Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6S0X_l
|
6S0X_a
|
7K00_L
|
7K00_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
l:5 [ASN] | a:593 [G] | L:5 [ASN] | A:585 [G] | ✔ |
l:5 [ASN] | a:888 [C] | L:5 [ASN] | A:879 [C] | ✔ |
l:5 [ASN] | a:889 [C] | L:5 [ASN] | A:880 [C] | ✔ |
l:101 [LYS] | a:531 [A] | L:88 [LYS] | A:523 [A] | ✔ |
l:101 [LYS] | a:533 [C] | L:88 [LYS] | A:525 [C] | ✔ |
l:101 [LYS] | a:534 [C] | L:88 [LYS] | A:526 [C] | ✔ |
l:71 [SER] | a:370 [G] | L:58 [THR] | A:362 [G] | ✔ |
l:71 [SER] | a:371 [A] | L:58 [THR] | A:363 [A] | ✔ |
l:123 [ARG] | a:545 [G] | L:110 [ARG] | A:537 [G] | ✔ |
l:123 [ARG] | a:546 [U] | L:110 [ARG] | A:538 [G] | ✔ |
l:61 [ALA] | a:526 [C] | L:48 [ALA] | A:518 [C] | ✔ |
l:61 [ALA] | a:527 [C] | L:48 [ALA] | A:519 [C] | ✔ |
l:61 [ALA] | a:528 [A] | L:48 [ALA] | A:520 [A] | ✔ |
l:61 [ALA] | a:529 [G] | L:48 [ALA] | A:521 [G] | ✔ |
l:61 [ALA] | a:537 [G] | L:48 [ALA] | A:529 [G] | ✔ |
l:113 [GLY] | a:36 [G] | L:100 [GLY] | A:35 [G] | ✔ |
l:113 [GLY] | a:37 [C] | L:100 [GLY] | A:36 [C] | ✔ |
l:125 [GLN] | a:546 [U] | L:112 [GLN] | A:538 [G] | ✔ |
l:125 [GLN] | a:547 [A] | L:112 [GLN] | A:539 [A] | ✔ |
l:56 [LYS] | a:1502 [G] | L:43 [LYS] | A:1491 [G] | ✔ |
l:56 [LYS] | a:1503 [A] | L:43 [LYS] | A:1492 [A] | ✔ |
l:59 [ASN] | a:526 [C] | L:46 [ASN] | A:518 [C] | ✔ |
l:59 [ASN] | a:529 [G] | L:46 [ASN] | A:521 [G] | ✔ |
l:59 [ASN] | a:535 [G] | L:46 [ASN] | A:527 [G7M] | ✔ |
l:59 [ASN] | a:536 [C] | L:46 [ASN] | A:528 [C] | ✔ |
l:59 [ASN] | a:537 [G] | L:46 [ASN] | A:529 [G] | ✔ |
l:105 [GLY] | a:920 [U] | L:92 [GLY] | A:911 [U] | ✔ |
l:7 [LEU] | a:572 [U] | L:7 [LEU] | A:564 [C] | ✔ |
l:94 [LEU] | a:35 [C] | L:81 [LEU] | A:34 [C] | ✔ |
l:94 [LEU] | a:371 [A] | L:81 [LEU] | A:363 [A] | ✔ |
l:63 [ARG] | a:529 [G] | L:50 [ARG] | A:521 [G] | ✔ |
l:63 [ARG] | a:530 [C] | L:50 [ARG] | A:522 [C] | ✔ |
l:63 [ARG] | a:531 [A] | L:50 [ARG] | A:523 [A] | ✔ |
l:82 [GLY] | a:529 [G] | L:69 [GLY] | A:521 [G] | ✔ |
l:82 [GLY] | a:530 [C] | L:69 [GLY] | A:522 [C] | ✔ |
l:43 [LYS] | a:370 [G] | L:30 [LYS] | A:362 [G] | ✔ |
l:43 [LYS] | a:371 [A] | L:30 [LYS] | A:363 [A] | ✔ |
l:83 [ILE] | a:528 [A] | L:70 [GLU] | A:520 [A] | ✔ |
l:83 [ILE] | a:529 [G] | L:70 [GLU] | A:521 [G] | ✔ |
l:19 [SER] | a:562 [U] | L:19 [SER] | A:554 [A] | ✔ |
l:6 [GLN] | a:889 [C] | L:6 [GLN] | A:880 [C] | ✔ |
l:6 [GLN] | a:890 [G] | L:6 [GLN] | A:881 [G] | ✔ |
l:6 [GLN] | a:891 [C] | L:6 [GLN] | A:882 [C] | ✔ |
l:60 [SER] | a:526 [C] | L:47 [SER] | A:518 [C] | ✔ |
l:60 [SER] | a:527 [C] | L:47 [SER] | A:519 [C] | ✔ |
l:60 [SER] | a:529 [G] | L:47 [SER] | A:521 [G] | ✔ |
l:60 [SER] | a:537 [G] | L:47 [SER] | A:529 [G] | ✔ |
l:131 [GLY] | a:36 [G] | L:119 [VAL] | A:35 [G] | ✔ |
l:131 [GLY] | a:37 [C] | L:119 [VAL] | A:36 [C] | ✔ |
l:64 [LYS] | a:528 [A] | L:51 [LYS] | A:520 [A] | ✔ |
l:64 [LYS] | a:529 [G] | L:51 [LYS] | A:521 [G] | ✔ |
l:15 [LYS] | a:570 [U] | L:15 [LYS] | A:562 [U] | ✔ |
l:15 [LYS] | a:893 [U] | L:15 [LYS] | A:884 [U] | ✔ |
l:15 [LYS] | a:894 [G] | L:15 [LYS] | A:885 [G] | ✔ |
l:127 [ARG] | a:509 [C] | L:114 [ARG] | A:501 [C] | ✔ |
l:127 [ARG] | a:510 [C] | L:114 [ARG] | A:502 [A] | ✔ |
l:40 [SER] | a:371 [A] | L:27 [CYS] | A:363 [A] | ✔ |
l:40 [SER] | a:561 [A] | L:27 [CYS] | A:553 [A] | ✔ |
l:126 [GLY] | a:510 [C] | L:113 [ALA] | A:502 [A] | ✔ |
l:126 [GLY] | a:511 [A] | L:113 [ALA] | A:503 [C] | ✔ |
l:3 [THR] | a:888 [C] | L:3 [THR] | A:879 [C] | ✔ |
l:3 [THR] | a:889 [C] | L:3 [THR] | A:880 [C] | ✔ |
l:102 [ASP] | a:531 [A] | L:89 [D2T] | A:523 [A] | ✔ |
l:97 [GLY] | a:560 [U] | L:84 [GLY] | A:552 [U] | ✔ |
l:97 [GLY] | a:561 [A] | L:84 [GLY] | A:553 [A] | ✔ |
l:100 [VAL] | a:531 [A] | L:87 [VAL] | A:523 [A] | ✔ |
l:107 [ARG] | a:919 [C] | L:94 [ARG] | A:910 [C] | ✔ |
l:107 [ARG] | a:920 [U] | L:94 [ARG] | A:911 [U] | ✔ |
l:14 [SER] | a:570 [U] | L:14 [ARG] | A:562 [U] | ✔ |
l:130 [TYR] | a:36 [G] | L:118 [GLY] | A:35 [G] | ✔ |
l:129 [LEU] | a:36 [G] | L:116 [LYS] | A:35 [G] | ✔ |
l:129 [LEU] | a:510 [C] | L:116 [LYS] | A:502 [A] | ✔ |
l:129 [LEU] | a:558 [G] | L:116 [LYS] | A:550 [G] | ✔ |
l:81 [PRO] | a:530 [C] | L:68 [GLY] | A:522 [C] | ✔ |
l:9 [ARG] | a:889 [C] | L:9 [ARG] | A:880 [C] | ✔ |
l:9 [ARG] | a:890 [G] | L:9 [ARG] | A:881 [G] | ✔ |
l:2 [PRO] | a:575 [G] | L:2 [ALA] | A:567 [G] | ✔ |
l:2 [PRO] | a:576 [G] | L:2 [ALA] | A:568 [G] | ✔ |
l:41 [PRO] | a:33 [A] | L:28 [PRO] | A:32 [A] | ✔ |
l:41 [PRO] | a:34 [A] | L:28 [PRO] | A:33 [A] | ✔ |
l:41 [PRO] | a:371 [A] | L:28 [PRO] | A:363 [A] | ✔ |
l:41 [PRO] | a:560 [U] | L:28 [PRO] | A:552 [U] | ✔ |
l:41 [PRO] | a:561 [A] | L:28 [PRO] | A:553 [A] | ✔ |
l:42 [GLN] | a:34 [A] | L:29 [GLN] | A:33 [A] | ✔ |
l:42 [GLN] | a:35 [C] | L:29 [GLN] | A:34 [C] | ✔ |
l:42 [GLN] | a:371 [A] | L:29 [GLN] | A:363 [A] | ✔ |
l:42 [GLN] | a:560 [U] | L:29 [GLN] | A:552 [U] | ✔ |
l:133 [LYS] | a:37 [C] | L:121 [ARG] | A:36 [C] | ✔ |
l:133 [LYS] | a:38 [U] | L:121 [ARG] | A:37 [U] | ✔ |
l:12 [ARG] | a:570 [U] | L:12 [ARG] | A:562 [U] | ✔ |
l:12 [ARG] | a:571 [A] | L:12 [ARG] | A:563 [A] | ✔ |
l:12 [ARG] | a:572 [U] | L:12 [ARG] | A:564 [C] | ✔ |
l:12 [ARG] | a:575 [G] | L:12 [ARG] | A:567 [G] | ✔ |
l:12 [ARG] | a:892 [C] | L:12 [ARG] | A:883 [C] | ✔ |
l:12 [ARG] | a:893 [U] | L:12 [ARG] | A:884 [U] | ✔ |
l:24 [LEU] | a:560 [U] | L:24 [LEU] | A:552 [U] | ✔ |
l:24 [LEU] | a:561 [A] | L:24 [LEU] | A:553 [A] | ✔ |
l:62 [LEU] | a:527 [C] | L:49 [LEU] | A:519 [C] | ✔ |
l:62 [LEU] | a:528 [A] | L:49 [LEU] | A:520 [A] | ✔ |
l:62 [LEU] | a:529 [G] | L:49 [LEU] | A:521 [G] | ✔ |
l:13 [GLN] | a:570 [U] | L:13 [ALA] | A:562 [U] | ✔ |
l:79 [TYR] | a:529 [G] | L:66 [TYR] | A:521 [G] | ✔ |
l:79 [TYR] | a:530 [C] | L:66 [TYR] | A:522 [C] | ✔ |
l:96 [ARG] | a:559 [U] | L:83 [ARG] | A:551 [U] | ✔ |
l:96 [ARG] | a:560 [U] | L:83 [ARG] | A:552 [U] | ✔ |
l:67 [ARG] | a:1422 [C] | L:54 [ARG] | A:1412 [C] | ✔ |
l:67 [ARG] | a:1423 [A] | L:54 [ARG] | A:1413 [A] | ✔ |
l:99 [ARG] | a:921 [C] | L:86 [ARG] | A:912 [C] | ✔ |
l:99 [ARG] | a:922 [A] | L:86 [ARG] | A:913 [A] | ✔ |
l:98 [GLY] | a:560 [U] | L:85 [GLY] | A:552 [U] | ✔ |
l:98 [GLY] | a:561 [A] | L:85 [GLY] | A:553 [A] | ✔ |
l:22 [PRO] | a:919 [C] | L:22 [PRO] | A:910 [C] | ✔ |
l:39 [ASN] | a:371 [A] | L:26 [ALA] | A:363 [A] | ✔ |
l:39 [ASN] | a:561 [A] | L:26 [ALA] | A:553 [A] | ✔ |
l:39 [ASN] | a:562 [U] | L:26 [ALA] | A:554 [A] | ✔ |
l:21 [SER] | a:561 [A] | L:21 [VAL] | A:553 [A] | ✔ |
l:18 [LYS] | a:918 [A] | L:18 [LYS] | A:909 [A] | ✔ |
l:18 [LYS] | a:919 [C] | L:18 [LYS] | A:910 [C] | ✔ |
l:104 [PRO] | a:921 [C] | L:91 [PRO] | A:912 [C] | ✔ |
l:104 [PRO] | a:1501 [U] | L:91 [PRO] | A:1490 [U] | ✔ |
l:104 [PRO] | a:1502 [G] | L:91 [PRO] | A:1491 [G] | ✔ |
l:132 [THR] | a:37 [C] | L:120 [LYS] | A:36 [C] | ✔ |
l:122 [GLY] | a:546 [U] | L:109 [ASP] | A:538 [G] | ✔ |
l:128 [SER] | a:36 [G] | L:115 [SER] | A:35 [G] | ✔ |
l:128 [SER] | a:37 [C] | L:115 [SER] | A:36 [C] | ✔ |
l:128 [SER] | a:509 [C] | L:115 [SER] | A:501 [C] | ✔ |
l:128 [SER] | a:510 [C] | L:115 [SER] | A:502 [A] | ✔ |
l:128 [SER] | a:558 [G] | L:115 [SER] | A:550 [G] | ✔ |
l:49 [ARG] | a:1421 [C] | L:36 [ARG] | A:1411 [C] | ✔ |
l:124 [ARG] | a:546 [U] | L:111 [LYS] | A:538 [G] | ✔ |
l:124 [ARG] | a:547 [A] | L:111 [LYS] | A:539 [A] | ✔ |
l:112 [ARG] | a:36 [G] | L:99 [ARG] | A:35 [G] | ✔ |
l:111 [VAL] | a:35 [C] | L:98 [VAL] | A:34 [C] | ✔ |
l:58 [PRO] | a:526 [C] | L:45 [PRO] | A:518 [C] | ✔ |
l:114 [ALA] | a:36 [G] | L:101 [ALA] | A:35 [G] | ✔ |
l:101 [LYS] | a:532 [G] | L:88 [LYS] | A:524 [G] | ❌ 7K00_L_A |
l:123 [ARG] | a:511 [A] | L:110 [ARG] | A:503 [C] | ❌ 7K00_L_A |
l:125 [GLN] | a:510 [C] | L:112 [GLN] | A:502 [A] | ❌ 7K00_L_A |
l:125 [GLN] | a:511 [A] | L:112 [GLN] | A:503 [C] | ❌ 7K00_L_A |
l:125 [GLN] | a:545 [G] | L:112 [GLN] | A:537 [G] | ❌ 7K00_L_A |
l:63 [ARG] | a:528 [A] | L:50 [ARG] | A:520 [A] | ❌ 7K00_L_A |
l:63 [ARG] | a:535 [G] | L:50 [ARG] | A:527 [G7M] | ❌ 7K00_L_A |
l:60 [SER] | a:528 [A] | L:47 [SER] | A:520 [A] | ❌ 7K00_L_A |
l:109 [HIS] | a:560 [U] | L:96 [HIS] | A:552 [U] | ❌ 7K00_L_A |
l:126 [GLY] | a:546 [U] | L:113 [ALA] | A:538 [G] | ❌ 7K00_L_A |
l:107 [ARG] | a:921 [C] | L:94 [ARG] | A:912 [C] | ❌ 7K00_L_A |
l:130 [TYR] | a:530 [C] | L:118 [GLY] | A:522 [C] | ❌ 7K00_L_A |
l:9 [ARG] | a:888 [C] | L:9 [ARG] | A:879 [C] | ❌ 7K00_L_A |
l:2 [PRO] | a:572 [U] | L:2 [ALA] | A:564 [C] | ❌ 7K00_L_A |
l:133 [LYS] | a:36 [G] | L:121 [ARG] | A:35 [G] | ❌ 7K00_L_A |
l:20 [ASP] | a:561 [A] | L:20 [ASN] | A:553 [A] | ❌ 7K00_L_A |
l:20 [ASP] | a:562 [U] | L:20 [ASN] | A:554 [A] | ❌ 7K00_L_A |
l:79 [TYR] | a:531 [A] | L:66 [TYR] | A:523 [A] | ❌ 7K00_L_A |
l:18 [LYS] | a:920 [U] | L:18 [LYS] | A:911 [U] | ❌ 7K00_L_A |
l:132 [THR] | a:36 [G] | L:120 [LYS] | A:35 [G] | ❌ 7K00_L_A |
l:122 [GLY] | a:545 [G] | L:109 [ASP] | A:537 [G] | ❌ 7K00_L_A |
l:114 [ALA] | a:35 [C] | L:101 [ALA] | A:34 [C] | ❌ 7K00_L_A |
l:124 [ARG] | a:545 [G] | L:111 [LYS] | A:537 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
l:127 [ARG] | a:508 [G] | L:114 [ARG] | A:500 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
l:127 [ARG] | a:36 [G] | L:114 [ARG] | A:35 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
l:127 [ARG] | a:37 [C] | L:114 [ARG] | A:36 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
l:127 [ARG] | a:38 [U] | L:114 [ARG] | A:37 [U] | ❌ 6S0X_l_a |
l:129 [LEU] | a:559 [U] | L:116 [LYS] | A:551 [U] | ❌ 6S0X_l_a |
l:129 [LEU] | a:511 [A] | L:116 [LYS] | A:503 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
l:129 [LEU] | a:531 [A] | L:116 [LYS] | A:523 [A] | ❌ 6S0X_l_a |
l:130 [TYR] | a:37 [C] | L:118 [GLY] | A:36 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
l:132 [THR] | a:38 [U] | L:120 [LYS] | A:37 [U] | ❌ 6S0X_l_a |
l:133 [LYS] | a:508 [G] | L:121 [ARG] | A:500 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
l:133 [LYS] | a:509 [C] | L:121 [ARG] | A:501 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
l:14 [SER] | a:571 [A] | L:14 [ARG] | A:563 [A] | ❌ 6S0X_l_a |
l:2 [PRO] | a:891 [C] | L:2 [ALA] | A:882 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
l:2 [PRO] | a:892 [C] | L:2 [ALA] | A:883 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
l:2 [PRO] | a:890 [G] | L:2 [ALA] | A:881 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
l:21 [SER] | a:562 [U] | L:21 [VAL] | A:554 [A] | ❌ 6S0X_l_a |
l:40 [SER] | a:560 [U] | L:27 [CYS] | A:552 [U] | ❌ 6S0X_l_a |
l:42 [GLN] | a:559 [U] | L:29 [GLN] | A:551 [U] | ❌ 6S0X_l_a |
l:56 [LYS] | a:921 [C] | L:43 [LYS] | A:912 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
l:56 [LYS] | a:922 [A] | L:43 [LYS] | A:913 [A] | ❌ 6S0X_l_a |
l:58 [PRO] | a:535 [G] | L:45 [PRO] | A:527 [G7M] | ❌ 6S0X_l_a |
l:58 [PRO] | a:537 [G] | L:45 [PRO] | A:529 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
l:59 [ASN] | a:530 [C] | L:46 [ASN] | A:522 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
l:59 [ASN] | a:531 [A] | L:46 [ASN] | A:523 [A] | ❌ 6S0X_l_a |
l:60 [SER] | a:1503 [A] | L:47 [SER] | A:1492 [A] | ❌ 6S0X_l_a |
l:63 [ARG] | a:536 [C] | L:50 [ARG] | A:528 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
l:81 [PRO] | a:529 [G] | L:68 [GLY] | A:521 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
l:83 [ILE] | a:545 [G] | L:70 [GLU] | A:537 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
l:99 [ARG] | a:534 [C] | L:86 [ARG] | A:526 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
l:99 [ARG] | a:533 [C] | L:86 [ARG] | A:525 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
l:99 [ARG] | a:532 [G] | L:86 [ARG] | A:524 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
l:101 [LYS] | a:921 [C] | L:88 [LYS] | A:912 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
l:101 [LYS] | a:535 [G] | L:88 [LYS] | A:527 [G7M] | ❌ 6S0X_l_a |
l:101 [LYS] | a:922 [A] | L:88 [LYS] | A:913 [A] | ❌ 6S0X_l_a |
l:102 [ASP] | a:535 [G] | L:89 [D2T] | A:527 [G7M] | ❌ 6S0X_l_a |
l:102 [ASP] | a:530 [C] | L:89 [D2T] | A:522 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
l:104 [PRO] | a:920 [U] | L:91 [PRO] | A:911 [U] | ❌ 6S0X_l_a |
l:105 [GLY] | a:921 [C] | L:92 [GLY] | A:912 [C] | ❌ 6S0X_l_a |
l:109 [HIS] | a:531 [A] | L:96 [HIS] | A:523 [A] | ❌ 6S0X_l_a |
l:111 [VAL] | a:36 [G] | L:98 [VAL] | A:35 [G] | ❌ 6S0X_l_a |
l:5 [ASN] | a:594 [C] | L:5 [ASN] | A:586 [C] | ❌ 7K00_A:586 no longer at interface |
l:17 [LYS] | a:564 [C] | L:17 [ALA] | A:556 [C] | ❌ 7K00_L:17, 7K00_A:556 no longer at interface |
l:128 [SER] | a:557 [C] | L:115 [SER] | A:549 [C] | ❌ 7K00_A:549 no longer at interface |
l:123 [ARG] | a:544 [C] | L:110 [ARG] | A:536 [C] | ❌ 6S0X_a:544 no longer at interface |
l:133 [LYS] | a:507 [A] | L:121 [ARG] | A:499 [A] | ❌ 6S0X_a:507 no longer at interface |
l:14 [SER] | a:309 [G] | L:14 [ARG] | A:301 [G] | ❌ 6S0X_a:309 no longer at interface |
l:14 [SER] | a:310 [G] | L:14 [ARG] | A:302 [G] | ❌ 6S0X_a:310 no longer at interface |
l:14 [SER] | a:311 [G] | L:14 [ARG] | A:303 [A] | ❌ 6S0X_a:311 no longer at interface |
l:15 [LYS] | a:569 [U] | L:15 [LYS] | A:561 [U] | ❌ 6S0X_a:569 no longer at interface |
l:15 [LYS] | a:23 [G] | L:15 [LYS] | A:22 [G] | ❌ 6S0X_a:23 no longer at interface |
l:2 [PRO] | a:577 [C] | L:2 [ALA] | A:569 [C] | ❌ 6S0X_a:577 no longer at interface |
l:20 [ASP] | a:25 [U] | L:20 [ASN] | A:24 [U] | ❌ 6S0X_a:25 no longer at interface |
l:5 [ASN] | a:592 [G] | L:5 [ASN] | A:584 [G] | ❌ 6S0X_a:592 no longer at interface |
l:9 [ARG] | a:767 [A] | L:9 [ARG] | A:759 [A] | ❌ 6S0X_a:767 no longer at interface |
l:4 [ILE] | a:572 [U] | L:4 [VAL] | A:564 [C] | ❌ 7K00_L:4 no longer at interface |
l:135 [PRO] | a:509 [C] | L:123 [LYS] | A:501 [C] | ❌ 7K00_L:123 no longer at interface |
l:77 [ASN] | a:1422 [C] | L:64 [THR] | A:1412 [C] | ❌ 7K00_L:64 no longer at interface |
l:134 [LYS] | a:37 [C] | L:122 [PRO] | A:36 [C] | ❌ 7K00_L:122 no longer at interface |
l:134 [LYS] | a:38 [U] | L:122 [PRO] | A:37 [U] | ❌ 7K00_L:122 no longer at interface |
l:134 [LYS] | a:508 [G] | L:122 [PRO] | A:500 [G] | ❌ 7K00_L:122 no longer at interface |
l:134 [LYS] | a:509 [C] | L:122 [PRO] | A:501 [C] | ❌ 7K00_L:122 no longer at interface |
l:25 [ASN] | a:562 [U] | L:25 [GLU] | A:554 [A] | ❌ 7K00_L:25 no longer at interface |
l:45 [GLY] | a:370 [G] | L:31 [ARG] | A:362 [G] | ❌ 6S0X_l:45 no longer at interface |
l:45 [GLY] | a:371 [A] | L:31 [ARG] | A:363 [A] | ❌ 6S0X_l:45 no longer at interface |
l:45 [GLY] | a:369 [G] | L:31 [ARG] | A:361 [G] | ❌ 6S0X_l:45 no longer at interface |
l:54 [THR] | a:1502 [G] | L:41 [THR] | A:1491 [G] | ❌ 6S0X_l:54 no longer at interface |
l:55 [PRO] | a:1503 [A] | L:42 [PRO] | A:1492 [A] | ❌ 6S0X_l:55 no longer at interface |
l:55 [PRO] | a:1502 [G] | L:42 [PRO] | A:1491 [G] | ❌ 6S0X_l:55 no longer at interface |
l:57 [LYS] | a:1503 [A] | L:44 [LYS] | A:1492 [A] | ❌ 6S0X_l:57 no longer at interface |
l:57 [LYS] | a:1502 [G] | L:44 [LYS] | A:1491 [G] | ❌ 6S0X_l:57 no longer at interface |
l:75 [GLU] | a:1423 [A] | L:62 [GLU] | A:1413 [A] | ❌ 6S0X_l:75 no longer at interface |
l:84 [GLY] | a:529 [G] | L:71 [GLY] | A:521 [G] | ❌ 6S0X_l:84 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Nucleic acid-binding proteins | Bacterial small subunit ribosomal RNA | 0.96 | 3.31 | 0.63 | 0.93 | 0.95 | 0.9 | 0.88 | 0.74 | 0.62 | 0.36 | 0.34 |
Other pairs involving 6S0X_l_a or 7K00_L_A
Total number of entries: 13