Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 4Y4O_1F
|
4Y4O_1A
|
7OF0_F
|
7OF0_A
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| 1F:73 [ALA] | 1A:1301 [U] | F:136 [ALA] | A:2299 [U] | ✔ |
| 1F:73 [ALA] | 1A:1302 [G] | F:136 [ALA] | A:2300 [G] | ✔ |
| 1F:73 [ALA] | 1A:1303 [C] | F:136 [ALA] | A:2301 [U] | ✔ |
| 1F:41 [LEU] | 1A:469 [A] | F:104 [LYS] | A:1769 [C] | ✔ |
| 1F:41 [LEU] | 1A:1247 [C] | F:104 [LYS] | A:2278 [A] | ✔ |
| 1F:84 [VAL] | 1A:474 [U] | F:147 [ARG] | A:1774 [U] | ✔ |
| 1F:84 [VAL] | 1A:475 [A] | F:147 [ARG] | A:1775 [A] | ✔ |
| 1F:84 [VAL] | 1A:1303 [C] | F:147 [ARG] | A:2301 [U] | ✔ |
| 1F:84 [VAL] | 1A:1304 [C] | F:147 [ARG] | A:2302 [U] | ✔ |
| 1F:42 [ALA] | 1A:469 [A] | F:105 [ASN] | A:1769 [C] | ✔ |
| 1F:59 [TYR] | 1A:495 [G] | F:122 [GLY] | A:1793 [G] | ✔ |
| 1F:59 [TYR] | 1A:845 [G] | F:122 [GLY] | A:2008 [G] | ✔ |
| 1F:74 [ARG] | 1A:720 [C] | F:137 [ARG] | A:1905 [C] | ✔ |
| 1F:74 [ARG] | 1A:721 [G] | F:137 [ARG] | A:1906 [G] | ✔ |
| 1F:74 [ARG] | 1A:854 [U] | F:137 [ARG] | A:2017 [U] | ✔ |
| 1F:74 [ARG] | 1A:1301 [U] | F:137 [ARG] | A:2299 [U] | ✔ |
| 1F:74 [ARG] | 1A:2456 [G] | F:137 [ARG] | A:2931 [A] | ✔ |
| 1F:74 [ARG] | 1A:2457 [G] | F:137 [ARG] | A:2932 [G] | ✔ |
| 1F:82 [ILE] | 1A:607 [C] | F:145 [LEU] | A:1865 [C] | ✔ |
| 1F:82 [ILE] | 1A:608 [G] | F:145 [LEU] | A:1866 [U] | ✔ |
| 1F:82 [ILE] | 1A:720 [C] | F:145 [LEU] | A:1905 [C] | ✔ |
| 1F:82 [ILE] | 1A:1300 [A] | F:145 [LEU] | A:2298 [A] | ✔ |
| 1F:82 [ILE] | 1A:1302 [G] | F:145 [LEU] | A:2300 [G] | ✔ |
| 1F:82 [ILE] | 1A:1303 [C] | F:145 [LEU] | A:2301 [U] | ✔ |
| 1F:80 [ALA] | 1A:720 [C] | F:143 [SER] | A:1905 [C] | ✔ |
| 1F:80 [ALA] | 1A:721 [G] | F:143 [SER] | A:1906 [G] | ✔ |
| 1F:53 [THR] | 1A:848 [G] | F:116 [THR] | A:2011 [G] | ✔ |
| 1F:97 [TYR] | 1A:1292 [A] | F:161 [TYR] | A:2290 [A] | ✔ |
| 1F:97 [TYR] | 1A:1293 [A] | F:161 [TYR] | A:2291 [A] | ✔ |
| 1F:88 [VAL] | 1A:476 [G] | F:151 [VAL] | A:1776 [G] | ✔ |
| 1F:88 [VAL] | 1A:1294 [G] | F:151 [VAL] | A:2292 [G] | ✔ |
| 1F:104 [LYS] | 1A:623 [G] | F:168 [LYS] | A:1879 [G] | ✔ |
| 1F:104 [LYS] | 1A:624 [C] | F:168 [LYS] | A:1880 [C] | ✔ |
| 1F:104 [LYS] | 1A:628 [C] | F:168 [LYS] | A:1884 [G] | ✔ |
| 1F:104 [LYS] | 1A:629 [U] | F:168 [LYS] | A:1885 [A] | ✔ |
| 1F:60 [SER] | 1A:494 [G] | F:123 [GLY] | A:1792 [G] | ✔ |
| 1F:60 [SER] | 1A:495 [G] | F:123 [GLY] | A:1793 [G] | ✔ |
| 1F:85 [GLY] | 1A:474 [U] | F:148 [GLY] | A:1774 [U] | ✔ |
| 1F:85 [GLY] | 1A:475 [A] | F:148 [GLY] | A:1775 [A] | ✔ |
| 1F:85 [GLY] | 1A:478 [G] | F:148 [GLY] | A:1778 [U] | ✔ |
| 1F:69 [HIS] | 1A:2081 [A] | F:132 [GLY] | A:2722 [A] | ✔ |
| 1F:83 [PHE] | 1A:1303 [C] | F:146 [TRP] | A:2301 [U] | ✔ |
| 1F:83 [PHE] | 1A:1304 [C] | F:146 [TRP] | A:2302 [U] | ✔ |
| 1F:188 [ARG] | 1A:1248 [G] | F:255 [LYS] | A:2279 [U] | ✔ |
| 1F:71 [GLY] | 1A:1301 [U] | F:134 [GLY] | A:2299 [U] | ✔ |
| 1F:75 [HIS] | 1A:720 [C] | F:138 [HIS] | A:1905 [C] | ✔ |
| 1F:75 [HIS] | 1A:721 [G] | F:138 [HIS] | A:1906 [G] | ✔ |
| 1F:75 [HIS] | 1A:722 [A] | F:138 [HIS] | A:1907 [A] | ✔ |
| 1F:75 [HIS] | 1A:1302 [G] | F:138 [HIS] | A:2300 [G] | ✔ |
| 1F:75 [HIS] | 1A:1303 [C] | F:138 [HIS] | A:2301 [U] | ✔ |
| 1F:48 [THR] | 1A:37 [C] | F:111 [TYR] | A:1683 [C] | ✔ |
| 1F:48 [THR] | 1A:38 [A] | F:111 [TYR] | A:1684 [C] | ✔ |
| 1F:48 [THR] | 1A:39 [C] | F:111 [TYR] | A:1685 [C] | ✔ |
| 1F:48 [THR] | 1A:468 [G] | F:111 [TYR] | A:1768 [G] | ✔ |
| 1F:48 [THR] | 1A:470 [C] | F:111 [TYR] | A:1770 [G] | ✔ |
| 1F:99 [TYR] | 1A:706 [C] | F:163 [TYR] | A:1897 [A] | ✔ |
| 1F:99 [TYR] | 1A:707 [G] | F:163 [TYR] | A:1898 [A] | ✔ |
| 1F:91 [GLY] | 1A:1294 [G] | F:154 [GLY] | A:2292 [G] | ✔ |
| 1F:67 [GLN] | 1A:721 [G] | F:130 [GLN] | A:1906 [G] | ✔ |
| 1F:67 [GLN] | 1A:722 [A] | F:130 [GLN] | A:1907 [A] | ✔ |
| 1F:67 [GLN] | 1A:723 [A] | F:130 [GLN] | A:1908 [A] | ✔ |
| 1F:67 [GLN] | 1A:1301 [U] | F:130 [GLN] | A:2299 [U] | ✔ |
| 1F:67 [GLN] | 1A:2455 [C] | F:130 [GLN] | A:2930 [U] | ✔ |
| 1F:67 [GLN] | 1A:2456 [G] | F:130 [GLN] | A:2931 [A] | ✔ |
| 1F:184 [TYR] | 1A:1247 [C] | F:251 [HIS] | A:2278 [A] | ✔ |
| 1F:184 [TYR] | 1A:1248 [G] | F:251 [HIS] | A:2279 [U] | ✔ |
| 1F:55 [GLY] | 1A:848 [G] | F:118 [ALA] | A:2011 [G] | ✔ |
| 1F:45 [ARG] | 1A:469 [A] | F:108 [ARG] | A:1769 [C] | ✔ |
| 1F:45 [ARG] | 1A:470 [C] | F:108 [ARG] | A:1770 [G] | ✔ |
| 1F:45 [ARG] | 1A:1292 [A] | F:108 [ARG] | A:2290 [A] | ✔ |
| 1F:54 [ARG] | 1A:720 [C] | F:117 [ARG] | A:1905 [C] | ✔ |
| 1F:54 [ARG] | 1A:721 [G] | F:117 [ARG] | A:1906 [G] | ✔ |
| 1F:54 [ARG] | 1A:848 [G] | F:117 [ARG] | A:2011 [G] | ✔ |
| 1F:58 [ALA] | 1A:478 [G] | F:121 [ARG] | A:1778 [U] | ✔ |
| 1F:58 [ALA] | 1A:484 [G] | F:121 [ARG] | A:1782 [G] | ✔ |
| 1F:58 [ALA] | 1A:495 [G] | F:121 [ARG] | A:1793 [G] | ✔ |
| 1F:68 [LYS] | 1A:2455 [C] | F:131 [LYS] | A:2930 [U] | ✔ |
| 1F:68 [LYS] | 1A:2456 [G] | F:131 [LYS] | A:2931 [A] | ✔ |
| 1F:101 [LEU] | 1A:630 [U] | F:165 [LEU] | A:1886 [G] | ✔ |
| 1F:101 [LEU] | 1A:706 [C] | F:165 [LEU] | A:1897 [A] | ✔ |
| 1F:89 [VAL] | 1A:609 [A] | F:152 [ALA] | A:1867 [A] | ✔ |
| 1F:89 [VAL] | 1A:719 [C] | F:152 [ALA] | A:1904 [C] | ✔ |
| 1F:29 [ASN] | 1A:622 [G] | F:92 [ARG] | A:1878 [U] | ✔ |
| 1F:29 [ASN] | 1A:623 [G] | F:92 [ARG] | A:1879 [G] | ✔ |
| 1F:81 [PRO] | 1A:607 [C] | F:144 [PRO] | A:1865 [C] | ✔ |
| 1F:81 [PRO] | 1A:608 [G] | F:144 [PRO] | A:1866 [U] | ✔ |
| 1F:81 [PRO] | 1A:719 [C] | F:144 [PRO] | A:1904 [C] | ✔ |
| 1F:81 [PRO] | 1A:720 [C] | F:144 [PRO] | A:1905 [C] | ✔ |
| 1F:56 [GLU] | 1A:478 [G] | F:119 [GLU] | A:1778 [U] | ✔ |
| 1F:77 [ASP] | 1A:721 [G] | F:140 [SER] | A:1906 [G] | ✔ |
| 1F:50 [SER] | 1A:37 [C] | F:113 [LYS] | A:1683 [C] | ✔ |
| 1F:50 [SER] | 1A:38 [A] | F:113 [LYS] | A:1684 [C] | ✔ |
| 1F:50 [SER] | 1A:470 [C] | F:113 [LYS] | A:1770 [G] | ✔ |
| 1F:50 [SER] | 1A:476 [G] | F:113 [LYS] | A:1776 [G] | ✔ |
| 1F:50 [SER] | 1A:477 [C] | F:113 [LYS] | A:1777 [A] | ✔ |
| 1F:34 [TRP] | 1A:1290 [G] | F:97 [HIS] | A:2288 [A] | ✔ |
| 1F:34 [TRP] | 1A:1291 [G] | F:97 [HIS] | A:2289 [G] | ✔ |
| 1F:61 [GLY] | 1A:844 [C] | F:124 [GLY] | A:2007 [U] | ✔ |
| 1F:61 [GLY] | 1A:845 [G] | F:124 [GLY] | A:2008 [G] | ✔ |
| 1F:32 [LEU] | 1A:622 [G] | F:95 [ILE] | A:1878 [U] | ✔ |
| 1F:32 [LEU] | 1A:623 [G] | F:95 [ILE] | A:1879 [G] | ✔ |
| 1F:100 [THR] | 1A:630 [U] | F:164 [MET] | A:1886 [G] | ✔ |
| 1F:100 [THR] | 1A:706 [C] | F:164 [MET] | A:1897 [A] | ✔ |
| 1F:65 [TRP] | 1A:1303 [C] | F:128 [TRP] | A:2301 [U] | ✔ |
| 1F:105 [VAL] | 1A:622 [G] | F:169 [VAL] | A:1878 [U] | ✔ |
| 1F:105 [VAL] | 1A:623 [G] | F:169 [VAL] | A:1879 [G] | ✔ |
| 1F:38 [ARG] | 1A:1291 [G] | F:101 [MET] | A:2289 [G] | ✔ |
| 1F:57 [VAL] | 1A:478 [G] | F:120 [VAL] | A:1778 [U] | ✔ |
| 1F:62 [ARG] | 1A:494 [G] | F:125 [ARG] | A:1792 [G] | ✔ |
| 1F:62 [ARG] | 1A:843 [C] | F:125 [ARG] | A:2006 [C] | ✔ |
| 1F:62 [ARG] | 1A:844 [C] | F:125 [ARG] | A:2007 [U] | ✔ |
| 1F:62 [ARG] | 1A:845 [G] | F:125 [ARG] | A:2008 [G] | ✔ |
| 1F:92 [PRO] | 1A:1294 [G] | F:155 [PRO] | A:2292 [G] | ✔ |
| 1F:106 [ARG] | 1A:630 [U] | F:170 [ARG] | A:1886 [G] | ✔ |
| 1F:47 [GLY] | 1A:469 [A] | F:110 [SER] | A:1769 [C] | ✔ |
| 1F:47 [GLY] | 1A:470 [C] | F:110 [SER] | A:1770 [G] | ✔ |
| 1F:49 [ALA] | 1A:468 [G] | F:112 [ALA] | A:1768 [G] | ✔ |
| 1F:49 [ALA] | 1A:470 [C] | F:112 [ALA] | A:1770 [G] | ✔ |
| 1F:63 [LYS] | 1A:721 [G] | F:126 [LYS] | A:1906 [G] | ✔ |
| 1F:63 [LYS] | 1A:722 [A] | F:126 [LYS] | A:1907 [A] | ✔ |
| 1F:63 [LYS] | 1A:723 [A] | F:126 [LYS] | A:1908 [A] | ✔ |
| 1F:94 [PRO] | 1A:38 [A] | F:158 [PRO] | A:1684 [C] | ✔ |
| 1F:94 [PRO] | 1A:39 [C] | F:158 [PRO] | A:1685 [C] | ✔ |
| 1F:90 [PHE] | 1A:610 [C] | F:153 [HIS] | A:1868 [G] | ✔ |
| 1F:90 [PHE] | 1A:611 [U] | F:153 [HIS] | A:1869 [A] | ✔ |
| 1F:90 [PHE] | 1A:718 [C] | F:153 [HIS] | A:1903 [C] | ✔ |
| 1F:90 [PHE] | 1A:719 [C] | F:153 [HIS] | A:1904 [C] | ✔ |
| 1F:90 [PHE] | 1A:1294 [G] | F:153 [HIS] | A:2292 [G] | ✔ |
| 1F:103 [LYS] | 1A:630 [U] | F:167 [MET] | A:1886 [G] | ✔ |
| 1F:102 [PRO] | 1A:629 [U] | F:166 [PRO] | A:1885 [A] | ✔ |
| 1F:102 [PRO] | 1A:630 [U] | F:166 [PRO] | A:1886 [G] | ✔ |
| 1F:102 [PRO] | 1A:705 [C] | F:166 [PRO] | A:1896 [U] | ✔ |
| 1F:102 [PRO] | 1A:706 [C] | F:166 [PRO] | A:1897 [A] | ✔ |
| 1F:35 [GLU] | 1A:622 [G] | F:98 [GLN] | A:1878 [U] | ✔ |
| 1F:108 [LYS] | 1A:623 [G] | F:172 [LEU] | A:1879 [G] | ✔ |
| 1F:108 [LYS] | 1A:624 [C] | F:172 [LEU] | A:1880 [C] | ✔ |
| 1F:78 [ILE] | 1A:495 [G] | F:141 [ILE] | A:1793 [G] | ✔ |
| 1F:51 [THR] | 1A:476 [G] | F:114 [THR] | A:1776 [G] | ✔ |
| 1F:51 [THR] | 1A:477 [C] | F:114 [THR] | A:1777 [A] | ✔ |
| 1F:51 [THR] | 1A:1294 [G] | F:114 [THR] | A:2292 [G] | ✔ |
| 1F:76 [GLY] | 1A:721 [G] | F:139 [GLY] | A:1906 [G] | ✔ |
| 1F:76 [GLY] | 1A:722 [A] | F:139 [GLY] | A:1907 [A] | ✔ |
| 1F:46 [ARG] | 1A:469 [A] | F:109 [ILE] | A:1769 [C] | ✔ |
| 1F:31 [HIS] | 1A:622 [G] | F:94 [ASP] | A:1878 [U] | ✔ |
| 1F:52 [LYS] | 1A:37 [C] | F:115 [LYS] | A:1683 [C] | ✔ |
| 1F:52 [LYS] | 1A:38 [A] | F:115 [LYS] | A:1684 [C] | ✔ |
| 1F:52 [LYS] | 1A:477 [C] | F:115 [LYS] | A:1777 [A] | ✔ |
| 1F:52 [LYS] | 1A:478 [G] | F:115 [LYS] | A:1778 [U] | ✔ |
| 1F:86 [GLY] | 1A:475 [A] | F:149 [GLY] | A:1775 [A] | ✔ |
| 1F:86 [GLY] | 1A:476 [G] | F:149 [GLY] | A:1776 [G] | ✔ |
| 1F:72 [ARG] | 1A:1301 [U] | F:135 [ARG] | A:2299 [U] | ✔ |
| 1F:72 [ARG] | 1A:1302 [G] | F:135 [ARG] | A:2300 [G] | ✔ |
| 1F:72 [ARG] | 1A:1303 [C] | F:135 [ARG] | A:2301 [U] | ✔ |
| 1F:72 [ARG] | 1A:1304 [C] | F:135 [ARG] | A:2302 [U] | ✔ |
| 1F:84 [VAL] | 1A:607 [C] | F:147 [ARG] | A:1865 [C] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:59 [TYR] | 1A:478 [G] | F:122 [GLY] | A:1778 [U] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:59 [TYR] | 1A:496 [A] | F:122 [GLY] | A:1794 [A] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:97 [TYR] | 1A:470 [C] | F:161 [TYR] | A:1770 [G] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:60 [SER] | 1A:843 [C] | F:123 [GLY] | A:2006 [C] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:60 [SER] | 1A:844 [C] | F:123 [GLY] | A:2007 [U] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:60 [SER] | 1A:845 [G] | F:123 [GLY] | A:2008 [G] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:69 [HIS] | 1A:2455 [C] | F:132 [GLY] | A:2930 [U] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:83 [PHE] | 1A:607 [C] | F:146 [TRP] | A:1865 [C] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:71 [GLY] | 1A:2081 [A] | F:134 [GLY] | A:2722 [A] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:58 [ALA] | 1A:477 [C] | F:121 [ARG] | A:1777 [A] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:68 [LYS] | 1A:2081 [A] | F:131 [LYS] | A:2722 [A] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:89 [VAL] | 1A:718 [C] | F:152 [ALA] | A:1903 [C] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:50 [SER] | 1A:1294 [G] | F:113 [LYS] | A:2292 [G] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:34 [TRP] | 1A:707 [G] | F:97 [HIS] | A:1898 [A] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:100 [THR] | 1A:705 [C] | F:164 [MET] | A:1896 [U] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:38 [ARG] | 1A:469 [A] | F:101 [MET] | A:1769 [C] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:38 [ARG] | 1A:707 [G] | F:101 [MET] | A:1898 [A] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:38 [ARG] | 1A:1292 [A] | F:101 [MET] | A:2290 [A] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:47 [GLY] | 1A:38 [A] | F:110 [SER] | A:1684 [C] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:49 [ALA] | 1A:38 [A] | F:112 [ALA] | A:1684 [C] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:103 [LYS] | 1A:645 [G] | F:167 [MET] | A:1887 [A] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:102 [PRO] | 1A:622 [G] | F:166 [PRO] | A:1878 [U] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:35 [GLU] | 1A:706 [C] | F:98 [GLN] | A:1897 [A] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:35 [GLU] | 1A:707 [G] | F:98 [GLN] | A:1898 [A] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:51 [THR] | 1A:37 [C] | F:114 [THR] | A:1683 [C] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:46 [ARG] | 1A:38 [A] | F:109 [ILE] | A:1684 [C] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:46 [ARG] | 1A:39 [C] | F:109 [ILE] | A:1685 [C] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:46 [ARG] | 1A:467 [U] | F:109 [ILE] | A:1767 [G] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:46 [ARG] | 1A:468 [G] | F:109 [ILE] | A:1768 [G] | ❌ 7OF0_F_A |
| 1F:38 [ARG] | 1A:1290 [G] | F:101 [MET] | A:2288 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:41 [LEU] | 1A:1291 [G] | F:104 [LYS] | A:2289 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:41 [LEU] | 1A:1290 [G] | F:104 [LYS] | A:2288 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:42 [ALA] | 1A:1291 [G] | F:105 [ASN] | A:2289 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:42 [ALA] | 1A:1292 [A] | F:105 [ASN] | A:2290 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:45 [ARG] | 1A:1293 [A] | F:108 [ARG] | A:2291 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:48 [THR] | 1A:467 [U] | F:111 [TYR] | A:1767 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:49 [ALA] | 1A:1294 [G] | F:112 [ALA] | A:2292 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:52 [LYS] | 1A:476 [G] | F:115 [LYS] | A:1776 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:54 [ARG] | 1A:719 [C] | F:117 [ARG] | A:1904 [C] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:71 [GLY] | 1A:1302 [G] | F:134 [GLY] | A:2300 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:76 [GLY] | 1A:720 [C] | F:139 [GLY] | A:1905 [C] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:78 [ILE] | 1A:496 [A] | F:141 [ILE] | A:1794 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:82 [ILE] | 1A:719 [C] | F:145 [LEU] | A:1904 [C] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:83 [PHE] | 1A:475 [A] | F:146 [TRP] | A:1775 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:84 [VAL] | 1A:496 [A] | F:147 [ARG] | A:1794 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:89 [VAL] | 1A:848 [G] | F:152 [ALA] | A:2011 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:89 [VAL] | 1A:608 [G] | F:152 [ALA] | A:1866 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:90 [PHE] | 1A:609 [A] | F:153 [HIS] | A:1867 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:103 [LYS] | 1A:629 [U] | F:167 [MET] | A:1885 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:104 [LYS] | 1A:630 [U] | F:168 [LYS] | A:1886 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
| 1F:66 [PRO] | 1A:837 [C] | F:129 [PRO] | A:2000 [C] | ❌ 7OF0_F:129, 7OF0_A:2000 no longer at interface |
| 1F:84 [VAL] | 1A:606 [G] | F:147 [ARG] | A:1864 [A] | ❌ 7OF0_A:1864 no longer at interface |
| 1F:69 [HIS] | 1A:2084 [A] | F:132 [GLY] | A:2725 [A] | ❌ 7OF0_A:2725 no longer at interface |
| 1F:68 [LYS] | 1A:2083 [G] | F:131 [LYS] | A:2724 [G] | ❌ 7OF0_A:2724 no longer at interface |
| 1F:68 [LYS] | 1A:2084 [A] | F:131 [LYS] | A:2725 [A] | ❌ 7OF0_A:2725 no longer at interface |
| 1F:38 [ARG] | 1A:708 [C] | F:101 [MET] | A:1899 [G] | ❌ 7OF0_A:1899 no longer at interface |
| 1F:95 [ARG] | 1A:612 [C] | F:159 [THR] | A:1870 [A] | ❌ 7OF0_F:159, 7OF0_A:1870 no longer at interface |
| 1F:90 [PHE] | 1A:717 [A] | F:153 [HIS] | A:1902 [C] | ❌ 7OF0_A:1902 no longer at interface |
| 1F:35 [GLU] | 1A:621 [G] | F:98 [GLN] | A:1877 [U] | ❌ 7OF0_A:1877 no longer at interface |
| 1F:46 [ARG] | 1A:466 [G] | F:109 [ILE] | A:1766 [U] | ❌ 7OF0_A:1766 no longer at interface |
| 1F:31 [HIS] | 1A:621 [G] | F:94 [ASP] | A:1877 [U] | ❌ 7OF0_A:1877 no longer at interface |
| 1F:41 [LEU] | 1A:1246 [C] | F:104 [LYS] | A:2277 [U] | ❌ 4Y4O_1A:1246 no longer at interface |
| 1F:62 [ARG] | 1A:493 [G] | F:125 [ARG] | A:1791 [G] | ❌ 4Y4O_1A:493 no longer at interface |
| 1F:84 [VAL] | 1A:498 [A] | F:147 [ARG] | A:1796 [A] | ❌ 4Y4O_1A:498 no longer at interface |
| 1F:84 [VAL] | 1A:497 [A] | F:147 [ARG] | A:1795 [A] | ❌ 4Y4O_1A:497 no longer at interface |
| 1F:90 [PHE] | 1A:1295 [U] | F:153 [HIS] | A:2293 [A] | ❌ 4Y4O_1A:1295 no longer at interface |
| 1F:188 [ARG] | 1A:1249 [A] | F:255 [LYS] | A:2280 [C] | ❌ 4Y4O_1A:1249 no longer at interface |
| 1F:44 [ARG] | 1A:469 [A] | F:107 [LYS] | A:1769 [C] | ❌ 7OF0_F:107 no longer at interface |
| 1F:44 [ARG] | 1A:1247 [C] | F:107 [LYS] | A:2278 [A] | ❌ 7OF0_F:107 no longer at interface |
| 1F:70 [THR] | 1A:2081 [A] | F:133 [THR] | A:2722 [A] | ❌ 7OF0_F:133 no longer at interface |
| 1F:95 [ARG] | 1A:1292 [A] | F:159 [THR] | A:2290 [A] | ❌ 7OF0_F:159 no longer at interface |
| 1F:95 [ARG] | 1A:1293 [A] | F:159 [THR] | A:2291 [A] | ❌ 7OF0_F:159 no longer at interface |
| 1F:79 [GLY] | 1A:478 [G] | F:142 [ARG] | A:1778 [U] | ❌ 4Y4O_1F:79 no longer at interface |
| 1F:79 [GLY] | 1A:495 [G] | F:142 [ARG] | A:1793 [G] | ❌ 4Y4O_1F:79 no longer at interface |
| 1F:79 [GLY] | 1A:496 [A] | F:142 [ARG] | A:1794 [A] | ❌ 4Y4O_1F:79 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ribosomal protein L4 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.94 | 1.15 | 0.47 | 0.88 | 0.97 | 0.85 | 0.85 | 0.80 | 0.75 | 0.43 | 0.33 |
Other pairs involving 4Y4O_1F_1A or 7OF0_F_A
Total number of entries: 15