Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 5FQ5_B
|
5FQ5_A
|
5X2H_A
|
5X2H_B
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| B:1112 [PRO] | A:23 [U] | A:794 [LYS] | B:23 [U] | ✔ |
| B:1112 [PRO] | A:24 [U] | A:794 [LYS] | B:24 [U] | ✔ |
| B:69 [ARG] | A:51 [A] | A:55 [ARG] | B:49 [A] | ✔ |
| B:69 [ARG] | A:62 [G] | A:55 [ARG] | B:68 [G] | ✔ |
| B:69 [ARG] | A:63 [U] | A:55 [ARG] | B:69 [C] | ✔ |
| B:447 [ARG] | A:16 [A] | A:233 [LYS] | B:16 [U] | ✔ |
| B:447 [ARG] | A:17 [A] | A:233 [LYS] | B:17 [U] | ✔ |
| B:522 [ASN] | A:4 [A] | A:269 [THR] | B:4 [A] | ✔ |
| B:135 [ILE] | A:45 [U] | A:101 [PRO] | B:43 [U] | ✔ |
| B:135 [ILE] | A:46 [A] | A:101 [PRO] | B:44 [A] | ✔ |
| B:61 [ALA] | A:63 [U] | A:47 [PRO] | B:69 [C] | ✔ |
| B:166 [GLY] | A:18 [A] | A:130 [GLY] | B:18 [G] | ✔ |
| B:166 [GLY] | A:19 [A] | A:130 [GLY] | B:19 [G] | ✔ |
| B:730 [SER] | A:11 [U] | A:449 [ASN] | B:11 [U] | ✔ |
| B:730 [SER] | A:12 [U] | A:449 [ASN] | B:12 [G] | ✔ |
| B:163 [LYS] | A:19 [A] | A:127 [LYS] | B:19 [G] | ✔ |
| B:163 [LYS] | A:47 [A] | A:127 [LYS] | B:45 [A] | ✔ |
| B:163 [LYS] | A:48 [A] | A:127 [LYS] | B:46 [A] | ✔ |
| B:742 [LYS] | A:67 [C] | A:461 [LYS] | B:78 [A] | ✔ |
| B:136 [TYR] | A:45 [U] | A:102 [TYR] | B:43 [U] | ✔ |
| B:136 [TYR] | A:46 [A] | A:102 [TYR] | B:44 [A] | ✔ |
| B:125 [GLU] | A:26 [A] | A:96 [GLY] | B:26 [A] | ✔ |
| B:495 [MET] | A:14 [U] | A:242 [LEU] | B:14 [G] | ✔ |
| B:62 [THR] | A:63 [U] | A:48 [ARG] | B:69 [C] | ✔ |
| B:62 [THR] | A:64 [U] | A:48 [ARG] | B:70 [G] | ✔ |
| B:734 [LYS] | A:66 [U] | A:453 [LEU] | B:72 [G] | ✔ |
| B:453 [GLY] | A:15 [A] | A:237 [LYS] | B:15 [C] | ✔ |
| B:453 [GLY] | A:16 [A] | A:237 [LYS] | B:16 [U] | ✔ |
| B:74 [ARG] | A:16 [A] | A:60 [ARG] | B:16 [U] | ✔ |
| B:74 [ARG] | A:17 [A] | A:60 [ARG] | B:17 [U] | ✔ |
| B:74 [ARG] | A:59 [U] | A:60 [ARG] | B:65 [U] | ✔ |
| B:74 [ARG] | A:60 [C] | A:60 [ARG] | B:66 [C] | ✔ |
| B:63 [ARG] | A:13 [G] | A:49 [ARG] | B:13 [C] | ✔ |
| B:63 [ARG] | A:14 [U] | A:49 [ARG] | B:14 [G] | ✔ |
| B:63 [ARG] | A:15 [A] | A:49 [ARG] | B:15 [C] | ✔ |
| B:105 [PHE] | A:24 [U] | A:88 [GLU] | B:24 [U] | ✔ |
| B:105 [PHE] | A:25 [U] | A:88 [GLU] | B:25 [U] | ✔ |
| B:731 [PRO] | A:12 [U] | A:450 [PRO] | B:12 [G] | ✔ |
| B:731 [PRO] | A:13 [G] | A:450 [PRO] | B:13 [C] | ✔ |
| B:66 [ARG] | A:14 [U] | A:52 [ARG] | B:14 [G] | ✔ |
| B:66 [ARG] | A:15 [A] | A:52 [ARG] | B:15 [C] | ✔ |
| B:66 [ARG] | A:62 [G] | A:52 [ARG] | B:68 [G] | ✔ |
| B:929 [LYS] | A:1 [A] | A:645 [ARG] | B:1 [G] | ✔ |
| B:929 [LYS] | A:2 [U] | A:645 [ARG] | B:2 [G] | ✔ |
| B:75 [ARG] | A:49 [A] | A:61 [ARG] | B:47 [A] | ✔ |
| B:75 [ARG] | A:50 [U] | A:61 [ARG] | B:48 [U] | ✔ |
| B:662 [LEU] | A:4 [A] | A:396 [ILE] | B:4 [A] | ✔ |
| B:160 [HIS] | A:45 [U] | A:124 [HIS] | B:43 [U] | ✔ |
| B:160 [HIS] | A:46 [A] | A:124 [HIS] | B:44 [A] | ✔ |
| B:160 [HIS] | A:47 [A] | A:124 [HIS] | B:45 [A] | ✔ |
| B:1132 [GLY] | A:23 [U] | A:823 [LYS] | B:23 [U] | ✔ |
| B:115 [ARG] | A:25 [U] | A:90 [LEU] | B:25 [U] | ✔ |
| B:115 [ARG] | A:26 [A] | A:90 [LEU] | B:26 [A] | ✔ |
| B:129 [HIS] | A:27 [G] | A:98 [LEU] | B:27 [G] | ✔ |
| B:401 [LYS] | A:44 [U] | A:184 [VAL] | B:42 [C] | ✔ |
| B:401 [LYS] | A:45 [U] | A:184 [VAL] | B:43 [U] | ✔ |
| B:405 [PHE] | A:19 [A] | A:190 [SER] | B:19 [G] | ✔ |
| B:450 [TYR] | A:15 [A] | A:236 [LEU] | B:15 [C] | ✔ |
| B:450 [TYR] | A:16 [A] | A:236 [LEU] | B:16 [U] | ✔ |
| B:106 [LEU] | A:25 [U] | A:89 [SER] | B:25 [U] | ✔ |
| B:1098 [THR] | A:67 [C] | A:779 [GLU] | B:78 [A] | ✔ |
| B:83 [GLN] | A:48 [A] | A:69 [LYS] | B:46 [A] | ✔ |
| B:70 [ARG] | A:15 [A] | A:56 [LYS] | B:15 [C] | ✔ |
| B:70 [ARG] | A:16 [A] | A:56 [LYS] | B:16 [U] | ✔ |
| B:70 [ARG] | A:60 [C] | A:56 [LYS] | B:66 [C] | ✔ |
| B:70 [ARG] | A:61 [C] | A:56 [LYS] | B:67 [U] | ✔ |
| B:693 [PHE] | A:3 [A] | A:414 [TYR] | B:3 [A] | ✔ |
| B:693 [PHE] | A:4 [A] | A:414 [TYR] | B:4 [A] | ✔ |
| B:1111 [LEU] | A:23 [U] | A:793 [ARG] | B:23 [U] | ✔ |
| B:76 [LYS] | A:49 [A] | A:62 [LYS] | B:47 [A] | ✔ |
| B:404 [THR] | A:20 [A] | A:187 [LYS] | B:20 [C] | ✔ |
| B:156 [LEU] | A:47 [A] | A:120 [ARG] | B:45 [A] | ✔ |
| B:1100 [VAL] | A:67 [C] | A:781 [LYS] | B:78 [A] | ✔ |
| B:58 [THR] | A:13 [G] | A:44 [LEU] | B:13 [C] | ✔ |
| B:58 [THR] | A:64 [U] | A:44 [LEU] | B:70 [G] | ✔ |
| B:402 [GLN] | A:20 [A] | A:185 [ARG] | B:20 [C] | ✔ |
| B:402 [GLN] | A:45 [U] | A:185 [ARG] | B:43 [U] | ✔ |
| B:60 [GLU] | A:13 [G] | A:46 [LEU] | B:13 [C] | ✔ |
| B:60 [GLU] | A:14 [U] | A:46 [LEU] | B:14 [G] | ✔ |
| B:448 [ILE] | A:16 [A] | A:234 [ARG] | B:16 [U] | ✔ |
| B:448 [ILE] | A:17 [A] | A:234 [ARG] | B:17 [U] | ✔ |
| B:101 [LEU] | A:47 [A] | A:85 [SER] | B:45 [A] | ✔ |
| B:101 [LEU] | A:48 [A] | A:85 [SER] | B:46 [A] | ✔ |
| B:65 [LYS] | A:51 [A] | A:51 [ALA] | B:49 [A] | ✔ |
| B:65 [LYS] | A:63 [U] | A:51 [ALA] | B:69 [C] | ✔ |
| B:660 [GLY] | A:5 [C] | A:394 [LEU] | B:5 [A] | ✔ |
| B:400 [ARG] | A:44 [U] | A:183 [ASN] | B:42 [C] | ✔ |
| B:1131 [TYR] | A:23 [U] | A:822 [GLY] | B:23 [U] | ✔ |
| B:359 [TYR] | A:43 [G] | A:180 [GLU] | B:41 [A] | ✔ |
| B:661 [ARG] | A:4 [A] | A:395 [ASN] | B:4 [A] | ✔ |
| B:661 [ARG] | A:5 [C] | A:395 [ASN] | B:5 [A] | ✔ |
| B:72 [TYR] | A:50 [U] | A:58 [LEU] | B:48 [U] | ✔ |
| B:72 [TYR] | A:51 [A] | A:58 [LEU] | B:49 [A] | ✔ |
| B:738 [LEU] | A:66 [U] | A:457 [LYS] | B:72 [G] | ✔ |
| B:159 [ALA] | A:47 [A] | A:123 [LEU] | B:45 [A] | ✔ |
| B:729 [GLY] | A:12 [U] | A:448 [THR] | B:12 [G] | ✔ |
| B:518 [PHE] | A:4 [A] | A:265 [PHE] | B:4 [A] | ✔ |
| B:406 [ASP] | A:19 [A] | A:191 [TYR] | B:19 [G] | ✔ |
| B:68 [ALA] | A:51 [A] | A:54 [ALA] | B:49 [A] | ✔ |
| B:165 [ARG] | A:17 [A] | A:129 [ARG] | B:17 [U] | ✔ |
| B:165 [ARG] | A:18 [A] | A:129 [ARG] | B:18 [G] | ✔ |
| B:165 [ARG] | A:19 [A] | A:129 [ARG] | B:19 [G] | ✔ |
| B:79 [ILE] | A:48 [A] | A:65 [LEU] | B:46 [A] | ✔ |
| B:510 [LYS] | A:6 [U] | A:257 [LYS] | B:6 [U] | ✔ |
| B:403 [ARG] | A:20 [A] | A:186 [ASN] | B:20 [C] | ✔ |
| B:403 [ARG] | A:21 [G] | A:186 [ASN] | B:21 [G] | ✔ |
| B:1110 [ILE] | A:21 [G] | A:792 [PHE] | B:21 [G] | ✔ |
| B:1110 [ILE] | A:22 [U] | A:792 [PHE] | B:22 [U] | ✔ |
| B:1110 [ILE] | A:23 [U] | A:792 [PHE] | B:23 [U] | ✔ |
| B:1110 [ILE] | A:49 [A] | A:792 [PHE] | B:47 [A] | ✔ |
| B:1110 [ILE] | A:50 [U] | A:792 [PHE] | B:48 [U] | ✔ |
| B:78 [ARG] | A:18 [A] | A:64 [ARG] | B:18 [G] | ✔ |
| B:167 [HIS] | A:18 [A] | A:131 [TYR] | B:18 [G] | ✔ |
| B:168 [PHE] | A:17 [A] | A:132 [ASP] | B:17 [U] | ✔ |
| B:519 [THR] | A:5 [C] | A:266 [VAL] | B:5 [A] | ✔ |
| B:735 [LYS] | A:66 [U] | A:454 [ARG] | B:72 [G] | ✔ |
| B:134 [THR] | A:45 [U] | A:100 [SER] | B:43 [U] | ✔ |
| B:1169 [MET] | A:52 [A] | A:852 [MET] | B:50 [A] | ✔ |
| B:1104 [GLY] | A:51 [A] | A:786 [ALA] | B:49 [A] | ✔ |
| B:1104 [GLY] | A:63 [U] | A:786 [ALA] | B:69 [C] | ✔ |
| B:71 [ARG] | A:17 [A] | A:57 [ARG] | B:17 [U] | ✔ |
| B:71 [ARG] | A:18 [A] | A:57 [ARG] | B:18 [G] | ✔ |
| B:449 [PRO] | A:15 [A] | A:235 [ALA] | B:15 [C] | ✔ |
| B:449 [PRO] | A:16 [A] | A:235 [ALA] | B:16 [U] | ✔ |
| B:59 [ALA] | A:13 [G] | A:45 [ALA] | B:13 [C] | ✔ |
| B:59 [ALA] | A:14 [U] | A:45 [ALA] | B:14 [G] | ✔ |
| B:59 [ALA] | A:64 [U] | A:45 [ALA] | B:70 [G] | ✔ |
| B:1103 [GLY] | A:51 [A] | A:785 [GLY] | B:49 [A] | ✔ |
| B:1103 [GLY] | A:63 [U] | A:785 [GLY] | B:69 [C] | ✔ |
| B:1103 [GLY] | A:64 [U] | A:785 [GLY] | B:70 [G] | ✔ |
| B:164 [PHE] | A:19 [A] | A:128 [ARG] | B:19 [G] | ✔ |
| B:164 [PHE] | A:20 [A] | A:128 [ARG] | B:20 [C] | ✔ |
| B:164 [PHE] | A:47 [A] | A:128 [ARG] | B:45 [A] | ✔ |
| B:67 [THR] | A:15 [A] | A:53 [SER] | B:15 [C] | ✔ |
| B:67 [THR] | A:16 [A] | A:53 [SER] | B:16 [U] | ✔ |
| B:1105 [PHE] | A:51 [A] | A:787 [LEU] | B:49 [A] | ✔ |
| B:1105 [PHE] | A:52 [A] | A:787 [LEU] | B:50 [A] | ✔ |
| B:1097 [LYS] | A:67 [C] | A:778 [PRO] | B:78 [A] | ✔ |
| B:1102 [THR] | A:63 [U] | A:784 [SER] | B:69 [C] | ✔ |
| B:1102 [THR] | A:64 [U] | A:784 [SER] | B:70 [G] | ✔ |
| B:166 [GLY] | A:17 [A] | A:130 [GLY] | B:17 [U] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:163 [LYS] | A:49 [A] | A:127 [LYS] | B:47 [A] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:742 [LYS] | A:66 [U] | A:461 [LYS] | B:72 [G] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:81 [TYR] | A:59 [U] | A:67 [HIS] | B:65 [U] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:495 [MET] | A:13 [G] | A:242 [LEU] | B:13 [C] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:57 [GLU] | A:64 [U] | A:43 [SER] | B:70 [G] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:57 [GLU] | A:65 [A] | A:43 [SER] | B:71 [G] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:105 [PHE] | A:23 [U] | A:88 [GLU] | B:23 [U] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:105 [PHE] | A:47 [A] | A:88 [GLU] | B:45 [A] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:105 [PHE] | A:48 [A] | A:88 [GLU] | B:46 [A] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:1132 [GLY] | A:24 [U] | A:823 [LYS] | B:24 [U] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:115 [ARG] | A:27 [G] | A:90 [LEU] | B:27 [G] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:129 [HIS] | A:26 [A] | A:98 [LEU] | B:26 [A] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:129 [HIS] | A:45 [U] | A:98 [LEU] | B:43 [U] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:401 [LYS] | A:21 [G] | A:184 [VAL] | B:21 [G] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:405 [PHE] | A:20 [A] | A:190 [SER] | B:20 [C] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:106 [LEU] | A:24 [U] | A:89 [SER] | B:24 [U] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:70 [ARG] | A:14 [U] | A:56 [LYS] | B:14 [G] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:1111 [LEU] | A:22 [U] | A:793 [ARG] | B:22 [U] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:76 [LYS] | A:48 [A] | A:62 [LYS] | B:46 [A] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:404 [THR] | A:19 [A] | A:187 [LYS] | B:19 [G] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:58 [THR] | A:12 [U] | A:44 [LEU] | B:12 [G] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:402 [GLN] | A:44 [U] | A:185 [ARG] | B:42 [C] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:77 [ASN] | A:59 [U] | A:63 [ALA] | B:65 [U] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:1130 [LYS] | A:24 [U] | A:821 [ASN] | B:24 [U] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:448 [ILE] | A:60 [C] | A:234 [ARG] | B:66 [C] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:1131 [TYR] | A:24 [U] | A:822 [GLY] | B:24 [U] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:328 [HIS] | A:43 [G] | A:174 [PHE] | B:41 [A] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:328 [HIS] | A:44 [U] | A:174 [PHE] | B:42 [C] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:359 [TYR] | A:44 [U] | A:180 [GLU] | B:42 [C] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:661 [ARG] | A:3 [A] | A:395 [ASN] | B:3 [A] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:72 [TYR] | A:20 [A] | A:58 [LEU] | B:20 [C] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:72 [TYR] | A:21 [G] | A:58 [LEU] | B:21 [G] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:738 [LEU] | A:67 [C] | A:457 [LYS] | B:78 [A] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:729 [GLY] | A:11 [U] | A:448 [THR] | B:11 [U] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:510 [LYS] | A:5 [C] | A:257 [LYS] | B:5 [A] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:403 [ARG] | A:45 [U] | A:186 [ASN] | B:43 [U] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:403 [ARG] | A:46 [A] | A:186 [ASN] | B:44 [A] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:403 [ARG] | A:47 [A] | A:186 [ASN] | B:45 [A] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:494 [ARG] | A:14 [U] | A:241 [HIS] | B:14 [G] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:325 [TYR] | A:43 [G] | A:171 [PHE] | B:41 [A] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:325 [TYR] | A:44 [U] | A:171 [PHE] | B:42 [C] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:167 [HIS] | A:17 [A] | A:131 [TYR] | B:17 [U] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:168 [PHE] | A:18 [A] | A:132 [ASP] | B:18 [G] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:1099 [GLU] | A:67 [C] | A:780 [ARG] | B:78 [A] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:134 [THR] | A:44 [U] | A:100 [SER] | B:42 [C] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:116 [HIS] | A:26 [A] | A:91 [ALA] | B:26 [A] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:116 [HIS] | A:27 [G] | A:91 [ALA] | B:27 [G] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:1102 [THR] | A:65 [A] | A:784 [SER] | B:71 [G] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:1102 [THR] | A:66 [U] | A:784 [SER] | B:72 [G] | ❌ 5X2H_A_B |
| B:164 [PHE] | A:46 [A] | A:128 [ARG] | B:44 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:164 [PHE] | A:18 [A] | A:128 [ARG] | B:18 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:325 [TYR] | A:45 [U] | A:171 [PHE] | B:43 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:400 [ARG] | A:45 [U] | A:183 [ASN] | B:43 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:402 [GLN] | A:19 [A] | A:185 [ARG] | B:19 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:402 [GLN] | A:46 [A] | A:185 [ARG] | B:44 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:403 [ARG] | A:19 [A] | A:186 [ASN] | B:19 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:404 [THR] | A:21 [G] | A:187 [LYS] | B:21 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:404 [THR] | A:44 [U] | A:187 [LYS] | B:42 [C] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:404 [THR] | A:45 [U] | A:187 [LYS] | B:43 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:406 [ASP] | A:18 [A] | A:191 [TYR] | B:18 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:448 [ILE] | A:59 [U] | A:234 [ARG] | B:65 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:448 [ILE] | A:58 [G] | A:234 [ARG] | B:64 [C] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:450 [TYR] | A:14 [U] | A:236 [LEU] | B:14 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:453 [GLY] | A:60 [C] | A:237 [LYS] | B:66 [C] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:453 [GLY] | A:61 [C] | A:237 [LYS] | B:67 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:510 [LYS] | A:7 [C] | A:257 [LYS] | B:7 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:518 [PHE] | A:5 [C] | A:265 [PHE] | B:5 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:519 [THR] | A:6 [U] | A:266 [VAL] | B:6 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:522 [ASN] | A:5 [C] | A:269 [THR] | B:5 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:660 [GLY] | A:6 [U] | A:394 [LEU] | B:6 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:662 [LEU] | A:5 [C] | A:396 [ILE] | B:5 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:57 [GLU] | A:12 [U] | A:43 [SER] | B:12 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:57 [GLU] | A:13 [G] | A:43 [SER] | B:13 [C] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:58 [THR] | A:65 [A] | A:44 [LEU] | B:71 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:729 [GLY] | A:13 [G] | A:448 [THR] | B:13 [C] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:730 [SER] | A:13 [G] | A:449 [ASN] | B:13 [C] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:731 [PRO] | A:64 [U] | A:450 [PRO] | B:70 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:731 [PRO] | A:65 [A] | A:450 [PRO] | B:71 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:734 [LYS] | A:65 [A] | A:453 [LEU] | B:71 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:735 [LYS] | A:65 [A] | A:454 [ARG] | B:71 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:62 [THR] | A:62 [G] | A:48 [ARG] | B:68 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:62 [THR] | A:14 [U] | A:48 [ARG] | B:14 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:66 [ARG] | A:61 [C] | A:52 [ARG] | B:67 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:67 [THR] | A:17 [A] | A:53 [SER] | B:17 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:71 [ARG] | A:19 [A] | A:57 [ARG] | B:19 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:76 [LYS] | A:50 [U] | A:62 [LYS] | B:48 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:77 [ASN] | A:58 [G] | A:63 [ALA] | B:64 [C] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:78 [ARG] | A:17 [A] | A:64 [ARG] | B:17 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:81 [TYR] | A:58 [G] | A:67 [HIS] | B:64 [C] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:83 [GLN] | A:47 [A] | A:69 [LYS] | B:45 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:1130 [LYS] | A:50 [U] | A:821 [ASN] | B:48 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:1130 [LYS] | A:52 [A] | A:821 [ASN] | B:50 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:1130 [LYS] | A:49 [A] | A:821 [ASN] | B:47 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:1130 [LYS] | A:53 [G] | A:821 [ASN] | B:51 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:1130 [LYS] | A:51 [A] | A:821 [ASN] | B:49 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:1132 [GLY] | A:50 [U] | A:823 [LYS] | B:48 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:1132 [GLY] | A:49 [A] | A:823 [LYS] | B:47 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:115 [ARG] | A:47 [A] | A:90 [LEU] | B:45 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:115 [ARG] | A:46 [A] | A:90 [LEU] | B:44 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:116 [HIS] | A:47 [A] | A:91 [ALA] | B:45 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:125 [GLU] | A:27 [G] | A:96 [GLY] | B:27 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:129 [HIS] | A:46 [A] | A:98 [LEU] | B:44 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:694 [MET] | A:3 [A] | A:415 [ASP] | B:3 [A] | ❌ 5X2H_A:415 no longer at interface |
| B:721 [HIS] | A:65 [A] | A:438 [PHE] | B:71 [G] | ❌ 5X2H_A:438 no longer at interface |
| B:721 [HIS] | A:66 [U] | A:438 [PHE] | B:72 [G] | ❌ 5X2H_A:438 no longer at interface |
| B:1168 [ILE] | A:51 [A] | A:851 [THR] | B:49 [A] | ❌ 5X2H_A:851 no longer at interface |
| B:1121 [ALA] | A:52 [A] | A:812 [LEU] | B:50 [A] | ❌ 5X2H_A:812 no longer at interface |
| B:588 [ASN] | A:5 [C] | A:324 [GLU] | B:5 [A] | ❌ 5X2H_A:324 no longer at interface |
| B:588 [ASN] | A:6 [U] | A:324 [GLU] | B:6 [U] | ❌ 5X2H_A:324 no longer at interface |
| B:336 [LYS] | A:43 [G] | A:179 [LYS] | B:41 [A] | ❌ 5X2H_A:179 no longer at interface |
| B:589 [ALA] | A:5 [C] | A:325 [LYS] | B:5 [A] | ❌ 5X2H_A:325 no longer at interface |
| B:589 [ALA] | A:6 [U] | A:325 [LYS] | B:6 [U] | ❌ 5X2H_A:325 no longer at interface |
| B:491 [PHE] | A:14 [U] | A:238 [ASP] | B:14 [G] | ❌ 5X2H_A:238 no longer at interface |
| B:515 [TYR] | A:4 [A] | A:262 [ALA] | B:4 [A] | ❌ 5X2H_A:262 no longer at interface |
| B:515 [TYR] | A:5 [C] | A:262 [ALA] | B:5 [A] | ❌ 5X2H_A:262 no longer at interface |
| B:332 [LEU] | A:43 [G] | A:176 [GLU] | B:41 [A] | ❌ 5X2H_A:176 no longer at interface |
| B:407 [ASN] | A:18 [A] | A:192 [GLU] | B:18 [G] | ❌ 5X2H_A:192 no longer at interface |
| B:407 [ASN] | A:19 [A] | A:192 [GLU] | B:19 [G] | ❌ 5X2H_A:192 no longer at interface |
| B:407 [ASN] | A:20 [A] | A:192 [GLU] | B:20 [C] | ❌ 5X2H_A:192 no longer at interface |
| B:324 [ARG] | A:44 [U] | A:170 [TYR] | B:42 [C] | ❌ 5X2H_A:170 no longer at interface |
| B:446 [PHE] | A:17 [A] | A:232 [TYR] | B:17 [U] | ❌ 5X2H_A:232 no longer at interface |
| B:446 [PHE] | A:59 [U] | A:232 [TYR] | B:65 [U] | ❌ 5X2H_A:232 no longer at interface |
| B:410 [ILE] | A:18 [A] | A:195 [ILE] | B:18 [G] | ❌ 5X2H_A:195 no longer at interface |
| B:1126 [TRP] | A:48 [A] | A:817 [ILE] | B:46 [A] | ❌ 5X2H_A:817 no longer at interface |
| B:1126 [TRP] | A:49 [A] | A:817 [ILE] | B:47 [A] | ❌ 5X2H_A:817 no longer at interface |
| B:1113 [LYS] | A:23 [U] | A:795 [GLU] | B:23 [U] | ❌ 5X2H_A:795 no longer at interface |
| B:1113 [LYS] | A:24 [U] | A:795 [GLU] | B:24 [U] | ❌ 5X2H_A:795 no longer at interface |
| B:1113 [LYS] | A:25 [U] | A:795 [GLU] | B:25 [U] | ❌ 5X2H_A:795 no longer at interface |
| B:155 [TYR] | A:48 [A] | A:119 [ALA] | B:46 [A] | ❌ 5X2H_A:119 no longer at interface |
| B:1122 [ARG] | A:23 [U] | A:813 [GLU] | B:23 [U] | ❌ 5X2H_A:813 no longer at interface |
| B:1122 [ARG] | A:49 [A] | A:813 [GLU] | B:47 [A] | ❌ 5X2H_A:813 no longer at interface |
| B:1122 [ARG] | A:50 [U] | A:813 [GLU] | B:48 [U] | ❌ 5X2H_A:813 no longer at interface |
| B:1122 [ARG] | A:52 [A] | A:813 [GLU] | B:50 [A] | ❌ 5X2H_A:813 no longer at interface |
| B:102 [GLU] | A:47 [A] | A:86 [PHE] | B:45 [A] | ❌ 5X2H_A:86 no longer at interface |
| B:102 [GLU] | A:48 [A] | A:86 [PHE] | B:46 [A] | ❌ 5X2H_A:86 no longer at interface |
| B:102 [GLU] | A:49 [A] | A:86 [PHE] | B:47 [A] | ❌ 5X2H_A:86 no longer at interface |
| B:55 [SER] | A:65 [A] | A:42 [GLU] | B:71 [G] | ❌ 5X2H_A:42 no longer at interface |
| B:73 [THR] | A:59 [U] | A:59 [ALA] | B:65 [U] | ❌ 5X2H_A:59 no longer at interface |
| B:73 [THR] | A:60 [C] | A:59 [ALA] | B:66 [C] | ❌ 5X2H_A:59 no longer at interface |
| B:73 [THR] | A:61 [C] | A:59 [ALA] | B:67 [U] | ❌ 5X2H_A:59 no longer at interface |
| B:415 [HIS] | A:19 [A] | A:200 [LEU] | B:19 [G] | ❌ 5X2H_A:200 no longer at interface |
| B:1134 [PHE] | A:51 [A] | A:825 [VAL] | B:49 [A] | ❌ 5X2H_A:825 no longer at interface |
| B:1124 [LYS] | A:52 [A] | A:815 [GLY] | B:50 [A] | ❌ 5X2H_A:815 no longer at interface |
| B:1124 [LYS] | A:53 [G] | A:815 [GLY] | B:51 [A] | ❌ 5X2H_A:815 no longer at interface |
| B:408 [GLY] | A:18 [A] | A:193 [ARG] | B:18 [G] | ❌ 5X2H_A:193 no longer at interface |
| B:408 [GLY] | A:19 [A] | A:193 [ARG] | B:19 [G] | ❌ 5X2H_A:193 no longer at interface |
| B:739 [GLN] | A:66 [U] | A:458 [GLU] | B:72 [G] | ❌ 5X2H_A:458 no longer at interface |
| B:739 [GLN] | A:67 [C] | A:458 [GLU] | B:78 [A] | ❌ 5X2H_A:458 no longer at interface |
| B:117 [PRO] | A:26 [A] | A:92 [LYS] | B:26 [A] | ❌ 5X2H_A:92 no longer at interface |
| B:926 [GLN] | A:2 [U] | A:642 [TYR] | B:2 [G] | ❌ 5X2H_A:642 no longer at interface |
| B:725 [ALA] | A:65 [A] | A:444 [LYS] | B:71 [G] | ❌ 5X2H_A:444 no longer at interface |
| B:326 [ASP] | A:44 [U] | A:172 [GLN] | B:42 [C] | ❌ 5FQ5_B:326 no longer at interface |
| B:331 [ASP] | A:43 [G] | A:175 [LYS] | B:41 [A] | ❌ 5FQ5_B:331 no longer at interface |
| B:398 [LEU] | A:43 [G] | A:181 [PHE] | B:41 [A] | ❌ 5FQ5_B:398 no longer at interface |
| B:398 [LEU] | A:44 [U] | A:181 [PHE] | B:42 [C] | ❌ 5FQ5_B:398 no longer at interface |
| B:399 [LEU] | A:44 [U] | A:182 [THR] | B:42 [C] | ❌ 5FQ5_B:399 no longer at interface |
| B:399 [LEU] | A:45 [U] | A:182 [THR] | B:43 [U] | ❌ 5FQ5_B:399 no longer at interface |
| B:399 [LEU] | A:43 [G] | A:182 [THR] | B:41 [A] | ❌ 5FQ5_B:399 no longer at interface |
| B:409 [SER] | A:19 [A] | A:194 [CYS] | B:19 [G] | ❌ 5FQ5_B:409 no longer at interface |
| B:412 [HIS] | A:18 [A] | A:197 [GLN] | B:18 [G] | ❌ 5FQ5_B:412 no longer at interface |
| B:500 [LYS] | A:3 [A] | A:247 [SER] | B:3 [A] | ❌ 5FQ5_B:500 no longer at interface |
| B:500 [LYS] | A:4 [A] | A:247 [SER] | B:4 [A] | ❌ 5FQ5_B:500 no longer at interface |
| B:501 [ASN] | A:3 [A] | A:248 [PHE] | B:3 [A] | ❌ 5FQ5_B:501 no longer at interface |
| B:523 [GLU] | A:6 [U] | A:270 [ARG] | B:6 [U] | ❌ 5FQ5_B:523 no longer at interface |
| B:523 [GLU] | A:5 [C] | A:270 [ARG] | B:5 [A] | ❌ 5FQ5_B:523 no longer at interface |
| B:526 [LYS] | A:4 [A] | A:273 [ASN] | B:4 [A] | ❌ 5FQ5_B:526 no longer at interface |
| B:51 [LEU] | A:67 [C] | A:30 [ARG] | B:78 [A] | ❌ 5FQ5_B:51 no longer at interface |
| B:592 [GLY] | A:7 [C] | A:328 [TYR] | B:7 [U] | ❌ 5FQ5_B:592 no longer at interface |
| B:708 [ILE] | A:3 [A] | A:425 [VAL] | B:3 [A] | ❌ 5FQ5_B:708 no longer at interface |
| B:708 [ILE] | A:2 [U] | A:425 [VAL] | B:2 [G] | ❌ 5FQ5_B:708 no longer at interface |
| B:720 [LEU] | A:66 [U] | A:437 [ALA] | B:72 [G] | ❌ 5FQ5_B:720 no longer at interface |
| B:722 [GLU] | A:66 [U] | A:439 [ASN] | B:72 [G] | ❌ 5FQ5_B:722 no longer at interface |
| B:933 [GLN] | A:2 [U] | A:649 [ASN] | B:2 [G] | ❌ 5FQ5_B:933 no longer at interface |
| B:933 [GLN] | A:1 [A] | A:649 [ASN] | B:1 [G] | ❌ 5FQ5_B:933 no longer at interface |
| B:1101 [GLN] | A:67 [C] | A:782 [LYS] | B:78 [A] | ❌ 5FQ5_B:1101 no longer at interface |
| B:1101 [GLN] | A:64 [U] | A:782 [LYS] | B:70 [G] | ❌ 5FQ5_B:1101 no longer at interface |
| B:1101 [GLN] | A:65 [A] | A:782 [LYS] | B:71 [G] | ❌ 5FQ5_B:1101 no longer at interface |
| B:1106 [SER] | A:51 [A] | A:788 [HIS] | B:49 [A] | ❌ 5FQ5_B:1106 no longer at interface |
| B:1108 [GLU] | A:63 [U] | A:790 [GLU] | B:69 [C] | ❌ 5FQ5_B:1108 no longer at interface |
| B:1109 [SER] | A:22 [U] | A:791 [THR] | B:22 [U] | ❌ 5FQ5_B:1109 no longer at interface |
| B:1129 [LYS] | A:51 [A] | A:820 [VAL] | B:49 [A] | ❌ 5FQ5_B:1129 no longer at interface |
| B:1129 [LYS] | A:52 [A] | A:820 [VAL] | B:50 [A] | ❌ 5FQ5_B:1129 no longer at interface |
| B:98 [PHE] | A:48 [A] | A:83 [TYR] | B:46 [A] | ❌ 5FQ5_B:98 no longer at interface |
| B:1172 [SER] | A:52 [A] | A:855 [ALA] | B:50 [A] | ❌ 5FQ5_B:1172 no longer at interface |
| B:1173 [SER] | A:52 [A] | A:856 [LEU] | B:50 [A] | ❌ 5FQ5_B:1173 no longer at interface |
| B:119 [PHE] | A:47 [A] | A:94 [TYR] | B:45 [A] | ❌ 5FQ5_B:119 no longer at interface |
| B:119 [PHE] | A:26 [A] | A:94 [TYR] | B:26 [A] | ❌ 5FQ5_B:119 no longer at interface |
| B:119 [PHE] | A:46 [A] | A:94 [TYR] | B:44 [A] | ❌ 5FQ5_B:119 no longer at interface |
| B:120 [GLY] | A:26 [A] | A:95 [LYS] | B:26 [A] | ❌ 5FQ5_B:120 no longer at interface |
| B:128 [TYR] | A:27 [G] | A:97 [SER] | B:27 [G] | ❌ 5FQ5_B:128 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 | 0.75 | 3.12 | 0.15 | 0.76 | 0.47 | 0.66 | 0.78 | 0.55 | 0.41 | 0.29 | 0.46 |
Other pairs involving 5FQ5_B_A or 5X2H_A_B
Total number of entries: 15