Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
ChainChain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity Electrostatics (surface only) Conservation*
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show as licoriceshow Accessibility
Rim - Core
Contacts -
5X2H_A
|
5X2H_B
|
Distance
|
Base Pair
|
Hbond nuc:res
|
Base Stacking
|
Residue conservation
|
---|---|---|---|---|---|---|
A:30 [ARG] | B:78 [A] | 2.8 | 94.73 | |||
A:43 [SER] | B:12 [G] | 3.95 | C:9 [DC] | 98.28 | ||
A:43 [SER] | B:13 [C] | 3.14 | C:8 [DG] | 98.28 | ||
A:44 [LEU] | B:13 [C] | 4.04 | C:8 [DG] | 87.85 | ||
A:44 [LEU] | B:70 [G] | 3.49 | B:84 [C] | 87.85 | ||
A:44 [LEU] | B:71 [G] | 3.3 | B:83 [C] | 87.85 | ||
A:45 [ALA] | B:13 [C] | 3.59 | C:8 [DG] | 93.74 | ||
A:45 [ALA] | B:14 [G] | 3.6 | C:7 [DC] | 93.74 | ||
A:45 [ALA] | B:70 [G] | 3.71 | B:84 [C] | 93.74 | ||
A:46 [LEU] | B:13 [C] | 3.82 | C:8 [DG] | 56.24 | ||
A:46 [LEU] | B:14 [G] | 4.88 | C:7 [DC] | 56.24 | ||
A:47 [PRO] | B:69 [C] | 4.1 | 62.28 | |||
A:48 [ARG] | B:14 [G] | 3.91 | C:7 [DC] | 96.69 | ||
A:48 [ARG] | B:68 [G] | 2.7 | B:50 [A] | 96.69 | ||
A:48 [ARG] | B:69 [C] | 2.74 | 96.69 | |||
A:48 [ARG] | B:70 [G] | 3.17 | B:84 [C] | base/AA stacks | 96.69 | |
A:48 [ARG] | B:85 [U] | 3.71 | 96.69 | |||
A:49 [ARG] | B:13 [C] | 3.52 | C:8 [DG] | 98.46 | ||
A:49 [ARG] | B:14 [G] | 2.65 | C:7 [DC] | 98.46 | ||
A:49 [ARG] | B:15 [C] | 4.0 | C:6 [DG] | 98.46 | ||
A:51 [ALA] | B:49 [A] | 4.98 | 74.26 | |||
A:51 [ALA] | B:69 [C] | 3.56 | 74.26 | |||
A:52 [ARG] | B:14 [G] | 3.43 | C:7 [DC] | 98.44 | ||
A:52 [ARG] | B:15 [C] | 2.66 | C:6 [DG] | 98.44 | ||
A:52 [ARG] | B:67 [U] | 4.79 | B:51 [A] | 98.44 | ||
A:52 [ARG] | B:68 [G] | 4.12 | B:50 [A] | 98.44 | ||
A:53 [SER] | B:15 [C] | 4.33 | C:6 [DG] | 76.39 | ||
A:53 [SER] | B:16 [U] | 4.7 | C:5 [DA] | 76.39 | ||
A:53 [SER] | B:17 [U] | 4.77 | C:4 [DA] | 76.39 | ||
A:54 [ALA] | B:49 [A] | 4.36 | 58.03 | |||
A:55 [ARG] | B:49 [A] | 3.24 | 97.71 | |||
A:55 [ARG] | B:68 [G] | 3.58 | B:50 [A] | base/AA stacks | 97.71 | |
A:55 [ARG] | B:69 [C] | 3.4 | 97.71 | |||
A:56 [LYS] | B:15 [C] | 4.96 | C:6 [DG] | 94.27 | ||
A:56 [LYS] | B:16 [U] | 3.17 | C:5 [DA] | 94.27 | ||
A:56 [LYS] | B:66 [C] | 4.12 | B:52 [G] | 94.27 | ||
A:56 [LYS] | B:67 [U] | 3.23 | B:51 [A] | 94.27 | ||
A:57 [ARG] | B:17 [U] | 3.63 | C:4 [DA] | 84.99 | ||
A:57 [ARG] | B:18 [G] | 2.84 | C:3 [DC] | 84.99 | ||
A:57 [ARG] | B:19 [G] | 3.68 | C:2 [DC] | base:SC | 84.99 | |
A:58 [LEU] | B:48 [U] | 3.62 | B:21 [G] | 49.9 | ||
A:58 [LEU] | B:49 [A] | 4.66 | 49.9 | |||
A:60 [ARG] | B:16 [U] | 2.74 | C:5 [DA] | 98.81 | ||
A:60 [ARG] | B:17 [U] | 2.73 | C:4 [DA] | 98.81 | ||
A:60 [ARG] | B:65 [U] | 4.95 | B:53 [A] | 98.81 | ||
A:60 [ARG] | B:66 [C] | 3.32 | B:52 [G] | 98.81 | ||
A:61 [ARG] | B:47 [A] | 4.99 | B:22 [U] | 88.9 | ||
A:61 [ARG] | B:48 [U] | 2.91 | B:21 [G] | base:SC | 88.9 | |
A:62 [LYS] | B:47 [A] | 3.17 | B:22 [U] | 59.79 | ||
A:62 [LYS] | B:48 [U] | 2.79 | B:21 [G] | 59.79 | ||
A:63 [ALA] | B:63 [A] | 3.63 | 4.46 | |||
A:63 [ALA] | B:64 [C] | 3.72 | B:54 [G] | 4.46 | ||
A:64 [ARG] | B:17 [U] | 4.95 | C:4 [DA] | 98.81 | ||
A:64 [ARG] | B:18 [G] | 3.35 | C:3 [DC] | 98.81 | ||
A:65 [LEU] | B:46 [A] | 4.11 | B:23 [U] | 67.22 | ||
A:66 [ASN] | B:63 [A] | 3.25 | 11.41 | |||
A:67 [HIS] | B:63 [A] | 3.25 | base:SC | 51.36 | ||
A:67 [HIS] | B:64 [C] | 4.8 | B:54 [G] | 51.36 | ||
A:69 [LYS] | B:45 [A] | 4.33 | B:24 [U] | 72.7 | ||
A:69 [LYS] | B:46 [A] | 2.67 | B:23 [U] | 72.7 | ||
A:70 [HIS] | B:62 [G] | 4.69 | B:89 [A] | 44.03 | ||
A:70 [HIS] | B:63 [A] | 2.75 | base/AA stacks | 44.03 | ||
A:71 [LEU] | B:63 [A] | 4.49 | 68.33 | |||
A:74 [ASN] | B:63 [A] | 2.97 | base:SC | 44.55 | ||
A:80 [TYR] | B:63 [A] | 3.8 | 56.97 | |||
A:83 [TYR] | B:46 [A] | 4.6 | B:23 [U] | 44.04 | ||
A:85 [SER] | B:45 [A] | 4.34 | B:24 [U] | 29.19 | ||
A:85 [SER] | B:46 [A] | 3.02 | B:23 [U] | sugar:SC | 29.19 | |
A:88 [GLU] | B:24 [U] | 3.23 | B:45 [A] | sugar:BB | 55.27 | |
A:88 [GLU] | B:25 [U] | 3.68 | B:44 [A] | 55.27 | ||
A:89 [SER] | B:25 [U] | 3.58 | B:44 [A] | 24.76 | ||
A:90 [LEU] | B:25 [U] | 2.99 | B:44 [A] | sugar:BB | 47.14 | |
A:90 [LEU] | B:26 [A] | 3.76 | B:43 [U] | 47.14 | ||
A:90 [LEU] | B:44 [A] | 4.33 | B:25 [U] | 47.14 | ||
A:90 [LEU] | B:45 [A] | 3.74 | B:24 [U] | 47.14 | ||
A:91 [ALA] | B:45 [A] | 4.25 | B:24 [U] | 38.48 | ||
A:94 [TYR] | B:26 [A] | 4.58 | B:43 [U] | 58.39 | ||
A:94 [TYR] | B:44 [A] | 3.31 | B:25 [U] | 58.39 | ||
A:94 [TYR] | B:45 [A] | 3.52 | B:24 [U] | 58.39 | ||
A:95 [LYS] | B:26 [A] | 4.74 | B:43 [U] | 12.51 | ||
A:96 [GLY] | B:26 [A] | 4.33 | B:43 [U] | 66.64 | ||
A:96 [GLY] | B:27 [G] | 3.35 | B:42 [C] | 66.64 | ||
A:97 [SER] | B:27 [G] | 3.58 | B:42 [C] | 47.78 | ||
A:97 [SER] | B:28 [U] | 3.21 | B:41 [A] | 47.78 | ||
A:98 [LEU] | B:27 [G] | 3.42 | B:42 [C] | sugar:BB | 58.41 | |
A:98 [LEU] | B:28 [U] | 4.73 | B:41 [A] | 58.41 | ||
A:98 [LEU] | B:44 [A] | 4.14 | B:25 [U] | 58.41 | ||
A:100 [SER] | B:43 [U] | 4.0 | B:26 [A] | 83.69 | ||
A:101 [PRO] | B:43 [U] | 4.08 | B:26 [A] | 85.71 | ||
A:101 [PRO] | B:44 [A] | 3.66 | B:25 [U] | 85.71 | ||
A:102 [TYR] | B:43 [U] | 3.06 | B:26 [A] | 84.4 | ||
A:102 [TYR] | B:44 [A] | 2.57 | B:25 [U] | 84.4 | ||
A:120 [ARG] | B:45 [A] | 4.88 | B:24 [U] | 90.94 | ||
A:123 [LEU] | B:45 [A] | 4.04 | B:24 [U] | 79.82 | ||
A:124 [HIS] | B:43 [U] | 4.67 | B:26 [A] | 96.18 | ||
A:124 [HIS] | B:44 [A] | 2.78 | B:25 [U] | 96.18 | ||
A:124 [HIS] | B:45 [A] | 3.4 | B:24 [U] | 96.18 | ||
A:127 [LYS] | B:19 [G] | 4.27 | C:2 [DC] | 95.03 | ||
A:127 [LYS] | B:45 [A] | 3.98 | B:24 [U] | 95.03 | ||
A:127 [LYS] | B:46 [A] | 2.84 | B:23 [U] | 95.03 | ||
A:128 [ARG] | B:18 [G] | 4.99 | C:3 [DC] | 78.42 | ||
A:128 [ARG] | B:19 [G] | 3.21 | C:2 [DC] | 78.42 | ||
A:128 [ARG] | B:20 [C] | 3.75 | C:1 [DG] | 78.42 | ||
A:128 [ARG] | B:44 [A] | 3.45 | B:25 [U] | 78.42 | ||
A:128 [ARG] | B:45 [A] | 2.94 | B:24 [U] | 78.42 | ||
A:129 [ARG] | B:17 [U] | 3.26 | C:4 [DA] | 98.95 | ||
A:129 [ARG] | B:18 [G] | 2.81 | C:3 [DC] | 98.95 | ||
A:129 [ARG] | B:19 [G] | 3.62 | C:2 [DC] | 98.95 | ||
A:130 [GLY] | B:18 [G] | 3.25 | C:3 [DC] | 98.68 | ||
A:130 [GLY] | B:19 [G] | 3.02 | C:2 [DC] | 98.68 | ||
A:131 [TYR] | B:18 [G] | 3.43 | C:3 [DC] | 83.54 | ||
A:132 [ASP] | B:17 [U] | 4.89 | C:4 [DA] | 65.82 | ||
A:145 [ILE] | B:18 [G] | 3.62 | C:3 [DC] | 72.49 | ||
A:171 [PHE] | B:43 [U] | 4.02 | B:26 [A] | 34.02 | ||
A:172 [GLN] | B:28 [U] | 2.49 | B:41 [A] | sugar:SC | 47.27 | |
A:172 [GLN] | B:29 [C] | 4.51 | B:40 [G] | 47.27 | ||
A:172 [GLN] | B:42 [C] | 4.78 | B:27 [G] | 47.27 | ||
A:174 [PHE] | B:29 [C] | 4.3 | B:40 [G] | 1.21 | ||
A:175 [LYS] | B:41 [A] | 4.75 | B:28 [U] | 49.55 | ||
A:180 [GLU] | B:40 [G] | 3.54 | B:29 [C] | 35.9 | ||
A:180 [GLU] | B:41 [A] | 3.26 | B:28 [U] | 35.9 | ||
A:181 [PHE] | B:28 [U] | 3.99 | B:41 [A] | 34.93 | ||
A:181 [PHE] | B:29 [C] | 3.39 | B:40 [G] | 34.93 | ||
A:181 [PHE] | B:41 [A] | 2.79 | B:28 [U] | sugar:BB | 34.93 | |
A:181 [PHE] | B:42 [C] | 3.32 | B:27 [G] | 34.93 | ||
A:182 [THR] | B:41 [A] | 4.92 | B:28 [U] | 28.14 | ||
A:182 [THR] | B:42 [C] | 3.6 | B:27 [G] | 28.14 | ||
A:182 [THR] | B:43 [U] | 4.95 | B:26 [A] | 28.14 | ||
A:183 [ASN] | B:42 [C] | 3.99 | B:27 [G] | 71.99 | ||
A:183 [ASN] | B:43 [U] | 3.78 | B:26 [A] | 71.99 | ||
A:184 [VAL] | B:42 [C] | 4.02 | B:27 [G] | 72.85 | ||
A:184 [VAL] | B:43 [U] | 2.78 | B:26 [A] | 72.85 | ||
A:185 [ARG] | B:19 [G] | 4.99 | C:2 [DC] | 98.19 | ||
A:185 [ARG] | B:20 [C] | 2.84 | C:1 [DG] | 98.19 | ||
A:185 [ARG] | B:43 [U] | 2.78 | B:26 [A] | 98.19 | ||
A:185 [ARG] | B:44 [A] | 3.18 | B:25 [U] | 98.19 | ||
A:186 [ASN] | B:19 [G] | 2.86 | C:2 [DC] | sugar:SC | 96.23 | |
A:186 [ASN] | B:20 [C] | 2.99 | C:1 [DG] | 96.23 | ||
A:186 [ASN] | B:21 [G] | 3.85 | B:48 [U] | 96.23 | ||
A:187 [LYS] | B:20 [C] | 3.78 | C:1 [DG] | 73.48 | ||
A:187 [LYS] | B:21 [G] | 3.39 | B:48 [U] | 73.48 | ||
A:187 [LYS] | B:42 [C] | 3.7 | B:27 [G] | 73.48 | ||
A:187 [LYS] | B:43 [U] | 2.56 | B:26 [A] | 73.48 | ||
A:188 [LYS] | B:20 [C] | 3.63 | C:1 [DG] | 0.56 | ||
A:188 [LYS] | B:21 [G] | 3.08 | B:48 [U] | 0.56 | ||
A:189 [GLU] | B:20 [C] | 3.68 | C:1 [DG] | sugar:BB | 39.59 | |
A:190 [SER] | B:19 [G] | 4.42 | C:2 [DC] | 52.2 | ||
A:191 [TYR] | B:18 [G] | 3.81 | C:3 [DC] | 89.92 | ||
A:191 [TYR] | B:19 [G] | 3.63 | C:2 [DC] | 89.92 | ||
A:194 [CYS] | B:19 [G] | 4.25 | C:2 [DC] | 76.5 | ||
A:197 [GLN] | B:18 [G] | 4.46 | C:3 [DC] | 92.18 | ||
A:233 [LYS] | B:16 [U] | 3.23 | C:5 [DA] | 89.37 | ||
A:233 [LYS] | B:17 [U] | 3.62 | C:4 [DA] | 89.37 | ||
A:234 [ARG] | B:16 [U] | 2.76 | C:5 [DA] | sugar:BB | 88.74 | |
A:234 [ARG] | B:17 [U] | 2.94 | C:4 [DA] | 88.74 | ||
A:234 [ARG] | B:64 [C] | 4.56 | B:54 [G] | 88.74 | ||
A:234 [ARG] | B:65 [U] | 2.41 | B:53 [A] | 88.74 | ||
A:235 [ALA] | B:15 [C] | 4.71 | C:6 [DG] | 65.48 | ||
A:235 [ALA] | B:16 [U] | 3.57 | C:5 [DA] | 65.48 | ||
A:236 [LEU] | B:14 [G] | 4.43 | C:7 [DC] | 78.5 | ||
A:236 [LEU] | B:15 [C] | 3.35 | C:6 [DG] | 78.5 | ||
A:236 [LEU] | B:16 [U] | 3.86 | C:5 [DA] | 78.5 | ||
A:237 [LYS] | B:15 [C] | 2.96 | C:6 [DG] | sugar:BB | 84.32 | |
A:237 [LYS] | B:16 [U] | 4.26 | C:5 [DA] | 84.32 | ||
A:237 [LYS] | B:66 [C] | 4.19 | B:52 [G] | 84.32 | ||
A:237 [LYS] | B:67 [U] | 4.12 | B:51 [A] | 84.32 | ||
A:241 [HIS] | B:85 [U] | 4.15 | 69.76 | |||
A:242 [LEU] | B:14 [G] | 4.2 | C:7 [DC] | 79.0 | ||
A:247 [SER] | B:3 [A] | 3.55 | C:18 [DT] | 67.97 | ||
A:247 [SER] | B:4 [A] | 2.16 | C:17 [DT] | 67.97 | ||
A:248 [PHE] | B:3 [A] | 4.16 | C:18 [DT] | 84.47 | ||
A:257 [LYS] | B:6 [U] | 3.36 | C:15 [DA] | 96.02 | ||
A:257 [LYS] | B:7 [U] | 4.46 | C:14 [DA] | 96.02 | ||
A:265 [PHE] | B:4 [A] | 3.17 | C:17 [DT] | 97.95 | ||
A:265 [PHE] | B:5 [A] | 3.85 | C:16 [DT] | 97.95 | ||
A:266 [VAL] | B:5 [A] | 3.56 | C:16 [DT] | 77.44 | ||
A:266 [VAL] | B:6 [U] | 3.72 | C:15 [DA] | 77.44 | ||
A:269 [THR] | B:4 [A] | 4.7 | C:17 [DT] | 73.52 | ||
A:269 [THR] | B:5 [A] | 3.82 | C:16 [DT] | 73.52 | ||
A:270 [ARG] | B:5 [A] | 3.65 | C:16 [DT] | 80.14 | ||
A:270 [ARG] | B:6 [U] | 3.95 | C:15 [DA] | 80.14 | ||
A:273 [ASN] | B:4 [A] | 4.24 | C:17 [DT] | 96.13 | ||
A:328 [TYR] | B:7 [U] | 4.88 | C:14 [DA] | 63.4 | ||
A:394 [LEU] | B:5 [A] | 3.45 | C:16 [DT] | 90.65 | ||
A:394 [LEU] | B:6 [U] | 4.08 | C:15 [DA] | 90.65 | ||
A:395 [ASN] | B:4 [A] | 3.48 | C:17 [DT] | 81.26 | ||
A:395 [ASN] | B:5 [A] | 2.67 | C:16 [DT] | 81.26 | ||
A:396 [ILE] | B:4 [A] | 4.06 | C:17 [DT] | 94.52 | ||
A:396 [ILE] | B:5 [A] | 4.4 | C:16 [DT] | 94.52 | ||
A:414 [TYR] | B:3 [A] | 2.87 | C:18 [DT] | sugar:SC | 96.74 | |
A:414 [TYR] | B:4 [A] | 3.14 | C:17 [DT] | 96.74 | ||
A:425 [VAL] | B:2 [G] | 4.92 | C:19 [DC] | 26.64 | ||
A:425 [VAL] | B:3 [A] | 4.0 | C:18 [DT] | 26.64 | ||
A:437 [ALA] | B:72 [G] | 4.91 | B:82 [C] | 65.36 | ||
A:437 [ALA] | B:73 [G] | 3.57 | B:81 [C] | 65.36 | ||
A:439 [ASN] | B:72 [G] | 3.74 | B:82 [C] | 1.42 | ||
A:448 [THR] | B:12 [G] | 3.17 | C:9 [DC] | sugar:SC | 62.45 | |
A:448 [THR] | B:13 [C] | 3.31 | C:8 [DG] | 62.45 | ||
A:449 [ASN] | B:11 [U] | 4.5 | C:10 [DA] | 97.39 | ||
A:449 [ASN] | B:12 [G] | 3.12 | C:9 [DC] | 97.39 | ||
A:449 [ASN] | B:13 [C] | 4.85 | C:8 [DG] | 97.39 | ||
A:450 [PRO] | B:12 [G] | 4.19 | C:9 [DC] | 97.28 | ||
A:450 [PRO] | B:13 [C] | 3.56 | C:8 [DG] | 97.28 | ||
A:450 [PRO] | B:70 [G] | 3.72 | B:84 [C] | 97.28 | ||
A:450 [PRO] | B:71 [G] | 3.81 | B:83 [C] | 97.28 | ||
A:453 [LEU] | B:71 [G] | 3.44 | B:83 [C] | 66.41 | ||
A:453 [LEU] | B:72 [G] | 3.88 | B:82 [C] | 66.41 | ||
A:454 [ARG] | B:71 [G] | 2.97 | B:83 [C] | 98.01 | ||
A:454 [ARG] | B:72 [G] | 3.4 | B:82 [C] | 98.01 | ||
A:457 [LYS] | B:72 [G] | 3.39 | B:82 [C] | 78.38 | ||
A:457 [LYS] | B:73 [G] | 3.14 | B:81 [C] | 78.38 | ||
A:460 [ARG] | B:73 [G] | 3.18 | B:81 [C] | 93.84 | ||
A:460 [ARG] | B:74 [U] | 2.81 | B:79 [A] | 93.84 | ||
A:461 [LYS] | B:75 [U] | 3.21 | base:SC | 95.51 | ||
A:461 [LYS] | B:78 [A] | 3.24 | 95.51 | |||
A:645 [ARG] | B:1 [G] | 3.43 | C:20 [DC] | 86.72 | ||
A:645 [ARG] | B:2 [G] | 3.82 | C:19 [DC] | 86.72 | ||
A:649 [ASN] | B:1 [G] | 4.56 | C:20 [DC] | 51.15 | ||
A:649 [ASN] | B:2 [G] | 3.25 | C:19 [DC] | 51.15 | ||
A:778 [PRO] | B:78 [A] | 3.52 | 68.37 | |||
A:779 [GLU] | B:77 [C] | 2.92 | sugar:SC | 73.58 | ||
A:779 [GLU] | B:78 [A] | 3.43 | 73.58 | |||
A:779 [GLU] | B:79 [A] | 3.66 | B:74 [U] | 73.58 | ||
A:780 [ARG] | B:79 [A] | 3.58 | B:74 [U] | 71.16 | ||
A:781 [LYS] | B:77 [C] | 2.83 | base:SC | 73.01 | ||
A:781 [LYS] | B:78 [A] | 2.89 | base:SC | 73.01 | ||
A:781 [LYS] | B:79 [A] | 2.89 | B:74 [U] | 73.01 | ||
A:782 [LYS] | B:70 [G] | 2.68 | B:84 [C] | 80.02 | ||
A:782 [LYS] | B:71 [G] | 2.72 | B:83 [C] | 80.02 | ||
A:782 [LYS] | B:78 [A] | 4.97 | 80.02 | |||
A:782 [LYS] | B:79 [A] | 3.28 | B:74 [U] | 80.02 | ||
A:783 [PRO] | B:79 [A] | 3.31 | B:74 [U] | 67.57 | ||
A:783 [PRO] | B:80 [U] | 3.63 | 67.57 | |||
A:784 [SER] | B:69 [C] | 4.29 | 69.31 | |||
A:784 [SER] | B:70 [G] | 2.63 | B:84 [C] | 69.31 | ||
A:785 [GLY] | B:49 [A] | 3.05 | base:BB | 94.35 | ||
A:785 [GLY] | B:69 [C] | 3.11 | 94.35 | |||
A:785 [GLY] | B:70 [G] | 4.31 | B:84 [C] | 94.35 | ||
A:786 [ALA] | B:49 [A] | 3.66 | 87.85 | |||
A:786 [ALA] | B:69 [C] | 3.19 | 87.85 | |||
A:787 [LEU] | B:49 [A] | 3.08 | base:BB | 87.64 | ||
A:787 [LEU] | B:50 [A] | 3.49 | B:68 [G] | 87.64 | ||
A:788 [HIS] | B:49 [A] | 2.74 | sugar:SC | 94.6 | ||
A:790 [GLU] | B:69 [C] | 4.45 | 80.78 | |||
A:791 [THR] | B:22 [U] | 4.89 | B:47 [A] | 94.27 | ||
A:792 [PHE] | B:21 [G] | 4.19 | B:48 [U] | 86.18 | ||
A:792 [PHE] | B:22 [U] | 3.16 | B:47 [A] | sugar:BB | 86.18 | |
A:792 [PHE] | B:23 [U] | 3.45 | B:46 [A] | 86.18 | ||
A:792 [PHE] | B:47 [A] | 4.59 | B:22 [U] | 86.18 | ||
A:792 [PHE] | B:48 [U] | 3.78 | B:21 [G] | 86.18 | ||
A:793 [ARG] | B:23 [U] | 4.51 | B:46 [A] | 9.93 | ||
A:794 [LYS] | B:23 [U] | 3.72 | B:46 [A] | 83.71 | ||
A:794 [LYS] | B:24 [U] | 3.81 | B:45 [A] | 83.71 | ||
A:820 [VAL] | B:49 [A] | 3.99 | 66.55 | |||
A:820 [VAL] | B:50 [A] | 3.97 | B:68 [G] | 66.55 | ||
A:821 [ASN] | B:47 [A] | 3.55 | B:22 [U] | 71.79 | ||
A:821 [ASN] | B:48 [U] | 3.67 | B:21 [G] | 71.79 | ||
A:821 [ASN] | B:49 [A] | 3.61 | 71.79 | |||
A:821 [ASN] | B:50 [A] | 2.92 | B:68 [G] | 71.79 | ||
A:821 [ASN] | B:51 [A] | 3.98 | B:67 [U] | 71.79 | ||
A:822 [GLY] | B:23 [U] | 4.26 | B:46 [A] | 50.43 | ||
A:823 [LYS] | B:23 [U] | 3.28 | B:46 [A] | base:SC | 76.46 | |
A:823 [LYS] | B:47 [A] | 3.11 | B:22 [U] | base:SC | 76.46 | |
A:823 [LYS] | B:48 [U] | 4.35 | B:21 [G] | 76.46 | ||
A:832 [ARG] | B:80 [U] | 2.74 | base:SC | 97.01 | ||
A:852 [MET] | B:50 [A] | 3.85 | B:68 [G] | 69.08 | ||
A:854 [PHE] | B:80 [U] | 3.14 | 64.66 | |||
A:855 [ALA] | B:50 [A] | 3.26 | B:68 [G] | 83.97 | ||
A:856 [LEU] | B:50 [A] | 3.48 | B:68 [G] | 58.07 | ||
A:964 [ILE] | B:76 [A] | 3.82 | 59.32 | |||
A:964 [ILE] | B:77 [C] | 3.25 | 59.32 | |||
A:965 [VAL] | B:77 [C] | 3.73 | 88.38 | |||
A:966 [SER] | B:77 [C] | 3.54 | 88.49 | |||
A:967 [ALA] | B:77 [C] | 4.76 | 52.85 | |||
A:970 [GLU] | B:77 [C] | 4.91 | 78.56 | |||
A:972 [THR] | B:76 [A] | 3.88 | 9.29 | |||
A:972 [THR] | B:77 [C] | 4.51 | 9.29 | |||
A:973 [LYS] | B:76 [A] | 3.55 | 56.45 | |||
A:974 [ALA] | B:76 [A] | 3.48 | 64.39 | |||
A:975 [GLU] | B:76 [A] | 2.89 | base:BB, base:BB | 29.64 | ||
A:977 [ARG] | B:76 [A] | 3.88 | base/AA stacks | 23.39 | ||
A:977 [ARG] | B:77 [C] | 4.98 | 23.39 | |||
A:980 [GLU] | B:79 [A] | 4.71 | B:74 [U] | 58.03 | ||
A:980 [GLU] | B:80 [U] | 3.21 | base/AA stacks | 58.03 | ||
A:981 [ASP] | B:80 [U] | 2.89 | base:BB | 1.29 | ||
A:982 [PHE] | B:80 [U] | 3.34 | 80.76 | |||
A:983 [LYS] | B:80 [U] | 4.23 | 27.98 |
*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)
Properties of this interface
Interolog group ID | Structure ID |
Structure description |
UniProt ID |
ECOD label(s) |
RFAM label(s) |
Is ribosome? | RCSB PDB link |
---|---|---|---|---|---|---|---|
group125 | 5X2H_A_B | A: Crispr-associated endonuclease cas9, Campylobacter jejuni subsp. jejuni serotype o:2 (strain atcc 700819 / nctc 11168) (genetically engineered) B: sgRNA, Campylobacter jejuni (synthetic) | Q0P897 | CRISPR-associated endonuclease Cas9 wedge domain & Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 | ✘ |
![]() |
Interologs
Total number of interologs for this interface: 8