RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group126 > 7K00_e_a vs 7OF0_F_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

7K00_e
7K00_a
7OF0_F
7OF0_A
Conserved?
e:69 [ARG] a:673 [C] F:137 [ARG] A:1905 [C]
e:69 [ARG] a:674 [G] F:137 [ARG] A:1906 [G]
e:69 [ARG] a:807 [U] F:137 [ARG] A:2017 [U]
e:69 [ARG] a:1255 [U] F:137 [ARG] A:2299 [U]
e:69 [ARG] a:2444 [G] F:137 [ARG] A:2931 [A]
e:69 [ARG] a:2445 [2MG] F:137 [ARG] A:2932 [G]
e:94 [GLN] a:660 [C] F:163 [TYR] A:1898 [A]
e:73 [ILE] a:469 [G] F:141 [ILE] A:1793 [G]
e:37 [ALA] a:443 [A] F:105 [ASN] A:1769 [C]
e:45 [ALA] a:37 [C] F:113 [LYS] A:1683 [C]
e:45 [ALA] a:38 [A] F:113 [LYS] A:1684 [C]
e:45 [ALA] a:450 [G] F:113 [LYS] A:1776 [G]
e:45 [ALA] a:451 [U] F:113 [LYS] A:1777 [A]
e:47 [LYS] a:37 [C] F:115 [LYS] A:1683 [C]
e:47 [LYS] a:451 [U] F:115 [LYS] A:1777 [A]
e:47 [LYS] a:452 [G] F:115 [LYS] A:1778 [U]
e:51 [GLU] a:452 [G] F:119 [GLU] A:1778 [U]
e:58 [LYS] a:674 [G] F:126 [LYS] A:1906 [G]
e:58 [LYS] a:675 [A] F:126 [LYS] A:1907 [A]
e:58 [LYS] a:676 [A] F:126 [LYS] A:1908 [A]
e:78 [TRP] a:1257 [C] F:146 [TRP] A:2301 [U]
e:53 [THR] a:452 [G] F:121 [ARG] A:1778 [U]
e:53 [THR] a:458 [G] F:121 [ARG] A:1782 [G]
e:53 [THR] a:469 [G] F:121 [ARG] A:1793 [G]
e:44 [ARG] a:442 [G] F:112 [ALA] A:1768 [G]
e:44 [ARG] a:444 [C] F:112 [ALA] A:1770 [G]
e:44 [ARG] a:1248 [G] F:112 [ALA] A:2292 [G]
e:75 [SER] a:673 [C] F:143 [SER] A:1905 [C]
e:75 [SER] a:674 [G] F:143 [SER] A:1906 [G]
e:54 [GLY] a:469 [G] F:122 [GLY] A:1793 [G]
e:54 [GLY] a:798 [G] F:122 [GLY] A:2008 [G]
e:83 [VAL] a:450 [G] F:151 [VAL] A:1776 [G]
e:83 [VAL] a:1248 [G] F:151 [VAL] A:2292 [G]
e:43 [THR] a:38 [A] F:111 [TYR] A:1684 [C]
e:43 [THR] a:39 [G] F:111 [TYR] A:1685 [C]
e:43 [THR] a:441 [U] F:111 [TYR] A:1767 [G]
e:43 [THR] a:442 [G] F:111 [TYR] A:1768 [G]
e:43 [THR] a:444 [C] F:111 [TYR] A:1770 [G]
e:96 [VAL] a:607 [U] F:165 [LEU] A:1886 [G]
e:96 [VAL] a:659 [G] F:165 [LEU] A:1897 [A]
e:24 [ASN] a:599 [A] F:92 [ARG] A:1878 [U]
e:24 [ASN] a:600 [G] F:92 [ARG] A:1879 [G]
e:71 [GLY] a:673 [C] F:139 [GLY] A:1905 [C]
e:71 [GLY] a:674 [G] F:139 [GLY] A:1906 [G]
e:71 [GLY] a:675 [A] F:139 [GLY] A:1907 [A]
e:27 [LEU] a:599 [A] F:95 [ILE] A:1878 [U]
e:27 [LEU] a:600 [G] F:95 [ILE] A:1879 [G]
e:48 [THR] a:801 [G] F:116 [THR] A:2011 [G]
e:80 [SER] a:448 [U] F:148 [GLY] A:1774 [U]
e:80 [SER] a:449 [A] F:148 [GLY] A:1775 [A]
e:100 [MET] a:599 [A] F:169 [VAL] A:1878 [U]
e:100 [MET] a:600 [G] F:169 [VAL] A:1879 [G]
e:56 [GLY] a:798 [G] F:124 [GLY] A:2008 [G]
e:52 [VAL] a:452 [G] F:120 [VAL] A:1778 [U]
e:79 [ARG] a:448 [U] F:147 [ARG] A:1774 [U]
e:79 [ARG] a:449 [A] F:147 [ARG] A:1775 [A]
e:79 [ARG] a:470 [A] F:147 [ARG] A:1794 [A]
e:79 [ARG] a:471 [A] F:147 [ARG] A:1795 [A]
e:79 [ARG] a:472 [A] F:147 [ARG] A:1796 [A]
e:79 [ARG] a:1257 [C] F:147 [ARG] A:2301 [U]
e:79 [ARG] a:1258 [U] F:147 [ARG] A:2302 [U]
e:95 [LYS] a:607 [U] F:164 [MET] A:1886 [G]
e:95 [LYS] a:659 [G] F:164 [MET] A:1897 [A]
e:29 [HIS] a:1244 [A] F:97 [HIS] A:2288 [A]
e:29 [HIS] a:1245 [G] F:97 [HIS] A:2289 [G]
e:76 [PRO] a:585 [G] F:144 [PRO] A:1866 [U]
e:76 [PRO] a:672 [C] F:144 [PRO] A:1904 [C]
e:76 [PRO] a:673 [C] F:144 [PRO] A:1905 [C]
e:97 [ASN] a:606 [U] F:166 [PRO] A:1885 [A]
e:97 [ASN] a:607 [U] F:166 [PRO] A:1886 [G]
e:97 [ASN] a:658 [U] F:166 [PRO] A:1896 [U]
e:97 [ASN] a:659 [G] F:166 [PRO] A:1897 [A]
e:42 [GLY] a:443 [A] F:110 [SER] A:1769 [C]
e:42 [GLY] a:444 [C] F:110 [SER] A:1770 [G]
e:55 [SER] a:468 [G] F:123 [GLY] A:1792 [G]
e:55 [SER] a:469 [G] F:123 [GLY] A:1793 [G]
e:98 [LYS] a:607 [U] F:167 [MET] A:1886 [G]
e:68 [ALA] a:1255 [U] F:136 [ALA] A:2299 [U]
e:68 [ALA] a:1256 [G] F:136 [ALA] A:2300 [G]
e:68 [ALA] a:1257 [C] F:136 [ALA] A:2301 [U]
e:84 [THR] a:585 [G] F:152 [ALA] A:1866 [U]
e:84 [THR] a:586 [A] F:152 [ALA] A:1867 [A]
e:84 [THR] a:672 [C] F:152 [ALA] A:1904 [C]
e:84 [THR] a:801 [G] F:152 [ALA] A:2011 [G]
e:36 [ALA] a:443 [A] F:104 [LYS] A:1769 [C]
e:26 [ALA] a:599 [A] F:94 [ASP] A:1878 [U]
e:81 [GLY] a:449 [A] F:149 [GLY] A:1775 [A]
e:81 [GLY] a:450 [G] F:149 [GLY] A:1776 [G]
e:67 [ARG] a:1255 [U] F:135 [ARG] A:2299 [U]
e:67 [ARG] a:1256 [G] F:135 [ARG] A:2300 [G]
e:67 [ARG] a:1257 [C] F:135 [ARG] A:2301 [U]
e:67 [ARG] a:1258 [U] F:135 [ARG] A:2302 [U]
e:40 [ARG] a:443 [A] F:108 [ARG] A:1769 [C]
e:40 [ARG] a:444 [C] F:108 [ARG] A:1770 [G]
e:40 [ARG] a:1246 [A] F:108 [ARG] A:2290 [A]
e:57 [LYS] a:796 [C] F:125 [ARG] A:2006 [C]
e:57 [LYS] a:797 [G] F:125 [ARG] A:2007 [U]
e:57 [LYS] a:798 [G] F:125 [ARG] A:2008 [G]
e:63 [LYS] a:2443 [C] F:131 [LYS] A:2930 [U]
e:63 [LYS] a:2444 [G] F:131 [LYS] A:2931 [A]
e:85 [PHE] a:586 [A] F:153 [HIS] A:1867 [A]
e:85 [PHE] a:587 [C] F:153 [HIS] A:1868 [G]
e:85 [PHE] a:588 [U] F:153 [HIS] A:1869 [A]
e:85 [PHE] a:671 [C] F:153 [HIS] A:1903 [C]
e:85 [PHE] a:672 [C] F:153 [HIS] A:1904 [C]
e:33 [VAL] a:1244 [A] F:101 [MET] A:2288 [A]
e:33 [VAL] a:1245 [G] F:101 [MET] A:2289 [G]
e:72 [SER] a:674 [G] F:140 [SER] A:1906 [G]
e:41 [GLN] a:443 [A] F:109 [ILE] A:1769 [C]
e:66 [GLY] a:1255 [U] F:134 [GLY] A:2299 [U]
e:66 [GLY] a:1256 [G] F:134 [GLY] A:2300 [G]
e:30 [GLN] a:599 [A] F:98 [GLN] A:1878 [U]
e:70 [SER] a:674 [G] F:138 [HIS] A:1906 [G]
e:70 [SER] a:675 [A] F:138 [HIS] A:1907 [A]
e:64 [GLY] a:2059 [A] F:132 [GLY] A:2722 [A]
e:62 [GLN] a:674 [G] F:130 [GLN] A:1906 [G]
e:62 [GLN] a:675 [A] F:130 [GLN] A:1907 [A]
e:62 [GLN] a:676 [A] F:130 [GLN] A:1908 [A]
e:62 [GLN] a:1255 [U] F:130 [GLN] A:2299 [U]
e:62 [GLN] a:2443 [C] F:130 [GLN] A:2930 [U]
e:62 [GLN] a:2444 [G] F:130 [GLN] A:2931 [A]
e:99 [LYS] a:600 [G] F:168 [LYS] A:1879 [G]
e:99 [LYS] a:601 [C] F:168 [LYS] A:1880 [C]
e:99 [LYS] a:605 [G] F:168 [LYS] A:1884 [G]
e:99 [LYS] a:606 [U] F:168 [LYS] A:1885 [A]
e:77 [ILE] a:584 [C] F:145 [LEU] A:1865 [C]
e:77 [ILE] a:585 [G] F:145 [LEU] A:1866 [U]
e:77 [ILE] a:672 [C] F:145 [LEU] A:1904 [C]
e:77 [ILE] a:673 [C] F:145 [LEU] A:1905 [C]
e:77 [ILE] a:1254 [A] F:145 [LEU] A:2298 [A]
e:77 [ILE] a:1256 [G] F:145 [LEU] A:2300 [G]
e:77 [ILE] a:1257 [C] F:145 [LEU] A:2301 [U]
e:49 [ARG] a:672 [C] F:117 [ARG] A:1904 [C]
e:49 [ARG] a:673 [C] F:117 [ARG] A:1905 [C]
e:49 [ARG] a:674 [G] F:117 [ARG] A:1906 [G]
e:49 [ARG] a:801 [G] F:117 [ARG] A:2011 [G]
e:50 [ALA] a:801 [G] F:118 [ALA] A:2011 [G]
e:46 [GLN] a:450 [G] F:114 [THR] A:1776 [G]
e:46 [GLN] a:451 [U] F:114 [THR] A:1777 [A]
e:46 [GLN] a:1248 [G] F:114 [THR] A:2292 [G]
e:89 [PRO] a:38 [A] F:158 [PRO] A:1684 [C]
e:89 [PRO] a:39 [G] F:158 [PRO] A:1685 [C]
e:60 [TRP] a:1257 [C] F:128 [TRP] A:2301 [U]
e:78 [TRP] a:1256 [G] F:146 [TRP] A:2300 [G] ❌ 7OF0_F_A
e:53 [THR] a:451 [U] F:121 [ARG] A:1777 [A] ❌ 7OF0_F_A
e:44 [ARG] a:37 [C] F:112 [ALA] A:1683 [C] ❌ 7OF0_F_A
e:44 [ARG] a:38 [A] F:112 [ALA] A:1684 [C] ❌ 7OF0_F_A
e:44 [ARG] a:1247 [A] F:112 [ALA] A:2291 [A] ❌ 7OF0_F_A
e:83 [VAL] a:449 [A] F:151 [VAL] A:1775 [A] ❌ 7OF0_F_A
e:74 [LYS] a:801 [G] F:142 [ARG] A:2011 [G] ❌ 7OF0_F_A
e:80 [SER] a:471 [A] F:148 [GLY] A:1795 [A] ❌ 7OF0_F_A
e:100 [MET] a:658 [U] F:169 [VAL] A:1896 [U] ❌ 7OF0_F_A
e:100 [MET] a:659 [G] F:169 [VAL] A:1897 [A] ❌ 7OF0_F_A
e:95 [LYS] a:606 [U] F:164 [MET] A:1885 [A] ❌ 7OF0_F_A
e:95 [LYS] a:658 [U] F:164 [MET] A:1896 [U] ❌ 7OF0_F_A
e:95 [LYS] a:660 [C] F:164 [MET] A:1898 [A] ❌ 7OF0_F_A
e:97 [ASN] a:600 [G] F:166 [PRO] A:1879 [G] ❌ 7OF0_F_A
e:42 [GLY] a:442 [G] F:110 [SER] A:1768 [G] ❌ 7OF0_F_A
e:55 [SER] a:797 [G] F:123 [GLY] A:2007 [U] ❌ 7OF0_F_A
e:55 [SER] a:798 [G] F:123 [GLY] A:2008 [G] ❌ 7OF0_F_A
e:98 [LYS] a:620 [G] F:167 [MET] A:1887 [A] ❌ 7OF0_F_A
e:63 [LYS] a:2059 [A] F:131 [LYS] A:2722 [A] ❌ 7OF0_F_A
e:41 [GLN] a:38 [A] F:109 [ILE] A:1684 [C] ❌ 7OF0_F_A
e:41 [GLN] a:39 [G] F:109 [ILE] A:1685 [C] ❌ 7OF0_F_A
e:41 [GLN] a:441 [U] F:109 [ILE] A:1767 [G] ❌ 7OF0_F_A
e:41 [GLN] a:442 [G] F:109 [ILE] A:1768 [G] ❌ 7OF0_F_A
e:92 [HIS] a:444 [C] F:161 [TYR] A:1770 [G] ❌ 7OF0_F_A
e:66 [GLY] a:2059 [A] F:134 [GLY] A:2722 [A] ❌ 7OF0_F_A
e:30 [GLN] a:659 [G] F:98 [GLN] A:1897 [A] ❌ 7OF0_F_A
e:30 [GLN] a:660 [C] F:98 [GLN] A:1898 [A] ❌ 7OF0_F_A
e:46 [GLN] a:37 [C] F:114 [THR] A:1683 [C] ❌ 7OF0_F_A
e:46 [GLN] a:444 [C] F:114 [THR] A:1770 [G] ❌ 7OF0_F_A
e:36 [ALA] a:1245 [G] F:104 [LYS] A:2289 [G] ❌ 7K00_e_a
e:36 [ALA] a:1244 [A] F:104 [LYS] A:2288 [A] ❌ 7K00_e_a
e:37 [ALA] a:1245 [G] F:105 [ASN] A:2289 [G] ❌ 7K00_e_a
e:37 [ALA] a:1246 [A] F:105 [ASN] A:2290 [A] ❌ 7K00_e_a
e:40 [ARG] a:1247 [A] F:108 [ARG] A:2291 [A] ❌ 7K00_e_a
e:43 [THR] a:37 [C] F:111 [TYR] A:1683 [C] ❌ 7K00_e_a
e:45 [ALA] a:444 [C] F:113 [LYS] A:1770 [G] ❌ 7K00_e_a
e:47 [LYS] a:38 [A] F:115 [LYS] A:1684 [C] ❌ 7K00_e_a
e:47 [LYS] a:450 [G] F:115 [LYS] A:1776 [G] ❌ 7K00_e_a
e:56 [GLY] a:797 [G] F:124 [GLY] A:2007 [U] ❌ 7K00_e_a
e:57 [LYS] a:468 [G] F:125 [ARG] A:1792 [G] ❌ 7K00_e_a
e:70 [SER] a:1257 [C] F:138 [HIS] A:2301 [U] ❌ 7K00_e_a
e:70 [SER] a:673 [C] F:138 [HIS] A:1905 [C] ❌ 7K00_e_a
e:70 [SER] a:1256 [G] F:138 [HIS] A:2300 [G] ❌ 7K00_e_a
e:73 [ILE] a:470 [A] F:141 [ILE] A:1794 [A] ❌ 7K00_e_a
e:74 [LYS] a:452 [G] F:142 [ARG] A:1778 [U] ❌ 7K00_e_a
e:74 [LYS] a:469 [G] F:142 [ARG] A:1793 [G] ❌ 7K00_e_a
e:74 [LYS] a:470 [A] F:142 [ARG] A:1794 [A] ❌ 7K00_e_a
e:76 [PRO] a:584 [C] F:144 [PRO] A:1865 [C] ❌ 7K00_e_a
e:78 [TRP] a:449 [A] F:146 [TRP] A:1775 [A] ❌ 7K00_e_a
e:78 [TRP] a:1258 [U] F:146 [TRP] A:2302 [U] ❌ 7K00_e_a
e:80 [SER] a:452 [G] F:148 [GLY] A:1778 [U] ❌ 7K00_e_a
e:85 [PHE] a:1248 [G] F:153 [HIS] A:2292 [G] ❌ 7K00_e_a
e:92 [HIS] a:1247 [A] F:161 [TYR] A:2291 [A] ❌ 7K00_e_a
e:92 [HIS] a:1246 [A] F:161 [TYR] A:2290 [A] ❌ 7K00_e_a
e:94 [GLN] a:659 [G] F:163 [TYR] A:1897 [A] ❌ 7K00_e_a
e:98 [LYS] a:606 [U] F:167 [MET] A:1885 [A] ❌ 7K00_e_a
e:99 [LYS] a:607 [U] F:168 [LYS] A:1886 [G] ❌ 7K00_e_a
e:101 [TYR] a:607 [U] F:170 [ARG] A:1886 [G] ❌ 7K00_e_a
e:94 [GLN] a:661 [A] F:163 [TYR] A:1899 [G] ❌ 7OF0_A:1899 no longer at interface
e:90 [GLN] a:590 [A] F:159 [THR] A:1870 [A] ❌ 7OF0_F:159, 7OF0_A:1870 no longer at interface
e:57 [LYS] a:795 [C] F:125 [ARG] A:2005 [C] ❌ 7OF0_A:2005 no longer at interface
e:63 [LYS] a:2061 [G] F:131 [LYS] A:2724 [G] ❌ 7OF0_A:2724 no longer at interface
e:63 [LYS] a:2062 [A] F:131 [LYS] A:2725 [A] ❌ 7OF0_A:2725 no longer at interface
e:36 [ALA] a:1202 [G] F:104 [LYS] A:2278 [A] ❌ 7K00_a:1202 no longer at interface
e:36 [ALA] a:1201 [U] F:104 [LYS] A:2277 [U] ❌ 7K00_a:1201 no longer at interface
e:57 [LYS] a:467 [G] F:125 [ARG] A:1791 [G] ❌ 7K00_a:467 no longer at interface
e:85 [PHE] a:1249 [U] F:153 [HIS] A:2293 [A] ❌ 7K00_a:1249 no longer at interface
e:178 [VAL] a:1203 [U] F:251 [HIS] A:2279 [U] ❌ 7K00_e:178, 7K00_a:1203 no longer at interface
e:178 [VAL] a:1202 [G] F:251 [HIS] A:2278 [A] ❌ 7K00_e:178, 7K00_a:1202 no longer at interface
e:182 [ALA] a:1203 [U] F:255 [LYS] A:2279 [U] ❌ 7K00_e:182, 7K00_a:1203 no longer at interface
e:182 [ALA] a:1204 [A] F:255 [LYS] A:2280 [C] ❌ 7K00_e:182, 7K00_a:1204 no longer at interface
e:65 [THR] a:2059 [A] F:133 [THR] A:2722 [A] ❌ 7OF0_F:133 no longer at interface
e:39 [ALA] a:443 [A] F:107 [LYS] A:1769 [C] ❌ 7OF0_F:107 no longer at interface
e:21 [ARG] a:601 [C] F:89 [THR] A:1880 [C] ❌ 7OF0_F:89 no longer at interface
e:86 [ALA] a:1248 [G] F:154 [GLY] A:2292 [G] ❌ 7K00_e:86 no longer at interface
e:87 [ALA] a:1248 [G] F:155 [PRO] A:2292 [G] ❌ 7K00_e:87 no longer at interface
e:88 [ARG] a:38 [A] F:157 [GLY] A:1684 [C] ❌ 7K00_e:88 no longer at interface
e:103 [GLY] a:600 [G] F:172 [LEU] A:1879 [G] ❌ 7K00_e:103 no longer at interface
e:103 [GLY] a:601 [C] F:172 [LEU] A:1880 [C] ❌ 7K00_e:103 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
Common RFAM label(s)
Interface TM-score
Interface RMSD
Percentage identity
Protein TM-score
RNA TM-score
Protein coverage
RNA coverage
Percentage conservation
Apolar conservation
H-bond conservation
Percentage switching out
Ribosomal protein L4 Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.91 1.05 0.41 0.91 0.93 0.8 0.85 0.76 0.74 0.40 0.27


Other pairs involving 7K00_e_a or 7OF0_F_A

Total number of entries: 15