Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
ChainChain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity Electrostatics (surface only) Conservation*
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show as licoriceshow Accessibility
Rim - Core
Contacts -
5FQ5_B
|
5FQ5_A
|
Distance
|
Base Pair
|
Hbond nuc:res
|
Base Stacking
|
Residue conservation
|
---|---|---|---|---|---|---|
B:31 [LYS] | A:82 [A] | 4.83 | 65.06 | |||
B:33 [LYS] | A:81 [G] | 2.93 | A:68 [A] | base:BB | 75.05 | |
B:33 [LYS] | A:82 [A] | 4.59 | 75.05 | |||
B:34 [VAL] | A:81 [G] | 4.32 | A:68 [A] | 27.6 | ||
B:35 [LEU] | A:69 [A] | 4.45 | A:80 [U] | 62.31 | ||
B:35 [LEU] | A:80 [U] | 4.99 | A:69 [A] | 62.31 | ||
B:35 [LEU] | A:81 [G] | 3.61 | A:68 [A] | 62.31 | ||
B:55 [SER] | A:65 [A] | 4.25 | 61.08 | |||
B:56 [GLY] | A:64 [U] | 4.95 | 88.76 | |||
B:56 [GLY] | A:65 [A] | 3.36 | 88.76 | |||
B:57 [GLU] | A:64 [U] | 2.73 | sugar:BB | 50.23 | ||
B:57 [GLU] | A:65 [A] | 2.79 | 50.23 | |||
B:58 [THR] | A:12 [U] | 3.75 | E:17 [DA] | 90.88 | ||
B:58 [THR] | A:13 [G] | 3.49 | E:16 [DC] | 90.88 | ||
B:58 [THR] | A:64 [U] | 3.46 | 90.88 | |||
B:59 [ALA] | A:13 [G] | 2.66 | E:16 [DC] | 98.75 | ||
B:59 [ALA] | A:14 [U] | 3.96 | E:15 [DA] | 98.75 | ||
B:59 [ALA] | A:64 [U] | 3.58 | 98.75 | |||
B:60 [GLU] | A:13 [G] | 4.32 | E:16 [DC] | 73.82 | ||
B:60 [GLU] | A:14 [U] | 4.83 | E:15 [DA] | 73.82 | ||
B:61 [ALA] | A:63 [U] | 4.44 | 54.59 | |||
B:62 [THR] | A:63 [U] | 2.75 | sugar:SC | 89.36 | ||
B:62 [THR] | A:64 [U] | 3.06 | sugar:SC | 89.36 | ||
B:63 [ARG] | A:13 [G] | 4.54 | E:16 [DC] | 98.97 | ||
B:63 [ARG] | A:14 [U] | 2.83 | E:15 [DA] | 98.97 | ||
B:63 [ARG] | A:15 [A] | 3.32 | E:14 [DT] | 98.97 | ||
B:65 [LYS] | A:51 [A] | 4.96 | 51.88 | |||
B:65 [LYS] | A:63 [U] | 3.71 | 51.88 | |||
B:66 [ARG] | A:14 [U] | 3.21 | E:15 [DA] | 98.97 | ||
B:66 [ARG] | A:15 [A] | 2.86 | E:14 [DT] | 98.97 | ||
B:66 [ARG] | A:62 [G] | 3.38 | A:52 [A] | 98.97 | ||
B:67 [THR] | A:15 [A] | 3.69 | E:14 [DT] | 79.07 | ||
B:67 [THR] | A:16 [A] | 3.91 | E:13 [DT] | 79.07 | ||
B:68 [ALA] | A:51 [A] | 4.78 | 74.51 | |||
B:69 [ARG] | A:51 [A] | 3.52 | 98.97 | |||
B:69 [ARG] | A:62 [G] | 2.98 | A:52 [A] | base/AA stacks | 98.97 | |
B:69 [ARG] | A:63 [U] | 3.07 | 98.97 | |||
B:70 [ARG] | A:14 [U] | 4.68 | E:15 [DA] | 98.97 | ||
B:70 [ARG] | A:15 [A] | 2.6 | E:14 [DT] | 98.97 | ||
B:70 [ARG] | A:16 [A] | 2.9 | E:13 [DT] | 98.97 | ||
B:70 [ARG] | A:60 [C] | 4.99 | A:54 [G] | 98.97 | ||
B:70 [ARG] | A:61 [C] | 2.98 | A:53 [G] | 98.97 | ||
B:71 [ARG] | A:17 [A] | 3.25 | E:12 [DT] | base/AA stacks | 95.92 | |
B:71 [ARG] | A:18 [A] | 3.03 | base:SC | 95.92 | ||
B:72 [TYR] | A:20 [A] | 4.14 | 47.53 | |||
B:72 [TYR] | A:21 [G] | 4.9 | A:50 [U] | 47.53 | ||
B:72 [TYR] | A:50 [U] | 3.52 | A:21 [G] | base/AA stacks | 47.53 | |
B:72 [TYR] | A:51 [A] | 3.36 | 47.53 | |||
B:73 [THR] | A:59 [U] | 4.01 | 55.44 | |||
B:73 [THR] | A:60 [C] | 4.16 | A:54 [G] | 55.44 | ||
B:73 [THR] | A:61 [C] | 4.82 | A:53 [G] | 55.44 | ||
B:74 [ARG] | A:16 [A] | 2.7 | E:13 [DT] | 98.77 | ||
B:74 [ARG] | A:17 [A] | 3.05 | E:12 [DT] | 98.77 | ||
B:74 [ARG] | A:59 [U] | 3.45 | 98.77 | |||
B:74 [ARG] | A:60 [C] | 2.82 | A:54 [G] | 98.77 | ||
B:75 [ARG] | A:49 [A] | 4.92 | A:22 [U] | 89.41 | ||
B:75 [ARG] | A:50 [U] | 3.05 | A:21 [G] | base:SC | 89.41 | |
B:76 [LYS] | A:48 [A] | 3.93 | A:23 [U] | 75.1 | ||
B:76 [LYS] | A:49 [A] | 2.88 | A:22 [U] | 75.1 | ||
B:77 [ASN] | A:59 [U] | 2.73 | base:SC | 57.86 | ||
B:78 [ARG] | A:18 [A] | 3.57 | 98.92 | |||
B:79 [ILE] | A:48 [A] | 3.91 | A:23 [U] | 78.75 | ||
B:81 [TYR] | A:59 [U] | 3.46 | base:SC | 60.58 | ||
B:83 [GLN] | A:48 [A] | 4.26 | A:23 [U] | 71.81 | ||
B:100 [ARG] | A:47 [A] | 4.86 | A:24 [U] | 95.64 | ||
B:101 [LEU] | A:47 [A] | 2.61 | A:24 [U] | sugar:BB | 83.71 | |
B:101 [LEU] | A:48 [A] | 3.9 | A:23 [U] | 83.71 | ||
B:102 [GLU] | A:47 [A] | 4.58 | A:24 [U] | 56.7 | ||
B:102 [GLU] | A:48 [A] | 4.07 | A:23 [U] | 56.7 | ||
B:102 [GLU] | A:49 [A] | 4.26 | A:22 [U] | 56.7 | ||
B:104 [SER] | A:24 [U] | 4.28 | A:47 [A] | 96.25 | ||
B:104 [SER] | A:25 [U] | 3.17 | A:46 [A] | sugar:BB | 96.25 | |
B:104 [SER] | A:47 [A] | 2.83 | A:24 [U] | base:SC, sugar:SC | 96.25 | |
B:104 [SER] | A:48 [A] | 3.55 | A:23 [U] | sugar:SC | 96.25 | |
B:105 [PHE] | A:23 [U] | 3.54 | A:48 [A] | 55.43 | ||
B:105 [PHE] | A:24 [U] | 2.69 | A:47 [A] | sugar:BB | base/AA stacks | 55.43 |
B:105 [PHE] | A:25 [U] | 3.69 | A:46 [A] | 55.43 | ||
B:105 [PHE] | A:47 [A] | 4.47 | A:24 [U] | 55.43 | ||
B:105 [PHE] | A:48 [A] | 3.67 | A:23 [U] | 55.43 | ||
B:106 [LEU] | A:24 [U] | 4.22 | A:47 [A] | 61.15 | ||
B:106 [LEU] | A:25 [U] | 3.6 | A:46 [A] | 61.15 | ||
B:107 [VAL] | A:24 [U] | 3.82 | A:47 [A] | 35.09 | ||
B:107 [VAL] | A:25 [U] | 4.0 | A:46 [A] | 35.09 | ||
B:108 [GLU] | A:25 [U] | 4.86 | A:46 [A] | 34.89 | ||
B:108 [GLU] | A:26 [A] | 4.53 | A:45 [U] | 34.89 | ||
B:111 [LYS] | A:25 [U] | 3.26 | A:46 [A] | sugar:SC | 82.11 | |
B:115 [ARG] | A:25 [U] | 4.28 | A:46 [A] | 43.76 | ||
B:115 [ARG] | A:26 [A] | 2.65 | A:45 [U] | 43.76 | ||
B:115 [ARG] | A:27 [G] | 3.8 | 43.76 | |||
B:116 [HIS] | A:26 [A] | 3.15 | A:45 [U] | 47.66 | ||
B:116 [HIS] | A:27 [G] | 2.77 | 47.66 | |||
B:117 [PRO] | A:26 [A] | 3.53 | A:45 [U] | 49.14 | ||
B:122 [ILE] | A:27 [G] | 4.14 | 44.08 | |||
B:122 [ILE] | A:28 [A] | 4.08 | 44.08 | |||
B:123 [VAL] | A:28 [A] | 4.55 | 65.03 | |||
B:125 [GLU] | A:26 [A] | 3.67 | A:45 [U] | sugar:SC | 82.1 | |
B:126 [VAL] | A:27 [G] | 4.93 | 61.8 | |||
B:126 [VAL] | A:28 [A] | 3.1 | 61.8 | |||
B:129 [HIS] | A:26 [A] | 4.39 | A:45 [U] | 67.72 | ||
B:129 [HIS] | A:27 [G] | 2.99 | 67.72 | |||
B:129 [HIS] | A:45 [U] | 4.29 | A:26 [A] | 67.72 | ||
B:130 [GLU] | A:28 [A] | 4.88 | 57.66 | |||
B:133 [PRO] | A:27 [G] | 4.89 | 96.3 | |||
B:133 [PRO] | A:45 [U] | 3.66 | A:26 [A] | 96.3 | ||
B:134 [THR] | A:44 [U] | 3.6 | 98.97 | |||
B:134 [THR] | A:45 [U] | 3.51 | A:26 [A] | 98.97 | ||
B:135 [ILE] | A:45 [U] | 3.02 | A:26 [A] | sugar:BB | 95.32 | |
B:135 [ILE] | A:46 [A] | 3.62 | A:25 [U] | 95.32 | ||
B:136 [TYR] | A:45 [U] | 4.76 | A:26 [A] | 81.66 | ||
B:136 [TYR] | A:46 [A] | 4.52 | A:25 [U] | 81.66 | ||
B:155 [TYR] | A:48 [A] | 4.6 | A:23 [U] | 94.43 | ||
B:156 [LEU] | A:47 [A] | 4.65 | A:24 [U] | 96.43 | ||
B:159 [ALA] | A:47 [A] | 4.75 | A:24 [U] | 91.99 | ||
B:160 [HIS] | A:45 [U] | 4.83 | A:26 [A] | 88.18 | ||
B:160 [HIS] | A:46 [A] | 2.86 | A:25 [U] | 88.18 | ||
B:160 [HIS] | A:47 [A] | 3.99 | A:24 [U] | 88.18 | ||
B:163 [LYS] | A:19 [A] | 4.69 | 98.07 | |||
B:163 [LYS] | A:47 [A] | 4.37 | A:24 [U] | 98.07 | ||
B:163 [LYS] | A:48 [A] | 2.77 | A:23 [U] | 98.07 | ||
B:163 [LYS] | A:49 [A] | 4.79 | A:22 [U] | 98.07 | ||
B:164 [PHE] | A:19 [A] | 3.18 | 70.75 | |||
B:164 [PHE] | A:20 [A] | 4.82 | 70.75 | |||
B:164 [PHE] | A:47 [A] | 3.77 | A:24 [U] | 70.75 | ||
B:165 [ARG] | A:17 [A] | 3.31 | E:12 [DT] | 98.97 | ||
B:165 [ARG] | A:18 [A] | 3.04 | 98.97 | |||
B:165 [ARG] | A:19 [A] | 3.32 | 98.97 | |||
B:166 [GLY] | A:17 [A] | 4.68 | E:12 [DT] | 98.85 | ||
B:166 [GLY] | A:18 [A] | 3.02 | 98.85 | |||
B:166 [GLY] | A:19 [A] | 3.1 | 98.85 | |||
B:167 [HIS] | A:17 [A] | 4.43 | E:12 [DT] | 90.02 | ||
B:167 [HIS] | A:18 [A] | 3.62 | 90.02 | |||
B:168 [PHE] | A:17 [A] | 3.51 | E:12 [DT] | 98.85 | ||
B:168 [PHE] | A:18 [A] | 4.77 | 98.85 | |||
B:324 [ARG] | A:44 [U] | 4.33 | 41.5 | |||
B:325 [TYR] | A:43 [G] | 4.86 | 91.86 | |||
B:325 [TYR] | A:44 [U] | 3.29 | base:BB | base/AA stacks | 91.86 | |
B:328 [HIS] | A:43 [G] | 4.85 | 94.96 | |||
B:328 [HIS] | A:44 [U] | 3.1 | base/AA stacks | 94.96 | ||
B:329 [HIS] | A:43 [G] | 4.02 | 62.17 | |||
B:329 [HIS] | A:44 [U] | 3.08 | 62.17 | |||
B:332 [LEU] | A:43 [G] | 3.78 | 94.28 | |||
B:336 [LYS] | A:42 [A] | 3.68 | 95.57 | |||
B:336 [LYS] | A:43 [G] | 2.84 | base:SC, base:SC | 95.57 | ||
B:340 [ARG] | A:40 [C] | 3.38 | A:29 [G] | 63.83 | ||
B:340 [ARG] | A:41 [A] | 2.47 | 63.83 | |||
B:347 [TYR] | A:41 [A] | 3.79 | 72.64 | |||
B:347 [TYR] | A:43 [G] | 4.59 | 72.64 | |||
B:351 [PHE] | A:42 [A] | 3.49 | 92.52 | |||
B:351 [PHE] | A:43 [G] | 2.84 | base:BB, base:BB | 92.52 | ||
B:352 [PHE] | A:40 [C] | 4.34 | A:29 [G] | 58.41 | ||
B:352 [PHE] | A:41 [A] | 3.57 | 58.41 | |||
B:352 [PHE] | A:42 [A] | 3.45 | 58.41 | |||
B:359 [TYR] | A:43 [G] | 2.82 | sugar:SC | 89.29 | ||
B:359 [TYR] | A:44 [U] | 4.34 | 89.29 | |||
B:360 [ALA] | A:43 [G] | 3.67 | 48.83 | |||
B:363 [ILE] | A:43 [G] | 3.33 | 68.2 | |||
B:363 [ILE] | A:44 [U] | 4.05 | 68.2 | |||
B:364 [ASP] | A:43 [G] | 3.08 | base:SC | 60.95 | ||
B:365 [GLY] | A:22 [U] | 4.08 | A:49 [A] | 41.96 | ||
B:366 [GLY] | A:22 [U] | 4.69 | A:49 [A] | 37.22 | ||
B:400 [ARG] | A:44 [U] | 3.74 | 72.95 | |||
B:401 [LYS] | A:21 [G] | 4.91 | A:50 [U] | 85.97 | ||
B:401 [LYS] | A:44 [U] | 3.85 | 85.97 | |||
B:401 [LYS] | A:45 [U] | 3.64 | A:26 [A] | 85.97 | ||
B:402 [GLN] | A:20 [A] | 4.55 | 83.12 | |||
B:402 [GLN] | A:44 [U] | 2.1 | base:SC, sugar:SC | 83.12 | ||
B:402 [GLN] | A:45 [U] | 3.02 | A:26 [A] | 83.12 | ||
B:403 [ARG] | A:20 [A] | 2.94 | 84.66 | |||
B:403 [ARG] | A:21 [G] | 4.18 | A:50 [U] | 84.66 | ||
B:403 [ARG] | A:45 [U] | 2.87 | A:26 [A] | 84.66 | ||
B:403 [ARG] | A:46 [A] | 2.57 | A:25 [U] | 84.66 | ||
B:403 [ARG] | A:47 [A] | 4.43 | A:24 [U] | 84.66 | ||
B:404 [THR] | A:19 [A] | 3.04 | sugar:BB | 76.74 | ||
B:404 [THR] | A:20 [A] | 2.9 | 76.74 | |||
B:405 [PHE] | A:19 [A] | 2.97 | 57.48 | |||
B:405 [PHE] | A:20 [A] | 4.06 | 57.48 | |||
B:406 [ASP] | A:19 [A] | 4.13 | 50.53 | |||
B:407 [ASN] | A:18 [A] | 4.81 | 98.97 | |||
B:407 [ASN] | A:19 [A] | 3.29 | 98.97 | |||
B:407 [ASN] | A:20 [A] | 2.87 | 98.97 | |||
B:408 [GLY] | A:18 [A] | 3.63 | sugar:BB | 71.93 | ||
B:408 [GLY] | A:19 [A] | 3.45 | 71.93 | |||
B:410 [ILE] | A:18 [A] | 4.7 | 95.9 | |||
B:415 [HIS] | A:19 [A] | 4.87 | 88.15 | |||
B:446 [PHE] | A:17 [A] | 4.84 | E:12 [DT] | 97.08 | ||
B:446 [PHE] | A:59 [U] | 3.39 | 97.08 | |||
B:447 [ARG] | A:16 [A] | 3.36 | E:13 [DT] | base:SC | 90.78 | |
B:447 [ARG] | A:17 [A] | 3.19 | E:12 [DT] | sugar:SC | 90.78 | |
B:448 [ILE] | A:16 [A] | 2.72 | E:13 [DT] | sugar:BB | 91.25 | |
B:448 [ILE] | A:17 [A] | 3.05 | E:12 [DT] | 91.25 | ||
B:448 [ILE] | A:60 [C] | 4.6 | A:54 [G] | 91.25 | ||
B:449 [PRO] | A:15 [A] | 4.22 | E:14 [DT] | 98.67 | ||
B:449 [PRO] | A:16 [A] | 3.83 | E:13 [DT] | 98.67 | ||
B:450 [TYR] | A:15 [A] | 2.6 | E:14 [DT] | sugar:BB | 97.81 | |
B:450 [TYR] | A:16 [A] | 3.21 | E:13 [DT] | 97.81 | ||
B:451 [TYR] | A:15 [A] | 4.62 | E:14 [DT] | 95.11 | ||
B:452 [VAL] | A:15 [A] | 4.85 | E:14 [DT] | 94.61 | ||
B:453 [GLY] | A:15 [A] | 3.41 | E:14 [DT] | 98.85 | ||
B:453 [GLY] | A:16 [A] | 3.87 | E:13 [DT] | 98.85 | ||
B:454 [PRO] | A:15 [A] | 3.4 | E:14 [DT] | 97.49 | ||
B:454 [PRO] | A:16 [A] | 3.53 | E:13 [DT] | 97.49 | ||
B:454 [PRO] | A:60 [C] | 3.84 | A:54 [G] | 97.49 | ||
B:454 [PRO] | A:61 [C] | 3.94 | A:53 [G] | 97.49 | ||
B:455 [LEU] | A:58 [G] | 2.59 | A:55 [C] | sugar:BB | 89.21 | |
B:455 [LEU] | A:59 [U] | 3.68 | 89.21 | |||
B:455 [LEU] | A:60 [C] | 2.94 | A:54 [G] | 89.21 | ||
B:456 [ALA] | A:58 [G] | 3.32 | A:55 [C] | 81.18 | ||
B:456 [ALA] | A:60 [C] | 3.7 | A:54 [G] | 81.18 | ||
B:457 [ARG] | A:57 [A] | 2.69 | 41.08 | |||
B:457 [ARG] | A:58 [G] | 3.3 | A:55 [C] | 41.08 | ||
B:459 [ASN] | A:56 [U] | 3.26 | base/AA stacks | 46.67 | ||
B:459 [ASN] | A:58 [G] | 4.85 | A:55 [C] | 46.67 | ||
B:459 [ASN] | A:60 [C] | 3.4 | A:54 [G] | 46.67 | ||
B:459 [ASN] | A:61 [C] | 3.96 | A:53 [G] | 46.67 | ||
B:460 [SER] | A:60 [C] | 3.44 | A:54 [G] | 72.31 | ||
B:460 [SER] | A:61 [C] | 2.69 | A:53 [G] | 72.31 | ||
B:461 [ARG] | A:62 [G] | 4.03 | A:52 [A] | 46.06 | ||
B:461 [ARG] | A:64 [U] | 4.61 | 46.06 | |||
B:462 [PHE] | A:14 [U] | 3.63 | E:15 [DA] | 67.9 | ||
B:462 [PHE] | A:15 [A] | 3.39 | E:14 [DT] | 67.9 | ||
B:462 [PHE] | A:61 [C] | 3.73 | A:53 [G] | 67.9 | ||
B:462 [PHE] | A:62 [G] | 3.53 | A:52 [A] | 67.9 | ||
B:464 [TRP] | A:14 [U] | 3.88 | E:15 [DA] | 96.93 | ||
B:464 [TRP] | A:15 [A] | 3.65 | E:14 [DT] | 96.93 | ||
B:467 [ARG] | A:58 [G] | 3.7 | A:55 [C] | 85.85 | ||
B:467 [ARG] | A:59 [U] | 2.52 | 85.85 | |||
B:471 [GLU] | A:59 [U] | 4.15 | 63.54 | |||
B:472 [THR] | A:58 [G] | 5.0 | A:55 [C] | 51.15 | ||
B:472 [THR] | A:59 [U] | 2.92 | 51.15 | |||
B:473 [ILE] | A:59 [U] | 2.92 | 90.32 | |||
B:474 [THR] | A:59 [U] | 4.27 | 73.02 | |||
B:475 [PRO] | A:59 [U] | 3.3 | 98.62 | |||
B:491 [PHE] | A:14 [U] | 4.67 | E:15 [DA] | 98.55 | ||
B:494 [ARG] | A:14 [U] | 4.15 | E:15 [DA] | 89.03 | ||
B:495 [MET] | A:13 [G] | 3.21 | E:16 [DC] | 88.68 | ||
B:495 [MET] | A:14 [U] | 4.04 | E:15 [DA] | 88.68 | ||
B:510 [LYS] | A:5 [C] | 4.15 | E:24 [DG] | 85.15 | ||
B:510 [LYS] | A:6 [U] | 2.89 | E:23 [DA] | 85.15 | ||
B:515 [TYR] | A:4 [A] | 3.34 | E:25 [DT] | 97.66 | ||
B:515 [TYR] | A:5 [C] | 2.29 | E:24 [DG] | 97.66 | ||
B:518 [PHE] | A:4 [A] | 3.52 | E:25 [DT] | 72.35 | ||
B:519 [THR] | A:5 [C] | 3.19 | E:24 [DG] | sugar:SC | 59.22 | |
B:522 [ASN] | A:4 [A] | 4.54 | E:25 [DT] | 94.84 | ||
B:588 [ASN] | A:5 [C] | 4.43 | E:24 [DG] | 82.58 | ||
B:588 [ASN] | A:6 [U] | 3.3 | E:23 [DA] | 82.58 | ||
B:589 [ALA] | A:5 [C] | 4.21 | E:24 [DG] | 82.78 | ||
B:589 [ALA] | A:6 [U] | 4.69 | E:23 [DA] | 82.78 | ||
B:660 [GLY] | A:5 [C] | 4.22 | E:24 [DG] | 92.42 | ||
B:661 [ARG] | A:3 [A] | 4.83 | E:26 [DT] | 82.27 | ||
B:661 [ARG] | A:4 [A] | 2.53 | E:25 [DT] | 82.27 | ||
B:661 [ARG] | A:5 [C] | 3.44 | E:24 [DG] | 82.27 | ||
B:662 [LEU] | A:4 [A] | 4.07 | E:25 [DT] | 85.78 | ||
B:693 [PHE] | A:3 [A] | 3.87 | E:26 [DT] | 82.25 | ||
B:693 [PHE] | A:4 [A] | 4.13 | E:25 [DT] | 82.25 | ||
B:694 [MET] | A:3 [A] | 3.52 | E:26 [DT] | 93.83 | ||
B:721 [HIS] | A:65 [A] | 2.95 | sugar:SC | 47.18 | ||
B:721 [HIS] | A:66 [U] | 3.19 | 47.18 | |||
B:725 [ALA] | A:65 [A] | 4.81 | 55.04 | |||
B:729 [GLY] | A:11 [U] | 4.66 | E:18 [DA] | 75.96 | ||
B:729 [GLY] | A:12 [U] | 4.07 | E:17 [DA] | 75.96 | ||
B:730 [SER] | A:11 [U] | 4.79 | E:18 [DA] | 95.9 | ||
B:730 [SER] | A:12 [U] | 4.64 | E:17 [DA] | 95.9 | ||
B:731 [PRO] | A:12 [U] | 3.98 | E:17 [DA] | 92.69 | ||
B:731 [PRO] | A:13 [G] | 4.23 | E:16 [DC] | 92.69 | ||
B:734 [LYS] | A:66 [U] | 4.65 | 94.31 | |||
B:735 [LYS] | A:66 [U] | 3.56 | 91.38 | |||
B:738 [LEU] | A:66 [U] | 3.84 | 65.68 | |||
B:738 [LEU] | A:67 [C] | 4.24 | 65.68 | |||
B:739 [GLN] | A:66 [U] | 4.53 | 90.04 | |||
B:739 [GLN] | A:67 [C] | 3.02 | 90.04 | |||
B:742 [LYS] | A:66 [U] | 3.74 | 57.9 | |||
B:742 [LYS] | A:67 [C] | 2.83 | 57.9 | |||
B:749 [LYS] | A:80 [U] | 4.38 | A:69 [A] | 59.45 | ||
B:749 [LYS] | A:81 [G] | 3.95 | A:68 [A] | 59.45 | ||
B:753 [ARG] | A:80 [U] | 3.39 | A:69 [A] | 72.94 | ||
B:890 [LYS] | A:8 [A] | 4.48 | E:21 [DT] | 57.94 | ||
B:890 [LYS] | A:9 [A] | 2.43 | E:20 [DT] | 57.94 | ||
B:893 [THR] | A:8 [A] | 3.82 | E:21 [DT] | 89.84 | ||
B:893 [THR] | A:9 [A] | 3.39 | E:20 [DT] | 89.84 | ||
B:894 [GLN] | A:7 [C] | 4.34 | E:22 [DG] | 47.06 | ||
B:894 [GLN] | A:8 [A] | 3.66 | E:21 [DT] | sugar:BB | 47.06 | |
B:895 [ARG] | A:8 [A] | 4.69 | E:21 [DT] | 73.32 | ||
B:924 [THR] | A:1 [A] | 3.8 | E:28 [DT] | 98.37 | ||
B:926 [GLN] | A:2 [U] | 3.75 | E:27 [DA] | 98.97 | ||
B:929 [LYS] | A:1 [A] | 3.22 | E:28 [DT] | 95.04 | ||
B:929 [LYS] | A:2 [U] | 4.09 | E:27 [DA] | 95.04 | ||
B:1012 [ASP] | A:1 [A] | 4.69 | E:28 [DT] | 0.0 | ||
B:1097 [LYS] | A:67 [C] | 2.95 | 0.0 | |||
B:1097 [LYS] | A:68 [A] | 4.25 | A:81 [G] | 0.0 | ||
B:1098 [THR] | A:67 [C] | 4.63 | 0.0 | |||
B:1098 [THR] | A:68 [A] | 4.33 | A:81 [G] | 0.0 | ||
B:1099 [GLU] | A:67 [C] | 3.53 | base/AA stacks | 0.0 | ||
B:1100 [VAL] | A:67 [C] | 2.96 | base:BB, base:BB | 0.0 | ||
B:1102 [THR] | A:63 [U] | 4.86 | 0.0 | |||
B:1102 [THR] | A:64 [U] | 2.93 | 0.0 | |||
B:1102 [THR] | A:65 [A] | 4.46 | 0.0 | |||
B:1102 [THR] | A:66 [U] | 4.04 | 0.0 | |||
B:1103 [GLY] | A:51 [A] | 3.21 | base:BB | 0.0 | ||
B:1103 [GLY] | A:63 [U] | 3.32 | 0.0 | |||
B:1103 [GLY] | A:64 [U] | 3.55 | 0.0 | |||
B:1104 [GLY] | A:51 [A] | 3.57 | 0.0 | |||
B:1104 [GLY] | A:63 [U] | 3.17 | 0.0 | |||
B:1105 [PHE] | A:51 [A] | 3.04 | base:BB | base/AA stacks | 0.0 | |
B:1105 [PHE] | A:52 [A] | 3.43 | A:62 [G] | 0.0 | ||
B:1110 [ILE] | A:21 [G] | 4.09 | A:50 [U] | 0.0 | ||
B:1110 [ILE] | A:22 [U] | 2.59 | A:49 [A] | sugar:BB | 0.0 | |
B:1110 [ILE] | A:23 [U] | 3.24 | A:48 [A] | 0.0 | ||
B:1110 [ILE] | A:49 [A] | 4.52 | A:22 [U] | 0.0 | ||
B:1110 [ILE] | A:50 [U] | 4.64 | A:21 [G] | 0.0 | ||
B:1111 [LEU] | A:22 [U] | 4.78 | A:49 [A] | 0.0 | ||
B:1111 [LEU] | A:23 [U] | 3.77 | A:48 [A] | 0.0 | ||
B:1112 [PRO] | A:23 [U] | 3.77 | A:48 [A] | 0.0 | ||
B:1112 [PRO] | A:24 [U] | 3.35 | A:47 [A] | 0.0 | ||
B:1113 [LYS] | A:23 [U] | 4.33 | A:48 [A] | 0.0 | ||
B:1113 [LYS] | A:24 [U] | 3.0 | A:47 [A] | 0.0 | ||
B:1113 [LYS] | A:25 [U] | 4.33 | A:46 [A] | 0.0 | ||
B:1121 [ALA] | A:52 [A] | 4.41 | A:62 [G] | 0.0 | ||
B:1122 [ARG] | A:23 [U] | 2.96 | A:48 [A] | base:SC | 0.0 | |
B:1122 [ARG] | A:49 [A] | 2.99 | A:22 [U] | base:SC | 0.0 | |
B:1122 [ARG] | A:50 [U] | 4.53 | A:21 [G] | 0.0 | ||
B:1122 [ARG] | A:52 [A] | 3.15 | A:62 [G] | 0.0 | ||
B:1123 [LYS] | A:49 [A] | 3.35 | A:22 [U] | 0.0 | ||
B:1123 [LYS] | A:50 [U] | 3.13 | A:21 [G] | 0.0 | ||
B:1123 [LYS] | A:52 [A] | 2.8 | A:62 [G] | 0.0 | ||
B:1123 [LYS] | A:53 [G] | 3.43 | A:61 [C] | 0.0 | ||
B:1124 [LYS] | A:52 [A] | 3.7 | A:62 [G] | 0.0 | ||
B:1124 [LYS] | A:53 [G] | 2.8 | A:61 [C] | 0.0 | ||
B:1126 [TRP] | A:48 [A] | 4.46 | A:23 [U] | 0.0 | ||
B:1126 [TRP] | A:49 [A] | 3.33 | A:22 [U] | 0.0 | ||
B:1130 [LYS] | A:24 [U] | 3.45 | A:47 [A] | 0.0 | ||
B:1131 [TYR] | A:23 [U] | 2.64 | A:48 [A] | sugar:BB | 0.0 | |
B:1131 [TYR] | A:24 [U] | 3.65 | A:47 [A] | 0.0 | ||
B:1132 [GLY] | A:23 [U] | 4.63 | A:48 [A] | 0.0 | ||
B:1132 [GLY] | A:24 [U] | 4.76 | A:47 [A] | 0.0 | ||
B:1134 [PHE] | A:51 [A] | 3.79 | 0.0 | |||
B:1168 [ILE] | A:51 [A] | 4.88 | 0.0 | |||
B:1169 [MET] | A:52 [A] | 3.53 | A:62 [G] | 0.0 | ||
B:1349 [HIS] | A:68 [A] | 2.85 | A:81 [G] | sugar:SC | 0.0 | |
B:1349 [HIS] | A:69 [A] | 3.5 | A:80 [U] | 0.0 | ||
B:1350 [GLN] | A:68 [A] | 3.01 | A:81 [G] | 0.0 | ||
B:1351 [SER] | A:68 [A] | 3.85 | A:81 [G] | 0.0 | ||
B:1356 [TYR] | A:68 [A] | 3.92 | A:81 [G] | 0.0 | ||
B:1356 [TYR] | A:81 [G] | 3.31 | A:68 [A] | base/AA stacks | 0.0 | |
B:1357 [GLU] | A:68 [A] | 4.61 | A:81 [G] | 0.0 | ||
B:1357 [GLU] | A:81 [G] | 2.96 | A:68 [A] | base:BB | 0.0 | |
B:1358 [THR] | A:68 [A] | 3.5 | A:81 [G] | 0.0 | ||
B:1358 [THR] | A:69 [A] | 3.88 | A:80 [U] | 0.0 | ||
B:1358 [THR] | A:81 [G] | 4.91 | A:68 [A] | 0.0 |
*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)
Properties of this interface
Interolog group ID | Structure ID |
Structure description |
UniProt ID |
ECOD label(s) |
RFAM label(s) |
Is ribosome? | RCSB PDB link |
---|---|---|---|---|---|---|---|
group125 | 5FQ5_B_A | B: Crispr-associated endonuclease cas9/csn1, Streptococcus pyogenes (genetically engineered) A: sgRNA, Synthetic construct (synthetic) | Q99ZW2 | Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 | ✘ |
Interologs
Total number of interologs for this interface: 8