Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
ChainChain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity Electrostatics (surface only) Conservation*
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show as licoriceshow Accessibility
Rim - Core
Contacts -
7EL1_A
|
7EL1_B
|
Distance
|
Base Pair
|
Hbond nuc:res
|
Base Stacking
|
Residue conservation
|
---|---|---|---|---|---|---|
A:41 [VAL] | B:12 [G] | 3.33 | C:17 [DC] | 80.88 | ||
A:41 [VAL] | B:13 [C] | 3.38 | C:16 [DG] | 80.88 | ||
A:43 [ASN] | B:69 [U] | 4.31 | 57.19 | |||
A:43 [ASN] | B:70 [G] | 3.76 | 57.19 | |||
A:43 [ASN] | B:71 [U] | 4.63 | 57.19 | |||
A:44 [ASN] | B:13 [C] | 3.12 | C:16 [DG] | 97.32 | ||
A:44 [ASN] | B:14 [G] | 3.07 | C:15 [DC] | 97.32 | ||
A:44 [ASN] | B:70 [G] | 3.56 | 97.32 | |||
A:45 [GLU] | B:12 [G] | 4.04 | C:17 [DC] | 26.45 | ||
A:45 [GLU] | B:13 [C] | 4.49 | C:16 [DG] | 26.45 | ||
A:46 [GLY] | B:69 [U] | 4.22 | 46.91 | |||
A:47 [ARG] | B:14 [G] | 4.41 | C:15 [DC] | 98.75 | ||
A:47 [ARG] | B:68 [G] | 3.83 | B:56 [A] | 98.75 | ||
A:47 [ARG] | B:69 [U] | 3.07 | 98.75 | |||
A:47 [ARG] | B:70 [G] | 3.34 | base/AA stacks | 98.75 | ||
A:48 [ARG] | B:12 [G] | 4.94 | C:17 [DC] | 98.92 | ||
A:48 [ARG] | B:13 [C] | 2.61 | C:16 [DG] | 98.92 | ||
A:48 [ARG] | B:14 [G] | 3.11 | C:15 [DC] | 98.92 | ||
A:48 [ARG] | B:15 [C] | 4.46 | C:14 [DG] | 98.92 | ||
A:50 [LYS] | B:69 [U] | 3.09 | 29.2 | |||
A:51 [ARG] | B:14 [G] | 3.57 | C:15 [DC] | 98.77 | ||
A:51 [ARG] | B:15 [C] | 3.01 | C:14 [DG] | 98.77 | ||
A:51 [ARG] | B:68 [G] | 3.59 | B:56 [A] | 98.77 | ||
A:54 [ARG] | B:55 [A] | 4.09 | 95.99 | |||
A:54 [ARG] | B:68 [G] | 3.04 | B:56 [A] | base/AA stacks | 95.99 | |
A:54 [ARG] | B:69 [U] | 3.03 | 95.99 | |||
A:55 [ARG] | B:15 [C] | 2.85 | C:14 [DG] | 98.77 | ||
A:55 [ARG] | B:16 [U] | 2.85 | C:13 [DA] | 98.77 | ||
A:55 [ARG] | B:66 [C] | 4.92 | B:58 [G] | 98.77 | ||
A:55 [ARG] | B:67 [C] | 2.77 | B:57 [G] | 98.77 | ||
A:56 [LEU] | B:17 [U] | 3.53 | C:12 [DA] | 77.19 | ||
A:56 [LEU] | B:18 [G] | 3.55 | C:11 [DC] | 77.19 | ||
A:57 [LYS] | B:53 [A] | 4.85 | B:22 [U] | 37.33 | ||
A:57 [LYS] | B:54 [C] | 2.67 | B:21 [G] | 37.33 | ||
A:57 [LYS] | B:55 [A] | 2.77 | 37.33 | |||
A:58 [ARG] | B:66 [C] | 3.1 | B:58 [G] | base/AA stacks | 92.71 | |
A:58 [ARG] | B:67 [C] | 2.95 | B:57 [G] | 92.71 | ||
A:59 [ARG] | B:16 [U] | 2.79 | C:13 [DA] | 98.77 | ||
A:59 [ARG] | B:17 [U] | 2.59 | C:12 [DA] | 98.77 | ||
A:59 [ARG] | B:65 [G] | 3.28 | B:59 [C] | 98.77 | ||
A:59 [ARG] | B:66 [C] | 2.87 | B:58 [G] | 98.77 | ||
A:60 [ARG] | B:54 [C] | 4.56 | B:21 [G] | 75.34 | ||
A:61 [ARG] | B:53 [A] | 3.26 | B:22 [U] | 44.96 | ||
A:61 [ARG] | B:54 [C] | 2.88 | B:21 [G] | 44.96 | ||
A:62 [HIS] | B:62 [A] | 4.91 | 78.0 | |||
A:62 [HIS] | B:63 [A] | 2.75 | B:60 [A] | sugar:SC | 78.0 | |
A:62 [HIS] | B:64 [U] | 4.41 | 78.0 | |||
A:62 [HIS] | B:65 [G] | 3.59 | B:59 [C] | 78.0 | ||
A:63 [ARG] | B:18 [G] | 3.53 | C:11 [DC] | 98.77 | ||
A:64 [ILE] | B:52 [A] | 3.66 | B:23 [U] | 66.89 | ||
A:65 [GLN] | B:52 [A] | 4.4 | B:23 [U] | 25.71 | ||
A:65 [GLN] | B:62 [A] | 4.24 | 25.71 | |||
A:66 [ARG] | B:62 [A] | 4.2 | 89.26 | |||
A:66 [ARG] | B:63 [A] | 4.33 | B:60 [A] | 89.26 | ||
A:66 [ARG] | B:64 [U] | 3.29 | 89.26 | |||
A:69 [LYS] | B:62 [A] | 3.54 | 34.45 | |||
A:84 [SER] | B:26 [A] | 4.92 | B:49 [U] | 37.2 | ||
A:87 [ASN] | B:49 [U] | 4.36 | B:26 [A] | 82.56 | ||
A:88 [PRO] | B:49 [U] | 4.34 | B:26 [A] | 86.36 | ||
A:88 [PRO] | B:50 [A] | 3.53 | B:25 [U] | 86.36 | ||
A:89 [TYR] | B:49 [U] | 3.26 | B:26 [A] | 91.46 | ||
A:89 [TYR] | B:50 [A] | 2.7 | B:25 [U] | 91.46 | ||
A:107 [ALA] | B:51 [A] | 4.96 | B:24 [U] | 38.84 | ||
A:110 [LEU] | B:51 [A] | 4.32 | B:24 [U] | 20.08 | ||
A:111 [HIS] | B:49 [U] | 4.82 | B:26 [A] | 88.13 | ||
A:111 [HIS] | B:50 [A] | 2.91 | B:25 [U] | 88.13 | ||
A:111 [HIS] | B:51 [A] | 3.7 | B:24 [U] | 88.13 | ||
A:114 [LYS] | B:19 [G] | 4.62 | C:10 [DC] | 95.89 | ||
A:114 [LYS] | B:51 [A] | 2.72 | B:24 [U] | 95.89 | ||
A:114 [LYS] | B:52 [A] | 2.87 | B:23 [U] | 95.89 | ||
A:115 [ARG] | B:19 [G] | 3.23 | C:10 [DC] | 88.57 | ||
A:115 [ARG] | B:20 [C] | 3.81 | C:9 [DG] | 88.57 | ||
A:115 [ARG] | B:50 [A] | 3.34 | B:25 [U] | 88.57 | ||
A:115 [ARG] | B:51 [A] | 4.71 | B:24 [U] | 88.57 | ||
A:116 [ARG] | B:17 [U] | 3.28 | C:12 [DA] | 98.95 | ||
A:116 [ARG] | B:18 [G] | 2.73 | C:11 [DC] | 98.95 | ||
A:116 [ARG] | B:19 [G] | 3.6 | C:10 [DC] | 98.95 | ||
A:117 [GLY] | B:17 [U] | 4.42 | C:12 [DA] | 98.69 | ||
A:117 [GLY] | B:18 [G] | 3.09 | C:11 [DC] | 98.69 | ||
A:117 [GLY] | B:19 [G] | 3.01 | C:10 [DC] | 98.69 | ||
A:118 [VAL] | B:17 [U] | 4.74 | C:12 [DA] | 87.06 | ||
A:118 [VAL] | B:18 [G] | 3.21 | C:11 [DC] | 87.06 | ||
A:119 [HIS] | B:17 [U] | 4.18 | C:12 [DA] | 85.36 | ||
A:134 [THR] | B:18 [G] | 4.84 | C:11 [DC] | 67.08 | ||
A:158 [LEU] | B:48 [C] | 3.87 | B:27 [G] | 70.0 | ||
A:158 [LEU] | B:49 [U] | 3.97 | B:26 [A] | 70.0 | ||
A:162 [GLY] | B:48 [C] | 2.89 | B:27 [G] | sugar:BB | 70.94 | |
A:163 [GLU] | B:48 [C] | 3.39 | B:27 [G] | 49.97 | ||
A:163 [GLU] | B:49 [U] | 3.65 | B:26 [A] | 49.97 | ||
A:164 [VAL] | B:20 [C] | 5.0 | C:9 [DG] | 80.28 | ||
A:164 [VAL] | B:48 [C] | 4.19 | B:27 [G] | 80.28 | ||
A:164 [VAL] | B:49 [U] | 2.82 | B:26 [A] | 80.28 | ||
A:165 [ARG] | B:19 [G] | 4.88 | C:10 [DC] | 95.25 | ||
A:165 [ARG] | B:20 [C] | 2.72 | C:9 [DG] | 95.25 | ||
A:165 [ARG] | B:49 [U] | 2.75 | B:26 [A] | 95.25 | ||
A:165 [ARG] | B:50 [A] | 2.94 | B:25 [U] | 95.25 | ||
A:166 [GLY] | B:19 [G] | 2.77 | C:10 [DC] | sugar:BB | 86.33 | |
A:166 [GLY] | B:20 [C] | 2.98 | C:9 [DG] | 86.33 | ||
A:167 [SER] | B:19 [G] | 3.92 | C:10 [DC] | 49.52 | ||
A:167 [SER] | B:20 [C] | 4.66 | C:9 [DG] | 49.52 | ||
A:169 [ASN] | B:19 [G] | 3.39 | C:10 [DC] | 79.73 | ||
A:169 [ASN] | B:20 [C] | 3.18 | C:9 [DG] | 79.73 | ||
A:170 [ARG] | B:18 [G] | 4.39 | C:11 [DC] | 57.95 | ||
A:170 [ARG] | B:19 [G] | 3.38 | C:10 [DC] | 57.95 | ||
A:176 [TYR] | B:19 [G] | 4.32 | C:10 [DC] | 91.81 | ||
A:207 [THR] | B:64 [U] | 3.52 | 79.86 | |||
A:208 [ARG] | B:16 [U] | 3.81 | C:13 [DA] | 91.48 | ||
A:208 [ARG] | B:17 [U] | 2.97 | C:12 [DA] | sugar:SC | 91.48 | |
A:208 [ARG] | B:18 [G] | 4.6 | C:11 [DC] | 91.48 | ||
A:208 [ARG] | B:64 [U] | 3.32 | 91.48 | |||
A:209 [ARG] | B:16 [U] | 2.55 | C:13 [DA] | sugar:BB | 98.95 | |
A:209 [ARG] | B:17 [U] | 2.96 | C:12 [DA] | 98.95 | ||
A:209 [ARG] | B:64 [U] | 3.44 | base/AA stacks | 98.95 | ||
A:209 [ARG] | B:65 [G] | 2.8 | B:59 [C] | 98.95 | ||
A:209 [ARG] | B:66 [C] | 3.71 | B:58 [G] | 98.95 | ||
A:210 [THR] | B:15 [C] | 3.89 | C:14 [DG] | sugar:BB | 59.5 | |
A:210 [THR] | B:16 [U] | 3.56 | C:13 [DA] | 59.5 | ||
A:211 [TYR] | B:14 [G] | 4.68 | C:15 [DC] | 92.17 | ||
A:211 [TYR] | B:15 [C] | 2.55 | C:14 [DG] | sugar:BB | 92.17 | |
A:211 [TYR] | B:16 [U] | 3.76 | C:13 [DA] | 92.17 | ||
A:212 [TYR] | B:15 [C] | 4.55 | C:14 [DG] | 70.08 | ||
A:213 [GLU] | B:15 [C] | 4.9 | C:14 [DG] | 63.52 | ||
A:213 [GLU] | B:64 [U] | 2.8 | base:SC | 63.52 | ||
A:214 [GLY] | B:15 [C] | 3.41 | C:14 [DG] | 98.16 | ||
A:214 [GLY] | B:16 [U] | 3.53 | C:13 [DA] | 98.16 | ||
A:215 [PRO] | B:15 [C] | 3.51 | C:14 [DG] | 98.77 | ||
A:215 [PRO] | B:16 [U] | 3.35 | C:13 [DA] | 98.77 | ||
A:215 [PRO] | B:66 [C] | 3.53 | B:58 [G] | 98.77 | ||
A:215 [PRO] | B:67 [C] | 4.26 | B:57 [G] | 98.77 | ||
A:216 [GLY] | B:65 [G] | 3.63 | B:59 [C] | 98.67 | ||
A:216 [GLY] | B:66 [C] | 2.76 | B:58 [G] | 98.67 | ||
A:217 [GLU] | B:65 [G] | 3.74 | B:59 [C] | 80.75 | ||
A:217 [GLU] | B:66 [C] | 3.74 | B:58 [G] | 80.75 | ||
A:218 [GLY] | B:66 [C] | 3.82 | B:58 [G] | 53.61 | ||
A:219 [SER] | B:66 [C] | 3.21 | B:58 [G] | 94.52 | ||
A:219 [SER] | B:67 [C] | 2.55 | B:57 [G] | 94.52 | ||
A:220 [PRO] | B:66 [C] | 4.65 | B:58 [G] | 72.69 | ||
A:220 [PRO] | B:67 [C] | 3.55 | B:57 [G] | 72.69 | ||
A:221 [PHE] | B:14 [G] | 3.47 | C:15 [DC] | 84.1 | ||
A:221 [PHE] | B:15 [C] | 3.22 | C:14 [DG] | 84.1 | ||
A:221 [PHE] | B:67 [C] | 3.78 | B:57 [G] | 84.1 | ||
A:221 [PHE] | B:68 [G] | 3.46 | B:56 [A] | 84.1 | ||
A:223 [TRP] | B:14 [G] | 4.06 | C:15 [DC] | 73.59 | ||
A:223 [TRP] | B:15 [C] | 3.78 | C:14 [DG] | 73.59 | ||
A:238 [THR] | B:3 [A] | 3.85 | C:26 [DT] | 85.22 | ||
A:238 [THR] | B:4 [A] | 2.51 | C:25 [DT] | 85.22 | ||
A:239 [TYR] | B:3 [A] | 2.66 | C:26 [DT] | sugar:SC | 72.91 | |
A:248 [LYS] | B:5 [A] | 4.85 | C:24 [DT] | 72.6 | ||
A:248 [LYS] | B:6 [U] | 2.94 | C:23 [DA] | 72.6 | ||
A:248 [LYS] | B:7 [U] | 4.98 | C:22 [DA] | 72.6 | ||
A:249 [TYR] | B:6 [U] | 4.69 | C:23 [DA] | 54.56 | ||
A:249 [TYR] | B:7 [U] | 4.95 | C:22 [DA] | 54.56 | ||
A:254 [ASP] | B:6 [U] | 4.99 | C:23 [DA] | 87.14 | ||
A:256 [TYR] | B:4 [A] | 3.08 | C:25 [DT] | sugar:SC | 77.68 | |
A:257 [ASN] | B:4 [A] | 4.09 | C:25 [DT] | 94.18 | ||
A:257 [ASN] | B:5 [A] | 3.4 | C:24 [DT] | 94.18 | ||
A:257 [ASN] | B:6 [U] | 4.66 | C:23 [DA] | 94.18 | ||
A:260 [ASN] | B:4 [A] | 4.48 | C:25 [DT] | 97.5 | ||
A:261 [ASP] | B:5 [A] | 4.95 | C:24 [DT] | 95.84 | ||
A:314 [ARG] | B:5 [A] | 3.2 | C:24 [DT] | 95.84 | ||
A:314 [ARG] | B:6 [U] | 3.18 | C:23 [DA] | sugar:SC | 95.84 | |
A:322 [GLU] | B:6 [U] | 4.03 | C:23 [DA] | 58.34 | ||
A:324 [THR] | B:5 [A] | 4.76 | C:24 [DT] | 94.26 | ||
A:393 [HIS] | B:4 [A] | 3.65 | C:25 [DT] | 94.18 | ||
A:393 [HIS] | B:5 [A] | 3.47 | C:24 [DT] | 94.18 | ||
A:394 [ASN] | B:4 [A] | 3.63 | C:25 [DT] | 87.41 | ||
A:394 [ASN] | B:5 [A] | 2.81 | C:24 [DT] | 87.41 | ||
A:395 [LEU] | B:4 [A] | 4.12 | C:25 [DT] | 90.67 | ||
A:395 [LEU] | B:5 [A] | 4.86 | C:24 [DT] | 90.67 | ||
A:414 [GLN] | B:3 [A] | 2.88 | C:26 [DT] | base:SC, sugar:SC | 93.52 | |
A:414 [GLN] | B:4 [A] | 3.34 | C:25 [DT] | 93.52 | ||
A:415 [ILE] | B:2 [G] | 3.73 | C:27 [DC] | 91.41 | ||
A:415 [ILE] | B:3 [A] | 3.88 | C:26 [DT] | 91.41 | ||
A:425 [PRO] | B:2 [G] | 4.76 | C:27 [DC] | 54.62 | ||
A:425 [PRO] | B:3 [A] | 4.12 | C:26 [DT] | 54.62 | ||
A:446 [LEU] | B:11 [U] | 3.78 | C:18 [DA] | 84.33 | ||
A:446 [LEU] | B:12 [G] | 4.6 | C:17 [DC] | 84.33 | ||
A:448 [PRO] | B:12 [G] | 4.6 | C:17 [DC] | 96.63 | ||
A:448 [PRO] | B:13 [C] | 4.94 | C:16 [DG] | 96.63 | ||
A:451 [LYS] | B:71 [U] | 4.56 | 76.1 | |||
A:452 [ARG] | B:71 [U] | 2.94 | 93.85 | |||
A:452 [ARG] | B:72 [U] | 2.8 | 93.85 | |||
A:455 [ILE] | B:72 [U] | 3.97 | 65.32 | |||
A:455 [ILE] | B:73 [U] | 4.33 | 65.32 | |||
A:456 [GLN] | B:73 [U] | 3.96 | 90.08 | |||
A:459 [LYS] | B:72 [U] | 4.5 | 85.1 | |||
A:459 [LYS] | B:73 [U] | 3.22 | 85.1 | |||
A:485 [LYS] | B:11 [U] | 2.89 | C:18 [DA] | 39.53 | ||
A:485 [LYS] | B:12 [G] | 3.02 | C:17 [DC] | 39.53 | ||
A:486 [ASP] | B:11 [U] | 4.76 | C:18 [DA] | 73.61 | ||
A:489 [LYS] | B:11 [U] | 3.29 | C:18 [DA] | 70.6 | ||
A:489 [LYS] | B:12 [G] | 3.06 | C:17 [DC] | 70.6 | ||
A:649 [THR] | B:1 [G] | 3.46 | C:28 [DC] | 99.0 | ||
A:654 [ARG] | B:1 [G] | 4.06 | C:28 [DC] | 88.41 | ||
A:654 [ARG] | B:2 [G] | 3.77 | C:27 [DC] | 88.41 | ||
A:774 [ARG] | B:72 [U] | 3.16 | 86.15 | |||
A:774 [ARG] | B:73 [U] | 3.96 | 86.15 | |||
A:778 [LYS] | B:69 [U] | 4.84 | 97.27 | |||
A:778 [LYS] | B:70 [G] | 2.86 | 97.27 | |||
A:778 [LYS] | B:71 [U] | 3.83 | 97.27 | |||
A:778 [LYS] | B:72 [U] | 4.91 | 97.27 | |||
A:780 [ASN] | B:55 [A] | 2.84 | base:SC | 98.92 | ||
A:780 [ASN] | B:56 [A] | 4.68 | B:68 [G] | 98.92 | ||
A:780 [ASN] | B:68 [G] | 3.17 | B:56 [A] | sugar:SC | 98.92 | |
A:780 [ASN] | B:69 [U] | 3.11 | 98.92 | |||
A:780 [ASN] | B:70 [G] | 3.65 | 98.92 | |||
A:781 [ARG] | B:55 [A] | 3.16 | base:BB | 98.39 | ||
A:781 [ARG] | B:69 [U] | 3.66 | 98.39 | |||
A:781 [ARG] | B:70 [G] | 2.87 | 98.39 | |||
A:781 [ARG] | B:71 [U] | 2.87 | 98.39 | |||
A:782 [GLU] | B:55 [A] | 3.69 | 69.04 | |||
A:782 [GLU] | B:69 [U] | 3.52 | 69.04 | |||
A:782 [GLU] | B:70 [G] | 4.94 | 69.04 | |||
A:783 [LEU] | B:55 [A] | 3.15 | base:BB | 71.87 | ||
A:783 [LEU] | B:56 [A] | 3.46 | B:68 [G] | 71.87 | ||
A:784 [ILE] | B:55 [A] | 3.77 | 83.65 | |||
A:785 [ASN] | B:55 [A] | 4.93 | 87.66 | |||
A:786 [ASP] | B:54 [C] | 4.48 | B:21 [G] | 87.3 | ||
A:786 [ASP] | B:55 [A] | 4.52 | 87.3 | |||
A:786 [ASP] | B:69 [U] | 4.24 | 87.3 | |||
A:787 [THR] | B:22 [U] | 3.78 | B:53 [A] | 95.87 | ||
A:788 [LEU] | B:22 [U] | 2.62 | B:53 [A] | sugar:BB, sugar:BB | 89.8 | |
A:788 [LEU] | B:23 [U] | 3.38 | B:52 [A] | 89.8 | ||
A:788 [LEU] | B:53 [A] | 3.82 | B:22 [U] | 89.8 | ||
A:788 [LEU] | B:54 [C] | 4.27 | B:21 [G] | 89.8 | ||
A:789 [TYR] | B:22 [U] | 4.66 | B:53 [A] | 87.65 | ||
A:789 [TYR] | B:23 [U] | 4.4 | B:52 [A] | 87.65 | ||
A:790 [SER] | B:23 [U] | 3.45 | B:52 [A] | 93.75 | ||
A:790 [SER] | B:24 [U] | 2.93 | B:51 [A] | 93.75 | ||
A:792 [ARG] | B:24 [U] | 4.55 | B:51 [A] | 96.88 | ||
A:792 [ARG] | B:44 [U] | 4.69 | 96.88 | |||
A:792 [ARG] | B:45 [C] | 2.74 | 96.88 | |||
A:804 [ASN] | B:22 [U] | 3.8 | B:53 [A] | 86.84 | ||
A:804 [ASN] | B:23 [U] | 2.74 | B:52 [A] | 86.84 | ||
A:828 [LEU] | B:45 [C] | 3.61 | 93.75 | |||
A:829 [MET] | B:45 [C] | 3.48 | 90.51 | |||
A:832 [HIS] | B:43 [A] | 4.13 | B:30 [C] | 72.12 | ||
A:832 [HIS] | B:44 [U] | 3.41 | 72.12 | |||
A:832 [HIS] | B:45 [C] | 3.41 | 72.12 | |||
A:833 [ASP] | B:45 [C] | 3.34 | 97.75 | |||
A:835 [GLN] | B:31 [U] | 2.55 | B:42 [A] | sugar:SC | 69.12 | |
A:835 [GLN] | B:32 [C] | 4.09 | B:41 [G] | 69.12 | ||
A:867 [LYS] | B:30 [C] | 2.88 | B:43 [A] | 98.62 | ||
A:867 [LYS] | B:31 [U] | 4.94 | B:42 [A] | 98.62 | ||
A:867 [LYS] | B:45 [C] | 2.33 | base:SC | 98.62 | ||
A:867 [LYS] | B:46 [U] | 3.36 | B:29 [A] | 98.62 | ||
A:868 [TYR] | B:30 [C] | 2.96 | B:43 [A] | sugar:BB | 78.34 | |
A:868 [TYR] | B:31 [U] | 3.41 | B:42 [A] | 78.34 | ||
A:868 [TYR] | B:32 [C] | 4.72 | B:41 [G] | 78.34 | ||
A:869 [SER] | B:30 [C] | 3.14 | B:43 [A] | 87.92 | ||
A:869 [SER] | B:31 [U] | 3.47 | B:42 [A] | 87.92 | ||
A:870 [LYS] | B:30 [C] | 4.61 | B:43 [A] | 91.92 | ||
A:870 [LYS] | B:31 [U] | 2.96 | B:42 [A] | 91.92 | ||
A:870 [LYS] | B:32 [C] | 2.98 | B:41 [G] | 91.92 | ||
A:871 [LYS] | B:31 [U] | 4.61 | B:42 [A] | 78.67 | ||
A:873 [ASN] | B:30 [C] | 4.06 | B:43 [A] | 88.37 | ||
A:874 [GLY] | B:30 [C] | 4.75 | B:43 [A] | 94.46 | ||
A:875 [PRO] | B:29 [A] | 4.5 | B:46 [U] | 92.37 | ||
A:875 [PRO] | B:30 [C] | 4.72 | B:43 [A] | 92.37 | ||
A:875 [PRO] | B:46 [U] | 3.44 | B:29 [A] | 92.37 | ||
A:875 [PRO] | B:47 [A] | 3.67 | B:28 [U] | 92.37 | ||
A:876 [VAL] | B:46 [U] | 3.36 | B:29 [A] | 38.35 | ||
A:876 [VAL] | B:47 [A] | 3.17 | B:28 [U] | 38.35 | ||
A:877 [ILE] | B:46 [U] | 3.34 | B:29 [A] | 88.63 | ||
A:877 [ILE] | B:47 [A] | 4.08 | B:28 [U] | 88.63 | ||
A:878 [LYS] | B:46 [U] | 4.01 | B:29 [A] | 63.65 | ||
A:878 [LYS] | B:47 [A] | 2.96 | B:28 [U] | 63.65 | ||
A:879 [LYS] | B:22 [U] | 4.1 | B:53 [A] | 61.82 | ||
A:879 [LYS] | B:23 [U] | 4.13 | B:52 [A] | 61.82 | ||
A:879 [LYS] | B:46 [U] | 3.54 | B:29 [A] | 61.82 | ||
A:879 [LYS] | B:47 [A] | 2.9 | B:28 [U] | 61.82 | ||
A:880 [ILE] | B:46 [U] | 3.7 | B:29 [A] | 70.07 | ||
A:881 [LYS] | B:24 [U] | 4.95 | B:51 [A] | 94.9 | ||
A:881 [LYS] | B:45 [C] | 3.87 | 94.9 | |||
A:881 [LYS] | B:46 [U] | 2.93 | B:29 [A] | 94.9 | ||
A:891 [LEU] | B:56 [A] | 3.67 | B:68 [G] | 81.42 | ||
A:893 [ILE] | B:56 [A] | 4.86 | B:68 [G] | 89.31 | ||
A:896 [ASP] | B:52 [A] | 4.89 | B:23 [U] | 69.4 | ||
A:896 [ASP] | B:53 [A] | 3.59 | B:22 [U] | 69.4 | ||
A:896 [ASP] | B:56 [A] | 4.86 | B:68 [G] | 69.4 | ||
A:896 [ASP] | B:57 [G] | 4.81 | B:67 [C] | 69.4 | ||
A:897 [TYR] | B:23 [U] | 3.33 | B:52 [A] | 67.49 | ||
A:897 [TYR] | B:24 [U] | 3.57 | B:51 [A] | 67.49 | ||
A:897 [TYR] | B:52 [A] | 4.23 | B:23 [U] | 67.49 | ||
A:897 [TYR] | B:53 [A] | 2.61 | B:22 [U] | base:SC | 67.49 | |
A:897 [TYR] | B:54 [C] | 4.57 | B:21 [G] | 67.49 | ||
A:898 [PRO] | B:24 [U] | 4.09 | B:51 [A] | 38.66 | ||
A:898 [PRO] | B:25 [U] | 3.82 | B:50 [A] | 38.66 | ||
A:899 [ASN] | B:24 [U] | 4.79 | B:51 [A] | 3.44 | ||
A:899 [ASN] | B:25 [U] | 3.39 | B:50 [A] | 3.44 | ||
A:900 [SER] | B:24 [U] | 3.37 | B:51 [A] | 46.89 | ||
A:900 [SER] | B:25 [U] | 3.89 | B:50 [A] | 46.89 | ||
A:901 [ARG] | B:24 [U] | 3.98 | B:51 [A] | 50.34 | ||
A:901 [ARG] | B:25 [U] | 3.0 | B:50 [A] | 50.34 | ||
A:901 [ARG] | B:26 [A] | 2.87 | B:49 [U] | 50.34 | ||
A:902 [ASN] | B:25 [U] | 4.9 | B:50 [A] | 69.83 | ||
A:904 [VAL] | B:23 [U] | 3.41 | B:52 [A] | 93.78 | ||
A:904 [VAL] | B:24 [U] | 4.0 | B:51 [A] | 93.78 | ||
A:906 [LYS] | B:54 [C] | 2.82 | B:21 [G] | sugar:SC | 75.48 | |
A:906 [LYS] | B:55 [A] | 2.9 | sugar:SC | 75.48 | ||
A:906 [LYS] | B:56 [A] | 4.12 | B:68 [G] | 75.48 | ||
A:931 [LEU] | B:56 [A] | 3.67 | B:68 [G] | 67.23 | ||
A:933 [VAL] | B:56 [A] | 4.89 | B:68 [G] | 65.37 | ||
A:934 [ILE] | B:56 [A] | 4.12 | B:68 [G] | 41.02 |
*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)
Properties of this interface
Interolog group ID | Structure ID |
Structure description |
UniProt ID |
ECOD label(s) |
RFAM label(s) |
Is ribosome? | RCSB PDB link |
---|---|---|---|---|---|---|---|
group125 | 7EL1_A_B | A: Crispr-associated endonuclease cas9, Staphylococcus aureus (genetically engineered) B: RNA (73-mer), Staphylococcus aureus (synthetic) | J7RUA5 | CRISPR-associated endonuclease Cas9 wedge domain & Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 | ✘ |
![]() |
Interologs
Total number of interologs for this interface: 8