Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
4W2F_AL
|
4W2F_AA
|
6S0X_l
|
6S0X_a
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
AL:104 [VAL] | AA:34 [C] | l:114 [ALA] | a:35 [C] | ✔ |
AL:104 [VAL] | AA:35 [G] | l:114 [ALA] | a:36 [G] | ✔ |
AL:24 [VAL] | AA:553 [A] | l:21 [SER] | a:561 [A] | ✔ |
AL:23 [LYS] | AA:554 [C] | l:20 [ASP] | a:562 [U] | ✔ |
AL:112 [ASP] | AA:538 [G] | l:122 [GLY] | a:546 [U] | ✔ |
AL:30 [ALA] | AA:363 [A] | l:40 [SER] | a:371 [A] | ✔ |
AL:30 [ALA] | AA:553 [A] | l:40 [SER] | a:561 [A] | ✔ |
AL:115 [LYS] | AA:538 [G] | l:125 [GLN] | a:546 [U] | ✔ |
AL:115 [LYS] | AA:539 [A] | l:125 [GLN] | a:547 [A] | ✔ |
AL:5 [PRO] | AA:567 [G] | l:2 [PRO] | a:575 [G] | ✔ |
AL:5 [PRO] | AA:568 [G] | l:2 [PRO] | a:576 [G] | ✔ |
AL:88 [GLY] | AA:552 [U] | l:98 [GLY] | a:560 [U] | ✔ |
AL:88 [GLY] | AA:553 [A] | l:98 [GLY] | a:561 [A] | ✔ |
AL:69 [TYR] | AA:521 [G] | l:79 [TYR] | a:529 [G] | ✔ |
AL:69 [TYR] | AA:522 [C] | l:79 [TYR] | a:530 [C] | ✔ |
AL:118 [SER] | AA:35 [G] | l:128 [SER] | a:36 [G] | ✔ |
AL:118 [SER] | AA:36 [C] | l:128 [SER] | a:37 [C] | ✔ |
AL:118 [SER] | AA:501 [C] | l:128 [SER] | a:509 [C] | ✔ |
AL:118 [SER] | AA:502 [G] | l:128 [SER] | a:510 [C] | ✔ |
AL:118 [SER] | AA:550 [G] | l:128 [SER] | a:558 [G] | ✔ |
AL:57 [LYS] | AA:1412 [C] | l:67 [ARG] | a:1422 [C] | ✔ |
AL:8 [ASN] | AA:585 [G] | l:5 [ASN] | a:593 [G] | ✔ |
AL:8 [ASN] | AA:879 [C] | l:5 [ASN] | a:888 [C] | ✔ |
AL:8 [ASN] | AA:880 [C] | l:5 [ASN] | a:889 [C] | ✔ |
AL:113 [ARG] | AA:537 [G] | l:123 [ARG] | a:545 [G] | ✔ |
AL:113 [ARG] | AA:538 [G] | l:123 [ARG] | a:546 [U] | ✔ |
AL:25 [PRO] | AA:910 [C] | l:22 [PRO] | a:919 [C] | ✔ |
AL:21 [LYS] | AA:909 [A] | l:18 [LYS] | a:918 [A] | ✔ |
AL:91 [LYS] | AA:523 [A] | l:101 [LYS] | a:531 [A] | ✔ |
AL:91 [LYS] | AA:525 [C] | l:101 [LYS] | a:533 [C] | ✔ |
AL:91 [LYS] | AA:526 [C] | l:101 [LYS] | a:534 [C] | ✔ |
AL:53 [ARG] | AA:521 [G] | l:63 [ARG] | a:529 [G] | ✔ |
AL:53 [ARG] | AA:522 [C] | l:63 [ARG] | a:530 [C] | ✔ |
AL:53 [ARG] | AA:523 [A] | l:63 [ARG] | a:531 [A] | ✔ |
AL:22 [SER] | AA:554 [C] | l:19 [SER] | a:562 [U] | ✔ |
AL:84 [LEU] | AA:363 [A] | l:94 [LEU] | a:371 [A] | ✔ |
AL:117 [ARG] | AA:501 [C] | l:127 [ARG] | a:509 [C] | ✔ |
AL:117 [ARG] | AA:502 [G] | l:127 [ARG] | a:510 [C] | ✔ |
AL:101 [VAL] | AA:34 [C] | l:111 [VAL] | a:35 [C] | ✔ |
AL:97 [ARG] | AA:910 [C] | l:107 [ARG] | a:919 [C] | ✔ |
AL:97 [ARG] | AA:911 [U] | l:107 [ARG] | a:920 [U] | ✔ |
AL:72 [GLY] | AA:521 [G] | l:82 [GLY] | a:529 [G] | ✔ |
AL:72 [GLY] | AA:522 [C] | l:82 [GLY] | a:530 [C] | ✔ |
AL:33 [ARG] | AA:362 [G] | l:43 [LYS] | a:370 [G] | ✔ |
AL:33 [ARG] | AA:363 [A] | l:43 [LYS] | a:371 [A] | ✔ |
AL:9 [GLN] | AA:880 [C] | l:6 [GLN] | a:889 [C] | ✔ |
AL:9 [GLN] | AA:881 [G] | l:6 [GLN] | a:890 [G] | ✔ |
AL:9 [GLN] | AA:882 [C] | l:6 [GLN] | a:891 [C] | ✔ |
AL:94 [PRO] | AA:912 [C] | l:104 [PRO] | a:921 [C] | ✔ |
AL:94 [PRO] | AA:1490 [C] | l:104 [PRO] | a:1501 [U] | ✔ |
AL:94 [PRO] | AA:1491 [G] | l:104 [PRO] | a:1502 [G] | ✔ |
AL:17 [LYS] | AA:562 [C] | l:14 [SER] | a:570 [U] | ✔ |
AL:48 [PRO] | AA:518 [C] | l:58 [PRO] | a:526 [C] | ✔ |
AL:6 [THR] | AA:879 [C] | l:3 [THR] | a:888 [C] | ✔ |
AL:6 [THR] | AA:880 [C] | l:3 [THR] | a:889 [C] | ✔ |
AL:124 [LYS] | AA:36 [C] | l:133 [LYS] | a:37 [C] | ✔ |
AL:124 [LYS] | AA:37 [U] | l:133 [LYS] | a:38 [U] | ✔ |
AL:10 [LEU] | AA:564 [C] | l:7 [LEU] | a:572 [U] | ✔ |
AL:50 [SER] | AA:518 [C] | l:60 [SER] | a:526 [C] | ✔ |
AL:50 [SER] | AA:519 [C] | l:60 [SER] | a:527 [C] | ✔ |
AL:50 [SER] | AA:529 [G] | l:60 [SER] | a:537 [G] | ✔ |
AL:29 [GLY] | AA:553 [A] | l:39 [ASN] | a:561 [A] | ✔ |
AL:122 [THR] | AA:36 [C] | l:131 [GLY] | a:37 [C] | ✔ |
AL:71 [PRO] | AA:522 [C] | l:81 [PRO] | a:530 [C] | ✔ |
AL:102 [ARG] | AA:35 [G] | l:112 [ARG] | a:36 [G] | ✔ |
AL:54 [LYS] | AA:520 [A] | l:64 [LYS] | a:528 [A] | ✔ |
AL:54 [LYS] | AA:521 [G] | l:64 [LYS] | a:529 [G] | ✔ |
AL:103 [GLY] | AA:35 [G] | l:113 [GLY] | a:36 [G] | ✔ |
AL:103 [GLY] | AA:36 [C] | l:113 [GLY] | a:37 [C] | ✔ |
AL:114 [LYS] | AA:538 [G] | l:124 [ARG] | a:546 [U] | ✔ |
AL:114 [LYS] | AA:539 [A] | l:124 [ARG] | a:547 [A] | ✔ |
AL:87 [GLY] | AA:552 [U] | l:97 [GLY] | a:560 [U] | ✔ |
AL:87 [GLY] | AA:553 [A] | l:97 [GLY] | a:561 [A] | ✔ |
AL:51 [ALA] | AA:518 [C] | l:61 [ALA] | a:526 [C] | ✔ |
AL:51 [ALA] | AA:519 [C] | l:61 [ALA] | a:527 [C] | ✔ |
AL:51 [ALA] | AA:520 [A] | l:61 [ALA] | a:528 [A] | ✔ |
AL:51 [ALA] | AA:521 [G] | l:61 [ALA] | a:529 [G] | ✔ |
AL:51 [ALA] | AA:529 [G] | l:61 [ALA] | a:537 [G] | ✔ |
AL:32 [PHE] | AA:33 [A] | l:42 [GLN] | a:34 [A] | ✔ |
AL:32 [PHE] | AA:34 [C] | l:42 [GLN] | a:35 [C] | ✔ |
AL:32 [PHE] | AA:363 [A] | l:42 [GLN] | a:371 [A] | ✔ |
AL:32 [PHE] | AA:552 [U] | l:42 [GLN] | a:560 [U] | ✔ |
AL:121 [GLY] | AA:35 [G] | l:130 [TYR] | a:36 [G] | ✔ |
AL:116 [SER] | AA:502 [G] | l:126 [GLY] | a:510 [C] | ✔ |
AL:116 [SER] | AA:503 [C] | l:126 [GLY] | a:511 [A] | ✔ |
AL:49 [ASN] | AA:518 [C] | l:59 [ASN] | a:526 [C] | ✔ |
AL:49 [ASN] | AA:521 [G] | l:59 [ASN] | a:529 [G] | ✔ |
AL:49 [ASN] | AA:527 [G] | l:59 [ASN] | a:535 [G] | ✔ |
AL:49 [ASN] | AA:528 [C] | l:59 [ASN] | a:536 [C] | ✔ |
AL:49 [ASN] | AA:529 [G] | l:59 [ASN] | a:537 [G] | ✔ |
AL:95 [GLY] | AA:911 [U] | l:105 [GLY] | a:920 [U] | ✔ |
AL:73 [GLU] | AA:520 [A] | l:83 [ILE] | a:528 [A] | ✔ |
AL:73 [GLU] | AA:521 [G] | l:83 [ILE] | a:529 [G] | ✔ |
AL:27 [LEU] | AA:552 [U] | l:24 [LEU] | a:560 [U] | ✔ |
AL:27 [LEU] | AA:553 [A] | l:24 [LEU] | a:561 [A] | ✔ |
AL:123 [LYS] | AA:35 [G] | l:132 [THR] | a:36 [G] | ✔ |
AL:123 [LYS] | AA:36 [C] | l:132 [THR] | a:37 [C] | ✔ |
AL:119 [LYS] | AA:35 [G] | l:129 [LEU] | a:36 [G] | ✔ |
AL:119 [LYS] | AA:502 [G] | l:129 [LEU] | a:510 [C] | ✔ |
AL:119 [LYS] | AA:550 [G] | l:129 [LEU] | a:558 [G] | ✔ |
AL:16 [GLU] | AA:562 [C] | l:13 [GLN] | a:570 [U] | ✔ |
AL:7 [ILE] | AA:564 [C] | l:4 [ILE] | a:572 [U] | ✔ |
AL:52 [LEU] | AA:519 [C] | l:62 [LEU] | a:527 [C] | ✔ |
AL:52 [LEU] | AA:520 [A] | l:62 [LEU] | a:528 [A] | ✔ |
AL:52 [LEU] | AA:521 [G] | l:62 [LEU] | a:529 [G] | ✔ |
AL:31 [PRO] | AA:32 [A] | l:41 [PRO] | a:33 [A] | ✔ |
AL:31 [PRO] | AA:33 [A] | l:41 [PRO] | a:34 [A] | ✔ |
AL:31 [PRO] | AA:363 [A] | l:41 [PRO] | a:371 [A] | ✔ |
AL:31 [PRO] | AA:552 [U] | l:41 [PRO] | a:560 [U] | ✔ |
AL:31 [PRO] | AA:553 [A] | l:41 [PRO] | a:561 [A] | ✔ |
AL:46 [LYS] | AA:1491 [G] | l:56 [LYS] | a:1502 [G] | ✔ |
AL:46 [LYS] | AA:1492 [A] | l:56 [LYS] | a:1503 [A] | ✔ |
AL:92 [ASP] | AA:523 [A] | l:102 [ASP] | a:531 [A] | ✔ |
AL:15 [ARG] | AA:562 [C] | l:12 [ARG] | a:570 [U] | ✔ |
AL:15 [ARG] | AA:563 [A] | l:12 [ARG] | a:571 [A] | ✔ |
AL:15 [ARG] | AA:564 [C] | l:12 [ARG] | a:572 [U] | ✔ |
AL:15 [ARG] | AA:567 [G] | l:12 [ARG] | a:575 [G] | ✔ |
AL:15 [ARG] | AA:883 [C] | l:12 [ARG] | a:892 [C] | ✔ |
AL:15 [ARG] | AA:884 [U] | l:12 [ARG] | a:893 [U] | ✔ |
AL:90 [VAL] | AA:523 [A] | l:100 [VAL] | a:531 [A] | ✔ |
AL:89 [ARG] | AA:912 [C] | l:99 [ARG] | a:921 [C] | ✔ |
AL:89 [ARG] | AA:913 [A] | l:99 [ARG] | a:922 [A] | ✔ |
AL:86 [ARG] | AA:551 [U] | l:96 [ARG] | a:559 [U] | ✔ |
AL:86 [ARG] | AA:552 [U] | l:96 [ARG] | a:560 [U] | ✔ |
AL:61 [THR] | AA:362 [G] | l:71 [SER] | a:370 [G] | ✔ |
AL:61 [THR] | AA:363 [A] | l:71 [SER] | a:371 [A] | ✔ |
AL:12 [ARG] | AA:880 [C] | l:9 [ARG] | a:889 [C] | ✔ |
AL:12 [ARG] | AA:881 [G] | l:9 [ARG] | a:890 [G] | ✔ |
AL:18 [VAL] | AA:562 [C] | l:15 [LYS] | a:570 [U] | ✔ |
AL:24 [VAL] | AA:554 [C] | l:21 [SER] | a:562 [U] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:5 [PRO] | AA:881 [G] | l:2 [PRO] | a:890 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:5 [PRO] | AA:882 [C] | l:2 [PRO] | a:891 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:5 [PRO] | AA:883 [C] | l:2 [PRO] | a:892 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:99 [HIS] | AA:523 [A] | l:109 [HIS] | a:531 [A] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:99 [HIS] | AA:524 [G] | l:109 [HIS] | a:532 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:91 [LYS] | AA:912 [C] | l:101 [LYS] | a:921 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:91 [LYS] | AA:913 [A] | l:101 [LYS] | a:922 [A] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:53 [ARG] | AA:528 [C] | l:63 [ARG] | a:536 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:53 [ARG] | AA:529 [G] | l:63 [ARG] | a:537 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:117 [ARG] | AA:35 [G] | l:127 [ARG] | a:36 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:117 [ARG] | AA:36 [C] | l:127 [ARG] | a:37 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:117 [ARG] | AA:37 [U] | l:127 [ARG] | a:38 [U] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:101 [VAL] | AA:35 [G] | l:111 [VAL] | a:36 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:94 [PRO] | AA:911 [U] | l:104 [PRO] | a:920 [U] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:48 [PRO] | AA:529 [G] | l:58 [PRO] | a:537 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:124 [LYS] | AA:500 [G] | l:133 [LYS] | a:508 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:124 [LYS] | AA:501 [C] | l:133 [LYS] | a:509 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:50 [SER] | AA:1492 [A] | l:60 [SER] | a:1503 [A] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:114 [LYS] | AA:537 [G] | l:124 [ARG] | a:545 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:32 [PHE] | AA:551 [U] | l:42 [GLN] | a:559 [U] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:121 [GLY] | AA:36 [C] | l:130 [TYR] | a:37 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:49 [ASN] | AA:522 [C] | l:59 [ASN] | a:530 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:49 [ASN] | AA:523 [A] | l:59 [ASN] | a:531 [A] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:73 [GLU] | AA:537 [G] | l:83 [ILE] | a:545 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:123 [LYS] | AA:37 [U] | l:132 [THR] | a:38 [U] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:119 [LYS] | AA:503 [C] | l:129 [LEU] | a:511 [A] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:119 [LYS] | AA:551 [U] | l:129 [LEU] | a:559 [U] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:46 [LYS] | AA:912 [C] | l:56 [LYS] | a:921 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:46 [LYS] | AA:913 [A] | l:56 [LYS] | a:922 [A] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:92 [ASP] | AA:522 [C] | l:102 [ASP] | a:530 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:92 [ASP] | AA:527 [G] | l:102 [ASP] | a:535 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:92 [ASP] | AA:528 [C] | l:102 [ASP] | a:536 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:89 [ARG] | AA:524 [G] | l:99 [ARG] | a:532 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:89 [ARG] | AA:525 [C] | l:99 [ARG] | a:533 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
AL:91 [LYS] | AA:524 [G] | l:101 [LYS] | a:532 [G] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:97 [ARG] | AA:912 [C] | l:107 [ARG] | a:921 [C] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:99 [HIS] | AA:552 [U] | l:109 [HIS] | a:560 [U] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:112 [ASP] | AA:537 [G] | l:122 [GLY] | a:545 [G] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:113 [ARG] | AA:503 [C] | l:123 [ARG] | a:511 [A] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:115 [LYS] | AA:502 [G] | l:125 [GLN] | a:510 [C] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:115 [LYS] | AA:503 [C] | l:125 [GLN] | a:511 [A] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:115 [LYS] | AA:537 [G] | l:125 [GLN] | a:545 [G] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:116 [SER] | AA:538 [G] | l:126 [GLY] | a:546 [U] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:121 [GLY] | AA:522 [C] | l:130 [TYR] | a:530 [C] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:122 [THR] | AA:35 [G] | l:131 [GLY] | a:36 [G] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:124 [LYS] | AA:35 [G] | l:133 [LYS] | a:36 [G] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:18 [VAL] | AA:884 [U] | l:15 [LYS] | a:893 [U] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:21 [LYS] | AA:911 [U] | l:18 [LYS] | a:920 [U] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:21 [LYS] | AA:910 [C] | l:18 [LYS] | a:919 [C] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:5 [PRO] | AA:564 [C] | l:2 [PRO] | a:572 [U] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:23 [LYS] | AA:553 [A] | l:20 [ASP] | a:561 [A] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:29 [GLY] | AA:363 [A] | l:39 [ASN] | a:371 [A] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:29 [GLY] | AA:554 [C] | l:39 [ASN] | a:562 [U] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:50 [SER] | AA:520 [A] | l:60 [SER] | a:528 [A] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:50 [SER] | AA:521 [G] | l:60 [SER] | a:529 [G] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:53 [ARG] | AA:520 [A] | l:63 [ARG] | a:528 [A] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:53 [ARG] | AA:527 [G] | l:63 [ARG] | a:535 [G] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:57 [LYS] | AA:1413 [A] | l:67 [ARG] | a:1423 [A] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:69 [TYR] | AA:523 [A] | l:79 [TYR] | a:531 [A] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:12 [ARG] | AA:879 [C] | l:9 [ARG] | a:888 [C] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:84 [LEU] | AA:34 [C] | l:94 [LEU] | a:35 [C] | ❌ 4W2F_AL_AA |
AL:23 [LYS] | AA:24 [U] | l:20 [ASP] | a:25 [U] | ❌ 6S0X_a:25 no longer at interface |
AL:73 [GLU] | AA:536 [C] | l:83 [ILE] | a:544 [C] | ❌ 6S0X_a:544 no longer at interface |
AL:12 [ARG] | AA:759 [A] | l:9 [ARG] | a:767 [A] | ❌ 6S0X_a:767 no longer at interface |
AL:118 [SER] | AA:549 [C] | l:128 [SER] | a:557 [C] | ❌ 4W2F_AA:549 no longer at interface |
AL:18 [VAL] | AA:885 [G] | l:15 [LYS] | a:894 [G] | ❌ 4W2F_AA:885 no longer at interface |
AL:20 [LYS] | AA:556 [C] | l:17 [LYS] | a:564 [C] | ❌ 4W2F_AL:20, 4W2F_AA:556 no longer at interface |
AL:8 [ASN] | AA:586 [C] | l:5 [ASN] | a:594 [C] | ❌ 4W2F_AA:586 no longer at interface |
AL:41 [ARG] | AA:1411 [C] | l:51 [GLY] | a:1421 [C] | ❌ 6S0X_l:51 no longer at interface |
AL:74 [GLY] | AA:520 [A] | l:84 [GLY] | a:528 [A] | ❌ 6S0X_l:84 no longer at interface |
AL:74 [GLY] | AA:521 [G] | l:84 [GLY] | a:529 [G] | ❌ 6S0X_l:84 no longer at interface |
AL:44 [THR] | AA:1491 [G] | l:54 [THR] | a:1502 [G] | ❌ 6S0X_l:54 no longer at interface |
AL:45 [PRO] | AA:1491 [G] | l:55 [PRO] | a:1502 [G] | ❌ 6S0X_l:55 no longer at interface |
AL:45 [PRO] | AA:1492 [A] | l:55 [PRO] | a:1503 [A] | ❌ 6S0X_l:55 no longer at interface |
AL:34 [ARG] | AA:362 [G] | l:45 [GLY] | a:370 [G] | ❌ 6S0X_l:45 no longer at interface |
AL:34 [ARG] | AA:363 [A] | l:45 [GLY] | a:371 [A] | ❌ 6S0X_l:45 no longer at interface |
AL:47 [LYS] | AA:1491 [G] | l:57 [LYS] | a:1502 [G] | ❌ 6S0X_l:57 no longer at interface |
AL:47 [LYS] | AA:1492 [A] | l:57 [LYS] | a:1503 [A] | ❌ 6S0X_l:57 no longer at interface |
AL:65 [GLU] | AA:1413 [A] | l:75 [GLU] | a:1423 [A] | ❌ 6S0X_l:75 no longer at interface |
AL:13 [LYS] | AA:881 [G] | l:10 [LYS] | a:890 [G] | ❌ 6S0X_l:10 no longer at interface |
AL:13 [LYS] | AA:882 [C] | l:10 [LYS] | a:891 [C] | ❌ 6S0X_l:10 no longer at interface |
AL:105 [TYR] | AA:363 [A] | l:115 [LEU] | a:371 [A] | ❌ 6S0X_l:115 no longer at interface |
AL:105 [TYR] | AA:364 [A] | l:115 [LEU] | a:372 [A] | ❌ 6S0X_l:115 no longer at interface |
AL:14 [GLY] | AA:562 [C] | l:11 [PRO] | a:570 [U] | ❌ 6S0X_l:11 no longer at interface |
AL:125 [PRO] | AA:501 [C] | l:135 [PRO] | a:509 [C] | ❌ 4W2F_AL:125 no longer at interface |
AL:38 [THR] | AA:1411 [C] | l:49 [ARG] | a:1421 [C] | ❌ 4W2F_AL:38 no longer at interface |
AL:67 [THR] | AA:1412 [C] | l:77 [ASN] | a:1422 [C] | ❌ 4W2F_AL:67 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Nucleic acid-binding proteins | Bacterial small subunit ribosomal RNA | 0.96 | 3.37 | 0.57 | 0.93 | 0.96 | 0.85 | 0.95 | 0.77 | 0.68 | 0.35 | 0.30 |
Other pairs involving 4W2F_AL_AA or 6S0X_l_a
Total number of entries: 13