Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
1YHQ_C
|
1YHQ_0
|
7K00_e
|
7K00_a
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
C:88 [SER] | 0:456 [G] | e:83 [VAL] | a:450 [G] | ✔ |
C:88 [SER] | 0:1352 [A] | e:83 [VAL] | a:1248 [G] | ✔ |
C:85 [LYS] | 0:454 [U] | e:80 [SER] | a:448 [U] | ✔ |
C:85 [LYS] | 0:455 [A] | e:80 [SER] | a:449 [A] | ✔ |
C:85 [LYS] | 0:477 [A] | e:80 [SER] | a:471 [A] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:643 [A] | e:85 [PHE] | a:586 [A] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:644 [G] | e:85 [PHE] | a:587 [C] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:645 [U] | e:85 [PHE] | a:588 [U] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:762 [C] | e:85 [PHE] | a:671 [C] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:763 [C] | e:85 [PHE] | a:672 [C] | ✔ |
C:84 [VAL] | 0:454 [U] | e:79 [ARG] | a:448 [U] | ✔ |
C:84 [VAL] | 0:455 [A] | e:79 [ARG] | a:449 [A] | ✔ |
C:84 [VAL] | 0:1361 [C] | e:79 [ARG] | a:1257 [C] | ✔ |
C:84 [VAL] | 0:1362 [U] | e:79 [ARG] | a:1258 [U] | ✔ |
C:37 [ALA] | 0:676 [C] | e:34 [ALA] | a:615 [U] | ✔ |
C:53 [GLY] | 0:458 [G] | e:52 [VAL] | a:452 [G] | ✔ |
C:246 [ARG] | 0:677 [C] | e:199 [MET] | a:616 [A] | ✔ |
C:246 [ARG] | 0:678 [G] | e:199 [MET] | a:617 [G] | ✔ |
C:150 [THR] | 0:327 [A] | e:131 [THR] | a:320 [A] | ✔ |
C:150 [THR] | 0:328 [U] | e:131 [THR] | a:321 [U] | ✔ |
C:150 [THR] | 0:329 [A] | e:131 [THR] | a:322 [A] | ✔ |
C:154 [VAL] | 0:327 [A] | e:135 [ALA] | a:320 [A] | ✔ |
C:94 [THR] | 0:35 [U] | e:89 [PRO] | a:38 [A] | ✔ |
C:94 [THR] | 0:36 [C] | e:89 [PRO] | a:39 [G] | ✔ |
C:36 [ARG] | 0:1348 [A] | e:33 [VAL] | a:1244 [A] | ✔ |
C:36 [ARG] | 0:1349 [G] | e:33 [VAL] | a:1245 [G] | ✔ |
C:108 [GLN] | 0:678 [G] | e:102 [ARG] | a:617 [G] | ✔ |
C:108 [GLN] | 0:679 [G] | e:102 [ARG] | a:618 [G] | ✔ |
C:38 [ALA] | 0:676 [C] | e:35 [TYR] | a:615 [U] | ✔ |
C:43 [LYS] | 0:449 [A] | e:40 [ARG] | a:443 [A] | ✔ |
C:151 [GLN] | 0:326 [G] | e:132 [LYS] | a:319 [G] | ✔ |
C:151 [GLN] | 0:327 [A] | e:132 [LYS] | a:320 [A] | ✔ |
C:151 [GLN] | 0:328 [U] | e:132 [LYS] | a:321 [U] | ✔ |
C:149 [LYS] | 0:327 [A] | e:130 [LYS] | a:320 [A] | ✔ |
C:149 [LYS] | 0:328 [U] | e:130 [LYS] | a:321 [U] | ✔ |
C:49 [ASP] | 0:34 [C] | e:47 [LYS] | a:37 [C] | ✔ |
C:49 [ASP] | 0:457 [U] | e:47 [LYS] | a:451 [U] | ✔ |
C:55 [ARG] | 0:475 [G] | e:54 [GLY] | a:469 [G] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:764 [C] | e:69 [ARG] | a:673 [C] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:765 [G] | e:69 [ARG] | a:674 [G] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:1359 [U] | e:69 [ARG] | a:1255 [U] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:2101 [A] | e:69 [ARG] | a:2060 [A] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:2479 [A] | e:69 [ARG] | a:2444 [G] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:641 [G] | e:77 [ILE] | a:584 [C] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:642 [G] | e:77 [ILE] | a:585 [G] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:763 [C] | e:77 [ILE] | a:672 [C] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:764 [C] | e:77 [ILE] | a:673 [C] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:1358 [A] | e:77 [ILE] | a:1254 [A] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:1360 [C] | e:77 [ILE] | a:1256 [G] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:1361 [C] | e:77 [ILE] | a:1257 [C] | ✔ |
C:106 [GLU] | 0:656 [G] | e:100 [MET] | a:599 [A] | ✔ |
C:106 [GLU] | 0:657 [G] | e:100 [MET] | a:600 [G] | ✔ |
C:57 [PRO] | 0:891 [G] | e:56 [GLY] | a:798 [G] | ✔ |
C:29 [ASP] | 0:656 [G] | e:26 [ALA] | a:599 [A] | ✔ |
C:40 [ALA] | 0:449 [A] | e:37 [ALA] | a:443 [A] | ✔ |
C:105 [LYS] | 0:657 [G] | e:99 [LYS] | a:600 [G] | ✔ |
C:105 [LYS] | 0:658 [C] | e:99 [LYS] | a:601 [C] | ✔ |
C:105 [LYS] | 0:662 [U] | e:99 [LYS] | a:605 [G] | ✔ |
C:105 [LYS] | 0:663 [C] | e:99 [LYS] | a:606 [U] | ✔ |
C:33 [LYS] | 0:656 [G] | e:30 [GLN] | a:599 [A] | ✔ |
C:33 [LYS] | 0:750 [A] | e:30 [GLN] | a:659 [G] | ✔ |
C:33 [LYS] | 0:751 [U] | e:30 [GLN] | a:660 [C] | ✔ |
C:206 [ASN] | 0:326 [G] | e:163 [ASN] | a:319 [G] | ✔ |
C:206 [ASN] | 0:327 [A] | e:163 [ASN] | a:320 [A] | ✔ |
C:206 [ASN] | 0:329 [A] | e:163 [ASN] | a:322 [A] | ✔ |
C:206 [ASN] | 0:330 [C] | e:163 [ASN] | a:323 [C] | ✔ |
C:30 [LEU] | 0:656 [G] | e:27 [LEU] | a:599 [A] | ✔ |
C:30 [LEU] | 0:657 [G] | e:27 [LEU] | a:600 [G] | ✔ |
C:41 [ASN] | 0:676 [C] | e:38 [GLY] | a:615 [U] | ✔ |
C:96 [LYS] | 0:646 [G] | e:90 [GLN] | a:589 [U] | ✔ |
C:96 [LYS] | 0:647 [U] | e:90 [GLN] | a:590 [A] | ✔ |
C:42 [ARG] | 0:449 [A] | e:39 [ALA] | a:443 [A] | ✔ |
C:67 [GLN] | 0:1359 [U] | e:67 [ARG] | a:1255 [U] | ✔ |
C:67 [GLN] | 0:1361 [C] | e:67 [ARG] | a:1257 [C] | ✔ |
C:67 [GLN] | 0:2101 [A] | e:67 [ARG] | a:2060 [A] | ✔ |
C:56 [THR] | 0:474 [C] | e:55 [SER] | a:468 [G] | ✔ |
C:56 [THR] | 0:475 [G] | e:55 [SER] | a:469 [G] | ✔ |
C:56 [THR] | 0:891 [G] | e:55 [SER] | a:798 [G] | ✔ |
C:207 [LEU] | 0:327 [A] | e:164 [LEU] | a:320 [A] | ✔ |
C:207 [LEU] | 0:330 [C] | e:164 [LEU] | a:323 [C] | ✔ |
C:107 [ARG] | 0:676 [C] | e:101 [TYR] | a:615 [U] | ✔ |
C:107 [ARG] | 0:677 [C] | e:101 [TYR] | a:616 [A] | ✔ |
C:107 [ARG] | 0:678 [G] | e:101 [TYR] | a:617 [G] | ✔ |
C:101 [ASP] | 0:750 [A] | e:95 [LYS] | a:659 [G] | ✔ |
C:101 [ASP] | 0:751 [U] | e:95 [LYS] | a:660 [C] | ✔ |
C:52 [ALA] | 0:458 [G] | e:51 [GLU] | a:452 [G] | ✔ |
C:79 [ARG] | 0:894 [A] | e:74 [LYS] | a:801 [G] | ✔ |
C:51 [TYR] | 0:894 [A] | e:50 [ALA] | a:801 [G] | ✔ |
C:148 [VAL] | 0:328 [U] | e:129 [PRO] | a:321 [U] | ✔ |
C:102 [LEU] | 0:664 [U] | e:96 [VAL] | a:607 [U] | ✔ |
C:102 [LEU] | 0:750 [A] | e:96 [VAL] | a:659 [G] | ✔ |
C:81 [PRO] | 0:642 [G] | e:76 [PRO] | a:585 [G] | ✔ |
C:81 [PRO] | 0:763 [C] | e:76 [PRO] | a:672 [C] | ✔ |
C:81 [PRO] | 0:764 [C] | e:76 [PRO] | a:673 [C] | ✔ |
C:216 [SER] | 0:677 [C] | e:173 [THR] | a:616 [A] | ✔ |
C:48 [SER] | 0:34 [C] | e:46 [GLN] | a:37 [C] | ✔ |
C:48 [SER] | 0:456 [G] | e:46 [GLN] | a:450 [G] | ✔ |
C:48 [SER] | 0:457 [U] | e:46 [GLN] | a:451 [U] | ✔ |
C:48 [SER] | 0:1352 [A] | e:46 [GLN] | a:1248 [G] | ✔ |
C:62 [GLY] | 0:766 [A] | e:62 [GLN] | a:675 [A] | ✔ |
C:62 [GLY] | 0:767 [A] | e:62 [GLN] | a:676 [A] | ✔ |
C:62 [GLY] | 0:1359 [U] | e:62 [GLN] | a:1255 [U] | ✔ |
C:63 [SER] | 0:2100 [A] | e:63 [LYS] | a:2059 [A] | ✔ |
C:63 [SER] | 0:2101 [A] | e:63 [LYS] | a:2060 [A] | ✔ |
C:63 [SER] | 0:2479 [A] | e:63 [LYS] | a:2444 [G] | ✔ |
C:203 [ALA] | 0:328 [U] | e:160 [ALA] | a:321 [U] | ✔ |
C:68 [ALA] | 0:1359 [U] | e:68 [ALA] | a:1255 [U] | ✔ |
C:68 [ALA] | 0:1360 [C] | e:68 [ALA] | a:1256 [G] | ✔ |
C:68 [ALA] | 0:1361 [C] | e:68 [ALA] | a:1257 [C] | ✔ |
C:100 [LEU] | 0:751 [U] | e:94 [GLN] | a:660 [C] | ✔ |
C:100 [LEU] | 0:752 [G] | e:94 [GLN] | a:661 [A] | ✔ |
C:54 [LEU] | 0:458 [G] | e:53 [THR] | a:452 [G] | ✔ |
C:78 [ARG] | 0:475 [G] | e:73 [ILE] | a:469 [G] | ✔ |
C:205 [ARG] | 0:328 [U] | e:162 [ARG] | a:321 [U] | ✔ |
C:205 [ARG] | 0:329 [A] | e:162 [ARG] | a:322 [A] | ✔ |
C:205 [ARG] | 0:347 [A] | e:162 [ARG] | a:340 [A] | ✔ |
C:27 [ARG] | 0:656 [G] | e:24 [ASN] | a:599 [A] | ✔ |
C:27 [ARG] | 0:657 [G] | e:24 [ASN] | a:600 [G] | ✔ |
C:47 [GLY] | 0:34 [C] | e:45 [ALA] | a:37 [C] | ✔ |
C:47 [GLY] | 0:35 [U] | e:45 [ALA] | a:38 [A] | ✔ |
C:46 [TYR] | 0:35 [U] | e:44 [ARG] | a:38 [A] | ✔ |
C:46 [TYR] | 0:448 [G] | e:44 [ARG] | a:442 [G] | ✔ |
C:46 [TYR] | 0:450 [C] | e:44 [ARG] | a:444 [C] | ✔ |
C:46 [TYR] | 0:1351 [G] | e:44 [ARG] | a:1247 [A] | ✔ |
C:46 [TYR] | 0:1352 [A] | e:44 [ARG] | a:1248 [G] | ✔ |
C:65 [ARG] | 0:2100 [A] | e:65 [THR] | a:2059 [A] | ✔ |
C:65 [ARG] | 0:2101 [A] | e:65 [THR] | a:2060 [A] | ✔ |
C:66 [GLY] | 0:1359 [U] | e:66 [GLY] | a:1255 [U] | ✔ |
C:66 [GLY] | 0:2100 [A] | e:66 [GLY] | a:2059 [A] | ✔ |
C:66 [GLY] | 0:2101 [A] | e:66 [GLY] | a:2060 [A] | ✔ |
C:80 [VAL] | 0:764 [C] | e:75 [SER] | a:673 [C] | ✔ |
C:80 [VAL] | 0:765 [G] | e:75 [SER] | a:674 [G] | ✔ |
C:103 [ASN] | 0:657 [G] | e:97 [ASN] | a:600 [G] | ✔ |
C:103 [ASN] | 0:663 [C] | e:97 [ASN] | a:606 [U] | ✔ |
C:103 [ASN] | 0:664 [U] | e:97 [ASN] | a:607 [U] | ✔ |
C:103 [ASN] | 0:749 [C] | e:97 [ASN] | a:658 [U] | ✔ |
C:103 [ASN] | 0:750 [A] | e:97 [ASN] | a:659 [G] | ✔ |
C:71 [PRO] | 0:764 [C] | e:71 [GLY] | a:673 [C] | ✔ |
C:71 [PRO] | 0:765 [G] | e:71 [GLY] | a:674 [G] | ✔ |
C:104 [ASP] | 0:664 [U] | e:98 [LYS] | a:607 [U] | ✔ |
C:104 [ASP] | 0:678 [G] | e:98 [LYS] | a:617 [G] | ✔ |
C:104 [ASP] | 0:680 [G] | e:98 [LYS] | a:619 [G] | ✔ |
C:64 [GLY] | 0:2100 [A] | e:64 [GLY] | a:2059 [A] | ✔ |
C:64 [GLY] | 0:2101 [A] | e:64 [GLY] | a:2060 [A] | ✔ |
C:208 [ALA] | 0:330 [C] | e:165 [HIS] | a:323 [C] | ✔ |
C:89 [ALA] | 0:643 [A] | e:84 [THR] | a:586 [A] | ✔ |
C:89 [ALA] | 0:763 [C] | e:84 [THR] | a:672 [C] | ✔ |
C:89 [ALA] | 0:894 [A] | e:84 [THR] | a:801 [G] | ✔ |
C:83 [ALA] | 0:1361 [C] | e:78 [TRP] | a:1257 [C] | ✔ |
C:86 [GLY] | 0:455 [A] | e:81 [GLY] | a:449 [A] | ✔ |
C:86 [GLY] | 0:456 [G] | e:81 [GLY] | a:450 [G] | ✔ |
C:44 [GLN] | 0:35 [U] | e:41 [GLN] | a:38 [A] | ✔ |
C:44 [GLN] | 0:36 [C] | e:41 [GLN] | a:39 [G] | ✔ |
C:44 [GLN] | 0:447 [A] | e:41 [GLN] | a:441 [U] | ✔ |
C:44 [GLN] | 0:448 [G] | e:41 [GLN] | a:442 [G] | ✔ |
C:44 [GLN] | 0:449 [A] | e:41 [GLN] | a:443 [A] | ✔ |
C:85 [LYS] | 0:458 [G] | e:80 [SER] | a:452 [G] | ❌ 7K00_e_a |
C:85 [LYS] | 0:476 [A] | e:80 [SER] | a:470 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:90 [HIS] | 0:1352 [A] | e:85 [PHE] | a:1248 [G] | ❌ 7K00_e_a |
C:45 [ASP] | 0:35 [U] | e:42 [GLY] | a:38 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:45 [ASP] | 0:36 [C] | e:42 [GLY] | a:39 [G] | ❌ 7K00_e_a |
C:37 [ALA] | 0:675 [U] | e:34 [ALA] | a:614 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:209 [GLY] | 0:330 [C] | e:166 [LYS] | a:323 [C] | ❌ 7K00_e_a |
C:53 [GLY] | 0:457 [U] | e:52 [VAL] | a:451 [U] | ❌ 7K00_e_a |
C:38 [ALA] | 0:675 [U] | e:35 [TYR] | a:614 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:149 [LYS] | 0:326 [G] | e:130 [LYS] | a:319 [G] | ❌ 7K00_e_a |
C:60 [SER] | 0:765 [G] | e:60 [TRP] | a:674 [G] | ❌ 7K00_e_a |
C:60 [SER] | 0:766 [A] | e:60 [TRP] | a:675 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:60 [SER] | 0:767 [A] | e:60 [TRP] | a:676 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:49 [ASP] | 0:35 [U] | e:47 [LYS] | a:38 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:55 [ARG] | 0:457 [U] | e:54 [GLY] | a:451 [U] | ❌ 7K00_e_a |
C:55 [ARG] | 0:458 [G] | e:54 [GLY] | a:452 [G] | ❌ 7K00_e_a |
C:69 [HIS] | 0:766 [A] | e:69 [ARG] | a:675 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:72 [LYS] | 0:1361 [C] | e:72 [SER] | a:1257 [C] | ❌ 7K00_e_a |
C:72 [LYS] | 0:1362 [U] | e:72 [SER] | a:1258 [U] | ❌ 7K00_e_a |
C:57 [PRO] | 0:474 [C] | e:56 [GLY] | a:468 [G] | ❌ 7K00_e_a |
C:57 [PRO] | 0:475 [G] | e:56 [GLY] | a:469 [G] | ❌ 7K00_e_a |
C:57 [PRO] | 0:890 [C] | e:56 [GLY] | a:797 [G] | ❌ 7K00_e_a |
C:70 [VAL] | 0:764 [C] | e:70 [SER] | a:673 [C] | ❌ 7K00_e_a |
C:70 [VAL] | 0:1360 [C] | e:70 [SER] | a:1256 [G] | ❌ 7K00_e_a |
C:70 [VAL] | 0:1361 [C] | e:70 [SER] | a:1257 [C] | ❌ 7K00_e_a |
C:105 [LYS] | 0:664 [U] | e:99 [LYS] | a:607 [U] | ❌ 7K00_e_a |
C:206 [ASN] | 0:331 [A] | e:163 [ASN] | a:324 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:41 [ASN] | 0:675 [U] | e:38 [GLY] | a:614 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:96 [LYS] | 0:1350 [U] | e:90 [GLN] | a:1246 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:96 [LYS] | 0:1351 [G] | e:90 [GLN] | a:1247 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:42 [ARG] | 0:675 [U] | e:39 [ALA] | a:614 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:52 [ALA] | 0:457 [U] | e:51 [GLU] | a:451 [U] | ❌ 7K00_e_a |
C:51 [TYR] | 0:458 [G] | e:50 [ALA] | a:452 [G] | ❌ 7K00_e_a |
C:48 [SER] | 0:35 [U] | e:46 [GLN] | a:38 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:39 [GLN] | 0:675 [U] | e:36 [ALA] | a:614 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:63 [SER] | 0:767 [A] | e:63 [LYS] | a:676 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:63 [SER] | 0:1359 [U] | e:63 [LYS] | a:1255 [U] | ❌ 7K00_e_a |
C:100 [LEU] | 0:750 [A] | e:94 [GLN] | a:659 [G] | ❌ 7K00_e_a |
C:54 [LEU] | 0:894 [A] | e:53 [THR] | a:801 [G] | ❌ 7K00_e_a |
C:78 [ARG] | 0:476 [A] | e:73 [ILE] | a:470 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:78 [ARG] | 0:477 [A] | e:73 [ILE] | a:471 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:50 [GLU] | 0:35 [U] | e:48 [THR] | a:38 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:103 [ASN] | 0:656 [G] | e:97 [ASN] | a:599 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:104 [ASP] | 0:663 [C] | e:98 [LYS] | a:606 [U] | ❌ 7K00_e_a |
C:64 [GLY] | 0:1359 [U] | e:64 [GLY] | a:1255 [U] | ❌ 7K00_e_a |
C:208 [ALA] | 0:327 [A] | e:165 [HIS] | a:320 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:83 [ALA] | 0:455 [A] | e:78 [TRP] | a:449 [A] | ❌ 7K00_e_a |
C:106 [GLU] | 0:750 [A] | e:100 [MET] | a:659 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:106 [GLU] | 0:749 [C] | e:100 [MET] | a:658 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:205 [ARG] | 0:331 [A] | e:162 [ARG] | a:324 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:214 [THR] | 0:670 [G] | e:171 [ASP] | a:613 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:216 [SER] | 0:670 [G] | e:173 [THR] | a:613 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:216 [SER] | 0:675 [U] | e:173 [THR] | a:614 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:39 [GLN] | 0:449 [A] | e:36 [ALA] | a:443 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:39 [GLN] | 0:676 [C] | e:36 [ALA] | a:615 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:42 [ARG] | 0:676 [C] | e:39 [ALA] | a:615 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:43 [LYS] | 0:450 [C] | e:40 [ARG] | a:444 [C] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:43 [LYS] | 0:1350 [U] | e:40 [ARG] | a:1246 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:45 [ASP] | 0:449 [A] | e:42 [GLY] | a:443 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:45 [ASP] | 0:450 [C] | e:42 [GLY] | a:444 [C] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:45 [ASP] | 0:448 [G] | e:42 [GLY] | a:442 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:46 [TYR] | 0:34 [C] | e:44 [ARG] | a:37 [C] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:47 [GLY] | 0:457 [U] | e:45 [ALA] | a:451 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:47 [GLY] | 0:456 [G] | e:45 [ALA] | a:450 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:48 [SER] | 0:450 [C] | e:46 [GLN] | a:444 [C] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:49 [ASP] | 0:458 [G] | e:47 [LYS] | a:452 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:50 [GLU] | 0:894 [A] | e:48 [THR] | a:801 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:50 [GLU] | 0:760 [G] | e:48 [THR] | a:669 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:54 [LEU] | 0:457 [U] | e:53 [THR] | a:451 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:54 [LEU] | 0:475 [G] | e:53 [THR] | a:469 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:55 [ARG] | 0:891 [G] | e:54 [GLY] | a:798 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:56 [THR] | 0:890 [C] | e:55 [SER] | a:797 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:60 [SER] | 0:1361 [C] | e:60 [TRP] | a:1257 [C] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:62 [GLY] | 0:765 [G] | e:62 [GLN] | a:674 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:62 [GLY] | 0:2479 [A] | e:62 [GLN] | a:2444 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:62 [GLY] | 0:2101 [A] | e:62 [GLN] | a:2060 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:66 [GLY] | 0:1360 [C] | e:66 [GLY] | a:1256 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:67 [GLN] | 0:1362 [U] | e:67 [ARG] | a:1258 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:67 [GLN] | 0:1360 [C] | e:67 [ARG] | a:1256 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:70 [VAL] | 0:765 [G] | e:70 [SER] | a:674 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:70 [VAL] | 0:766 [A] | e:70 [SER] | a:675 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:71 [PRO] | 0:766 [A] | e:71 [GLY] | a:675 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:72 [LYS] | 0:765 [G] | e:72 [SER] | a:674 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:83 [ALA] | 0:1360 [C] | e:78 [TRP] | a:1256 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:84 [VAL] | 0:477 [A] | e:79 [ARG] | a:471 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:84 [VAL] | 0:476 [A] | e:79 [ARG] | a:470 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:88 [SER] | 0:455 [A] | e:83 [VAL] | a:449 [A] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:89 [ALA] | 0:642 [G] | e:84 [THR] | a:585 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:89 [ALA] | 0:760 [G] | e:84 [THR] | a:669 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:90 [HIS] | 0:760 [G] | e:85 [PHE] | a:669 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:101 [ASP] | 0:664 [U] | e:95 [LYS] | a:607 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:101 [ASP] | 0:663 [C] | e:95 [LYS] | a:606 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:101 [ASP] | 0:749 [C] | e:95 [LYS] | a:658 [U] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:104 [ASP] | 0:679 [G] | e:98 [LYS] | a:618 [G] | ❌ 1YHQ_C_0 |
C:85 [LYS] | 0:459 [A] | e:80 [SER] | a:453 [A] | ❌ 7K00_a:453 no longer at interface |
C:84 [VAL] | 0:640 [G] | e:79 [ARG] | a:583 [G] | ❌ 7K00_a:583 no longer at interface |
C:43 [LYS] | 0:1306 [U] | e:40 [ARG] | a:1201 [U] | ❌ 7K00_a:1201 no longer at interface |
C:93 [LYS] | 0:761 [A] | e:88 [ARG] | a:670 [A] | ❌ 7K00_e:88, 7K00_a:670 no longer at interface |
C:51 [TYR] | 0:892 [G] | e:50 [ALA] | a:799 [G] | ❌ 7K00_a:799 no longer at interface |
C:39 [GLN] | 0:1307 [A] | e:36 [ALA] | a:1202 [G] | ❌ 7K00_a:1202 no longer at interface |
C:205 [ARG] | 0:348 [C] | e:162 [ARG] | a:341 [C] | ❌ 7K00_a:341 no longer at interface |
C:225 [PRO] | 0:1308 [A] | e:182 [ALA] | a:1203 [U] | ❌ 7K00_e:182, 7K00_a:1203 no longer at interface |
C:54 [LEU] | 0:464 [G] | e:53 [THR] | a:458 [G] | ❌ 1YHQ_0:464 no longer at interface |
C:58 [ALA] | 0:889 [C] | e:57 [LYS] | a:796 [C] | ❌ 1YHQ_C:58, 1YHQ_0:889 no longer at interface |
C:58 [ALA] | 0:888 [U] | e:57 [LYS] | a:795 [C] | ❌ 1YHQ_C:58, 1YHQ_0:888 no longer at interface |
C:62 [GLY] | 0:2478 [U] | e:62 [GLN] | a:2443 [C] | ❌ 1YHQ_0:2478 no longer at interface |
C:63 [SER] | 0:2478 [U] | e:63 [LYS] | a:2443 [C] | ❌ 1YHQ_0:2478 no longer at interface |
C:63 [SER] | 0:2103 [A] | e:63 [LYS] | a:2062 [A] | ❌ 1YHQ_0:2103 no longer at interface |
C:63 [SER] | 0:2102 [G] | e:63 [LYS] | a:2061 [G] | ❌ 1YHQ_0:2102 no longer at interface |
C:69 [HIS] | 0:900 [U] | e:69 [ARG] | a:807 [U] | ❌ 1YHQ_0:900 no longer at interface |
C:69 [HIS] | 0:2480 [G] | e:69 [ARG] | a:2445 [2MG] | ❌ 1YHQ_0:2480 no longer at interface |
C:84 [VAL] | 0:478 [C] | e:79 [ARG] | a:472 [A] | ❌ 1YHQ_0:478 no longer at interface |
C:104 [ASP] | 0:681 [G] | e:98 [LYS] | a:620 [G] | ❌ 1YHQ_0:681 no longer at interface |
C:87 [ARG] | 0:763 [C] | e:82 [GLY] | a:672 [C] | ❌ 7K00_e:82 no longer at interface |
C:87 [ARG] | 0:764 [C] | e:82 [GLY] | a:673 [C] | ❌ 7K00_e:82 no longer at interface |
C:87 [ARG] | 0:894 [A] | e:82 [GLY] | a:801 [G] | ❌ 7K00_e:82 no longer at interface |
C:219 [ASN] | 0:676 [C] | e:176 [ASP] | a:615 [U] | ❌ 7K00_e:176 no longer at interface |
C:219 [ASN] | 0:677 [C] | e:176 [ASP] | a:616 [A] | ❌ 7K00_e:176 no longer at interface |
C:202 [THR] | 0:328 [U] | e:158 [PHE] | a:321 [U] | ❌ 7K00_e:158 no longer at interface |
C:202 [THR] | 0:329 [A] | e:158 [PHE] | a:322 [A] | ❌ 7K00_e:158 no longer at interface |
C:93 [LYS] | 0:645 [U] | e:88 [ARG] | a:588 [U] | ❌ 7K00_e:88 no longer at interface |
C:93 [LYS] | 0:646 [G] | e:88 [ARG] | a:589 [U] | ❌ 7K00_e:88 no longer at interface |
C:93 [LYS] | 0:760 [G] | e:88 [ARG] | a:669 [G] | ❌ 7K00_e:88 no longer at interface |
C:221 [GLU] | 0:675 [U] | e:178 [VAL] | a:614 [A] | ❌ 7K00_e:178 no longer at interface |
C:218 [VAL] | 0:677 [C] | e:175 [ILE] | a:616 [A] | ❌ 7K00_e:175 no longer at interface |
C:97 [ASP] | 0:646 [G] | e:91 [ASP] | a:589 [U] | ❌ 7K00_e:91 no longer at interface |
C:97 [ASP] | 0:647 [U] | e:91 [ASP] | a:590 [A] | ❌ 7K00_e:91 no longer at interface |
C:99 [SER] | 0:751 [U] | e:93 [SER] | a:660 [C] | ❌ 7K00_e:93 no longer at interface |
C:217 [GLU] | 0:670 [G] | e:174 [GLY] | a:613 [A] | ❌ 7K00_e:174 no longer at interface |
C:217 [GLU] | 0:676 [C] | e:174 [GLY] | a:615 [U] | ❌ 7K00_e:174 no longer at interface |
C:217 [GLU] | 0:677 [C] | e:174 [GLY] | a:616 [A] | ❌ 7K00_e:174 no longer at interface |
C:61 [PHE] | 0:766 [A] | e:61 [ARG] | a:675 [A] | ❌ 7K00_e:61 no longer at interface |
C:61 [PHE] | 0:767 [A] | e:61 [ARG] | a:676 [A] | ❌ 7K00_e:61 no longer at interface |
C:92 [PRO] | 0:450 [C] | e:87 [ALA] | a:444 [C] | ❌ 7K00_e:87 no longer at interface |
C:92 [PRO] | 0:1352 [A] | e:87 [ALA] | a:1248 [G] | ❌ 7K00_e:87 no longer at interface |
C:91 [PRO] | 0:645 [U] | e:86 [ALA] | a:588 [U] | ❌ 7K00_e:86 no longer at interface |
C:91 [PRO] | 0:1352 [A] | e:86 [ALA] | a:1248 [G] | ❌ 7K00_e:86 no longer at interface |
C:109 [LEU] | 0:657 [G] | e:103 [GLY] | a:600 [G] | ❌ 7K00_e:103 no longer at interface |
C:109 [LEU] | 0:658 [C] | e:103 [GLY] | a:601 [C] | ❌ 7K00_e:103 no longer at interface |
C:111 [VAL] | 0:677 [C] | e:105 [LEU] | a:616 [A] | ❌ 7K00_e:105 no longer at interface |
C:24 [THR] | 0:658 [C] | e:21 [ARG] | a:601 [C] | ❌ 1YHQ_C:24 no longer at interface |
C:32 [GLY] | 0:1348 [A] | e:29 [HIS] | a:1244 [A] | ❌ 1YHQ_C:32 no longer at interface |
C:32 [GLY] | 0:1349 [G] | e:29 [HIS] | a:1245 [G] | ❌ 1YHQ_C:32 no longer at interface |
C:58 [ALA] | 0:891 [G] | e:57 [LYS] | a:798 [G] | ❌ 1YHQ_C:58 no longer at interface |
C:58 [ALA] | 0:890 [C] | e:57 [LYS] | a:797 [G] | ❌ 1YHQ_C:58 no longer at interface |
C:59 [GLU] | 0:767 [A] | e:58 [LYS] | a:676 [A] | ❌ 1YHQ_C:59 no longer at interface |
C:59 [GLU] | 0:765 [G] | e:58 [LYS] | a:674 [G] | ❌ 1YHQ_C:59 no longer at interface |
C:59 [GLU] | 0:766 [A] | e:58 [LYS] | a:675 [A] | ❌ 1YHQ_C:59 no longer at interface |
C:98 [ARG] | 0:450 [C] | e:92 [HIS] | a:444 [C] | ❌ 1YHQ_C:98 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L4 | 0.91 | 2.39 | 0.20 | 0.82 | 0.9 | 0.9 | 0.86 | 0.65 | 0.56 | 0.26 | 0.37 |
Other pairs involving 1YHQ_C_0 or 7K00_e_a
Total number of entries: 17