Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
4Y4O_1l
|
4Y4O_1a
|
7PJS_l
|
7PJS_a
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
1l:104 [VAL] | 1a:34 [C] | l:100 [ALA] | a:34 [C] | ✔ |
1l:104 [VAL] | 1a:35 [G] | l:100 [ALA] | a:35 [G] | ✔ |
1l:24 [VAL] | 1a:553 [A] | l:20 [VAL] | a:553 [A] | ✔ |
1l:24 [VAL] | 1a:554 [C] | l:20 [VAL] | a:554 [A] | ✔ |
1l:112 [ASP] | 1a:538 [G] | l:108 [ASP] | a:538 [G] | ✔ |
1l:30 [ALA] | 1a:363 [A] | l:26 [CYS] | a:363 [A] | ✔ |
1l:30 [ALA] | 1a:553 [A] | l:26 [CYS] | a:553 [A] | ✔ |
1l:115 [LYS] | 1a:538 [G] | l:111 [GLN] | a:538 [G] | ✔ |
1l:115 [LYS] | 1a:539 [A] | l:111 [GLN] | a:539 [A] | ✔ |
1l:5 [PRO] | 1a:567 [G] | l:1 [ALA] | a:567 [G] | ✔ |
1l:5 [PRO] | 1a:568 [G] | l:1 [ALA] | a:568 [G] | ✔ |
1l:5 [PRO] | 1a:882 [C] | l:1 [ALA] | a:882 [C] | ✔ |
1l:5 [PRO] | 1a:883 [C] | l:1 [ALA] | a:883 [C] | ✔ |
1l:88 [GLY] | 1a:552 [U] | l:84 [GLY] | a:552 [U] | ✔ |
1l:88 [GLY] | 1a:553 [A] | l:84 [GLY] | a:553 [A] | ✔ |
1l:74 [GLY] | 1a:521 [G] | l:70 [GLY] | a:521 [G] | ✔ |
1l:69 [TYR] | 1a:521 [G] | l:65 [TYR] | a:521 [G] | ✔ |
1l:69 [TYR] | 1a:522 [C] | l:65 [TYR] | a:522 [C] | ✔ |
1l:118 [SER] | 1a:35 [G] | l:114 [SER] | a:35 [G] | ✔ |
1l:118 [SER] | 1a:36 [C] | l:114 [SER] | a:36 [C] | ✔ |
1l:118 [SER] | 1a:501 [C] | l:114 [SER] | a:501 [C] | ✔ |
1l:118 [SER] | 1a:502 [G] | l:114 [SER] | a:502 [A] | ✔ |
1l:118 [SER] | 1a:550 [G] | l:114 [SER] | a:550 [G] | ✔ |
1l:57 [LYS] | 1a:1412 [C] | l:53 [ARG] | a:1412 [C] | ✔ |
1l:8 [ASN] | 1a:585 [G] | l:4 [ASN] | a:585 [G] | ✔ |
1l:8 [ASN] | 1a:879 [C] | l:4 [ASN] | a:879 [C] | ✔ |
1l:8 [ASN] | 1a:880 [C] | l:4 [ASN] | a:880 [C] | ✔ |
1l:113 [ARG] | 1a:537 [G] | l:109 [ARG] | a:537 [G] | ✔ |
1l:113 [ARG] | 1a:538 [G] | l:109 [ARG] | a:538 [G] | ✔ |
1l:25 [PRO] | 1a:910 [C] | l:21 [PRO] | a:910 [C] | ✔ |
1l:21 [LYS] | 1a:909 [A] | l:17 [LYS] | a:909 [A] | ✔ |
1l:91 [LYS] | 1a:523 [A] | l:87 [LYS] | a:523 [A] | ✔ |
1l:91 [LYS] | 1a:525 [C] | l:87 [LYS] | a:525 [C] | ✔ |
1l:91 [LYS] | 1a:526 [C] | l:87 [LYS] | a:526 [C] | ✔ |
1l:91 [LYS] | 1a:912 [C] | l:87 [LYS] | a:912 [C] | ✔ |
1l:91 [LYS] | 1a:913 [A] | l:87 [LYS] | a:913 [A] | ✔ |
1l:53 [ARG] | 1a:521 [G] | l:49 [ARG] | a:521 [G] | ✔ |
1l:53 [ARG] | 1a:522 [C] | l:49 [ARG] | a:522 [C] | ✔ |
1l:53 [ARG] | 1a:523 [A] | l:49 [ARG] | a:523 [A] | ✔ |
1l:53 [ARG] | 1a:528 [C] | l:49 [ARG] | a:528 [C] | ✔ |
1l:53 [ARG] | 1a:529 [G] | l:49 [ARG] | a:529 [G] | ✔ |
1l:22 [SER] | 1a:554 [C] | l:18 [SER] | a:554 [A] | ✔ |
1l:84 [LEU] | 1a:34 [C] | l:80 [LEU] | a:34 [C] | ✔ |
1l:84 [LEU] | 1a:363 [A] | l:80 [LEU] | a:363 [A] | ✔ |
1l:117 [ARG] | 1a:35 [G] | l:113 [ARG] | a:35 [G] | ✔ |
1l:117 [ARG] | 1a:36 [C] | l:113 [ARG] | a:36 [C] | ✔ |
1l:117 [ARG] | 1a:37 [U] | l:113 [ARG] | a:37 [U] | ✔ |
1l:117 [ARG] | 1a:500 [G] | l:113 [ARG] | a:500 [G] | ✔ |
1l:117 [ARG] | 1a:501 [C] | l:113 [ARG] | a:501 [C] | ✔ |
1l:117 [ARG] | 1a:502 [G] | l:113 [ARG] | a:502 [A] | ✔ |
1l:101 [VAL] | 1a:34 [C] | l:97 [VAL] | a:34 [C] | ✔ |
1l:101 [VAL] | 1a:35 [G] | l:97 [VAL] | a:35 [G] | ✔ |
1l:97 [ARG] | 1a:910 [C] | l:93 [ARG] | a:910 [C] | ✔ |
1l:97 [ARG] | 1a:911 [U] | l:93 [ARG] | a:911 [U] | ✔ |
1l:45 [PRO] | 1a:1492 [A] | l:41 [PRO] | a:1492 [A] | ✔ |
1l:72 [GLY] | 1a:521 [G] | l:68 [GLY] | a:521 [G] | ✔ |
1l:72 [GLY] | 1a:522 [C] | l:68 [GLY] | a:522 [C] | ✔ |
1l:33 [ARG] | 1a:362 [G] | l:29 [LYS] | a:362 [G] | ✔ |
1l:33 [ARG] | 1a:363 [A] | l:29 [LYS] | a:363 [A] | ✔ |
1l:9 [GLN] | 1a:880 [C] | l:5 [GLN] | a:880 [C] | ✔ |
1l:9 [GLN] | 1a:881 [G] | l:5 [GLN] | a:881 [G] | ✔ |
1l:9 [GLN] | 1a:882 [C] | l:5 [GLN] | a:882 [C] | ✔ |
1l:94 [PRO] | 1a:911 [U] | l:90 [PRO] | a:911 [U] | ✔ |
1l:94 [PRO] | 1a:912 [C] | l:90 [PRO] | a:912 [C] | ✔ |
1l:94 [PRO] | 1a:1490 [C] | l:90 [PRO] | a:1490 [U] | ✔ |
1l:17 [LYS] | 1a:562 [C] | l:13 [ARG] | a:562 [U] | ✔ |
1l:48 [PRO] | 1a:518 [C] | l:44 [PRO] | a:518 [C] | ✔ |
1l:48 [PRO] | 1a:527 [7MG] | l:44 [PRO] | a:527 [G7M] | ✔ |
1l:48 [PRO] | 1a:529 [G] | l:44 [PRO] | a:529 [G] | ✔ |
1l:34 [ARG] | 1a:362 [G] | l:30 [ARG] | a:362 [G] | ✔ |
1l:34 [ARG] | 1a:363 [A] | l:30 [ARG] | a:363 [A] | ✔ |
1l:6 [THR] | 1a:879 [C] | l:2 [THR] | a:879 [C] | ✔ |
1l:6 [THR] | 1a:880 [C] | l:2 [THR] | a:880 [C] | ✔ |
1l:124 [LYS] | 1a:36 [C] | l:120 [ARG] | a:36 [C] | ✔ |
1l:124 [LYS] | 1a:37 [U] | l:120 [ARG] | a:37 [U] | ✔ |
1l:124 [LYS] | 1a:500 [G] | l:120 [ARG] | a:500 [G] | ✔ |
1l:124 [LYS] | 1a:501 [C] | l:120 [ARG] | a:501 [C] | ✔ |
1l:10 [LEU] | 1a:564 [C] | l:6 [LEU] | a:564 [C] | ✔ |
1l:92 [0TD] | 1a:522 [C] | l:88 [ASP] | a:522 [C] | ✔ |
1l:92 [0TD] | 1a:523 [A] | l:88 [ASP] | a:523 [A] | ✔ |
1l:50 [SER] | 1a:518 [C] | l:46 [SER] | a:518 [C] | ✔ |
1l:50 [SER] | 1a:519 [C] | l:46 [SER] | a:519 [C] | ✔ |
1l:50 [SER] | 1a:529 [G] | l:46 [SER] | a:529 [G] | ✔ |
1l:29 [GLY] | 1a:363 [A] | l:25 [ALA] | a:363 [A] | ✔ |
1l:29 [GLY] | 1a:553 [A] | l:25 [ALA] | a:553 [A] | ✔ |
1l:122 [THR] | 1a:35 [G] | l:118 [VAL] | a:35 [G] | ✔ |
1l:122 [THR] | 1a:36 [C] | l:118 [VAL] | a:36 [C] | ✔ |
1l:71 [PRO] | 1a:522 [C] | l:67 [GLY] | a:522 [C] | ✔ |
1l:102 [ARG] | 1a:35 [G] | l:98 [ARG] | a:35 [G] | ✔ |
1l:54 [LYS] | 1a:520 [A] | l:50 [LYS] | a:520 [A] | ✔ |
1l:54 [LYS] | 1a:521 [G] | l:50 [LYS] | a:521 [G] | ✔ |
1l:103 [GLY] | 1a:35 [G] | l:99 [GLY] | a:35 [G] | ✔ |
1l:114 [LYS] | 1a:537 [G] | l:110 [LYS] | a:537 [G] | ✔ |
1l:114 [LYS] | 1a:538 [G] | l:110 [LYS] | a:538 [G] | ✔ |
1l:114 [LYS] | 1a:539 [A] | l:110 [LYS] | a:539 [A] | ✔ |
1l:87 [GLY] | 1a:552 [U] | l:83 [GLY] | a:552 [U] | ✔ |
1l:87 [GLY] | 1a:553 [A] | l:83 [GLY] | a:553 [A] | ✔ |
1l:51 [ALA] | 1a:519 [C] | l:47 [ALA] | a:519 [C] | ✔ |
1l:51 [ALA] | 1a:520 [A] | l:47 [ALA] | a:520 [A] | ✔ |
1l:51 [ALA] | 1a:521 [G] | l:47 [ALA] | a:521 [G] | ✔ |
1l:51 [ALA] | 1a:529 [G] | l:47 [ALA] | a:529 [G] | ✔ |
1l:47 [LYS] | 1a:1492 [A] | l:43 [LYS] | a:1492 [A] | ✔ |
1l:47 [LYS] | 1a:1493 [A] | l:43 [LYS] | a:1493 [A] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:33 [A] | l:28 [GLN] | a:33 [A] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:34 [C] | l:28 [GLN] | a:34 [C] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:363 [A] | l:28 [GLN] | a:363 [A] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:551 [U] | l:28 [GLN] | a:551 [U] | ✔ |
1l:32 [PHE] | 1a:552 [U] | l:28 [GLN] | a:552 [U] | ✔ |
1l:121 [GLY] | 1a:35 [G] | l:117 [GLY] | a:35 [G] | ✔ |
1l:121 [GLY] | 1a:36 [C] | l:117 [GLY] | a:36 [C] | ✔ |
1l:116 [SER] | 1a:502 [G] | l:112 [ALA] | a:502 [A] | ✔ |
1l:116 [SER] | 1a:503 [C] | l:112 [ALA] | a:503 [C] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:518 [C] | l:45 [ASN] | a:518 [C] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:521 [G] | l:45 [ASN] | a:521 [G] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:522 [C] | l:45 [ASN] | a:522 [C] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:523 [A] | l:45 [ASN] | a:523 [A] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:527 [7MG] | l:45 [ASN] | a:527 [G7M] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:528 [C] | l:45 [ASN] | a:528 [C] | ✔ |
1l:49 [ASN] | 1a:529 [G] | l:45 [ASN] | a:529 [G] | ✔ |
1l:95 [GLY] | 1a:911 [U] | l:91 [GLY] | a:911 [U] | ✔ |
1l:73 [GLU] | 1a:520 [A] | l:69 [GLU] | a:520 [A] | ✔ |
1l:73 [GLU] | 1a:521 [G] | l:69 [GLU] | a:521 [G] | ✔ |
1l:73 [GLU] | 1a:536 [C] | l:69 [GLU] | a:536 [C] | ✔ |
1l:73 [GLU] | 1a:537 [G] | l:69 [GLU] | a:537 [G] | ✔ |
1l:27 [LEU] | 1a:552 [U] | l:23 [LEU] | a:552 [U] | ✔ |
1l:27 [LEU] | 1a:553 [A] | l:23 [LEU] | a:553 [A] | ✔ |
1l:123 [LYS] | 1a:36 [C] | l:119 [LYS] | a:36 [C] | ✔ |
1l:123 [LYS] | 1a:37 [U] | l:119 [LYS] | a:37 [U] | ✔ |
1l:16 [GLU] | 1a:562 [C] | l:12 [ALA] | a:562 [U] | ✔ |
1l:119 [LYS] | 1a:35 [G] | l:115 [LYS] | a:35 [G] | ✔ |
1l:119 [LYS] | 1a:502 [G] | l:115 [LYS] | a:502 [A] | ✔ |
1l:119 [LYS] | 1a:503 [C] | l:115 [LYS] | a:503 [C] | ✔ |
1l:119 [LYS] | 1a:550 [G] | l:115 [LYS] | a:550 [G] | ✔ |
1l:119 [LYS] | 1a:551 [U] | l:115 [LYS] | a:551 [U] | ✔ |
1l:52 [LEU] | 1a:519 [C] | l:48 [LEU] | a:519 [C] | ✔ |
1l:52 [LEU] | 1a:520 [A] | l:48 [LEU] | a:520 [A] | ✔ |
1l:52 [LEU] | 1a:521 [G] | l:48 [LEU] | a:521 [G] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:32 [A] | l:27 [PRO] | a:32 [A] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:33 [A] | l:27 [PRO] | a:33 [A] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:363 [A] | l:27 [PRO] | a:363 [A] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:552 [U] | l:27 [PRO] | a:552 [U] | ✔ |
1l:31 [PRO] | 1a:553 [A] | l:27 [PRO] | a:553 [A] | ✔ |
1l:46 [LYS] | 1a:912 [C] | l:42 [LYS] | a:912 [C] | ✔ |
1l:46 [LYS] | 1a:913 [A] | l:42 [LYS] | a:913 [A] | ✔ |
1l:46 [LYS] | 1a:1491 [G] | l:42 [LYS] | a:1491 [G] | ✔ |
1l:46 [LYS] | 1a:1492 [A] | l:42 [LYS] | a:1492 [A] | ✔ |
1l:15 [ARG] | 1a:562 [C] | l:11 [ARG] | a:562 [U] | ✔ |
1l:15 [ARG] | 1a:563 [A] | l:11 [ARG] | a:563 [A] | ✔ |
1l:15 [ARG] | 1a:564 [C] | l:11 [ARG] | a:564 [C] | ✔ |
1l:15 [ARG] | 1a:567 [G] | l:11 [ARG] | a:567 [G] | ✔ |
1l:15 [ARG] | 1a:883 [C] | l:11 [ARG] | a:883 [C] | ✔ |
1l:15 [ARG] | 1a:884 [U] | l:11 [ARG] | a:884 [U] | ✔ |
1l:90 [VAL] | 1a:523 [A] | l:86 [VAL] | a:523 [A] | ✔ |
1l:89 [ARG] | 1a:524 [G] | l:85 [ARG] | a:524 [G] | ✔ |
1l:89 [ARG] | 1a:525 [C] | l:85 [ARG] | a:525 [C] | ✔ |
1l:89 [ARG] | 1a:912 [C] | l:85 [ARG] | a:912 [C] | ✔ |
1l:89 [ARG] | 1a:913 [A] | l:85 [ARG] | a:913 [A] | ✔ |
1l:86 [ARG] | 1a:551 [U] | l:82 [ARG] | a:551 [U] | ✔ |
1l:86 [ARG] | 1a:552 [U] | l:82 [ARG] | a:552 [U] | ✔ |
1l:61 [THR] | 1a:362 [G] | l:57 [THR] | a:362 [G] | ✔ |
1l:61 [THR] | 1a:363 [A] | l:57 [THR] | a:363 [A] | ✔ |
1l:12 [ARG] | 1a:759 [A] | l:8 [ARG] | a:759 [A] | ✔ |
1l:12 [ARG] | 1a:880 [C] | l:8 [ARG] | a:880 [C] | ✔ |
1l:12 [ARG] | 1a:881 [G] | l:8 [ARG] | a:881 [G] | ✔ |
1l:18 [VAL] | 1a:562 [C] | l:14 [LYS] | a:562 [U] | ✔ |
1l:120 [TYR] | 1a:35 [G] | l:116 [TYR] | a:35 [G] | ✔ |
1l:120 [TYR] | 1a:522 [C] | l:116 [TYR] | a:522 [C] | ✔ |
1l:120 [TYR] | 1a:523 [A] | l:116 [TYR] | a:523 [A] | ✔ |
1l:120 [TYR] | 1a:537 [G] | l:116 [TYR] | a:537 [G] | ✔ |
1l:74 [GLY] | 1a:520 [A] | l:70 [GLY] | a:520 [A] | ❌ 7PJS_l_a |
1l:53 [ARG] | 1a:520 [A] | l:49 [ARG] | a:520 [A] | ❌ 7PJS_l_a |
1l:44 [THR] | 1a:1493 [A] | l:40 [THR] | a:1493 [A] | ❌ 7PJS_l_a |
1l:92 [0TD] | 1a:527 [7MG] | l:88 [ASP] | a:527 [G7M] | ❌ 7PJS_l_a |
1l:50 [SER] | 1a:521 [G] | l:46 [SER] | a:521 [G] | ❌ 7PJS_l_a |
1l:46 [LYS] | 1a:1490 [C] | l:42 [LYS] | a:1490 [U] | ❌ 7PJS_l_a |
1l:5 [PRO] | 1a:564 [C] | l:1 [ALA] | a:564 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:112 [ASP] | 1a:537 [G] | l:108 [ASP] | a:537 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:113 [ARG] | 1a:536 [C] | l:109 [ARG] | a:536 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:115 [LYS] | 1a:503 [C] | l:111 [GLN] | a:503 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:119 [LYS] | 1a:523 [A] | l:115 [LYS] | a:523 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:17 [LYS] | 1a:563 [A] | l:13 [ARG] | a:563 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:18 [VAL] | 1a:884 [U] | l:14 [LYS] | a:884 [U] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:18 [VAL] | 1a:23 [C] | l:14 [LYS] | a:23 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:21 [LYS] | 1a:911 [U] | l:17 [LYS] | a:911 [U] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:21 [LYS] | 1a:910 [C] | l:17 [LYS] | a:910 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:29 [GLY] | 1a:554 [C] | l:25 [ALA] | a:554 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:30 [ALA] | 1a:552 [U] | l:26 [CYS] | a:552 [U] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:44 [THR] | 1a:1491 [G] | l:40 [THR] | a:1491 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:45 [PRO] | 1a:1491 [G] | l:41 [PRO] | a:1491 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:47 [LYS] | 1a:1491 [G] | l:43 [LYS] | a:1491 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:50 [SER] | 1a:1492 [A] | l:46 [SER] | a:1492 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:51 [ALA] | 1a:518 [C] | l:47 [ALA] | a:518 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:12 [ARG] | 1a:879 [C] | l:8 [ARG] | a:879 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:91 [LYS] | 1a:527 [7MG] | l:87 [LYS] | a:527 [G7M] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:94 [PRO] | 1a:1491 [G] | l:90 [PRO] | a:1491 [G] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:95 [GLY] | 1a:912 [C] | l:91 [GLY] | a:912 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:97 [ARG] | 1a:909 [A] | l:93 [ARG] | a:909 [A] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:103 [GLY] | 1a:36 [C] | l:99 [GLY] | a:36 [C] | ❌ 4Y4O_1l_1a |
1l:23 [LYS] | 1a:24 [U] | l:19 [ASN] | a:24 [U] | ❌ 7PJS_l:19, 7PJS_a:24 no longer at interface |
1l:105 [TYR] | 1a:364 [A] | l:101 [LEU] | a:364 [A] | ❌ 7PJS_l:101, 7PJS_a:364 no longer at interface |
1l:17 [LYS] | 1a:303 [A] | l:13 [ARG] | a:303 [A] | ❌ 4Y4O_1a:303 no longer at interface |
1l:17 [LYS] | 1a:301 [G] | l:13 [ARG] | a:301 [G] | ❌ 4Y4O_1a:301 no longer at interface |
1l:17 [LYS] | 1a:302 [G] | l:13 [ARG] | a:302 [G] | ❌ 4Y4O_1a:302 no longer at interface |
1l:18 [VAL] | 1a:22 [G] | l:14 [LYS] | a:22 [G] | ❌ 4Y4O_1a:22 no longer at interface |
1l:18 [VAL] | 1a:885 [G] | l:14 [LYS] | a:885 [G] | ❌ 4Y4O_1a:885 no longer at interface |
1l:18 [VAL] | 1a:561 [U] | l:14 [LYS] | a:561 [U] | ❌ 4Y4O_1a:561 no longer at interface |
1l:34 [ARG] | 1a:361 [G] | l:30 [ARG] | a:361 [G] | ❌ 4Y4O_1a:361 no longer at interface |
1l:8 [ASN] | 1a:584 [G] | l:4 [ASN] | a:584 [G] | ❌ 4Y4O_1a:584 no longer at interface |
1l:57 [LYS] | 1a:1413 [A] | l:53 [ARG] | a:1413 [A] | ❌ 4Y4O_1a:1413 no longer at interface |
1l:65 [GLU] | 1a:1413 [A] | l:61 [GLU] | a:1413 [A] | ❌ 4Y4O_1l:65, 4Y4O_1a:1413 no longer at interface |
1l:23 [LYS] | 1a:23 [C] | l:19 [ASN] | a:23 [C] | ❌ 7PJS_l:19 no longer at interface |
1l:23 [LYS] | 1a:554 [C] | l:19 [ASN] | a:554 [A] | ❌ 7PJS_l:19 no longer at interface |
1l:41 [ARG] | 1a:1411 [C] | l:37 [TYR] | a:1411 [C] | ❌ 7PJS_l:37 no longer at interface |
1l:7 [ILE] | 1a:564 [C] | l:3 [VAL] | a:564 [C] | ❌ 7PJS_l:3 no longer at interface |
1l:13 [LYS] | 1a:881 [G] | l:9 [LYS] | a:881 [G] | ❌ 7PJS_l:9 no longer at interface |
1l:13 [LYS] | 1a:882 [C] | l:9 [LYS] | a:882 [C] | ❌ 7PJS_l:9 no longer at interface |
1l:105 [TYR] | 1a:363 [A] | l:101 [LEU] | a:363 [A] | ❌ 7PJS_l:101 no longer at interface |
1l:14 [GLY] | 1a:562 [C] | l:10 [PRO] | a:562 [U] | ❌ 7PJS_l:10 no longer at interface |
1l:39 [VAL] | 1a:1411 [C] | l:35 [ARG] | a:1411 [C] | ❌ 4Y4O_1l:39 no longer at interface |
1l:96 [VAL] | 1a:911 [U] | l:92 [VAL] | a:911 [U] | ❌ 4Y4O_1l:96 no longer at interface |
1l:99 [HIS] | 1a:523 [A] | l:95 [HIS] | a:523 [A] | ❌ 4Y4O_1l:99 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Nucleic acid-binding proteins | Bacterial small subunit ribosomal RNA | 0.98 | 0.67 | 0.72 | 0.98 | 0.98 | 0.94 | 0.97 | 0.93 | 0.83 | 0.61 | 0.44 |
Other pairs involving 4Y4O_1l_1a or 7PJS_l_a
Total number of entries: 12