Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 7OF0_Z
|
7OF0_A
|
7RYG_Y
|
7RYG_A
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| Z:76 [ARG] | A:2121 [G] | Y:14 [HIS] | A:966 [G] | ✔ |
| Z:76 [ARG] | A:2122 [A] | Y:14 [HIS] | A:967 [U] | ✔ |
| Z:76 [ARG] | A:2139 [U] | Y:14 [HIS] | A:985 [A] | ✔ |
| Z:78 [ARG] | A:2121 [G] | Y:15 [ARG] | A:966 [G] | ✔ |
| Z:93 [LYS] | A:2253 [U] | Y:30 [ARG] | A:1156 [C] | ✔ |
| Z:93 [LYS] | A:2254 [C] | Y:30 [ARG] | A:1157 [U] | ✔ |
| Z:79 [PRO] | A:2120 [G] | Y:16 [LEU] | A:965 [A] | ✔ |
| Z:106 [VAL] | A:2081 [U] | Y:43 [ASN] | A:926 [G] | ✔ |
| Z:108 [ALA] | A:2060 [A] | Y:45 [GLY] | A:850 [A] | ✔ |
| Z:85 [ILE] | A:2058 [C] | Y:21 [LEU] | A:848 [C] | ✔ |
| Z:73 [LYS] | A:2139 [U] | Y:11 [SER] | A:985 [A] | ✔ |
| Z:73 [LYS] | A:2140 [G] | Y:11 [SER] | A:986 [G] | ✔ |
| Z:105 [SER] | A:2060 [A] | Y:42 [SER] | A:850 [A] | ✔ |
| Z:105 [SER] | A:2080 [U] | Y:42 [SER] | A:924 [G] | ✔ |
| Z:104 [PRO] | A:2060 [A] | Y:41 [PRO] | A:850 [A] | ✔ |
| Z:74 [SER] | A:2140 [G] | Y:12 [SER] | A:986 [G] | ✔ |
| Z:109 [LYS] | A:2058 [C] | Y:46 [MET] | A:848 [C] | ✔ |
| Z:109 [LYS] | A:2081 [U] | Y:46 [MET] | A:926 [G] | ✔ |
| Z:94 [ALA] | A:2140 [G] | Y:31 [ILE] | A:986 [G] | ✔ |
| Z:94 [ALA] | A:2252 [C] | Y:31 [ILE] | A:1155 [G] | ✔ |
| Z:94 [ALA] | A:2253 [U] | Y:31 [ILE] | A:1156 [C] | ✔ |
| Z:88 [MET] | A:2082 [G] | Y:24 [GLN] | A:927 [U] | ✔ |
| Z:88 [MET] | A:2083 [U] | Y:24 [GLN] | A:928 [A] | ✔ |
| Z:101 [LYS] | A:2081 [U] | Y:38 [GLN] | A:926 [G] | ✔ |
| Z:72 [ILE] | A:2139 [U] | Y:10 [LYS] | A:985 [A] | ✔ |
| Z:89 [LEU] | A:2082 [G] | Y:25 [GLY] | A:927 [U] | ✔ |
| Z:75 [THR] | A:2122 [A] | Y:13 [SER] | A:967 [U] | ✔ |
| Z:75 [THR] | A:2140 [G] | Y:13 [SER] | A:986 [G] | ✔ |
| Z:76 [ARG] | A:2140 [G] | Y:14 [HIS] | A:986 [G] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:78 [ARG] | A:2122 [A] | Y:15 [ARG] | A:967 [U] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:79 [PRO] | A:2121 [G] | Y:16 [LEU] | A:966 [G] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:106 [VAL] | A:2082 [G] | Y:43 [ASN] | A:927 [U] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:92 [GLU] | A:2140 [G] | Y:29 [ARG] | A:986 [G] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:73 [LYS] | A:2138 [U] | Y:11 [SER] | A:984 [C] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:105 [SER] | A:2081 [U] | Y:42 [SER] | A:926 [G] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:74 [SER] | A:2138 [U] | Y:12 [SER] | A:984 [C] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:74 [SER] | A:2139 [U] | Y:12 [SER] | A:985 [A] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:109 [LYS] | A:2082 [G] | Y:46 [MET] | A:927 [U] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:88 [MET] | A:2057 [C] | Y:24 [GLN] | A:847 [A] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:88 [MET] | A:2058 [C] | Y:24 [GLN] | A:848 [C] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:101 [LYS] | A:2082 [G] | Y:38 [GLN] | A:927 [U] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:81 [TRP] | A:2120 [G] | Y:17 [LYS] | A:965 [A] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:103 [ILE] | A:2081 [U] | Y:40 [THR] | A:926 [G] | ❌ 7RYG_Y_A |
| Z:75 [THR] | A:2139 [U] | Y:13 [SER] | A:985 [A] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:76 [ARG] | A:2138 [U] | Y:14 [HIS] | A:984 [C] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:78 [ARG] | A:2139 [U] | Y:15 [ARG] | A:985 [A] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:78 [ARG] | A:2138 [U] | Y:15 [ARG] | A:984 [C] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:81 [TRP] | A:2057 [C] | Y:17 [LYS] | A:847 [A] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:81 [TRP] | A:2121 [G] | Y:17 [LYS] | A:966 [G] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:85 [ILE] | A:2057 [C] | Y:21 [LEU] | A:847 [A] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:89 [LEU] | A:2081 [U] | Y:25 [GLY] | A:926 [G] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:89 [LEU] | A:2058 [C] | Y:25 [GLY] | A:848 [C] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:94 [ALA] | A:2139 [U] | Y:31 [ILE] | A:985 [A] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:104 [PRO] | A:2059 [C] | Y:41 [PRO] | A:849 [C] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:105 [SER] | A:2059 [C] | Y:42 [SER] | A:849 [C] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:106 [VAL] | A:2059 [C] | Y:43 [ASN] | A:849 [C] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:108 [ALA] | A:2059 [C] | Y:45 [GLY] | A:849 [C] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:109 [LYS] | A:2059 [C] | Y:46 [MET] | A:849 [C] | ❌ 7OF0_Z_A |
| Z:76 [ARG] | A:2123 [C] | Y:14 [HIS] | A:968 [C] | ❌ 7RYG_A:968 no longer at interface |
| Z:76 [ARG] | A:2126 [U] | Y:14 [HIS] | A:972 [A] | ❌ 7RYG_A:972 no longer at interface |
| Z:93 [LYS] | A:2141 [U] | Y:30 [ARG] | A:987 [A] | ❌ 7RYG_A:987 no longer at interface |
| Z:73 [LYS] | A:2137 [C] | Y:11 [SER] | A:983 [C] | ❌ 7RYG_A:983 no longer at interface |
| Z:100 [HIS] | A:2082 [G] | Y:37 [VAL] | A:927 [U] | ❌ 7RYG_Y:37 no longer at interface |
| Z:100 [HIS] | A:2083 [U] | Y:37 [VAL] | A:928 [A] | ❌ 7RYG_Y:37 no longer at interface |
| Z:71 [ARG] | A:2139 [U] | Y:9 [THR] | A:985 [A] | ❌ 7RYG_Y:9 no longer at interface |
| Z:71 [ARG] | A:2140 [G] | Y:9 [THR] | A:986 [G] | ❌ 7RYG_Y:9 no longer at interface |
| Z:96 [THR] | A:2253 [U] | Y:33 [HIS] | A:1156 [C] | ❌ 7RYG_Y:33 no longer at interface |
| Z:96 [THR] | A:2254 [C] | Y:33 [HIS] | A:1157 [U] | ❌ 7RYG_Y:33 no longer at interface |
| Z:83 [LYS] | A:2121 [G] | Y:19 [HIS] | A:966 [G] | ❌ 7RYG_Y:19 no longer at interface |
| Z:83 [LYS] | A:2122 [A] | Y:19 [HIS] | A:967 [U] | ❌ 7RYG_Y:19 no longer at interface |
| Z:95 [HIS] | A:2252 [C] | Y:32 [GLY] | A:1155 [G] | ❌ 7RYG_Y:32 no longer at interface |
| Z:95 [HIS] | A:2253 [U] | Y:32 [GLY] | A:1156 [C] | ❌ 7RYG_Y:32 no longer at interface |
| Z:82 [GLU] | A:2059 [C] | Y:18 [ASN] | A:849 [C] | ❌ 7OF0_Z:82 no longer at interface |
| Z:82 [GLU] | A:2058 [C] | Y:18 [ASN] | A:848 [C] | ❌ 7OF0_Z:82 no longer at interface |
| Z:86 [ILE] | A:2059 [C] | Y:22 [CYS] | A:849 [C] | ❌ 7OF0_Z:86 no longer at interface |
| Z:86 [ILE] | A:2058 [C] | Y:22 [CYS] | A:848 [C] | ❌ 7OF0_Z:86 no longer at interface |
| Z:90 [GLY] | A:2082 [G] | Y:27 [GLY] | A:927 [U] | ❌ 7OF0_Z:90 no longer at interface |
| Z:111 [LYS] | A:2059 [C] | Y:49 [LYS] | A:849 [C] | ❌ 7OF0_Z:111 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ribosomal protein L30p/L7e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.89 | 3.29 | 0.15 | 0.88 | 0.93 | 0.81 | 0.85 | 0.37 | 0.12 | 0.05 | 0.40 |
Other pairs involving 7OF0_Z_A or 7RYG_Y_A
Total number of entries: 8
| Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1VQ8_W_0 | 7RYG_Y_A | 0.78 | 0.92 | 2.64 | 0.15 | Ribosomal protein L30p/L7e | compare | |
| 1YHQ_W_0 | 7RYG_Y_A | 0.79 | 0.92 | 2.65 | 0.15 | Ribosomal protein L30p/L7e | compare | |
| 4Y4O_13_1A | 7OF0_Z_A | 0.49 | 0.93 | 1.37 | 0.18 | Ribosomal protein L30p/L7e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 4Y4O_13_1A | 7RYG_Y_A | 0.66 | 0.96 | 3.31 | 0.31 | Ribosomal protein L30p/L7e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 6AZ3_c_1 | 7RYG_Y_A | 0.57 | 0.63 | 2.5 | 0.19 | Ribosomal protein L30p/L7e | compare | |
| 6S0Z_X_A | 7OF0_Z_A | 0.62 | 0.93 | 2.4 | 0.18 | Ribosomal protein L30p/L7e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0Z_X_A | 7RYG_Y_A | 0.68 | 0.98 | 2.14 | 0.27 | Ribosomal protein L30p/L7e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 7OF0_Z_A | 7RYG_Y_A | 0.37 | 0.89 | 3.29 | 0.15 | Ribosomal protein L30p/L7e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |