Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
4Y4O_1F
|
4Y4O_1A
|
7RYG_E
|
7RYG_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
1F:134 [GLY] | 1A:345 [G] | E:128 [PRO] | A:323 [U] | ✔ |
1F:169 [ASN] | 1A:344 [A] | E:162 [ASN] | A:322 [G] | ✔ |
1F:169 [ASN] | 1A:346 [A] | E:162 [ASN] | A:324 [A] | ✔ |
1F:169 [ASN] | 1A:347 [G] | E:162 [ASN] | A:325 [G] | ✔ |
1F:169 [ASN] | 1A:348 [A] | E:162 [ASN] | A:326 [A] | ✔ |
1F:73 [ALA] | 1A:1301 [U] | E:67 [ALA] | A:1250 [U] | ✔ |
1F:73 [ALA] | 1A:1302 [G] | E:67 [ALA] | A:1251 [G] | ✔ |
1F:73 [ALA] | 1A:1303 [C] | E:67 [ALA] | A:1252 [C] | ✔ |
1F:140 [LEU] | 1A:344 [A] | E:134 [LEU] | A:322 [G] | ✔ |
1F:41 [LEU] | 1A:469 [A] | E:35 [LEU] | A:442 [A] | ✔ |
1F:84 [VAL] | 1A:474 [U] | E:78 [VAL] | A:447 [U] | ✔ |
1F:84 [VAL] | 1A:475 [A] | E:78 [VAL] | A:448 [A] | ✔ |
1F:84 [VAL] | 1A:606 [G] | E:78 [VAL] | A:581 [G] | ✔ |
1F:84 [VAL] | 1A:1303 [C] | E:78 [VAL] | A:1252 [C] | ✔ |
1F:84 [VAL] | 1A:1304 [C] | E:78 [VAL] | A:1253 [U] | ✔ |
1F:42 [ALA] | 1A:469 [A] | E:36 [ALA] | A:442 [A] | ✔ |
1F:59 [TYR] | 1A:495 [G] | E:53 [GLY] | A:468 [G] | ✔ |
1F:74 [ARG] | 1A:720 [C] | E:68 [ARG] | A:671 [C] | ✔ |
1F:74 [ARG] | 1A:721 [G] | E:68 [ARG] | A:672 [G] | ✔ |
1F:74 [ARG] | 1A:854 [U] | E:68 [ARG] | A:805 [U] | ✔ |
1F:74 [ARG] | 1A:1301 [U] | E:68 [ARG] | A:1250 [U] | ✔ |
1F:74 [ARG] | 1A:2082 [A] | E:68 [ARG] | A:2056 [A] | ✔ |
1F:74 [ARG] | 1A:2456 [G] | E:68 [ARG] | A:2440 [G] | ✔ |
1F:74 [ARG] | 1A:2457 [G] | E:68 [ARG] | A:2441 [2MG] | ✔ |
1F:82 [ILE] | 1A:607 [C] | E:76 [ILE] | A:582 [C] | ✔ |
1F:82 [ILE] | 1A:608 [G] | E:76 [ILE] | A:583 [G] | ✔ |
1F:82 [ILE] | 1A:720 [C] | E:76 [ILE] | A:671 [C] | ✔ |
1F:82 [ILE] | 1A:1300 [A] | E:76 [ILE] | A:1249 [A] | ✔ |
1F:82 [ILE] | 1A:1302 [G] | E:76 [ILE] | A:1251 [G] | ✔ |
1F:82 [ILE] | 1A:1303 [C] | E:76 [ILE] | A:1252 [C] | ✔ |
1F:80 [ALA] | 1A:720 [C] | E:74 [SER] | A:671 [C] | ✔ |
1F:80 [ALA] | 1A:721 [G] | E:74 [SER] | A:672 [G] | ✔ |
1F:53 [THR] | 1A:716 [G] | E:47 [SER] | A:667 [G] | ✔ |
1F:53 [THR] | 1A:848 [G] | E:47 [SER] | A:799 [G] | ✔ |
1F:97 [TYR] | 1A:1292 [A] | E:91 [TRP] | A:1241 [A] | ✔ |
1F:97 [TYR] | 1A:1293 [A] | E:91 [TRP] | A:1242 [A] | ✔ |
1F:44 [ARG] | 1A:469 [A] | E:38 [GLY] | A:442 [A] | ✔ |
1F:88 [VAL] | 1A:476 [G] | E:82 [LYS] | A:449 [G] | ✔ |
1F:88 [VAL] | 1A:1294 [G] | E:82 [LYS] | A:1243 [G] | ✔ |
1F:168 [ARG] | 1A:345 [G] | E:161 [ARG] | A:323 [U] | ✔ |
1F:168 [ARG] | 1A:346 [A] | E:161 [ARG] | A:324 [A] | ✔ |
1F:168 [ARG] | 1A:364 [A] | E:161 [ARG] | A:342 [A] | ✔ |
1F:104 [LYS] | 1A:623 [G] | E:98 [LYS] | A:598 [G] | ✔ |
1F:104 [LYS] | 1A:624 [C] | E:98 [LYS] | A:599 [C] | ✔ |
1F:104 [LYS] | 1A:628 [C] | E:98 [LYS] | A:603 [G] | ✔ |
1F:104 [LYS] | 1A:629 [U] | E:98 [LYS] | A:604 [U] | ✔ |
1F:60 [SER] | 1A:495 [G] | E:54 [GLY] | A:468 [G] | ✔ |
1F:85 [GLY] | 1A:474 [U] | E:79 [GLY] | A:447 [U] | ✔ |
1F:85 [GLY] | 1A:475 [A] | E:79 [GLY] | A:448 [A] | ✔ |
1F:136 [THR] | 1A:344 [A] | E:130 [THR] | A:322 [G] | ✔ |
1F:136 [THR] | 1A:345 [G] | E:130 [THR] | A:323 [U] | ✔ |
1F:136 [THR] | 1A:346 [A] | E:130 [THR] | A:324 [A] | ✔ |
1F:69 [HIS] | 1A:2081 [A] | E:63 [GLY] | A:2055 [A] | ✔ |
1F:69 [HIS] | 1A:2082 [A] | E:63 [GLY] | A:2056 [A] | ✔ |
1F:83 [PHE] | 1A:1303 [C] | E:77 [TRP] | A:1252 [C] | ✔ |
1F:170 [LEU] | 1A:344 [A] | E:163 [LEU] | A:322 [G] | ✔ |
1F:71 [GLY] | 1A:1301 [U] | E:65 [GLY] | A:1250 [U] | ✔ |
1F:71 [GLY] | 1A:2081 [A] | E:65 [GLY] | A:2055 [A] | ✔ |
1F:71 [GLY] | 1A:2082 [A] | E:65 [GLY] | A:2056 [A] | ✔ |
1F:75 [HIS] | 1A:721 [G] | E:69 [ALA] | A:672 [G] | ✔ |
1F:75 [HIS] | 1A:722 [A] | E:69 [ALA] | A:673 [A] | ✔ |
1F:48 [THR] | 1A:38 [A] | E:42 [THR] | A:45 [A] | ✔ |
1F:48 [THR] | 1A:39 [C] | E:42 [THR] | A:46 [G] | ✔ |
1F:48 [THR] | 1A:468 [G] | E:42 [THR] | A:441 [G] | ✔ |
1F:48 [THR] | 1A:470 [C] | E:42 [THR] | A:443 [C] | ✔ |
1F:166 [ALA] | 1A:345 [G] | E:159 [ALA] | A:323 [U] | ✔ |
1F:99 [TYR] | 1A:707 [G] | E:93 [GLN] | A:658 [C] | ✔ |
1F:67 [GLN] | 1A:721 [G] | E:61 [GLN] | A:672 [G] | ✔ |
1F:67 [GLN] | 1A:722 [A] | E:61 [GLN] | A:673 [A] | ✔ |
1F:67 [GLN] | 1A:1301 [U] | E:61 [GLN] | A:1250 [U] | ✔ |
1F:67 [GLN] | 1A:2455 [C] | E:61 [GLN] | A:2439 [U] | ✔ |
1F:67 [GLN] | 1A:2456 [G] | E:61 [GLN] | A:2440 [G] | ✔ |
1F:55 [GLY] | 1A:848 [G] | E:49 [ALA] | A:799 [G] | ✔ |
1F:45 [ARG] | 1A:469 [A] | E:39 [ARG] | A:442 [A] | ✔ |
1F:45 [ARG] | 1A:470 [C] | E:39 [ARG] | A:443 [C] | ✔ |
1F:45 [ARG] | 1A:1292 [A] | E:39 [ARG] | A:1241 [A] | ✔ |
1F:54 [ARG] | 1A:720 [C] | E:48 [ARG] | A:671 [C] | ✔ |
1F:54 [ARG] | 1A:721 [G] | E:48 [ARG] | A:672 [G] | ✔ |
1F:54 [ARG] | 1A:848 [G] | E:48 [ARG] | A:799 [G] | ✔ |
1F:58 [ALA] | 1A:478 [G] | E:52 [SER] | A:451 [G] | ✔ |
1F:58 [ALA] | 1A:484 [G] | E:52 [SER] | A:457 [G] | ✔ |
1F:58 [ALA] | 1A:495 [G] | E:52 [SER] | A:468 [G] | ✔ |
1F:68 [LYS] | 1A:2082 [A] | E:62 [LYS] | A:2056 [A] | ✔ |
1F:68 [LYS] | 1A:2083 [G] | E:62 [LYS] | A:2057 [G] | ✔ |
1F:68 [LYS] | 1A:2455 [C] | E:62 [LYS] | A:2439 [U] | ✔ |
1F:68 [LYS] | 1A:2456 [G] | E:62 [LYS] | A:2440 [G] | ✔ |
1F:101 [LEU] | 1A:630 [U] | E:95 [VAL] | A:605 [U] | ✔ |
1F:101 [LEU] | 1A:706 [C] | E:95 [VAL] | A:657 [G] | ✔ |
1F:89 [VAL] | 1A:609 [A] | E:83 [THR] | A:584 [A] | ✔ |
1F:89 [VAL] | 1A:719 [C] | E:83 [THR] | A:670 [C] | ✔ |
1F:70 [THR] | 1A:2081 [A] | E:64 [THR] | A:2055 [A] | ✔ |
1F:70 [THR] | 1A:2082 [A] | E:64 [THR] | A:2056 [A] | ✔ |
1F:29 [ASN] | 1A:622 [G] | E:23 [ASN] | A:597 [A] | ✔ |
1F:29 [ASN] | 1A:623 [G] | E:23 [ASN] | A:598 [G] | ✔ |
1F:81 [PRO] | 1A:608 [G] | E:75 [PRO] | A:583 [G] | ✔ |
1F:81 [PRO] | 1A:719 [C] | E:75 [PRO] | A:670 [C] | ✔ |
1F:81 [PRO] | 1A:720 [C] | E:75 [PRO] | A:671 [C] | ✔ |
1F:56 [GLU] | 1A:478 [G] | E:50 [ASP] | A:451 [G] | ✔ |
1F:77 [ASP] | 1A:721 [G] | E:71 [SER] | A:672 [G] | ✔ |
1F:50 [SER] | 1A:37 [C] | E:44 [ALA] | A:44 [C] | ✔ |
1F:50 [SER] | 1A:38 [A] | E:44 [ALA] | A:45 [A] | ✔ |
1F:50 [SER] | 1A:477 [C] | E:44 [ALA] | A:450 [U] | ✔ |
1F:34 [TRP] | 1A:1290 [G] | E:28 [HIS] | A:1239 [A] | ✔ |
1F:34 [TRP] | 1A:1291 [G] | E:28 [HIS] | A:1240 [G] | ✔ |
1F:40 [GLN] | 1A:640 [A] | E:34 [TYR] | A:613 [U] | ✔ |
1F:61 [GLY] | 1A:845 [G] | E:55 [GLY] | A:796 [G] | ✔ |
1F:32 [LEU] | 1A:622 [G] | E:26 [LEU] | A:597 [A] | ✔ |
1F:32 [LEU] | 1A:623 [G] | E:26 [LEU] | A:598 [G] | ✔ |
1F:100 [THR] | 1A:630 [U] | E:94 [LYS] | A:605 [U] | ✔ |
1F:100 [THR] | 1A:705 [C] | E:94 [LYS] | A:656 [U] | ✔ |
1F:100 [THR] | 1A:706 [C] | E:94 [LYS] | A:657 [G] | ✔ |
1F:105 [VAL] | 1A:622 [G] | E:99 [MET] | A:597 [A] | ✔ |
1F:105 [VAL] | 1A:623 [G] | E:99 [MET] | A:598 [G] | ✔ |
1F:38 [ARG] | 1A:1291 [G] | E:32 [THR] | A:1240 [G] | ✔ |
1F:165 [ARG] | 1A:345 [G] | E:158 [LEU] | A:323 [U] | ✔ |
1F:165 [ARG] | 1A:346 [A] | E:158 [LEU] | A:324 [A] | ✔ |
1F:57 [VAL] | 1A:478 [G] | E:51 [VAL] | A:451 [G] | ✔ |
1F:62 [ARG] | 1A:494 [G] | E:56 [LYS] | A:467 [G] | ✔ |
1F:62 [ARG] | 1A:843 [C] | E:56 [LYS] | A:794 [C] | ✔ |
1F:62 [ARG] | 1A:844 [C] | E:56 [LYS] | A:795 [U] | ✔ |
1F:62 [ARG] | 1A:845 [G] | E:56 [LYS] | A:796 [G] | ✔ |
1F:95 [ARG] | 1A:612 [C] | E:89 [GLN] | A:587 [U] | ✔ |
1F:95 [ARG] | 1A:613 [A] | E:89 [GLN] | A:588 [A] | ✔ |
1F:135 [LYS] | 1A:344 [A] | E:129 [LYS] | A:322 [G] | ✔ |
1F:135 [LYS] | 1A:345 [G] | E:129 [LYS] | A:323 [U] | ✔ |
1F:106 [ARG] | 1A:642 [G] | E:100 [TYR] | A:615 [G] | ✔ |
1F:171 [PRO] | 1A:344 [A] | E:164 [PRO] | A:322 [G] | ✔ |
1F:171 [PRO] | 1A:347 [G] | E:164 [PRO] | A:325 [G] | ✔ |
1F:171 [PRO] | 1A:1250 [U] | E:164 [PRO] | A:1200 [A] | ✔ |
1F:205 [ARG] | 1A:642 [G] | E:198 [GLU] | A:615 [G] | ✔ |
1F:47 [GLY] | 1A:469 [A] | E:41 [GLY] | A:442 [A] | ✔ |
1F:47 [GLY] | 1A:470 [C] | E:41 [GLY] | A:443 [C] | ✔ |
1F:49 [ALA] | 1A:38 [A] | E:43 [ARG] | A:45 [A] | ✔ |
1F:49 [ALA] | 1A:468 [G] | E:43 [ARG] | A:441 [G] | ✔ |
1F:49 [ALA] | 1A:470 [C] | E:43 [ARG] | A:443 [C] | ✔ |
1F:63 [LYS] | 1A:721 [G] | E:57 [LYS] | A:672 [G] | ✔ |
1F:63 [LYS] | 1A:722 [A] | E:57 [LYS] | A:673 [A] | ✔ |
1F:63 [LYS] | 1A:723 [A] | E:57 [LYS] | A:674 [A] | ✔ |
1F:94 [PRO] | 1A:38 [A] | E:88 [PRO] | A:45 [A] | ✔ |
1F:94 [PRO] | 1A:39 [C] | E:88 [PRO] | A:46 [G] | ✔ |
1F:137 [LYS] | 1A:344 [A] | E:131 [LYS] | A:322 [G] | ✔ |
1F:90 [PHE] | 1A:610 [C] | E:84 [PHE] | A:585 [C] | ✔ |
1F:90 [PHE] | 1A:611 [U] | E:84 [PHE] | A:586 [U] | ✔ |
1F:90 [PHE] | 1A:716 [G] | E:84 [PHE] | A:667 [G] | ✔ |
1F:90 [PHE] | 1A:718 [C] | E:84 [PHE] | A:669 [C] | ✔ |
1F:90 [PHE] | 1A:719 [C] | E:84 [PHE] | A:670 [C] | ✔ |
1F:103 [LYS] | 1A:630 [U] | E:97 [ARG] | A:605 [U] | ✔ |
1F:103 [LYS] | 1A:643 [C] | E:97 [ARG] | A:616 [G] | ✔ |
1F:103 [LYS] | 1A:644 [G] | E:97 [ARG] | A:617 [G] | ✔ |
1F:103 [LYS] | 1A:645 [G] | E:97 [ARG] | A:618 [G] | ✔ |
1F:102 [PRO] | 1A:629 [U] | E:96 [ASN] | A:604 [U] | ✔ |
1F:102 [PRO] | 1A:630 [U] | E:96 [ASN] | A:605 [U] | ✔ |
1F:102 [PRO] | 1A:705 [C] | E:96 [ASN] | A:656 [U] | ✔ |
1F:102 [PRO] | 1A:706 [C] | E:96 [ASN] | A:657 [G] | ✔ |
1F:35 [GLU] | 1A:622 [G] | E:29 [GLN] | A:597 [A] | ✔ |
1F:35 [GLU] | 1A:706 [C] | E:29 [GLN] | A:657 [G] | ✔ |
1F:35 [GLU] | 1A:707 [G] | E:29 [GLN] | A:658 [C] | ✔ |
1F:78 [ILE] | 1A:495 [G] | E:72 [ILE] | A:468 [G] | ✔ |
1F:51 [THR] | 1A:476 [G] | E:45 [HIS] | A:449 [G] | ✔ |
1F:51 [THR] | 1A:477 [C] | E:45 [HIS] | A:450 [U] | ✔ |
1F:51 [THR] | 1A:1294 [G] | E:45 [HIS] | A:1243 [G] | ✔ |
1F:179 [GLU] | 1A:641 [G] | E:172 [THR] | A:614 [A] | ✔ |
1F:76 [GLY] | 1A:721 [G] | E:70 [GLY] | A:672 [G] | ✔ |
1F:76 [GLY] | 1A:722 [A] | E:70 [GLY] | A:673 [A] | ✔ |
1F:46 [ARG] | 1A:38 [A] | E:40 [GLN] | A:45 [A] | ✔ |
1F:46 [ARG] | 1A:39 [C] | E:40 [GLN] | A:46 [G] | ✔ |
1F:46 [ARG] | 1A:467 [U] | E:40 [GLN] | A:440 [U] | ✔ |
1F:46 [ARG] | 1A:468 [G] | E:40 [GLN] | A:441 [G] | ✔ |
1F:46 [ARG] | 1A:469 [A] | E:40 [GLN] | A:442 [A] | ✔ |
1F:31 [HIS] | 1A:622 [G] | E:25 [ALA] | A:597 [A] | ✔ |
1F:107 [LYS] | 1A:642 [G] | E:101 [ARG] | A:615 [G] | ✔ |
1F:52 [LYS] | 1A:37 [C] | E:46 [LYS] | A:44 [C] | ✔ |
1F:52 [LYS] | 1A:38 [A] | E:46 [LYS] | A:45 [A] | ✔ |
1F:52 [LYS] | 1A:477 [C] | E:46 [LYS] | A:450 [U] | ✔ |
1F:52 [LYS] | 1A:478 [G] | E:46 [LYS] | A:451 [G] | ✔ |
1F:86 [GLY] | 1A:475 [A] | E:80 [GLY] | A:448 [A] | ✔ |
1F:86 [GLY] | 1A:476 [G] | E:80 [GLY] | A:449 [G] | ✔ |
1F:72 [ARG] | 1A:1301 [U] | E:66 [ARG] | A:1250 [U] | ✔ |
1F:72 [ARG] | 1A:1302 [G] | E:66 [ARG] | A:1251 [G] | ✔ |
1F:72 [ARG] | 1A:1303 [C] | E:66 [ARG] | A:1252 [C] | ✔ |
1F:72 [ARG] | 1A:1304 [C] | E:66 [ARG] | A:1253 [U] | ✔ |
1F:39 [TRP] | 1A:641 [G] | E:33 [ALA] | A:614 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:39 [TRP] | 1A:642 [G] | E:33 [ALA] | A:615 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:84 [VAL] | 1A:607 [C] | E:78 [VAL] | A:582 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:59 [TYR] | 1A:478 [G] | E:53 [GLY] | A:451 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:59 [TYR] | 1A:496 [A] | E:53 [GLY] | A:469 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:59 [TYR] | 1A:845 [G] | E:53 [GLY] | A:796 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:97 [TYR] | 1A:470 [C] | E:91 [TRP] | A:443 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:43 [LYS] | 1A:641 [G] | E:37 [GLY] | A:614 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:168 [ARG] | 1A:1250 [U] | E:161 [ARG] | A:1200 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:60 [SER] | 1A:494 [G] | E:54 [GLY] | A:467 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:60 [SER] | 1A:843 [C] | E:54 [GLY] | A:794 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:60 [SER] | 1A:844 [C] | E:54 [GLY] | A:795 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:60 [SER] | 1A:845 [G] | E:54 [GLY] | A:796 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:85 [GLY] | 1A:478 [G] | E:79 [GLY] | A:451 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:69 [HIS] | 1A:2455 [C] | E:63 [GLY] | A:2439 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:83 [PHE] | 1A:607 [C] | E:77 [TRP] | A:582 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:83 [PHE] | 1A:1304 [C] | E:77 [TRP] | A:1253 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:170 [LEU] | 1A:347 [G] | E:163 [LEU] | A:325 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:170 [LEU] | 1A:1250 [U] | E:163 [LEU] | A:1200 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:75 [HIS] | 1A:720 [C] | E:69 [ALA] | A:671 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:75 [HIS] | 1A:1302 [G] | E:69 [ALA] | A:1251 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:75 [HIS] | 1A:1303 [C] | E:69 [ALA] | A:1252 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:48 [THR] | 1A:37 [C] | E:42 [THR] | A:44 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:99 [TYR] | 1A:706 [C] | E:93 [GLN] | A:657 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:67 [GLN] | 1A:723 [A] | E:61 [GLN] | A:674 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:67 [GLN] | 1A:2082 [A] | E:61 [GLN] | A:2056 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:58 [ALA] | 1A:477 [C] | E:52 [SER] | A:450 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:68 [LYS] | 1A:2081 [A] | E:62 [LYS] | A:2055 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:89 [VAL] | 1A:718 [C] | E:83 [THR] | A:669 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:81 [PRO] | 1A:607 [C] | E:75 [PRO] | A:582 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:50 [SER] | 1A:470 [C] | E:44 [ALA] | A:443 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:50 [SER] | 1A:476 [G] | E:44 [ALA] | A:449 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:50 [SER] | 1A:1294 [G] | E:44 [ALA] | A:1243 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:34 [TRP] | 1A:707 [G] | E:28 [HIS] | A:658 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:40 [GLN] | 1A:641 [G] | E:34 [TYR] | A:614 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:61 [GLY] | 1A:844 [C] | E:55 [GLY] | A:795 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:38 [ARG] | 1A:469 [A] | E:32 [THR] | A:442 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:38 [ARG] | 1A:707 [G] | E:32 [THR] | A:658 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:38 [ARG] | 1A:708 [C] | E:32 [THR] | A:659 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:38 [ARG] | 1A:1292 [A] | E:32 [THR] | A:1241 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:95 [ARG] | 1A:1292 [A] | E:89 [GLN] | A:1241 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:95 [ARG] | 1A:1293 [A] | E:89 [GLN] | A:1242 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:135 [LYS] | 1A:343 [C] | E:129 [LYS] | A:321 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:106 [ARG] | 1A:630 [U] | E:100 [TYR] | A:605 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:205 [ARG] | 1A:641 [G] | E:198 [GLU] | A:614 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:47 [GLY] | 1A:38 [A] | E:41 [GLY] | A:45 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:137 [LYS] | 1A:345 [G] | E:131 [LYS] | A:323 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:90 [PHE] | 1A:1294 [G] | E:84 [PHE] | A:1243 [G] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:102 [PRO] | 1A:622 [G] | E:96 [ASN] | A:597 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:51 [THR] | 1A:37 [C] | E:45 [HIS] | A:44 [C] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:179 [GLU] | 1A:640 [A] | E:172 [THR] | A:613 [U] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:72 [ARG] | 1A:2082 [A] | E:66 [ARG] | A:2056 [A] | ❌ 7RYG_E_A |
1F:106 [ARG] | 1A:641 [G] | E:100 [TYR] | A:614 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:106 [ARG] | 1A:640 [A] | E:100 [TYR] | A:613 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:107 [LYS] | 1A:643 [C] | E:101 [ARG] | A:616 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:137 [LYS] | 1A:343 [C] | E:131 [LYS] | A:321 [C] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:168 [ARG] | 1A:348 [A] | E:161 [ARG] | A:326 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:38 [ARG] | 1A:1290 [G] | E:32 [THR] | A:1239 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:39 [TRP] | 1A:640 [A] | E:33 [ALA] | A:613 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:43 [LYS] | 1A:640 [A] | E:37 [GLY] | A:613 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:44 [ARG] | 1A:640 [A] | E:38 [GLY] | A:613 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:49 [ALA] | 1A:1294 [G] | E:43 [ARG] | A:1243 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:49 [ALA] | 1A:37 [C] | E:43 [ARG] | A:44 [C] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:49 [ALA] | 1A:1293 [A] | E:43 [ARG] | A:1242 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:51 [THR] | 1A:470 [C] | E:45 [HIS] | A:443 [C] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:59 [TYR] | 1A:494 [G] | E:53 [GLY] | A:467 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:71 [GLY] | 1A:1302 [G] | E:65 [GLY] | A:1251 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:82 [ILE] | 1A:719 [C] | E:76 [ILE] | A:670 [C] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:89 [VAL] | 1A:848 [G] | E:83 [THR] | A:799 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:89 [VAL] | 1A:608 [G] | E:83 [THR] | A:583 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:90 [PHE] | 1A:609 [A] | E:84 [PHE] | A:584 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:99 [TYR] | 1A:708 [C] | E:93 [GLN] | A:659 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:100 [THR] | 1A:629 [U] | E:94 [LYS] | A:604 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:100 [THR] | 1A:707 [G] | E:94 [LYS] | A:658 [C] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:103 [LYS] | 1A:642 [G] | E:97 [ARG] | A:615 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:105 [VAL] | 1A:706 [C] | E:99 [MET] | A:657 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:66 [PRO] | 1A:837 [C] | E:60 [ARG] | A:788 [U] | ❌ 7RYG_E:60, 7RYG_A:788 no longer at interface |
1F:41 [LEU] | 1A:1247 [C] | E:35 [LEU] | A:1197 [G] | ❌ 7RYG_A:1197 no longer at interface |
1F:44 [ARG] | 1A:1247 [C] | E:38 [GLY] | A:1197 [G] | ❌ 7RYG_A:1197 no longer at interface |
1F:69 [HIS] | 1A:2084 [A] | E:63 [GLY] | A:2058 [A] | ❌ 7RYG_A:2058 no longer at interface |
1F:188 [ARG] | 1A:1248 [G] | E:181 [ALA] | A:1198 [U] | ❌ 7RYG_E:181, 7RYG_A:1198 no longer at interface |
1F:184 [TYR] | 1A:1247 [C] | E:177 [VAL] | A:1197 [G] | ❌ 7RYG_E:177, 7RYG_A:1197 no longer at interface |
1F:184 [TYR] | 1A:1248 [G] | E:177 [VAL] | A:1198 [U] | ❌ 7RYG_E:177, 7RYG_A:1198 no longer at interface |
1F:68 [LYS] | 1A:2084 [A] | E:62 [LYS] | A:2058 [A] | ❌ 7RYG_A:2058 no longer at interface |
1F:100 [THR] | 1A:631 [A] | E:94 [LYS] | A:606 [A] | ❌ 7RYG_A:606 no longer at interface |
1F:90 [PHE] | 1A:717 [A] | E:84 [PHE] | A:668 [A] | ❌ 7RYG_A:668 no longer at interface |
1F:35 [GLU] | 1A:621 [G] | E:29 [GLN] | A:596 [U] | ❌ 7RYG_A:596 no longer at interface |
1F:46 [ARG] | 1A:466 [G] | E:40 [GLN] | A:439 [C] | ❌ 7RYG_A:439 no longer at interface |
1F:31 [HIS] | 1A:621 [G] | E:25 [ALA] | A:596 [U] | ❌ 7RYG_A:596 no longer at interface |
1F:176 [LEU] | 1A:640 [A] | E:169 [VAL] | A:613 [U] | ❌ 7RYG_E:169 no longer at interface |
1F:185 [ASP] | 1A:640 [A] | E:178 [SER] | A:613 [U] | ❌ 7RYG_E:178 no longer at interface |
1F:91 [GLY] | 1A:1294 [G] | E:85 [ALA] | A:1243 [G] | ❌ 7RYG_E:85 no longer at interface |
1F:182 [ASN] | 1A:640 [A] | E:175 [ASP] | A:613 [U] | ❌ 7RYG_E:175 no longer at interface |
1F:182 [ASN] | 1A:641 [G] | E:175 [ASP] | A:614 [A] | ❌ 7RYG_E:175 no longer at interface |
1F:177 [ALA] | 1A:640 [A] | E:170 [ASP] | A:613 [U] | ❌ 7RYG_E:170 no longer at interface |
1F:181 [LEU] | 1A:641 [G] | E:174 [ILE] | A:614 [A] | ❌ 7RYG_E:174 no longer at interface |
1F:65 [TRP] | 1A:1303 [C] | E:59 [PHE] | A:1252 [C] | ❌ 7RYG_E:59 no longer at interface |
1F:92 [PRO] | 1A:1294 [G] | E:86 [ALA] | A:1243 [G] | ❌ 7RYG_E:86 no longer at interface |
1F:180 [GLY] | 1A:640 [A] | E:173 [ALA] | A:613 [U] | ❌ 7RYG_E:173 no longer at interface |
1F:180 [GLY] | 1A:641 [G] | E:173 [ALA] | A:614 [A] | ❌ 7RYG_E:173 no longer at interface |
1F:108 [LYS] | 1A:623 [G] | E:102 [GLY] | A:598 [G] | ❌ 7RYG_E:102 no longer at interface |
1F:108 [LYS] | 1A:624 [C] | E:102 [GLY] | A:599 [C] | ❌ 7RYG_E:102 no longer at interface |
1F:172 [TRP] | 1A:1250 [U] | E:165 [HIS] | A:1200 [A] | ❌ 4Y4O_1F:172 no longer at interface |
1F:26 [ALA] | 1A:624 [C] | E:20 [ARG] | A:599 [C] | ❌ 4Y4O_1F:26 no longer at interface |
1F:26 [ALA] | 1A:623 [G] | E:20 [ARG] | A:598 [G] | ❌ 4Y4O_1F:26 no longer at interface |
1F:79 [GLY] | 1A:496 [A] | E:73 [ARG] | A:469 [A] | ❌ 4Y4O_1F:79 no longer at interface |
1F:79 [GLY] | 1A:495 [G] | E:73 [ARG] | A:468 [G] | ❌ 4Y4O_1F:79 no longer at interface |
1F:79 [GLY] | 1A:478 [G] | E:73 [ARG] | A:451 [G] | ❌ 4Y4O_1F:79 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L4 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.96 | 1.8 | 0.47 | 0.88 | 0.96 | 0.96 | 1.0 | 0.74 | 0.65 | 0.47 | 0.30 |
Other pairs involving 4Y4O_1F_1A or 7RYG_E_A
Total number of entries: 16