Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
4Y4O_1l
|
4Y4O_1a
|
7O7Y_Aw
|
7O7Y_A2
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
1l:104 [VAL] | 1a:34 [C] | Aw:124 [LYS] | A2:28 [U] | ✔ |
1l:104 [VAL] | 1a:35 [G] | Aw:124 [LYS] | A2:29 [G] | ✔ |
1l:30 [ALA] | 1a:363 [A] | Aw:44 [ALA] | A2:484 [C] | ✔ |
1l:30 [ALA] | 1a:553 [A] | Aw:44 [ALA] | A2:650 [PSU] | ✔ |
1l:5 [PRO] | 1a:567 [G] | Aw:3 [LYS] | A2:664 [C] | ✔ |
1l:88 [GLY] | 1a:552 [U] | Aw:104 [GLY] | A2:649 [A] | ✔ |
1l:88 [GLY] | 1a:553 [A] | Aw:104 [GLY] | A2:650 [PSU] | ✔ |
1l:74 [GLY] | 1a:520 [A] | Aw:88 [ASP] | A2:617 [A] | ✔ |
1l:74 [GLY] | 1a:521 [G] | Aw:88 [ASP] | A2:618 [G] | ✔ |
1l:118 [SER] | 1a:35 [G] | Aw:131 [LEU] | A2:29 [G] | ✔ |
1l:118 [SER] | 1a:502 [G] | Aw:131 [LEU] | A2:598 [G] | ✔ |
1l:8 [ASN] | 1a:585 [G] | Aw:9 [THR] | A2:682 [PSU] | ✔ |
1l:8 [ASN] | 1a:879 [C] | Aw:9 [THR] | A2:1161 [U] | ✔ |
1l:91 [LYS] | 1a:525 [C] | Aw:112 [VAL] | A2:622 [C] | ✔ |
1l:53 [ARG] | 1a:520 [A] | Aw:66 [ILE] | A2:617 [A] | ✔ |
1l:53 [ARG] | 1a:521 [G] | Aw:66 [ILE] | A2:618 [G] | ✔ |
1l:72 [GLY] | 1a:522 [C] | Aw:86 [PRO] | A2:619 [C] | ✔ |
1l:33 [ARG] | 1a:363 [A] | Aw:47 [ALA] | A2:484 [C] | ✔ |
1l:9 [GLN] | 1a:880 [C] | Aw:12 [LYS] | A2:1162 [U] | ✔ |
1l:9 [GLN] | 1a:881 [G] | Aw:12 [LYS] | A2:1163 [C] | ✔ |
1l:17 [LYS] | 1a:562 [C] | Aw:21 [LYS] | A2:659 [U] | ✔ |
1l:34 [ARG] | 1a:363 [A] | Aw:48 [LYS] | A2:484 [C] | ✔ |
1l:6 [THR] | 1a:879 [C] | Aw:4 [CYS] | A2:1161 [U] | ✔ |
1l:6 [THR] | 1a:880 [C] | Aw:4 [CYS] | A2:1162 [U] | ✔ |
1l:10 [LEU] | 1a:564 [C] | Aw:13 [LEU] | A2:661 [C] | ✔ |
1l:92 [0TD] | 1a:523 [A] | Aw:113 [GLY] | A2:620 [A] | ✔ |
1l:50 [SER] | 1a:518 [C] | Aw:63 [ASN] | A2:615 [C] | ✔ |
1l:50 [SER] | 1a:529 [G] | Aw:63 [ASN] | A2:626 [G] | ✔ |
1l:29 [GLY] | 1a:553 [A] | Aw:43 [GLY] | A2:650 [PSU] | ✔ |
1l:54 [LYS] | 1a:521 [G] | Aw:67 [ARG] | A2:618 [G] | ✔ |
1l:87 [GLY] | 1a:552 [U] | Aw:103 [ALA] | A2:649 [A] | ✔ |
1l:51 [ALA] | 1a:519 [C] | Aw:64 [SER] | A2:616 [C] | ✔ |
1l:51 [ALA] | 1a:520 [A] | Aw:64 [SER] | A2:617 [A] | ✔ |
1l:51 [ALA] | 1a:529 [G] | Aw:64 [SER] | A2:626 [G] | ✔ |
1l:47 [LYS] | 1a:1492 [A] | Aw:61 [GLN] | A2:1825 [A] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:33 [A] | Aw:46 [HIS] | A2:27 [A2M] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:34 [C] | Aw:46 [HIS] | A2:28 [U] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:363 [A] | Aw:46 [HIS] | A2:484 [C] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:551 [U] | Aw:46 [HIS] | A2:648 [U] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:552 [U] | Aw:46 [HIS] | A2:649 [A] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:518 [C] | Aw:62 [HY3] | A2:615 [C] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:529 [G] | Aw:62 [HY3] | A2:626 [G] | ✔ |
1l:73 [GLU] | 1a:521 [G] | Aw:87 [ASN] | A2:618 [G] | ✔ |
1l:73 [GLU] | 1a:537 [G] | Aw:87 [ASN] | A2:634 [C] | ✔ |
1l:16 [GLU] | 1a:562 [C] | Aw:20 [GLN] | A2:659 [U] | ✔ |
1l:7 [ILE] | 1a:564 [C] | Aw:5 [ARG] | A2:661 [C] | ✔ |
1l:52 [LEU] | 1a:519 [C] | Aw:65 [ALA] | A2:616 [C] | ✔ |
1l:52 [LEU] | 1a:520 [A] | Aw:65 [ALA] | A2:617 [A] | ✔ |
1l:52 [LEU] | 1a:521 [G] | Aw:65 [ALA] | A2:618 [G] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:32 [A] | Aw:45 [SER] | A2:26 [U] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:33 [A] | Aw:45 [SER] | A2:27 [A2M] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:363 [A] | Aw:45 [SER] | A2:484 [C] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:552 [U] | Aw:45 [SER] | A2:649 [A] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:553 [A] | Aw:45 [SER] | A2:650 [PSU] | ✔ |
1l:46 [LYS] | 1a:912 [C] | Aw:60 [LYS] | A2:1194 [U] | ✔ |
1l:46 [LYS] | 1a:913 [A] | Aw:60 [LYS] | A2:1195 [A] | ✔ |
1l:13 [LYS] | 1a:882 [C] | Aw:16 [HIS] | A2:1164 [C] | ✔ |
1l:89 [ARG] | 1a:912 [C] | Aw:110 [HIS] | A2:1194 [U] | ✔ |
1l:89 [ARG] | 1a:913 [A] | Aw:110 [HIS] | A2:1195 [A] | ✔ |
1l:18 [VAL] | 1a:562 [C] | Aw:24 [ASP] | A2:659 [U] | ✔ |
1l:120 [TYR] | 1a:35 [G] | Aw:132 [ALA] | A2:29 [G] | ✔ |
1l:14 [GLY] | 1a:562 [C] | Aw:17 [ARG] | A2:659 [U] | ✔ |
1l:24 [VAL] | 1a:553 [A] | Aw:38 [ALA] | A2:650 [PSU] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:24 [VAL] | 1a:554 [C] | Aw:38 [ALA] | A2:651 [A] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:23 [LYS] | 1a:23 [C] | Aw:36 [LEU] | A2:18 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:23 [LYS] | 1a:24 [U] | Aw:36 [LEU] | A2:19 [A] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:23 [LYS] | 1a:554 [C] | Aw:36 [LEU] | A2:651 [A] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:5 [PRO] | 1a:882 [C] | Aw:3 [LYS] | A2:1164 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:5 [PRO] | 1a:883 [C] | Aw:3 [LYS] | A2:1165 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:118 [SER] | 1a:36 [C] | Aw:131 [LEU] | A2:30 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:118 [SER] | 1a:501 [C] | Aw:131 [LEU] | A2:597 [U] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:8 [ASN] | 1a:880 [C] | Aw:9 [THR] | A2:1162 [U] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:21 [LYS] | 1a:909 [A] | Aw:29 [LYS] | A2:1191 [A] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:91 [LYS] | 1a:523 [A] | Aw:112 [VAL] | A2:620 [A] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:91 [LYS] | 1a:912 [C] | Aw:112 [VAL] | A2:1194 [U] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:91 [LYS] | 1a:913 [A] | Aw:112 [VAL] | A2:1195 [A] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:53 [ARG] | 1a:522 [C] | Aw:66 [ILE] | A2:619 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:53 [ARG] | 1a:523 [A] | Aw:66 [ILE] | A2:620 [A] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:53 [ARG] | 1a:528 [C] | Aw:66 [ILE] | A2:625 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:53 [ARG] | 1a:529 [G] | Aw:66 [ILE] | A2:626 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:22 [SER] | 1a:554 [C] | Aw:35 [ALA] | A2:651 [A] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:72 [GLY] | 1a:521 [G] | Aw:86 [PRO] | A2:618 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:33 [ARG] | 1a:362 [G] | Aw:47 [ALA] | A2:483 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:9 [GLN] | 1a:882 [C] | Aw:12 [LYS] | A2:1164 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:94 [PRO] | 1a:911 [U] | Aw:115 [ILE] | A2:1193 [U] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:94 [PRO] | 1a:912 [C] | Aw:115 [ILE] | A2:1194 [U] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:34 [ARG] | 1a:362 [G] | Aw:48 [LYS] | A2:483 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:92 [0TD] | 1a:522 [C] | Aw:113 [GLY] | A2:619 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:92 [0TD] | 1a:527 [7MG] | Aw:113 [GLY] | A2:624 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:50 [SER] | 1a:519 [C] | Aw:63 [ASN] | A2:616 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:50 [SER] | 1a:521 [G] | Aw:63 [ASN] | A2:618 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:29 [GLY] | 1a:363 [A] | Aw:43 [GLY] | A2:484 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:122 [THR] | 1a:35 [G] | Aw:134 [TYR] | A2:29 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:122 [THR] | 1a:36 [C] | Aw:134 [TYR] | A2:30 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:54 [LYS] | 1a:520 [A] | Aw:67 [ARG] | A2:617 [A] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:103 [GLY] | 1a:35 [G] | Aw:123 [VAL] | A2:29 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:87 [GLY] | 1a:553 [A] | Aw:103 [ALA] | A2:650 [PSU] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:51 [ALA] | 1a:521 [G] | Aw:64 [SER] | A2:618 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:49 [ASN] | 1a:521 [G] | Aw:62 [HY3] | A2:618 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:49 [ASN] | 1a:522 [C] | Aw:62 [HY3] | A2:619 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:49 [ASN] | 1a:523 [A] | Aw:62 [HY3] | A2:620 [A] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:49 [ASN] | 1a:527 [7MG] | Aw:62 [HY3] | A2:624 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:49 [ASN] | 1a:528 [C] | Aw:62 [HY3] | A2:625 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:73 [GLU] | 1a:520 [A] | Aw:87 [ASN] | A2:617 [A] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:123 [LYS] | 1a:36 [C] | Aw:135 [LYS] | A2:30 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:123 [LYS] | 1a:37 [U] | Aw:135 [LYS] | A2:31 [U] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:46 [LYS] | 1a:1492 [A] | Aw:60 [LYS] | A2:1825 [A] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:13 [LYS] | 1a:881 [G] | Aw:16 [HIS] | A2:1163 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:15 [ARG] | 1a:562 [C] | Aw:18 [ARG] | A2:659 [U] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:15 [ARG] | 1a:563 [A] | Aw:18 [ARG] | A2:660 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:15 [ARG] | 1a:564 [C] | Aw:18 [ARG] | A2:661 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:15 [ARG] | 1a:567 [G] | Aw:18 [ARG] | A2:664 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:15 [ARG] | 1a:883 [C] | Aw:18 [ARG] | A2:1165 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:15 [ARG] | 1a:884 [U] | Aw:18 [ARG] | A2:1166 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:90 [VAL] | 1a:523 [A] | Aw:111 [ALA] | A2:620 [A] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:89 [ARG] | 1a:524 [G] | Aw:110 [HIS] | A2:621 [G] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:89 [ARG] | 1a:525 [C] | Aw:110 [HIS] | A2:622 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:120 [TYR] | 1a:522 [C] | Aw:132 [ALA] | A2:619 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:120 [TYR] | 1a:523 [A] | Aw:132 [ALA] | A2:620 [A] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:120 [TYR] | 1a:537 [G] | Aw:132 [ALA] | A2:634 [C] | ❌ 7O7Y_Aw_A2 |
1l:90 [VAL] | 1a:525 [C] | Aw:111 [ALA] | A2:622 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:90 [VAL] | 1a:912 [C] | Aw:111 [ALA] | A2:1194 [U] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:91 [LYS] | 1a:524 [G] | Aw:112 [VAL] | A2:621 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:92 [0TD] | 1a:525 [C] | Aw:113 [GLY] | A2:622 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:92 [0TD] | 1a:524 [G] | Aw:113 [GLY] | A2:621 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:94 [PRO] | 1a:523 [A] | Aw:115 [ILE] | A2:620 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:103 [GLY] | 1a:34 [C] | Aw:123 [VAL] | A2:28 [U] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:120 [TYR] | 1a:36 [C] | Aw:132 [ALA] | A2:30 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:122 [THR] | 1a:537 [G] | Aw:134 [TYR] | A2:634 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:122 [THR] | 1a:538 [G] | Aw:134 [TYR] | A2:635 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:123 [LYS] | 1a:502 [G] | Aw:135 [LYS] | A2:598 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:14 [GLY] | 1a:567 [G] | Aw:17 [ARG] | A2:664 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:14 [GLY] | 1a:884 [U] | Aw:17 [ARG] | A2:1166 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:14 [GLY] | 1a:564 [C] | Aw:17 [ARG] | A2:661 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:14 [GLY] | 1a:563 [A] | Aw:17 [ARG] | A2:660 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:16 [GLU] | 1a:883 [C] | Aw:20 [GLN] | A2:1165 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:16 [GLU] | 1a:884 [U] | Aw:20 [GLN] | A2:1166 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:18 [VAL] | 1a:884 [U] | Aw:24 [ASP] | A2:1166 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:21 [LYS] | 1a:554 [C] | Aw:29 [LYS] | A2:651 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:5 [PRO] | 1a:564 [C] | Aw:3 [LYS] | A2:661 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:5 [PRO] | 1a:563 [A] | Aw:3 [LYS] | A2:660 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:5 [PRO] | 1a:879 [C] | Aw:3 [LYS] | A2:1161 [U] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:22 [SER] | 1a:909 [A] | Aw:35 [ALA] | A2:1191 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:24 [VAL] | 1a:909 [A] | Aw:38 [ALA] | A2:1191 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:24 [VAL] | 1a:910 [C] | Aw:38 [ALA] | A2:1192 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:6 [THR] | 1a:585 [G] | Aw:4 [CYS] | A2:682 [PSU] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:34 [ARG] | 1a:364 [A] | Aw:48 [LYS] | A2:485 [A2M] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:7 [ILE] | 1a:879 [C] | Aw:5 [ARG] | A2:1161 [U] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:46 [LYS] | 1a:911 [U] | Aw:60 [LYS] | A2:1193 [U] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:50 [SER] | 1a:522 [C] | Aw:63 [ASN] | A2:619 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:50 [SER] | 1a:528 [C] | Aw:63 [ASN] | A2:625 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:50 [SER] | 1a:523 [A] | Aw:63 [ASN] | A2:620 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:50 [SER] | 1a:527 [7MG] | Aw:63 [ASN] | A2:624 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:51 [ALA] | 1a:518 [C] | Aw:64 [SER] | A2:615 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:52 [LEU] | 1a:529 [G] | Aw:65 [ALA] | A2:626 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:54 [LYS] | 1a:528 [C] | Aw:67 [ARG] | A2:625 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:54 [LYS] | 1a:522 [C] | Aw:67 [ARG] | A2:619 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:54 [LYS] | 1a:523 [A] | Aw:67 [ARG] | A2:620 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:73 [GLU] | 1a:522 [C] | Aw:87 [ASN] | A2:619 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:74 [GLY] | 1a:537 [G] | Aw:88 [ASP] | A2:634 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:74 [GLY] | 1a:522 [C] | Aw:88 [ASP] | A2:619 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:41 [ARG] | 1a:1411 [C] | Aw:55 [VAL] | A2:1713 [A] | ❌ 7O7Y_Aw:55, 7O7Y_A2:1713 no longer at interface |
1l:5 [PRO] | 1a:568 [G] | Aw:3 [LYS] | A2:665 [A] | ❌ 7O7Y_A2:665 no longer at interface |
1l:118 [SER] | 1a:550 [G] | Aw:131 [LEU] | A2:647 [G] | ❌ 7O7Y_A2:647 no longer at interface |
1l:57 [LYS] | 1a:1412 [C] | Aw:70 [VAL] | A2:1714 [C] | ❌ 7O7Y_Aw:70, 7O7Y_A2:1714 no longer at interface |
1l:91 [LYS] | 1a:526 [C] | Aw:112 [VAL] | A2:623 [C] | ❌ 7O7Y_A2:623 no longer at interface |
1l:44 [THR] | 1a:1493 [A] | Aw:58 [GLU] | A2:1826 [A] | ❌ 7O7Y_Aw:58, 7O7Y_A2:1826 no longer at interface |
1l:117 [ARG] | 1a:500 [G] | Aw:130 [LEU] | A2:596 [U] | ❌ 7O7Y_Aw:130, 7O7Y_A2:596 no longer at interface |
1l:94 [PRO] | 1a:1490 [C] | Aw:115 [ILE] | A2:1823 [A] | ❌ 7O7Y_A2:1823 no longer at interface |
1l:124 [LYS] | 1a:500 [G] | Aw:136 [GLY] | A2:596 [U] | ❌ 7O7Y_Aw:136, 7O7Y_A2:596 no longer at interface |
1l:47 [LYS] | 1a:1493 [A] | Aw:61 [GLN] | A2:1826 [A] | ❌ 7O7Y_A2:1826 no longer at interface |
1l:73 [GLU] | 1a:536 [C] | Aw:87 [ASN] | A2:633 [C] | ❌ 7O7Y_A2:633 no longer at interface |
1l:46 [LYS] | 1a:1490 [C] | Aw:60 [LYS] | A2:1823 [A] | ❌ 7O7Y_A2:1823 no longer at interface |
1l:46 [LYS] | 1a:1491 [G] | Aw:60 [LYS] | A2:1824 [A] | ❌ 7O7Y_A2:1824 no longer at interface |
1l:12 [ARG] | 1a:759 [A] | Aw:15 [SER] | A2:1028 [A] | ❌ 7O7Y_Aw:15, 7O7Y_A2:1028 no longer at interface |
1l:11 [VAL] | 1a:240 [C] | Aw:14 [ARG] | A2:358 [C] | ❌ 4Y4O_1l:11, 4Y4O_1a:240 no longer at interface |
1l:15 [ARG] | 1a:241 [C] | Aw:18 [ARG] | A2:359 [C] | ❌ 4Y4O_1a:241 no longer at interface |
1l:15 [ARG] | 1a:242 [C] | Aw:18 [ARG] | A2:360 [U] | ❌ 4Y4O_1a:242 no longer at interface |
1l:17 [LYS] | 1a:302 [G] | Aw:21 [LYS] | A2:423 [U] | ❌ 4Y4O_1a:302 no longer at interface |
1l:17 [LYS] | 1a:303 [A] | Aw:21 [LYS] | A2:424 [U] | ❌ 4Y4O_1a:303 no longer at interface |
1l:18 [VAL] | 1a:561 [U] | Aw:24 [ASP] | A2:658 [U] | ❌ 4Y4O_1a:561 no longer at interface |
1l:19 [ARG] | 1a:241 [C] | Aw:27 [TYR] | A2:359 [C] | ❌ 4Y4O_1l:19, 4Y4O_1a:241 no longer at interface |
1l:19 [ARG] | 1a:303 [A] | Aw:27 [TYR] | A2:424 [U] | ❌ 4Y4O_1l:19, 4Y4O_1a:303 no longer at interface |
1l:20 [LYS] | 1a:908 [A] | Aw:28 [LYS] | A2:1190 [A] | ❌ 4Y4O_1l:20, 4Y4O_1a:908 no longer at interface |
1l:20 [LYS] | 1a:907 [A] | Aw:28 [LYS] | A2:1189 [A] | ❌ 4Y4O_1l:20, 4Y4O_1a:907 no longer at interface |
1l:5 [PRO] | 1a:566 [G] | Aw:3 [LYS] | A2:663 [G] | ❌ 4Y4O_1a:566 no longer at interface |
1l:5 [PRO] | 1a:565 [U] | Aw:3 [LYS] | A2:662 [U] | ❌ 4Y4O_1a:565 no longer at interface |
1l:22 [SER] | 1a:908 [A] | Aw:35 [ALA] | A2:1190 [A] | ❌ 4Y4O_1a:908 no longer at interface |
1l:7 [ILE] | 1a:565 [U] | Aw:5 [ARG] | A2:662 [U] | ❌ 4Y4O_1a:565 no longer at interface |
1l:7 [ILE] | 1a:877 [C] | Aw:5 [ARG] | A2:1159 [G] | ❌ 4Y4O_1a:877 no longer at interface |
1l:7 [ILE] | 1a:878 [G] | Aw:5 [ARG] | A2:1160 [G] | ❌ 4Y4O_1a:878 no longer at interface |
1l:7 [ILE] | 1a:876 [G] | Aw:5 [ARG] | A2:1158 [G] | ❌ 4Y4O_1a:876 no longer at interface |
1l:51 [ALA] | 1a:530 [G] | Aw:64 [SER] | A2:627 [G] | ❌ 4Y4O_1a:530 no longer at interface |
1l:8 [ASN] | 1a:586 [C] | Aw:9 [THR] | A2:683 [U] | ❌ 4Y4O_1a:586 no longer at interface |
1l:69 [TYR] | 1a:521 [G] | Aw:83 [ALA] | A2:618 [G] | ❌ 7O7Y_Aw:83 no longer at interface |
1l:69 [TYR] | 1a:522 [C] | Aw:83 [ALA] | A2:619 [C] | ❌ 7O7Y_Aw:83 no longer at interface |
1l:25 [PRO] | 1a:910 [C] | Aw:39 [ASN] | A2:1192 [C] | ❌ 7O7Y_Aw:39 no longer at interface |
1l:84 [LEU] | 1a:34 [C] | Aw:100 [VAL] | A2:28 [U] | ❌ 7O7Y_Aw:100 no longer at interface |
1l:84 [LEU] | 1a:363 [A] | Aw:100 [VAL] | A2:484 [C] | ❌ 7O7Y_Aw:100 no longer at interface |
1l:117 [ARG] | 1a:35 [G] | Aw:130 [LEU] | A2:29 [G] | ❌ 7O7Y_Aw:130 no longer at interface |
1l:117 [ARG] | 1a:36 [C] | Aw:130 [LEU] | A2:30 [C] | ❌ 7O7Y_Aw:130 no longer at interface |
1l:117 [ARG] | 1a:37 [U] | Aw:130 [LEU] | A2:31 [U] | ❌ 7O7Y_Aw:130 no longer at interface |
1l:117 [ARG] | 1a:501 [C] | Aw:130 [LEU] | A2:597 [U] | ❌ 7O7Y_Aw:130 no longer at interface |
1l:117 [ARG] | 1a:502 [G] | Aw:130 [LEU] | A2:598 [G] | ❌ 7O7Y_Aw:130 no longer at interface |
1l:101 [VAL] | 1a:34 [C] | Aw:122 [VAL] | A2:28 [U] | ❌ 7O7Y_Aw:122 no longer at interface |
1l:101 [VAL] | 1a:35 [G] | Aw:122 [VAL] | A2:29 [G] | ❌ 7O7Y_Aw:122 no longer at interface |
1l:97 [ARG] | 1a:910 [C] | Aw:118 [VAL] | A2:1192 [C] | ❌ 7O7Y_Aw:118 no longer at interface |
1l:97 [ARG] | 1a:911 [U] | Aw:118 [VAL] | A2:1193 [U] | ❌ 7O7Y_Aw:118 no longer at interface |
1l:45 [PRO] | 1a:1492 [A] | Aw:59 [ALA] | A2:1825 [A] | ❌ 7O7Y_Aw:59 no longer at interface |
1l:124 [LYS] | 1a:36 [C] | Aw:136 [GLY] | A2:30 [C] | ❌ 7O7Y_Aw:136 no longer at interface |
1l:124 [LYS] | 1a:37 [U] | Aw:136 [GLY] | A2:31 [U] | ❌ 7O7Y_Aw:136 no longer at interface |
1l:124 [LYS] | 1a:501 [C] | Aw:136 [GLY] | A2:597 [U] | ❌ 7O7Y_Aw:136 no longer at interface |
1l:71 [PRO] | 1a:522 [C] | Aw:85 [VAL] | A2:619 [C] | ❌ 7O7Y_Aw:85 no longer at interface |
1l:121 [GLY] | 1a:35 [G] | Aw:133 [LEU] | A2:29 [G] | ❌ 7O7Y_Aw:133 no longer at interface |
1l:121 [GLY] | 1a:36 [C] | Aw:133 [LEU] | A2:30 [C] | ❌ 7O7Y_Aw:133 no longer at interface |
1l:95 [GLY] | 1a:911 [U] | Aw:116 [PRO] | A2:1193 [U] | ❌ 7O7Y_Aw:116 no longer at interface |
1l:27 [LEU] | 1a:552 [U] | Aw:41 [PHE] | A2:649 [A] | ❌ 7O7Y_Aw:41 no longer at interface |
1l:27 [LEU] | 1a:553 [A] | Aw:41 [PHE] | A2:650 [PSU] | ❌ 7O7Y_Aw:41 no longer at interface |
1l:86 [ARG] | 1a:551 [U] | Aw:102 [VAL] | A2:648 [U] | ❌ 7O7Y_Aw:102 no longer at interface |
1l:86 [ARG] | 1a:552 [U] | Aw:102 [VAL] | A2:649 [A] | ❌ 7O7Y_Aw:102 no longer at interface |
1l:61 [THR] | 1a:362 [G] | Aw:74 [LEU] | A2:483 [G] | ❌ 7O7Y_Aw:74 no longer at interface |
1l:61 [THR] | 1a:363 [A] | Aw:74 [LEU] | A2:484 [C] | ❌ 7O7Y_Aw:74 no longer at interface |
1l:12 [ARG] | 1a:880 [C] | Aw:15 [SER] | A2:1162 [U] | ❌ 7O7Y_Aw:15 no longer at interface |
1l:12 [ARG] | 1a:881 [G] | Aw:15 [SER] | A2:1163 [C] | ❌ 7O7Y_Aw:15 no longer at interface |
1l:105 [TYR] | 1a:363 [A] | Aw:125 [VAL] | A2:484 [C] | ❌ 7O7Y_Aw:125 no longer at interface |
1l:105 [TYR] | 1a:364 [A] | Aw:125 [VAL] | A2:485 [A2M] | ❌ 7O7Y_Aw:125 no longer at interface |
1l:85 [ILE] | 1a:363 [A] | Aw:101 [LEU] | A2:484 [C] | ❌ 4Y4O_1l:85 no longer at interface |
1l:85 [ILE] | 1a:34 [C] | Aw:101 [LEU] | A2:28 [U] | ❌ 4Y4O_1l:85 no longer at interface |
1l:93 [LEU] | 1a:528 [C] | Aw:114 [ASP] | A2:625 [C] | ❌ 4Y4O_1l:93 no longer at interface |
1l:93 [LEU] | 1a:527 [7MG] | Aw:114 [ASP] | A2:624 [G] | ❌ 4Y4O_1l:93 no longer at interface |
1l:93 [LEU] | 1a:522 [C] | Aw:114 [ASP] | A2:619 [C] | ❌ 4Y4O_1l:93 no longer at interface |
1l:93 [LEU] | 1a:523 [A] | Aw:114 [ASP] | A2:620 [A] | ❌ 4Y4O_1l:93 no longer at interface |
1l:96 [VAL] | 1a:911 [U] | Aw:117 [GLY] | A2:1193 [U] | ❌ 4Y4O_1l:96 no longer at interface |
1l:96 [VAL] | 1a:912 [C] | Aw:117 [GLY] | A2:1194 [U] | ❌ 4Y4O_1l:96 no longer at interface |
1l:98 [TYR] | 1a:911 [U] | Aw:119 [ARG] | A2:1193 [U] | ❌ 4Y4O_1l:98 no longer at interface |
1l:98 [TYR] | 1a:912 [C] | Aw:119 [ARG] | A2:1194 [U] | ❌ 4Y4O_1l:98 no longer at interface |
1l:98 [TYR] | 1a:910 [C] | Aw:119 [ARG] | A2:1192 [C] | ❌ 4Y4O_1l:98 no longer at interface |
1l:100 [ILE] | 1a:551 [U] | Aw:121 [LYS] | A2:648 [U] | ❌ 4Y4O_1l:100 no longer at interface |
1l:100 [ILE] | 1a:552 [U] | Aw:121 [LYS] | A2:649 [A] | ❌ 4Y4O_1l:100 no longer at interface |
1l:109 [GLY] | 1a:36 [C] | Aw:129 [SER] | A2:30 [C] | ❌ 4Y4O_1l:109 no longer at interface |
1l:109 [GLY] | 1a:35 [G] | Aw:129 [SER] | A2:29 [G] | ❌ 4Y4O_1l:109 no longer at interface |
1l:125 [PRO] | 1a:36 [C] | Aw:137 [LYS] | A2:30 [C] | ❌ 4Y4O_1l:125 no longer at interface |
1l:125 [PRO] | 1a:37 [U] | Aw:137 [LYS] | A2:31 [U] | ❌ 4Y4O_1l:125 no longer at interface |
1l:125 [PRO] | 1a:501 [C] | Aw:137 [LYS] | A2:597 [U] | ❌ 4Y4O_1l:125 no longer at interface |
1l:55 [VAL] | 1a:521 [G] | Aw:68 [LYS] | A2:618 [G] | ❌ 4Y4O_1l:55 no longer at interface |
1l:55 [VAL] | 1a:519 [C] | Aw:68 [LYS] | A2:616 [C] | ❌ 4Y4O_1l:55 no longer at interface |
1l:55 [VAL] | 1a:520 [A] | Aw:68 [LYS] | A2:617 [A] | ❌ 4Y4O_1l:55 no longer at interface |
1l:62 [SER] | 1a:362 [G] | Aw:75 [ILE] | A2:483 [G] | ❌ 4Y4O_1l:62 no longer at interface |
1l:63 [GLY] | 1a:363 [A] | Aw:76 [LYS] | A2:484 [C] | ❌ 4Y4O_1l:63 no longer at interface |
1l:63 [GLY] | 1a:362 [G] | Aw:76 [LYS] | A2:483 [G] | ❌ 4Y4O_1l:63 no longer at interface |
1l:70 [ILE] | 1a:522 [C] | Aw:84 [PHE] | A2:619 [C] | ❌ 4Y4O_1l:70 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Nucleic acid-binding proteins | 0.93 | 4.24 | 0.12 | 0.71 | 0.93 | 0.63 | 0.78 | 0.34 | 0.24 | 0.08 | 0.48 |
Other pairs involving 4Y4O_1l_1a or 7O7Y_Aw_A2
Total number of entries: 11