RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group125 > 4OO8_A_B vs 5X2H_A_B

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4OO8_A
4OO8_B
5X2H_A
5X2H_B
Conserved?
A:1112 [PRO] B:23 [U] A:794 [LYS] B:23 [U] ✔
A:1112 [PRO] B:24 [U] A:794 [LYS] B:24 [U] ✔
A:69 [ARG] B:51 [A] A:55 [ARG] B:49 [A] ✔
A:69 [ARG] B:62 [G] A:55 [ARG] B:68 [G] ✔
A:69 [ARG] B:63 [U] A:55 [ARG] B:69 [C] ✔
A:447 [ARG] B:16 [U] A:233 [LYS] B:16 [U] ✔
A:447 [ARG] B:17 [U] A:233 [LYS] B:17 [U] ✔
A:522 [ASN] B:4 [A] A:269 [THR] B:4 [A] ✔
A:135 [ILE] B:45 [U] A:101 [PRO] B:43 [U] ✔
A:135 [ILE] B:46 [A] A:101 [PRO] B:44 [A] ✔
A:61 [ALA] B:63 [U] A:47 [PRO] B:69 [C] ✔
A:166 [GLY] B:18 [G] A:130 [GLY] B:18 [G] ✔
A:166 [GLY] B:19 [G] A:130 [GLY] B:19 [G] ✔
A:163 [LYS] B:19 [G] A:127 [LYS] B:19 [G] ✔
A:163 [LYS] B:47 [A] A:127 [LYS] B:45 [A] ✔
A:163 [LYS] B:48 [A] A:127 [LYS] B:46 [A] ✔
A:1172 [SER] B:52 [A] A:855 [ALA] B:50 [A] ✔
A:721 [HIS] B:66 [U] A:439 [ASN] B:72 [G] ✔
A:136 [TYR] B:45 [U] A:102 [TYR] B:43 [U] ✔
A:136 [TYR] B:46 [A] A:102 [TYR] B:44 [A] ✔
A:125 [GLU] B:26 [A] A:96 [GLY] B:26 [A] ✔
A:125 [GLU] B:27 [G] A:96 [GLY] B:27 [G] ✔
A:62 [THR] B:63 [U] A:48 [ARG] B:69 [C] ✔
A:62 [THR] B:64 [U] A:48 [ARG] B:70 [G] ✔
A:734 [LYS] B:66 [U] A:453 [LEU] B:72 [G] ✔
A:453 [GLY] B:15 [C] A:237 [LYS] B:15 [C] ✔
A:453 [GLY] B:16 [U] A:237 [LYS] B:16 [U] ✔
A:74 [ARG] B:16 [U] A:60 [ARG] B:16 [U] ✔
A:74 [ARG] B:17 [U] A:60 [ARG] B:17 [U] ✔
A:74 [ARG] B:59 [U] A:60 [ARG] B:65 [U] ✔
A:74 [ARG] B:60 [C] A:60 [ARG] B:66 [C] ✔
A:63 [ARG] B:13 [C] A:49 [ARG] B:13 [C] ✔
A:63 [ARG] B:14 [G] A:49 [ARG] B:14 [G] ✔
A:63 [ARG] B:15 [C] A:49 [ARG] B:15 [C] ✔
A:105 [PHE] B:24 [U] A:88 [GLU] B:24 [U] ✔
A:105 [PHE] B:25 [U] A:88 [GLU] B:25 [U] ✔
A:731 [PRO] B:65 [A] A:450 [PRO] B:71 [G] ✔
A:66 [ARG] B:14 [G] A:52 [ARG] B:14 [G] ✔
A:66 [ARG] B:15 [C] A:52 [ARG] B:15 [C] ✔
A:66 [ARG] B:62 [G] A:52 [ARG] B:68 [G] ✔
A:929 [LYS] B:1 [G] A:645 [ARG] B:1 [G] ✔
A:929 [LYS] B:2 [G] A:645 [ARG] B:2 [G] ✔
A:75 [ARG] B:49 [A] A:61 [ARG] B:47 [A] ✔
A:75 [ARG] B:50 [U] A:61 [ARG] B:48 [U] ✔
A:1349 [HIS] B:68 [A] A:964 [ILE] B:77 [C] ✔
A:662 [LEU] B:4 [A] A:396 [ILE] B:4 [A] ✔
A:160 [HIS] B:45 [U] A:124 [HIS] B:43 [U] ✔
A:160 [HIS] B:46 [A] A:124 [HIS] B:44 [A] ✔
A:160 [HIS] B:47 [A] A:124 [HIS] B:45 [A] ✔
A:1132 [GLY] B:23 [U] A:823 [LYS] B:23 [U] ✔
A:115 [ARG] B:25 [U] A:90 [LEU] B:25 [U] ✔
A:115 [ARG] B:26 [A] A:90 [LEU] B:26 [A] ✔
A:129 [HIS] B:27 [G] A:98 [LEU] B:27 [G] ✔
A:401 [LYS] B:44 [U] A:184 [VAL] B:42 [C] ✔
A:401 [LYS] B:45 [U] A:184 [VAL] B:43 [U] ✔
A:405 [PHE] B:19 [G] A:190 [SER] B:19 [G] ✔
A:523 [GLU] B:5 [A] A:270 [ARG] B:5 [A] ✔
A:1350 [GLN] B:68 [A] A:965 [VAL] B:77 [C] ✔
A:450 [TYR] B:14 [G] A:236 [LEU] B:14 [G] ✔
A:450 [TYR] B:15 [C] A:236 [LEU] B:15 [C] ✔
A:450 [TYR] B:16 [U] A:236 [LEU] B:16 [U] ✔
A:106 [LEU] B:25 [U] A:89 [SER] B:25 [U] ✔
A:1098 [THR] B:68 [A] A:779 [GLU] B:77 [C] ✔
A:83 [GLN] B:48 [A] A:69 [LYS] B:46 [A] ✔
A:70 [ARG] B:15 [C] A:56 [LYS] B:15 [C] ✔
A:70 [ARG] B:16 [U] A:56 [LYS] B:16 [U] ✔
A:70 [ARG] B:60 [C] A:56 [LYS] B:66 [C] ✔
A:70 [ARG] B:61 [C] A:56 [LYS] B:67 [U] ✔
A:693 [PHE] B:3 [A] A:414 [TYR] B:3 [A] ✔
A:693 [PHE] B:4 [A] A:414 [TYR] B:4 [A] ✔
A:329 [HIS] B:43 [G] A:175 [LYS] B:41 [A] ✔
A:1111 [LEU] B:23 [U] A:793 [ARG] B:23 [U] ✔
A:76 [LYS] B:49 [A] A:62 [LYS] B:47 [A] ✔
A:76 [LYS] B:50 [U] A:62 [LYS] B:48 [U] ✔
A:404 [THR] B:20 [C] A:187 [LYS] B:20 [C] ✔
A:156 [LEU] B:47 [A] A:120 [ARG] B:45 [A] ✔
A:1109 [SER] B:22 [U] A:791 [THR] B:22 [U] ✔
A:58 [THR] B:13 [C] A:44 [LEU] B:13 [C] ✔
A:58 [THR] B:64 [U] A:44 [LEU] B:70 [G] ✔
A:402 [GLN] B:20 [C] A:185 [ARG] B:20 [C] ✔
A:402 [GLN] B:45 [U] A:185 [ARG] B:43 [U] ✔
A:1357 [GLU] B:68 [A] A:972 [THR] B:77 [C] ✔
A:60 [GLU] B:13 [C] A:46 [LEU] B:13 [C] ✔
A:60 [GLU] B:14 [G] A:46 [LEU] B:14 [G] ✔
A:448 [ILE] B:16 [U] A:234 [ARG] B:16 [U] ✔
A:448 [ILE] B:17 [U] A:234 [ARG] B:17 [U] ✔
A:101 [LEU] B:47 [A] A:85 [SER] B:45 [A] ✔
A:101 [LEU] B:48 [A] A:85 [SER] B:46 [A] ✔
A:65 [LYS] B:51 [A] A:51 [ALA] B:49 [A] ✔
A:65 [LYS] B:63 [U] A:51 [ALA] B:69 [C] ✔
A:660 [GLY] B:5 [A] A:394 [LEU] B:5 [A] ✔
A:400 [ARG] B:44 [U] A:183 [ASN] B:42 [C] ✔
A:1131 [TYR] B:23 [U] A:822 [GLY] B:23 [U] ✔
A:359 [TYR] B:43 [G] A:180 [GLU] B:41 [A] ✔
A:661 [ARG] B:4 [A] A:395 [ASN] B:4 [A] ✔
A:661 [ARG] B:5 [A] A:395 [ASN] B:5 [A] ✔
A:72 [TYR] B:50 [U] A:58 [LEU] B:48 [U] ✔
A:72 [TYR] B:51 [A] A:58 [LEU] B:49 [A] ✔
A:738 [LEU] B:66 [U] A:457 [LYS] B:72 [G] ✔
A:159 [ALA] B:47 [A] A:123 [LEU] B:45 [A] ✔
A:518 [PHE] B:4 [A] A:265 [PHE] B:4 [A] ✔
A:406 [ASP] B:19 [G] A:191 [TYR] B:19 [G] ✔
A:68 [ALA] B:51 [A] A:54 [ALA] B:49 [A] ✔
A:165 [ARG] B:17 [U] A:129 [ARG] B:17 [U] ✔
A:165 [ARG] B:18 [G] A:129 [ARG] B:18 [G] ✔
A:165 [ARG] B:19 [G] A:129 [ARG] B:19 [G] ✔
A:79 [ILE] B:48 [A] A:65 [LEU] B:46 [A] ✔
A:510 [LYS] B:6 [U] A:257 [LYS] B:6 [U] ✔
A:403 [ARG] B:19 [G] A:186 [ASN] B:19 [G] ✔
A:403 [ARG] B:20 [C] A:186 [ASN] B:20 [C] ✔
A:403 [ARG] B:21 [G] A:186 [ASN] B:21 [G] ✔
A:1110 [ILE] B:22 [U] A:792 [PHE] B:22 [U] ✔
A:1110 [ILE] B:23 [U] A:792 [PHE] B:23 [U] ✔
A:1110 [ILE] B:49 [A] A:792 [PHE] B:47 [A] ✔
A:78 [ARG] B:18 [G] A:64 [ARG] B:18 [G] ✔
A:167 [HIS] B:18 [G] A:131 [TYR] B:18 [G] ✔
A:168 [PHE] B:17 [U] A:132 [ASP] B:17 [U] ✔
A:1108 [GLU] B:63 [U] A:790 [GLU] B:69 [C] ✔
A:519 [THR] B:5 [A] A:266 [VAL] B:5 [A] ✔
A:735 [LYS] B:66 [U] A:454 [ARG] B:72 [G] ✔
A:134 [THR] B:45 [U] A:100 [SER] B:43 [U] ✔
A:1169 [MET] B:52 [A] A:852 [MET] B:50 [A] ✔
A:1104 [GLY] B:51 [A] A:786 [ALA] B:49 [A] ✔
A:1104 [GLY] B:63 [U] A:786 [ALA] B:69 [C] ✔
A:71 [ARG] B:17 [U] A:57 [ARG] B:17 [U] ✔
A:71 [ARG] B:18 [G] A:57 [ARG] B:18 [G] ✔
A:1351 [SER] B:68 [A] A:966 [SER] B:77 [C] ✔
A:500 [LYS] B:3 [A] A:247 [SER] B:3 [A] ✔
A:449 [PRO] B:15 [C] A:235 [ALA] B:15 [C] ✔
A:449 [PRO] B:16 [U] A:235 [ALA] B:16 [U] ✔
A:59 [ALA] B:13 [C] A:45 [ALA] B:13 [C] ✔
A:59 [ALA] B:14 [G] A:45 [ALA] B:14 [G] ✔
A:59 [ALA] B:64 [U] A:45 [ALA] B:70 [G] ✔
A:1103 [GLY] B:51 [A] A:785 [GLY] B:49 [A] ✔
A:1103 [GLY] B:63 [U] A:785 [GLY] B:69 [C] ✔
A:1103 [GLY] B:64 [U] A:785 [GLY] B:70 [G] ✔
A:164 [PHE] B:18 [G] A:128 [ARG] B:18 [G] ✔
A:164 [PHE] B:19 [G] A:128 [ARG] B:19 [G] ✔
A:164 [PHE] B:47 [A] A:128 [ARG] B:45 [A] ✔
A:67 [THR] B:15 [C] A:53 [SER] B:15 [C] ✔
A:67 [THR] B:16 [U] A:53 [SER] B:16 [U] ✔
A:67 [THR] B:17 [U] A:53 [SER] B:17 [U] ✔
A:1105 [PHE] B:51 [A] A:787 [LEU] B:49 [A] ✔
A:1105 [PHE] B:52 [A] A:787 [LEU] B:50 [A] ✔
A:1102 [THR] B:63 [U] A:784 [SER] B:69 [C] ✔
A:1102 [THR] B:64 [U] A:784 [SER] B:70 [G] ✔
A:166 [GLY] B:17 [U] A:130 [GLY] B:17 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:163 [LYS] B:49 [A] A:127 [LYS] B:47 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:742 [LYS] B:66 [U] A:461 [LYS] B:72 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:742 [LYS] B:67 [C] A:461 [LYS] B:74 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:721 [HIS] B:65 [A] A:439 [ASN] B:71 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:81 [TYR] B:59 [U] A:67 [HIS] B:65 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:1358 [THR] B:68 [A] A:973 [LYS] B:77 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:57 [GLU] B:64 [U] A:43 [SER] B:70 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:57 [GLU] B:65 [A] A:43 [SER] B:71 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:105 [PHE] B:23 [U] A:88 [GLU] B:23 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:105 [PHE] B:47 [A] A:88 [GLU] B:45 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:105 [PHE] B:48 [A] A:88 [GLU] B:46 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:1132 [GLY] B:24 [U] A:823 [LYS] B:24 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:115 [ARG] B:27 [G] A:90 [LEU] B:27 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:129 [HIS] B:26 [A] A:98 [LEU] B:26 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:129 [HIS] B:45 [U] A:98 [LEU] B:43 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:405 [PHE] B:20 [C] A:190 [SER] B:20 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:106 [LEU] B:24 [U] A:89 [SER] B:24 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:1098 [THR] B:67 [C] A:779 [GLU] B:74 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:70 [ARG] B:62 [G] A:56 [LYS] B:68 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:329 [HIS] B:44 [U] A:175 [LYS] B:42 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:1111 [LEU] B:22 [U] A:793 [ARG] B:22 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:404 [THR] B:19 [G] A:187 [LYS] B:19 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:1100 [VAL] B:67 [C] A:781 [LYS] B:74 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:58 [THR] B:12 [G] A:44 [LEU] B:12 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:402 [GLN] B:44 [U] A:185 [ARG] B:42 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:77 [ASN] B:59 [U] A:63 [ALA] B:65 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:1130 [LYS] B:24 [U] A:821 [ASN] B:24 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:60 [GLU] B:12 [G] A:46 [LEU] B:12 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:448 [ILE] B:60 [C] A:234 [ARG] B:66 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:1131 [TYR] B:24 [U] A:822 [GLY] B:24 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:328 [HIS] B:44 [U] A:174 [PHE] B:42 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:359 [TYR] B:44 [U] A:180 [GLU] B:42 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:72 [TYR] B:20 [C] A:58 [LEU] B:20 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:72 [TYR] B:21 [G] A:58 [LEU] B:21 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:738 [LEU] B:67 [C] A:457 [LYS] B:74 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:510 [LYS] B:5 [A] A:257 [LYS] B:5 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:403 [ARG] B:45 [U] A:186 [ASN] B:43 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:403 [ARG] B:46 [A] A:186 [ASN] B:44 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:325 [TYR] B:43 [G] A:171 [PHE] B:41 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:325 [TYR] B:44 [U] A:171 [PHE] B:42 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:167 [HIS] B:17 [U] A:131 [TYR] B:17 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:168 [PHE] B:18 [G] A:132 [ASP] B:18 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:1099 [GLU] B:67 [C] A:780 [ARG] B:74 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:519 [THR] B:4 [A] A:266 [VAL] B:4 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:134 [THR] B:44 [U] A:100 [SER] B:42 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:116 [HIS] B:26 [A] A:91 [ALA] B:26 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:116 [HIS] B:27 [G] A:91 [ALA] B:27 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:59 [ALA] B:12 [G] A:45 [ALA] B:12 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:1097 [LYS] B:67 [C] A:778 [PRO] B:74 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:1097 [LYS] B:68 [A] A:778 [PRO] B:77 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:1102 [THR] B:65 [A] A:784 [SER] B:71 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:1102 [THR] B:66 [U] A:784 [SER] B:72 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:164 [PHE] B:46 [A] A:128 [ARG] B:44 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:164 [PHE] B:20 [C] A:128 [ARG] B:20 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:325 [TYR] B:45 [U] A:171 [PHE] B:43 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:400 [ARG] B:45 [U] A:183 [ASN] B:43 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:402 [GLN] B:19 [G] A:185 [ARG] B:19 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:402 [GLN] B:46 [A] A:185 [ARG] B:44 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:404 [THR] B:21 [G] A:187 [LYS] B:21 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:404 [THR] B:44 [U] A:187 [LYS] B:42 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:404 [THR] B:45 [U] A:187 [LYS] B:43 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:406 [ASP] B:18 [G] A:191 [TYR] B:18 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:448 [ILE] B:59 [U] A:234 [ARG] B:65 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:448 [ILE] B:58 [G] A:234 [ARG] B:64 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:453 [GLY] B:60 [C] A:237 [LYS] B:66 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:453 [GLY] B:61 [C] A:237 [LYS] B:67 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:500 [LYS] B:4 [A] A:247 [SER] B:4 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:510 [LYS] B:7 [U] A:257 [LYS] B:7 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:518 [PHE] B:5 [A] A:265 [PHE] B:5 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:519 [THR] B:6 [U] A:266 [VAL] B:6 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:522 [ASN] B:5 [A] A:269 [THR] B:5 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:523 [GLU] B:6 [U] A:270 [ARG] B:6 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:660 [GLY] B:6 [U] A:394 [LEU] B:6 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:662 [LEU] B:5 [A] A:396 [ILE] B:5 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:57 [GLU] B:12 [G] A:43 [SER] B:12 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:57 [GLU] B:13 [C] A:43 [SER] B:13 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:719 [SER] B:66 [U] A:437 [ALA] B:72 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:58 [THR] B:65 [A] A:44 [LEU] B:71 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:731 [PRO] B:12 [G] A:450 [PRO] B:12 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:731 [PRO] B:64 [U] A:450 [PRO] B:70 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:731 [PRO] B:13 [C] A:450 [PRO] B:13 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:734 [LYS] B:65 [A] A:453 [LEU] B:71 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:735 [LYS] B:65 [A] A:454 [ARG] B:71 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:62 [THR] B:62 [G] A:48 [ARG] B:68 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:62 [THR] B:14 [G] A:48 [ARG] B:14 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:66 [ARG] B:61 [C] A:52 [ARG] B:67 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:71 [ARG] B:19 [G] A:57 [ARG] B:19 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:77 [ASN] B:58 [G] A:63 [ALA] B:64 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:78 [ARG] B:17 [U] A:64 [ARG] B:17 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:81 [TYR] B:58 [G] A:67 [HIS] B:64 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:83 [GLN] B:47 [A] A:69 [LYS] B:45 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:1100 [VAL] B:68 [A] A:781 [LYS] B:77 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:1110 [ILE] B:50 [U] A:792 [PHE] B:48 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:1110 [ILE] B:21 [G] A:792 [PHE] B:21 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:1130 [LYS] B:50 [U] A:821 [ASN] B:48 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:1130 [LYS] B:52 [A] A:821 [ASN] B:50 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:1130 [LYS] B:49 [A] A:821 [ASN] B:47 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:1130 [LYS] B:53 [G] A:821 [ASN] B:51 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:1130 [LYS] B:51 [A] A:821 [ASN] B:49 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:1132 [GLY] B:50 [U] A:823 [LYS] B:48 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:1132 [GLY] B:49 [A] A:823 [LYS] B:47 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:115 [ARG] B:47 [A] A:90 [LEU] B:45 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:115 [ARG] B:46 [A] A:90 [LEU] B:44 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:116 [HIS] B:47 [A] A:91 [ALA] B:45 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:129 [HIS] B:46 [A] A:98 [LEU] B:44 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:719 [SER] B:76 [A] A:437 [ALA] B:83 [C] ❌ 5X2H_B:83 no longer at interface
A:730 [SER] B:11 [U] A:449 [ASN] B:11 [U] ❌ 4OO8_A:730, 4OO8_B:11 no longer at interface
A:694 [MET] B:2 [G] A:415 [ASP] B:2 [G] ❌ 5X2H_A:415 no longer at interface
A:694 [MET] B:3 [A] A:415 [ASP] B:3 [A] ❌ 5X2H_A:415 no longer at interface
A:1168 [ILE] B:51 [A] A:851 [THR] B:49 [A] ❌ 5X2H_A:851 no longer at interface
A:1121 [ALA] B:52 [A] A:812 [LEU] B:50 [A] ❌ 5X2H_A:812 no longer at interface
A:588 [ASN] B:5 [A] A:325 [LYS] B:5 [A] ❌ 5X2H_A:325 no longer at interface
A:588 [ASN] B:6 [U] A:325 [LYS] B:6 [U] ❌ 5X2H_A:325 no longer at interface
A:589 [ALA] B:5 [A] A:326 [GLY] B:5 [A] ❌ 5X2H_A:326 no longer at interface
A:589 [ALA] B:6 [U] A:326 [GLY] B:6 [U] ❌ 5X2H_A:326 no longer at interface
A:491 [PHE] B:14 [G] A:238 [ASP] B:14 [G] ❌ 5X2H_A:238 no longer at interface
A:515 [TYR] B:4 [A] A:262 [ALA] B:4 [A] ❌ 5X2H_A:262 no longer at interface
A:515 [TYR] B:5 [A] A:262 [ALA] B:5 [A] ❌ 5X2H_A:262 no longer at interface
A:332 [LEU] B:43 [G] A:178 [SER] B:41 [A] ❌ 5X2H_A:178 no longer at interface
A:332 [LEU] B:44 [U] A:178 [SER] B:42 [C] ❌ 5X2H_A:178 no longer at interface
A:407 [ASN] B:19 [G] A:192 [GLU] B:19 [G] ❌ 5X2H_A:192 no longer at interface
A:407 [ASN] B:20 [C] A:192 [GLU] B:20 [C] ❌ 5X2H_A:192 no longer at interface
A:1356 [TYR] B:68 [A] A:971 [VAL] B:77 [C] ❌ 5X2H_A:971 no longer at interface
A:324 [ARG] B:44 [U] A:170 [TYR] B:42 [C] ❌ 5X2H_A:170 no longer at interface
A:446 [PHE] B:59 [U] A:232 [TYR] B:65 [U] ❌ 5X2H_A:232 no longer at interface
A:410 [ILE] B:18 [G] A:195 [ILE] B:18 [G] ❌ 5X2H_A:195 no longer at interface
A:1126 [TRP] B:48 [A] A:817 [ILE] B:46 [A] ❌ 5X2H_A:817 no longer at interface
A:1126 [TRP] B:49 [A] A:817 [ILE] B:47 [A] ❌ 5X2H_A:817 no longer at interface
A:1113 [LYS] B:23 [U] A:795 [GLU] B:23 [U] ❌ 5X2H_A:795 no longer at interface
A:1113 [LYS] B:24 [U] A:795 [GLU] B:24 [U] ❌ 5X2H_A:795 no longer at interface
A:1113 [LYS] B:25 [U] A:795 [GLU] B:25 [U] ❌ 5X2H_A:795 no longer at interface
A:155 [TYR] B:48 [A] A:119 [ALA] B:46 [A] ❌ 5X2H_A:119 no longer at interface
A:1122 [ARG] B:23 [U] A:813 [GLU] B:23 [U] ❌ 5X2H_A:813 no longer at interface
A:1122 [ARG] B:49 [A] A:813 [GLU] B:47 [A] ❌ 5X2H_A:813 no longer at interface
A:1122 [ARG] B:50 [U] A:813 [GLU] B:48 [U] ❌ 5X2H_A:813 no longer at interface
A:1122 [ARG] B:52 [A] A:813 [GLU] B:50 [A] ❌ 5X2H_A:813 no longer at interface
A:1122 [ARG] B:53 [G] A:813 [GLU] B:51 [A] ❌ 5X2H_A:813 no longer at interface
A:1197 [LYS] B:67 [C] A:887 [SER] B:74 [U] ❌ 5X2H_A:887 no longer at interface
A:102 [GLU] B:47 [A] A:86 [PHE] B:45 [A] ❌ 5X2H_A:86 no longer at interface
A:102 [GLU] B:48 [A] A:86 [PHE] B:46 [A] ❌ 5X2H_A:86 no longer at interface
A:55 [SER] B:65 [A] A:42 [GLU] B:71 [G] ❌ 5X2H_A:42 no longer at interface
A:73 [THR] B:59 [U] A:59 [ALA] B:65 [U] ❌ 5X2H_A:59 no longer at interface
A:73 [THR] B:60 [C] A:59 [ALA] B:66 [C] ❌ 5X2H_A:59 no longer at interface
A:73 [THR] B:61 [C] A:59 [ALA] B:67 [U] ❌ 5X2H_A:59 no longer at interface
A:73 [THR] B:62 [G] A:59 [ALA] B:68 [G] ❌ 5X2H_A:59 no longer at interface
A:415 [HIS] B:19 [G] A:200 [LEU] B:19 [G] ❌ 5X2H_A:200 no longer at interface
A:1134 [PHE] B:51 [A] A:825 [VAL] B:49 [A] ❌ 5X2H_A:825 no longer at interface
A:1124 [LYS] B:52 [A] A:815 [GLY] B:50 [A] ❌ 5X2H_A:815 no longer at interface
A:1124 [LYS] B:53 [G] A:815 [GLY] B:51 [A] ❌ 5X2H_A:815 no longer at interface
A:408 [GLY] B:18 [G] A:193 [ARG] B:18 [G] ❌ 5X2H_A:193 no longer at interface
A:408 [GLY] B:19 [G] A:193 [ARG] B:19 [G] ❌ 5X2H_A:193 no longer at interface
A:739 [GLN] B:66 [U] A:458 [GLU] B:72 [G] ❌ 5X2H_A:458 no longer at interface
A:739 [GLN] B:67 [C] A:458 [GLU] B:74 [U] ❌ 5X2H_A:458 no longer at interface
A:117 [PRO] B:26 [A] A:92 [LYS] B:26 [A] ❌ 5X2H_A:92 no longer at interface
A:926 [GLN] B:2 [G] A:642 [TYR] B:2 [G] ❌ 5X2H_A:642 no longer at interface
A:725 [ALA] B:65 [A] A:444 [LYS] B:71 [G] ❌ 5X2H_A:444 no longer at interface
A:246 [LEU] B:18 [G] A:145 [ILE] B:18 [G] ❌ 4OO8_A:246 no longer at interface
A:326 [ASP] B:44 [U] A:172 [GLN] B:42 [C] ❌ 4OO8_A:326 no longer at interface
A:398 [LEU] B:43 [G] A:181 [PHE] B:41 [A] ❌ 4OO8_A:398 no longer at interface
A:398 [LEU] B:44 [U] A:181 [PHE] B:42 [C] ❌ 4OO8_A:398 no longer at interface
A:399 [LEU] B:44 [U] A:182 [THR] B:42 [C] ❌ 4OO8_A:399 no longer at interface
A:399 [LEU] B:45 [U] A:182 [THR] B:43 [U] ❌ 4OO8_A:399 no longer at interface
A:399 [LEU] B:43 [G] A:182 [THR] B:41 [A] ❌ 4OO8_A:399 no longer at interface
A:409 [SER] B:19 [G] A:194 [CYS] B:19 [G] ❌ 4OO8_A:409 no longer at interface
A:412 [HIS] B:18 [G] A:197 [GLN] B:18 [G] ❌ 4OO8_A:412 no longer at interface
A:495 [MET] B:14 [G] A:242 [LEU] B:14 [G] ❌ 4OO8_A:495 no longer at interface
A:501 [ASN] B:3 [A] A:248 [PHE] B:3 [A] ❌ 4OO8_A:501 no longer at interface
A:526 [LYS] B:4 [A] A:273 [ASN] B:4 [A] ❌ 4OO8_A:526 no longer at interface
A:591 [LEU] B:7 [U] A:328 [TYR] B:7 [U] ❌ 4OO8_A:591 no longer at interface
A:707 [ASP] B:3 [A] A:425 [VAL] B:3 [A] ❌ 4OO8_A:707 no longer at interface
A:707 [ASP] B:2 [G] A:425 [VAL] B:2 [G] ❌ 4OO8_A:707 no longer at interface
A:729 [GLY] B:12 [G] A:448 [THR] B:12 [G] ❌ 4OO8_A:729 no longer at interface
A:729 [GLY] B:13 [C] A:448 [THR] B:13 [C] ❌ 4OO8_A:729 no longer at interface
A:730 [SER] B:12 [G] A:449 [ASN] B:12 [G] ❌ 4OO8_A:730 no longer at interface
A:730 [SER] B:13 [C] A:449 [ASN] B:13 [C] ❌ 4OO8_A:730 no longer at interface
A:741 [VAL] B:67 [C] A:460 [ARG] B:74 [U] ❌ 4OO8_A:741 no longer at interface
A:933 [GLN] B:2 [G] A:649 [ASN] B:2 [G] ❌ 4OO8_A:933 no longer at interface
A:933 [GLN] B:1 [G] A:649 [ASN] B:1 [G] ❌ 4OO8_A:933 no longer at interface
A:1101 [GLN] B:64 [U] A:782 [LYS] B:70 [G] ❌ 4OO8_A:1101 no longer at interface
A:1101 [GLN] B:65 [A] A:782 [LYS] B:71 [G] ❌ 4OO8_A:1101 no longer at interface
A:1106 [SER] B:51 [A] A:788 [HIS] B:49 [A] ❌ 4OO8_A:1106 no longer at interface
A:1129 [LYS] B:51 [A] A:820 [VAL] B:49 [A] ❌ 4OO8_A:1129 no longer at interface
A:1129 [LYS] B:52 [A] A:820 [VAL] B:50 [A] ❌ 4OO8_A:1129 no longer at interface
A:98 [PHE] B:48 [A] A:83 [TYR] B:46 [A] ❌ 4OO8_A:98 no longer at interface
A:1173 [SER] B:52 [A] A:856 [LEU] B:50 [A] ❌ 4OO8_A:1173 no longer at interface
A:119 [PHE] B:47 [A] A:94 [TYR] B:45 [A] ❌ 4OO8_A:119 no longer at interface
A:119 [PHE] B:26 [A] A:94 [TYR] B:26 [A] ❌ 4OO8_A:119 no longer at interface
A:119 [PHE] B:46 [A] A:94 [TYR] B:44 [A] ❌ 4OO8_A:119 no longer at interface
A:120 [GLY] B:26 [A] A:95 [LYS] B:26 [A] ❌ 4OO8_A:120 no longer at interface
A:1352 [ILE] B:68 [A] A:967 [ALA] B:77 [C] ❌ 4OO8_A:1352 no longer at interface
A:128 [TYR] B:27 [G] A:97 [SER] B:27 [G] ❌ 4OO8_A:128 no longer at interface
A:1355 [LEU] B:68 [A] A:970 [GLU] B:77 [C] ❌ 4OO8_A:1355 no longer at interface
A:1362 [LEU] B:68 [A] A:977 [ARG] B:77 [C] ❌ 4OO8_A:1362 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 0.74 3.37 0.16 0.75 0.45 0.69 0.78 0.54 0.39 0.27 0.45


Other pairs involving 4OO8_A_B or 5X2H_A_B

Total number of entries: 15

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
4OO8_A_B 5B2R_B_A 0.96 0.92 1.49 0.97 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5B2S_B_A 0.96 0.92 1.52 0.97 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5B2T_B_A 0.97 0.93 1.46 0.97 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5FQ5_B_A 0.95 0.92 1.5 0.72 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5FW1_B_A 0.94 0.93 1.42 0.73 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5X2H_A_B 0.54 0.74 3.37 0.16 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2S_B_A 5X2H_A_B 0.54 0.75 3.21 0.15 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FQ5_B_A 5X2H_A_B 0.55 0.75 3.12 0.15 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2T_B_A 5X2H_A_B 0.53 0.75 3.2 0.16 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FW1_B_A 5X2H_A_B 0.56 0.75 3.12 0.16 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2R_B_A 5X2H_A_B 0.54 0.75 3.21 0.15 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 7EL1_A_B 0.65 0.71 2.09 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5X2H_A_B 7EL1_A_B 0.68 0.81 2.06 0.19 CRISPR-associated endonuclease Cas9 wedge domain & Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 7OX9_B_A 0.96 0.93 1.58 0.72 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5X2H_A_B 7OX9_B_A 0.54 0.75 3.13 0.15 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare