RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group127 > 1VQ8_L_0 vs 6S0Z_J_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

1VQ8_L
1VQ8_0
6S0Z_J
6S0Z_A
Conserved?
L:55 [GLN] 0:215 [A] J:69 [ILE] A:247 [A] ✔
L:18 [HIS] 0:624 [U] J:36 [LYS] A:610 [U] ✔
L:18 [HIS] 0:901 [G] J:36 [LYS] A:853 [G] ✔
L:51 [PHE] 0:692 [A] J:66 [PHE] A:676 [A] ✔
L:51 [PHE] 0:693 [A] J:66 [PHE] A:677 [A] ✔
L:51 [PHE] 0:2440 [C] J:66 [PHE] A:2430 [C] ✔
L:51 [PHE] 0:2441 [U] J:66 [PHE] A:2431 [C] ✔
L:51 [PHE] 0:2452 [G] J:66 [PHE] A:2441 [G] ✔
L:51 [PHE] 0:2453 [G] J:66 [PHE] A:2442 [G] ✔
L:22 [ARG] 0:762 [C] J:41 [ARG] A:716 [C] ✔
L:22 [ARG] 0:898 [G] J:41 [ARG] A:850 [G] ✔
L:22 [ARG] 0:899 [C] J:41 [ARG] A:851 [C] ✔
L:22 [ARG] 0:900 [U] J:41 [ARG] A:852 [U] ✔
L:22 [ARG] 0:901 [G] J:41 [ARG] A:853 [G] ✔
L:110 [GLY] 0:688 [A] J:112 [LEU] A:672 [A] ✔
L:110 [GLY] 0:698 [A] J:112 [LEU] A:682 [A] ✔
L:19 [LYS] 0:899 [C] J:37 [GLY] A:851 [C] ✔
L:11 [ARG] 0:623 [U] J:29 [LYS] A:609 [U] ✔
L:11 [ARG] 0:624 [U] J:29 [LYS] A:610 [U] ✔
L:11 [ARG] 0:903 [U] J:29 [LYS] A:855 [U] ✔
L:11 [ARG] 0:904 [U] J:29 [LYS] A:856 [U] ✔
L:4 [LYS] 0:645 [U] J:17 [ASN] A:631 [U] ✔
L:4 [LYS] 0:754 [G] J:17 [ASN] A:708 [G] ✔
L:48 [LYS] 0:220 [C] J:63 [LYS] A:252 [C] ✔
L:48 [LYS] 0:2430 [A] J:63 [LYS] A:2420 [U] ✔
L:48 [LYS] 0:2431 [C] J:63 [LYS] A:2421 [C] ✔
L:48 [LYS] 0:2432 [C] J:63 [LYS] A:2422 [C] ✔
L:48 [LYS] 0:2454 [C] J:63 [LYS] A:2443 [C] ✔
L:50 [GLY] 0:692 [A] J:65 [GLY] A:676 [A] ✔
L:50 [GLY] 0:2453 [G] J:65 [GLY] A:2442 [G] ✔
L:50 [GLY] 0:2454 [C] J:65 [GLY] A:2443 [C] ✔
L:15 [GLY] 0:1041 [U] J:33 [ARG] A:986 [G] ✔
L:15 [GLY] 0:1042 [U] J:33 [ARG] A:987 [U] ✔
L:15 [GLY] 0:1295 [G] J:33 [ARG] A:1229 [G] ✔
L:5 [LYS] 0:905 [C] J:18 [ARG] A:857 [C] ✔
L:5 [LYS] 0:1301 [C] J:18 [ARG] A:1235 [C] ✔
L:5 [LYS] 0:1302 [G] J:18 [ARG] A:1236 [G] ✔
L:5 [LYS] 0:1353 [C] J:18 [ARG] A:1287 [U] ✔
L:5 [LYS] 0:1354 [G] J:18 [ARG] A:1288 [G] ✔
L:1 [THR] 0:1299 [G] J:14 [LYS] A:1233 [A] ✔
L:34 [GLY] 0:166 [A] J:50 [PHE] A:199 [A] ✔
L:9 [GLY] 0:904 [U] J:22 [GLY] A:856 [U] ✔
L:9 [GLY] 0:905 [C] J:22 [GLY] A:857 [C] ✔
L:3 [LYS] 0:753 [U] J:16 [ARG] A:707 [G] ✔
L:3 [LYS] 0:754 [G] J:16 [ARG] A:708 [G] ✔
L:37 [LYS] 0:919 [U] J:53 [GLY] A:871 [U] ✔
L:53 [ARG] 0:693 [A] J:68 [ASN] A:677 [A] ✔
L:53 [ARG] 0:694 [A] J:68 [ASN] A:678 [A] ✔
L:53 [ARG] 0:2441 [U] J:68 [ASN] A:2431 [C] ✔
L:53 [ARG] 0:2442 [G] J:68 [ASN] A:2432 [G] ✔
L:125 [PHE] 0:697 [G] J:128 [PHE] A:681 [G] ✔
L:41 [HIS] 0:2396 [C] J:57 [LEU] A:2386 [C] ✔
L:49 [SER] 0:2453 [G] J:64 [ARG] A:2442 [G] ✔
L:49 [SER] 0:2454 [C] J:64 [ARG] A:2443 [C] ✔
L:46 [LEU] 0:2430 [A] J:61 [LEU] A:2420 [U] ✔
L:126 [SER] 0:697 [G] J:129 [SER] A:681 [G] ✔
L:126 [SER] 0:698 [A] J:129 [SER] A:682 [A] ✔
L:59 [GLU] 0:695 [C] J:71 [ARG] A:679 [G] ✔
L:14 [GLY] 0:1040 [A] J:32 [GLY] A:985 [A] ✔
L:14 [GLY] 0:1041 [U] J:32 [GLY] A:986 [G] ✔
L:14 [GLY] 0:1295 [G] J:32 [GLY] A:1229 [G] ✔
L:14 [GLY] 0:1296 [A] J:32 [GLY] A:1230 [G] ✔
L:127 [GLU] 0:697 [G] J:130 [ALA] A:681 [G] ✔
L:36 [ASP] 0:166 [A] J:52 [GLY] A:199 [A] ✔
L:2 [SER] 0:753 [U] J:15 [GLU] A:707 [G] ✔
L:8 [ARG] 0:644 [G] J:21 [ARG] A:630 [G] ✔
L:8 [ARG] 0:903 [U] J:21 [ARG] A:855 [U] ✔
L:8 [ARG] 0:904 [U] J:21 [ARG] A:856 [U] ✔
L:8 [ARG] 0:905 [C] J:21 [ARG] A:857 [C] ✔
L:8 [ARG] 0:906 [C] J:21 [ARG] A:858 [U] ✔
L:8 [ARG] 0:1354 [G] J:21 [ARG] A:1288 [G] ✔
L:47 [GLY] 0:2430 [A] J:62 [PRO] A:2420 [U] ✔
L:47 [GLY] 0:2431 [C] J:62 [PRO] A:2421 [C] ✔
L:10 [SER] 0:904 [U] J:28 [GLY] A:856 [U] ✔
L:17 [SER] 0:624 [U] J:35 [HIS] A:610 [U] ✔
L:17 [SER] 0:625 [U] J:35 [HIS] A:611 [U] ✔
L:17 [SER] 0:1041 [U] J:35 [HIS] A:986 [G] ✔
L:17 [SER] 0:1042 [U] J:35 [HIS] A:987 [U] ✔
L:17 [SER] 0:1294 [A] J:35 [HIS] A:1228 [A] ✔
L:16 [GLY] 0:1041 [U] J:34 [GLY] A:986 [G] ✔
L:16 [GLY] 0:1042 [U] J:34 [GLY] A:987 [U] ✔
L:16 [GLY] 0:1294 [A] J:34 [GLY] A:1228 [A] ✔
L:16 [GLY] 0:1295 [G] J:34 [GLY] A:1229 [G] ✔
L:20 [ASN] 0:925 [C] J:39 [LYS] A:877 [G] ✔
L:20 [ASN] 0:1041 [U] J:39 [LYS] A:986 [G] ✔
L:128 [GLY] 0:698 [A] J:131 [SER] A:682 [A] ✔
L:109 [LEU] 0:698 [A] J:111 [ILE] A:682 [A] ✔
L:28 [GLY] 0:166 [A] J:46 [VAL] A:199 [A] ✔
L:28 [GLY] 0:925 [C] J:46 [VAL] A:877 [G] ✔
L:12 [THR] 0:644 [G] J:30 [THR] A:630 [G] ✔
L:12 [THR] 0:903 [U] J:30 [THR] A:855 [U] ✔
L:12 [THR] 0:1294 [A] J:30 [THR] A:1228 [A] ✔
L:12 [THR] 0:1295 [G] J:30 [THR] A:1229 [G] ✔
L:31 [GLY] 0:222 [A] J:47 [ARG] A:254 [A] ✔
L:31 [GLY] 0:223 [G] J:47 [ARG] A:255 [G] ✔
L:21 [ARG] 0:762 [C] J:40 [ALA] A:716 [C] ✔
L:13 [HIS] 0:644 [G] J:31 [SER] A:630 [G] ✔
L:13 [HIS] 0:903 [U] J:31 [SER] A:855 [U] ✔
L:13 [HIS] 0:1295 [G] J:31 [SER] A:1229 [G] ✔
L:7 [GLN] 0:904 [U] J:20 [GLY] A:856 [U] ✔
L:52 [LYS] 0:215 [A] J:67 [THR] A:247 [A] ✔
L:52 [LYS] 0:216 [A] J:67 [THR] A:248 [G] ✔
L:38 [HIS] 0:918 [G] J:54 [GLN] A:870 [C] ✔
L:38 [HIS] 0:919 [U] J:54 [GLN] A:871 [U] ✔
L:111 [ALA] 0:688 [A] J:113 [GLY] A:672 [A] ✔
L:111 [ALA] 0:698 [A] J:113 [GLY] A:682 [A] ✔
L:18 [HIS] 0:623 [U] J:36 [LYS] A:609 [U] ❌ 6S0Z_J_A
L:18 [HIS] 0:902 [G] J:36 [LYS] A:854 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:18 [HIS] 0:903 [U] J:36 [LYS] A:855 [U] ❌ 6S0Z_J_A
L:19 [LYS] 0:624 [U] J:37 [GLY] A:610 [U] ❌ 6S0Z_J_A
L:19 [LYS] 0:625 [U] J:37 [GLY] A:611 [U] ❌ 6S0Z_J_A
L:19 [LYS] 0:900 [U] J:37 [GLY] A:852 [U] ❌ 6S0Z_J_A
L:19 [LYS] 0:901 [G] J:37 [GLY] A:853 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:19 [LYS] 0:2483 [A] J:37 [GLY] A:2475 [A] ❌ 6S0Z_J_A
L:11 [ARG] 0:902 [G] J:29 [LYS] A:854 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:4 [LYS] 0:644 [G] J:17 [ASN] A:630 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:48 [LYS] 0:2453 [G] J:63 [LYS] A:2442 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:50 [GLY] 0:2452 [G] J:65 [GLY] A:2441 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:23 [GLY] 0:898 [G] J:42 [SER] A:850 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:5 [LYS] 0:1300 [G] J:18 [ARG] A:1234 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:1 [THR] 0:905 [C] J:14 [LYS] A:857 [C] ❌ 6S0Z_J_A
L:1 [THR] 0:1300 [G] J:14 [LYS] A:1234 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:34 [GLY] 0:165 [A] J:50 [PHE] A:198 [A] ❌ 6S0Z_J_A
L:9 [GLY] 0:903 [U] J:22 [GLY] A:855 [U] ❌ 6S0Z_J_A
L:3 [LYS] 0:1296 [A] J:16 [ARG] A:1230 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:3 [LYS] 0:1297 [U] J:16 [ARG] A:1231 [A] ❌ 6S0Z_J_A
L:37 [LYS] 0:918 [G] J:53 [GLY] A:870 [C] ❌ 6S0Z_J_A
L:37 [LYS] 0:2466 [G] J:53 [GLY] A:2456 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:53 [ARG] 0:695 [C] J:68 [ASN] A:679 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:32 [ASP] 0:222 [A] J:48 [PRO] A:254 [A] ❌ 6S0Z_J_A
L:32 [ASP] 0:223 [G] J:48 [PRO] A:255 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:41 [HIS] 0:918 [G] J:57 [LEU] A:870 [C] ❌ 6S0Z_J_A
L:41 [HIS] 0:926 [A] J:57 [LEU] A:878 [C] ❌ 6S0Z_J_A
L:41 [HIS] 0:2395 [A] J:57 [LEU] A:2385 [A] ❌ 6S0Z_J_A
L:35 [ARG] 0:166 [A] J:51 [GLU] A:199 [A] ❌ 6S0Z_J_A
L:35 [ARG] 0:221 [G] J:51 [GLU] A:253 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:35 [ARG] 0:222 [A] J:51 [GLU] A:254 [A] ❌ 6S0Z_J_A
L:46 [LEU] 0:221 [G] J:61 [LEU] A:253 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:46 [LEU] 0:2429 [A] J:61 [LEU] A:2419 [A] ❌ 6S0Z_J_A
L:6 [ARG] 0:905 [C] J:19 [VAL] A:857 [C] ❌ 6S0Z_J_A
L:6 [ARG] 0:906 [C] J:19 [VAL] A:858 [U] ❌ 6S0Z_J_A
L:6 [ARG] 0:907 [A] J:19 [VAL] A:859 [C] ❌ 6S0Z_J_A
L:6 [ARG] 0:1298 [U] J:19 [VAL] A:1232 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:6 [ARG] 0:1299 [G] J:19 [VAL] A:1233 [A] ❌ 6S0Z_J_A
L:6 [ARG] 0:1300 [G] J:19 [VAL] A:1234 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:43 [HIS] 0:222 [A] J:58 [PHE] A:254 [A] ❌ 6S0Z_J_A
L:36 [ASP] 0:2466 [G] J:52 [GLY] A:2456 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:2 [SER] 0:754 [G] J:15 [GLU] A:708 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:26 [HIS] 0:898 [G] J:44 [GLY] A:850 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:26 [HIS] 0:924 [G] J:44 [GLY] A:876 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:26 [HIS] 0:925 [C] J:44 [GLY] A:877 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:26 [HIS] 0:926 [A] J:44 [GLY] A:878 [C] ❌ 6S0Z_J_A
L:26 [HIS] 0:1041 [U] J:44 [GLY] A:986 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:58 [GLN] 0:694 [A] J:70 [ASN] A:678 [A] ❌ 6S0Z_J_A
L:39 [GLU] 0:918 [G] J:55 [LEU] A:870 [C] ❌ 6S0Z_J_A
L:39 [GLU] 0:925 [C] J:55 [LEU] A:877 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:39 [GLU] 0:926 [A] J:55 [LEU] A:878 [C] ❌ 6S0Z_J_A
L:47 [GLY] 0:220 [C] J:62 [PRO] A:252 [C] ❌ 6S0Z_J_A
L:47 [GLY] 0:221 [G] J:62 [PRO] A:253 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:24 [ALA] 0:166 [A] J:43 [GLY] A:199 [A] ❌ 6S0Z_J_A
L:24 [ALA] 0:898 [G] J:43 [GLY] A:850 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:20 [ASN] 0:1042 [U] J:39 [LYS] A:987 [U] ❌ 6S0Z_J_A
L:128 [GLY] 0:697 [G] J:131 [SER] A:681 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:109 [LEU] 0:688 [A] J:111 [ILE] A:672 [A] ❌ 6S0Z_J_A
L:109 [LEU] 0:697 [G] J:111 [ILE] A:681 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:31 [GLY] 0:757 [C] J:47 [ARG] A:711 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:99 [GLU] 0:686 [A] J:104 [ASN] A:670 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:99 [GLU] 0:687 [C] J:104 [ASN] A:671 [U] ❌ 6S0Z_J_A
L:21 [ARG] 0:644 [G] J:40 [ALA] A:630 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:21 [ARG] 0:763 [C] J:40 [ALA] A:717 [C] ❌ 6S0Z_J_A
L:21 [ARG] 0:1041 [U] J:40 [ALA] A:986 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:13 [HIS] 0:904 [U] J:31 [SER] A:856 [U] ❌ 6S0Z_J_A
L:38 [HIS] 0:166 [A] J:54 [GLN] A:199 [A] ❌ 6S0Z_J_A
L:38 [HIS] 0:921 [G] J:54 [GLN] A:873 [U] ❌ 6S0Z_J_A
L:38 [HIS] 0:924 [G] J:54 [GLN] A:876 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:38 [HIS] 0:925 [C] J:54 [GLN] A:877 [G] ❌ 6S0Z_J_A
L:38 [HIS] 0:926 [A] J:54 [GLN] A:878 [C] ❌ 6S0Z_J_A
L:110 [GLY] 0:697 [G] J:112 [LEU] A:681 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:112 [GLY] 0:688 [A] J:114 [ASN] A:672 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:112 [GLY] 0:698 [A] J:114 [ASN] A:682 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:1 [THR] 0:753 [U] J:14 [LYS] A:707 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:1 [THR] 0:1298 [U] J:14 [LYS] A:1232 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:2 [SER] 0:1299 [G] J:15 [GLU] A:1233 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:2 [SER] 0:1300 [G] J:15 [GLU] A:1234 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:3 [LYS] 0:645 [U] J:16 [ARG] A:631 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:3 [LYS] 0:1353 [C] J:16 [ARG] A:1287 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:4 [LYS] 0:753 [U] J:17 [ASN] A:707 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:6 [ARG] 0:644 [G] J:19 [VAL] A:630 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:7 [GLN] 0:903 [U] J:20 [GLY] A:855 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:7 [GLN] 0:644 [G] J:20 [GLY] A:630 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:8 [ARG] 0:1353 [C] J:21 [ARG] A:1287 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:9 [GLY] 0:906 [C] J:22 [GLY] A:858 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:10 [SER] 0:903 [U] J:28 [GLY] A:855 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:15 [GLY] 0:644 [G] J:33 [ARG] A:630 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:15 [GLY] 0:762 [C] J:33 [ARG] A:716 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:18 [HIS] 0:625 [U] J:36 [LYS] A:611 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:18 [HIS] 0:925 [C] J:36 [LYS] A:877 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:18 [HIS] 0:900 [U] J:36 [LYS] A:852 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:18 [HIS] 0:2483 [A] J:36 [LYS] A:2475 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:18 [HIS] 0:1042 [U] J:36 [LYS] A:987 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:19 [LYS] 0:898 [G] J:37 [GLY] A:850 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:19 [LYS] 0:925 [C] J:37 [GLY] A:877 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:19 [LYS] 0:924 [G] J:37 [GLY] A:876 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:20 [ASN] 0:926 [A] J:39 [LYS] A:878 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:21 [ARG] 0:902 [G] J:40 [ALA] A:854 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:23 [GLY] 0:762 [C] J:42 [SER] A:716 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:23 [GLY] 0:763 [C] J:42 [SER] A:717 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:23 [GLY] 0:761 [A] J:42 [SER] A:715 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:24 [ALA] 0:762 [C] J:43 [GLY] A:716 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:24 [ALA] 0:761 [A] J:43 [GLY] A:715 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:26 [HIS] 0:762 [C] J:44 [GLY] A:716 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:28 [GLY] 0:926 [A] J:46 [VAL] A:878 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:28 [GLY] 0:757 [C] J:46 [VAL] A:711 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:31 [GLY] 0:165 [A] J:47 [ARG] A:198 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:31 [GLY] 0:166 [A] J:47 [ARG] A:199 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:32 [ASP] 0:757 [C] J:48 [PRO] A:711 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:34 [GLY] 0:926 [A] J:50 [PHE] A:878 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:34 [GLY] 0:925 [C] J:50 [PHE] A:877 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:35 [ARG] 0:918 [G] J:51 [GLU] A:870 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:35 [ARG] 0:926 [A] J:51 [GLU] A:878 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:35 [ARG] 0:925 [C] J:51 [GLU] A:877 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:36 [ASP] 0:926 [A] J:52 [GLY] A:878 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:36 [ASP] 0:925 [C] J:52 [GLY] A:877 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:36 [ASP] 0:921 [G] J:52 [GLY] A:873 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:36 [ASP] 0:919 [U] J:52 [GLY] A:871 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:36 [ASP] 0:924 [G] J:52 [GLY] A:876 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:37 [LYS] 0:2465 [A] J:53 [GLY] A:2455 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:38 [HIS] 0:2396 [C] J:54 [GLN] A:2386 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:38 [HIS] 0:2465 [A] J:54 [GLN] A:2455 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:38 [HIS] 0:2395 [A] J:54 [GLN] A:2385 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:39 [GLU] 0:2466 [G] J:55 [LEU] A:2456 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:39 [GLU] 0:2465 [A] J:55 [LEU] A:2455 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:39 [GLU] 0:2429 [A] J:55 [LEU] A:2419 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:43 [HIS] 0:221 [G] J:58 [PHE] A:253 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:46 [LEU] 0:2431 [C] J:61 [LEU] A:2421 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:49 [SER] 0:692 [A] J:64 [ARG] A:676 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:58 [GLN] 0:2441 [U] J:70 [ASN] A:2431 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:58 [GLN] 0:2443 [C] J:70 [ASN] A:2433 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:58 [GLN] 0:2442 [G] J:70 [ASN] A:2432 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:59 [GLU] 0:696 [C] J:71 [ARG] A:680 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:59 [GLU] 0:694 [A] J:71 [ARG] A:678 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:59 [GLU] 0:693 [A] J:71 [ARG] A:677 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:55 [GLN] 0:214 [U] J:69 [ILE] A:246 [U] ❌ 6S0Z_A:246 no longer at interface
L:55 [GLN] 0:226 [A] J:69 [ILE] A:258 [A] ❌ 6S0Z_A:258 no longer at interface
L:71 [GLU] 0:745 [G] J:83 [ASN] A:699 [U] ❌ 6S0Z_J:83, 6S0Z_A:699 no longer at interface
L:11 [ARG] 0:622 [G] J:29 [LYS] A:608 [C] ❌ 6S0Z_A:608 no longer at interface
L:4 [LYS] 0:755 [G] J:17 [ASN] A:709 [U] ❌ 6S0Z_A:709 no longer at interface
L:23 [GLY] 0:897 [A] J:42 [SER] A:849 [A] ❌ 6S0Z_A:849 no longer at interface
L:3 [LYS] 0:755 [G] J:16 [ARG] A:709 [U] ❌ 6S0Z_A:709 no longer at interface
L:3 [LYS] 0:1039 [G] J:16 [ARG] A:984 [G] ❌ 6S0Z_A:984 no longer at interface
L:37 [LYS] 0:920 [C] J:53 [GLY] A:872 [U] ❌ 6S0Z_A:872 no longer at interface
L:37 [LYS] 0:2467 [A] J:53 [GLY] A:2457 [A] ❌ 6S0Z_A:2457 no longer at interface
L:41 [HIS] 0:917 [U] J:57 [LEU] A:869 [G] ❌ 6S0Z_A:869 no longer at interface
L:41 [HIS] 0:927 [U] J:57 [LEU] A:879 [U] ❌ 6S0Z_A:879 no longer at interface
L:8 [ARG] 0:643 [A] J:21 [ARG] A:629 [A] ❌ 6S0Z_A:629 no longer at interface
L:27 [ARG] 0:758 [A] J:45 [GLY] A:712 [U] ❌ 6S0Z_J:45, 6S0Z_A:712 no longer at interface
L:27 [ARG] 0:759 [C] J:45 [GLY] A:713 [A] ❌ 6S0Z_J:45, 6S0Z_A:713 no longer at interface
L:67 [ARG] 0:745 [G] J:79 [LEU] A:699 [U] ❌ 6S0Z_J:79, 6S0Z_A:699 no longer at interface
L:24 [ALA] 0:897 [A] J:43 [GLY] A:849 [A] ❌ 6S0Z_A:849 no longer at interface
L:31 [GLY] 0:758 [A] J:47 [ARG] A:712 [U] ❌ 6S0Z_A:712 no longer at interface
L:52 [LYS] 0:214 [U] J:67 [THR] A:246 [U] ❌ 6S0Z_A:246 no longer at interface
L:98 [GLU] 0:662 [U] J:103 [LYS] A:648 [G] ❌ 1VQ8_L:98, 1VQ8_0:662 no longer at interface
L:98 [GLU] 0:663 [C] J:103 [LYS] A:649 [U] ❌ 1VQ8_L:98, 1VQ8_0:663 no longer at interface
L:98 [GLU] 0:684 [G] J:103 [LYS] A:668 [C] ❌ 1VQ8_L:98, 1VQ8_0:684 no longer at interface
L:98 [GLU] 0:685 [C] J:103 [LYS] A:669 [C] ❌ 1VQ8_L:98, 1VQ8_0:685 no longer at interface
L:98 [GLU] 0:661 [G] J:103 [LYS] A:647 [G] ❌ 1VQ8_L:98, 1VQ8_0:661 no longer at interface
L:99 [GLU] 0:684 [G] J:104 [ASN] A:668 [C] ❌ 1VQ8_0:684 no longer at interface
L:1 [THR] 0:752 [G] J:14 [LYS] A:706 [U] ❌ 1VQ8_0:752 no longer at interface
L:3 [LYS] 0:646 [G] J:16 [ARG] A:632 [U] ❌ 1VQ8_0:646 no longer at interface
L:41 [HIS] 0:2397 [G] J:57 [LEU] A:2387 [A] ❌ 1VQ8_0:2397 no longer at interface
L:45 [PRO] 0:2397 [G] J:60 [ARG] A:2387 [A] ❌ 1VQ8_L:45, 1VQ8_0:2397 no longer at interface
L:46 [LEU] 0:2397 [G] J:61 [LEU] A:2387 [A] ❌ 1VQ8_0:2397 no longer at interface
L:49 [SER] 0:2455 [A] J:64 [ARG] A:2444 [C] ❌ 1VQ8_0:2455 no longer at interface
L:59 [GLU] 0:691 [G] J:71 [ARG] A:675 [G] ❌ 1VQ8_0:691 no longer at interface
L:59 [GLU] 0:690 [G] J:71 [ARG] A:674 [C] ❌ 1VQ8_0:690 no longer at interface
L:59 [GLU] 0:689 [G] J:71 [ARG] A:673 [G] ❌ 1VQ8_0:689 no longer at interface
L:72 [ASN] 0:661 [G] J:84 [LYS] A:647 [G] ❌ 1VQ8_L:72, 1VQ8_0:661 no longer at interface
L:61 [ALA] 0:697 [G] J:73 [GLU] A:681 [G] ❌ 6S0Z_J:73 no longer at interface
L:40 [PHE] 0:918 [G] J:56 [PRO] A:870 [C] ❌ 6S0Z_J:56 no longer at interface
L:40 [PHE] 0:926 [A] J:56 [PRO] A:878 [C] ❌ 6S0Z_J:56 no longer at interface
L:40 [PHE] 0:2396 [C] J:56 [PRO] A:2386 [C] ❌ 6S0Z_J:56 no longer at interface
L:40 [PHE] 0:2465 [A] J:56 [PRO] A:2455 [G] ❌ 6S0Z_J:56 no longer at interface
L:129 [ALA] 0:698 [A] J:132 [ALA] A:682 [A] ❌ 6S0Z_J:132 no longer at interface
L:65 [ASP] 0:688 [A] J:77 [VAL] A:672 [A] ❌ 6S0Z_J:77 no longer at interface
L:65 [ASP] 0:698 [A] J:77 [VAL] A:682 [A] ❌ 6S0Z_J:77 no longer at interface
L:63 [THR] 0:697 [G] J:75 [ALA] A:681 [G] ❌ 6S0Z_J:75 no longer at interface
L:27 [ARG] 0:757 [C] J:45 [GLY] A:711 [G] ❌ 6S0Z_J:45 no longer at interface
L:27 [ARG] 0:925 [C] J:45 [GLY] A:877 [G] ❌ 6S0Z_J:45 no longer at interface
L:67 [ARG] 0:688 [A] J:79 [LEU] A:672 [A] ❌ 6S0Z_J:79 no longer at interface
L:33 [ALA] 0:165 [A] J:49 [GLY] A:198 [A] ❌ 6S0Z_J:49 no longer at interface
L:33 [ALA] 0:166 [A] J:49 [GLY] A:199 [A] ❌ 6S0Z_J:49 no longer at interface
L:33 [ALA] 0:222 [A] J:49 [GLY] A:254 [A] ❌ 6S0Z_J:49 no longer at interface
L:132 [LYS] 0:698 [A] J:135 [ALA] A:682 [A] ❌ 6S0Z_J:135 no longer at interface
L:107 [LYS] 0:696 [C] J:109 [ILE] A:680 [C] ❌ 6S0Z_J:109 no longer at interface
L:107 [LYS] 0:697 [G] J:109 [ILE] A:681 [G] ❌ 6S0Z_J:109 no longer at interface
L:98 [GLU] 0:686 [A] J:103 [LYS] A:670 [G] ❌ 1VQ8_L:98 no longer at interface
L:108 [VAL] 0:696 [C] J:110 [LYS] A:680 [C] ❌ 1VQ8_L:108 no longer at interface
L:108 [VAL] 0:697 [G] J:110 [LYS] A:681 [G] ❌ 1VQ8_L:108 no longer at interface
L:124 [ASP] 0:696 [C] J:127 [LYS] A:680 [C] ❌ 1VQ8_L:124 no longer at interface
L:44 [GLU] 0:2431 [C] J:59 [ARG] A:2421 [C] ❌ 1VQ8_L:44 no longer at interface
L:44 [GLU] 0:221 [G] J:59 [ARG] A:253 [G] ❌ 1VQ8_L:44 no longer at interface
L:44 [GLU] 0:2429 [A] J:59 [ARG] A:2419 [A] ❌ 1VQ8_L:44 no longer at interface
L:44 [GLU] 0:220 [C] J:59 [ARG] A:252 [C] ❌ 1VQ8_L:44 no longer at interface
L:44 [GLU] 0:2430 [A] J:59 [ARG] A:2420 [U] ❌ 1VQ8_L:44 no longer at interface
L:45 [PRO] 0:2396 [C] J:60 [ARG] A:2386 [C] ❌ 1VQ8_L:45 no longer at interface
L:45 [PRO] 0:2466 [G] J:60 [ARG] A:2456 [G] ❌ 1VQ8_L:45 no longer at interface
L:45 [PRO] 0:2465 [A] J:60 [ARG] A:2455 [G] ❌ 1VQ8_L:45 no longer at interface
L:45 [PRO] 0:2429 [A] J:60 [ARG] A:2419 [A] ❌ 1VQ8_L:45 no longer at interface
L:45 [PRO] 0:2430 [A] J:60 [ARG] A:2420 [U] ❌ 1VQ8_L:45 no longer at interface
L:60 [GLU] 0:694 [A] J:72 [LYS] A:678 [A] ❌ 1VQ8_L:60 no longer at interface
L:60 [GLU] 0:695 [C] J:72 [LYS] A:679 [G] ❌ 1VQ8_L:60 no longer at interface
L:62 [ALA] 0:697 [G] J:74 [TYR] A:681 [G] ❌ 1VQ8_L:62 no longer at interface
L:64 [ILE] 0:688 [A] J:76 [ILE] A:672 [A] ❌ 1VQ8_L:64 no longer at interface
L:64 [ILE] 0:697 [G] J:76 [ILE] A:681 [G] ❌ 1VQ8_L:64 no longer at interface
L:66 [VAL] 0:688 [A] J:78 [ASN] A:672 [A] ❌ 1VQ8_L:66 no longer at interface
L:69 [ILE] 0:687 [C] J:81 [GLN] A:671 [U] ❌ 1VQ8_L:69 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal proteins L15p and L18e 0.93 4.07 0.15 0.64 0.93 0.7 0.74 0.41 0.34 0.26 0.35


Other pairs involving 1VQ8_L_0 or 6S0Z_J_A

Total number of entries: 14

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1VQ8_L_0 7O7Y_Ba_B5 0.62 0.93 2.45 0.36 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 6AZ3_L_2 0.48 0.82 2.4 0.27 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 4Y4O_1P_1A 0.38 0.93 4.18 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 6AZ3_L_1 0.63 0.77 2.74 0.34 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 6S0Z_J_A 0.41 0.93 4.07 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 1YHQ_L_0 0.99 1.0 0.24 0.98 Ribosomal proteins L15p and L18e Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1YHQ_L_0 6S0Z_J_A 0.41 0.93 4.03 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 6S0Z_J_A 0.72 0.96 2.46 0.46 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_L_1 6S0Z_J_A 0.36 0.72 4.24 0.11 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
6AZ3_L_2 6S0Z_J_A 0.29 0.81 5.35 0.13 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
6S0Z_J_A 7RYG_K_A 0.78 0.97 1.41 0.47 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7O7Y_Ba_B5 0.38 0.88 4.38 0.11 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
6S0Z_J_A 7OF0_M_A 0.78 0.88 2.04 0.38 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7K00_k_a 0.81 0.97 1.67 0.52 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare