RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group125 > 7OX9_B_A

Interface analysis

mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Chain
Chain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity
Electrostatics (surface only)
Conservation*

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show as licorice
show Accessibility
Rim - Core

Contacts -

7OX9_B
7OX9_A
Distance
Base Pair
Hbond nuc:res
Base Stacking
Residue conservation
B:33 [LYS] A:81 [G] 2.86 A:68 [A] base:BB 72.59
B:33 [LYS] A:82 [A] 4.11 72.59
B:34 [VAL] A:81 [G] 4.18 A:68 [A] 6.88
B:35 [LEU] A:69 [A] 4.82 A:80 [U] 59.76
B:35 [LEU] A:81 [G] 3.48 A:68 [A] 59.76
B:55 [SER] A:65 [A] 4.24 59.92
B:56 [GLY] A:65 [A] 3.5 89.58
B:57 [GLU] A:64 [U] 2.69 sugar:BB 49.47
B:57 [GLU] A:65 [A] 2.91 49.47
B:58 [THR] A:12 [G] 3.81 C:9 [DC] 90.48
B:58 [THR] A:13 [G] 3.57 C:8 [DC] 90.48
B:58 [THR] A:64 [U] 3.33 90.48
B:59 [ALA] A:12 [G] 4.99 C:9 [DC] 98.77
B:59 [ALA] A:13 [G] 2.64 C:8 [DC] 98.77
B:59 [ALA] A:14 [A] 3.85 C:7 [DT] 98.77
B:59 [ALA] A:64 [U] 3.59 98.77
B:60 [GLU] A:13 [G] 4.26 C:8 [DC] 72.83
B:60 [GLU] A:14 [A] 4.98 C:7 [DT] 72.83
B:61 [ALA] A:63 [U] 4.32 56.43
B:62 [THR] A:63 [U] 2.79 sugar:SC 89.22
B:62 [THR] A:64 [U] 3.07 sugar:SC 89.22
B:63 [ARG] A:13 [G] 4.88 C:8 [DC] 98.97
B:63 [ARG] A:14 [A] 2.79 C:7 [DT] 98.97
B:63 [ARG] A:15 [C] 3.46 C:6 [DG] 98.97
B:65 [LYS] A:51 [A] 4.82 40.25
B:65 [LYS] A:63 [U] 3.24 40.25
B:66 [ARG] A:14 [A] 3.47 C:7 [DT] 98.97
B:66 [ARG] A:15 [C] 2.74 C:6 [DG] 98.97
B:66 [ARG] A:62 [G] 3.27 A:52 [A] 98.97
B:66 [ARG] A:63 [U] 4.99 98.97
B:67 [THR] A:15 [C] 3.95 C:6 [DG] 78.77
B:67 [THR] A:16 [A] 3.96 C:5 [DT] 78.77
B:68 [ALA] A:51 [A] 4.51 73.74
B:69 [ARG] A:51 [A] 3.43 98.97
B:69 [ARG] A:62 [G] 2.98 A:52 [A] base/AA stacks 98.97
B:69 [ARG] A:63 [U] 3.16 98.97
B:70 [ARG] A:14 [A] 4.6 C:7 [DT] 98.97
B:70 [ARG] A:15 [C] 2.45 C:6 [DG] 98.97
B:70 [ARG] A:16 [A] 3.06 C:5 [DT] 98.97
B:70 [ARG] A:60 [C] 4.73 A:54 [G] 98.97
B:70 [ARG] A:61 [C] 2.79 A:53 [G] 98.97
B:71 [ARG] A:17 [G] 3.26 C:4 [DC] base/AA stacks 95.47
B:71 [ARG] A:18 [G] 2.74 C:3 [DC] base:SC 95.47
B:72 [TYR] A:20 [U] 4.31 C:1 [DA] 41.78
B:72 [TYR] A:21 [G] 4.56 A:50 [U] 41.78
B:72 [TYR] A:50 [U] 3.31 A:21 [G] base/AA stacks 41.78
B:72 [TYR] A:51 [A] 3.47 41.78
B:73 [THR] A:59 [U] 3.97 57.23
B:73 [THR] A:60 [C] 4.51 A:54 [G] 57.23
B:73 [THR] A:61 [C] 4.69 A:53 [G] 57.23
B:74 [ARG] A:16 [A] 2.86 C:5 [DT] 98.49
B:74 [ARG] A:17 [G] 2.96 C:4 [DC] 98.49
B:74 [ARG] A:59 [U] 3.44 98.49
B:74 [ARG] A:60 [C] 2.78 A:54 [G] 98.49
B:75 [ARG] A:50 [U] 3.04 A:21 [G] base:SC, base:SC 88.71
B:76 [LYS] A:48 [A] 3.76 A:23 [U] 70.7
B:76 [LYS] A:49 [A] 3.15 A:22 [U] 70.7
B:77 [ASN] A:59 [U] 2.7 base:SC 56.82
B:78 [ARG] A:18 [G] 3.89 C:3 [DC] 98.95
B:79 [ILE] A:48 [A] 3.77 A:23 [U] 78.81
B:81 [TYR] A:59 [U] 3.45 base:SC 59.23
B:83 [GLN] A:48 [A] 4.27 A:23 [U] 72.17
B:100 [ARG] A:47 [A] 4.92 A:24 [U] 95.57
B:101 [LEU] A:47 [A] 2.66 A:24 [U] sugar:BB 82.12
B:101 [LEU] A:48 [A] 3.75 A:23 [U] 82.12
B:102 [GLU] A:47 [A] 4.67 A:24 [U] 53.11
B:102 [GLU] A:48 [A] 3.82 A:23 [U] 53.11
B:102 [GLU] A:49 [A] 4.23 A:22 [U] 53.11
B:104 [SER] A:24 [U] 4.35 A:47 [A] 96.29
B:104 [SER] A:25 [U] 3.22 A:46 [A] sugar:BB 96.29
B:104 [SER] A:47 [A] 2.75 A:24 [U] base:SC, sugar:SC 96.29
B:104 [SER] A:48 [A] 3.53 A:23 [U] sugar:SC 96.29
B:105 [PHE] A:23 [U] 3.07 A:48 [A] 45.26
B:105 [PHE] A:24 [U] 2.82 A:47 [A] sugar:BB base/AA stacks 45.26
B:105 [PHE] A:25 [U] 3.88 A:46 [A] 45.26
B:105 [PHE] A:47 [A] 4.51 A:24 [U] 45.26
B:105 [PHE] A:48 [A] 3.68 A:23 [U] 45.26
B:106 [LEU] A:24 [U] 4.29 A:47 [A] 60.48
B:106 [LEU] A:25 [U] 3.61 A:46 [A] 60.48
B:107 [VAL] A:24 [U] 3.88 A:47 [A] 35.78
B:107 [VAL] A:25 [U] 4.03 A:46 [A] 35.78
B:108 [GLU] A:25 [U] 4.89 A:46 [A] 17.92
B:108 [GLU] A:26 [A] 4.65 A:45 [U] 17.92
B:111 [LYS] A:25 [U] 3.26 A:46 [A] sugar:SC 82.05
B:115 [ARG] A:25 [U] 4.32 A:46 [A] 43.92
B:115 [ARG] A:26 [A] 2.64 A:45 [U] 43.92
B:115 [ARG] A:27 [G] 3.78 43.92
B:116 [HIS] A:26 [A] 3.1 A:45 [U] 44.63
B:116 [HIS] A:27 [G] 2.87 44.63
B:117 [PRO] A:26 [A] 3.6 A:45 [U] 49.06
B:122 [ILE] A:27 [G] 3.55 40.81
B:122 [ILE] A:28 [A] 3.21 40.81
B:123 [VAL] A:28 [A] 3.88 63.99
B:125 [GLU] A:26 [A] 3.68 A:45 [U] 83.57
B:125 [GLU] A:27 [G] 4.68 83.57
B:126 [VAL] A:27 [G] 3.81 62.75
B:126 [VAL] A:28 [A] 3.94 62.75
B:129 [HIS] A:26 [A] 4.32 A:45 [U] 70.33
B:129 [HIS] A:27 [G] 2.97 70.33
B:129 [HIS] A:45 [U] 4.48 A:26 [A] 70.33
B:133 [PRO] A:45 [U] 3.63 A:26 [A] 94.16
B:134 [THR] A:44 [U] 3.56 99.0
B:134 [THR] A:45 [U] 3.62 A:26 [A] 99.0
B:135 [ILE] A:45 [U] 3.04 A:26 [A] sugar:BB 95.34
B:135 [ILE] A:46 [A] 3.64 A:25 [U] 95.34
B:136 [TYR] A:45 [U] 4.92 A:26 [A] 80.63
B:136 [TYR] A:46 [A] 4.58 A:25 [U] 80.63
B:155 [TYR] A:48 [A] 4.48 A:23 [U] 94.44
B:156 [LEU] A:47 [A] 4.74 A:24 [U] 95.65
B:159 [ALA] A:47 [A] 4.65 A:24 [U] 91.35
B:160 [HIS] A:45 [U] 4.8 A:26 [A] 89.2
B:160 [HIS] A:46 [A] 2.81 A:25 [U] 89.2
B:160 [HIS] A:47 [A] 3.96 A:24 [U] 89.2
B:163 [LYS] A:19 [A] 4.87 C:2 [DT] 98.13
B:163 [LYS] A:47 [A] 4.32 A:24 [U] 98.13
B:163 [LYS] A:48 [A] 2.87 A:23 [U] 98.13
B:163 [LYS] A:49 [A] 4.85 A:22 [U] 98.13
B:164 [PHE] A:19 [A] 3.34 C:2 [DT] 73.21
B:164 [PHE] A:20 [U] 4.61 C:1 [DA] 73.21
B:164 [PHE] A:47 [A] 3.78 A:24 [U] 73.21
B:165 [ARG] A:17 [G] 3.24 C:4 [DC] 98.97
B:165 [ARG] A:18 [G] 2.64 C:3 [DC] 98.97
B:165 [ARG] A:19 [A] 3.48 C:2 [DT] 98.97
B:166 [GLY] A:18 [G] 3.17 C:3 [DC] 98.87
B:166 [GLY] A:19 [A] 3.18 C:2 [DT] 98.87
B:167 [HIS] A:17 [G] 4.98 C:4 [DC] 89.89
B:167 [HIS] A:18 [G] 3.72 C:3 [DC] 89.89
B:168 [PHE] A:17 [G] 3.63 C:4 [DC] 98.87
B:168 [PHE] A:18 [G] 4.55 C:3 [DC] 98.87
B:324 [ARG] A:44 [U] 4.36 41.7
B:325 [TYR] A:43 [G] 4.27 90.35
B:325 [TYR] A:44 [U] 3.24 base:BB base/AA stacks 90.35
B:328 [HIS] A:43 [G] 4.87 95.03
B:328 [HIS] A:44 [U] 3.13 base/AA stacks 95.03
B:329 [HIS] A:43 [G] 4.57 61.23
B:329 [HIS] A:44 [U] 3.2 61.23
B:332 [LEU] A:43 [G] 3.88 94.65
B:332 [LEU] A:44 [U] 4.99 94.65
B:336 [LYS] A:42 [A] 3.7 96.24
B:336 [LYS] A:43 [G] 2.8 base:SC 96.24
B:340 [ARG] A:40 [C] 3.73 A:29 [G] 60.83
B:340 [ARG] A:41 [A] 2.51 60.83
B:347 [TYR] A:41 [A] 3.8 73.49
B:347 [TYR] A:43 [G] 4.7 73.49
B:351 [PHE] A:42 [A] 3.33 91.71
B:351 [PHE] A:43 [G] 3.09 base:BB 91.71
B:352 [PHE] A:40 [C] 4.43 A:29 [G] 53.29
B:352 [PHE] A:41 [A] 3.82 53.29
B:352 [PHE] A:42 [A] 3.55 53.29
B:359 [TYR] A:43 [G] 2.97 sugar:SC 89.84
B:359 [TYR] A:44 [U] 4.34 89.84
B:360 [ALA] A:43 [G] 3.61 51.15
B:363 [ILE] A:43 [G] 3.35 69.12
B:363 [ILE] A:44 [U] 3.98 69.12
B:364 [ASP] A:43 [G] 3.04 base:SC 65.3
B:365 [GLY] A:22 [U] 4.22 A:49 [A] 44.99
B:366 [GLY] A:22 [U] 4.58 A:49 [A] 34.73
B:400 [ARG] A:44 [U] 3.65 75.61
B:401 [LYS] A:21 [G] 4.93 A:50 [U] 86.36
B:401 [LYS] A:44 [U] 3.78 86.36
B:401 [LYS] A:45 [U] 3.63 A:26 [A] 86.36
B:402 [GLN] A:20 [U] 4.42 C:1 [DA] 81.82
B:402 [GLN] A:44 [U] 2.48 base:SC, sugar:SC 81.82
B:402 [GLN] A:45 [U] 2.86 A:26 [A] 81.82
B:403 [ARG] A:19 [A] 4.97 C:2 [DT] 83.07
B:403 [ARG] A:20 [U] 2.69 C:1 [DA] 83.07
B:403 [ARG] A:21 [G] 4.31 A:50 [U] 83.07
B:403 [ARG] A:45 [U] 2.9 A:26 [A] 83.07
B:403 [ARG] A:46 [A] 2.8 A:25 [U] 83.07
B:404 [THR] A:19 [A] 2.95 C:2 [DT] sugar:BB 75.2
B:404 [THR] A:20 [U] 3.0 C:1 [DA] 75.2
B:405 [PHE] A:19 [A] 2.82 C:2 [DT] 56.59
B:405 [PHE] A:20 [U] 3.84 C:1 [DA] 56.59
B:406 [ASP] A:19 [A] 3.87 C:2 [DT] 54.38
B:407 [ASN] A:19 [A] 3.31 C:2 [DT] 98.97
B:407 [ASN] A:20 [U] 2.87 C:1 [DA] 98.97
B:408 [GLY] A:18 [G] 3.72 C:3 [DC] sugar:BB 75.47
B:408 [GLY] A:19 [A] 3.43 C:2 [DT] 75.47
B:415 [HIS] A:19 [A] 4.92 C:2 [DT] 87.66
B:446 [PHE] A:17 [G] 4.99 C:4 [DC] 96.21
B:446 [PHE] A:59 [U] 3.42 96.21
B:447 [ARG] A:16 [A] 3.54 C:5 [DT] base:SC 89.86
B:447 [ARG] A:17 [G] 3.73 C:4 [DC] sugar:SC 89.86
B:448 [ILE] A:16 [A] 2.7 C:5 [DT] sugar:BB 93.19
B:448 [ILE] A:17 [G] 2.91 C:4 [DC] 93.19
B:448 [ILE] A:60 [C] 4.56 A:54 [G] 93.19
B:449 [PRO] A:15 [C] 4.38 C:6 [DG] 98.69
B:449 [PRO] A:16 [A] 3.93 C:5 [DT] 98.69
B:450 [TYR] A:15 [C] 2.69 C:6 [DG] sugar:BB 97.85
B:450 [TYR] A:16 [A] 3.34 C:5 [DT] 97.85
B:451 [TYR] A:15 [C] 4.74 C:6 [DG] 95.95
B:452 [VAL] A:15 [C] 4.99 C:6 [DG] 94.16
B:453 [GLY] A:15 [C] 3.54 C:6 [DG] 98.87
B:453 [GLY] A:16 [A] 3.84 C:5 [DT] 98.87
B:454 [PRO] A:15 [C] 3.3 C:6 [DG] 97.52
B:454 [PRO] A:16 [A] 3.54 C:5 [DT] 97.52
B:454 [PRO] A:60 [C] 3.87 A:54 [G] 97.52
B:454 [PRO] A:61 [C] 3.95 A:53 [G] 97.52
B:455 [LEU] A:58 [G] 2.59 A:55 [C] sugar:BB 90.14
B:455 [LEU] A:59 [U] 3.76 90.14
B:455 [LEU] A:60 [C] 2.96 A:54 [G] 90.14
B:456 [ALA] A:58 [G] 3.32 A:55 [C] 81.38
B:456 [ALA] A:60 [C] 3.65 A:54 [G] 81.38
B:457 [ARG] A:57 [A] 2.8 42.92
B:457 [ARG] A:58 [G] 3.31 A:55 [C] 42.92
B:459 [ASN] A:56 [U] 3.01 base/AA stacks 42.23
B:459 [ASN] A:58 [G] 4.89 A:55 [C] 42.23
B:459 [ASN] A:60 [C] 3.56 A:54 [G] 42.23
B:459 [ASN] A:61 [C] 3.95 A:53 [G] 42.23
B:460 [SER] A:60 [C] 3.32 A:54 [G] 74.76
B:460 [SER] A:61 [C] 2.66 A:53 [G] 74.76
B:462 [PHE] A:14 [A] 3.63 C:7 [DT] 70.15
B:462 [PHE] A:15 [C] 3.4 C:6 [DG] 70.15
B:462 [PHE] A:61 [C] 3.74 A:53 [G] 70.15
B:462 [PHE] A:62 [G] 3.46 A:52 [A] 70.15
B:464 [TRP] A:14 [A] 4.01 C:7 [DT] 98.23
B:464 [TRP] A:15 [C] 3.71 C:6 [DG] 98.23
B:467 [ARG] A:58 [G] 3.42 A:55 [C] 86.79
B:467 [ARG] A:59 [U] 2.32 86.79
B:471 [GLU] A:59 [U] 4.08 61.42
B:472 [THR] A:58 [G] 4.96 A:55 [C] 49.9
B:472 [THR] A:59 [U] 3.09 49.9
B:473 [ILE] A:59 [U] 2.99 90.6
B:474 [THR] A:59 [U] 4.19 73.42
B:475 [PRO] A:59 [U] 3.16 98.67
B:491 [PHE] A:14 [A] 4.59 C:7 [DT] 98.85
B:494 [ARG] A:14 [A] 4.09 C:7 [DT] 88.81
B:495 [MET] A:13 [G] 3.39 C:8 [DC] 88.84
B:510 [LYS] A:5 [C] 3.43 C:16 [DG] 85.26
B:510 [LYS] A:6 [C] 3.01 C:15 [DG] 85.26
B:515 [TYR] A:4 [G] 3.25 C:17 [DC] 97.77
B:515 [TYR] A:5 [C] 2.44 C:16 [DG] 97.77
B:518 [PHE] A:4 [G] 3.71 C:17 [DC] 74.49
B:519 [THR] A:4 [G] 4.76 C:17 [DC] 59.78
B:519 [THR] A:5 [C] 3.78 C:16 [DG] 59.78
B:522 [ASN] A:4 [G] 4.95 C:17 [DC] 95.01
B:523 [GLU] A:5 [C] 4.77 C:16 [DG] 98.1
B:586 [ARG] A:6 [C] 3.62 C:15 [DG] sugar:SC 39.37
B:588 [ASN] A:5 [C] 4.3 C:16 [DG] 80.96
B:588 [ASN] A:6 [C] 3.35 C:15 [DG] 80.96
B:589 [ALA] A:5 [C] 4.05 C:16 [DG] 81.32
B:589 [ALA] A:6 [C] 4.86 C:15 [DG] 81.32
B:660 [GLY] A:5 [C] 4.57 C:16 [DG] 92.45
B:661 [ARG] A:3 [G] 4.76 C:18 [DC] 83.86
B:661 [ARG] A:4 [G] 2.65 C:17 [DC] 83.86
B:661 [ARG] A:5 [C] 3.33 C:16 [DG] 83.86
B:662 [LEU] A:4 [G] 4.35 C:17 [DC] 86.0
B:693 [PHE] A:3 [G] 4.08 C:18 [DC] 81.33
B:693 [PHE] A:4 [G] 4.42 C:17 [DC] 81.33
B:694 [MET] A:2 [G] 3.71 C:19 [DC] 94.01
B:694 [MET] A:3 [G] 3.36 C:18 [DC] 94.01
B:721 [HIS] A:65 [A] 2.72 sugar:SC 51.62
B:721 [HIS] A:66 [U] 3.07 51.62
B:725 [ALA] A:65 [A] 4.75 53.78
B:729 [GLY] A:12 [G] 4.48 C:9 [DC] 73.0
B:731 [PRO] A:12 [G] 4.41 C:9 [DC] 93.75
B:731 [PRO] A:13 [G] 4.49 C:8 [DC] 93.75
B:734 [LYS] A:66 [U] 4.63 94.42
B:735 [LYS] A:66 [U] 3.34 91.94
B:738 [LEU] A:66 [U] 3.73 67.2
B:738 [LEU] A:67 [C] 4.72 67.2
B:739 [GLN] A:66 [U] 4.59 90.14
B:739 [GLN] A:67 [C] 3.03 90.14
B:742 [LYS] A:66 [U] 3.79 56.7
B:742 [LYS] A:67 [C] 2.88 56.7
B:749 [LYS] A:80 [U] 3.37 A:69 [A] 57.51
B:749 [LYS] A:81 [G] 3.83 A:68 [A] base:SC 57.51
B:753 [ARG] A:80 [U] 3.14 A:69 [A] 76.94
B:753 [ARG] A:81 [G] 4.82 A:68 [A] 76.94
B:779 [GLU] A:11 [G] 4.43 C:10 [DC] 86.46
B:783 [ARG] A:10 [A] 4.74 C:11 [DT] 62.97
B:890 [LYS] A:8 [C] 4.41 C:13 [DG] 58.61
B:890 [LYS] A:9 [U] 2.96 C:12 [DA] 58.61
B:893 [THR] A:8 [C] 4.23 C:13 [DG] 89.61
B:893 [THR] A:9 [U] 3.77 C:12 [DA] 89.61
B:894 [GLN] A:7 [A] 3.77 C:14 [DT] 51.2
B:894 [GLN] A:8 [C] 3.61 C:13 [DG] sugar:BB 51.2
B:895 [ARG] A:8 [C] 4.49 C:13 [DG] 71.64
B:918 [LYS] A:0 [G] 3.62 73.48
B:923 [GLU] A:1 [G] 4.78 C:20 [DC] 94.14
B:924 [THR] A:1 [G] 3.43 C:20 [DC] 98.49
B:926 [GLN] A:1 [G] 4.84 C:20 [DC] 98.97
B:926 [GLN] A:2 [G] 2.53 C:19 [DC] 98.97
B:929 [LYS] A:0 [G] 4.75 95.72
B:929 [LYS] A:1 [G] 2.39 C:20 [DC] 95.72
B:929 [LYS] A:2 [G] 3.96 C:19 [DC] 95.72
B:1006 [SER] A:0 [G] 3.68 sugar:BB 0.0
B:1007 [GLU] A:0 [G] 3.79 0.0
B:1012 [ASP] A:0 [G] 3.53 0.0
B:1012 [ASP] A:1 [G] 4.62 C:20 [DC] 0.0
B:1097 [LYS] A:67 [C] 2.93 0.0
B:1097 [LYS] A:68 [A] 4.16 A:81 [G] 0.0
B:1098 [THR] A:67 [C] 4.6 0.0
B:1098 [THR] A:68 [A] 4.43 A:81 [G] 0.0
B:1099 [GLU] A:67 [C] 3.33 base/AA stacks 0.0
B:1100 [VAL] A:67 [C] 3.01 base:BB, base:BB 0.0
B:1102 [THR] A:63 [U] 4.75 0.0
B:1102 [THR] A:64 [U] 2.64 0.0
B:1102 [THR] A:65 [A] 4.51 0.0
B:1102 [THR] A:66 [U] 4.05 0.0
B:1103 [GLY] A:51 [A] 3.4 base:BB 0.0
B:1103 [GLY] A:63 [U] 3.39 0.0
B:1103 [GLY] A:64 [U] 3.39 0.0
B:1104 [GLY] A:51 [A] 3.55 0.0
B:1104 [GLY] A:63 [U] 2.97 0.0
B:1105 [PHE] A:51 [A] 3.15 base:BB base/AA stacks 0.0
B:1105 [PHE] A:52 [A] 3.67 A:62 [G] 0.0
B:1110 [ILE] A:21 [G] 3.96 A:50 [U] 0.0
B:1110 [ILE] A:22 [U] 2.57 A:49 [A] sugar:BB 0.0
B:1110 [ILE] A:23 [U] 3.24 A:48 [A] 0.0
B:1110 [ILE] A:49 [A] 4.43 A:22 [U] 0.0
B:1110 [ILE] A:50 [U] 4.71 A:21 [G] 0.0
B:1111 [LEU] A:22 [U] 4.76 A:49 [A] 0.0
B:1111 [LEU] A:23 [U] 3.71 A:48 [A] 0.0
B:1112 [PRO] A:23 [U] 3.75 A:48 [A] 0.0
B:1112 [PRO] A:24 [U] 3.43 A:47 [A] 0.0
B:1113 [LYS] A:23 [U] 4.4 A:48 [A] 0.0
B:1113 [LYS] A:24 [U] 3.13 A:47 [A] 0.0
B:1113 [LYS] A:25 [U] 4.13 A:46 [A] 0.0
B:1121 [ALA] A:52 [A] 4.38 A:62 [G] 0.0
B:1122 [ARG] A:23 [U] 3.91 A:48 [A] 0.0
B:1122 [ARG] A:49 [A] 2.5 A:22 [U] base:SC 0.0
B:1122 [ARG] A:50 [U] 4.13 A:21 [G] 0.0
B:1122 [ARG] A:52 [A] 3.19 A:62 [G] 0.0
B:1123 [LYS] A:49 [A] 3.33 A:22 [U] 0.0
B:1123 [LYS] A:50 [U] 3.23 A:21 [G] 0.0
B:1123 [LYS] A:51 [A] 4.99 0.0
B:1123 [LYS] A:52 [A] 2.55 A:62 [G] 0.0
B:1123 [LYS] A:53 [G] 3.61 A:61 [C] 0.0
B:1124 [LYS] A:52 [A] 3.82 A:62 [G] 0.0
B:1124 [LYS] A:53 [G] 2.81 A:61 [C] 0.0
B:1126 [TRP] A:48 [A] 4.52 A:23 [U] 0.0
B:1126 [TRP] A:49 [A] 3.33 A:22 [U] 0.0
B:1130 [LYS] A:24 [U] 3.48 A:47 [A] 0.0
B:1131 [TYR] A:23 [U] 2.76 A:48 [A] sugar:BB 0.0
B:1131 [TYR] A:24 [U] 3.78 A:47 [A] 0.0
B:1132 [GLY] A:23 [U] 4.72 A:48 [A] 0.0
B:1132 [GLY] A:24 [U] 4.88 A:47 [A] 0.0
B:1134 [PHE] A:51 [A] 3.89 0.0
B:1168 [ILE] A:51 [A] 4.99 0.0
B:1169 [MET] A:52 [A] 3.51 A:62 [G] 0.0
B:1197 [LYS] A:67 [C] 4.99 0.0
B:1349 [HIS] A:68 [A] 2.65 A:81 [G] sugar:SC 0.0
B:1349 [HIS] A:69 [A] 3.48 A:80 [U] 0.0
B:1350 [GLN] A:68 [A] 3.04 A:81 [G] 0.0
B:1351 [SER] A:68 [A] 3.52 A:81 [G] 0.0
B:1352 [ILE] A:68 [A] 4.8 A:81 [G] 0.0
B:1356 [TYR] A:68 [A] 4.16 A:81 [G] 0.0
B:1356 [TYR] A:81 [G] 3.47 A:68 [A] base/AA stacks 0.0
B:1357 [GLU] A:68 [A] 4.62 A:81 [G] 0.0
B:1357 [GLU] A:81 [G] 3.15 A:68 [A] base:BB 0.0
B:1358 [THR] A:68 [A] 3.75 A:81 [G] 0.0
B:1358 [THR] A:69 [A] 3.81 A:80 [U] 0.0
B:1358 [THR] A:81 [G] 4.95 A:68 [A] 0.0

logo_download Export the table of contacts

*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)

Properties of this interface

Interolog group ID Structure ID Structure description
 UniProt ID
 		ECOD label(s)
 		RFAM label(s)
 		Is ribosome? RCSB PDB link
group125 7OX9_B_A B: Crispr-associated endonuclease cas9/csn1, Streptococcus pyogenes serotype m1 (genetically engineered) A: sgRNA, Synthetic construct (synthetic) Q99ZW2 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 ✘

Interologs

Total number of interologs for this interface: 8

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
5X2H_A_B 7OX9_B_A 0.54 0.75 3.13 0.15 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
7EL1_A_B 7OX9_B_A 0.63 0.73 1.92 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 7OX9_B_A 0.96 0.93 1.58 0.72 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2T_B_A 7OX9_B_A 0.98 0.99 0.36 0.72 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FW1_B_A 7OX9_B_A 0.97 0.99 0.36 0.7 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2S_B_A 7OX9_B_A 0.98 1.0 0.32 0.74 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FQ5_B_A 7OX9_B_A 0.98 0.99 0.31 0.74 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2R_B_A 7OX9_B_A 0.98 1.0 0.3 0.75 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare