RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group125 > 5B2T_B_A

Interface analysis

mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Chain
Chain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity
Electrostatics (surface only)
Conservation*

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show as licorice
show Accessibility
Rim - Core

Contacts -

5B2T_B
5B2T_A
Distance
Base Pair
Hbond nuc:res
Base Stacking
Residue conservation
B:33 [LYS] A:81 [G] 2.65 A:68 [A] base:BB 75.01
B:34 [VAL] A:81 [G] 4.17 A:68 [A] 19.2
B:35 [LEU] A:69 [A] 4.42 A:80 [U] 65.42
B:35 [LEU] A:81 [G] 3.53 A:68 [A] 65.42
B:55 [SER] A:65 [A] 4.33 61.52
B:56 [GLY] A:65 [A] 3.46 90.71
B:57 [GLU] A:64 [U] 2.62 sugar:BB 45.57
B:57 [GLU] A:65 [A] 2.79 45.57
B:58 [THR] A:12 [G] 3.96 C:17 [DC] 91.62
B:58 [THR] A:13 [C] 3.44 C:16 [DG] 91.62
B:58 [THR] A:64 [U] 3.25 91.62
B:59 [ALA] A:12 [G] 4.88 C:17 [DC] 98.95
B:59 [ALA] A:13 [C] 2.53 C:16 [DG] 98.95
B:59 [ALA] A:14 [G] 3.75 C:15 [DC] 98.95
B:59 [ALA] A:64 [U] 3.47 98.95
B:60 [GLU] A:12 [G] 4.88 C:17 [DC] 73.25
B:60 [GLU] A:13 [C] 3.86 C:16 [DG] 73.25
B:60 [GLU] A:14 [G] 4.85 C:15 [DC] 73.25
B:61 [ALA] A:63 [U] 4.6 56.31
B:62 [THR] A:63 [U] 2.79 sugar:SC 89.57
B:62 [THR] A:64 [U] 3.06 sugar:SC 89.57
B:63 [ARG] A:13 [C] 3.71 C:16 [DG] 98.97
B:63 [ARG] A:14 [G] 2.67 C:15 [DC] base/AA stacks 98.97
B:63 [ARG] A:15 [C] 3.35 C:14 [DG] 98.97
B:65 [LYS] A:51 [A] 4.9 42.77
B:65 [LYS] A:63 [U] 3.25 42.77
B:66 [ARG] A:14 [G] 3.29 C:15 [DC] 98.97
B:66 [ARG] A:15 [C] 2.75 C:14 [DG] 98.97
B:66 [ARG] A:62 [G] 3.33 A:52 [A] 98.97
B:67 [THR] A:15 [C] 4.68 C:14 [DG] 79.2
B:67 [THR] A:16 [U] 4.16 C:13 [DA] 79.2
B:67 [THR] A:17 [U] 4.14 C:12 [DA] 79.2
B:68 [ALA] A:51 [A] 4.19 76.48
B:69 [ARG] A:51 [A] 3.36 98.97
B:69 [ARG] A:62 [G] 3.15 A:52 [A] base/AA stacks 98.97
B:69 [ARG] A:63 [U] 2.99 98.97
B:70 [ARG] A:15 [C] 2.95 C:14 [DG] 98.97
B:70 [ARG] A:16 [U] 3.03 C:13 [DA] 98.97
B:70 [ARG] A:60 [C] 4.76 A:54 [G] 98.97
B:70 [ARG] A:61 [C] 2.61 A:53 [G] 98.97
B:70 [ARG] A:62 [G] 4.91 A:52 [A] 98.97
B:71 [ARG] A:17 [U] 2.87 C:12 [DA] base/AA stacks 95.48
B:71 [ARG] A:18 [G] 2.6 C:11 [DC] base:SC 95.48
B:72 [TYR] A:20 [C] 3.99 C:9 [DG] base:SC 46.42
B:72 [TYR] A:21 [G] 4.61 A:50 [U] 46.42
B:72 [TYR] A:50 [U] 3.5 A:21 [G] base/AA stacks 46.42
B:72 [TYR] A:51 [A] 3.47 46.42
B:73 [THR] A:59 [U] 3.91 53.65
B:73 [THR] A:60 [C] 4.65 A:54 [G] 53.65
B:73 [THR] A:61 [C] 4.75 A:53 [G] 53.65
B:73 [THR] A:62 [G] 4.78 A:52 [A] 53.65
B:74 [ARG] A:16 [U] 2.7 C:13 [DA] 98.59
B:74 [ARG] A:17 [U] 3.05 C:12 [DA] 98.59
B:74 [ARG] A:59 [U] 3.43 98.59
B:74 [ARG] A:60 [C] 2.94 A:54 [G] 98.59
B:75 [ARG] A:49 [A] 4.32 A:22 [U] 89.41
B:75 [ARG] A:50 [U] 2.72 A:21 [G] base:SC 89.41
B:76 [LYS] A:48 [A] 3.9 A:23 [U] 70.96
B:76 [LYS] A:49 [A] 3.43 A:22 [U] 70.96
B:77 [ASN] A:59 [U] 2.79 base:SC 53.96
B:78 [ARG] A:18 [G] 3.74 C:11 [DC] 98.95
B:79 [ILE] A:48 [A] 3.79 A:23 [U] 82.06
B:81 [TYR] A:59 [U] 3.27 59.15
B:83 [GLN] A:48 [A] 4.15 A:23 [U] 73.43
B:100 [ARG] A:47 [A] 4.87 A:24 [U] 95.63
B:101 [LEU] A:47 [A] 2.54 A:24 [U] sugar:BB 82.94
B:101 [LEU] A:48 [A] 3.75 A:23 [U] 82.94
B:102 [GLU] A:47 [A] 4.5 A:24 [U] 52.4
B:102 [GLU] A:48 [A] 4.08 A:23 [U] 52.4
B:104 [SER] A:24 [U] 4.11 A:47 [A] 96.62
B:104 [SER] A:25 [U] 3.18 A:46 [A] sugar:BB 96.62
B:104 [SER] A:47 [A] 2.81 A:24 [U] base:SC, sugar:SC 96.62
B:104 [SER] A:48 [A] 3.65 A:23 [U] sugar:SC 96.62
B:105 [PHE] A:23 [U] 3.48 A:48 [A] 48.84
B:105 [PHE] A:24 [U] 2.58 A:47 [A] sugar:BB base/AA stacks 48.84
B:105 [PHE] A:25 [U] 3.73 A:46 [A] 48.84
B:105 [PHE] A:47 [A] 4.44 A:24 [U] 48.84
B:105 [PHE] A:48 [A] 3.63 A:23 [U] 48.84
B:106 [LEU] A:24 [U] 4.23 A:47 [A] 56.07
B:106 [LEU] A:25 [U] 3.74 A:46 [A] 56.07
B:107 [VAL] A:24 [U] 3.88 A:47 [A] 37.06
B:107 [VAL] A:25 [U] 3.96 A:46 [A] 37.06
B:108 [GLU] A:25 [U] 4.89 A:46 [A] 37.75
B:108 [GLU] A:26 [A] 4.41 A:45 [U] 37.75
B:111 [LYS] A:25 [U] 3.34 A:46 [A] sugar:SC 80.86
B:115 [ARG] A:25 [U] 4.33 A:46 [A] 45.4
B:115 [ARG] A:26 [A] 2.8 A:45 [U] 45.4
B:115 [ARG] A:27 [G] 3.74 45.4
B:116 [HIS] A:26 [A] 3.09 A:45 [U] 44.06
B:116 [HIS] A:27 [G] 2.99 44.06
B:117 [PRO] A:26 [A] 3.73 A:45 [U] 47.73
B:122 [ILE] A:27 [G] 3.85 26.27
B:122 [ILE] A:28 [A] 3.32 26.27
B:123 [VAL] A:28 [A] 4.47 62.54
B:125 [GLU] A:26 [A] 3.62 A:45 [U] 86.7
B:125 [GLU] A:27 [G] 4.62 86.7
B:126 [VAL] A:27 [G] 3.77 62.09
B:126 [VAL] A:28 [A] 3.72 62.09
B:129 [HIS] A:26 [A] 4.39 A:45 [U] 70.02
B:129 [HIS] A:27 [G] 3.01 70.02
B:129 [HIS] A:45 [U] 4.3 A:26 [A] 70.02
B:133 [PRO] A:45 [U] 3.53 A:26 [A] 92.99
B:134 [THR] A:44 [U] 3.61 99.0
B:134 [THR] A:45 [U] 3.59 A:26 [A] 99.0
B:135 [ILE] A:45 [U] 3.07 A:26 [A] sugar:BB 96.11
B:135 [ILE] A:46 [A] 3.62 A:25 [U] 96.11
B:136 [TYR] A:45 [U] 4.73 A:26 [A] 80.16
B:136 [TYR] A:46 [A] 4.42 A:25 [U] 80.16
B:155 [TYR] A:48 [A] 4.5 A:23 [U] 93.57
B:156 [LEU] A:47 [A] 4.59 A:24 [U] 97.45
B:159 [ALA] A:47 [A] 4.83 A:24 [U] 91.7
B:160 [HIS] A:45 [U] 4.79 A:26 [A] 88.53
B:160 [HIS] A:46 [A] 2.81 A:25 [U] 88.53
B:160 [HIS] A:47 [A] 3.9 A:24 [U] 88.53
B:163 [LYS] A:19 [G] 4.75 C:10 [DC] 98.26
B:163 [LYS] A:47 [A] 4.33 A:24 [U] 98.26
B:163 [LYS] A:48 [A] 2.7 A:23 [U] 98.26
B:163 [LYS] A:49 [A] 4.7 A:22 [U] 98.26
B:164 [PHE] A:19 [G] 3.19 C:10 [DC] 71.32
B:164 [PHE] A:20 [C] 4.91 C:9 [DG] 71.32
B:164 [PHE] A:47 [A] 3.66 A:24 [U] 71.32
B:165 [ARG] A:17 [U] 3.42 C:12 [DA] 98.97
B:165 [ARG] A:18 [G] 2.83 C:11 [DC] 98.97
B:165 [ARG] A:19 [G] 3.32 C:10 [DC] 98.97
B:166 [GLY] A:17 [U] 4.93 C:12 [DA] 98.87
B:166 [GLY] A:18 [G] 3.16 C:11 [DC] 98.87
B:166 [GLY] A:19 [G] 3.19 C:10 [DC] 98.87
B:167 [HIS] A:17 [U] 4.69 C:12 [DA] 89.87
B:167 [HIS] A:18 [G] 3.6 C:11 [DC] 89.87
B:168 [PHE] A:17 [U] 3.51 C:12 [DA] 98.87
B:168 [PHE] A:18 [G] 4.65 C:11 [DC] 98.87
B:324 [ARG] A:44 [U] 4.23 42.32
B:325 [TYR] A:43 [G] 4.44 91.67
B:325 [TYR] A:44 [U] 3.22 base:BB base/AA stacks 91.67
B:328 [HIS] A:43 [G] 4.95 95.4
B:328 [HIS] A:44 [U] 3.26 base/AA stacks 95.4
B:329 [HIS] A:43 [G] 4.87 66.17
B:329 [HIS] A:44 [U] 3.21 66.17
B:332 [LEU] A:43 [G] 3.82 94.18
B:332 [LEU] A:44 [U] 4.89 94.18
B:336 [LYS] A:42 [A] 3.43 95.53
B:336 [LYS] A:43 [G] 2.82 base:SC, base:SC 95.53
B:340 [ARG] A:40 [C] 3.45 A:29 [G] 63.81
B:340 [ARG] A:41 [A] 2.56 63.81
B:347 [TYR] A:41 [A] 3.81 70.2
B:347 [TYR] A:43 [G] 4.67 70.2
B:348 [LYS] A:39 [G] 4.61 A:30 [C] 45.1
B:351 [PHE] A:42 [A] 3.13 base:BB 91.34
B:351 [PHE] A:43 [G] 2.87 base:BB 91.34
B:352 [PHE] A:40 [C] 4.32 A:29 [G] 52.6
B:352 [PHE] A:41 [A] 3.36 52.6
B:352 [PHE] A:42 [A] 3.61 52.6
B:359 [TYR] A:43 [G] 2.96 sugar:SC 89.82
B:359 [TYR] A:44 [U] 4.26 89.82
B:360 [ALA] A:43 [G] 3.51 50.75
B:363 [ILE] A:43 [G] 3.32 68.4
B:363 [ILE] A:44 [U] 4.07 68.4
B:364 [ASP] A:43 [G] 3.02 base:SC 60.79
B:365 [GLY] A:22 [U] 4.04 A:49 [A] 41.05
B:366 [GLY] A:22 [U] 4.6 A:49 [A] 29.42
B:400 [ARG] A:44 [U] 3.86 74.01
B:401 [LYS] A:44 [U] 3.84 85.33
B:401 [LYS] A:45 [U] 3.6 A:26 [A] 85.33
B:402 [GLN] A:20 [C] 4.45 C:9 [DG] 80.05
B:402 [GLN] A:44 [U] 2.4 base:SC, sugar:SC 80.05
B:402 [GLN] A:45 [U] 2.82 A:26 [A] 80.05
B:403 [ARG] A:19 [G] 4.96 C:10 [DC] 84.38
B:403 [ARG] A:20 [C] 2.88 C:9 [DG] 84.38
B:403 [ARG] A:21 [G] 4.04 A:50 [U] 84.38
B:403 [ARG] A:45 [U] 2.87 A:26 [A] 84.38
B:403 [ARG] A:46 [A] 2.72 A:25 [U] 84.38
B:403 [ARG] A:47 [A] 4.89 A:24 [U] 84.38
B:404 [THR] A:19 [G] 3.07 C:10 [DC] sugar:BB 74.85
B:404 [THR] A:20 [C] 2.83 C:9 [DG] 74.85
B:405 [PHE] A:19 [G] 2.96 C:10 [DC] 59.96
B:405 [PHE] A:20 [C] 4.11 C:9 [DG] 59.96
B:406 [ASP] A:19 [G] 4.21 C:10 [DC] 50.83
B:407 [ASN] A:19 [G] 3.22 C:10 [DC] 98.97
B:407 [ASN] A:20 [C] 2.91 C:9 [DG] 98.97
B:408 [GLY] A:18 [G] 3.49 C:11 [DC] sugar:BB 74.75
B:408 [GLY] A:19 [G] 3.5 C:10 [DC] 74.75
B:410 [ILE] A:18 [G] 4.78 C:11 [DC] 95.83
B:415 [HIS] A:19 [G] 4.87 C:10 [DC] 87.61
B:446 [PHE] A:59 [U] 3.22 96.24
B:447 [ARG] A:16 [U] 2.83 C:13 [DA] base:SC, sugar:SC 89.87
B:447 [ARG] A:17 [U] 3.54 C:12 [DA] 89.87
B:448 [ILE] A:16 [U] 2.63 C:13 [DA] sugar:BB 92.48
B:448 [ILE] A:17 [U] 3.49 C:12 [DA] 92.48
B:448 [ILE] A:59 [U] 4.9 92.48
B:448 [ILE] A:60 [C] 4.94 A:54 [G] 92.48
B:449 [PRO] A:15 [C] 4.33 C:14 [DG] 98.72
B:449 [PRO] A:16 [U] 3.9 C:13 [DA] 98.72
B:450 [TYR] A:14 [G] 4.78 C:15 [DC] 97.93
B:450 [TYR] A:15 [C] 2.71 C:14 [DG] sugar:BB 97.93
B:450 [TYR] A:16 [U] 3.27 C:13 [DA] 97.93
B:451 [TYR] A:15 [C] 4.68 C:14 [DG] 95.04
B:452 [VAL] A:15 [C] 4.99 C:14 [DG] 94.08
B:453 [GLY] A:15 [C] 3.52 C:14 [DG] 98.87
B:453 [GLY] A:16 [U] 3.79 C:13 [DA] 98.87
B:454 [PRO] A:15 [C] 3.33 C:14 [DG] 97.63
B:454 [PRO] A:16 [U] 3.47 C:13 [DA] 97.63
B:454 [PRO] A:60 [C] 3.74 A:54 [G] 97.63
B:454 [PRO] A:61 [C] 3.91 A:53 [G] 97.63
B:455 [LEU] A:58 [G] 2.7 A:55 [C] sugar:BB 90.76
B:455 [LEU] A:59 [U] 3.67 90.76
B:455 [LEU] A:60 [C] 2.78 A:54 [G] 90.76
B:456 [ALA] A:58 [G] 3.23 A:55 [C] 80.55
B:456 [ALA] A:60 [C] 3.59 A:54 [G] 80.55
B:457 [ARG] A:57 [A] 2.85 44.28
B:457 [ARG] A:58 [G] 3.33 A:55 [C] 44.28
B:459 [ASN] A:56 [U] 3.18 base/AA stacks 42.93
B:459 [ASN] A:58 [G] 4.99 A:55 [C] 42.93
B:459 [ASN] A:60 [C] 3.34 A:54 [G] 42.93
B:459 [ASN] A:61 [C] 3.96 A:53 [G] 42.93
B:460 [SER] A:60 [C] 3.45 A:54 [G] 73.06
B:460 [SER] A:61 [C] 2.69 A:53 [G] 73.06
B:461 [ARG] A:14 [G] 4.33 C:15 [DC] 49.85
B:461 [ARG] A:62 [G] 4.99 A:52 [A] 49.85
B:462 [PHE] A:14 [G] 3.54 C:15 [DC] 67.57
B:462 [PHE] A:15 [C] 3.35 C:14 [DG] 67.57
B:462 [PHE] A:61 [C] 3.79 A:53 [G] 67.57
B:462 [PHE] A:62 [G] 3.4 A:52 [A] 67.57
B:464 [TRP] A:14 [G] 4.0 C:15 [DC] 98.24
B:464 [TRP] A:15 [C] 3.68 C:14 [DG] 98.24
B:467 [ARG] A:58 [G] 3.11 A:55 [C] 86.9
B:467 [ARG] A:59 [U] 3.01 86.9
B:471 [GLU] A:59 [U] 4.1 62.38
B:472 [THR] A:58 [G] 4.89 A:55 [C] 55.34
B:472 [THR] A:59 [U] 3.13 55.34
B:473 [ILE] A:59 [U] 2.84 91.37
B:474 [THR] A:59 [U] 4.31 72.83
B:475 [PRO] A:59 [U] 3.14 98.7
B:491 [PHE] A:14 [G] 4.04 C:15 [DC] 98.85
B:494 [ARG] A:14 [G] 4.71 C:15 [DC] 91.27
B:500 [LYS] A:3 [A] 4.39 C:26 [DT] 90.1
B:510 [LYS] A:5 [A] 3.96 C:24 [DT] 85.29
B:510 [LYS] A:6 [U] 3.17 C:23 [DA] 85.29
B:515 [TYR] A:4 [A] 3.31 C:25 [DT] 97.88
B:515 [TYR] A:5 [A] 2.44 C:24 [DT] 97.88
B:518 [PHE] A:4 [A] 3.94 C:25 [DT] 74.44
B:519 [THR] A:4 [A] 4.92 C:25 [DT] 60.98
B:519 [THR] A:5 [A] 3.61 C:24 [DT] 60.98
B:522 [ASN] A:4 [A] 4.6 C:25 [DT] 94.56
B:523 [GLU] A:5 [A] 4.86 C:24 [DT] 98.26
B:588 [ASN] A:5 [A] 3.97 C:24 [DT] 79.54
B:588 [ASN] A:6 [U] 3.26 C:23 [DA] 79.54
B:589 [ALA] A:5 [A] 3.79 C:24 [DT] 81.53
B:589 [ALA] A:6 [U] 4.7 C:23 [DA] 81.53
B:660 [GLY] A:5 [A] 4.55 C:24 [DT] 93.24
B:661 [ARG] A:4 [A] 2.75 C:25 [DT] 83.25
B:661 [ARG] A:5 [A] 3.44 C:24 [DT] 83.25
B:662 [LEU] A:4 [A] 4.29 C:25 [DT] 84.24
B:693 [PHE] A:3 [A] 3.74 C:26 [DT] 80.36
B:693 [PHE] A:4 [A] 4.65 C:25 [DT] 80.36
B:694 [MET] A:2 [G] 3.13 C:27 [DC] 94.94
B:694 [MET] A:3 [A] 3.31 C:26 [DT] 94.94
B:721 [HIS] A:65 [A] 2.75 sugar:SC 48.08
B:721 [HIS] A:66 [U] 3.08 48.08
B:721 [HIS] A:77 [A] 4.73 A:72 [U] 48.08
B:725 [ALA] A:65 [A] 4.56 54.16
B:729 [GLY] A:11 [U] 4.83 C:18 [DA] 72.32
B:729 [GLY] A:12 [G] 4.89 C:17 [DC] 72.32
B:731 [PRO] A:12 [G] 4.24 C:17 [DC] 93.55
B:731 [PRO] A:13 [C] 4.52 C:16 [DG] 93.55
B:734 [LYS] A:66 [U] 4.83 94.38
B:735 [LYS] A:66 [U] 3.46 91.44
B:738 [LEU] A:66 [U] 3.62 62.03
B:738 [LEU] A:67 [C] 4.96 62.03
B:739 [GLN] A:66 [U] 4.49 90.1
B:739 [GLN] A:67 [C] 3.0 90.1
B:742 [LYS] A:66 [U] 3.41 62.24
B:742 [LYS] A:67 [C] 2.56 62.24
B:749 [LYS] A:79 [G] 4.69 A:70 [C] 58.68
B:753 [ARG] A:79 [G] 4.88 A:70 [C] 76.52
B:753 [ARG] A:80 [U] 2.69 A:69 [A] 76.52
B:753 [ARG] A:81 [G] 4.46 A:68 [A] 76.52
B:893 [THR] A:8 [A] 4.3 C:21 [DT] 90.35
B:893 [THR] A:9 [G] 4.14 C:20 [DC] 90.35
B:894 [GLN] A:7 [U] 4.01 C:22 [DA] 50.01
B:894 [GLN] A:8 [A] 3.71 C:21 [DT] sugar:BB 50.01
B:895 [ARG] A:8 [A] 4.59 C:21 [DT] 69.18
B:922 [VAL] A:1 [G] 4.71 C:28 [DC] 98.77
B:926 [GLN] A:2 [G] 3.59 C:27 [DC] 98.97
B:929 [LYS] A:1 [G] 3.9 C:28 [DC] 94.44
B:929 [LYS] A:2 [G] 3.52 C:27 [DC] 94.44
B:1097 [LYS] A:67 [C] 2.99 0.0
B:1097 [LYS] A:68 [A] 4.05 A:81 [G] 0.0
B:1098 [THR] A:67 [C] 4.71 0.0
B:1098 [THR] A:68 [A] 4.49 A:81 [G] 0.0
B:1099 [GLU] A:67 [C] 3.39 base/AA stacks 0.0
B:1100 [VAL] A:67 [C] 2.94 base:BB, base:BB 0.0
B:1102 [THR] A:63 [U] 4.78 0.0
B:1102 [THR] A:64 [U] 2.75 0.0
B:1102 [THR] A:65 [A] 4.48 0.0
B:1102 [THR] A:66 [U] 4.17 0.0
B:1103 [GLY] A:51 [A] 3.52 base:BB 0.0
B:1103 [GLY] A:63 [U] 3.42 0.0
B:1103 [GLY] A:64 [U] 3.48 0.0
B:1104 [GLY] A:51 [A] 3.53 0.0
B:1104 [GLY] A:63 [U] 3.0 0.0
B:1105 [PHE] A:51 [A] 3.12 base:BB base/AA stacks 0.0
B:1105 [PHE] A:52 [A] 3.46 A:62 [G] 0.0
B:1108 [GLU] A:63 [U] 4.98 0.0
B:1110 [ILE] A:21 [G] 3.82 A:50 [U] 0.0
B:1110 [ILE] A:22 [U] 2.54 A:49 [A] sugar:BB 0.0
B:1110 [ILE] A:23 [U] 3.32 A:48 [A] 0.0
B:1111 [LEU] A:22 [U] 4.74 A:49 [A] 0.0
B:1111 [LEU] A:23 [U] 3.96 A:48 [A] 0.0
B:1112 [PRO] A:23 [U] 3.76 A:48 [A] 0.0
B:1112 [PRO] A:24 [U] 3.35 A:47 [A] 0.0
B:1113 [LYS] A:23 [U] 4.45 A:48 [A] 0.0
B:1113 [LYS] A:24 [U] 3.04 A:47 [A] 0.0
B:1113 [LYS] A:25 [U] 4.43 A:46 [A] 0.0
B:1121 [ALA] A:52 [A] 4.85 A:62 [G] 0.0
B:1122 [ARG] A:23 [U] 2.77 A:48 [A] base:SC 0.0
B:1122 [ARG] A:48 [A] 4.96 A:23 [U] 0.0
B:1122 [ARG] A:49 [A] 2.85 A:22 [U] base:SC 0.0
B:1122 [ARG] A:50 [U] 4.56 A:21 [G] 0.0
B:1122 [ARG] A:52 [A] 3.26 A:62 [G] 0.0
B:1123 [LYS] A:49 [A] 3.28 A:22 [U] 0.0
B:1123 [LYS] A:50 [U] 3.77 A:21 [G] 0.0
B:1123 [LYS] A:52 [A] 2.84 A:62 [G] 0.0
B:1123 [LYS] A:53 [G] 3.57 A:61 [C] 0.0
B:1124 [LYS] A:52 [A] 3.36 A:62 [G] 0.0
B:1124 [LYS] A:53 [G] 2.76 A:61 [C] 0.0
B:1126 [TRP] A:48 [A] 4.52 A:23 [U] 0.0
B:1126 [TRP] A:49 [A] 3.38 A:22 [U] 0.0
B:1130 [LYS] A:24 [U] 3.34 A:47 [A] 0.0
B:1131 [TYR] A:23 [U] 2.62 A:48 [A] sugar:BB 0.0
B:1131 [TYR] A:24 [U] 3.63 A:47 [A] 0.0
B:1132 [GLY] A:23 [U] 4.68 A:48 [A] 0.0
B:1132 [GLY] A:24 [U] 4.8 A:47 [A] 0.0
B:1134 [PHE] A:51 [A] 4.0 0.0
B:1168 [ILE] A:51 [A] 4.96 0.0
B:1169 [MET] A:52 [A] 3.39 A:62 [G] 0.0
B:1197 [LYS] A:67 [C] 5.0 0.0
B:1197 [LYS] A:69 [A] 4.89 A:80 [U] 0.0
B:1349 [HIS] A:68 [A] 2.59 A:81 [G] sugar:SC 0.0
B:1349 [HIS] A:69 [A] 3.48 A:80 [U] 0.0
B:1350 [GLN] A:68 [A] 3.15 A:81 [G] 0.0
B:1351 [SER] A:68 [A] 3.73 A:81 [G] 0.0
B:1356 [TYR] A:68 [A] 4.0 A:81 [G] 0.0
B:1356 [TYR] A:81 [G] 3.44 A:68 [A] base/AA stacks 0.0
B:1357 [GLU] A:68 [A] 4.64 A:81 [G] 0.0
B:1357 [GLU] A:81 [G] 3.19 A:68 [A] base:BB 0.0
B:1358 [THR] A:68 [A] 3.8 A:81 [G] 0.0
B:1358 [THR] A:69 [A] 3.87 A:80 [U] 0.0
B:1358 [THR] A:81 [G] 4.93 A:68 [A] 0.0

logo_download Export the table of contacts

*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)

Properties of this interface

Interolog group ID Structure ID Structure description
 UniProt ID
 		ECOD label(s)
 		RFAM label(s)
 		Is ribosome? RCSB PDB link
group125 5B2T_B_A B: Crispr-associated endonuclease cas9, Streptococcus pyogenes serotype m1 (genetically engineered) A: Guide RNA, Streptococcus pyogenes (synthetic) Q99ZW2 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 ✘

Interologs

Total number of interologs for this interface: 8

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
4OO8_A_B 5B2T_B_A 0.97 0.93 1.46 0.97 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2S_B_A 5B2T_B_A 0.99 0.99 0.38 0.99 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2T_B_A 7OX9_B_A 0.98 0.99 0.36 0.72 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2T_B_A 5FQ5_B_A 0.98 0.98 0.29 0.74 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2T_B_A 7EL1_A_B 0.64 0.73 1.93 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2T_B_A 5FW1_B_A 0.97 0.99 0.37 0.75 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2T_B_A 5X2H_A_B 0.53 0.75 3.2 0.16 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2R_B_A 5B2T_B_A 0.99 0.99 0.31 0.99 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare