RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group125 > 4OO8_A_B vs 5FW1_B_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4OO8_A
4OO8_B
5FW1_B
5FW1_A
Conserved?
A:1112 [PRO] B:23 [U] B:1112 [PRO] A:23 [U] ✔
A:1112 [PRO] B:24 [U] B:1112 [PRO] A:24 [U] ✔
A:69 [ARG] B:51 [A] B:69 [ARG] A:51 [A] ✔
A:69 [ARG] B:62 [G] B:69 [ARG] A:62 [G] ✔
A:69 [ARG] B:63 [U] B:69 [ARG] A:63 [U] ✔
A:447 [ARG] B:16 [U] B:447 [ARG] A:16 [A] ✔
A:447 [ARG] B:17 [U] B:447 [ARG] A:17 [A] ✔
A:522 [ASN] B:4 [A] B:522 [ASN] A:4 [A] ✔
A:135 [ILE] B:45 [U] B:135 [ILE] A:45 [U] ✔
A:135 [ILE] B:46 [A] B:135 [ILE] A:46 [A] ✔
A:61 [ALA] B:63 [U] B:61 [ALA] A:63 [U] ✔
A:340 [ARG] B:40 [C] B:340 [ARG] A:40 [C] ✔
A:340 [ARG] B:41 [A] B:340 [ARG] A:41 [A] ✔
A:166 [GLY] B:17 [U] B:166 [GLY] A:17 [A] ✔
A:166 [GLY] B:18 [G] B:166 [GLY] A:18 [A] ✔
A:166 [GLY] B:19 [G] B:166 [GLY] A:19 [A] ✔
A:694 [MET] B:2 [G] B:694 [MET] A:2 [U] ✔
A:694 [MET] B:3 [A] B:694 [MET] A:3 [A] ✔
A:163 [LYS] B:19 [G] B:163 [LYS] A:19 [A] ✔
A:163 [LYS] B:47 [A] B:163 [LYS] A:47 [A] ✔
A:163 [LYS] B:48 [A] B:163 [LYS] A:48 [A] ✔
A:163 [LYS] B:49 [A] B:163 [LYS] A:49 [A] ✔
A:474 [THR] B:59 [U] B:474 [THR] A:59 [U] ✔
A:742 [LYS] B:66 [U] B:742 [LYS] A:66 [U] ✔
A:742 [LYS] B:67 [C] B:742 [LYS] A:67 [C] ✔
A:721 [HIS] B:77 [A] B:721 [HIS] A:77 [A] ✔
A:364 [ASP] B:43 [G] B:364 [ASP] A:43 [G] ✔
A:136 [TYR] B:46 [A] B:136 [TYR] A:46 [A] ✔
A:125 [GLU] B:26 [A] B:125 [GLU] A:26 [A] ✔
A:753 [ARG] B:80 [U] B:753 [ARG] A:80 [U] ✔
A:81 [TYR] B:59 [U] B:81 [TYR] A:59 [U] ✔
A:100 [ARG] B:47 [A] B:100 [ARG] A:47 [A] ✔
A:1358 [THR] B:68 [A] B:1358 [THR] A:68 [A] ✔
A:1358 [THR] B:69 [A] B:1358 [THR] A:69 [A] ✔
A:62 [THR] B:63 [U] B:62 [THR] A:63 [U] ✔
A:62 [THR] B:64 [U] B:62 [THR] A:64 [U] ✔
A:57 [GLU] B:64 [U] B:57 [GLU] A:64 [U] ✔
A:57 [GLU] B:65 [A] B:57 [GLU] A:65 [A] ✔
A:734 [LYS] B:66 [U] B:734 [LYS] A:66 [U] ✔
A:893 [THR] B:8 [A] B:893 [THR] A:8 [A] ✔
A:894 [GLN] B:7 [U] B:894 [GLN] A:7 [C] ✔
A:894 [GLN] B:8 [A] B:894 [GLN] A:8 [A] ✔
A:453 [GLY] B:15 [C] B:453 [GLY] A:15 [A] ✔
A:453 [GLY] B:16 [U] B:453 [GLY] A:16 [A] ✔
A:74 [ARG] B:16 [U] B:74 [ARG] A:16 [A] ✔
A:74 [ARG] B:17 [U] B:74 [ARG] A:17 [A] ✔
A:74 [ARG] B:59 [U] B:74 [ARG] A:59 [U] ✔
A:74 [ARG] B:60 [C] B:74 [ARG] A:60 [C] ✔
A:1168 [ILE] B:51 [A] B:1168 [ILE] A:51 [A] ✔
A:461 [ARG] B:14 [G] B:461 [ARG] A:14 [U] ✔
A:461 [ARG] B:64 [U] B:461 [ARG] A:64 [U] ✔
A:1121 [ALA] B:52 [A] B:1121 [ALA] A:52 [A] ✔
A:588 [ASN] B:5 [A] B:588 [ASN] A:5 [C] ✔
A:588 [ASN] B:6 [U] B:588 [ASN] A:6 [U] ✔
A:366 [GLY] B:22 [U] B:366 [GLY] A:22 [U] ✔
A:464 [TRP] B:14 [G] B:464 [TRP] A:14 [U] ✔
A:464 [TRP] B:15 [C] B:464 [TRP] A:15 [A] ✔
A:63 [ARG] B:13 [C] B:63 [ARG] A:13 [G] ✔
A:63 [ARG] B:14 [G] B:63 [ARG] A:14 [U] ✔
A:63 [ARG] B:15 [C] B:63 [ARG] A:15 [A] ✔
A:105 [PHE] B:23 [U] B:105 [PHE] A:23 [U] ✔
A:105 [PHE] B:24 [U] B:105 [PHE] A:24 [U] ✔
A:105 [PHE] B:25 [U] B:105 [PHE] A:25 [U] ✔
A:105 [PHE] B:47 [A] B:105 [PHE] A:47 [A] ✔
A:105 [PHE] B:48 [A] B:105 [PHE] A:48 [A] ✔
A:66 [ARG] B:14 [G] B:66 [ARG] A:14 [U] ✔
A:66 [ARG] B:15 [C] B:66 [ARG] A:15 [A] ✔
A:66 [ARG] B:62 [G] B:66 [ARG] A:62 [G] ✔
A:929 [LYS] B:1 [G] B:929 [LYS] A:1 [A] ✔
A:929 [LYS] B:2 [G] B:929 [LYS] A:2 [U] ✔
A:472 [THR] B:58 [G] B:472 [THR] A:58 [G] ✔
A:472 [THR] B:59 [U] B:472 [THR] A:59 [U] ✔
A:75 [ARG] B:50 [U] B:75 [ARG] A:50 [U] ✔
A:473 [ILE] B:59 [U] B:473 [ILE] A:59 [U] ✔
A:108 [GLU] B:25 [U] B:108 [GLU] A:25 [U] ✔
A:108 [GLU] B:26 [A] B:108 [GLU] A:26 [A] ✔
A:1349 [HIS] B:68 [A] B:1349 [HIS] A:68 [A] ✔
A:1349 [HIS] B:69 [A] B:1349 [HIS] A:69 [A] ✔
A:662 [LEU] B:4 [A] B:662 [LEU] A:4 [A] ✔
A:160 [HIS] B:45 [U] B:160 [HIS] A:45 [U] ✔
A:160 [HIS] B:46 [A] B:160 [HIS] A:46 [A] ✔
A:160 [HIS] B:47 [A] B:160 [HIS] A:47 [A] ✔
A:336 [LYS] B:42 [A] B:336 [LYS] A:42 [A] ✔
A:336 [LYS] B:43 [G] B:336 [LYS] A:43 [G] ✔
A:1132 [GLY] B:23 [U] B:1132 [GLY] A:23 [U] ✔
A:589 [ALA] B:5 [A] B:589 [ALA] A:5 [C] ✔
A:589 [ALA] B:6 [U] B:589 [ALA] A:6 [U] ✔
A:491 [PHE] B:14 [G] B:491 [PHE] A:14 [U] ✔
A:115 [ARG] B:25 [U] B:115 [ARG] A:25 [U] ✔
A:115 [ARG] B:26 [A] B:115 [ARG] A:26 [A] ✔
A:115 [ARG] B:27 [G] B:115 [ARG] A:27 [G] ✔
A:451 [TYR] B:15 [C] B:451 [TYR] A:15 [A] ✔
A:129 [HIS] B:26 [A] B:129 [HIS] A:26 [A] ✔
A:129 [HIS] B:27 [G] B:129 [HIS] A:27 [G] ✔
A:129 [HIS] B:45 [U] B:129 [HIS] A:45 [U] ✔
A:515 [TYR] B:4 [A] B:515 [TYR] A:4 [A] ✔
A:515 [TYR] B:5 [A] B:515 [TYR] A:5 [C] ✔
A:401 [LYS] B:44 [U] B:401 [LYS] A:44 [U] ✔
A:401 [LYS] B:45 [U] B:401 [LYS] A:45 [U] ✔
A:405 [PHE] B:19 [G] B:405 [PHE] A:19 [A] ✔
A:405 [PHE] B:20 [C] B:405 [PHE] A:20 [A] ✔
A:332 [LEU] B:43 [G] B:332 [LEU] A:43 [G] ✔
A:523 [GLU] B:5 [A] B:523 [GLU] A:5 [C] ✔
A:1350 [GLN] B:68 [A] B:1350 [GLN] A:68 [A] ✔
A:450 [TYR] B:15 [C] B:450 [TYR] A:15 [A] ✔
A:450 [TYR] B:16 [U] B:450 [TYR] A:16 [A] ✔
A:106 [LEU] B:24 [U] B:106 [LEU] A:24 [U] ✔
A:106 [LEU] B:25 [U] B:106 [LEU] A:25 [U] ✔
A:407 [ASN] B:19 [G] B:407 [ASN] A:19 [A] ✔
A:407 [ASN] B:20 [C] B:407 [ASN] A:20 [A] ✔
A:1356 [TYR] B:68 [A] B:1356 [TYR] A:68 [A] ✔
A:1356 [TYR] B:81 [G] B:1356 [TYR] A:81 [G] ✔
A:1098 [THR] B:67 [C] B:1098 [THR] A:67 [C] ✔
A:1098 [THR] B:68 [A] B:1098 [THR] A:68 [A] ✔
A:454 [PRO] B:15 [C] B:454 [PRO] A:15 [A] ✔
A:454 [PRO] B:16 [U] B:454 [PRO] A:16 [A] ✔
A:454 [PRO] B:60 [C] B:454 [PRO] A:60 [C] ✔
A:454 [PRO] B:61 [C] B:454 [PRO] A:61 [C] ✔
A:352 [PHE] B:40 [C] B:352 [PHE] A:40 [C] ✔
A:352 [PHE] B:41 [A] B:352 [PHE] A:41 [A] ✔
A:352 [PHE] B:42 [A] B:352 [PHE] A:42 [A] ✔
A:83 [GLN] B:48 [A] B:83 [GLN] A:48 [A] ✔
A:70 [ARG] B:15 [C] B:70 [ARG] A:15 [A] ✔
A:70 [ARG] B:16 [U] B:70 [ARG] A:16 [A] ✔
A:70 [ARG] B:60 [C] B:70 [ARG] A:60 [C] ✔
A:70 [ARG] B:61 [C] B:70 [ARG] A:61 [C] ✔
A:70 [ARG] B:62 [G] B:70 [ARG] A:62 [G] ✔
A:693 [PHE] B:3 [A] B:693 [PHE] A:3 [A] ✔
A:693 [PHE] B:4 [A] B:693 [PHE] A:4 [A] ✔
A:329 [HIS] B:43 [G] B:329 [HIS] A:43 [G] ✔
A:329 [HIS] B:44 [U] B:329 [HIS] A:44 [U] ✔
A:324 [ARG] B:44 [U] B:324 [ARG] A:44 [U] ✔
A:123 [VAL] B:28 [A] B:123 [VAL] A:28 [A] ✔
A:1111 [LEU] B:22 [U] B:1111 [LEU] A:22 [U] ✔
A:1111 [LEU] B:23 [U] B:1111 [LEU] A:23 [U] ✔
A:467 [ARG] B:58 [G] B:467 [ARG] A:58 [G] ✔
A:467 [ARG] B:59 [U] B:467 [ARG] A:59 [U] ✔
A:76 [LYS] B:49 [A] B:76 [LYS] A:49 [A] ✔
A:33 [LYS] B:81 [G] B:33 [LYS] A:81 [G] ✔
A:404 [THR] B:19 [G] B:404 [THR] A:19 [A] ✔
A:404 [THR] B:20 [C] B:404 [THR] A:20 [A] ✔
A:156 [LEU] B:47 [A] B:156 [LEU] A:47 [A] ✔
A:1100 [VAL] B:67 [C] B:1100 [VAL] A:67 [C] ✔
A:58 [THR] B:12 [G] B:58 [THR] A:12 [U] ✔
A:58 [THR] B:13 [C] B:58 [THR] A:13 [G] ✔
A:58 [THR] B:64 [U] B:58 [THR] A:64 [U] ✔
A:402 [GLN] B:20 [C] B:402 [GLN] A:20 [A] ✔
A:402 [GLN] B:44 [U] B:402 [GLN] A:44 [U] ✔
A:402 [GLN] B:45 [U] B:402 [GLN] A:45 [U] ✔
A:446 [PHE] B:59 [U] B:446 [PHE] A:59 [U] ✔
A:455 [LEU] B:58 [G] B:455 [LEU] A:58 [G] ✔
A:455 [LEU] B:59 [U] B:455 [LEU] A:59 [U] ✔
A:455 [LEU] B:60 [C] B:455 [LEU] A:60 [C] ✔
A:456 [ALA] B:58 [G] B:456 [ALA] A:58 [G] ✔
A:456 [ALA] B:60 [C] B:456 [ALA] A:60 [C] ✔
A:56 [GLY] B:65 [A] B:56 [GLY] A:65 [A] ✔
A:111 [LYS] B:25 [U] B:111 [LYS] A:25 [U] ✔
A:1357 [GLU] B:68 [A] B:1357 [GLU] A:68 [A] ✔
A:1357 [GLU] B:81 [G] B:1357 [GLU] A:81 [G] ✔
A:77 [ASN] B:59 [U] B:77 [ASN] A:59 [U] ✔
A:1130 [LYS] B:24 [U] B:1130 [LYS] A:24 [U] ✔
A:1126 [TRP] B:48 [A] B:1126 [TRP] A:48 [A] ✔
A:1126 [TRP] B:49 [A] B:1126 [TRP] A:49 [A] ✔
A:347 [TYR] B:41 [A] B:347 [TYR] A:41 [A] ✔
A:347 [TYR] B:43 [G] B:347 [TYR] A:43 [G] ✔
A:104 [SER] B:24 [U] B:104 [SER] A:24 [U] ✔
A:104 [SER] B:25 [U] B:104 [SER] A:25 [U] ✔
A:104 [SER] B:47 [A] B:104 [SER] A:47 [A] ✔
A:104 [SER] B:48 [A] B:104 [SER] A:48 [A] ✔
A:60 [GLU] B:13 [C] B:60 [GLU] A:13 [G] ✔
A:60 [GLU] B:14 [G] B:60 [GLU] A:14 [U] ✔
A:462 [PHE] B:14 [G] B:462 [PHE] A:14 [U] ✔
A:462 [PHE] B:15 [C] B:462 [PHE] A:15 [A] ✔
A:462 [PHE] B:61 [C] B:462 [PHE] A:61 [C] ✔
A:462 [PHE] B:62 [G] B:462 [PHE] A:62 [G] ✔
A:471 [GLU] B:59 [U] B:471 [GLU] A:59 [U] ✔
A:363 [ILE] B:43 [G] B:363 [ILE] A:43 [G] ✔
A:363 [ILE] B:44 [U] B:363 [ILE] A:44 [U] ✔
A:1113 [LYS] B:23 [U] B:1113 [LYS] A:23 [U] ✔
A:1113 [LYS] B:24 [U] B:1113 [LYS] A:24 [U] ✔
A:1113 [LYS] B:25 [U] B:1113 [LYS] A:25 [U] ✔
A:448 [ILE] B:16 [U] B:448 [ILE] A:16 [A] ✔
A:448 [ILE] B:17 [U] B:448 [ILE] A:17 [A] ✔
A:448 [ILE] B:60 [C] B:448 [ILE] A:60 [C] ✔
A:155 [TYR] B:48 [A] B:155 [TYR] A:48 [A] ✔
A:101 [LEU] B:47 [A] B:101 [LEU] A:47 [A] ✔
A:101 [LEU] B:48 [A] B:101 [LEU] A:48 [A] ✔
A:65 [LYS] B:51 [A] B:65 [LYS] A:51 [A] ✔
A:65 [LYS] B:63 [U] B:65 [LYS] A:63 [U] ✔
A:35 [LEU] B:69 [A] B:35 [LEU] A:69 [A] ✔
A:35 [LEU] B:81 [G] B:35 [LEU] A:81 [G] ✔
A:660 [GLY] B:5 [A] B:660 [GLY] A:5 [C] ✔
A:400 [ARG] B:44 [U] B:400 [ARG] A:44 [U] ✔
A:1131 [TYR] B:23 [U] B:1131 [TYR] A:23 [U] ✔
A:1131 [TYR] B:24 [U] B:1131 [TYR] A:24 [U] ✔
A:328 [HIS] B:44 [U] B:328 [HIS] A:44 [U] ✔
A:1122 [ARG] B:23 [U] B:1122 [ARG] A:23 [U] ✔
A:1122 [ARG] B:49 [A] B:1122 [ARG] A:49 [A] ✔
A:1122 [ARG] B:50 [U] B:1122 [ARG] A:50 [U] ✔
A:1122 [ARG] B:52 [A] B:1122 [ARG] A:52 [A] ✔
A:351 [PHE] B:42 [A] B:351 [PHE] A:42 [A] ✔
A:351 [PHE] B:43 [G] B:351 [PHE] A:43 [G] ✔
A:1197 [LYS] B:67 [C] B:1197 [LYS] A:67 [C] ✔
A:102 [GLU] B:47 [A] B:102 [GLU] A:47 [A] ✔
A:102 [GLU] B:48 [A] B:102 [GLU] A:48 [A] ✔
A:359 [TYR] B:43 [G] B:359 [TYR] A:43 [G] ✔
A:359 [TYR] B:44 [U] B:359 [TYR] A:44 [U] ✔
A:459 [ASN] B:56 [U] B:459 [ASN] A:56 [U] ✔
A:459 [ASN] B:60 [C] B:459 [ASN] A:60 [C] ✔
A:459 [ASN] B:61 [C] B:459 [ASN] A:61 [C] ✔
A:661 [ARG] B:4 [A] B:661 [ARG] A:4 [A] ✔
A:661 [ARG] B:5 [A] B:661 [ARG] A:5 [C] ✔
A:72 [TYR] B:20 [C] B:72 [TYR] A:20 [A] ✔
A:72 [TYR] B:21 [G] B:72 [TYR] A:21 [G] ✔
A:72 [TYR] B:50 [U] B:72 [TYR] A:50 [U] ✔
A:72 [TYR] B:51 [A] B:72 [TYR] A:51 [A] ✔
A:738 [LEU] B:66 [U] B:738 [LEU] A:66 [U] ✔
A:738 [LEU] B:67 [C] B:738 [LEU] A:67 [C] ✔
A:159 [ALA] B:47 [A] B:159 [ALA] A:47 [A] ✔
A:55 [SER] B:65 [A] B:55 [SER] A:65 [A] ✔
A:518 [PHE] B:4 [A] B:518 [PHE] A:4 [A] ✔
A:406 [ASP] B:19 [G] B:406 [ASP] A:19 [A] ✔
A:68 [ALA] B:51 [A] B:68 [ALA] A:51 [A] ✔
A:165 [ARG] B:17 [U] B:165 [ARG] A:17 [A] ✔
A:165 [ARG] B:18 [G] B:165 [ARG] A:18 [A] ✔
A:165 [ARG] B:19 [G] B:165 [ARG] A:19 [A] ✔
A:749 [LYS] B:80 [U] B:749 [LYS] A:80 [U] ✔
A:79 [ILE] B:48 [A] B:79 [ILE] A:48 [A] ✔
A:510 [LYS] B:5 [A] B:510 [LYS] A:5 [C] ✔
A:510 [LYS] B:6 [U] B:510 [LYS] A:6 [U] ✔
A:457 [ARG] B:57 [A] B:457 [ARG] A:57 [A] ✔
A:457 [ARG] B:58 [G] B:457 [ARG] A:58 [G] ✔
A:34 [VAL] B:81 [G] B:34 [VAL] A:81 [G] ✔
A:403 [ARG] B:19 [G] B:403 [ARG] A:19 [A] ✔
A:403 [ARG] B:20 [C] B:403 [ARG] A:20 [A] ✔
A:403 [ARG] B:21 [G] B:403 [ARG] A:21 [G] ✔
A:403 [ARG] B:45 [U] B:403 [ARG] A:45 [U] ✔
A:403 [ARG] B:46 [A] B:403 [ARG] A:46 [A] ✔
A:1123 [LYS] B:49 [A] B:1123 [LYS] A:49 [A] ✔
A:1123 [LYS] B:50 [U] B:1123 [LYS] A:50 [U] ✔
A:1123 [LYS] B:52 [A] B:1123 [LYS] A:52 [A] ✔
A:1123 [LYS] B:53 [G] B:1123 [LYS] A:53 [G] ✔
A:1110 [ILE] B:22 [U] B:1110 [ILE] A:22 [U] ✔
A:1110 [ILE] B:23 [U] B:1110 [ILE] A:23 [U] ✔
A:1110 [ILE] B:49 [A] B:1110 [ILE] A:49 [A] ✔
A:78 [ARG] B:18 [G] B:78 [ARG] A:18 [A] ✔
A:73 [THR] B:59 [U] B:73 [THR] A:59 [U] ✔
A:73 [THR] B:60 [C] B:73 [THR] A:60 [C] ✔
A:73 [THR] B:61 [C] B:73 [THR] A:61 [C] ✔
A:325 [TYR] B:43 [G] B:325 [TYR] A:43 [G] ✔
A:325 [TYR] B:44 [U] B:325 [TYR] A:44 [U] ✔
A:167 [HIS] B:17 [U] B:167 [HIS] A:17 [A] ✔
A:167 [HIS] B:18 [G] B:167 [HIS] A:18 [A] ✔
A:415 [HIS] B:19 [G] B:415 [HIS] A:19 [A] ✔
A:168 [PHE] B:17 [U] B:168 [PHE] A:17 [A] ✔
A:168 [PHE] B:18 [G] B:168 [PHE] A:18 [A] ✔
A:1134 [PHE] B:51 [A] B:1134 [PHE] A:51 [A] ✔
A:1108 [GLU] B:63 [U] B:1108 [GLU] A:63 [U] ✔
A:1099 [GLU] B:67 [C] B:1099 [GLU] A:67 [C] ✔
A:519 [THR] B:5 [A] B:519 [THR] A:5 [C] ✔
A:1124 [LYS] B:52 [A] B:1124 [LYS] A:52 [A] ✔
A:1124 [LYS] B:53 [G] B:1124 [LYS] A:53 [G] ✔
A:408 [GLY] B:18 [G] B:408 [GLY] A:18 [A] ✔
A:408 [GLY] B:19 [G] B:408 [GLY] A:19 [A] ✔
A:739 [GLN] B:66 [U] B:739 [GLN] A:66 [U] ✔
A:739 [GLN] B:67 [C] B:739 [GLN] A:67 [C] ✔
A:735 [LYS] B:66 [U] B:735 [LYS] A:66 [U] ✔
A:134 [THR] B:44 [U] B:134 [THR] A:44 [U] ✔
A:134 [THR] B:45 [U] B:134 [THR] A:45 [U] ✔
A:117 [PRO] B:26 [A] B:117 [PRO] A:26 [A] ✔
A:360 [ALA] B:43 [G] B:360 [ALA] A:43 [G] ✔
A:460 [SER] B:60 [C] B:460 [SER] A:60 [C] ✔
A:460 [SER] B:61 [C] B:460 [SER] A:61 [C] ✔
A:116 [HIS] B:26 [A] B:116 [HIS] A:26 [A] ✔
A:116 [HIS] B:27 [G] B:116 [HIS] A:27 [G] ✔
A:1169 [MET] B:52 [A] B:1169 [MET] A:52 [A] ✔
A:1104 [GLY] B:51 [A] B:1104 [GLY] A:51 [A] ✔
A:1104 [GLY] B:63 [U] B:1104 [GLY] A:63 [U] ✔
A:71 [ARG] B:17 [U] B:71 [ARG] A:17 [A] ✔
A:71 [ARG] B:18 [G] B:71 [ARG] A:18 [A] ✔
A:122 [ILE] B:27 [G] B:122 [ILE] A:27 [G] ✔
A:122 [ILE] B:28 [A] B:122 [ILE] A:28 [A] ✔
A:1351 [SER] B:68 [A] B:1351 [SER] A:68 [A] ✔
A:926 [GLN] B:2 [G] B:926 [GLN] A:2 [U] ✔
A:449 [PRO] B:15 [C] B:449 [PRO] A:15 [A] ✔
A:449 [PRO] B:16 [U] B:449 [PRO] A:16 [A] ✔
A:59 [ALA] B:12 [G] B:59 [ALA] A:12 [U] ✔
A:59 [ALA] B:13 [C] B:59 [ALA] A:13 [G] ✔
A:59 [ALA] B:14 [G] B:59 [ALA] A:14 [U] ✔
A:59 [ALA] B:64 [U] B:59 [ALA] A:64 [U] ✔
A:452 [VAL] B:15 [C] B:452 [VAL] A:15 [A] ✔
A:133 [PRO] B:45 [U] B:133 [PRO] A:45 [U] ✔
A:1103 [GLY] B:51 [A] B:1103 [GLY] A:51 [A] ✔
A:1103 [GLY] B:63 [U] B:1103 [GLY] A:63 [U] ✔
A:1103 [GLY] B:64 [U] B:1103 [GLY] A:64 [U] ✔
A:164 [PHE] B:19 [G] B:164 [PHE] A:19 [A] ✔
A:164 [PHE] B:47 [A] B:164 [PHE] A:47 [A] ✔
A:67 [THR] B:15 [C] B:67 [THR] A:15 [A] ✔
A:67 [THR] B:16 [U] B:67 [THR] A:16 [A] ✔
A:126 [VAL] B:28 [A] B:126 [VAL] A:28 [A] ✔
A:1105 [PHE] B:51 [A] B:1105 [PHE] A:51 [A] ✔
A:1105 [PHE] B:52 [A] B:1105 [PHE] A:52 [A] ✔
A:725 [ALA] B:65 [A] B:725 [ALA] A:65 [A] ✔
A:107 [VAL] B:24 [U] B:107 [VAL] A:24 [U] ✔
A:107 [VAL] B:25 [U] B:107 [VAL] A:25 [U] ✔
A:1097 [LYS] B:67 [C] B:1097 [LYS] A:67 [C] ✔
A:1097 [LYS] B:68 [A] B:1097 [LYS] A:68 [A] ✔
A:475 [PRO] B:59 [U] B:475 [PRO] A:59 [U] ✔
A:1102 [THR] B:63 [U] B:1102 [THR] A:63 [U] ✔
A:1102 [THR] B:64 [U] B:1102 [THR] A:64 [U] ✔
A:1102 [THR] B:65 [A] B:1102 [THR] A:65 [A] ✔
A:1102 [THR] B:66 [U] B:1102 [THR] A:66 [U] ✔
A:721 [HIS] B:65 [A] B:721 [HIS] A:65 [A] ❌ 5FW1_B_A
A:721 [HIS] B:66 [U] B:721 [HIS] A:66 [U] ❌ 5FW1_B_A
A:136 [TYR] B:45 [U] B:136 [TYR] A:45 [U] ❌ 5FW1_B_A
A:125 [GLU] B:27 [G] B:125 [GLU] A:27 [G] ❌ 5FW1_B_A
A:1358 [THR] B:81 [G] B:1358 [THR] A:81 [G] ❌ 5FW1_B_A
A:461 [ARG] B:62 [G] B:461 [ARG] A:62 [G] ❌ 5FW1_B_A
A:731 [PRO] B:65 [A] B:731 [PRO] A:65 [A] ❌ 5FW1_B_A
A:75 [ARG] B:49 [A] B:75 [ARG] A:49 [A] ❌ 5FW1_B_A
A:1132 [GLY] B:24 [U] B:1132 [GLY] A:24 [U] ❌ 5FW1_B_A
A:115 [ARG] B:28 [A] B:115 [ARG] A:28 [A] ❌ 5FW1_B_A
A:332 [LEU] B:44 [U] B:332 [LEU] A:44 [U] ❌ 5FW1_B_A
A:450 [TYR] B:14 [G] B:450 [TYR] A:14 [U] ❌ 5FW1_B_A
A:352 [PHE] B:43 [G] B:352 [PHE] A:43 [G] ❌ 5FW1_B_A
A:76 [LYS] B:50 [U] B:76 [LYS] A:50 [U] ❌ 5FW1_B_A
A:60 [GLU] B:12 [G] B:60 [GLU] A:12 [U] ❌ 5FW1_B_A
A:1122 [ARG] B:53 [G] B:1122 [ARG] A:53 [G] ❌ 5FW1_B_A
A:457 [ARG] B:60 [C] B:457 [ARG] A:60 [C] ❌ 5FW1_B_A
A:73 [THR] B:62 [G] B:73 [THR] A:62 [G] ❌ 5FW1_B_A
A:519 [THR] B:4 [A] B:519 [THR] A:4 [A] ❌ 5FW1_B_A
A:500 [LYS] B:3 [A] B:500 [LYS] A:3 [A] ❌ 5FW1_B_A
A:164 [PHE] B:18 [G] B:164 [PHE] A:18 [A] ❌ 5FW1_B_A
A:67 [THR] B:17 [U] B:67 [THR] A:17 [A] ❌ 5FW1_B_A
A:126 [VAL] B:27 [G] B:126 [VAL] A:27 [G] ❌ 5FW1_B_A
A:1097 [LYS] B:66 [U] B:1097 [LYS] A:66 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:1110 [ILE] B:21 [G] B:1110 [ILE] A:21 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:1122 [ARG] B:48 [A] B:1122 [ARG] A:48 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:1197 [LYS] B:69 [A] B:1197 [LYS] A:69 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:133 [PRO] B:27 [G] B:133 [PRO] A:27 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:164 [PHE] B:20 [C] B:164 [PHE] A:20 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:328 [HIS] B:43 [G] B:328 [HIS] A:43 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:364 [ASP] B:42 [A] B:364 [ASP] A:42 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:401 [LYS] B:21 [G] B:401 [LYS] A:21 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:403 [ARG] B:47 [A] B:403 [ARG] A:47 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:459 [ASN] B:58 [G] B:459 [ASN] A:58 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:500 [LYS] B:4 [A] B:500 [LYS] A:4 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:56 [GLY] B:64 [U] B:56 [GLY] A:64 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:66 [ARG] B:63 [U] B:66 [ARG] A:63 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:70 [ARG] B:14 [G] B:70 [ARG] A:14 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:71 [ARG] B:19 [G] B:71 [ARG] A:19 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:721 [HIS] B:76 [A] B:721 [HIS] A:76 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:731 [PRO] B:13 [C] B:731 [PRO] A:13 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:731 [PRO] B:12 [G] B:731 [PRO] A:12 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:735 [LYS] B:65 [A] B:735 [LYS] A:65 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:742 [LYS] B:77 [A] B:742 [LYS] A:77 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:749 [LYS] B:81 [G] B:749 [LYS] A:81 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:753 [ARG] B:81 [G] B:753 [ARG] A:81 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:76 [LYS] B:48 [A] B:76 [LYS] A:48 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:78 [ARG] B:17 [U] B:78 [ARG] A:17 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:893 [THR] B:9 [G] B:893 [THR] A:9 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:894 [GLN] B:9 [G] B:894 [GLN] A:9 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:753 [ARG] B:79 [G] B:753 [ARG] A:79 [G] ❌ 5FW1_A:79 no longer at interface
A:779 [GLU] B:10 [G] B:783 [ARG] A:10 [U] ❌ 5FW1_B:783, 5FW1_A:10 no longer at interface
A:938 [ARG] B:78 [A] B:938 [ARG] A:78 [A] ❌ 5FW1_B:938, 5FW1_A:78 no longer at interface
A:348 [LYS] B:39 [G] B:348 [LYS] A:39 [G] ❌ 4OO8_A:348, 4OO8_B:39 no longer at interface
A:729 [GLY] B:11 [U] B:729 [GLY] A:11 [U] ❌ 4OO8_A:729, 4OO8_B:11 no longer at interface
A:730 [SER] B:11 [U] B:730 [SER] A:11 [U] ❌ 4OO8_A:730, 4OO8_B:11 no longer at interface
A:1172 [SER] B:52 [A] B:1172 [SER] A:52 [A] ❌ 5FW1_B:1172 no longer at interface
A:1008 [PHE] B:1 [G] B:1008 [PHE] A:1 [A] ❌ 5FW1_B:1008 no longer at interface
A:719 [SER] B:76 [A] B:719 [SER] A:76 [A] ❌ 5FW1_B:719 no longer at interface
A:719 [SER] B:77 [A] B:719 [SER] A:77 [A] ❌ 5FW1_B:719 no longer at interface
A:923 [GLU] B:1 [G] B:923 [GLU] A:1 [A] ❌ 5FW1_B:923 no longer at interface
A:1010 [TYR] B:1 [G] B:1010 [TYR] A:1 [A] ❌ 5FW1_B:1010 no longer at interface
A:1109 [SER] B:22 [U] B:1109 [SER] A:22 [U] ❌ 5FW1_B:1109 no longer at interface
A:410 [ILE] B:18 [G] B:410 [ILE] A:18 [A] ❌ 5FW1_B:410 no longer at interface
A:1009 [VAL] B:1 [G] B:1009 [VAL] A:1 [A] ❌ 5FW1_B:1009 no longer at interface
A:783 [ARG] B:8 [A] B:787 [GLY] A:8 [A] ❌ 5FW1_B:787 no longer at interface
A:783 [ARG] B:9 [G] B:787 [GLY] A:9 [A] ❌ 5FW1_B:787 no longer at interface
A:720 [LEU] B:77 [A] B:720 [LEU] A:77 [A] ❌ 5FW1_B:720 no longer at interface
A:1011 [GLY] B:1 [G] B:1011 [GLY] A:1 [A] ❌ 5FW1_B:1011 no longer at interface
A:1012 [ASP] B:1 [G] B:1012 [ASP] A:1 [A] ❌ 4OO8_A:1012 no longer at interface
A:365 [GLY] B:22 [U] B:365 [GLY] A:22 [U] ❌ 4OO8_A:365 no longer at interface
A:494 [ARG] B:14 [G] B:494 [ARG] A:14 [U] ❌ 4OO8_A:494 no longer at interface
A:495 [MET] B:13 [C] B:495 [MET] A:13 [G] ❌ 4OO8_A:495 no longer at interface
A:495 [MET] B:14 [G] B:495 [MET] A:14 [U] ❌ 4OO8_A:495 no longer at interface
A:729 [GLY] B:12 [G] B:729 [GLY] A:12 [U] ❌ 4OO8_A:729 no longer at interface
A:730 [SER] B:12 [G] B:730 [SER] A:12 [U] ❌ 4OO8_A:730 no longer at interface
A:890 [LYS] B:9 [G] B:890 [LYS] A:9 [A] ❌ 4OO8_A:890 no longer at interface
A:924 [THR] B:1 [G] B:924 [THR] A:1 [A] ❌ 4OO8_A:924 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 0.93 1.42 0.73 0.92 0.85 0.95 0.97 0.94 0.90 0.76 0.36


Other pairs involving 4OO8_A_B or 5FW1_B_A

Total number of entries: 15

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
4OO8_A_B 5X2H_A_B 0.54 0.74 3.37 0.16 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5B2R_B_A 0.96 0.92 1.49 0.97 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5B2S_B_A 0.96 0.92 1.52 0.97 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5FQ5_B_A 0.95 0.92 1.5 0.72 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5B2T_B_A 0.97 0.93 1.46 0.97 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5FW1_B_A 0.94 0.93 1.42 0.73 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 7OX9_B_A 0.96 0.93 1.58 0.72 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 7EL1_A_B 0.65 0.71 2.09 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2R_B_A 5FW1_B_A 0.96 0.99 0.33 0.75 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2S_B_A 5FW1_B_A 0.97 0.99 0.39 0.76 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2T_B_A 5FW1_B_A 0.97 0.99 0.37 0.75 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FQ5_B_A 5FW1_B_A 0.98 1.0 0.27 0.98 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FW1_B_A 7OX9_B_A 0.97 0.99 0.36 0.7 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FW1_B_A 7EL1_A_B 0.65 0.73 2.0 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FW1_B_A 5X2H_A_B 0.56 0.75 3.12 0.16 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare