Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
1YHQ_C
|
1YHQ_0
|
6S0Z_E
|
6S0Z_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
C:88 [SER] | 0:456 [G] | E:88 [ILE] | A:496 [G] | ✔ |
C:88 [SER] | 0:1352 [A] | E:88 [ILE] | A:1286 [G] | ✔ |
C:85 [LYS] | 0:455 [A] | E:85 [GLY] | A:495 [A] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:643 [A] | E:90 [PHE] | A:629 [A] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:644 [G] | E:90 [PHE] | A:630 [G] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:645 [U] | E:90 [PHE] | A:631 [U] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:762 [C] | E:90 [PHE] | A:716 [C] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:763 [C] | E:90 [PHE] | A:717 [C] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:1352 [A] | E:90 [PHE] | A:1286 [G] | ✔ |
C:84 [VAL] | 0:454 [U] | E:84 [ARG] | A:494 [U] | ✔ |
C:84 [VAL] | 0:455 [A] | E:84 [ARG] | A:495 [A] | ✔ |
C:84 [VAL] | 0:1361 [C] | E:84 [ARG] | A:1295 [C] | ✔ |
C:84 [VAL] | 0:1362 [U] | E:84 [ARG] | A:1296 [C] | ✔ |
C:37 [ALA] | 0:676 [C] | E:39 [LEU] | A:660 [A] | ✔ |
C:53 [GLY] | 0:458 [G] | E:57 [VAL] | A:498 [G] | ✔ |
C:150 [THR] | 0:327 [A] | E:136 [THR] | A:363 [A] | ✔ |
C:150 [THR] | 0:328 [U] | E:136 [THR] | A:364 [A] | ✔ |
C:150 [THR] | 0:329 [A] | E:136 [THR] | A:365 [A] | ✔ |
C:154 [VAL] | 0:327 [A] | E:140 [LYS] | A:363 [A] | ✔ |
C:94 [THR] | 0:35 [U] | E:94 [PRO] | A:38 [A] | ✔ |
C:94 [THR] | 0:36 [C] | E:94 [PRO] | A:39 [C] | ✔ |
C:219 [ASN] | 0:676 [C] | E:182 [ASN] | A:660 [A] | ✔ |
C:36 [ARG] | 0:1349 [G] | E:38 [ASN] | A:1283 [G] | ✔ |
C:108 [GLN] | 0:678 [G] | E:107 [ARG] | A:662 [G] | ✔ |
C:38 [ALA] | 0:675 [U] | E:40 [GLN] | A:659 [A] | ✔ |
C:38 [ALA] | 0:676 [C] | E:40 [GLN] | A:660 [A] | ✔ |
C:202 [THR] | 0:328 [U] | E:165 [LEU] | A:364 [A] | ✔ |
C:202 [THR] | 0:329 [A] | E:165 [LEU] | A:365 [A] | ✔ |
C:43 [LYS] | 0:449 [A] | E:45 [ARG] | A:489 [A] | ✔ |
C:93 [LYS] | 0:646 [G] | E:93 [THR] | A:632 [U] | ✔ |
C:151 [GLN] | 0:326 [G] | E:137 [LYS] | A:362 [C] | ✔ |
C:151 [GLN] | 0:327 [A] | E:137 [LYS] | A:363 [A] | ✔ |
C:149 [LYS] | 0:327 [A] | E:135 [LYS] | A:363 [A] | ✔ |
C:149 [LYS] | 0:328 [U] | E:135 [LYS] | A:364 [A] | ✔ |
C:49 [ASP] | 0:34 [C] | E:52 [LYS] | A:37 [C] | ✔ |
C:49 [ASP] | 0:35 [U] | E:52 [LYS] | A:38 [A] | ✔ |
C:49 [ASP] | 0:457 [U] | E:52 [LYS] | A:497 [U] | ✔ |
C:55 [ARG] | 0:475 [G] | E:59 [GLY] | A:515 [G] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:764 [C] | E:74 [ARG] | A:718 [C] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:765 [G] | E:74 [ARG] | A:719 [G] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:1359 [U] | E:74 [ARG] | A:1293 [U] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:2101 [A] | E:74 [ARG] | A:2087 [A] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:2479 [A] | E:74 [ARG] | A:2471 [G] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:641 [G] | E:82 [GLN] | A:627 [C] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:642 [G] | E:82 [GLN] | A:628 [G] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:763 [C] | E:82 [GLN] | A:717 [C] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:764 [C] | E:82 [GLN] | A:718 [C] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:1358 [A] | E:82 [GLN] | A:1292 [A] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:1360 [C] | E:82 [GLN] | A:1294 [G] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:1361 [C] | E:82 [GLN] | A:1295 [C] | ✔ |
C:106 [GLU] | 0:656 [G] | E:105 [MET] | A:642 [U] | ✔ |
C:106 [GLU] | 0:657 [G] | E:105 [MET] | A:643 [G] | ✔ |
C:97 [ASP] | 0:647 [U] | E:96 [SER] | A:633 [A] | ✔ |
C:57 [PRO] | 0:891 [G] | E:61 [GLY] | A:843 [G] | ✔ |
C:29 [ASP] | 0:656 [G] | E:31 [SER] | A:642 [U] | ✔ |
C:70 [VAL] | 0:764 [C] | E:75 [GLN] | A:718 [C] | ✔ |
C:70 [VAL] | 0:1360 [C] | E:75 [GLN] | A:1294 [G] | ✔ |
C:70 [VAL] | 0:1361 [C] | E:75 [GLN] | A:1295 [C] | ✔ |
C:40 [ALA] | 0:449 [A] | E:42 [ALA] | A:489 [A] | ✔ |
C:105 [LYS] | 0:657 [G] | E:104 [LYS] | A:643 [G] | ✔ |
C:105 [LYS] | 0:658 [C] | E:104 [LYS] | A:644 [C] | ✔ |
C:105 [LYS] | 0:662 [U] | E:104 [LYS] | A:648 [G] | ✔ |
C:105 [LYS] | 0:663 [C] | E:104 [LYS] | A:649 [U] | ✔ |
C:33 [LYS] | 0:750 [A] | E:35 [GLU] | A:704 [U] | ✔ |
C:33 [LYS] | 0:751 [U] | E:35 [GLU] | A:705 [U] | ✔ |
C:206 [ASN] | 0:327 [A] | E:169 [ASN] | A:363 [A] | ✔ |
C:206 [ASN] | 0:329 [A] | E:169 [ASN] | A:365 [A] | ✔ |
C:206 [ASN] | 0:330 [C] | E:169 [ASN] | A:366 [G] | ✔ |
C:206 [ASN] | 0:331 [A] | E:169 [ASN] | A:367 [A] | ✔ |
C:30 [LEU] | 0:656 [G] | E:32 [VAL] | A:642 [U] | ✔ |
C:30 [LEU] | 0:657 [G] | E:32 [VAL] | A:643 [G] | ✔ |
C:41 [ASN] | 0:675 [U] | E:43 [SER] | A:659 [A] | ✔ |
C:41 [ASN] | 0:676 [C] | E:43 [SER] | A:660 [A] | ✔ |
C:96 [LYS] | 0:646 [G] | E:95 [ARG] | A:632 [U] | ✔ |
C:96 [LYS] | 0:647 [U] | E:95 [ARG] | A:633 [A] | ✔ |
C:96 [LYS] | 0:1350 [U] | E:95 [ARG] | A:1284 [A] | ✔ |
C:96 [LYS] | 0:1351 [G] | E:95 [ARG] | A:1285 [A] | ✔ |
C:42 [ARG] | 0:449 [A] | E:44 [LEU] | A:489 [A] | ✔ |
C:42 [ARG] | 0:675 [U] | E:44 [LEU] | A:659 [A] | ✔ |
C:67 [GLN] | 0:1359 [U] | E:72 [ARG] | A:1293 [U] | ✔ |
C:67 [GLN] | 0:2101 [A] | E:72 [ARG] | A:2087 [A] | ✔ |
C:56 [THR] | 0:475 [G] | E:60 [GLY] | A:515 [G] | ✔ |
C:207 [LEU] | 0:327 [A] | E:170 [ILE] | A:363 [A] | ✔ |
C:207 [LEU] | 0:330 [C] | E:170 [ILE] | A:366 [G] | ✔ |
C:107 [ARG] | 0:677 [C] | E:106 [ARG] | A:661 [U] | ✔ |
C:107 [ARG] | 0:678 [G] | E:106 [ARG] | A:662 [G] | ✔ |
C:101 [ASP] | 0:750 [A] | E:100 [LYS] | A:704 [U] | ✔ |
C:101 [ASP] | 0:751 [U] | E:100 [LYS] | A:705 [U] | ✔ |
C:52 [ALA] | 0:458 [G] | E:56 [ALA] | A:498 [G] | ✔ |
C:51 [TYR] | 0:894 [A] | E:55 [SER] | A:846 [G] | ✔ |
C:148 [VAL] | 0:328 [U] | E:134 [PRO] | A:364 [A] | ✔ |
C:102 [LEU] | 0:664 [U] | E:101 [MET] | A:650 [U] | ✔ |
C:102 [LEU] | 0:750 [A] | E:101 [MET] | A:704 [U] | ✔ |
C:81 [PRO] | 0:642 [G] | E:81 [PRO] | A:628 [G] | ✔ |
C:81 [PRO] | 0:763 [C] | E:81 [PRO] | A:717 [C] | ✔ |
C:81 [PRO] | 0:764 [C] | E:81 [PRO] | A:718 [C] | ✔ |
C:216 [SER] | 0:677 [C] | E:179 [GLN] | A:661 [U] | ✔ |
C:48 [SER] | 0:456 [G] | E:51 [VAL] | A:496 [G] | ✔ |
C:48 [SER] | 0:457 [U] | E:51 [VAL] | A:497 [U] | ✔ |
C:48 [SER] | 0:1352 [A] | E:51 [VAL] | A:1286 [G] | ✔ |
C:217 [GLU] | 0:676 [C] | E:180 [GLY] | A:660 [A] | ✔ |
C:39 [GLN] | 0:1307 [A] | E:41 [ARG] | A:1241 [A] | ✔ |
C:62 [GLY] | 0:766 [A] | E:67 [GLN] | A:720 [A] | ✔ |
C:62 [GLY] | 0:1359 [U] | E:67 [GLN] | A:1293 [U] | ✔ |
C:63 [SER] | 0:1359 [U] | E:68 [LYS] | A:1293 [U] | ✔ |
C:63 [SER] | 0:2101 [A] | E:68 [LYS] | A:2087 [A] | ✔ |
C:63 [SER] | 0:2479 [A] | E:68 [LYS] | A:2471 [G] | ✔ |
C:203 [ALA] | 0:328 [U] | E:166 [SER] | A:364 [A] | ✔ |
C:68 [ALA] | 0:1359 [U] | E:73 [ALA] | A:1293 [U] | ✔ |
C:68 [ALA] | 0:1360 [C] | E:73 [ALA] | A:1294 [G] | ✔ |
C:68 [ALA] | 0:1361 [C] | E:73 [ALA] | A:1295 [C] | ✔ |
C:100 [LEU] | 0:750 [A] | E:99 [TYR] | A:704 [U] | ✔ |
C:100 [LEU] | 0:751 [U] | E:99 [TYR] | A:705 [U] | ✔ |
C:54 [LEU] | 0:458 [G] | E:58 [SER] | A:498 [G] | ✔ |
C:92 [PRO] | 0:1352 [A] | E:92 [PRO] | A:1286 [G] | ✔ |
C:78 [ARG] | 0:475 [G] | E:78 [ILE] | A:515 [G] | ✔ |
C:205 [ARG] | 0:328 [U] | E:168 [ARG] | A:364 [A] | ✔ |
C:205 [ARG] | 0:329 [A] | E:168 [ARG] | A:365 [A] | ✔ |
C:205 [ARG] | 0:347 [A] | E:168 [ARG] | A:383 [A] | ✔ |
C:27 [ARG] | 0:656 [G] | E:29 [ASN] | A:642 [U] | ✔ |
C:27 [ARG] | 0:657 [G] | E:29 [ASN] | A:643 [G] | ✔ |
C:47 [GLY] | 0:34 [C] | E:50 [ALA] | A:37 [C] | ✔ |
C:47 [GLY] | 0:35 [U] | E:50 [ALA] | A:38 [A] | ✔ |
C:46 [TYR] | 0:35 [U] | E:49 [HIS] | A:38 [A] | ✔ |
C:46 [TYR] | 0:448 [G] | E:49 [HIS] | A:488 [G] | ✔ |
C:46 [TYR] | 0:450 [C] | E:49 [HIS] | A:490 [C] | ✔ |
C:91 [PRO] | 0:645 [U] | E:91 [GLY] | A:631 [U] | ✔ |
C:91 [PRO] | 0:1352 [A] | E:91 [GLY] | A:1286 [G] | ✔ |
C:65 [ARG] | 0:2100 [A] | E:70 [THR] | A:2086 [A] | ✔ |
C:65 [ARG] | 0:2101 [A] | E:70 [THR] | A:2087 [A] | ✔ |
C:225 [PRO] | 0:1308 [A] | E:188 [ASN] | A:1242 [A] | ✔ |
C:66 [GLY] | 0:1359 [U] | E:71 [GLY] | A:1293 [U] | ✔ |
C:66 [GLY] | 0:2100 [A] | E:71 [GLY] | A:2086 [A] | ✔ |
C:66 [GLY] | 0:2101 [A] | E:71 [GLY] | A:2087 [A] | ✔ |
C:109 [LEU] | 0:657 [G] | E:108 [LEU] | A:643 [G] | ✔ |
C:80 [VAL] | 0:764 [C] | E:80 [ALA] | A:718 [C] | ✔ |
C:80 [VAL] | 0:765 [G] | E:80 [ALA] | A:719 [G] | ✔ |
C:103 [ASN] | 0:663 [C] | E:102 [PRO] | A:649 [U] | ✔ |
C:103 [ASN] | 0:664 [U] | E:102 [PRO] | A:650 [U] | ✔ |
C:103 [ASN] | 0:749 [C] | E:102 [PRO] | A:703 [A] | ✔ |
C:103 [ASN] | 0:750 [A] | E:102 [PRO] | A:704 [U] | ✔ |
C:71 [PRO] | 0:765 [G] | E:76 [GLY] | A:719 [G] | ✔ |
C:104 [ASP] | 0:664 [U] | E:103 [LYS] | A:650 [U] | ✔ |
C:104 [ASP] | 0:678 [G] | E:103 [LYS] | A:662 [G] | ✔ |
C:104 [ASP] | 0:680 [G] | E:103 [LYS] | A:664 [G] | ✔ |
C:208 [ALA] | 0:330 [C] | E:171 [PRO] | A:366 [G] | ✔ |
C:89 [ALA] | 0:643 [A] | E:89 [VAL] | A:629 [A] | ✔ |
C:89 [ALA] | 0:763 [C] | E:89 [VAL] | A:717 [C] | ✔ |
C:89 [ALA] | 0:894 [A] | E:89 [VAL] | A:846 [G] | ✔ |
C:83 [ALA] | 0:1361 [C] | E:83 [TRP] | A:1295 [C] | ✔ |
C:86 [GLY] | 0:455 [A] | E:86 [GLY] | A:495 [A] | ✔ |
C:44 [GLN] | 0:35 [U] | E:46 [GLN] | A:38 [A] | ✔ |
C:44 [GLN] | 0:447 [A] | E:46 [GLN] | A:487 [U] | ✔ |
C:44 [GLN] | 0:448 [G] | E:46 [GLN] | A:488 [G] | ✔ |
C:44 [GLN] | 0:449 [A] | E:46 [GLN] | A:489 [A] | ✔ |
C:44 [GLN] | 0:674 [A] | E:46 [GLN] | A:658 [A] | ✔ |
C:85 [LYS] | 0:454 [U] | E:85 [GLY] | A:494 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:85 [LYS] | 0:458 [G] | E:85 [GLY] | A:498 [G] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:85 [LYS] | 0:476 [A] | E:85 [GLY] | A:516 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:85 [LYS] | 0:477 [A] | E:85 [GLY] | A:517 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:45 [ASP] | 0:35 [U] | E:47 [GLY] | A:38 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:45 [ASP] | 0:36 [C] | E:47 [GLY] | A:39 [C] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:37 [ALA] | 0:675 [U] | E:39 [LEU] | A:659 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:53 [GLY] | 0:457 [U] | E:57 [VAL] | A:497 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:219 [ASN] | 0:677 [C] | E:182 [ASN] | A:661 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:36 [ARG] | 0:1348 [A] | E:38 [ASN] | A:1282 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:108 [GLN] | 0:679 [G] | E:107 [ARG] | A:663 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:43 [LYS] | 0:1306 [U] | E:45 [ARG] | A:1240 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:93 [LYS] | 0:645 [U] | E:93 [THR] | A:631 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:93 [LYS] | 0:760 [G] | E:93 [THR] | A:714 [G] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:93 [LYS] | 0:761 [A] | E:93 [THR] | A:715 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:151 [GLN] | 0:328 [U] | E:137 [LYS] | A:364 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:149 [LYS] | 0:326 [G] | E:135 [LYS] | A:362 [C] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:60 [SER] | 0:765 [G] | E:65 [TRP] | A:719 [G] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:60 [SER] | 0:766 [A] | E:65 [TRP] | A:720 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:60 [SER] | 0:767 [A] | E:65 [TRP] | A:721 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:55 [ARG] | 0:457 [U] | E:59 [GLY] | A:497 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:55 [ARG] | 0:458 [G] | E:59 [GLY] | A:498 [G] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:69 [HIS] | 0:766 [A] | E:74 [ARG] | A:720 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:218 [VAL] | 0:677 [C] | E:181 [LEU] | A:661 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:72 [LYS] | 0:1361 [C] | E:77 [THR] | A:1295 [C] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:72 [LYS] | 0:1362 [U] | E:77 [THR] | A:1296 [C] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:97 [ASP] | 0:646 [G] | E:96 [SER] | A:632 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:57 [PRO] | 0:474 [C] | E:61 [GLY] | A:514 [G] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:57 [PRO] | 0:475 [G] | E:61 [GLY] | A:515 [G] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:57 [PRO] | 0:890 [C] | E:61 [GLY] | A:842 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:105 [LYS] | 0:664 [U] | E:104 [LYS] | A:650 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:33 [LYS] | 0:656 [G] | E:35 [GLU] | A:642 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:206 [ASN] | 0:326 [G] | E:169 [ASN] | A:362 [C] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:41 [ASN] | 0:674 [A] | E:43 [SER] | A:658 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:42 [ARG] | 0:674 [A] | E:44 [LEU] | A:658 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:67 [GLN] | 0:1361 [C] | E:72 [ARG] | A:1295 [C] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:56 [THR] | 0:474 [C] | E:60 [GLY] | A:514 [G] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:56 [THR] | 0:891 [G] | E:60 [GLY] | A:843 [G] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:107 [ARG] | 0:676 [C] | E:106 [ARG] | A:660 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:52 [ALA] | 0:457 [U] | E:56 [ALA] | A:497 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:79 [ARG] | 0:894 [A] | E:79 [ARG] | A:846 [G] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:51 [TYR] | 0:458 [G] | E:55 [SER] | A:498 [G] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:99 [SER] | 0:751 [U] | E:98 [ALA] | A:705 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:48 [SER] | 0:34 [C] | E:51 [VAL] | A:37 [C] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:48 [SER] | 0:35 [U] | E:51 [VAL] | A:38 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:217 [GLU] | 0:677 [C] | E:180 [GLY] | A:661 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:39 [GLN] | 0:675 [U] | E:41 [ARG] | A:659 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:62 [GLY] | 0:767 [A] | E:67 [GLN] | A:721 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:63 [SER] | 0:767 [A] | E:68 [LYS] | A:721 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:63 [SER] | 0:2100 [A] | E:68 [LYS] | A:2086 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:54 [LEU] | 0:894 [A] | E:58 [SER] | A:846 [G] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:92 [PRO] | 0:450 [C] | E:92 [PRO] | A:490 [C] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:78 [ARG] | 0:476 [A] | E:78 [ILE] | A:516 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:78 [ARG] | 0:477 [A] | E:78 [ILE] | A:517 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:46 [TYR] | 0:1351 [G] | E:49 [HIS] | A:1285 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:46 [TYR] | 0:1352 [A] | E:49 [HIS] | A:1286 [G] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:109 [LEU] | 0:658 [C] | E:108 [LEU] | A:644 [C] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:50 [GLU] | 0:35 [U] | E:53 [ASN] | A:38 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:103 [ASN] | 0:656 [G] | E:102 [PRO] | A:642 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:103 [ASN] | 0:657 [G] | E:102 [PRO] | A:643 [G] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:71 [PRO] | 0:764 [C] | E:76 [GLY] | A:718 [C] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:104 [ASP] | 0:663 [C] | E:103 [LYS] | A:649 [U] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:208 [ALA] | 0:327 [A] | E:171 [PRO] | A:363 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:83 [ALA] | 0:455 [A] | E:83 [TRP] | A:495 [A] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:86 [GLY] | 0:456 [G] | E:86 [GLY] | A:496 [G] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:44 [GLN] | 0:36 [C] | E:46 [GLN] | A:39 [C] | ❌ 6S0Z_E_A |
C:101 [ASP] | 0:664 [U] | E:100 [LYS] | A:650 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:104 [ASP] | 0:679 [G] | E:103 [LYS] | A:663 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:106 [GLU] | 0:750 [A] | E:105 [MET] | A:704 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:106 [GLU] | 0:749 [C] | E:105 [MET] | A:703 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:107 [ARG] | 0:664 [U] | E:106 [ARG] | A:650 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:205 [ARG] | 0:331 [A] | E:168 [ARG] | A:367 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:216 [SER] | 0:676 [C] | E:179 [GLN] | A:660 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:216 [SER] | 0:678 [G] | E:179 [GLN] | A:662 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:218 [VAL] | 0:676 [C] | E:181 [LEU] | A:660 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:225 [PRO] | 0:1309 [U] | E:188 [ASN] | A:1243 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:36 [ARG] | 0:1350 [U] | E:38 [ASN] | A:1284 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:37 [ALA] | 0:677 [C] | E:39 [LEU] | A:661 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:39 [GLN] | 0:1306 [U] | E:41 [ARG] | A:1240 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:39 [GLN] | 0:1349 [G] | E:41 [ARG] | A:1283 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:39 [GLN] | 0:449 [A] | E:41 [ARG] | A:489 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:39 [GLN] | 0:1348 [A] | E:41 [ARG] | A:1282 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:43 [LYS] | 0:1350 [U] | E:45 [ARG] | A:1284 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:43 [LYS] | 0:450 [C] | E:45 [ARG] | A:490 [C] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:44 [GLN] | 0:450 [C] | E:46 [GLN] | A:490 [C] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:45 [ASP] | 0:449 [A] | E:47 [GLY] | A:489 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:47 [GLY] | 0:1352 [A] | E:50 [ALA] | A:1286 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:47 [GLY] | 0:457 [U] | E:50 [ALA] | A:497 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:47 [GLY] | 0:450 [C] | E:50 [ALA] | A:490 [C] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:49 [ASP] | 0:458 [G] | E:52 [LYS] | A:498 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:50 [GLU] | 0:760 [G] | E:53 [ASN] | A:714 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:50 [GLU] | 0:894 [A] | E:53 [ASN] | A:846 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:54 [LEU] | 0:476 [A] | E:58 [SER] | A:516 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:54 [LEU] | 0:475 [G] | E:58 [SER] | A:515 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:60 [SER] | 0:1361 [C] | E:65 [TRP] | A:1295 [C] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:62 [GLY] | 0:2479 [A] | E:67 [GLN] | A:2471 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:62 [GLY] | 0:765 [G] | E:67 [GLN] | A:719 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:70 [VAL] | 0:766 [A] | E:75 [GLN] | A:720 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:70 [VAL] | 0:765 [G] | E:75 [GLN] | A:719 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:71 [PRO] | 0:766 [A] | E:76 [GLY] | A:720 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:72 [LYS] | 0:765 [G] | E:77 [THR] | A:719 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:79 [ARG] | 0:476 [A] | E:79 [ARG] | A:516 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:79 [ARG] | 0:458 [G] | E:79 [ARG] | A:498 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:79 [ARG] | 0:475 [G] | E:79 [ARG] | A:515 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:81 [PRO] | 0:641 [G] | E:81 [PRO] | A:627 [C] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:83 [ALA] | 0:1362 [U] | E:83 [TRP] | A:1296 [C] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:83 [ALA] | 0:1360 [C] | E:83 [TRP] | A:1294 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:84 [VAL] | 0:477 [A] | E:84 [ARG] | A:517 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:84 [VAL] | 0:476 [A] | E:84 [ARG] | A:516 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:88 [SER] | 0:455 [A] | E:88 [ILE] | A:495 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:89 [ALA] | 0:762 [C] | E:89 [VAL] | A:716 [C] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:90 [HIS] | 0:761 [A] | E:90 [PHE] | A:715 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:90 [HIS] | 0:760 [G] | E:90 [PHE] | A:714 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:99 [SER] | 0:676 [C] | E:98 [ALA] | A:660 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:85 [LYS] | 0:459 [A] | E:85 [GLY] | A:499 [A] | ❌ 6S0Z_A:499 no longer at interface |
C:84 [VAL] | 0:640 [G] | E:84 [ARG] | A:626 [G] | ❌ 6S0Z_A:626 no longer at interface |
C:51 [TYR] | 0:892 [G] | E:55 [SER] | A:844 [G] | ❌ 6S0Z_A:844 no longer at interface |
C:217 [GLU] | 0:671 [A] | E:180 [GLY] | A:656 [G] | ❌ 6S0Z_A:656 no longer at interface |
C:100 [LEU] | 0:752 [G] | E:99 [TYR] | A:706 [U] | ❌ 6S0Z_A:706 no longer at interface |
C:205 [ARG] | 0:348 [C] | E:168 [ARG] | A:384 [G] | ❌ 6S0Z_A:384 no longer at interface |
C:101 [ASP] | 0:665 [A] | E:100 [LYS] | A:651 [A] | ❌ 1YHQ_0:665 no longer at interface |
C:104 [ASP] | 0:681 [G] | E:103 [LYS] | A:665 [G] | ❌ 1YHQ_0:681 no longer at interface |
C:151 [GLN] | 0:325 [U] | E:137 [LYS] | A:361 [U] | ❌ 1YHQ_0:325 no longer at interface |
C:54 [LEU] | 0:464 [G] | E:58 [SER] | A:504 [G] | ❌ 1YHQ_0:464 no longer at interface |
C:58 [ALA] | 0:473 [A] | E:62 [ARG] | A:513 [G] | ❌ 1YHQ_C:58, 1YHQ_0:473 no longer at interface |
C:58 [ALA] | 0:889 [C] | E:62 [ARG] | A:841 [C] | ❌ 1YHQ_C:58, 1YHQ_0:889 no longer at interface |
C:62 [GLY] | 0:2478 [U] | E:67 [GLN] | A:2470 [C] | ❌ 1YHQ_0:2478 no longer at interface |
C:63 [SER] | 0:2102 [G] | E:68 [LYS] | A:2088 [G] | ❌ 1YHQ_0:2102 no longer at interface |
C:63 [SER] | 0:2478 [U] | E:68 [LYS] | A:2470 [C] | ❌ 1YHQ_0:2478 no longer at interface |
C:69 [HIS] | 0:2480 [G] | E:74 [ARG] | A:2472 [G] | ❌ 1YHQ_0:2480 no longer at interface |
C:69 [HIS] | 0:900 [U] | E:74 [ARG] | A:852 [U] | ❌ 1YHQ_0:900 no longer at interface |
C:84 [VAL] | 0:478 [C] | E:84 [ARG] | A:518 [A] | ❌ 1YHQ_0:478 no longer at interface |
C:209 [GLY] | 0:330 [C] | E:172 [GLY] | A:366 [G] | ❌ 6S0Z_E:172 no longer at interface |
C:246 [ARG] | 0:677 [C] | E:206 [LEU] | A:661 [U] | ❌ 6S0Z_E:206 no longer at interface |
C:246 [ARG] | 0:678 [G] | E:206 [LEU] | A:662 [G] | ❌ 6S0Z_E:206 no longer at interface |
C:87 [ARG] | 0:763 [C] | E:87 [GLY] | A:717 [C] | ❌ 6S0Z_E:87 no longer at interface |
C:87 [ARG] | 0:764 [C] | E:87 [GLY] | A:718 [C] | ❌ 6S0Z_E:87 no longer at interface |
C:87 [ARG] | 0:894 [A] | E:87 [GLY] | A:846 [G] | ❌ 6S0Z_E:87 no longer at interface |
C:221 [GLU] | 0:675 [U] | E:184 [LEU] | A:659 [A] | ❌ 6S0Z_E:184 no longer at interface |
C:61 [PHE] | 0:766 [A] | E:66 [LYS] | A:720 [A] | ❌ 6S0Z_E:66 no longer at interface |
C:61 [PHE] | 0:767 [A] | E:66 [LYS] | A:721 [A] | ❌ 6S0Z_E:66 no longer at interface |
C:64 [GLY] | 0:1359 [U] | E:69 [GLY] | A:1293 [U] | ❌ 6S0Z_E:69 no longer at interface |
C:64 [GLY] | 0:2100 [A] | E:69 [GLY] | A:2086 [A] | ❌ 6S0Z_E:69 no longer at interface |
C:64 [GLY] | 0:2101 [A] | E:69 [GLY] | A:2087 [A] | ❌ 6S0Z_E:69 no longer at interface |
C:111 [VAL] | 0:677 [C] | E:110 [LEU] | A:661 [U] | ❌ 6S0Z_E:110 no longer at interface |
C:166 [ILE] | 0:1309 [U] | E:150 [LYS] | A:1243 [G] | ❌ 1YHQ_C:166 no longer at interface |
C:191 [SER] | 0:1309 [U] | E:151 [LYS] | A:1243 [G] | ❌ 1YHQ_C:191 no longer at interface |
C:191 [SER] | 0:1308 [A] | E:151 [LYS] | A:1242 [A] | ❌ 1YHQ_C:191 no longer at interface |
C:32 [GLY] | 0:1349 [G] | E:34 [PHE] | A:1283 [G] | ❌ 1YHQ_C:32 no longer at interface |
C:32 [GLY] | 0:1348 [A] | E:34 [PHE] | A:1282 [A] | ❌ 1YHQ_C:32 no longer at interface |
C:58 [ALA] | 0:474 [C] | E:62 [ARG] | A:514 [G] | ❌ 1YHQ_C:58 no longer at interface |
C:58 [ALA] | 0:890 [C] | E:62 [ARG] | A:842 [U] | ❌ 1YHQ_C:58 no longer at interface |
C:58 [ALA] | 0:891 [G] | E:62 [ARG] | A:843 [G] | ❌ 1YHQ_C:58 no longer at interface |
C:59 [GLU] | 0:767 [A] | E:63 [LYS] | A:721 [A] | ❌ 1YHQ_C:59 no longer at interface |
C:59 [GLU] | 0:765 [G] | E:63 [LYS] | A:719 [G] | ❌ 1YHQ_C:59 no longer at interface |
C:59 [GLU] | 0:766 [A] | E:63 [LYS] | A:720 [A] | ❌ 1YHQ_C:59 no longer at interface |
C:98 [ARG] | 0:1351 [G] | E:97 [TYR] | A:1285 [A] | ❌ 1YHQ_C:98 no longer at interface |
C:98 [ARG] | 0:1350 [U] | E:97 [TYR] | A:1284 [A] | ❌ 1YHQ_C:98 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L4 | 0.92 | 2.18 | 0.20 | 0.86 | 0.93 | 0.91 | 0.87 | 0.68 | 0.66 | 0.18 | 0.28 |
Other pairs involving 1YHQ_C_0 or 6S0Z_E_A
Total number of entries: 17