Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
3CC2_C
|
3CC2_0
|
7RYG_E
|
7RYG_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
C:88 [SER] | 0:456 [G] | E:82 [LYS] | A:449 [G] | ✔ |
C:88 [SER] | 0:1352 [A] | E:82 [LYS] | A:1243 [G] | ✔ |
C:85 [LYS] | 0:454 [U] | E:79 [GLY] | A:447 [U] | ✔ |
C:85 [LYS] | 0:455 [A] | E:79 [GLY] | A:448 [A] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:643 [A] | E:84 [PHE] | A:584 [A] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:644 [G] | E:84 [PHE] | A:585 [C] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:645 [U] | E:84 [PHE] | A:586 [U] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:762 [C] | E:84 [PHE] | A:669 [C] | ✔ |
C:90 [HIS] | 0:763 [C] | E:84 [PHE] | A:670 [C] | ✔ |
C:45 [ASP] | 0:35 [U] | E:42 [THR] | A:45 [A] | ✔ |
C:45 [ASP] | 0:36 [C] | E:42 [THR] | A:46 [G] | ✔ |
C:84 [VAL] | 0:454 [U] | E:78 [VAL] | A:447 [U] | ✔ |
C:84 [VAL] | 0:455 [A] | E:78 [VAL] | A:448 [A] | ✔ |
C:84 [VAL] | 0:640 [G] | E:78 [VAL] | A:581 [G] | ✔ |
C:84 [VAL] | 0:1361 [C] | E:78 [VAL] | A:1252 [C] | ✔ |
C:84 [VAL] | 0:1362 [U] | E:78 [VAL] | A:1253 [U] | ✔ |
C:37 [ALA] | 0:676 [C] | E:33 [ALA] | A:613 [U] | ✔ |
C:53 [GLY] | 0:458 [G] | E:51 [VAL] | A:451 [G] | ✔ |
C:150 [THR] | 0:327 [A] | E:130 [THR] | A:322 [G] | ✔ |
C:150 [THR] | 0:328 [U] | E:130 [THR] | A:323 [U] | ✔ |
C:150 [THR] | 0:329 [A] | E:130 [THR] | A:324 [A] | ✔ |
C:154 [VAL] | 0:327 [A] | E:134 [LEU] | A:322 [G] | ✔ |
C:94 [THR] | 0:35 [U] | E:88 [PRO] | A:45 [A] | ✔ |
C:94 [THR] | 0:36 [C] | E:88 [PRO] | A:46 [G] | ✔ |
C:36 [ARG] | 0:1348 [A] | E:32 [THR] | A:1239 [A] | ✔ |
C:36 [ARG] | 0:1349 [G] | E:32 [THR] | A:1240 [G] | ✔ |
C:108 [GLN] | 0:678 [G] | E:101 [ARG] | A:615 [G] | ✔ |
C:108 [GLN] | 0:679 [G] | E:101 [ARG] | A:616 [G] | ✔ |
C:38 [ALA] | 0:676 [C] | E:34 [TYR] | A:613 [U] | ✔ |
C:43 [LYS] | 0:449 [A] | E:39 [ARG] | A:442 [A] | ✔ |
C:151 [GLN] | 0:326 [G] | E:131 [LYS] | A:321 [C] | ✔ |
C:151 [GLN] | 0:327 [A] | E:131 [LYS] | A:322 [G] | ✔ |
C:149 [LYS] | 0:327 [A] | E:129 [LYS] | A:322 [G] | ✔ |
C:149 [LYS] | 0:328 [U] | E:129 [LYS] | A:323 [U] | ✔ |
C:49 [ASP] | 0:34 [C] | E:46 [LYS] | A:44 [C] | ✔ |
C:49 [ASP] | 0:35 [U] | E:46 [LYS] | A:45 [A] | ✔ |
C:49 [ASP] | 0:457 [U] | E:46 [LYS] | A:450 [U] | ✔ |
C:55 [ARG] | 0:475 [G] | E:53 [GLY] | A:468 [G] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:764 [C] | E:68 [ARG] | A:671 [C] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:765 [G] | E:68 [ARG] | A:672 [G] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:1359 [U] | E:68 [ARG] | A:1250 [U] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:2101 [A] | E:68 [ARG] | A:2056 [A] | ✔ |
C:69 [HIS] | 0:2479 [A] | E:68 [ARG] | A:2440 [G] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:641 [G] | E:76 [ILE] | A:582 [C] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:642 [G] | E:76 [ILE] | A:583 [G] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:763 [C] | E:76 [ILE] | A:670 [C] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:764 [C] | E:76 [ILE] | A:671 [C] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:1358 [A] | E:76 [ILE] | A:1249 [A] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:1360 [C] | E:76 [ILE] | A:1251 [G] | ✔ |
C:82 [GLN] | 0:1361 [C] | E:76 [ILE] | A:1252 [C] | ✔ |
C:106 [GLU] | 0:656 [G] | E:99 [MET] | A:597 [A] | ✔ |
C:106 [GLU] | 0:657 [G] | E:99 [MET] | A:598 [G] | ✔ |
C:57 [PRO] | 0:891 [G] | E:55 [GLY] | A:796 [G] | ✔ |
C:29 [ASP] | 0:656 [G] | E:25 [ALA] | A:597 [A] | ✔ |
C:70 [VAL] | 0:765 [G] | E:69 [ALA] | A:672 [G] | ✔ |
C:40 [ALA] | 0:449 [A] | E:36 [ALA] | A:442 [A] | ✔ |
C:105 [LYS] | 0:657 [G] | E:98 [LYS] | A:598 [G] | ✔ |
C:105 [LYS] | 0:658 [C] | E:98 [LYS] | A:599 [C] | ✔ |
C:105 [LYS] | 0:662 [U] | E:98 [LYS] | A:603 [G] | ✔ |
C:105 [LYS] | 0:663 [C] | E:98 [LYS] | A:604 [U] | ✔ |
C:33 [LYS] | 0:656 [G] | E:29 [GLN] | A:597 [A] | ✔ |
C:33 [LYS] | 0:750 [A] | E:29 [GLN] | A:657 [G] | ✔ |
C:33 [LYS] | 0:751 [U] | E:29 [GLN] | A:658 [C] | ✔ |
C:206 [ASN] | 0:327 [A] | E:162 [ASN] | A:322 [G] | ✔ |
C:206 [ASN] | 0:329 [A] | E:162 [ASN] | A:324 [A] | ✔ |
C:206 [ASN] | 0:330 [C] | E:162 [ASN] | A:325 [G] | ✔ |
C:206 [ASN] | 0:331 [A] | E:162 [ASN] | A:326 [A] | ✔ |
C:30 [LEU] | 0:656 [G] | E:26 [LEU] | A:597 [A] | ✔ |
C:30 [LEU] | 0:657 [G] | E:26 [LEU] | A:598 [G] | ✔ |
C:41 [ASN] | 0:676 [C] | E:37 [GLY] | A:613 [U] | ✔ |
C:96 [LYS] | 0:646 [G] | E:89 [GLN] | A:587 [U] | ✔ |
C:96 [LYS] | 0:647 [U] | E:89 [GLN] | A:588 [A] | ✔ |
C:42 [ARG] | 0:449 [A] | E:38 [GLY] | A:442 [A] | ✔ |
C:67 [GLN] | 0:1359 [U] | E:66 [ARG] | A:1250 [U] | ✔ |
C:56 [THR] | 0:475 [G] | E:54 [GLY] | A:468 [G] | ✔ |
C:207 [LEU] | 0:327 [A] | E:163 [LEU] | A:322 [G] | ✔ |
C:107 [ARG] | 0:676 [C] | E:100 [TYR] | A:613 [U] | ✔ |
C:107 [ARG] | 0:677 [C] | E:100 [TYR] | A:614 [A] | ✔ |
C:107 [ARG] | 0:678 [G] | E:100 [TYR] | A:615 [G] | ✔ |
C:101 [ASP] | 0:750 [A] | E:94 [LYS] | A:657 [G] | ✔ |
C:101 [ASP] | 0:751 [U] | E:94 [LYS] | A:658 [C] | ✔ |
C:52 [ALA] | 0:458 [G] | E:50 [ASP] | A:451 [G] | ✔ |
C:51 [TYR] | 0:894 [A] | E:49 [ALA] | A:799 [G] | ✔ |
C:148 [VAL] | 0:328 [U] | E:128 [PRO] | A:323 [U] | ✔ |
C:102 [LEU] | 0:664 [U] | E:95 [VAL] | A:605 [U] | ✔ |
C:102 [LEU] | 0:750 [A] | E:95 [VAL] | A:657 [G] | ✔ |
C:81 [PRO] | 0:642 [G] | E:75 [PRO] | A:583 [G] | ✔ |
C:81 [PRO] | 0:763 [C] | E:75 [PRO] | A:670 [C] | ✔ |
C:81 [PRO] | 0:764 [C] | E:75 [PRO] | A:671 [C] | ✔ |
C:216 [SER] | 0:677 [C] | E:172 [THR] | A:614 [A] | ✔ |
C:48 [SER] | 0:456 [G] | E:45 [HIS] | A:449 [G] | ✔ |
C:48 [SER] | 0:457 [U] | E:45 [HIS] | A:450 [U] | ✔ |
C:48 [SER] | 0:1352 [A] | E:45 [HIS] | A:1243 [G] | ✔ |
C:62 [GLY] | 0:766 [A] | E:61 [GLN] | A:673 [A] | ✔ |
C:62 [GLY] | 0:1359 [U] | E:61 [GLN] | A:1250 [U] | ✔ |
C:63 [SER] | 0:2101 [A] | E:62 [LYS] | A:2056 [A] | ✔ |
C:63 [SER] | 0:2479 [A] | E:62 [LYS] | A:2440 [G] | ✔ |
C:203 [ALA] | 0:328 [U] | E:159 [ALA] | A:323 [U] | ✔ |
C:68 [ALA] | 0:1359 [U] | E:67 [ALA] | A:1250 [U] | ✔ |
C:68 [ALA] | 0:1360 [C] | E:67 [ALA] | A:1251 [G] | ✔ |
C:68 [ALA] | 0:1361 [C] | E:67 [ALA] | A:1252 [C] | ✔ |
C:100 [LEU] | 0:751 [U] | E:93 [GLN] | A:658 [C] | ✔ |
C:100 [LEU] | 0:752 [G] | E:93 [GLN] | A:659 [U] | ✔ |
C:54 [LEU] | 0:458 [G] | E:52 [SER] | A:451 [G] | ✔ |
C:78 [ARG] | 0:475 [G] | E:72 [ILE] | A:468 [G] | ✔ |
C:205 [ARG] | 0:328 [U] | E:161 [ARG] | A:323 [U] | ✔ |
C:205 [ARG] | 0:329 [A] | E:161 [ARG] | A:324 [A] | ✔ |
C:205 [ARG] | 0:347 [A] | E:161 [ARG] | A:342 [A] | ✔ |
C:27 [ARG] | 0:656 [G] | E:23 [ASN] | A:597 [A] | ✔ |
C:27 [ARG] | 0:657 [G] | E:23 [ASN] | A:598 [G] | ✔ |
C:47 [GLY] | 0:34 [C] | E:44 [ALA] | A:44 [C] | ✔ |
C:47 [GLY] | 0:35 [U] | E:44 [ALA] | A:45 [A] | ✔ |
C:46 [TYR] | 0:35 [U] | E:43 [ARG] | A:45 [A] | ✔ |
C:46 [TYR] | 0:448 [G] | E:43 [ARG] | A:441 [G] | ✔ |
C:46 [TYR] | 0:450 [C] | E:43 [ARG] | A:443 [C] | ✔ |
C:46 [TYR] | 0:1351 [G] | E:43 [ARG] | A:1242 [A] | ✔ |
C:46 [TYR] | 0:1352 [A] | E:43 [ARG] | A:1243 [G] | ✔ |
C:65 [ARG] | 0:2100 [A] | E:64 [THR] | A:2055 [A] | ✔ |
C:65 [ARG] | 0:2101 [A] | E:64 [THR] | A:2056 [A] | ✔ |
C:66 [GLY] | 0:1359 [U] | E:65 [GLY] | A:1250 [U] | ✔ |
C:66 [GLY] | 0:2100 [A] | E:65 [GLY] | A:2055 [A] | ✔ |
C:66 [GLY] | 0:2101 [A] | E:65 [GLY] | A:2056 [A] | ✔ |
C:80 [VAL] | 0:764 [C] | E:74 [SER] | A:671 [C] | ✔ |
C:80 [VAL] | 0:765 [G] | E:74 [SER] | A:672 [G] | ✔ |
C:50 [GLU] | 0:894 [A] | E:47 [SER] | A:799 [G] | ✔ |
C:103 [ASN] | 0:663 [C] | E:96 [ASN] | A:604 [U] | ✔ |
C:103 [ASN] | 0:664 [U] | E:96 [ASN] | A:605 [U] | ✔ |
C:103 [ASN] | 0:749 [C] | E:96 [ASN] | A:656 [U] | ✔ |
C:103 [ASN] | 0:750 [A] | E:96 [ASN] | A:657 [G] | ✔ |
C:71 [PRO] | 0:765 [G] | E:70 [GLY] | A:672 [G] | ✔ |
C:104 [ASP] | 0:664 [U] | E:97 [ARG] | A:605 [U] | ✔ |
C:104 [ASP] | 0:678 [G] | E:97 [ARG] | A:615 [G] | ✔ |
C:104 [ASP] | 0:680 [G] | E:97 [ARG] | A:617 [G] | ✔ |
C:64 [GLY] | 0:2100 [A] | E:63 [GLY] | A:2055 [A] | ✔ |
C:64 [GLY] | 0:2101 [A] | E:63 [GLY] | A:2056 [A] | ✔ |
C:208 [ALA] | 0:327 [A] | E:164 [PRO] | A:322 [G] | ✔ |
C:208 [ALA] | 0:330 [C] | E:164 [PRO] | A:325 [G] | ✔ |
C:89 [ALA] | 0:643 [A] | E:83 [THR] | A:584 [A] | ✔ |
C:89 [ALA] | 0:763 [C] | E:83 [THR] | A:670 [C] | ✔ |
C:89 [ALA] | 0:894 [A] | E:83 [THR] | A:799 [G] | ✔ |
C:83 [ALA] | 0:1361 [C] | E:77 [TRP] | A:1252 [C] | ✔ |
C:86 [GLY] | 0:455 [A] | E:80 [GLY] | A:448 [A] | ✔ |
C:86 [GLY] | 0:456 [G] | E:80 [GLY] | A:449 [G] | ✔ |
C:44 [GLN] | 0:449 [A] | E:41 [GLY] | A:442 [A] | ✔ |
C:85 [LYS] | 0:458 [G] | E:79 [GLY] | A:451 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:85 [LYS] | 0:476 [A] | E:79 [GLY] | A:469 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
C:90 [HIS] | 0:1352 [A] | E:84 [PHE] | A:1243 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:209 [GLY] | 0:330 [C] | E:165 [HIS] | A:325 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:53 [GLY] | 0:457 [U] | E:51 [VAL] | A:450 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
C:151 [GLN] | 0:328 [U] | E:131 [LYS] | A:323 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
C:55 [ARG] | 0:457 [U] | E:53 [GLY] | A:450 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
C:55 [ARG] | 0:458 [G] | E:53 [GLY] | A:451 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:69 [HIS] | 0:766 [A] | E:68 [ARG] | A:673 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
C:72 [LYS] | 0:1361 [C] | E:71 [SER] | A:1252 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
C:72 [LYS] | 0:1362 [U] | E:71 [SER] | A:1253 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
C:57 [PRO] | 0:474 [C] | E:55 [GLY] | A:467 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:57 [PRO] | 0:475 [G] | E:55 [GLY] | A:468 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:57 [PRO] | 0:890 [C] | E:55 [GLY] | A:795 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
C:70 [VAL] | 0:764 [C] | E:69 [ALA] | A:671 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
C:70 [VAL] | 0:1360 [C] | E:69 [ALA] | A:1251 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:70 [VAL] | 0:1361 [C] | E:69 [ALA] | A:1252 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
C:105 [LYS] | 0:664 [U] | E:98 [LYS] | A:605 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
C:206 [ASN] | 0:326 [G] | E:162 [ASN] | A:321 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
C:96 [LYS] | 0:1350 [U] | E:89 [GLN] | A:1241 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
C:96 [LYS] | 0:1351 [G] | E:89 [GLN] | A:1242 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
C:67 [GLN] | 0:2101 [A] | E:66 [ARG] | A:2056 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
C:56 [THR] | 0:474 [C] | E:54 [GLY] | A:467 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:56 [THR] | 0:891 [G] | E:54 [GLY] | A:796 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:207 [LEU] | 0:330 [C] | E:163 [LEU] | A:325 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:52 [ALA] | 0:457 [U] | E:50 [ASP] | A:450 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
C:79 [ARG] | 0:894 [A] | E:73 [ARG] | A:799 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:51 [TYR] | 0:458 [G] | E:49 [ALA] | A:451 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:81 [PRO] | 0:641 [G] | E:75 [PRO] | A:582 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
C:48 [SER] | 0:34 [C] | E:45 [HIS] | A:44 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
C:48 [SER] | 0:35 [U] | E:45 [HIS] | A:45 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
C:62 [GLY] | 0:767 [A] | E:61 [GLN] | A:674 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
C:63 [SER] | 0:767 [A] | E:62 [LYS] | A:674 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
C:63 [SER] | 0:1359 [U] | E:62 [LYS] | A:1250 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
C:63 [SER] | 0:2100 [A] | E:62 [LYS] | A:2055 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
C:100 [LEU] | 0:750 [A] | E:93 [GLN] | A:657 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:54 [LEU] | 0:894 [A] | E:52 [SER] | A:799 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:78 [ARG] | 0:476 [A] | E:72 [ILE] | A:469 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
C:50 [GLU] | 0:35 [U] | E:47 [SER] | A:45 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
C:103 [ASN] | 0:656 [G] | E:96 [ASN] | A:597 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
C:103 [ASN] | 0:657 [G] | E:96 [ASN] | A:598 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:103 [ASN] | 0:662 [U] | E:96 [ASN] | A:603 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:71 [PRO] | 0:764 [C] | E:70 [GLY] | A:671 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
C:64 [GLY] | 0:1359 [U] | E:63 [GLY] | A:1250 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
C:83 [ALA] | 0:455 [A] | E:77 [TRP] | A:448 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
C:44 [GLN] | 0:35 [U] | E:41 [GLY] | A:45 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
C:44 [GLN] | 0:36 [C] | E:41 [GLY] | A:46 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:44 [GLN] | 0:447 [A] | E:41 [GLY] | A:440 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
C:44 [GLN] | 0:448 [G] | E:41 [GLY] | A:441 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
C:205 [ARG] | 0:331 [A] | E:161 [ARG] | A:326 [A] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:39 [GLN] | 0:449 [A] | E:35 [LEU] | A:442 [A] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:42 [ARG] | 0:676 [C] | E:38 [GLY] | A:613 [U] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:43 [LYS] | 0:1350 [U] | E:39 [ARG] | A:1241 [A] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:43 [LYS] | 0:450 [C] | E:39 [ARG] | A:443 [C] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:44 [GLN] | 0:450 [C] | E:41 [GLY] | A:443 [C] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:45 [ASP] | 0:448 [G] | E:42 [THR] | A:441 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:45 [ASP] | 0:450 [C] | E:42 [THR] | A:443 [C] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:46 [TYR] | 0:34 [C] | E:43 [ARG] | A:44 [C] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:47 [GLY] | 0:457 [U] | E:44 [ALA] | A:450 [U] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:48 [SER] | 0:450 [C] | E:45 [HIS] | A:443 [C] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:49 [ASP] | 0:458 [G] | E:46 [LYS] | A:451 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:50 [GLU] | 0:760 [G] | E:47 [SER] | A:667 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:54 [LEU] | 0:475 [G] | E:52 [SER] | A:468 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:55 [ARG] | 0:474 [C] | E:53 [GLY] | A:467 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:62 [GLY] | 0:2479 [A] | E:61 [GLN] | A:2440 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:62 [GLY] | 0:765 [G] | E:61 [GLN] | A:672 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:66 [GLY] | 0:1360 [C] | E:65 [GLY] | A:1251 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:67 [GLN] | 0:1360 [C] | E:66 [ARG] | A:1251 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:67 [GLN] | 0:1362 [U] | E:66 [ARG] | A:1253 [U] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:67 [GLN] | 0:1361 [C] | E:66 [ARG] | A:1252 [C] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:70 [VAL] | 0:766 [A] | E:69 [ALA] | A:673 [A] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:71 [PRO] | 0:766 [A] | E:70 [GLY] | A:673 [A] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:72 [LYS] | 0:765 [G] | E:71 [SER] | A:672 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:79 [ARG] | 0:476 [A] | E:73 [ARG] | A:469 [A] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:79 [ARG] | 0:475 [G] | E:73 [ARG] | A:468 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:79 [ARG] | 0:458 [G] | E:73 [ARG] | A:451 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:89 [ALA] | 0:642 [G] | E:83 [THR] | A:583 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:90 [HIS] | 0:760 [G] | E:84 [PHE] | A:667 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:101 [ASP] | 0:663 [C] | E:94 [LYS] | A:604 [U] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:101 [ASP] | 0:749 [C] | E:94 [LYS] | A:656 [U] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:101 [ASP] | 0:664 [U] | E:94 [LYS] | A:605 [U] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:104 [ASP] | 0:679 [G] | E:97 [ARG] | A:616 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:106 [GLU] | 0:750 [A] | E:99 [MET] | A:657 [G] | ❌ 3CC2_C_0 |
C:85 [LYS] | 0:459 [A] | E:79 [GLY] | A:452 [A] | ❌ 7RYG_A:452 no longer at interface |
C:85 [LYS] | 0:477 [A] | E:79 [GLY] | A:470 [A] | ❌ 7RYG_A:470 no longer at interface |
C:43 [LYS] | 0:1306 [U] | E:39 [ARG] | A:1196 [U] | ❌ 7RYG_A:1196 no longer at interface |
C:93 [LYS] | 0:761 [A] | E:87 [ARG] | A:668 [A] | ❌ 7RYG_E:87, 7RYG_A:668 no longer at interface |
C:151 [GLN] | 0:325 [U] | E:131 [LYS] | A:320 [A] | ❌ 7RYG_A:320 no longer at interface |
C:51 [TYR] | 0:892 [G] | E:49 [ALA] | A:797 [G] | ❌ 7RYG_A:797 no longer at interface |
C:217 [GLU] | 0:670 [G] | E:173 [ALA] | A:611 [U] | ❌ 7RYG_E:173, 7RYG_A:611 no longer at interface |
C:39 [GLN] | 0:1307 [A] | E:35 [LEU] | A:1197 [G] | ❌ 7RYG_A:1197 no longer at interface |
C:205 [ARG] | 0:348 [C] | E:161 [ARG] | A:343 [C] | ❌ 7RYG_A:343 no longer at interface |
C:225 [PRO] | 0:1308 [A] | E:181 [ALA] | A:1198 [U] | ❌ 7RYG_E:181, 7RYG_A:1198 no longer at interface |
C:54 [LEU] | 0:464 [G] | E:52 [SER] | A:457 [G] | ❌ 3CC2_0:464 no longer at interface |
C:58 [ALA] | 0:889 [C] | E:56 [LYS] | A:794 [C] | ❌ 3CC2_C:58, 3CC2_0:889 no longer at interface |
C:62 [GLY] | 0:2478 [U] | E:61 [GLN] | A:2439 [U] | ❌ 3CC2_0:2478 no longer at interface |
C:63 [SER] | 0:2102 [G] | E:62 [LYS] | A:2057 [G] | ❌ 3CC2_0:2102 no longer at interface |
C:63 [SER] | 0:2478 [U] | E:62 [LYS] | A:2439 [U] | ❌ 3CC2_0:2478 no longer at interface |
C:69 [HIS] | 0:2480 [G] | E:68 [ARG] | A:2441 [2MG] | ❌ 3CC2_0:2480 no longer at interface |
C:69 [HIS] | 0:900 [U] | E:68 [ARG] | A:805 [U] | ❌ 3CC2_0:900 no longer at interface |
C:104 [ASP] | 0:681 [G] | E:97 [ARG] | A:618 [G] | ❌ 3CC2_0:681 no longer at interface |
C:246 [ARG] | 0:677 [C] | E:200 [GLY] | A:614 [A] | ❌ 7RYG_E:200 no longer at interface |
C:246 [ARG] | 0:678 [G] | E:200 [GLY] | A:615 [G] | ❌ 7RYG_E:200 no longer at interface |
C:87 [ARG] | 0:763 [C] | E:81 [GLY] | A:670 [C] | ❌ 7RYG_E:81 no longer at interface |
C:87 [ARG] | 0:764 [C] | E:81 [GLY] | A:671 [C] | ❌ 7RYG_E:81 no longer at interface |
C:87 [ARG] | 0:894 [A] | E:81 [GLY] | A:799 [G] | ❌ 7RYG_E:81 no longer at interface |
C:219 [ASN] | 0:676 [C] | E:175 [ASP] | A:613 [U] | ❌ 7RYG_E:175 no longer at interface |
C:219 [ASN] | 0:677 [C] | E:175 [ASP] | A:614 [A] | ❌ 7RYG_E:175 no longer at interface |
C:202 [THR] | 0:328 [U] | E:157 [TYR] | A:323 [U] | ❌ 7RYG_E:157 no longer at interface |
C:202 [THR] | 0:329 [A] | E:157 [TYR] | A:324 [A] | ❌ 7RYG_E:157 no longer at interface |
C:93 [LYS] | 0:645 [U] | E:87 [ARG] | A:586 [U] | ❌ 7RYG_E:87 no longer at interface |
C:93 [LYS] | 0:646 [G] | E:87 [ARG] | A:587 [U] | ❌ 7RYG_E:87 no longer at interface |
C:93 [LYS] | 0:760 [G] | E:87 [ARG] | A:667 [G] | ❌ 7RYG_E:87 no longer at interface |
C:60 [SER] | 0:765 [G] | E:59 [PHE] | A:672 [G] | ❌ 7RYG_E:59 no longer at interface |
C:60 [SER] | 0:766 [A] | E:59 [PHE] | A:673 [A] | ❌ 7RYG_E:59 no longer at interface |
C:60 [SER] | 0:767 [A] | E:59 [PHE] | A:674 [A] | ❌ 7RYG_E:59 no longer at interface |
C:218 [VAL] | 0:677 [C] | E:174 [ILE] | A:614 [A] | ❌ 7RYG_E:174 no longer at interface |
C:97 [ASP] | 0:646 [G] | E:90 [ASP] | A:587 [U] | ❌ 7RYG_E:90 no longer at interface |
C:97 [ASP] | 0:647 [U] | E:90 [ASP] | A:588 [A] | ❌ 7RYG_E:90 no longer at interface |
C:99 [SER] | 0:751 [U] | E:92 [SER] | A:658 [C] | ❌ 7RYG_E:92 no longer at interface |
C:217 [GLU] | 0:676 [C] | E:173 [ALA] | A:613 [U] | ❌ 7RYG_E:173 no longer at interface |
C:217 [GLU] | 0:677 [C] | E:173 [ALA] | A:614 [A] | ❌ 7RYG_E:173 no longer at interface |
C:61 [PHE] | 0:767 [A] | E:60 [ARG] | A:674 [A] | ❌ 7RYG_E:60 no longer at interface |
C:92 [PRO] | 0:450 [C] | E:86 [ALA] | A:443 [C] | ❌ 7RYG_E:86 no longer at interface |
C:92 [PRO] | 0:1352 [A] | E:86 [ALA] | A:1243 [G] | ❌ 7RYG_E:86 no longer at interface |
C:91 [PRO] | 0:645 [U] | E:85 [ALA] | A:586 [U] | ❌ 7RYG_E:85 no longer at interface |
C:91 [PRO] | 0:1352 [A] | E:85 [ALA] | A:1243 [G] | ❌ 7RYG_E:85 no longer at interface |
C:109 [LEU] | 0:657 [G] | E:102 [GLY] | A:598 [G] | ❌ 7RYG_E:102 no longer at interface |
C:109 [LEU] | 0:658 [C] | E:102 [GLY] | A:599 [C] | ❌ 7RYG_E:102 no longer at interface |
C:111 [VAL] | 0:677 [C] | E:104 [MET] | A:614 [A] | ❌ 7RYG_E:104 no longer at interface |
C:245 [GLU] | 0:678 [G] | E:198 [GLU] | A:615 [G] | ❌ 3CC2_C:245 no longer at interface |
C:24 [THR] | 0:658 [C] | E:20 [ARG] | A:599 [C] | ❌ 3CC2_C:24 no longer at interface |
C:24 [THR] | 0:657 [G] | E:20 [ARG] | A:598 [G] | ❌ 3CC2_C:24 no longer at interface |
C:32 [GLY] | 0:1348 [A] | E:28 [HIS] | A:1239 [A] | ❌ 3CC2_C:32 no longer at interface |
C:32 [GLY] | 0:1349 [G] | E:28 [HIS] | A:1240 [G] | ❌ 3CC2_C:32 no longer at interface |
C:58 [ALA] | 0:474 [C] | E:56 [LYS] | A:467 [G] | ❌ 3CC2_C:58 no longer at interface |
C:58 [ALA] | 0:891 [G] | E:56 [LYS] | A:796 [G] | ❌ 3CC2_C:58 no longer at interface |
C:58 [ALA] | 0:890 [C] | E:56 [LYS] | A:795 [U] | ❌ 3CC2_C:58 no longer at interface |
C:59 [GLU] | 0:767 [A] | E:57 [LYS] | A:674 [A] | ❌ 3CC2_C:59 no longer at interface |
C:59 [GLU] | 0:765 [G] | E:57 [LYS] | A:672 [G] | ❌ 3CC2_C:59 no longer at interface |
C:59 [GLU] | 0:766 [A] | E:57 [LYS] | A:673 [A] | ❌ 3CC2_C:59 no longer at interface |
C:98 [ARG] | 0:1351 [G] | E:91 [TRP] | A:1242 [A] | ❌ 3CC2_C:98 no longer at interface |
C:98 [ARG] | 0:1350 [U] | E:91 [TRP] | A:1241 [A] | ❌ 3CC2_C:98 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L4 | 0.92 | 2.47 | 0.22 | 0.82 | 0.92 | 0.89 | 0.89 | 0.63 | 0.55 | 0.24 | 0.42 |
Other pairs involving 3CC2_C_0 or 7RYG_E_A
Total number of entries: 16