Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
4Y4O_1l
|
4Y4O_1a
|
7K00_L
|
7K00_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
1l:104 [VAL] | 1a:35 [G] | L:101 [ALA] | A:35 [G] | ✔ |
1l:24 [VAL] | 1a:553 [A] | L:21 [VAL] | A:553 [A] | ✔ |
1l:24 [VAL] | 1a:554 [C] | L:21 [VAL] | A:554 [A] | ✔ |
1l:23 [LYS] | 1a:24 [U] | L:20 [ASN] | A:24 [U] | ✔ |
1l:112 [ASP] | 1a:538 [G] | L:109 [ASP] | A:538 [G] | ✔ |
1l:30 [ALA] | 1a:363 [A] | L:27 [CYS] | A:363 [A] | ✔ |
1l:30 [ALA] | 1a:553 [A] | L:27 [CYS] | A:553 [A] | ✔ |
1l:115 [LYS] | 1a:538 [G] | L:112 [GLN] | A:538 [G] | ✔ |
1l:115 [LYS] | 1a:539 [A] | L:112 [GLN] | A:539 [A] | ✔ |
1l:5 [PRO] | 1a:567 [G] | L:2 [ALA] | A:567 [G] | ✔ |
1l:5 [PRO] | 1a:568 [G] | L:2 [ALA] | A:568 [G] | ✔ |
1l:5 [PRO] | 1a:882 [C] | L:2 [ALA] | A:882 [C] | ✔ |
1l:5 [PRO] | 1a:883 [C] | L:2 [ALA] | A:883 [C] | ✔ |
1l:88 [GLY] | 1a:552 [U] | L:85 [GLY] | A:552 [U] | ✔ |
1l:88 [GLY] | 1a:553 [A] | L:85 [GLY] | A:553 [A] | ✔ |
1l:74 [GLY] | 1a:521 [G] | L:71 [GLY] | A:521 [G] | ✔ |
1l:69 [TYR] | 1a:521 [G] | L:66 [TYR] | A:521 [G] | ✔ |
1l:69 [TYR] | 1a:522 [C] | L:66 [TYR] | A:522 [C] | ✔ |
1l:118 [SER] | 1a:35 [G] | L:115 [SER] | A:35 [G] | ✔ |
1l:118 [SER] | 1a:36 [C] | L:115 [SER] | A:36 [C] | ✔ |
1l:118 [SER] | 1a:501 [C] | L:115 [SER] | A:501 [C] | ✔ |
1l:118 [SER] | 1a:502 [G] | L:115 [SER] | A:502 [A] | ✔ |
1l:118 [SER] | 1a:550 [G] | L:115 [SER] | A:550 [G] | ✔ |
1l:57 [LYS] | 1a:1412 [C] | L:54 [ARG] | A:1412 [C] | ✔ |
1l:8 [ASN] | 1a:585 [G] | L:5 [ASN] | A:585 [G] | ✔ |
1l:8 [ASN] | 1a:879 [C] | L:5 [ASN] | A:879 [C] | ✔ |
1l:8 [ASN] | 1a:880 [C] | L:5 [ASN] | A:880 [C] | ✔ |
1l:113 [ARG] | 1a:537 [G] | L:110 [ARG] | A:537 [G] | ✔ |
1l:113 [ARG] | 1a:538 [G] | L:110 [ARG] | A:538 [G] | ✔ |
1l:25 [PRO] | 1a:910 [C] | L:22 [PRO] | A:910 [C] | ✔ |
1l:21 [LYS] | 1a:909 [A] | L:18 [LYS] | A:909 [A] | ✔ |
1l:91 [LYS] | 1a:523 [A] | L:88 [LYS] | A:523 [A] | ✔ |
1l:91 [LYS] | 1a:525 [C] | L:88 [LYS] | A:525 [C] | ✔ |
1l:91 [LYS] | 1a:526 [C] | L:88 [LYS] | A:526 [C] | ✔ |
1l:91 [LYS] | 1a:912 [C] | L:88 [LYS] | A:912 [C] | ✔ |
1l:91 [LYS] | 1a:913 [A] | L:88 [LYS] | A:913 [A] | ✔ |
1l:53 [ARG] | 1a:521 [G] | L:50 [ARG] | A:521 [G] | ✔ |
1l:53 [ARG] | 1a:522 [C] | L:50 [ARG] | A:522 [C] | ✔ |
1l:53 [ARG] | 1a:523 [A] | L:50 [ARG] | A:523 [A] | ✔ |
1l:53 [ARG] | 1a:528 [C] | L:50 [ARG] | A:528 [C] | ✔ |
1l:22 [SER] | 1a:554 [C] | L:19 [SER] | A:554 [A] | ✔ |
1l:84 [LEU] | 1a:34 [C] | L:81 [LEU] | A:34 [C] | ✔ |
1l:84 [LEU] | 1a:363 [A] | L:81 [LEU] | A:363 [A] | ✔ |
1l:117 [ARG] | 1a:35 [G] | L:114 [ARG] | A:35 [G] | ✔ |
1l:117 [ARG] | 1a:36 [C] | L:114 [ARG] | A:36 [C] | ✔ |
1l:117 [ARG] | 1a:37 [U] | L:114 [ARG] | A:37 [U] | ✔ |
1l:117 [ARG] | 1a:500 [G] | L:114 [ARG] | A:500 [G] | ✔ |
1l:117 [ARG] | 1a:501 [C] | L:114 [ARG] | A:501 [C] | ✔ |
1l:117 [ARG] | 1a:502 [G] | L:114 [ARG] | A:502 [A] | ✔ |
1l:101 [VAL] | 1a:34 [C] | L:98 [VAL] | A:34 [C] | ✔ |
1l:101 [VAL] | 1a:35 [G] | L:98 [VAL] | A:35 [G] | ✔ |
1l:97 [ARG] | 1a:910 [C] | L:94 [ARG] | A:910 [C] | ✔ |
1l:97 [ARG] | 1a:911 [U] | L:94 [ARG] | A:911 [U] | ✔ |
1l:45 [PRO] | 1a:1492 [A] | L:42 [PRO] | A:1492 [A] | ✔ |
1l:72 [GLY] | 1a:521 [G] | L:69 [GLY] | A:521 [G] | ✔ |
1l:72 [GLY] | 1a:522 [C] | L:69 [GLY] | A:522 [C] | ✔ |
1l:33 [ARG] | 1a:362 [G] | L:30 [LYS] | A:362 [G] | ✔ |
1l:33 [ARG] | 1a:363 [A] | L:30 [LYS] | A:363 [A] | ✔ |
1l:9 [GLN] | 1a:880 [C] | L:6 [GLN] | A:880 [C] | ✔ |
1l:9 [GLN] | 1a:881 [G] | L:6 [GLN] | A:881 [G] | ✔ |
1l:9 [GLN] | 1a:882 [C] | L:6 [GLN] | A:882 [C] | ✔ |
1l:94 [PRO] | 1a:911 [U] | L:91 [PRO] | A:911 [U] | ✔ |
1l:94 [PRO] | 1a:912 [C] | L:91 [PRO] | A:912 [C] | ✔ |
1l:94 [PRO] | 1a:1490 [C] | L:91 [PRO] | A:1490 [U] | ✔ |
1l:17 [LYS] | 1a:562 [C] | L:14 [ARG] | A:562 [U] | ✔ |
1l:48 [PRO] | 1a:518 [C] | L:45 [PRO] | A:518 [C] | ✔ |
1l:48 [PRO] | 1a:527 [7MG] | L:45 [PRO] | A:527 [G7M] | ✔ |
1l:48 [PRO] | 1a:529 [G] | L:45 [PRO] | A:529 [G] | ✔ |
1l:34 [ARG] | 1a:362 [G] | L:31 [ARG] | A:362 [G] | ✔ |
1l:34 [ARG] | 1a:363 [A] | L:31 [ARG] | A:363 [A] | ✔ |
1l:6 [THR] | 1a:879 [C] | L:3 [THR] | A:879 [C] | ✔ |
1l:6 [THR] | 1a:880 [C] | L:3 [THR] | A:880 [C] | ✔ |
1l:124 [LYS] | 1a:36 [C] | L:121 [ARG] | A:36 [C] | ✔ |
1l:124 [LYS] | 1a:37 [U] | L:121 [ARG] | A:37 [U] | ✔ |
1l:124 [LYS] | 1a:500 [G] | L:121 [ARG] | A:500 [G] | ✔ |
1l:124 [LYS] | 1a:501 [C] | L:121 [ARG] | A:501 [C] | ✔ |
1l:10 [LEU] | 1a:564 [C] | L:7 [LEU] | A:564 [C] | ✔ |
1l:92 [0TD] | 1a:522 [C] | L:89 [D2T] | A:522 [C] | ✔ |
1l:92 [0TD] | 1a:523 [A] | L:89 [D2T] | A:523 [A] | ✔ |
1l:92 [0TD] | 1a:527 [7MG] | L:89 [D2T] | A:527 [G7M] | ✔ |
1l:50 [SER] | 1a:518 [C] | L:47 [SER] | A:518 [C] | ✔ |
1l:50 [SER] | 1a:519 [C] | L:47 [SER] | A:519 [C] | ✔ |
1l:50 [SER] | 1a:521 [G] | L:47 [SER] | A:521 [G] | ✔ |
1l:50 [SER] | 1a:529 [G] | L:47 [SER] | A:529 [G] | ✔ |
1l:29 [GLY] | 1a:363 [A] | L:26 [ALA] | A:363 [A] | ✔ |
1l:29 [GLY] | 1a:553 [A] | L:26 [ALA] | A:553 [A] | ✔ |
1l:122 [THR] | 1a:35 [G] | L:119 [VAL] | A:35 [G] | ✔ |
1l:122 [THR] | 1a:36 [C] | L:119 [VAL] | A:36 [C] | ✔ |
1l:71 [PRO] | 1a:522 [C] | L:68 [GLY] | A:522 [C] | ✔ |
1l:102 [ARG] | 1a:35 [G] | L:99 [ARG] | A:35 [G] | ✔ |
1l:54 [LYS] | 1a:520 [A] | L:51 [LYS] | A:520 [A] | ✔ |
1l:54 [LYS] | 1a:521 [G] | L:51 [LYS] | A:521 [G] | ✔ |
1l:103 [GLY] | 1a:35 [G] | L:100 [GLY] | A:35 [G] | ✔ |
1l:114 [LYS] | 1a:537 [G] | L:111 [LYS] | A:537 [G] | ✔ |
1l:114 [LYS] | 1a:538 [G] | L:111 [LYS] | A:538 [G] | ✔ |
1l:114 [LYS] | 1a:539 [A] | L:111 [LYS] | A:539 [A] | ✔ |
1l:87 [GLY] | 1a:552 [U] | L:84 [GLY] | A:552 [U] | ✔ |
1l:87 [GLY] | 1a:553 [A] | L:84 [GLY] | A:553 [A] | ✔ |
1l:51 [ALA] | 1a:519 [C] | L:48 [ALA] | A:519 [C] | ✔ |
1l:51 [ALA] | 1a:520 [A] | L:48 [ALA] | A:520 [A] | ✔ |
1l:51 [ALA] | 1a:521 [G] | L:48 [ALA] | A:521 [G] | ✔ |
1l:51 [ALA] | 1a:529 [G] | L:48 [ALA] | A:529 [G] | ✔ |
1l:47 [LYS] | 1a:1492 [A] | L:44 [LYS] | A:1492 [A] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:33 [A] | L:29 [GLN] | A:33 [A] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:34 [C] | L:29 [GLN] | A:34 [C] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:363 [A] | L:29 [GLN] | A:363 [A] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:551 [U] | L:29 [GLN] | A:551 [U] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:552 [U] | L:29 [GLN] | A:552 [U] | ✔ |
1l:121 [GLY] | 1a:35 [G] | L:118 [GLY] | A:35 [G] | ✔ |
1l:121 [GLY] | 1a:36 [C] | L:118 [GLY] | A:36 [C] | ✔ |
1l:116 [SER] | 1a:502 [G] | L:113 [ALA] | A:502 [A] | ✔ |
1l:116 [SER] | 1a:503 [C] | L:113 [ALA] | A:503 [C] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:518 [C] | L:46 [ASN] | A:518 [C] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:521 [G] | L:46 [ASN] | A:521 [G] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:522 [C] | L:46 [ASN] | A:522 [C] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:523 [A] | L:46 [ASN] | A:523 [A] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:527 [7MG] | L:46 [ASN] | A:527 [G7M] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:528 [C] | L:46 [ASN] | A:528 [C] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:529 [G] | L:46 [ASN] | A:529 [G] | ✔ |
1l:95 [GLY] | 1a:911 [U] | L:92 [GLY] | A:911 [U] | ✔ |
1l:73 [GLU] | 1a:520 [A] | L:70 [GLU] | A:520 [A] | ✔ |
1l:73 [GLU] | 1a:521 [G] | L:70 [GLU] | A:521 [G] | ✔ |
1l:73 [GLU] | 1a:537 [G] | L:70 [GLU] | A:537 [G] | ✔ |
1l:27 [LEU] | 1a:552 [U] | L:24 [LEU] | A:552 [U] | ✔ |
1l:27 [LEU] | 1a:553 [A] | L:24 [LEU] | A:553 [A] | ✔ |
1l:123 [LYS] | 1a:36 [C] | L:120 [LYS] | A:36 [C] | ✔ |
1l:123 [LYS] | 1a:37 [U] | L:120 [LYS] | A:37 [U] | ✔ |
1l:16 [GLU] | 1a:562 [C] | L:13 [ALA] | A:562 [U] | ✔ |
1l:119 [LYS] | 1a:35 [G] | L:116 [LYS] | A:35 [G] | ✔ |
1l:119 [LYS] | 1a:502 [G] | L:116 [LYS] | A:502 [A] | ✔ |
1l:119 [LYS] | 1a:503 [C] | L:116 [LYS] | A:503 [C] | ✔ |
1l:119 [LYS] | 1a:550 [G] | L:116 [LYS] | A:550 [G] | ✔ |
1l:119 [LYS] | 1a:551 [U] | L:116 [LYS] | A:551 [U] | ✔ |
1l:52 [LEU] | 1a:519 [C] | L:49 [LEU] | A:519 [C] | ✔ |
1l:52 [LEU] | 1a:520 [A] | L:49 [LEU] | A:520 [A] | ✔ |
1l:52 [LEU] | 1a:521 [G] | L:49 [LEU] | A:521 [G] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:32 [A] | L:28 [PRO] | A:32 [A] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:33 [A] | L:28 [PRO] | A:33 [A] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:363 [A] | L:28 [PRO] | A:363 [A] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:552 [U] | L:28 [PRO] | A:552 [U] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:553 [A] | L:28 [PRO] | A:553 [A] | ✔ |
1l:46 [LYS] | 1a:912 [C] | L:43 [LYS] | A:912 [C] | ✔ |
1l:46 [LYS] | 1a:913 [A] | L:43 [LYS] | A:913 [A] | ✔ |
1l:46 [LYS] | 1a:1491 [G] | L:43 [LYS] | A:1491 [G] | ✔ |
1l:46 [LYS] | 1a:1492 [A] | L:43 [LYS] | A:1492 [A] | ✔ |
1l:15 [ARG] | 1a:562 [C] | L:12 [ARG] | A:562 [U] | ✔ |
1l:15 [ARG] | 1a:563 [A] | L:12 [ARG] | A:563 [A] | ✔ |
1l:15 [ARG] | 1a:564 [C] | L:12 [ARG] | A:564 [C] | ✔ |
1l:15 [ARG] | 1a:567 [G] | L:12 [ARG] | A:567 [G] | ✔ |
1l:15 [ARG] | 1a:883 [C] | L:12 [ARG] | A:883 [C] | ✔ |
1l:15 [ARG] | 1a:884 [U] | L:12 [ARG] | A:884 [U] | ✔ |
1l:90 [VAL] | 1a:523 [A] | L:87 [VAL] | A:523 [A] | ✔ |
1l:89 [ARG] | 1a:524 [G] | L:86 [ARG] | A:524 [G] | ✔ |
1l:89 [ARG] | 1a:525 [C] | L:86 [ARG] | A:525 [C] | ✔ |
1l:89 [ARG] | 1a:912 [C] | L:86 [ARG] | A:912 [C] | ✔ |
1l:89 [ARG] | 1a:913 [A] | L:86 [ARG] | A:913 [A] | ✔ |
1l:86 [ARG] | 1a:551 [U] | L:83 [ARG] | A:551 [U] | ✔ |
1l:86 [ARG] | 1a:552 [U] | L:83 [ARG] | A:552 [U] | ✔ |
1l:61 [THR] | 1a:362 [G] | L:58 [THR] | A:362 [G] | ✔ |
1l:61 [THR] | 1a:363 [A] | L:58 [THR] | A:363 [A] | ✔ |
1l:12 [ARG] | 1a:759 [A] | L:9 [ARG] | A:759 [A] | ✔ |
1l:12 [ARG] | 1a:880 [C] | L:9 [ARG] | A:880 [C] | ✔ |
1l:12 [ARG] | 1a:881 [G] | L:9 [ARG] | A:881 [G] | ✔ |
1l:18 [VAL] | 1a:562 [C] | L:15 [LYS] | A:562 [U] | ✔ |
1l:120 [TYR] | 1a:35 [G] | L:117 [TYR] | A:35 [G] | ✔ |
1l:120 [TYR] | 1a:522 [C] | L:117 [TYR] | A:522 [C] | ✔ |
1l:120 [TYR] | 1a:523 [A] | L:117 [TYR] | A:523 [A] | ✔ |
1l:120 [TYR] | 1a:537 [G] | L:117 [TYR] | A:537 [G] | ✔ |
1l:104 [VAL] | 1a:34 [C] | L:101 [ALA] | A:34 [C] | ❌ 7K00_L_A |
1l:23 [LYS] | 1a:554 [C] | L:20 [ASN] | A:554 [A] | ❌ 7K00_L_A |
1l:74 [GLY] | 1a:520 [A] | L:71 [GLY] | A:520 [A] | ❌ 7K00_L_A |
1l:53 [ARG] | 1a:520 [A] | L:50 [ARG] | A:520 [A] | ❌ 7K00_L_A |
1l:53 [ARG] | 1a:529 [G] | L:50 [ARG] | A:529 [G] | ❌ 7K00_L_A |
1l:73 [GLU] | 1a:536 [C] | L:70 [GLU] | A:536 [C] | ❌ 7K00_L_A |
1l:46 [LYS] | 1a:1490 [C] | L:43 [LYS] | A:1490 [U] | ❌ 7K00_L_A |
1l:103 [GLY] | 1a:36 [C] | L:100 [GLY] | A:36 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:113 [ARG] | 1a:536 [C] | L:110 [ARG] | A:536 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:119 [LYS] | 1a:523 [A] | L:116 [LYS] | A:523 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:17 [LYS] | 1a:563 [A] | L:14 [ARG] | A:563 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:18 [VAL] | 1a:884 [U] | L:15 [LYS] | A:884 [U] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:21 [LYS] | 1a:910 [C] | L:18 [LYS] | A:910 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:5 [PRO] | 1a:881 [G] | L:2 [ALA] | A:881 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:29 [GLY] | 1a:554 [C] | L:26 [ALA] | A:554 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:30 [ALA] | 1a:552 [U] | L:27 [CYS] | A:552 [U] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:44 [THR] | 1a:1491 [G] | L:41 [THR] | A:1491 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:45 [PRO] | 1a:1491 [G] | L:42 [PRO] | A:1491 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:47 [LYS] | 1a:1491 [G] | L:44 [LYS] | A:1491 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:50 [SER] | 1a:1492 [A] | L:47 [SER] | A:1492 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:51 [ALA] | 1a:518 [C] | L:48 [ALA] | A:518 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:71 [PRO] | 1a:521 [G] | L:68 [GLY] | A:521 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:89 [ARG] | 1a:526 [C] | L:86 [ARG] | A:526 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:91 [LYS] | 1a:527 [7MG] | L:88 [LYS] | A:527 [G7M] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:94 [PRO] | 1a:1491 [G] | L:91 [PRO] | A:1491 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:95 [GLY] | 1a:912 [C] | L:92 [GLY] | A:912 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:23 [LYS] | 1a:23 [C] | L:20 [ASN] | A:23 [C] | ❌ 7K00_A:23 no longer at interface |
1l:44 [THR] | 1a:1493 [A] | L:41 [THR] | A:1493 [A] | ❌ 7K00_A:1493 no longer at interface |
1l:47 [LYS] | 1a:1493 [A] | L:44 [LYS] | A:1493 [A] | ❌ 7K00_A:1493 no longer at interface |
1l:105 [TYR] | 1a:364 [A] | L:102 [LEU] | A:364 [A] | ❌ 7K00_L:102, 7K00_A:364 no longer at interface |
1l:124 [LYS] | 1a:499 [A] | L:121 [ARG] | A:499 [A] | ❌ 4Y4O_1a:499 no longer at interface |
1l:17 [LYS] | 1a:301 [G] | L:14 [ARG] | A:301 [G] | ❌ 4Y4O_1a:301 no longer at interface |
1l:17 [LYS] | 1a:302 [G] | L:14 [ARG] | A:302 [G] | ❌ 4Y4O_1a:302 no longer at interface |
1l:17 [LYS] | 1a:303 [A] | L:14 [ARG] | A:303 [A] | ❌ 4Y4O_1a:303 no longer at interface |
1l:18 [VAL] | 1a:885 [G] | L:15 [LYS] | A:885 [G] | ❌ 4Y4O_1a:885 no longer at interface |
1l:18 [VAL] | 1a:561 [U] | L:15 [LYS] | A:561 [U] | ❌ 4Y4O_1a:561 no longer at interface |
1l:18 [VAL] | 1a:22 [G] | L:15 [LYS] | A:22 [G] | ❌ 4Y4O_1a:22 no longer at interface |
1l:5 [PRO] | 1a:569 [C] | L:2 [ALA] | A:569 [C] | ❌ 4Y4O_1a:569 no longer at interface |
1l:34 [ARG] | 1a:361 [G] | L:31 [ARG] | A:361 [G] | ❌ 4Y4O_1a:361 no longer at interface |
1l:8 [ASN] | 1a:584 [G] | L:5 [ASN] | A:584 [G] | ❌ 4Y4O_1a:584 no longer at interface |
1l:57 [LYS] | 1a:1413 [A] | L:54 [ARG] | A:1413 [A] | ❌ 4Y4O_1a:1413 no longer at interface |
1l:65 [GLU] | 1a:1413 [A] | L:62 [GLU] | A:1413 [A] | ❌ 4Y4O_1l:65, 4Y4O_1a:1413 no longer at interface |
1l:41 [ARG] | 1a:1411 [C] | L:38 [TYR] | A:1411 [C] | ❌ 7K00_L:38 no longer at interface |
1l:7 [ILE] | 1a:564 [C] | L:4 [VAL] | A:564 [C] | ❌ 7K00_L:4 no longer at interface |
1l:13 [LYS] | 1a:881 [G] | L:10 [LYS] | A:881 [G] | ❌ 7K00_L:10 no longer at interface |
1l:13 [LYS] | 1a:882 [C] | L:10 [LYS] | A:882 [C] | ❌ 7K00_L:10 no longer at interface |
1l:105 [TYR] | 1a:363 [A] | L:102 [LEU] | A:363 [A] | ❌ 7K00_L:102 no longer at interface |
1l:14 [GLY] | 1a:562 [C] | L:11 [PRO] | A:562 [U] | ❌ 7K00_L:11 no longer at interface |
1l:39 [VAL] | 1a:1411 [C] | L:36 [ARG] | A:1411 [C] | ❌ 4Y4O_1l:39 no longer at interface |
1l:99 [HIS] | 1a:523 [A] | L:96 [HIS] | A:523 [A] | ❌ 4Y4O_1l:99 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Nucleic acid-binding proteins | Bacterial small subunit ribosomal RNA | 0.98 | 0.65 | 0.72 | 0.98 | 0.98 | 0.96 | 0.95 | 0.92 | 0.83 | 0.68 | 0.48 |
Other pairs involving 4Y4O_1l_1a or 7K00_L_A
Total number of entries: 13