Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 5B2R_B
|
5B2R_A
|
7EL1_A
|
7EL1_B
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| B:1112 [PRO] | A:23 [U] | A:790 [SER] | B:23 [U] | ✔ |
| B:1112 [PRO] | A:24 [U] | A:790 [SER] | B:24 [U] | ✔ |
| B:69 [ARG] | A:51 [A] | A:54 [ARG] | B:55 [A] | ✔ |
| B:69 [ARG] | A:62 [G] | A:54 [ARG] | B:68 [G] | ✔ |
| B:69 [ARG] | A:63 [U] | A:54 [ARG] | B:69 [U] | ✔ |
| B:447 [ARG] | A:16 [U] | A:208 [ARG] | B:16 [U] | ✔ |
| B:447 [ARG] | A:17 [U] | A:208 [ARG] | B:17 [U] | ✔ |
| B:522 [ASN] | A:4 [A] | A:260 [ASN] | B:4 [A] | ✔ |
| B:135 [ILE] | A:45 [U] | A:88 [PRO] | B:49 [U] | ✔ |
| B:135 [ILE] | A:46 [A] | A:88 [PRO] | B:50 [A] | ✔ |
| B:61 [ALA] | A:63 [U] | A:46 [GLY] | B:69 [U] | ✔ |
| B:166 [GLY] | A:17 [U] | A:117 [GLY] | B:17 [U] | ✔ |
| B:166 [GLY] | A:18 [G] | A:117 [GLY] | B:18 [G] | ✔ |
| B:166 [GLY] | A:19 [G] | A:117 [GLY] | B:19 [G] | ✔ |
| B:694 [MET] | A:2 [G] | A:415 [ILE] | B:2 [G] | ✔ |
| B:694 [MET] | A:3 [A] | A:415 [ILE] | B:3 [A] | ✔ |
| B:163 [LYS] | A:19 [G] | A:114 [LYS] | B:19 [G] | ✔ |
| B:163 [LYS] | A:47 [A] | A:114 [LYS] | B:51 [A] | ✔ |
| B:163 [LYS] | A:48 [A] | A:114 [LYS] | B:52 [A] | ✔ |
| B:742 [LYS] | A:66 [U] | A:459 [LYS] | B:72 [U] | ✔ |
| B:742 [LYS] | A:67 [C] | A:459 [LYS] | B:73 [U] | ✔ |
| B:136 [TYR] | A:45 [U] | A:89 [TYR] | B:49 [U] | ✔ |
| B:136 [TYR] | A:46 [A] | A:89 [TYR] | B:50 [A] | ✔ |
| B:62 [THR] | A:63 [U] | A:47 [ARG] | B:69 [U] | ✔ |
| B:62 [THR] | A:64 [U] | A:47 [ARG] | B:70 [G] | ✔ |
| B:453 [GLY] | A:15 [C] | A:214 [GLY] | B:15 [C] | ✔ |
| B:453 [GLY] | A:16 [U] | A:214 [GLY] | B:16 [U] | ✔ |
| B:74 [ARG] | A:16 [U] | A:59 [ARG] | B:16 [U] | ✔ |
| B:74 [ARG] | A:17 [U] | A:59 [ARG] | B:17 [U] | ✔ |
| B:74 [ARG] | A:59 [U] | A:59 [ARG] | B:65 [G] | ✔ |
| B:74 [ARG] | A:60 [C] | A:59 [ARG] | B:66 [C] | ✔ |
| B:588 [ASN] | A:6 [U] | A:322 [GLU] | B:6 [U] | ✔ |
| B:464 [TRP] | A:14 [G] | A:223 [TRP] | B:14 [G] | ✔ |
| B:464 [TRP] | A:15 [C] | A:223 [TRP] | B:15 [C] | ✔ |
| B:63 [ARG] | A:13 [C] | A:48 [ARG] | B:13 [C] | ✔ |
| B:63 [ARG] | A:14 [G] | A:48 [ARG] | B:14 [G] | ✔ |
| B:63 [ARG] | A:15 [C] | A:48 [ARG] | B:15 [C] | ✔ |
| B:731 [PRO] | A:12 [G] | A:448 [PRO] | B:12 [G] | ✔ |
| B:731 [PRO] | A:13 [C] | A:448 [PRO] | B:13 [C] | ✔ |
| B:66 [ARG] | A:14 [G] | A:51 [ARG] | B:14 [G] | ✔ |
| B:66 [ARG] | A:15 [C] | A:51 [ARG] | B:15 [C] | ✔ |
| B:66 [ARG] | A:62 [G] | A:51 [ARG] | B:68 [G] | ✔ |
| B:929 [LYS] | A:1 [G] | A:654 [ARG] | B:1 [G] | ✔ |
| B:929 [LYS] | A:2 [G] | A:654 [ARG] | B:2 [G] | ✔ |
| B:75 [ARG] | A:50 [U] | A:60 [ARG] | B:54 [C] | ✔ |
| B:662 [LEU] | A:4 [A] | A:395 [LEU] | B:4 [A] | ✔ |
| B:160 [HIS] | A:45 [U] | A:111 [HIS] | B:49 [U] | ✔ |
| B:160 [HIS] | A:46 [A] | A:111 [HIS] | B:50 [A] | ✔ |
| B:160 [HIS] | A:47 [A] | A:111 [HIS] | B:51 [A] | ✔ |
| B:1132 [GLY] | A:23 [U] | A:904 [VAL] | B:23 [U] | ✔ |
| B:1132 [GLY] | A:24 [U] | A:904 [VAL] | B:24 [U] | ✔ |
| B:451 [TYR] | A:15 [C] | A:212 [TYR] | B:15 [C] | ✔ |
| B:401 [LYS] | A:44 [U] | A:163 [GLU] | B:48 [C] | ✔ |
| B:401 [LYS] | A:45 [U] | A:163 [GLU] | B:49 [U] | ✔ |
| B:405 [PHE] | A:19 [G] | A:167 [SER] | B:19 [G] | ✔ |
| B:405 [PHE] | A:20 [C] | A:167 [SER] | B:20 [C] | ✔ |
| B:523 [GLU] | A:5 [A] | A:261 [ASP] | B:5 [A] | ✔ |
| B:450 [TYR] | A:14 [G] | A:211 [TYR] | B:14 [G] | ✔ |
| B:450 [TYR] | A:15 [C] | A:211 [TYR] | B:15 [C] | ✔ |
| B:450 [TYR] | A:16 [U] | A:211 [TYR] | B:16 [U] | ✔ |
| B:407 [ASN] | A:19 [G] | A:169 [ASN] | B:19 [G] | ✔ |
| B:407 [ASN] | A:20 [C] | A:169 [ASN] | B:20 [C] | ✔ |
| B:454 [PRO] | A:15 [C] | A:215 [PRO] | B:15 [C] | ✔ |
| B:454 [PRO] | A:16 [U] | A:215 [PRO] | B:16 [U] | ✔ |
| B:454 [PRO] | A:60 [C] | A:215 [PRO] | B:66 [C] | ✔ |
| B:454 [PRO] | A:61 [C] | A:215 [PRO] | B:67 [C] | ✔ |
| B:70 [ARG] | A:15 [C] | A:55 [ARG] | B:15 [C] | ✔ |
| B:70 [ARG] | A:16 [U] | A:55 [ARG] | B:16 [U] | ✔ |
| B:70 [ARG] | A:60 [C] | A:55 [ARG] | B:66 [C] | ✔ |
| B:70 [ARG] | A:61 [C] | A:55 [ARG] | B:67 [C] | ✔ |
| B:693 [PHE] | A:3 [A] | A:414 [GLN] | B:3 [A] | ✔ |
| B:693 [PHE] | A:4 [A] | A:414 [GLN] | B:4 [A] | ✔ |
| B:329 [HIS] | A:44 [U] | A:162 [GLY] | B:48 [C] | ✔ |
| B:1111 [LEU] | A:22 [U] | A:789 [TYR] | B:22 [U] | ✔ |
| B:1111 [LEU] | A:23 [U] | A:789 [TYR] | B:23 [U] | ✔ |
| B:76 [LYS] | A:49 [A] | A:61 [ARG] | B:53 [A] | ✔ |
| B:404 [THR] | A:19 [G] | A:166 [GLY] | B:19 [G] | ✔ |
| B:404 [THR] | A:20 [C] | A:166 [GLY] | B:20 [C] | ✔ |
| B:156 [LEU] | A:47 [A] | A:107 [ALA] | B:51 [A] | ✔ |
| B:58 [THR] | A:12 [G] | A:41 [VAL] | B:12 [G] | ✔ |
| B:58 [THR] | A:13 [C] | A:41 [VAL] | B:13 [C] | ✔ |
| B:402 [GLN] | A:20 [C] | A:164 [VAL] | B:20 [C] | ✔ |
| B:402 [GLN] | A:44 [U] | A:164 [VAL] | B:48 [C] | ✔ |
| B:402 [GLN] | A:45 [U] | A:164 [VAL] | B:49 [U] | ✔ |
| B:455 [LEU] | A:59 [U] | A:216 [GLY] | B:65 [G] | ✔ |
| B:455 [LEU] | A:60 [C] | A:216 [GLY] | B:66 [C] | ✔ |
| B:456 [ALA] | A:60 [C] | A:217 [GLU] | B:66 [C] | ✔ |
| B:77 [ASN] | A:59 [U] | A:62 [HIS] | B:65 [G] | ✔ |
| B:1126 [TRP] | A:48 [A] | A:897 [TYR] | B:52 [A] | ✔ |
| B:1126 [TRP] | A:49 [A] | A:897 [TYR] | B:53 [A] | ✔ |
| B:60 [GLU] | A:12 [G] | A:45 [GLU] | B:12 [G] | ✔ |
| B:60 [GLU] | A:13 [C] | A:45 [GLU] | B:13 [C] | ✔ |
| B:462 [PHE] | A:14 [G] | A:221 [PHE] | B:14 [G] | ✔ |
| B:462 [PHE] | A:15 [C] | A:221 [PHE] | B:15 [C] | ✔ |
| B:462 [PHE] | A:61 [C] | A:221 [PHE] | B:67 [C] | ✔ |
| B:462 [PHE] | A:62 [G] | A:221 [PHE] | B:68 [G] | ✔ |
| B:448 [ILE] | A:16 [U] | A:209 [ARG] | B:16 [U] | ✔ |
| B:448 [ILE] | A:17 [U] | A:209 [ARG] | B:17 [U] | ✔ |
| B:448 [ILE] | A:60 [C] | A:209 [ARG] | B:66 [C] | ✔ |
| B:65 [LYS] | A:63 [U] | A:50 [LYS] | B:69 [U] | ✔ |
| B:660 [GLY] | A:5 [A] | A:393 [HIS] | B:5 [A] | ✔ |
| B:1122 [ARG] | A:52 [A] | A:893 [ILE] | B:56 [A] | ✔ |
| B:661 [ARG] | A:4 [A] | A:394 [ASN] | B:4 [A] | ✔ |
| B:661 [ARG] | A:5 [A] | A:394 [ASN] | B:5 [A] | ✔ |
| B:72 [TYR] | A:50 [U] | A:57 [LYS] | B:54 [C] | ✔ |
| B:72 [TYR] | A:51 [A] | A:57 [LYS] | B:55 [A] | ✔ |
| B:738 [LEU] | A:66 [U] | A:455 [ILE] | B:72 [U] | ✔ |
| B:738 [LEU] | A:67 [C] | A:455 [ILE] | B:73 [U] | ✔ |
| B:159 [ALA] | A:47 [A] | A:110 [LEU] | B:51 [A] | ✔ |
| B:729 [GLY] | A:11 [U] | A:446 [LEU] | B:11 [U] | ✔ |
| B:518 [PHE] | A:4 [A] | A:256 [TYR] | B:4 [A] | ✔ |
| B:165 [ARG] | A:17 [U] | A:116 [ARG] | B:17 [U] | ✔ |
| B:165 [ARG] | A:18 [G] | A:116 [ARG] | B:18 [G] | ✔ |
| B:165 [ARG] | A:19 [G] | A:116 [ARG] | B:19 [G] | ✔ |
| B:79 [ILE] | A:48 [A] | A:64 [ILE] | B:52 [A] | ✔ |
| B:510 [LYS] | A:5 [A] | A:248 [LYS] | B:5 [A] | ✔ |
| B:510 [LYS] | A:6 [U] | A:248 [LYS] | B:6 [U] | ✔ |
| B:403 [ARG] | A:19 [G] | A:165 [ARG] | B:19 [G] | ✔ |
| B:403 [ARG] | A:20 [C] | A:165 [ARG] | B:20 [C] | ✔ |
| B:403 [ARG] | A:45 [U] | A:165 [ARG] | B:49 [U] | ✔ |
| B:403 [ARG] | A:46 [A] | A:165 [ARG] | B:50 [A] | ✔ |
| B:1110 [ILE] | A:22 [U] | A:788 [LEU] | B:22 [U] | ✔ |
| B:1110 [ILE] | A:23 [U] | A:788 [LEU] | B:23 [U] | ✔ |
| B:1110 [ILE] | A:50 [U] | A:788 [LEU] | B:54 [C] | ✔ |
| B:78 [ARG] | A:18 [G] | A:63 [ARG] | B:18 [G] | ✔ |
| B:73 [THR] | A:60 [C] | A:58 [ARG] | B:66 [C] | ✔ |
| B:73 [THR] | A:61 [C] | A:58 [ARG] | B:67 [C] | ✔ |
| B:325 [TYR] | A:44 [U] | A:158 [LEU] | B:48 [C] | ✔ |
| B:167 [HIS] | A:17 [U] | A:118 [VAL] | B:17 [U] | ✔ |
| B:167 [HIS] | A:18 [G] | A:118 [VAL] | B:18 [G] | ✔ |
| B:415 [HIS] | A:19 [G] | A:176 [TYR] | B:19 [G] | ✔ |
| B:168 [PHE] | A:17 [U] | A:119 [HIS] | B:17 [U] | ✔ |
| B:1134 [PHE] | A:51 [A] | A:906 [LYS] | B:55 [A] | ✔ |
| B:519 [THR] | A:4 [A] | A:257 [ASN] | B:4 [A] | ✔ |
| B:519 [THR] | A:5 [A] | A:257 [ASN] | B:5 [A] | ✔ |
| B:408 [GLY] | A:18 [G] | A:170 [ARG] | B:18 [G] | ✔ |
| B:408 [GLY] | A:19 [G] | A:170 [ARG] | B:19 [G] | ✔ |
| B:739 [GLN] | A:67 [C] | A:456 [GLN] | B:73 [U] | ✔ |
| B:735 [LYS] | A:66 [U] | A:452 [ARG] | B:72 [U] | ✔ |
| B:460 [SER] | A:60 [C] | A:219 [SER] | B:66 [C] | ✔ |
| B:460 [SER] | A:61 [C] | A:219 [SER] | B:67 [C] | ✔ |
| B:1169 [MET] | A:52 [A] | A:931 [LEU] | B:56 [A] | ✔ |
| B:1104 [GLY] | A:51 [A] | A:782 [GLU] | B:55 [A] | ✔ |
| B:1104 [GLY] | A:63 [U] | A:782 [GLU] | B:69 [U] | ✔ |
| B:71 [ARG] | A:17 [U] | A:56 [LEU] | B:17 [U] | ✔ |
| B:71 [ARG] | A:18 [G] | A:56 [LEU] | B:18 [G] | ✔ |
| B:500 [LYS] | A:3 [A] | A:238 [THR] | B:3 [A] | ✔ |
| B:449 [PRO] | A:15 [C] | A:210 [THR] | B:15 [C] | ✔ |
| B:449 [PRO] | A:16 [U] | A:210 [THR] | B:16 [U] | ✔ |
| B:59 [ALA] | A:13 [C] | A:44 [ASN] | B:13 [C] | ✔ |
| B:59 [ALA] | A:14 [G] | A:44 [ASN] | B:14 [G] | ✔ |
| B:59 [ALA] | A:64 [U] | A:44 [ASN] | B:70 [G] | ✔ |
| B:452 [VAL] | A:15 [C] | A:213 [GLU] | B:15 [C] | ✔ |
| B:1103 [GLY] | A:51 [A] | A:781 [ARG] | B:55 [A] | ✔ |
| B:1103 [GLY] | A:63 [U] | A:781 [ARG] | B:69 [U] | ✔ |
| B:1103 [GLY] | A:64 [U] | A:781 [ARG] | B:70 [G] | ✔ |
| B:164 [PHE] | A:19 [G] | A:115 [ARG] | B:19 [G] | ✔ |
| B:164 [PHE] | A:20 [C] | A:115 [ARG] | B:20 [C] | ✔ |
| B:164 [PHE] | A:47 [A] | A:115 [ARG] | B:51 [A] | ✔ |
| B:1105 [PHE] | A:51 [A] | A:783 [LEU] | B:55 [A] | ✔ |
| B:1105 [PHE] | A:52 [A] | A:783 [LEU] | B:56 [A] | ✔ |
| B:1097 [LYS] | A:67 [C] | A:774 [ARG] | B:73 [U] | ✔ |
| B:163 [LYS] | A:49 [A] | A:114 [LYS] | B:53 [A] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:81 [TYR] | A:59 [U] | A:66 [ARG] | B:65 [G] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:734 [LYS] | A:66 [U] | A:451 [LYS] | B:72 [U] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:461 [ARG] | A:14 [G] | A:220 [PRO] | B:14 [G] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:461 [ARG] | A:62 [G] | A:220 [PRO] | B:68 [G] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:588 [ASN] | A:5 [A] | A:322 [GLU] | B:5 [A] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:75 [ARG] | A:49 [A] | A:60 [ARG] | B:53 [A] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:407 [ASN] | A:18 [G] | A:169 [ASN] | B:18 [G] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:329 [HIS] | A:43 [G] | A:162 [GLY] | B:47 [A] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:76 [LYS] | A:48 [A] | A:61 [ARG] | B:52 [A] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:156 [LEU] | A:46 [A] | A:107 [ALA] | B:50 [A] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:58 [THR] | A:64 [U] | A:41 [VAL] | B:70 [G] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:446 [PHE] | A:59 [U] | A:207 [THR] | B:65 [G] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:455 [LEU] | A:58 [G] | A:216 [GLY] | B:63 [A] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:456 [ALA] | A:58 [G] | A:217 [GLU] | B:63 [A] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:1130 [LYS] | A:24 [U] | A:902 [ASN] | B:24 [U] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:60 [GLU] | A:14 [G] | A:45 [GLU] | B:14 [G] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:65 [LYS] | A:51 [A] | A:50 [LYS] | B:55 [A] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:1122 [ARG] | A:23 [U] | A:893 [ILE] | B:23 [U] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:1122 [ARG] | A:48 [A] | A:893 [ILE] | B:52 [A] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:1122 [ARG] | A:49 [A] | A:893 [ILE] | B:53 [A] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:1122 [ARG] | A:50 [U] | A:893 [ILE] | B:54 [C] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:72 [TYR] | A:20 [C] | A:57 [LYS] | B:20 [C] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:457 [ARG] | A:58 [G] | A:218 [GLY] | B:63 [A] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:73 [THR] | A:59 [U] | A:58 [ARG] | B:65 [G] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:325 [TYR] | A:43 [G] | A:158 [LEU] | B:47 [A] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:168 [PHE] | A:18 [G] | A:119 [HIS] | B:18 [G] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:739 [GLN] | A:66 [U] | A:456 [GLN] | B:72 [U] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:59 [ALA] | A:12 [G] | A:44 [ASN] | B:12 [G] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:164 [PHE] | A:18 [G] | A:115 [ARG] | B:18 [G] | ❌ 7EL1_A_B |
| B:164 [PHE] | A:46 [A] | A:115 [ARG] | B:50 [A] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:325 [TYR] | A:45 [U] | A:158 [LEU] | B:49 [U] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:447 [ARG] | A:18 [G] | A:208 [ARG] | B:18 [G] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:448 [ILE] | A:59 [U] | A:209 [ARG] | B:65 [G] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:456 [ALA] | A:59 [U] | A:217 [GLU] | B:65 [G] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:457 [ARG] | A:60 [C] | A:218 [GLY] | B:66 [C] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:461 [ARG] | A:60 [C] | A:220 [PRO] | B:66 [C] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:461 [ARG] | A:61 [C] | A:220 [PRO] | B:67 [C] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:500 [LYS] | A:4 [A] | A:238 [THR] | B:4 [A] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:510 [LYS] | A:7 [U] | A:248 [LYS] | B:7 [U] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:519 [THR] | A:6 [U] | A:257 [ASN] | B:6 [U] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:660 [GLY] | A:4 [A] | A:393 [HIS] | B:4 [A] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:662 [LEU] | A:5 [A] | A:395 [LEU] | B:5 [A] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:729 [GLY] | A:12 [G] | A:446 [LEU] | B:12 [G] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:734 [LYS] | A:65 [A] | A:451 [LYS] | B:71 [U] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:735 [LYS] | A:65 [A] | A:452 [ARG] | B:71 [U] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:62 [THR] | A:14 [G] | A:47 [ARG] | B:14 [G] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:62 [THR] | A:62 [G] | A:47 [ARG] | B:68 [G] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:63 [ARG] | A:12 [G] | A:48 [ARG] | B:12 [G] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:72 [TYR] | A:49 [A] | A:57 [LYS] | B:53 [A] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:76 [LYS] | A:50 [U] | A:61 [ARG] | B:54 [C] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:77 [ASN] | A:58 [G] | A:62 [HIS] | B:63 [A] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:81 [TYR] | A:58 [G] | A:66 [ARG] | B:63 [A] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:1097 [LYS] | A:66 [U] | A:774 [ARG] | B:72 [U] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:1103 [GLY] | A:65 [A] | A:781 [ARG] | B:71 [U] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:1104 [GLY] | A:64 [U] | A:782 [GLU] | B:70 [G] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:1110 [ILE] | A:49 [A] | A:788 [LEU] | B:53 [A] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:1126 [TRP] | A:50 [U] | A:897 [TYR] | B:54 [C] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:1126 [TRP] | A:24 [U] | A:897 [TYR] | B:24 [U] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:1126 [TRP] | A:23 [U] | A:897 [TYR] | B:23 [U] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:1130 [LYS] | A:25 [U] | A:902 [ASN] | B:25 [U] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:1134 [PHE] | A:50 [U] | A:906 [LYS] | B:54 [C] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:1134 [PHE] | A:52 [A] | A:906 [LYS] | B:56 [A] | ❌ 5B2R_B_A |
| B:125 [GLU] | A:27 [G] | A:85 [GLY] | B:27 [G] | ❌ 7EL1_A:85, 7EL1_B:27 no longer at interface |
| B:893 [THR] | A:8 [A] | A:616 [GLY] | B:8 [A] | ❌ 7EL1_A:616, 7EL1_B:8 no longer at interface |
| B:893 [THR] | A:9 [G] | A:616 [GLY] | B:9 [G] | ❌ 7EL1_A:616, 7EL1_B:9 no longer at interface |
| B:894 [GLN] | A:8 [A] | A:617 [ARG] | B:8 [A] | ❌ 7EL1_A:617, 7EL1_B:8 no longer at interface |
| B:72 [TYR] | A:21 [G] | A:57 [LYS] | B:21 [G] | ❌ 7EL1_B:21 no longer at interface |
| B:457 [ARG] | A:57 [A] | A:218 [GLY] | B:60 [A] | ❌ 7EL1_B:60 no longer at interface |
| B:403 [ARG] | A:21 [G] | A:165 [ARG] | B:21 [G] | ❌ 7EL1_B:21 no longer at interface |
| B:1110 [ILE] | A:21 [G] | A:788 [LEU] | B:21 [G] | ❌ 7EL1_B:21 no longer at interface |
| B:730 [SER] | A:11 [U] | A:447 [SER] | B:11 [U] | ❌ 7EL1_A:447 no longer at interface |
| B:721 [HIS] | A:65 [A] | A:438 [THR] | B:71 [U] | ❌ 7EL1_A:438 no longer at interface |
| B:721 [HIS] | A:66 [U] | A:438 [THR] | B:72 [U] | ❌ 7EL1_A:438 no longer at interface |
| B:125 [GLU] | A:26 [A] | A:85 [GLY] | B:26 [A] | ❌ 7EL1_A:85 no longer at interface |
| B:57 [GLU] | A:64 [U] | A:40 [ASN] | B:70 [G] | ❌ 7EL1_A:40 no longer at interface |
| B:57 [GLU] | A:65 [A] | A:40 [ASN] | B:71 [U] | ❌ 7EL1_A:40 no longer at interface |
| B:894 [GLN] | A:7 [U] | A:617 [ARG] | B:7 [U] | ❌ 7EL1_A:617 no longer at interface |
| B:1168 [ILE] | A:51 [A] | A:930 [ASN] | B:55 [A] | ❌ 7EL1_A:930 no longer at interface |
| B:1121 [ALA] | A:52 [A] | A:892 [ASP] | B:56 [A] | ❌ 7EL1_A:892 no longer at interface |
| B:589 [ALA] | A:5 [A] | A:323 [PHE] | B:5 [A] | ❌ 7EL1_A:323 no longer at interface |
| B:589 [ALA] | A:6 [U] | A:323 [PHE] | B:6 [U] | ❌ 7EL1_A:323 no longer at interface |
| B:491 [PHE] | A:14 [G] | A:229 [TRP] | B:14 [G] | ❌ 7EL1_A:229 no longer at interface |
| B:515 [TYR] | A:4 [A] | A:253 [ALA] | B:4 [A] | ❌ 7EL1_A:253 no longer at interface |
| B:515 [TYR] | A:5 [A] | A:253 [ALA] | B:5 [A] | ❌ 7EL1_A:253 no longer at interface |
| B:1098 [THR] | A:67 [C] | A:775 [VAL] | B:73 [U] | ❌ 7EL1_A:775 no longer at interface |
| B:83 [GLN] | A:48 [A] | A:68 [LYS] | B:52 [A] | ❌ 7EL1_A:68 no longer at interface |
| B:324 [ARG] | A:44 [U] | A:157 [ARG] | B:48 [C] | ❌ 7EL1_A:157 no longer at interface |
| B:586 [ARG] | A:6 [U] | A:320 [LYS] | B:6 [U] | ❌ 7EL1_A:320 no longer at interface |
| B:1100 [VAL] | A:67 [C] | A:777 [LYS] | B:73 [U] | ❌ 7EL1_A:777 no longer at interface |
| B:56 [GLY] | A:65 [A] | A:39 [ALA] | B:71 [U] | ❌ 7EL1_A:39 no longer at interface |
| B:410 [ILE] | A:18 [G] | A:171 [PHE] | B:18 [G] | ❌ 7EL1_A:171 no longer at interface |
| B:1113 [LYS] | A:23 [U] | A:791 [THR] | B:23 [U] | ❌ 7EL1_A:791 no longer at interface |
| B:1113 [LYS] | A:24 [U] | A:791 [THR] | B:24 [U] | ❌ 7EL1_A:791 no longer at interface |
| B:1113 [LYS] | A:25 [U] | A:791 [THR] | B:25 [U] | ❌ 7EL1_A:791 no longer at interface |
| B:155 [TYR] | A:48 [A] | A:106 [SER] | B:52 [A] | ❌ 7EL1_A:106 no longer at interface |
| B:1131 [TYR] | A:23 [U] | A:903 [LYS] | B:23 [U] | ❌ 7EL1_A:903 no longer at interface |
| B:1131 [TYR] | A:24 [U] | A:903 [LYS] | B:24 [U] | ❌ 7EL1_A:903 no longer at interface |
| B:328 [HIS] | A:43 [G] | A:161 [ASP] | B:47 [A] | ❌ 7EL1_A:161 no longer at interface |
| B:328 [HIS] | A:44 [U] | A:161 [ASP] | B:48 [C] | ❌ 7EL1_A:161 no longer at interface |
| B:1197 [LYS] | A:67 [C] | A:965 [SER] | B:73 [U] | ❌ 7EL1_A:965 no longer at interface |
| B:55 [SER] | A:65 [A] | A:38 [GLU] | B:71 [U] | ❌ 7EL1_A:38 no longer at interface |
| B:406 [ASP] | A:19 [G] | A:168 [ILE] | B:19 [G] | ❌ 7EL1_A:168 no longer at interface |
| B:68 [ALA] | A:51 [A] | A:53 [ALA] | B:55 [A] | ❌ 7EL1_A:53 no longer at interface |
| B:1123 [LYS] | A:49 [A] | A:894 [THR] | B:53 [A] | ❌ 7EL1_A:894 no longer at interface |
| B:1123 [LYS] | A:50 [U] | A:894 [THR] | B:54 [C] | ❌ 7EL1_A:894 no longer at interface |
| B:1123 [LYS] | A:52 [A] | A:894 [THR] | B:56 [A] | ❌ 7EL1_A:894 no longer at interface |
| B:1123 [LYS] | A:53 [G] | A:894 [THR] | B:57 [G] | ❌ 7EL1_A:894 no longer at interface |
| B:494 [ARG] | A:14 [G] | A:232 [MET] | B:14 [G] | ❌ 7EL1_A:232 no longer at interface |
| B:1099 [GLU] | A:67 [C] | A:776 [ASP] | B:73 [U] | ❌ 7EL1_A:776 no longer at interface |
| B:1124 [LYS] | A:52 [A] | A:895 [ASP] | B:56 [A] | ❌ 7EL1_A:895 no longer at interface |
| B:1124 [LYS] | A:53 [G] | A:895 [ASP] | B:57 [G] | ❌ 7EL1_A:895 no longer at interface |
| B:117 [PRO] | A:26 [A] | A:82 [GLU] | B:26 [A] | ❌ 7EL1_A:82 no longer at interface |
| B:926 [GLN] | A:2 [G] | A:651 [TYR] | B:2 [G] | ❌ 7EL1_A:651 no longer at interface |
| B:67 [THR] | A:15 [C] | A:52 [GLY] | B:15 [C] | ❌ 7EL1_A:52 no longer at interface |
| B:67 [THR] | A:16 [U] | A:52 [GLY] | B:16 [U] | ❌ 7EL1_A:52 no longer at interface |
| B:67 [THR] | A:17 [U] | A:52 [GLY] | B:17 [U] | ❌ 7EL1_A:52 no longer at interface |
| B:725 [ALA] | A:65 [A] | A:442 [ASP] | B:71 [U] | ❌ 7EL1_A:442 no longer at interface |
| B:1102 [THR] | A:63 [U] | A:779 [PRO] | B:69 [U] | ❌ 7EL1_A:779 no longer at interface |
| B:1102 [THR] | A:64 [U] | A:779 [PRO] | B:70 [G] | ❌ 7EL1_A:779 no longer at interface |
| B:1102 [THR] | A:65 [A] | A:779 [PRO] | B:71 [U] | ❌ 7EL1_A:779 no longer at interface |
| B:1102 [THR] | A:66 [U] | A:779 [PRO] | B:72 [U] | ❌ 7EL1_A:779 no longer at interface |
| B:501 [ASN] | A:3 [A] | A:239 [TYR] | B:3 [A] | ❌ 5B2R_B:501 no longer at interface |
| B:511 [HIS] | A:6 [U] | A:249 [TYR] | B:6 [U] | ❌ 5B2R_B:511 no longer at interface |
| B:511 [HIS] | A:7 [U] | A:249 [TYR] | B:7 [U] | ❌ 5B2R_B:511 no longer at interface |
| B:516 [GLU] | A:6 [U] | A:254 [ASP] | B:6 [U] | ❌ 5B2R_B:516 no longer at interface |
| B:583 [VAL] | A:6 [U] | A:314 [ARG] | B:6 [U] | ❌ 5B2R_B:583 no longer at interface |
| B:583 [VAL] | A:5 [A] | A:314 [ARG] | B:5 [A] | ❌ 5B2R_B:583 no longer at interface |
| B:590 [SER] | A:5 [A] | A:324 [THR] | B:5 [A] | ❌ 5B2R_B:590 no longer at interface |
| B:708 [ILE] | A:3 [A] | A:425 [PRO] | B:3 [A] | ❌ 5B2R_B:708 no longer at interface |
| B:708 [ILE] | A:2 [G] | A:425 [PRO] | B:2 [G] | ❌ 5B2R_B:708 no longer at interface |
| B:776 [ASN] | A:11 [U] | A:486 [ASP] | B:11 [U] | ❌ 5B2R_B:776 no longer at interface |
| B:779 [GLU] | A:12 [G] | A:489 [LYS] | B:12 [G] | ❌ 5B2R_B:779 no longer at interface |
| B:779 [GLU] | A:11 [U] | A:489 [LYS] | B:11 [U] | ❌ 5B2R_B:779 no longer at interface |
| B:924 [THR] | A:1 [G] | A:649 [THR] | B:1 [G] | ❌ 5B2R_B:924 no longer at interface |
| B:80 [LEU] | A:48 [A] | A:65 [GLN] | B:52 [A] | ❌ 5B2R_B:80 no longer at interface |
| B:1101 [GLN] | A:63 [U] | A:778 [LYS] | B:69 [U] | ❌ 5B2R_B:1101 no longer at interface |
| B:1101 [GLN] | A:65 [A] | A:778 [LYS] | B:71 [U] | ❌ 5B2R_B:1101 no longer at interface |
| B:1101 [GLN] | A:64 [U] | A:778 [LYS] | B:70 [G] | ❌ 5B2R_B:1101 no longer at interface |
| B:1101 [GLN] | A:66 [U] | A:778 [LYS] | B:72 [U] | ❌ 5B2R_B:1101 no longer at interface |
| B:1106 [SER] | A:51 [A] | A:784 [ILE] | B:55 [A] | ❌ 5B2R_B:1106 no longer at interface |
| B:1107 [LYS] | A:51 [A] | A:785 [ASN] | B:55 [A] | ❌ 5B2R_B:1107 no longer at interface |
| B:1108 [GLU] | A:51 [A] | A:786 [ASP] | B:55 [A] | ❌ 5B2R_B:1108 no longer at interface |
| B:1108 [GLU] | A:50 [U] | A:786 [ASP] | B:54 [C] | ❌ 5B2R_B:1108 no longer at interface |
| B:1108 [GLU] | A:63 [U] | A:786 [ASP] | B:69 [U] | ❌ 5B2R_B:1108 no longer at interface |
| B:1109 [SER] | A:22 [U] | A:787 [THR] | B:22 [U] | ❌ 5B2R_B:1109 no longer at interface |
| B:1114 [ARG] | A:24 [U] | A:792 [ARG] | B:24 [U] | ❌ 5B2R_B:1114 no longer at interface |
| B:119 [PHE] | A:26 [A] | A:84 [SER] | B:26 [A] | ❌ 5B2R_B:119 no longer at interface |
| B:132 [TYR] | A:45 [U] | A:87 [ASN] | B:49 [U] | ❌ 5B2R_B:132 no longer at interface |
| B:1120 [ILE] | A:52 [A] | A:891 [LEU] | B:56 [A] | ❌ 5B2R_B:1120 no longer at interface |
| B:1125 [ASP] | A:53 [G] | A:896 [ASP] | B:57 [G] | ❌ 5B2R_B:1125 no longer at interface |
| B:1125 [ASP] | A:48 [A] | A:896 [ASP] | B:52 [A] | ❌ 5B2R_B:1125 no longer at interface |
| B:1125 [ASP] | A:49 [A] | A:896 [ASP] | B:53 [A] | ❌ 5B2R_B:1125 no longer at interface |
| B:1125 [ASP] | A:52 [A] | A:896 [ASP] | B:56 [A] | ❌ 5B2R_B:1125 no longer at interface |
| B:1127 [ASP] | A:24 [U] | A:898 [PRO] | B:24 [U] | ❌ 5B2R_B:1127 no longer at interface |
| B:1127 [ASP] | A:25 [U] | A:898 [PRO] | B:25 [U] | ❌ 5B2R_B:1127 no longer at interface |
| B:1128 [PRO] | A:24 [U] | A:900 [SER] | B:24 [U] | ❌ 5B2R_B:1128 no longer at interface |
| B:1128 [PRO] | A:25 [U] | A:900 [SER] | B:25 [U] | ❌ 5B2R_B:1128 no longer at interface |
| B:1129 [LYS] | A:24 [U] | A:901 [ARG] | B:24 [U] | ❌ 5B2R_B:1129 no longer at interface |
| B:1129 [LYS] | A:26 [A] | A:901 [ARG] | B:26 [A] | ❌ 5B2R_B:1129 no longer at interface |
| B:1129 [LYS] | A:25 [U] | A:901 [ARG] | B:25 [U] | ❌ 5B2R_B:1129 no longer at interface |
| B:1171 [ARG] | A:52 [A] | A:933 [VAL] | B:56 [A] | ❌ 5B2R_B:1171 no longer at interface |
| B:1172 [SER] | A:52 [A] | A:934 [ILE] | B:56 [A] | ❌ 5B2R_B:1172 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 | 0.73 | 1.96 | 0.23 | 0.73 | 0.56 | 0.64 | 0.81 | 0.63 | 0.56 | 0.34 | 0.61 |
Other pairs involving 5B2R_B_A or 7EL1_A_B
Total number of entries: 15