VAL] | a:564 [C] | ❌ 7PJS_l:3 no longer at interface |
L:28 [LYS] | A:362 [G] | l:24 [GLU] | a:362 [G] | ❌ 7PJS_l:24 no longer at interface |
L:28 [LYS] | A:363 [A] | l:24 [GLU] | a:363 [A] | ❌ 7PJS_l:24 no longer at interface |
L:13 [LYS] | A:881 [G] | l:9 [LYS] | a:881 [G] | ❌ 7PJS_l:9 no longer at interface |
L:13 [LYS] | A:882 [C] | l:9 [LYS] | a:882 [C] | ❌ 7PJS_l:9 no longer at interface |
L:105 [TYR] | A:363 [A] | l:101 [LEU] | a:363 [A] | ❌ 7PJS_l:101 no longer at interface |
L:14 [GLY] | A:562 [C] | l:10 [PRO] | a:562 [U] | ❌ 7PJS_l:10 no longer at interface |
L:27 [LEU] | A:553 [A] | l:23 [LEU] | a:553 [A] | ❌ 2VQE_L:27 no longer at interface |
L:27 [LEU] | A:552 [U] | l:23 [LEU] | a:552 [U] | ❌ 2VQE_L:27 no longer at interface |
L:39 [VAL] | A:1411 [C] | l:35 [ARG] | a:1411 [C] | ❌ 2VQE_L:39 no longer at interface |
L:96 [VAL] | A:911 [U] | l:92 [VAL] | a:911 [U] | ❌ 2VQE_L:96 no longer at interface |
L:102 [ARG] | A:35 [G] | l:98 [ARG] | a:35 [G] | ❌ 2VQE_L:102 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Nucleic acid-binding proteins | Bacterial small subunit ribosomal RNA | 0.97 | 1.1 | 0.73 | 0.96 | 0.97 | 0.94 | 0.88 | 0.90 | 0.84 | 0.50 | 0.56 |
Other pairs involving 2VQE_L_A or 7PJS_l_a
Total number of entries: 12