RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group125 > 5X2H_A_B vs 7EL1_A_B

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

5X2H_A
5X2H_B
7EL1_A
7EL1_B
Conserved?
A:100 [SER] B:43 [U] A:87 [ASN] B:49 [U] ✔
A:181 [PHE] B:42 [C] A:162 [GLY] B:48 [C] ✔
A:47 [PRO] B:69 [C] A:46 [GLY] B:69 [U] ✔
A:450 [PRO] B:12 [G] A:448 [PRO] B:12 [G] ✔
A:450 [PRO] B:13 [C] A:448 [PRO] B:13 [C] ✔
A:56 [LYS] B:15 [C] A:55 [ARG] B:15 [C] ✔
A:56 [LYS] B:16 [U] A:55 [ARG] B:16 [U] ✔
A:56 [LYS] B:66 [C] A:55 [ARG] B:66 [C] ✔
A:56 [LYS] B:67 [U] A:55 [ARG] B:67 [C] ✔
A:45 [ALA] B:13 [C] A:44 [ASN] B:13 [C] ✔
A:45 [ALA] B:14 [G] A:44 [ASN] B:14 [G] ✔
A:45 [ALA] B:70 [G] A:44 [ASN] B:70 [G] ✔
A:51 [ALA] B:69 [C] A:50 [LYS] B:69 [U] ✔
A:791 [THR] B:22 [U] A:787 [THR] B:22 [U] ✔
A:265 [PHE] B:4 [A] A:256 [TYR] B:4 [A] ✔
A:62 [LYS] B:47 [A] A:61 [ARG] B:53 [A] ✔
A:62 [LYS] B:48 [U] A:61 [ARG] B:54 [C] ✔
A:127 [LYS] B:19 [G] A:114 [LYS] B:19 [G] ✔
A:127 [LYS] B:45 [A] A:114 [LYS] B:51 [A] ✔
A:127 [LYS] B:46 [A] A:114 [LYS] B:52 [A] ✔
A:248 [PHE] B:3 [A] A:239 [TYR] B:3 [A] ✔
A:131 [TYR] B:18 [G] A:118 [VAL] B:18 [G] ✔
A:58 [LEU] B:48 [U] A:57 [LYS] B:54 [C] ✔
A:58 [LEU] B:49 [A] A:57 [LYS] B:55 [A] ✔
A:191 [TYR] B:19 [G] A:167 [SER] B:19 [G] ✔
A:132 [ASP] B:17 [U] A:119 [HIS] B:17 [U] ✔
A:395 [ASN] B:4 [A] A:394 [ASN] B:4 [A] ✔
A:395 [ASN] B:5 [A] A:394 [ASN] B:5 [A] ✔
A:55 [ARG] B:49 [A] A:54 [ARG] B:55 [A] ✔
A:55 [ARG] B:68 [G] A:54 [ARG] B:68 [G] ✔
A:55 [ARG] B:69 [C] A:54 [ARG] B:69 [U] ✔
A:145 [ILE] B:18 [G] A:134 [THR] B:18 [G] ✔
A:787 [LEU] B:49 [A] A:783 [LEU] B:55 [A] ✔
A:787 [LEU] B:50 [A] A:783 [LEU] B:56 [A] ✔
A:101 [PRO] B:43 [U] A:88 [PRO] B:49 [U] ✔
A:101 [PRO] B:44 [A] A:88 [PRO] B:50 [A] ✔
A:793 [ARG] B:23 [U] A:789 [TYR] B:23 [U] ✔
A:792 [PHE] B:22 [U] A:788 [LEU] B:22 [U] ✔
A:792 [PHE] B:23 [U] A:788 [LEU] B:23 [U] ✔
A:792 [PHE] B:47 [A] A:788 [LEU] B:53 [A] ✔
A:792 [PHE] B:48 [U] A:788 [LEU] B:54 [C] ✔
A:235 [ALA] B:15 [C] A:210 [THR] B:15 [C] ✔
A:235 [ALA] B:16 [U] A:210 [THR] B:16 [U] ✔
A:852 [MET] B:50 [A] A:931 [LEU] B:56 [A] ✔
A:46 [LEU] B:13 [C] A:45 [GLU] B:13 [C] ✔
A:454 [ARG] B:71 [G] A:452 [ARG] B:71 [U] ✔
A:454 [ARG] B:72 [G] A:452 [ARG] B:72 [U] ✔
A:186 [ASN] B:19 [G] A:166 [GLY] B:19 [G] ✔
A:186 [ASN] B:20 [C] A:166 [GLY] B:20 [C] ✔
A:233 [LYS] B:16 [U] A:208 [ARG] B:16 [U] ✔
A:233 [LYS] B:17 [U] A:208 [ARG] B:17 [U] ✔
A:247 [SER] B:3 [A] A:238 [THR] B:3 [A] ✔
A:247 [SER] B:4 [A] A:238 [THR] B:4 [A] ✔
A:266 [VAL] B:5 [A] A:257 [ASN] B:5 [A] ✔
A:266 [VAL] B:6 [U] A:257 [ASN] B:6 [U] ✔
A:790 [GLU] B:69 [C] A:786 [ASP] B:69 [U] ✔
A:257 [LYS] B:6 [U] A:248 [LYS] B:6 [U] ✔
A:257 [LYS] B:7 [U] A:248 [LYS] B:7 [U] ✔
A:61 [ARG] B:48 [U] A:60 [ARG] B:54 [C] ✔
A:822 [GLY] B:23 [U] A:897 [TYR] B:23 [U] ✔
A:784 [SER] B:69 [C] A:780 [ASN] B:69 [U] ✔
A:784 [SER] B:70 [G] A:780 [ASN] B:70 [G] ✔
A:269 [THR] B:4 [A] A:260 [ASN] B:4 [A] ✔
A:70 [HIS] B:62 [G] A:69 [LYS] B:62 [A] ✔
A:102 [TYR] B:43 [U] A:89 [TYR] B:49 [U] ✔
A:102 [TYR] B:44 [A] A:89 [TYR] B:50 [A] ✔
A:788 [HIS] B:49 [A] A:784 [ILE] B:55 [A] ✔
A:130 [GLY] B:18 [G] A:117 [GLY] B:18 [G] ✔
A:130 [GLY] B:19 [G] A:117 [GLY] B:19 [G] ✔
A:128 [ARG] B:19 [G] A:115 [ARG] B:19 [G] ✔
A:128 [ARG] B:20 [C] A:115 [ARG] B:20 [C] ✔
A:128 [ARG] B:44 [A] A:115 [ARG] B:50 [A] ✔
A:128 [ARG] B:45 [A] A:115 [ARG] B:51 [A] ✔
A:60 [ARG] B:16 [U] A:59 [ARG] B:16 [U] ✔
A:60 [ARG] B:17 [U] A:59 [ARG] B:17 [U] ✔
A:60 [ARG] B:65 [U] A:59 [ARG] B:65 [G] ✔
A:60 [ARG] B:66 [C] A:59 [ARG] B:66 [C] ✔
A:63 [ALA] B:63 [A] A:62 [HIS] B:63 [A] ✔
A:63 [ALA] B:64 [C] A:62 [HIS] B:64 [U] ✔
A:95 [LYS] B:26 [A] A:84 [SER] B:26 [A] ✔
A:185 [ARG] B:19 [G] A:165 [ARG] B:19 [G] ✔
A:185 [ARG] B:20 [C] A:165 [ARG] B:20 [C] ✔
A:185 [ARG] B:43 [U] A:165 [ARG] B:49 [U] ✔
A:185 [ARG] B:44 [A] A:165 [ARG] B:50 [A] ✔
A:821 [ASN] B:47 [A] A:896 [ASP] B:53 [A] ✔
A:821 [ASN] B:50 [A] A:896 [ASP] B:56 [A] ✔
A:821 [ASN] B:51 [A] A:896 [ASP] B:57 [G] ✔
A:778 [PRO] B:78 [A] A:774 [ARG] B:73 [U] ✔
A:394 [LEU] B:5 [A] A:393 [HIS] B:5 [A] ✔
A:425 [VAL] B:2 [G] A:425 [PRO] B:2 [G] ✔
A:425 [VAL] B:3 [A] A:425 [PRO] B:3 [A] ✔
A:457 [LYS] B:72 [G] A:455 [ILE] B:72 [U] ✔
A:64 [ARG] B:18 [G] A:63 [ARG] B:18 [G] ✔
A:57 [ARG] B:17 [U] A:56 [LEU] B:17 [U] ✔
A:57 [ARG] B:18 [G] A:56 [LEU] B:18 [G] ✔
A:123 [LEU] B:45 [A] A:110 [LEU] B:51 [A] ✔
A:194 [CYS] B:19 [G] A:170 [ARG] B:19 [G] ✔
A:120 [ARG] B:45 [A] A:107 [ALA] B:51 [A] ✔
A:270 [ARG] B:5 [A] A:261 [ASP] B:5 [A] ✔
A:44 [LEU] B:70 [G] A:43 [ASN] B:70 [G] ✔
A:44 [LEU] B:71 [G] A:43 [ASN] B:71 [U] ✔
A:855 [ALA] B:50 [A] A:934 [ILE] B:56 [A] ✔
A:183 [ASN] B:42 [C] A:163 [GLU] B:48 [C] ✔
A:183 [ASN] B:43 [U] A:163 [GLU] B:49 [U] ✔
A:234 [ARG] B:16 [U] A:209 [ARG] B:16 [U] ✔
A:234 [ARG] B:17 [U] A:209 [ARG] B:17 [U] ✔
A:234 [ARG] B:64 [C] A:209 [ARG] B:64 [U] ✔
A:234 [ARG] B:65 [U] A:209 [ARG] B:65 [G] ✔
A:461 [LYS] B:78 [A] A:459 [LYS] B:73 [U] ✔
A:43 [SER] B:12 [G] A:41 [VAL] B:12 [G] ✔
A:43 [SER] B:13 [C] A:41 [VAL] B:13 [C] ✔
A:48 [ARG] B:14 [G] A:47 [ARG] B:14 [G] ✔
A:48 [ARG] B:68 [G] A:47 [ARG] B:68 [G] ✔
A:48 [ARG] B:69 [C] A:47 [ARG] B:69 [U] ✔
A:48 [ARG] B:70 [G] A:47 [ARG] B:70 [G] ✔
A:823 [LYS] B:23 [U] A:904 [VAL] B:23 [U] ✔
A:414 [TYR] B:3 [A] A:414 [GLN] B:3 [A] ✔
A:414 [TYR] B:4 [A] A:414 [GLN] B:4 [A] ✔
A:453 [LEU] B:71 [G] A:451 [LYS] B:71 [U] ✔
A:396 [ILE] B:4 [A] A:395 [LEU] B:4 [A] ✔
A:396 [ILE] B:5 [A] A:395 [LEU] B:5 [A] ✔
A:645 [ARG] B:1 [G] A:654 [ARG] B:1 [G] ✔
A:645 [ARG] B:2 [G] A:654 [ARG] B:2 [G] ✔
A:171 [PHE] B:43 [U] A:158 [LEU] B:49 [U] ✔
A:184 [VAL] B:42 [C] A:164 [VAL] B:48 [C] ✔
A:184 [VAL] B:43 [U] A:164 [VAL] B:49 [U] ✔
A:448 [THR] B:12 [G] A:446 [LEU] B:12 [G] ✔
A:786 [ALA] B:49 [A] A:782 [GLU] B:55 [A] ✔
A:786 [ALA] B:69 [C] A:782 [GLU] B:69 [U] ✔
A:794 [LYS] B:23 [U] A:790 [SER] B:23 [U] ✔
A:794 [LYS] B:24 [U] A:790 [SER] B:24 [U] ✔
A:237 [LYS] B:15 [C] A:214 [GLY] B:15 [C] ✔
A:237 [LYS] B:16 [U] A:214 [GLY] B:16 [U] ✔
A:785 [GLY] B:49 [A] A:781 [ARG] B:55 [A] ✔
A:785 [GLY] B:69 [C] A:781 [ARG] B:69 [U] ✔
A:785 [GLY] B:70 [G] A:781 [ARG] B:70 [G] ✔
A:124 [HIS] B:43 [U] A:111 [HIS] B:49 [U] ✔
A:124 [HIS] B:44 [A] A:111 [HIS] B:50 [A] ✔
A:124 [HIS] B:45 [A] A:111 [HIS] B:51 [A] ✔
A:67 [HIS] B:63 [A] A:66 [ARG] B:63 [A] ✔
A:67 [HIS] B:64 [C] A:66 [ARG] B:64 [U] ✔
A:129 [ARG] B:17 [U] A:116 [ARG] B:17 [U] ✔
A:129 [ARG] B:18 [G] A:116 [ARG] B:18 [G] ✔
A:129 [ARG] B:19 [G] A:116 [ARG] B:19 [G] ✔
A:52 [ARG] B:14 [G] A:51 [ARG] B:14 [G] ✔
A:52 [ARG] B:15 [C] A:51 [ARG] B:15 [C] ✔
A:52 [ARG] B:68 [G] A:51 [ARG] B:68 [G] ✔
A:49 [ARG] B:13 [C] A:48 [ARG] B:13 [C] ✔
A:49 [ARG] B:14 [G] A:48 [ARG] B:14 [G] ✔
A:49 [ARG] B:15 [C] A:48 [ARG] B:15 [C] ✔
A:782 [LYS] B:70 [G] A:778 [LYS] B:70 [G] ✔
A:782 [LYS] B:71 [G] A:778 [LYS] B:71 [U] ✔
A:236 [LEU] B:14 [G] A:211 [TYR] B:14 [G] ✔
A:236 [LEU] B:15 [C] A:211 [TYR] B:15 [C] ✔
A:236 [LEU] B:16 [U] A:211 [TYR] B:16 [U] ✔
A:65 [LEU] B:46 [A] A:64 [ILE] B:52 [A] ✔
A:181 [PHE] B:41 [A] A:162 [GLY] B:47 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:450 [PRO] B:70 [G] A:448 [PRO] B:70 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:450 [PRO] B:71 [G] A:448 [PRO] B:71 [U] ❌ 7EL1_A_B
A:51 [ALA] B:49 [A] A:50 [LYS] B:55 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:265 [PHE] B:5 [A] A:256 [TYR] B:5 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:191 [TYR] B:18 [G] A:167 [SER] B:18 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:46 [LEU] B:14 [G] A:45 [GLU] B:14 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:328 [TYR] B:7 [U] A:324 [THR] B:7 [U] ❌ 7EL1_A_B
A:61 [ARG] B:47 [A] A:60 [ARG] B:53 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:269 [THR] B:5 [A] A:260 [ASN] B:5 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:70 [HIS] B:63 [A] A:69 [LYS] B:63 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:128 [ARG] B:18 [G] A:115 [ARG] B:18 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:821 [ASN] B:48 [U] A:896 [ASP] B:54 [C] ❌ 7EL1_A_B
A:821 [ASN] B:49 [A] A:896 [ASP] B:55 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:66 [ASN] B:63 [A] A:65 [GLN] B:63 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:394 [LEU] B:6 [U] A:393 [HIS] B:6 [U] ❌ 7EL1_A_B
A:64 [ARG] B:17 [U] A:63 [ARG] B:17 [U] ❌ 7EL1_A_B
A:57 [ARG] B:19 [G] A:56 [LEU] B:19 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:270 [ARG] B:6 [U] A:261 [ASP] B:6 [U] ❌ 7EL1_A_B
A:44 [LEU] B:13 [C] A:43 [ASN] B:13 [C] ❌ 7EL1_A_B
A:823 [LYS] B:47 [A] A:904 [VAL] B:53 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:823 [LYS] B:48 [U] A:904 [VAL] B:54 [C] ❌ 7EL1_A_B
A:453 [LEU] B:72 [G] A:451 [LYS] B:72 [U] ❌ 7EL1_A_B
A:448 [THR] B:13 [C] A:446 [LEU] B:13 [C] ❌ 7EL1_A_B
A:237 [LYS] B:66 [C] A:214 [GLY] B:66 [C] ❌ 7EL1_A_B
A:237 [LYS] B:67 [U] A:214 [GLY] B:67 [C] ❌ 7EL1_A_B
A:52 [ARG] B:67 [U] A:51 [ARG] B:67 [C] ❌ 7EL1_A_B
A:782 [LYS] B:78 [A] A:778 [LYS] B:73 [U] ❌ 7EL1_A_B
A:130 [GLY] B:17 [U] A:117 [GLY] B:17 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:131 [TYR] B:17 [U] A:118 [VAL] B:17 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:171 [PHE] B:42 [C] A:158 [LEU] B:48 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:184 [VAL] B:20 [C] A:164 [VAL] B:20 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:191 [TYR] B:20 [C] A:167 [SER] B:20 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:194 [CYS] B:18 [G] A:170 [ARG] B:18 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:233 [LYS] B:18 [G] A:208 [ARG] B:18 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:233 [LYS] B:64 [C] A:208 [ARG] B:64 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:234 [ARG] B:66 [C] A:209 [ARG] B:66 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:257 [LYS] B:5 [A] A:248 [LYS] B:5 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:266 [VAL] B:4 [A] A:257 [ASN] B:4 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:328 [TYR] B:5 [A] A:324 [THR] B:5 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:394 [LEU] B:4 [A] A:393 [HIS] B:4 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:44 [LEU] B:69 [C] A:43 [ASN] B:69 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:448 [THR] B:11 [U] A:446 [LEU] B:11 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:46 [LEU] B:12 [G] A:45 [GLU] B:12 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:457 [LYS] B:78 [A] A:455 [ILE] B:73 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:461 [LYS] B:72 [G] A:459 [LYS] B:72 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:49 [ARG] B:12 [G] A:48 [ARG] B:12 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:58 [LEU] B:47 [A] A:57 [LYS] B:53 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:63 [ALA] B:62 [G] A:62 [HIS] B:62 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:63 [ALA] B:65 [U] A:62 [HIS] B:65 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:66 [ASN] B:62 [G] A:65 [GLN] B:62 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:66 [ASN] B:46 [A] A:65 [GLN] B:52 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:67 [HIS] B:62 [G] A:66 [ARG] B:62 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:778 [PRO] B:72 [G] A:774 [ARG] B:72 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:782 [LYS] B:69 [C] A:778 [LYS] B:69 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:782 [LYS] B:72 [G] A:778 [LYS] B:72 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:784 [SER] B:49 [A] A:780 [ASN] B:55 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:784 [SER] B:50 [A] A:780 [ASN] B:56 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:784 [SER] B:68 [G] A:780 [ASN] B:68 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:785 [GLY] B:71 [G] A:781 [ARG] B:71 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:786 [ALA] B:70 [G] A:782 [GLU] B:70 [G] ❌ 5X2H_A_B
A:790 [GLU] B:49 [A] A:786 [ASP] B:55 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:790 [GLU] B:48 [U] A:786 [ASP] B:54 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:793 [ARG] B:22 [U] A:789 [TYR] B:22 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:821 [ASN] B:46 [A] A:896 [ASP] B:52 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:822 [GLY] B:48 [U] A:897 [TYR] B:54 [C] ❌ 5X2H_A_B
A:822 [GLY] B:47 [A] A:897 [TYR] B:53 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:822 [GLY] B:24 [U] A:897 [TYR] B:24 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:822 [GLY] B:46 [A] A:897 [TYR] B:52 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:823 [LYS] B:24 [U] A:904 [VAL] B:24 [U] ❌ 5X2H_A_B
A:854 [PHE] B:50 [A] A:933 [VAL] B:56 [A] ❌ 5X2H_A_B
A:181 [PHE] B:28 [U] A:162 [GLY] B:28 [U] ❌ 7EL1_B:28 no longer at interface
A:98 [LEU] B:27 [G] A:86 [ILE] B:27 [G] ❌ 7EL1_A:86, 7EL1_B:27 no longer at interface
A:98 [LEU] B:28 [U] A:86 [ILE] B:28 [U] ❌ 7EL1_A:86, 7EL1_B:28 no longer at interface
A:792 [PHE] B:21 [G] A:788 [LEU] B:21 [G] ❌ 7EL1_B:21 no longer at interface
A:97 [SER] B:27 [G] A:85 [GLY] B:27 [G] ❌ 7EL1_A:85, 7EL1_B:27 no longer at interface
A:97 [SER] B:28 [U] A:85 [GLY] B:28 [U] ❌ 7EL1_A:85, 7EL1_B:28 no longer at interface
A:186 [ASN] B:21 [G] A:166 [GLY] B:21 [G] ❌ 7EL1_B:21 no longer at interface
A:172 [GLN] B:28 [U] A:159 [LYS] B:28 [U] ❌ 7EL1_A:159, 7EL1_B:28 no longer at interface
A:796 [GLU] B:38 [G] A:792 [ARG] B:44 [U] ❌ 5X2H_A:796, 5X2H_B:38 no longer at interface
A:796 [GLU] B:39 [G] A:792 [ARG] B:45 [C] ❌ 5X2H_A:796, 5X2H_B:39 no longer at interface
A:242 [LEU] B:14 [G] A:233 [LEU] B:14 [G] ❌ 7EL1_A:233 no longer at interface
A:54 [ALA] B:49 [A] A:53 [ALA] B:55 [A] ❌ 7EL1_A:53 no longer at interface
A:437 [ALA] B:72 [G] A:437 [PRO] B:72 [U] ❌ 7EL1_A:437 no longer at interface
A:649 [ASN] B:1 [G] A:658 [ASN] B:1 [G] ❌ 7EL1_A:658 no longer at interface
A:649 [ASN] B:2 [G] A:658 [ASN] B:2 [G] ❌ 7EL1_A:658 no longer at interface
A:74 [ASN] B:63 [A] A:73 [ASP] B:63 [A] ❌ 7EL1_A:73 no longer at interface
A:781 [LYS] B:78 [A] A:777 [LYS] B:73 [U] ❌ 7EL1_A:777 no longer at interface
A:30 [ARG] B:78 [A] A:34 [ARG] B:73 [U] ❌ 7EL1_A:34 no longer at interface
A:98 [LEU] B:44 [A] A:86 [ILE] B:50 [A] ❌ 7EL1_A:86 no longer at interface
A:449 [ASN] B:11 [U] A:447 [SER] B:11 [U] ❌ 7EL1_A:447 no longer at interface
A:449 [ASN] B:12 [G] A:447 [SER] B:12 [G] ❌ 7EL1_A:447 no longer at interface
A:449 [ASN] B:13 [C] A:447 [SER] B:13 [C] ❌ 7EL1_A:447 no longer at interface
A:856 [LEU] B:50 [A] A:935 [LYS] B:56 [A] ❌ 7EL1_A:935 no longer at interface
A:53 [SER] B:15 [C] A:52 [GLY] B:15 [C] ❌ 7EL1_A:52 no longer at interface
A:53 [SER] B:16 [U] A:52 [GLY] B:16 [U] ❌ 7EL1_A:52 no longer at interface
A:53 [SER] B:17 [U] A:52 [GLY] B:17 [U] ❌ 7EL1_A:52 no longer at interface
A:172 [GLN] B:42 [C] A:159 [LYS] B:48 [C] ❌ 7EL1_A:159 no longer at interface
A:779 [GLU] B:78 [A] A:775 [VAL] B:73 [U] ❌ 7EL1_A:775 no longer at interface
A:197 [GLN] B:18 [G] A:173 [THR] B:18 [G] ❌ 7EL1_A:173 no longer at interface
A:71 [LEU] B:63 [A] A:70 [LEU] B:63 [A] ❌ 7EL1_A:70 no longer at interface
A:273 [ASN] B:4 [A] A:264 [ASN] B:4 [A] ❌ 7EL1_A:264 no longer at interface
A:94 [TYR] B:26 [A] A:83 [LEU] B:26 [A] ❌ 7EL1_A:83 no longer at interface
A:94 [TYR] B:44 [A] A:83 [LEU] B:50 [A] ❌ 7EL1_A:83 no longer at interface
A:94 [TYR] B:45 [A] A:83 [LEU] B:51 [A] ❌ 7EL1_A:83 no longer at interface
A:69 [LYS] B:45 [A] A:68 [LYS] B:51 [A] ❌ 7EL1_A:68 no longer at interface
A:69 [LYS] B:46 [A] A:68 [LYS] B:52 [A] ❌ 7EL1_A:68 no longer at interface
A:439 [ASN] B:72 [G] A:439 [THR] B:72 [U] ❌ 7EL1_A:439 no longer at interface
A:175 [LYS] B:41 [A] A:161 [ASP] B:47 [A] ❌ 7EL1_A:161 no longer at interface
A:820 [VAL] B:49 [A] A:894 [THR] B:55 [A] ❌ 7EL1_A:894 no longer at interface
A:820 [VAL] B:50 [A] A:894 [THR] B:56 [A] ❌ 7EL1_A:894 no longer at interface
A:193 [ARG] B:20 [C] A:169 [ASN] B:20 [C] ❌ 5X2H_A:193 no longer at interface
A:193 [ARG] B:19 [G] A:169 [ASN] B:19 [G] ❌ 5X2H_A:193 no longer at interface
A:200 [LEU] B:19 [G] A:176 [TYR] B:19 [G] ❌ 5X2H_A:200 no longer at interface
A:232 [TYR] B:64 [C] A:207 [THR] B:64 [U] ❌ 5X2H_A:232 no longer at interface
A:258 [ASN] B:6 [U] A:249 [TYR] B:6 [U] ❌ 5X2H_A:258 no longer at interface
A:258 [ASN] B:7 [U] A:249 [TYR] B:7 [U] ❌ 5X2H_A:258 no longer at interface
A:263 [PHE] B:6 [U] A:254 [ASP] B:6 [U] ❌ 5X2H_A:263 no longer at interface
A:326 [GLY] B:6 [U] A:322 [GLU] B:6 [U] ❌ 5X2H_A:326 no longer at interface
A:415 [ASP] B:3 [A] A:415 [ILE] B:3 [A] ❌ 5X2H_A:415 no longer at interface
A:415 [ASP] B:2 [G] A:415 [ILE] B:2 [G] ❌ 5X2H_A:415 no longer at interface
A:458 [GLU] B:78 [A] A:456 [GLN] B:73 [U] ❌ 5X2H_A:458 no longer at interface
A:59 [ALA] B:66 [C] A:58 [ARG] B:66 [C] ❌ 5X2H_A:59 no longer at interface
A:59 [ALA] B:67 [U] A:58 [ARG] B:67 [C] ❌ 5X2H_A:59 no longer at interface
A:789 [GLU] B:49 [A] A:785 [ASN] B:55 [A] ❌ 5X2H_A:789 no longer at interface
A:796 [GLU] B:24 [U] A:792 [ARG] B:24 [U] ❌ 5X2H_A:796 no longer at interface
A:817 [ILE] B:50 [A] A:891 [LEU] B:56 [A] ❌ 5X2H_A:817 no longer at interface
A:819 [LYS] B:50 [A] A:893 [ILE] B:56 [A] ❌ 5X2H_A:819 no longer at interface
A:825 [VAL] B:49 [A] A:906 [LYS] B:55 [A] ❌ 5X2H_A:825 no longer at interface
A:825 [VAL] B:48 [U] A:906 [LYS] B:54 [C] ❌ 5X2H_A:825 no longer at interface
A:825 [VAL] B:50 [A] A:906 [LYS] B:56 [A] ❌ 5X2H_A:825 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
CRISPR-associated endonuclease Cas9 wedge domain & Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 0.81 2.06 0.19 0.82 0.6 0.62 0.87 0.68 0.51 0.38 0.46


Other pairs involving 5X2H_A_B or 7EL1_A_B

Total number of entries: 15

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
4OO8_A_B 5X2H_A_B 0.54 0.74 3.37 0.16 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2S_B_A 5X2H_A_B 0.54 0.75 3.21 0.15 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FQ5_B_A 5X2H_A_B 0.55 0.75 3.12 0.15 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2T_B_A 5X2H_A_B 0.53 0.75 3.2 0.16 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FW1_B_A 5X2H_A_B 0.56 0.75 3.12 0.16 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2R_B_A 5X2H_A_B 0.54 0.75 3.21 0.15 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 7EL1_A_B 0.65 0.71 2.09 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2S_B_A 7EL1_A_B 0.63 0.73 1.98 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FQ5_B_A 7EL1_A_B 0.63 0.73 1.97 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5X2H_A_B 7EL1_A_B 0.68 0.81 2.06 0.19 CRISPR-associated endonuclease Cas9 wedge domain & Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2T_B_A 7EL1_A_B 0.64 0.73 1.93 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FW1_B_A 7EL1_A_B 0.65 0.73 2.0 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2R_B_A 7EL1_A_B 0.63 0.73 1.96 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5X2H_A_B 7OX9_B_A 0.54 0.75 3.13 0.15 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
7EL1_A_B 7OX9_B_A 0.63 0.73 1.92 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare