RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group125 > 5FW1_B_A

Interface analysis

mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Chain
Chain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity
Electrostatics (surface only)
Conservation*

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show as licorice
show Accessibility
Rim - Core

Contacts -

5FW1_B
5FW1_A
Distance
Base Pair
Hbond nuc:res
Base Stacking
Residue conservation
B:33 [LYS] A:81 [G] 2.69 A:68 [A] base:BB 74.44
B:34 [VAL] A:81 [G] 4.22 A:68 [A] 7.36
B:35 [LEU] A:69 [A] 4.75 A:80 [U] 60.67
B:35 [LEU] A:81 [G] 3.54 A:68 [A] 60.67
B:55 [SER] A:65 [A] 4.17 58.24
B:56 [GLY] A:64 [U] 4.89 89.79
B:56 [GLY] A:65 [A] 3.35 89.79
B:57 [GLU] A:64 [U] 2.66 sugar:BB 44.2
B:57 [GLU] A:65 [A] 2.75 44.2
B:58 [THR] A:12 [U] 3.73 C:17 [DA] 88.98
B:58 [THR] A:13 [G] 3.46 C:16 [DC] 88.98
B:58 [THR] A:64 [U] 3.43 88.98
B:59 [ALA] A:12 [U] 4.98 C:17 [DA] 98.77
B:59 [ALA] A:13 [G] 2.62 C:16 [DC] 98.77
B:59 [ALA] A:14 [U] 3.54 C:15 [DA] 98.77
B:59 [ALA] A:64 [U] 3.49 98.77
B:60 [GLU] A:13 [G] 4.27 C:16 [DC] 72.77
B:60 [GLU] A:14 [U] 4.66 C:15 [DA] 72.77
B:61 [ALA] A:63 [U] 4.42 54.85
B:62 [THR] A:63 [U] 2.76 sugar:SC 89.56
B:62 [THR] A:64 [U] 2.96 sugar:SC 89.56
B:63 [ARG] A:13 [G] 4.53 C:16 [DC] 98.97
B:63 [ARG] A:14 [U] 3.04 C:15 [DA] base/AA stacks 98.97
B:63 [ARG] A:15 [A] 3.28 C:14 [DT] 98.97
B:65 [LYS] A:51 [A] 4.97 39.95
B:65 [LYS] A:63 [U] 3.36 39.95
B:66 [ARG] A:14 [U] 3.34 C:15 [DA] 98.97
B:66 [ARG] A:15 [A] 2.71 C:14 [DT] 98.97
B:66 [ARG] A:62 [G] 3.33 A:52 [A] 98.97
B:66 [ARG] A:63 [U] 4.93 98.97
B:67 [THR] A:15 [A] 3.85 C:14 [DT] 75.99
B:67 [THR] A:16 [A] 3.78 C:13 [DT] 75.99
B:68 [ALA] A:51 [A] 4.76 73.51
B:69 [ARG] A:51 [A] 3.48 98.97
B:69 [ARG] A:62 [G] 3.14 A:52 [A] 98.97
B:69 [ARG] A:63 [U] 2.88 98.97
B:70 [ARG] A:14 [U] 4.52 C:15 [DA] 98.97
B:70 [ARG] A:15 [A] 2.44 C:14 [DT] 98.97
B:70 [ARG] A:16 [A] 2.92 C:13 [DT] 98.97
B:70 [ARG] A:60 [C] 4.61 A:54 [G] 98.97
B:70 [ARG] A:61 [C] 2.64 A:53 [G] 98.97
B:70 [ARG] A:62 [G] 4.91 A:52 [A] 98.97
B:71 [ARG] A:17 [A] 3.46 C:12 [DT] base/AA stacks 96.41
B:71 [ARG] A:18 [A] 2.49 C:11 [DT] 96.41
B:71 [ARG] A:19 [A] 4.38 C:10 [DT] 96.41
B:72 [TYR] A:20 [A] 4.14 C:9 [DT] 43.56
B:72 [TYR] A:21 [G] 4.57 A:50 [U] 43.56
B:72 [TYR] A:50 [U] 3.28 A:21 [G] base/AA stacks 43.56
B:72 [TYR] A:51 [A] 3.48 43.56
B:73 [THR] A:59 [U] 4.0 49.42
B:73 [THR] A:60 [C] 4.28 A:54 [G] 49.42
B:73 [THR] A:61 [C] 4.88 A:53 [G] 49.42
B:74 [ARG] A:16 [A] 2.72 C:13 [DT] 98.8
B:74 [ARG] A:17 [A] 2.87 C:12 [DT] 98.8
B:74 [ARG] A:59 [U] 3.39 98.8
B:74 [ARG] A:60 [C] 3.0 A:54 [G] 98.8
B:75 [ARG] A:50 [U] 3.25 A:21 [G] base:SC, base:SC 89.08
B:76 [LYS] A:48 [A] 4.41 A:23 [U] 72.07
B:76 [LYS] A:49 [A] 3.4 A:22 [U] 72.07
B:77 [ASN] A:59 [U] 2.46 base:SC 51.85
B:78 [ARG] A:17 [A] 4.99 C:12 [DT] 98.92
B:78 [ARG] A:18 [A] 3.15 C:11 [DT] 98.92
B:79 [ILE] A:48 [A] 3.79 A:23 [U] 79.63
B:81 [TYR] A:59 [U] 3.49 57.5
B:83 [GLN] A:48 [A] 4.09 A:23 [U] 68.39
B:100 [ARG] A:47 [A] 4.95 A:24 [U] 95.96
B:101 [LEU] A:47 [A] 2.53 A:24 [U] sugar:BB 82.65
B:101 [LEU] A:48 [A] 4.12 A:23 [U] 82.65
B:102 [GLU] A:47 [A] 4.42 A:24 [U] 48.6
B:102 [GLU] A:48 [A] 3.39 A:23 [U] 48.6
B:104 [SER] A:24 [U] 4.25 A:47 [A] 96.21
B:104 [SER] A:25 [U] 3.27 A:46 [A] sugar:BB 96.21
B:104 [SER] A:47 [A] 2.43 A:24 [U] base:SC, sugar:SC 96.21
B:104 [SER] A:48 [A] 3.76 A:23 [U] 96.21
B:105 [PHE] A:23 [U] 3.45 A:48 [A] 40.76
B:105 [PHE] A:24 [U] 2.69 A:47 [A] sugar:BB base/AA stacks 40.76
B:105 [PHE] A:25 [U] 3.82 A:46 [A] 40.76
B:105 [PHE] A:47 [A] 4.22 A:24 [U] 40.76
B:105 [PHE] A:48 [A] 3.63 A:23 [U] 40.76
B:106 [LEU] A:24 [U] 4.14 A:47 [A] 53.81
B:106 [LEU] A:25 [U] 3.63 A:46 [A] 53.81
B:107 [VAL] A:24 [U] 3.7 A:47 [A] 8.68
B:107 [VAL] A:25 [U] 3.87 A:46 [A] 8.68
B:108 [GLU] A:25 [U] 4.81 A:46 [A] 22.91
B:108 [GLU] A:26 [A] 4.73 A:45 [U] 22.91
B:111 [LYS] A:25 [U] 3.45 A:46 [A] sugar:SC 79.53
B:115 [ARG] A:25 [U] 4.22 A:46 [A] 46.83
B:115 [ARG] A:26 [A] 2.78 A:45 [U] 46.83
B:115 [ARG] A:27 [G] 3.59 46.83
B:116 [HIS] A:26 [A] 3.02 A:45 [U] 45.86
B:116 [HIS] A:27 [G] 2.7 45.86
B:117 [PRO] A:26 [A] 3.61 A:45 [U] 49.49
B:122 [ILE] A:27 [G] 4.3 19.08
B:122 [ILE] A:28 [A] 3.35 19.08
B:123 [VAL] A:28 [A] 4.22 61.68
B:125 [GLU] A:26 [A] 3.75 A:45 [U] 84.2
B:126 [VAL] A:28 [A] 3.15 59.06
B:129 [HIS] A:26 [A] 4.18 A:45 [U] 66.46
B:129 [HIS] A:27 [G] 2.92 66.46
B:129 [HIS] A:45 [U] 4.19 A:26 [A] 66.46
B:133 [PRO] A:27 [G] 4.84 95.35
B:133 [PRO] A:45 [U] 3.52 A:26 [A] 95.35
B:134 [THR] A:44 [U] 3.9 98.97
B:134 [THR] A:45 [U] 3.64 A:26 [A] 98.97
B:135 [ILE] A:45 [U] 3.05 A:26 [A] sugar:BB 96.01
B:135 [ILE] A:46 [A] 3.56 A:25 [U] 96.01
B:136 [TYR] A:46 [A] 4.71 A:25 [U] 82.12
B:155 [TYR] A:48 [A] 4.61 A:23 [U] 94.31
B:156 [LEU] A:47 [A] 4.57 A:24 [U] 94.81
B:159 [ALA] A:47 [A] 4.72 A:24 [U] 91.77
B:160 [HIS] A:45 [U] 4.95 A:26 [A] 87.81
B:160 [HIS] A:46 [A] 3.07 A:25 [U] 87.81
B:160 [HIS] A:47 [A] 4.1 A:24 [U] 87.81
B:163 [LYS] A:19 [A] 4.68 C:10 [DT] 97.33
B:163 [LYS] A:47 [A] 4.59 A:24 [U] 97.33
B:163 [LYS] A:48 [A] 3.03 A:23 [U] 97.33
B:163 [LYS] A:49 [A] 4.8 A:22 [U] 97.33
B:164 [PHE] A:19 [A] 3.3 C:10 [DT] 69.33
B:164 [PHE] A:20 [A] 4.42 C:9 [DT] 69.33
B:164 [PHE] A:47 [A] 3.88 A:24 [U] 69.33
B:165 [ARG] A:17 [A] 3.46 C:12 [DT] 98.97
B:165 [ARG] A:18 [A] 2.9 C:11 [DT] 98.97
B:165 [ARG] A:19 [A] 3.38 C:10 [DT] 98.97
B:166 [GLY] A:17 [A] 4.64 C:12 [DT] 98.85
B:166 [GLY] A:18 [A] 3.03 C:11 [DT] 98.85
B:166 [GLY] A:19 [A] 3.02 C:10 [DT] 98.85
B:167 [HIS] A:17 [A] 4.48 C:12 [DT] 88.14
B:167 [HIS] A:18 [A] 3.74 C:11 [DT] 88.14
B:168 [PHE] A:17 [A] 3.58 C:12 [DT] 98.85
B:168 [PHE] A:18 [A] 4.97 C:11 [DT] 98.85
B:324 [ARG] A:44 [U] 4.33 39.39
B:325 [TYR] A:43 [G] 4.96 89.76
B:325 [TYR] A:44 [U] 3.13 base:BB base/AA stacks 89.76
B:328 [HIS] A:43 [G] 4.97 94.23
B:328 [HIS] A:44 [U] 2.88 base/AA stacks 94.23
B:329 [HIS] A:43 [G] 4.35 62.74
B:329 [HIS] A:44 [U] 3.28 62.74
B:332 [LEU] A:43 [G] 3.89 94.38
B:336 [LYS] A:42 [A] 3.96 96.67
B:336 [LYS] A:43 [G] 3.02 base:SC 96.67
B:340 [ARG] A:40 [C] 3.35 A:29 [G] 63.39
B:340 [ARG] A:41 [A] 2.59 63.39
B:347 [TYR] A:41 [A] 3.89 74.41
B:347 [TYR] A:43 [G] 4.82 74.41
B:348 [LYS] A:39 [G] 4.65 A:30 [C] 41.69
B:351 [PHE] A:42 [A] 3.06 base:BB 92.2
B:351 [PHE] A:43 [G] 2.91 base:BB 92.2
B:352 [PHE] A:40 [C] 4.37 A:29 [G] 55.54
B:352 [PHE] A:41 [A] 3.54 55.54
B:352 [PHE] A:42 [A] 3.33 55.54
B:359 [TYR] A:43 [G] 2.83 sugar:SC 88.19
B:359 [TYR] A:44 [U] 4.33 88.19
B:360 [ALA] A:43 [G] 3.61 48.91
B:363 [ILE] A:43 [G] 3.23 68.27
B:363 [ILE] A:44 [U] 3.75 68.27
B:364 [ASP] A:42 [A] 4.77 59.64
B:364 [ASP] A:43 [G] 3.1 base:SC 59.64
B:365 [GLY] A:22 [U] 3.94 A:49 [A] 40.15
B:366 [GLY] A:22 [U] 4.29 A:49 [A] 36.57
B:400 [ARG] A:44 [U] 3.74 72.36
B:401 [LYS] A:21 [G] 4.87 A:50 [U] 83.31
B:401 [LYS] A:44 [U] 3.44 83.31
B:401 [LYS] A:45 [U] 3.38 A:26 [A] 83.31
B:402 [GLN] A:20 [A] 4.49 C:9 [DT] 82.59
B:402 [GLN] A:44 [U] 2.74 base:SC, sugar:SC 82.59
B:402 [GLN] A:45 [U] 2.71 A:26 [A] 82.59
B:403 [ARG] A:19 [A] 4.61 C:10 [DT] 82.34
B:403 [ARG] A:20 [A] 2.36 C:9 [DT] 82.34
B:403 [ARG] A:21 [G] 4.3 A:50 [U] 82.34
B:403 [ARG] A:45 [U] 2.89 A:26 [A] 82.34
B:403 [ARG] A:46 [A] 2.72 A:25 [U] 82.34
B:403 [ARG] A:47 [A] 4.93 A:24 [U] 82.34
B:404 [THR] A:19 [A] 2.87 C:10 [DT] sugar:BB 73.3
B:404 [THR] A:20 [A] 2.9 C:9 [DT] 73.3
B:405 [PHE] A:19 [A] 2.85 C:10 [DT] 59.28
B:405 [PHE] A:20 [A] 3.82 C:9 [DT] 59.28
B:406 [ASP] A:19 [A] 4.05 C:10 [DT] 54.15
B:407 [ASN] A:19 [A] 3.39 C:10 [DT] 98.97
B:407 [ASN] A:20 [A] 2.96 C:9 [DT] 98.97
B:408 [GLY] A:18 [A] 3.89 C:11 [DT] sugar:BB 71.82
B:408 [GLY] A:19 [A] 3.53 C:10 [DT] 71.82
B:415 [HIS] A:19 [A] 4.71 C:10 [DT] 87.68
B:446 [PHE] A:59 [U] 3.47 96.03
B:447 [ARG] A:16 [A] 3.2 C:13 [DT] base:SC 90.12
B:447 [ARG] A:17 [A] 3.29 C:12 [DT] sugar:SC, sugar:SC 90.12
B:448 [ILE] A:16 [A] 2.66 C:13 [DT] sugar:BB 91.29
B:448 [ILE] A:17 [A] 2.99 C:12 [DT] 91.29
B:448 [ILE] A:60 [C] 4.64 A:54 [G] 91.29
B:449 [PRO] A:15 [A] 4.33 C:14 [DT] 98.67
B:449 [PRO] A:16 [A] 3.95 C:13 [DT] 98.67
B:450 [TYR] A:15 [A] 2.59 C:14 [DT] sugar:BB 97.73
B:450 [TYR] A:16 [A] 3.26 C:13 [DT] 97.73
B:451 [TYR] A:15 [A] 4.62 C:14 [DT] 95.78
B:452 [VAL] A:15 [A] 4.98 C:14 [DT] 94.26
B:453 [GLY] A:15 [A] 3.55 C:14 [DT] 98.85
B:453 [GLY] A:16 [A] 3.97 C:13 [DT] 98.85
B:454 [PRO] A:15 [A] 3.21 C:14 [DT] 97.38
B:454 [PRO] A:16 [A] 3.39 C:13 [DT] 97.38
B:454 [PRO] A:60 [C] 3.72 A:54 [G] 97.38
B:454 [PRO] A:61 [C] 3.92 A:53 [G] 97.38
B:455 [LEU] A:58 [G] 2.72 A:55 [C] sugar:BB 89.46
B:455 [LEU] A:59 [U] 3.27 89.46
B:455 [LEU] A:60 [C] 2.78 A:54 [G] 89.46
B:456 [ALA] A:58 [G] 3.11 A:55 [C] 81.8
B:456 [ALA] A:60 [C] 3.85 A:54 [G] 81.8
B:457 [ARG] A:57 [A] 2.8 44.44
B:457 [ARG] A:58 [G] 3.12 A:55 [C] sugar:BB 44.44
B:459 [ASN] A:56 [U] 2.81 base:SC 45.21
B:459 [ASN] A:58 [G] 4.66 A:55 [C] 45.21
B:459 [ASN] A:60 [C] 3.69 A:54 [G] 45.21
B:459 [ASN] A:61 [C] 4.22 A:53 [G] 45.21
B:460 [SER] A:60 [C] 3.41 A:54 [G] 73.93
B:460 [SER] A:61 [C] 2.88 A:53 [G] 73.93
B:461 [ARG] A:14 [U] 4.31 C:15 [DA] 44.27
B:461 [ARG] A:64 [U] 4.83 44.27
B:462 [PHE] A:14 [U] 3.64 C:15 [DA] 66.38
B:462 [PHE] A:15 [A] 3.26 C:14 [DT] 66.38
B:462 [PHE] A:61 [C] 3.78 A:53 [G] 66.38
B:462 [PHE] A:62 [G] 3.29 A:52 [A] 66.38
B:464 [TRP] A:14 [U] 3.98 C:15 [DA] 96.72
B:464 [TRP] A:15 [A] 3.63 C:14 [DT] 96.72
B:467 [ARG] A:58 [G] 3.47 A:55 [C] 85.73
B:467 [ARG] A:59 [U] 2.32 85.73
B:471 [GLU] A:59 [U] 4.46 55.56
B:472 [THR] A:58 [G] 4.67 A:55 [C] 53.16
B:472 [THR] A:59 [U] 2.9 53.16
B:473 [ILE] A:59 [U] 2.94 91.26
B:474 [THR] A:59 [U] 4.25 73.54
B:475 [PRO] A:59 [U] 3.23 98.62
B:491 [PHE] A:14 [U] 4.71 C:15 [DA] 98.52
B:494 [ARG] A:14 [U] 4.44 C:15 [DA] 89.36
B:495 [MET] A:13 [G] 3.66 C:16 [DC] 89.23
B:495 [MET] A:14 [U] 4.65 C:15 [DA] 89.23
B:500 [LYS] A:4 [A] 4.94 C:25 [DT] 91.01
B:510 [LYS] A:5 [C] 3.86 C:24 [DG] 83.41
B:510 [LYS] A:6 [U] 2.62 C:23 [DA] 83.41
B:515 [TYR] A:4 [A] 3.38 C:25 [DT] 97.58
B:515 [TYR] A:5 [C] 2.04 C:24 [DG] 97.58
B:518 [PHE] A:4 [A] 3.53 C:25 [DT] 72.15
B:519 [THR] A:5 [C] 3.2 C:24 [DG] sugar:SC 61.18
B:522 [ASN] A:4 [A] 4.5 C:25 [DT] 94.53
B:523 [GLU] A:5 [C] 4.65 C:24 [DG] 97.93
B:588 [ASN] A:5 [C] 4.51 C:24 [DG] 81.46
B:588 [ASN] A:6 [U] 3.35 C:23 [DA] base/AA stacks 81.46
B:589 [ALA] A:5 [C] 4.41 C:24 [DG] 81.76
B:589 [ALA] A:6 [U] 4.9 C:23 [DA] 81.76
B:660 [GLY] A:5 [C] 4.07 C:24 [DG] 92.81
B:661 [ARG] A:4 [A] 3.18 C:25 [DT] 82.6
B:661 [ARG] A:5 [C] 3.34 C:24 [DG] 82.6
B:662 [LEU] A:4 [A] 3.84 C:25 [DT] 84.34
B:693 [PHE] A:3 [A] 3.83 C:26 [DT] 81.31
B:693 [PHE] A:4 [A] 3.96 C:25 [DT] 81.31
B:694 [MET] A:2 [U] 4.98 C:27 [DA] 93.52
B:694 [MET] A:3 [A] 3.61 C:26 [DT] 93.52
B:721 [HIS] A:76 [A] 4.08 A:73 [G] 41.29
B:721 [HIS] A:77 [A] 2.24 A:72 [U] 41.29
B:725 [ALA] A:65 [A] 4.79 54.0
B:729 [GLY] A:11 [U] 4.69 C:18 [DA] 69.5
B:729 [GLY] A:12 [U] 4.19 C:17 [DA] 69.5
B:730 [SER] A:11 [U] 4.78 C:18 [DA] 96.49
B:730 [SER] A:12 [U] 4.5 C:17 [DA] 96.49
B:731 [PRO] A:12 [U] 4.03 C:17 [DA] 94.05
B:731 [PRO] A:13 [G] 4.45 C:16 [DC] 94.05
B:734 [LYS] A:66 [U] 4.89 94.74
B:735 [LYS] A:65 [A] 4.81 90.09
B:735 [LYS] A:66 [U] 3.05 90.09
B:738 [LEU] A:66 [U] 4.0 61.61
B:738 [LEU] A:67 [C] 4.07 61.61
B:739 [GLN] A:66 [U] 4.83 89.43
B:739 [GLN] A:67 [C] 3.04 89.43
B:742 [LYS] A:66 [U] 3.77 61.13
B:742 [LYS] A:67 [C] 2.7 61.13
B:742 [LYS] A:77 [A] 4.15 A:72 [U] 61.13
B:749 [LYS] A:80 [U] 4.15 A:69 [A] 59.72
B:749 [LYS] A:81 [G] 4.18 A:68 [A] 59.72
B:753 [ARG] A:80 [U] 3.34 A:69 [A] 72.57
B:753 [ARG] A:81 [G] 4.89 A:68 [A] 72.57
B:890 [LYS] A:9 [A] 3.56 C:20 [DT] 54.9
B:893 [THR] A:8 [A] 3.31 C:21 [DT] sugar:SC 90.5
B:893 [THR] A:9 [A] 3.68 C:20 [DT] 90.5
B:894 [GLN] A:7 [C] 2.64 C:22 [DG] sugar:SC 47.7
B:894 [GLN] A:8 [A] 3.83 C:21 [DT] 47.7
B:894 [GLN] A:9 [A] 4.87 C:20 [DT] 47.7
B:924 [THR] A:1 [A] 4.51 C:28 [DT] 98.75
B:926 [GLN] A:2 [U] 3.23 C:27 [DA] 98.97
B:929 [LYS] A:1 [A] 3.3 C:28 [DT] 94.81
B:929 [LYS] A:2 [U] 4.35 C:27 [DA] 94.81
B:1012 [ASP] A:1 [A] 4.26 C:28 [DT] 0.0
B:1097 [LYS] A:66 [U] 5.0 0.0
B:1097 [LYS] A:67 [C] 2.58 0.0
B:1097 [LYS] A:68 [A] 3.84 A:81 [G] 0.0
B:1098 [THR] A:67 [C] 4.57 0.0
B:1098 [THR] A:68 [A] 4.4 A:81 [G] 0.0
B:1099 [GLU] A:67 [C] 3.28 0.0
B:1100 [VAL] A:67 [C] 3.01 base:BB, base:BB 0.0
B:1102 [THR] A:63 [U] 4.87 0.0
B:1102 [THR] A:64 [U] 2.77 0.0
B:1102 [THR] A:65 [A] 4.58 0.0
B:1102 [THR] A:66 [U] 4.05 0.0
B:1103 [GLY] A:51 [A] 3.24 base:BB 0.0
B:1103 [GLY] A:63 [U] 3.15 0.0
B:1103 [GLY] A:64 [U] 3.39 0.0
B:1104 [GLY] A:51 [A] 3.62 0.0
B:1104 [GLY] A:63 [U] 3.12 0.0
B:1105 [PHE] A:51 [A] 2.95 base:BB base/AA stacks 0.0
B:1105 [PHE] A:52 [A] 3.38 A:62 [G] 0.0
B:1108 [GLU] A:63 [U] 4.71 0.0
B:1110 [ILE] A:21 [G] 4.9 A:50 [U] 0.0
B:1110 [ILE] A:22 [U] 2.84 A:49 [A] sugar:BB 0.0
B:1110 [ILE] A:23 [U] 3.28 A:48 [A] 0.0
B:1110 [ILE] A:49 [A] 4.44 A:22 [U] 0.0
B:1111 [LEU] A:22 [U] 4.99 A:49 [A] 0.0
B:1111 [LEU] A:23 [U] 3.84 A:48 [A] 0.0
B:1112 [PRO] A:23 [U] 3.79 A:48 [A] 0.0
B:1112 [PRO] A:24 [U] 3.38 A:47 [A] 0.0
B:1113 [LYS] A:23 [U] 4.23 A:48 [A] 0.0
B:1113 [LYS] A:24 [U] 2.95 A:47 [A] 0.0
B:1113 [LYS] A:25 [U] 3.87 A:46 [A] 0.0
B:1121 [ALA] A:52 [A] 4.6 A:62 [G] 0.0
B:1122 [ARG] A:23 [U] 3.19 A:48 [A] base:SC 0.0
B:1122 [ARG] A:48 [A] 4.91 A:23 [U] 0.0
B:1122 [ARG] A:49 [A] 3.05 A:22 [U] base:SC 0.0
B:1122 [ARG] A:50 [U] 4.41 A:21 [G] 0.0
B:1122 [ARG] A:52 [A] 3.27 A:62 [G] 0.0
B:1123 [LYS] A:49 [A] 3.27 A:22 [U] 0.0
B:1123 [LYS] A:50 [U] 3.17 A:21 [G] 0.0
B:1123 [LYS] A:52 [A] 2.68 A:62 [G] 0.0
B:1123 [LYS] A:53 [G] 3.46 A:61 [C] 0.0
B:1124 [LYS] A:52 [A] 3.56 A:62 [G] 0.0
B:1124 [LYS] A:53 [G] 2.72 A:61 [C] 0.0
B:1126 [TRP] A:48 [A] 4.41 A:23 [U] 0.0
B:1126 [TRP] A:49 [A] 3.38 A:22 [U] 0.0
B:1130 [LYS] A:24 [U] 3.56 A:47 [A] 0.0
B:1131 [TYR] A:23 [U] 2.81 A:48 [A] sugar:BB 0.0
B:1131 [TYR] A:24 [U] 3.61 A:47 [A] 0.0
B:1132 [GLY] A:23 [U] 4.8 A:48 [A] 0.0
B:1134 [PHE] A:51 [A] 3.76 0.0
B:1168 [ILE] A:51 [A] 4.82 0.0
B:1169 [MET] A:52 [A] 3.51 A:62 [G] 0.0
B:1197 [LYS] A:67 [C] 4.54 0.0
B:1197 [LYS] A:69 [A] 4.46 A:80 [U] 0.0
B:1349 [HIS] A:68 [A] 3.21 A:81 [G] sugar:SC 0.0
B:1349 [HIS] A:69 [A] 3.38 A:80 [U] 0.0
B:1350 [GLN] A:68 [A] 2.89 A:81 [G] 0.0
B:1351 [SER] A:68 [A] 3.26 A:81 [G] 0.0
B:1356 [TYR] A:68 [A] 4.37 A:81 [G] 0.0
B:1356 [TYR] A:81 [G] 3.52 A:68 [A] base/AA stacks 0.0
B:1357 [GLU] A:68 [A] 4.78 A:81 [G] 0.0
B:1357 [GLU] A:81 [G] 3.01 A:68 [A] base:BB 0.0
B:1358 [THR] A:68 [A] 3.21 A:81 [G] 0.0
B:1358 [THR] A:69 [A] 3.62 A:80 [U] 0.0

logo_download Export the table of contacts

*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)

Properties of this interface

Interolog group ID Structure ID Structure description
 UniProt ID
 		ECOD label(s)
 		RFAM label(s)
 		Is ribosome? RCSB PDB link
group125 5FW1_B_A B: Crispr-associated endonuclease cas9/csn1, Streptococcus pyogenes (genetically engineered) A: sgRNA, Synthetic construct (synthetic) Q99ZW2 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 ✘

Interologs

Total number of interologs for this interface: 8

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
5FW1_B_A 7OX9_B_A 0.97 0.99 0.36 0.7 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FW1_B_A 7EL1_A_B 0.65 0.73 2.0 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FW1_B_A 5X2H_A_B 0.56 0.75 3.12 0.16 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FQ5_B_A 5FW1_B_A 0.98 1.0 0.27 0.98 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2T_B_A 5FW1_B_A 0.97 0.99 0.37 0.75 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2S_B_A 5FW1_B_A 0.97 0.99 0.39 0.76 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2R_B_A 5FW1_B_A 0.96 0.99 0.33 0.75 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5FW1_B_A 0.94 0.93 1.42 0.73 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare