RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group124 > 6S0Z_X_A vs 7RYG_Y_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

6S0Z_X
6S0Z_A
7RYG_Y
7RYG_A
Conserved?
X:13 [ILE] A:1014 [U] Y:13 [SER] A:967 [U]
X:13 [ILE] A:1032 [A] Y:13 [SER] A:985 [A]
X:13 [ILE] A:1033 [G] Y:13 [SER] A:986 [G]
X:11 [SER] A:1032 [A] Y:11 [SER] A:985 [A]
X:11 [SER] A:1033 [G] Y:11 [SER] A:986 [G]
X:45 [GLY] A:896 [U] Y:45 [GLY] A:849 [C]
X:45 [GLY] A:897 [A] Y:45 [GLY] A:850 [A]
X:25 [ALA] A:895 [U] Y:25 [GLY] A:848 [C]
X:25 [ALA] A:974 [U] Y:25 [GLY] A:927 [U]
X:43 [ILE] A:896 [U] Y:43 [ASN] A:849 [C]
X:43 [ILE] A:973 [A] Y:43 [ASN] A:926 [G]
X:18 [THR] A:895 [U] Y:18 [ASN] A:848 [C]
X:10 [ARG] A:1032 [A] Y:10 [LYS] A:985 [A]
X:21 [LYS] A:894 [A] Y:21 [LEU] A:847 [A]
X:21 [LYS] A:895 [U] Y:21 [LEU] A:848 [C]
X:16 [PRO] A:1012 [G] Y:16 [LEU] A:965 [A]
X:31 [THR] A:1032 [A] Y:31 [ILE] A:985 [A]
X:31 [THR] A:1033 [G] Y:31 [ILE] A:986 [G]
X:31 [THR] A:1201 [G] Y:31 [ILE] A:1155 [G]
X:31 [THR] A:1202 [C] Y:31 [ILE] A:1156 [C]
X:12 [VAL] A:1033 [G] Y:12 [SER] A:986 [G]
X:22 [THR] A:895 [U] Y:22 [CYS] A:848 [C]
X:22 [THR] A:896 [U] Y:22 [CYS] A:849 [C]
X:17 [GLU] A:1013 [U] Y:17 [LYS] A:966 [G]
X:42 [ALA] A:896 [U] Y:42 [SER] A:849 [C]
X:42 [ALA] A:897 [A] Y:42 [SER] A:850 [A]
X:42 [ALA] A:972 [A] Y:42 [SER] A:925 [A]
X:41 [PRO] A:896 [U] Y:41 [PRO] A:849 [C]
X:41 [PRO] A:897 [A] Y:41 [PRO] A:850 [A]
X:30 [LYS] A:1202 [C] Y:30 [ARG] A:1156 [C]
X:30 [LYS] A:1223 [A] Y:30 [ARG] A:1179 [G]
X:24 [GLU] A:975 [U] Y:24 [GLN] A:928 [A]
X:38 [GLU] A:973 [A] Y:38 [GLN] A:926 [G]
X:26 [LEU] A:974 [U] Y:26 [LEU] A:927 [U]
X:15 [ARG] A:1013 [U] Y:15 [ARG] A:966 [G]
X:15 [ARG] A:1031 [C] Y:15 [ARG] A:984 [C]
X:49 [LYS] A:896 [U] Y:49 [LYS] A:849 [C]
X:46 [GLN] A:895 [U] Y:46 [MET] A:848 [C]
X:46 [GLN] A:896 [U] Y:46 [MET] A:849 [C]
X:46 [GLN] A:973 [A] Y:46 [MET] A:926 [G]
X:27 [GLY] A:974 [U] Y:27 [GLY] A:927 [U]
X:29 [LYS] A:1222 [A] Y:29 [ARG] A:1178 [C]
X:29 [LYS] A:1223 [A] Y:29 [ARG] A:1179 [G]
X:14 [GLY] A:1013 [U] Y:14 [HIS] A:966 [G]
X:14 [GLY] A:1014 [U] Y:14 [HIS] A:967 [U]
X:13 [ILE] A:1013 [U] Y:13 [SER] A:966 [G] ❌ 7RYG_Y_A
X:11 [SER] A:1031 [C] Y:11 [SER] A:984 [C] ❌ 7RYG_Y_A
X:25 [ALA] A:894 [A] Y:25 [GLY] A:847 [A] ❌ 7RYG_Y_A
X:25 [ALA] A:975 [U] Y:25 [GLY] A:928 [A] ❌ 7RYG_Y_A
X:43 [ILE] A:974 [U] Y:43 [ASN] A:927 [U] ❌ 7RYG_Y_A
X:10 [ARG] A:1031 [C] Y:10 [LYS] A:984 [C] ❌ 7RYG_Y_A
X:16 [PRO] A:1013 [U] Y:16 [LEU] A:966 [G] ❌ 7RYG_Y_A
X:40 [ASN] A:973 [A] Y:40 [THR] A:926 [G] ❌ 7RYG_Y_A
X:17 [GLU] A:1012 [G] Y:17 [LYS] A:965 [A] ❌ 7RYG_Y_A
X:42 [ALA] A:973 [A] Y:42 [SER] A:926 [G] ❌ 7RYG_Y_A
X:38 [GLU] A:974 [U] Y:38 [GLN] A:927 [U] ❌ 7RYG_Y_A
X:26 [LEU] A:975 [U] Y:26 [LEU] A:928 [A] ❌ 7RYG_Y_A
X:15 [ARG] A:1012 [G] Y:15 [ARG] A:965 [A] ❌ 7RYG_Y_A
X:49 [LYS] A:895 [U] Y:49 [LYS] A:848 [C] ❌ 7RYG_Y_A
X:46 [GLN] A:974 [U] Y:46 [MET] A:927 [U] ❌ 7RYG_Y_A
X:27 [GLY] A:975 [U] Y:27 [GLY] A:928 [A] ❌ 7RYG_Y_A
X:14 [GLY] A:1032 [A] Y:14 [HIS] A:985 [A] ❌ 6S0Z_X_A
X:14 [GLY] A:1031 [C] Y:14 [HIS] A:984 [C] ❌ 6S0Z_X_A
X:15 [ARG] A:1032 [A] Y:15 [ARG] A:985 [A] ❌ 6S0Z_X_A
X:17 [GLU] A:894 [A] Y:17 [LYS] A:847 [A] ❌ 6S0Z_X_A
X:18 [THR] A:896 [U] Y:18 [ASN] A:849 [C] ❌ 6S0Z_X_A
X:24 [GLU] A:974 [U] Y:24 [GLN] A:927 [U] ❌ 6S0Z_X_A
X:25 [ALA] A:973 [A] Y:25 [GLY] A:926 [G] ❌ 6S0Z_X_A
X:26 [LEU] A:973 [A] Y:26 [LEU] A:926 [G] ❌ 6S0Z_X_A
X:30 [LYS] A:1222 [A] Y:30 [ARG] A:1178 [C] ❌ 6S0Z_X_A
X:38 [GLU] A:972 [A] Y:38 [GLN] A:925 [A] ❌ 6S0Z_X_A
X:40 [ASN] A:972 [A] Y:40 [THR] A:925 [A] ❌ 6S0Z_X_A
X:43 [ILE] A:972 [A] Y:43 [ASN] A:925 [A] ❌ 6S0Z_X_A
X:46 [GLN] A:972 [A] Y:46 [MET] A:925 [A] ❌ 6S0Z_X_A
X:10 [ARG] A:1044 [A] Y:10 [LYS] A:997 [A] ❌ 7RYG_A:997 no longer at interface
X:30 [LYS] A:1224 [U] Y:30 [ARG] A:1180 [U] ❌ 7RYG_A:1180 no longer at interface
X:24 [GLU] A:976 [U] Y:24 [GLN] A:929 [C] ❌ 7RYG_A:929 no longer at interface
X:24 [GLU] A:977 [A] Y:24 [GLN] A:930 [U] ❌ 7RYG_A:930 no longer at interface
X:30 [LYS] A:1203 [U] Y:30 [ARG] A:1157 [U] ❌ 6S0Z_A:1203 no longer at interface
X:42 [ALA] A:971 [U] Y:42 [SER] A:924 [G] ❌ 6S0Z_A:971 no longer at interface
X:32 [ASN] A:1201 [G] Y:32 [GLY] A:1155 [G] ❌ 7RYG_Y:32 no longer at interface
X:32 [ASN] A:1202 [C] Y:32 [GLY] A:1156 [C] ❌ 7RYG_Y:32 no longer at interface
X:37 [VAL] A:974 [U] Y:37 [VAL] A:927 [U] ❌ 7RYG_Y:37 no longer at interface
X:20 [ARG] A:1013 [U] Y:20 [LYS] A:966 [G] ❌ 7RYG_Y:20 no longer at interface
X:20 [ARG] A:1014 [U] Y:20 [LYS] A:967 [U] ❌ 7RYG_Y:20 no longer at interface
X:9 [THR] A:1032 [A] Y:9 [THR] A:985 [A] ❌ 7RYG_Y:9 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
Common RFAM label(s)
Interface TM-score
Interface RMSD
Percentage identity
Protein TM-score
RNA TM-score
Protein coverage
RNA coverage
Percentage conservation
Apolar conservation
H-bond conservation
Percentage switching out
Ribosomal protein L30p/L7e Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.98 2.14 0.27 0.91 0.98 1.0 0.9 0.68 0.51 0.11 0.29


Other pairs involving 6S0Z_X_A or 7RYG_Y_A

Total number of entries: 13